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Pontencial de Lennard Jones, Simulación.

Introducción:
En este proyecto se estudió la dinámica que presentaba determinado número de
partículas que interaccionaban mediante un potencial llamado, “Potencial de
Lennard Jones”.

Este Potencial representa de forma sencilla como se comportan dos partículas, ya


que cuando dos partículas están a grandes distancias hay una fuerza atractiva o
fuerza de dispersión que las obliga a estar más próximas una de otra, sin embargo
cuando estas partículas ya están lo suficientemente cerca, los orbitales más
externos se sobreponen y como lo predice el principio de exclusión de Pauli, esto
genera una fuerza repulsiva para evitar que dos electrones estén en el mismo lugar
al mismo tiempo.
Con ayuda del programa Wolfram Mathematica se realizó una simulación de la
situación antes mencionada, llegando a resultados satisfactorios ya que los
resultados de esta simulación fueron comparados con resultados publicados por J.
A. Barker y D. Henderson en Octubre del año 1976.
A continuación se detalla un poco más sobre la simulación antes dicha.

Desarrollo del programa:


El programa se divide en dos partes. La primera, es la parte donde se encuentran
las funciones del programa, donde se definen diversas funciones diferidas para
poder correr la simulación, la cual, está en otro cuaderno diferente del mismo
programa Mathematica.
Algunas de las funciones diferidas que se definieron fueron las siguientes:
1.- La función graficar lo que hace es presentar partículas esféricas dentro de la caja
con una posición completamente aleatoria.
2.- La función distancia calcula la distancia entre cada i-partícula y j-partícula, esto
con el fin de ver si una partícula no se traslapaba con otra, ya que si la distancia
entre dos partículas era menor que su radio, entonces ahí había un traslape.
3.- Las función relacionada con la energía potencial de lennard Jones lo que hace
es asignarles un potencial a cada partícula, esto dependiendo de la distancia que
tienen entre sí, y de los parámetros “ε” y “σ”. Por ejemplo si una partícula tenía una
distancia respecto de la otra de la otra menor o igual a su radio, entonces se le
asignaba un potencial muy grande.
4.- Se creó la función cuadrada con el fin de evitar traslapes al momento inicial de
la simulación, lo que hace cuadrada es enviar a las partículas a una posición inicial
de tal forma que no haya traslapes.
5.- La función diferida de la fuerza debido al potencial de Lennard Jones fue creada
para calcular que tan fuerte era la interacción de las partículas, esta se define así:

6.- Ya que para estudiar la evolución temporal de un sistema de partículas se


necesita conocer la velocidad, y aceleración con la que se desplaza es necesario
introducir una función que calcule y asigne una aceleración a cada partícula parar
posteriormente calcular su energía cinética.
7.- En la función de propiedades se establecen las propiedades que tendrán las
partículas al estarse moviendo, ya que incluye la energía cinética tanto como la
temperatura del sistema.

Por ultimo ya en el cuaderno donde se lleva a cabo la misma simulación se


establecen las condiciones periódicas para cada partícula, esto es si el
desplazamiento de cualquier partícula la lleva más allá de la longitud de la caja en
la que están entonces esa partícula saldrá por una cara de la caja pero volverá a
entra por otra opuesta a esa cara, así como también se definen los datos iniciales
donde se establecen cuánto vale el largo de la caja, las velocidades, el número de
partículas y los parámetros para el potencial de Lennard Jones.
En los resultados finales se definen las gráficas para la energía potencial, energía
cinética, la energía potencial total, etc.
Para proseguir se dan los resultados de la simulación comparándolos con
resultados ya publicados en la literatura científica.
Resultados:
A continuación se hacen comparaciones con el artículo publicado por, J. A. Barker
y D Henderson y las simulaciones hechas en este curso:

Grafica 1. Dinámica molecular con potencial de Lennard Jones a temperatura=2.20 y densidad de 0.85.
Comparando resultados de la simulación hecha en el curso con resultados publicados por Baker. (Línea
continua son los resultados hechos en el curso).
Grafica 2. Dinámica molecular con potencial de Lennard Jones a temperatura=0.72 y densidad de 0.85.
Comparando resultados de la simulación hecha en el curso con resultados publicados por Baker. (Línea
continua son los resultados hechos en el curso).

Grafica 3. Dinámica molecular con potencial de Lennard Jones a temperatura=1.36 y densidad de


0.5. Comparando resultados de la simulación hecha en el curso con resultados publicados por
Baker. (Línea continua son los resultados hechos en el curso).
Ahora se presenta una tabla comparando diferentes energías potenciales, ya que
se tomaron diferentes datos de la tabla 3 del artículo “What is “liquid”?
Understanding the states of matter de J. A. Barker and D Henderson, en específico
sólo la temperatura y la densidad, cabe mencionar que se tuvo que hacer
respectivas conversiones de unidades de esta tabla a las unidades que tiene
nuestra simulación.
Temp (A) Den (A) U (A) Temp (S) Den (S) U (S)
0.80 0.82 −5.82 0.80 0.82 −5.12
1.13 0.62 −4.28 1.13 0.62 −3.95
1.13 0.73 −5.00 1.13 0.73 −4.6

Tabla 1. Se muestran diferentes valores de densidad, temperatura y energía potencial siendo las tres primeras
columnas datos del artículo y las tres últimas columnas datos de la simulación que se llevó a cabo en el curso,
claro que los datos de temperatura y densidad son los mismos para ambas partes. (Todo está en unidades
adimensionales).

Conclusiones:
Se concluye por lo visto y comparado anteriormente que los resultados obtenidos
por medio de nuestra simulación no dan resultados aparentemente sin nada que
ver, ya que lo arrojado por nuestra simulación si se logra asemejar a los resultados
obtenidos en el artículo anteriormente citado. Por lo que se puede decir que la
simulación hecha acerca del potencial de Lennard Jones es aceptable y compatible
con lo publicado en los años 70´s.
Bibliografía:
Mathematica escencial con aplicaciones.Dagdug,Leonardo.Guzmán,Orlando.Colección
CBI

What is “liquid”? Understanding the states of matter, J. A. Barker and D


Henderson. IBM Research Laboratory, Monterey and cottle roads, San Jose,
California. Pdf.
http://www0.cs.ucl.ac.uk/staff/A.Sztrajman/projects/moldyn/moldyn-report.pdf