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Polimorfismook 3 PDF
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a tiempo o a medios.
El fenómeno del polimor-
fismo no atañe únicamente
cristales de un solo compo-
nente, sino también a cristales
con dos componentes (co-
cristales), a sales cristalinas sin
hidratar y a sus formas solva-
tadas o hidratadas (llamados
así porque el solvente, agua de
cristalización, se queda atrapa-
do en la estructura cristalina).
Los polimorfos cristalinos se
hallan depositados en la Base
Figura 2: Los cuatros alótropos más conocidos del carbono: a) Figura 3: Algunos de los polimorfos del ROY.1. de Datos Cristalográfica de
diamante, b) grafito, c) fullereno C60 y d) nanotubo. Cambridge (CSD)5, especiali-
zada en moléculas orgánicas y
cristalina1. En otras palabras, te enlazado mediante enlaces ¿Cuántos polimorfos es po- compuestos de coordinación,
esto quiere decir que las mo- sencillos C-C con otros cuatro sible encontrar para un com- y en la equivalente para es-
léculas (neutras o iónicas, átomos de carbono, formando puesto químico? Se acepta tructuras inorgánicas (ICSD)6.
radicales o no-radicales) en un tetraedro. Esta red tridi- generalmente que todos los Para cada cristal depositado en
su estado sólido pueden or- mensional de tetraedros uni- compuestos químicos pueden dichas bases de datos se guar-
ganizarse ordenadamente de dos covalentemente convierte presentar varios polimorfos, o da información cristalográfica
varias formas distintas (Figura el diamante en el mineral más bien algunos son todavía des- (grupo cristalográfico, pará-
1). Cada estructura cristalina duro conocido en la natura- conocidos o difíciles de con- metros de celda, coordenadas
diferente se denomina poli- leza. En cambio, en el grafito seguir debido a sus condicio- fraccionales de los átomos,…),
morfo, que se diferencian nor- los átomos de carbono están nes de cristalización. En este bibliográfica (autores, revis-
malmente con letras romanas enlazados covalentemente con sentido, se suele citar como ta,…), y también información
o griegas, aunque no hay una sólo tres átomos (tres enlaces representativo la famosa frase extra sobre el cristal (color y
convención aceptada al res- C-C aromáticos) formando de McCrone2 el cual afirmó hábito cristalino, temperatura
pecto. Polimorfos diferentes planos hexagonales, que se que “…el numero de formas a la que fue hecha la difracción
no necesariamente presentan apilan debido a interacciones conocidas para un compuesto del cristal,…). A veces, entre
simetría distinta. débiles (van der Waals) entre es proporcional al tiempo y esa información también se
Un ejemplo paradigmático láminas, generando una es- la energía empleados para es- indica el carácter de polimorfo
de polimorfismo se presenta tructura de laminas paralelas. tudiar dicho compuesto”. Así, de la estructura con respecto a
en el caso del carbono elemen- El hecho de que las interac- uno de los compuestos con un otra estructura ya depositada
tal, que existe en la naturaleza ciones entre capas sean débiles mayor número de polimorfos (muchas veces, ese hecho no
en una gran variedad de for- permite que éstas se desplacen caracterizados es el pigmento se indica, por lo que no es una
mas, llamadas alótropos (del entre sí, lo que hace del grafito ROY3 cuyo nombre sistemáti- forma sistemática de buscar
griego “allos”, otros y “tropos” un buen lubricante, y permite co es 5-metil-2-[(2-nitrofenil) polimorfos en los cristales de-
manera) por tratarse de un su utilización como lápiz en amino]-3-tiofeno-carbonitri- positados en la CSD).
elemento. Las cuatro formas la escritura. Por otro lado, el lo, con siete polimorfos ca-
alotrópicas más conocidas del grafito es un buen conductor racterizados y dos pendientes Implicaciones socio-
carbono elemental son el gra- eléctrico debido a la alta des- de resolución cristalográfica económicas
fito, el diamante, el fullereno localización de los orbitales (las iniciales ROY se refieren Aunque, como ya se ha co-
(C60 y sus derivados) y los π, contrariamente al diaman- a los tres colores que presen- mentado, muchos compuestos
nanotubos (Figura 2). A esas te, que se comporta más bien tan los cristales de polimorfos de los empleados en la vida
cuatro pueden añadirse otras como un aislante. Fullerenos conocidos: R=red, O=orange, cotidiana presentan formas
formas, como los vidrios de y nanotubos también tienen Y=yellow). Sin embargo, la polimórficas, hasta el presente
carbono, los “nanofoam”, o el propiedades distintas entre sí aspirina sólo presenta 2 de sus el campo que se ha visto más
carbono amorfo. De todas las debido a su diferente estruc- polimorfos conocidos, el se- afectado por la existencia de
formas conocidas, el grafito tura. Su utilización en micro- gundo de ellos objeto de deta- nuevas formas cristalinas de
es la termodinámicamente electrónica y ciencia de los llados estudios recientemente4. un mismo compuesto ha sido
más estable, aunque la trans- materiales es actualmente ob- Hay también casos en los que el farmacéutico, debido a la
formación diamante-grafito jeto de estudio (por ejemplo, sólo se conoce un polimorfo, posibilidad de patentar esos
es extremadamente lenta (del en almacenamiento de gases, si bien, de acuerdo con Mc- nuevos polimorfos cristalinos
orden de eras geológicas). para encapsular fármacos, en Crone2, ello podría ser debido en algunos países (Estados
En el diamante, un átomo de circuitos eléctricos y en células a que no se ha investigado lo Unidos, por ejemplo). Como
carbono está covalentemen- fotovoltaicas). suficiente, bien en lo referente consecuencia de ello ha habi-
do un aumento significativo congénita llamada focomelia, te el proceso de producción control humano basado en una
del interés en la producción que dejaba a los niños recién de la ranitidina (forma-I) se racional exploración del espa-
y caracterización de nuevos nacidos sin extremidades, o formaba un nuevo polimor- cio de las posibles formas cris-
polimorfos de productos ya con extremidades muy cortas. fo diferente del descrito en la talinas (el llamado espacio de
patentados, o en evitar dicho Se observó que este “efecto se- patente de 1971, y lo patentó las fases). Dicha exploración se
hecho en aquellos a patentar. cundario” desconocido hasta como la forma-II. En 1997, hace variando las condiciones
El 59% de los compuestos entonces era debido a la pre- con la expiración de la patente de precipitación (temperatura,
farmacéuticos listados en la sencia de una forma levógira de 1970 de la ranitidina, la de disolvente, velocidad de adi-
European Pharmacopoeia del API que no tenía los efec- la forma-I, la empresa farma- ción de los reactivos, método
(EP) presentan más de una tos terapéuticos deseados y céutica Novopharm pretendió de precipitación), haciendo
forma cristalina (dentro de además producía dichos efec- distribuir su propia ranitidina, estudios de fusión/solidifica-
este porcentaje un 12% son tos adversos, contrariamente pero Glaxo argumentó que ción con muestras de formas
solvatos y un 30% son hidra- a su forma dextrógira que era podría infringir la patente del cristalinas ya precipitadas,
tos 7,8). Dichas estadísticas dan la terapéuticamente activa. segundo polimorfo, que no aplicando presión a formas ya
una idea de la importancia del Desde entonces la americana expiraba hasta 2002. En este precipitadas, etc. Una vez que
fenómeno del polimorfismo FDA (Food and Drug Admi- conflicto los tribunales dieron se ha establecido la presencia
en la industria farmacéutica. nistration, Administración la razón a Novopharm con el de más de una forma cristali-
Dos polimorfos de un mismo para los Alimentos y Fárma- argumento de que Glaxo no na, se tiene que identificar la
principio activo (API= Active cos de Estados Unidos) obliga podía demostrar que la forma- estabilidad termodinámica re-
Pharmaceutical Ingredient) a comercializar fármacos que I de Novopharm contenía o se lativa de las diferentes formas y
pueden presentar distinta so- presenten un solo enantióme- trasformara en la forma-II de establecer si se trata de formas
lubilidad, fluidez, compresi- ro en el sólido comercializado Glaxo. Eso implicó que la No- enantiotrópicas (se pueden in-
bilidad e higroscopicidad, y y en los que también se conoz- vopharm y otras compañías terconvertir variando la tem-
cuando ello pasa tendrá que can los efectos terapéuticos de farmacéuticas pudieron distri- peratura) o monotrópicas (no
cuidarse el proceso de manu- ambos enantiómeros antes de buir un genérico del fármaco hay interconversión variando
factura y distribución del fár- su comercialización. antiulceroso, provocando la la temperatura). En general, se
maco. Así, puede ocurrir que Este ejemplo ilustra cómo el consiguiente pérdida econó- tiene que caracterizar física-
un polimorfo se transforme polimorfismo afecta las pro- mica a Glaxo, un ejemplo pa- mente cada una de las formas
en otro termodinámicamente piedades farmacológicas de los radigmático de cómo las com- con el mayor número posible
más estable en un intervalo productos farmacéuticos. Otro pañías farmacéuticas intentan de técnicas experimentales de
específico de temperatura y/o importante campo en el que utilizar la formación de nuevas estado sólido. Entre las técni-
presión, proceso que puede el polimorfismo ha afectado a formas cristalinas para exten- cas más utilizadas se encuen-
ser inhibido o catalizado por las empresas farmacéuticas es der sus patentes. El fallo del tran éstas: microscopía óptica,
determinados excipientes. el de la protección intelectual litigio se basó en reconocer las microscopía de plato caliente
Cuando eso ocurre, además de sus viejos o nuevos descu- diferentes formas cristalinas (HSM= hot stage microsco-
de controlar las condiciones brimientos. Cada vez son más de un mismo compuesto como py), calorimetría diferencial
de producción del fármaco, frecuentes los litigios entre entidades físicas distintas y de barrido (DSC= Differential
también se deben conseguir compañías farmacéuticas en con propiedades diferentes, y Scanning Calorimetry), análi-
unas condiciones y tiempo de los que se disputan ante los en evaluar cómo se transfor- sis termogravimetrico (TGA=
almacenamiento óptimos para tribunales la legitimidad de man entre sí. Thermo-Gravimetric Analy-
el polimorfo deseado. la propiedad intelectual de un sis), espectroscopia de infra-
Un ejemplo donde el poli- fármaco en base a la aparición Exploración del polimorfismo rrojo y Raman (IR= InfraRed
morfismo jugó un papel rele- de nuevos polimorfos de dicho cristalino spectroscopy), difracción de
vante es el trágico caso de la fármaco. Como ejemplo de di- La gran relevancia económica, rayos X de monocristal o de
talidomida (n-(2,6-dioxo-3- cha situación basta el siguiente arriba descrita, del fenómeno polvo (SCXR= single crystal,
piperidil)-ftalimida) (comer- caso. del polimorfismo ha motiva- PXRD= powder X-ray diffrac-
cializado por Chemie Grü- La compañía farmacéutica do una intensa investigación, tion) y espectroscopía de reso-
nenthal), donde una forma Glaxo Wellcome se enfrentó dentro de dicho campo, en las nancia magnética nuclear de
cristalina del mismo compues- a Novopharm por la defensa últimas décadas, buscando en- estado sólido (SSNMR= solid
to es activa y la otra es dañina de la patente de la ranitidina tender cómo y porqué se forma state nuclear magnetic reso-
para el cuerpo humano. La (hidrocloruro de ranitidina), un polimorfo. A pesar de ello, nance spectroscopy).
talidomida (n-(2,6-dioxo-3- un fármaco antiulceroso desa- el conocimiento que se tiene
piperidil)-ftalimida) se comer- rrollado por la empresa Glaxo en estos momentos sobre ese Ingeniería cristalina
cializó, a principio de los años en 19701. Este fármaco era el campo es todavía limitado y a Complementariamente a las
1960, como calmante para más vendido en el mundo con veces la aparición de un poli- técnicas experimentales de es-
evitar la náuseas matutinas del unos ingresos para la Glaxo de morfo está fundamentada por tudio de cristales descrita en
embarazo. Este fármaco causó unos 3.500 millones de dólares lo que, en inglés, se conoce apartados anteriores, a partir
miles de nacimientos de bebés anuales. En octubre de 1981, como “serendipity” (casuali- de mediados del siglo XX se ha
afectados por una anomalía Glaxo descubrió que duran- dad)9 en lugar de un diseño y/o ido desarrollando una nueva
disciplina de la Ciencia cuyo las fuerzas intermoleculares, los polimorfos de cristales con los potenciales de Williams.15,
objetivo final es el diseño y ob- primero es necesario conocer estructuras experimentales . Además de los tres po-
16, 17
tención controlada de cristales con exactitud su naturaleza. determinadas pero aún no pu- tenciales mencionados, existe
con propiedades específicas Gracias a la Química Teórica blicadas. De ahí el nombre de una gran variedad de poten-
(buena solubilidad o tiempo y Computacional, en el mo- “test a ciegas”. Los resultados ciales que se diferencian en la
de vida, alta conductividad, mento actual se tiene un co- se envían al Centro de Datos expresión de las interacciones
ferromagnetismo,…), que nocimiento adecuado sobre Cristalográficos de Cambrid- enlazantes y no enlazantes, en
recibe el nombre de Ingenie- la tipología, la naturaleza, la ge, que se encarga de compro- qué tipo de cargas utilizan, o
ría Cristalina. La Ingeniería fuerza y la direccionalidad en bar cuántos cristales han sido en la inclusión o no de térmi-
Cristalina trata de combinar la mayoría de las interacciones predichos adecuadamente por nos de dipolo, cuadrupolo o de
habilidades como la síntesis intermoleculares presentes en cada programa. El nivel medio multipolos de orden superior.
de las moléculas a ensamblar, un cristal. Esos conocimientos de aciertos en el último “test a No obstante su flexibilidad, es-
la cristalización, la resolución permiten entender la estructu- ciegas” se acercaba al 50%, lo tos potenciales están afectados
de las estructuras cristalinas, el ra cristalina a un primer nivel, que habla del progreso en estas por la limitación intrínseca de
análisis del empaquetamiento el cualitativo. Un enfoque cua- técnicas de predicción. estar parametrizados según
cristalino de esas estructuras litativo muy popular en los úl- una observación empírica.
y el estudio de la relación que timos tiempos es el del “sintón Predicción de formas Una expresión más exacta
guarda el empaquetamiento supramolecular”, en el que se cristalinas de polimorfos de potencial es la encontrada
con las propiedades específicas predice la estructura del cristal La estrategia general común en en los potenciales GRACE18,19
del cristal. En esas etapas em- a partir de agregados supra- la mayoría de las aproximacio- que utiliza energías obtenidas
plea tanto técnicas experimen- moleculares energéticamente nes de predicción de estruc- mediante cálculos DFT (Den-
tales como teóricas. muy robustos que puede for- turas cristalinas es la minimi- sity Functional Theory). Aun-
En el momento actual, el mar la molécula de interés. zación de la energía reticular que los potenciales GRACE
nivel de desarrollo de la Inge- Sin embargo, es difícil hacer del cristal, es decir, su DH, una son muy eficientes a la hora
niería Cristalina no permite predicciones energéticas sobre propiedad que tiene una co- de predecir el cristal, su coste
un control total sobre el po- la estructura de un polimorfo rrespondencia experimental computacional es muy eleva-
limorfo a obtener, especial- usando sólo una visión cuali- con la entalpía de formación do. Además, los potenciales
mente debido a un insuficiente tativa, lo que ha llevado al uso del cristal. Esta aproximación GRACE calculados para una
control en la etapa de cristali- de las técnicas cuantitativas. asume que la estructura re- molécula son específicos de
zación (particularmente, sobre Un paso más allá ha sido el sultante está determinada sólo aquella determinada molécula
aspectos como la nucleación desarrollo de técnicas cuan- por su DH. La contribución y no son extensibles a otras.
y crecimiento cristalino). Sin titativas de predicción de las entrópica al polimorfismo se Un método alternativo para
embargo, existen exhaustivos estructuras cristalinas más considera poco importante, calcular las energías de los cris-
conocimientos sobre deter- estables de un compuesto mo- dado que la diferencia de en- tales moleculares es el método
minación estructural (mono- lecular. Dichas técnicas se han tropía entre cristales de baja semi-clásico Pixel20, 21, 22 donde
cristal y/o polvo), relaciones materializado en el desarrollo energía se estima que es nor- la energía de interacción entre
estructura-propiedad, dife- de programas de cálculo para malmente pequeña. A menudo dos moléculas se expresa como
renciación estructural de po- la predicción de polimorfos. la predicción se complementa la suma de las componentes de
limorfos y transformaciones Las predicciones de dichos con un estudio estadístico de intercambio-repulsión, elec-
estructurales. Igualmente los programas reproducen razo- cristales reales cuyo esqueleto trostática, inducción, transfe-
conocimientos sobre la na- nablemente bien los resultados molecular sea similar al de la rencia de carga, y dispersión.
turaleza de las interacciones experimentales, lo que ha he- molécula estudiada, a fin de En cada término las integrales
intermoleculares ha progresa- cho interesante, para algunas determinar similitudes en el de volumen que aparecen se
do de forma muy importante, industrias, su utilización como empaquetamiento cristalino. sustituyen con productos so-
permitiendo la comprensión herramienta en la predicción Usualmente, la energía de bre elementos de volumen de
detallada de las estructuras de la probabilidad de existen- cohesión de un cristal se eva- cada molécula, llamados pixel.
obtenidas y el inicio de una cia de polimorfos, de su es- lúa empleando los llamados La densidad en cada pixel es la
incipiente predicción de los tructura y energía. La calidad potenciales átomo-átomo. suma de densidades electróni-
posibles polimorfos a obte- de las predicciones realizadas Este modelo básico asume cas calculadas en el elemento
ner. En principio, mediante el por dichos programas puede que la energía reticular se de volumen a nivel ab initio.
control de las fuerzas intermo- medirse mediante los deno- obtiene como suma de las in- La energía de cohesión es igual
leculares, responsables de la minados “Blind Test” (“Tests teracciones de pares átomo- a la suma de las interacciones
cohesión del cristal, es posible a ciegas”) introducidos por el átomo para todos los pares entre pares de moléculas dis-
organizar las moléculas con un Centro de Datos Cristalográ- no-repetidos. Usualmente tintos dentro del cristal. Los
orden predeterminado. ficos de Cambridge, y que se cada par átomo-átomo está potenciales pixel, además de
llevan a cabo cada dos años10, descrito mediante los poten- proporcionar la energía del
El papel de la Química Teórica 11, 12, 13
. Los diversos grupos que ciales Lennard-Jones o de Buc- cristal, permiten entender cuál
en la Ingeniería de Cristales participan en dichos tests han kingham14, pero en cristales es la componente energética
A fin de conseguir controlar de predecir las estructuras de también son muy utilizados que domina en la energía de
periores (unidas entre sí por hacer Ingeniería de Cristales. te de buscar formas cristalinas Schweizer, B.; Schmidt, M. U.; van Eijck, B. P.;
Verwer, P.; Williams, D. E. Acta Crystallogra-
enlaces O-H···O formando un Predecir cuales son las es- con propiedades tecnológicas phica Section B - Structural Science. 2000,
sintón supramolecular R22(8) ) tructuras más probables que deseadas a las industrias que 56, 697-714.
son idénticas, mientras que en puede adquirir un cristal trabajan con materiales crista- (12) Day, G. M.; Motherwell, W. D.; Ammon, H. L.;
la tercera (unida a la segunda puede servir de guía para el linos que presentan propieda- Boerrigter, S. X.; Della Valle, R. G.; Venuti, E.;
Dzyabchenko, A.; Dunitz, J. D.; Schweizer, B.;
por enlaces C-H···O, que for- trabajo experimental, acortan- des específicas.
van Eijck, B. P.; Erk, P.; Facelli, J. C.; Bazterra, V.
man un sintón supramolecular do los tiempos y los costes de E.; Ferraro, M. B.; Hofmann, D. W.; Leusen, F. J.;
Referencias
R22(8) ) varía la orientación re- búsqueda experimental de po- Liang, C.; Pantelides, C. C.; Karamertzanis, P.
(1) B ernstein, J. Polymorphism in Molecular Crys-
lativa de las moléculas. El he- limorfos. Incluso se podría lle- tals; International Union of Crystallography
G.; Price, S. L.; Lewis, T. C.; Nowell, H.; Torrisi,
cho de ser capaz de encontrar gar a descartar esta búsqueda Monographs on Crystallography; Clarendon
A.; Scheraga, H. A.; Arnautova, Y. A.; Schmidt,
M. U.; Verwer, P. Acta Crystallographica Section
polimorfos con tan pequeña si teóricamente no se predicen Press: Oxford, 2002.
B - Structural Science. 2005, 61, 511-527.
diferencia demuestra la cali- polimorfos alternativos al de (2) M cCrone, W. C. In Physics and Chemistry of
(13) D ay, G.; Cooper, T. G.; Cruz-Cabeza,
the Organic Solid State; Fox, D.; Labes, M.;
dad del programa de predic- referencia que presenten pro- Weissberger, M. M. ; Interscience: New York,
A. J.; Hejczyk, K. E.; Ammon, H. L.;
ción de polimorfos. piedades de interés. También 1965; pp. 726-727.
Boerrigter, S. X.; Tan, J. S.; Della Valle,
R. G.; Venuti, E.; Jose, J.; Gadre, S. R.; Desi-
se puede usar la información (3) C hen, S.; Guzei, I. A.; Yu, L. Journal of the
raju, G. R.; Thakur, T. S.; van Eijck, B. P.;
Conclusiones teórica sobre los polimorfos American Chemical Society. 2005, 127, 9881-
Facelli, J. C.; Bazterra, V. E.; Ferraro, M. B.;
9885.
Actualmente se está trabajan- posibles para diseñar nuevos Hofmann, D. W.; Neumann, M. A.; Leusen, F.
(4) B ond, A. D.; Boese, R.; Desiraju, G. R. An-
do en mejorar la fiabilidad de materiales con una determi- gewandte Chemie-International Edition. 2007,
J.; Kendrick, J.; Price, S. L.; Misquitta, A. J.;