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TRABAJO PRCTICO N3

MACROMOLCULAS: su importancia, estructura y funcin.


AO 2017

OBJETIVOS:
Conocer la estructura y organizacin de las macromolculas, as como su rol dentro de
los diferentes procesos biolgicos.

UNIDAD DE CONOCIMIENTO.
CONOCIMIENTOS PREVIOS REQUERIDOS: todos los conceptos que se adquirieron en
el TP PEQUEAS MOLCULAS.

TEMARIO
1. MACROMOLCULAS: definicin; principales macromolculas de una clula. Unidades
estructurales de cada una de ellas. Uniones qumicas que pueden encontrarse en una
macromolcula.

2. PROTENAS: clasificacin (diferentes criterios), funciones que desempean en el


organismo. Fuentes naturales. Estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria.
Uniones que estabilizan a cada una de ellas. Dominios estructurales y funcionales.
Relacin entre conformacin, estructura y funcin. Protenas globulares y fibrosas:
estructura y funcin. Protenas oligomricas. Agregados supramoleculares.
Mecanismos de regulacin de la actividad proteica. Desnaturalizacin proteica:
agentes desnaturalizantes y efectos sobre la funcin biolgica.

3. CIDOS NUCLEICOS: definicin. Caractersticas comunes y diferenciales de los


nucletidos constituyentes de los cidos nucleicos. Unin de los nucletidos para
generar cadenas polinucleotdicas. Acido desoxirribonucleico (ADN): estructura
primaria y secundaria. Funcin: concepto molecular de gen. Acido ribonucleico (ARN):
distintos tipos; estructura, funcin y localizacin de cada uno de ellos. Cdigo gentico:
definicin. Concepto de codn y anticodn.

VOCABULARIO ESPECFICO DEL TEMA


Macromolculas, dominio, conformacin, protena oligomrica, desnaturalizacin,
complementariedad, temperatura de fusin del ADN, codn, anticodn, mutacin,
mutacin silenciosa, gen, polipptido, polinucletido, polaridad, sustrato, protena
globular, protena fibrosa, policistrnico, monocistrnico, cambios conformacionales,

BIBLIOGRAFA:
-Blanco, A. Qumica Biolgica. 8a Edicin. Editorial El Ateneo. 2015
-Lehninger. Principios de Bioqumica - 6 Edicin Editorial Omega. 2014
-Alberts, B. et al. Biologa molecular de la clula, Ediciones Omega. 6ta Edicin 2014.
-Lodish, H. y col. Biologa celular y molecular . 4ta Edicin. Editorial Panamericana, 2002.

UNIDAD DE ACCIN

1
En su casa: el alumno deber investigar usando como base el temario propuesto y
contestar el cuestionario gua de estudio a los efectos de autoevaluar si ha enfocado
correctamente el tema. Adems deber intentar resolver los problemas de aplicacin.

En clase: deber participar de la discusin del temario y resolver con la ayuda del
docente los problemas de aplicacin con el fin de reafirmar los conceptos tericos
estudiados en casa y disipar dudas.

CUESTIONARIO GUA DE ESTUDIO

1- Lea detenidamente el siguiente texto y responda las preguntas que se hallan a


continuacin:
Las macromolculas son polmeros de alto peso molecular (PM: 5x10 3-109)
constituidos por un gran nmero de unidades ms simples, idnticas o qumicamente
similares (monmeros), unidas entre s de manera regular a travs de un proceso
denominado polimerizacin. La estereoisomera surge de los diferentes arreglos
espaciales de tomos o sustituyentes en una molcula. La presencia de centros quirales o
dobles enlaces permite que los sustituyentes se distribuyan de dos maneras alternativas
en el espacio denominadas configuraciones, que slo pueden interconvertirse por rotura y
reforma de enlaces qumicos primarios. Como ejemplos de ismeros configuracionales se
pueden mencionar: D- y L-alanina o cis- y trans-oleico.
El trmino configuracin no debe ser confundido con conformacin. La
conformacin hace referencia a los distintos arreglos de tomos y sustituyentes en una
molcula que son resultado de rotaciones alrededor de enlaces simples. Ejemplos de
distintas conformaciones de polmeros son los zigzag planares, los arrollamientos al azar,
las hlices y los arreglos de cadenas plegadas. Los ismeros conformacionales se
interconvierten por rotaciones de los enlaces sin necesidad de roturas de enlaces
qumicos.

a) Cules son las principales macromolculas presentes en la clula?


b) Los lpidos son macromolculas? Por qu?
c) Qu tipos de uniones qumicas pueden encontrarse en una macromolcula?

2- a) D una definicin clara y completa de protena.


b) Cules son las principales funciones biolgicas de las protenas?
c) Mencione diferentes criterios de clasificacin de las protenas.
3- Una cadena polipeptdica surge de la unin de aminocidos entre s por medio de
enlaces peptdicos y a medida que se va sintetizando sufre una serie de plegamientos
que pueden dar por resultado una protena funcional. Responda:
a) Los aminocidos se unen espontneamente y al azar?
b) Qu determina la estructura tridimensional de una protena?
c) Qu tipos de plegamientos pueden ir ocurriendo entre los distintos aminocidos de
un polipptido?

4- a) Describa la estructura primaria, secundaria y terciaria de una protena.


b) Qu tipo de uniones estabilizan a cada una de estas estructuras?

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c) Si bien existen infinitas conformaciones posibles, las protenas poseen una
estructura tridimensional nica. Cmo se denomina dicha estructura? A qu se debe
que sea nica? Qu importancia tiene en la funcin de las protenas?
d) Qu es una protena oligomrica? Qu estructura adicional presentan estas
protenas y qu tipo de interacciones las estabilizan? Cite algunos ejemplos.
e) Mencione complejos supramoleculares que surgen por la asociacin de subunidades
proteicas e indique las funciones que desempean.

5- Segn uno de los criterios de clasificacin se pueden distinguir dos grandes grupos de
protenas: globulares y fibrosas.
a) Indique las caractersticas generales distintivas de cada uno de estos grupos de
protenas (respecto a estructura, tipos de aminocidos predominantes y solubilidad en
agua).
b) Mencione algunas de las funciones que desempean. Relacione stas con las
caractersticas descriptas en a) para cada grupo de protenas.

6- Respecto a la desnaturalizacin proteica responda:


a) Qu implica este proceso?
b) A travs de qu agentes puede lograrse? Es un proceso reversible? Explique.
c) Qu consecuencias tiene?
d) Ocurre slo en el caso de protenas?

7- Qu significado tiene la frase: tanto las cadenas polipeptdicas como las


polinucleotdicas tienen polaridad.

8- a) Cul es la diferencia entre ADN y ARN desde el punto de vista qumico y


estructural?
b) Mencione la funcin y ubicacin de cada uno de ellos.

9- a) Explique claramente que significa que las cadenas que constituyen el ADN son
complementarias y antiparalelas.
b) Por qu emparejan especficamente adenina con timina y citosina con guanina?

10- Describa la estructura secundaria del ADN y del ARN t. Qu tipos de uniones
mantienen la estabilidad de estas estructuras?

11- Seale las caractersticas que diferencian al ADN bacteriano, mitocondrial y de


cloroplastos del ADN eucaritico.

12- a) Qu entiende por gen?


b) Qu es el cdigo gentico?
c) A qu se llama codn y anticodn?

13- Qu es una mutacin y qu consecuencias puede tener?

EJERCICIOS DE APLICACIN
1- El siguiente esquema representa la estructura de una protena:

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a) Complete la figura con los nombres de los enlaces sealados con flechas.
b) Qu nivel estructural se encuentran estabilizando en esta protena? Por qu?
c) Qu niveles estructurales pueden estabilizar este tipo de enlaces?
d) Cmo se denominan los dos elementos estructurales sealados en el esquema?
Qu nivel de estructura representan?
e) Qu niveles estructurales presenta esta protena?
f) Cree que esta protena podra ser citoslica? Justifique su respuesta.

2- Usted es un experto en protenas y como tal ha recibido una propuesta para predecir la
conformacin de una protena. La misma se halla inserta en un medio hidrofbico y tiene
algunas de sus partes en contacto con dos medios acuosos distintos (protena de
transmembrana).
a) Qu niveles estructurales presenta esta protena? Describa.
b) Qu caractersticas tendrn los aminocidos expuestos en cada una de las regiones
de la protena?
c) Por qu cree que en la porcin hidrofbica predomina la estructura en -hlice?
d) Qu funcin o funciones podra desarrollar dicha protena?

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3- Una enzima hipottica contiene 124 aminocidos y 4 puentes disulfuro en su
estructura. Cuando se la desnaturaliza con una solucin que contiene urea 8M y un
agente que reduce los puentes disulfuro a grupos sulfhidrilos (-mercaptoetanol), se
torna bioqumicamente inactiva. Si posteriormente se la deja oxidar al aire, la misma
permanece inactiva, an despus de eliminar la urea. La actividad enzimtica se
recupera cuando se agregan bajas concentraciones (trazas) de -mercaptoetanol, que
acta como catalizador en el rearreglo de puentes disulfuro.

UREA -MERCAPTOETANOL

a) Puede explicar qu ocurre en cada una de las etapas del experimento?


b) Por qu cree que cuando se deja que la protena se oxide al aire no recupera la
actividad biolgica?
c) A partir del anlisis de los datos que le propone este ejercicio qu relacin puede
establecer entre la relacin estructura-estabilidad y funcin de las protenas.

4- La hemoglobina es la protena encargada de captar el oxgeno en los pulmones y


transportarlo hacia los distintos tejidos del organismo donde lo intercambia por dixido
de carbono. Su molcula est constituida por dos pares de cadenas polipeptdicas
(globinas), cada una unida a un grupo hemo. Existen distintos tipos de hemoglobinas,
por ejemplo en el adulto la ms abundante es la A formada por 2 cadenas de globina
y dos de globina, (22), mientras que en el neonato predomina la hemolobina F(22).

a) Con la informacin que le brinda el enunciado puede determinar si se trata de una


protena globular o fibrosa? (Mencione especficamente qu datos le sirvieron como
gua).
b) Qu niveles de estructura presenta la hemoglobina normal?
c) Teniendo en cuenta el nmero de cadenas polipeptdicas que la forman cmo la
clasificara?
d) Teniendo en cuenta su composicin qumica, dentro de qu grupo la ubicara?

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Existen anormalidades hereditarias de la hemoglobina, denominadas
hemoglobinopatas, algunas de ellas se originan por alteraciones en la secuencia de
aminocidos de las cadenas de globina. Por ejemplo, la hemoglobina Constant Spring
es una variante en la cual la cadena presenta una sustitucin en una base de un
codn de terminacin; en el caso de la variante Gun Hill se produce una delecin de
uno o ms codones de la cadena de globina, manteniendo el marco de lectura. La
hemoglobina S difiere de la hemoglobina A por la sustitucin de un cido glutmico por
una valina en la globina . Esto lleva a que la protena se polimerice y forme fibras
intracelulares que deforman los glbulos rojos, lo cual dificulta la circulacin de los
mismos a travs de los capilares sanguneos.
e) Describa cmo se modifica la estructura primaria de las cadenas de globina en las
variantes de la hemoglobina descriptas en el enunciado.
f) Cree que estos cambios estructurales afectarn la funcin de la hemoglobina? Si su
respuesta es afirmativa, puede explicar cmo?

5- a) Algunas de las protenas presentes en la leche son: casenas, alfa-lactoalbmina,


beta- lactoglobulina (dmero), seroalbmina bovina. Salvo en el caso que se indica
todas las protenas son monomricas.
a1- Clasifquelas segn su forma en el espacio sabiendo que todas son solubles en
agua. Qu niveles estructurales espera encontrar en cada una de ellas? Enumere los
principales tipos de uniones que estabilizan a cada uno de los niveles estructurales de
una protena.
a2- Para obtener los productos derivados de la leche se somete a las protenas a
procesos de desnaturalizacin, ya sea por cambios de pH o por calor.
En qu consiste el proceso de desnaturalizacin de una protena y a qu niveles
estructurales afecta?
b) La lactosa es un disacrido que se encuentra presente en la leche, muchos adultos
no pueden digerir la lactosa (padecen intolerancia a la lactosa) y como consecuencia
de la ingesta de leche sufren de distensin abdominal, calambres y diarrea acuosa.
Los adultos que toleran la lactosa tienen una enzima denominada lactasa (-D-
galactosidasa) que se localiza en la superficie externa de las clulas epiteliales que
tapizan el intestino delgado. La lactasa hidroliza a la lactosa en sus dos monmeros
constituyentes, glucosa y galactosa. Tanto la glucosa como la galactosa pueden
atravesar las clulas epiteliales y no causan la enfermedad. Qu representa la lactosa
para la lactasa? Cmo se denomina la regin donde ocurre la reaccin qumica que
transforma la lactosa en sus productos?

6- Indique si las molculas de ADN y de ARN poseen carga elctrica neta, y en caso
afirmativo, indique de qu signo es dicha carga. Cules son los grupos funcionales
que aportan carga a la estructura de los cidos nucleicos?

7- Dos macromolculas (por ejemplo dos protenas) pueden unirse entre s con gran
fuerza y especificidad. Cmo es posible que interacciones dbiles, como las
interacciones de van der Waals, los enlaces de hidrgeno y las interacciones
hidrofbicas originen una adherencia tan fuerte? Analice cada una de las opciones,
indique cul es correcta y cuales son los errores en las opciones incorrectas.
OPCIONES:

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A. La adherencia puede llegar a ser fuerte cuando existen muchas interacciones
dbiles, todas ellas contribuyendo a la estabilidad de la estructura
B. Las interacciones dbiles se convierten en fuertes una vez que los grupos no
polares son excluos del interior de las macromolculas
C. Las interacciones dbiles son convertidas en enlaces covalentes, dando as lugar a
una adherencia fuerte entre las molculas
D. Si las interacciones dbiles se alinean correctamente pueden convertirse en tan
fuertes como los enlaces covalentes
E. La adhesin es fuerte porque las interacciones dbiles pueden estar implicadas en
reacciones de condensacin

8- Las protenas 1 y 2 interaccionan fuertemente. La siguiente figura muestra una parte


significativa de sus interacciones.

Suponga que ocurre una mutacin en la protena 2 que cambia el aminocido mostrado
arriba por uno de los aminocidos que se muestran a continuacin:

Qu cambio de los anteriores debera interrumpir en mayor medida la interaccin


entre las protenas 1 y 2? Cul afectara en menor medida? Elija la opcin correcta y
justifique su eleccin

OPCIONES:
A. El que ms: aspartato; el que menos: leucina
B. El que ms: lisina; el que menos: serina
C. El que ms: serina; el que menos: aspartato
D. El que ms: lisina; el que menos: aspartato
E. El que ms: aspartato; el que menos: serina

9- Se ha fraccionado una porcin del ADN de una clula obtenindose fragmentos de


igual tamao que corresponden a dos genes distintos: l y ll. De las bases presentes en
el gen l el 10% corresponde a adenina, mientras que en ll hay 30% de adenina.
a) Cul es el porcentaje de cada una de una de las otras bases presentes en ambos
genes?

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b) Si se tiene una solucin que contiene ambos genes y se dispone de un filtro de que
retiene al ADN bicatenario pero no al monohebra, cmo podemos separar estos
genes uno del otro?
c) Si el gen l tiene 3000 molculas de adenina, cul es la longitud del gen l y ll?

10- Un ARNm que codifica para una nucleasa procariota contiene 10% Adenina, 20%
Uracilo, 40% Citosina y 30% de Guanina. Cul cree Ud. que ser el porcentaje de
bases en el gen que codifica para esta enzima?

PROBLEMAS ADICIONALES
1- Marque la opcin correcta
i) Un ARN mensajero lleva informacin para:
a. La secuencia de aminocidos de una protena segn el orden lineal de sus nucletidos.
b. El orden de los nucletidos en el ARN de transferencia.
c. La secuencia de nucletidos en el ARN del ribosoma.
d. La estructura primaria de una protena segn la secuencia de los
desoxirribonucletidos que lo forman.
ii) Cules son los pares de bases que puede encontrar en la doble hlice del ADN?:
a. A-G
b. A-C
c. A-T
d. T-U
e. G-T

iii) Qu fuerzas estabilizan la doble hlice del ADN? :


a. puentes de hidrgeno
b. interacciones hidrofbicas
c. puentes disulfuro
d. a y b son correctas
e. ninguna es correcta

iv) El ARN ribosomal:


a. forma parte de los ribosomas
b. se sintetiza en los ribosomas
c. se une a los ribosomas
d. interviene en la maduracin del ARNm
e. ninguna es correcta

v) La unin peptdica se produce entre:


a. el grupo alcohol de un monosacrido y el grupo cido de un cido graso
b. el grupo amino de un aminocido y el grupo cido del mismo aminocido
c. el grupo amino de un aminocido y el grupo cido de otro
d. el grupo amino de un aminocido y el grupo fosfato
e. ninguna es correcta

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vi) Los anticodones son tripletes de nucletidos presentes en el:
a) ARNm.
b) ARNr.
c) ADN.
d) ARNt.

2- a) En muestras de ADN aisladas de dos especies bacterianas desconocidas, la


adenina representa el 32 y el 17 por ciento de las bases totales, respectivamente. Qu
proporciones relativas de timina, de guanina, de uracilo y de citosina cabra esperar que
existiesen en las dos muestras de DNA?
b) Una de las dos especies es una bacteria termfila, aislada de un manantial de agua
caliente (64C) Podra predecir cul de las dos muestras le corresponde?

3- Teniendo en cuenta los posibles apareamientos de bases intracatenarios, cree que


sera posible la existencia de regiones con estructura secundaria en doble hlice en los
ARNt? Contestar en forma afirmativa o negativa y explicar su respuesta con el mayor
detalle posible.

4- Una muestra de ADN de la bacteria E. coli contiene 28,9 moles % de Adenina. Cul
ser la cantidad aproximada de los restantes nucletidos (T, U, G y C)?

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