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14.

- Tipos de ARN
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Por Dr. Ananya Mandal, MD

Hay varios tipos y formas de ARN. Por ejemplo, el ARN mensajero (ARNm)
lleva la informacin desde el ADN al ribosoma en el citoplasma donde realiza la
sntesis de protena real (traduccin).

Tipos de ARN pueden definirse como:

ARN mensajero (ARNm)


Esto est formado por el proceso de transcripcin. La cadena de ADN acta
como una plantilla en la formacin de esta hebra de RNA. El ARNm lleva el
cdigo gentico del ADN en el citoplasma a los ribosomas para su traduccin
del ARN en un filamento de protena o polipptido.

ARN ribosmico
Esto ayuda al ARNm y el ARN de transferencia a unirse para formar la cadena
polipeptdica.

ARN de transferencia o ARNt


Hay al menos 20 especies de ARNt y estos actan en traer las bases para
formar los aminocidos de la cadena polipeptdica.

ARN no codificante o ARNt


Estos son codificados por genes de RNA y tambin deriva de intrones de
ARNm.

Transferencia-mensajero RNA (tmRNA)


Esto se encuentra en muchas bacterias y plastos. Estas etiquetas las protenas
codifican por el ARNm que carecen de codones de parada para la degradacin
e impide que el ribosoma calado.
Ribozimas (enzimas RNA)
Algunos RNAs son enzimas. Durante muchos aos se crea ampliamente que
slo protenas podran ser enzimas. RNAs son conocidos a adoptar estructuras
terciarias complejas y actuar como catalizadores biolgicos. Estas enzimas
RNA son conocidas como ribozimas y exhiben muchas de las caractersticas
de una enzima clsica, como un sitio activo, un sitio de enlace para un
substrato y un sitio de enlace para un cofactor, como un ion de metal.

Una de las ribozimas de primera en ser descubierta fue ARNasa P, una


ribonucleasa que participa en la generacin de molculas de tRNA de mayor
tamao, precursor RNAs. ARNasa P se compone de RNA y protenas; Sin
embargo, la porcin de RNA solo es el catalizador.

ARNs reguladores
Estos RNAs sirven para regular el proceso de la expresin gnica. MicroRNAs
(miRNA; 21-22 nt) por ejemplo son encontrados en eucariotas y actuar a travs
de ARN de interferencia (ARNi). Estos miRNA y enzimas pueden descomponer
ARNm que es complementario a la miRNA. Esto puede bloquear el ARNm de
ser traducido, o aceleran su degradacin.

Por otro lado pequeos RNAs de interferencia (siRNA; 20-25 nt) a menudo son
producidos por la degradacin del ARN viral, tambin hay fuentes endgenas
de ARNsi. Actan similares a miRNA. Un ARNm puede contener elementos
reguladores, como riboswitches, en la 5' UTR o 3' UTR; Estos elementos cis
reguladores regulan la actividad de ese mRNA.

RNAs en proceso de la estructura terciaria de RNA


RNAs muchos participan en la modificacin de otros RNAs. Por ejemplo, los
intrones son empalmados fuera del pre-mRNA por catabolizar, que contienen
varios RNAs pequeos de nucleares (snRNA).

RNA como material gentico o genomas de ARN


Como el ADN, RNA puede llevar la informacin gentica. Esto se ve en
muchos virus de ARN.
ARN en la transcripcin inversa
Algunos virus como el VIH tienen RNA como su material gentico que copia en
ADN en forma de transcripcin inversa. Estas copias de ADN, a continuacin,
se transcriben ARN nuevo.

ARN bicatenario
Estos son llamados dsARN donde el ARN tiene dos hebras complementarias,
similares al ADN encontrado en todas las clulas. dsARN constituye el material
gentico de algunos virus (virus de ARN bicatenario).

15.-

16.-

17.- unidad Svedberg

1. f. Biologa celular y molecular. Unidad de medida especfica para


ultracentrifugacin. Mide el coeficiente de sedimentacin en tiempo,
siendo equilavente a 10-13 segundos. En biologa celular y molecular, la
unidad Svedberg permite caracterizar y nomenclar subunidades
organelares o macromoleculares, como los organelos.

18.- ARN ribosomal y fabricacin de ribosomas

El ARN ribosomal (ARNr) constituye, junto con varias protenas, los ribosomas. El ribosoma es
la parte esencial de traduccin del ARN. Los ribosomas de procariotas y eucariotas son
ligeramente diferentes. Ambos estn compuestos por dos subunidades, pero los de procariotas
son ms pequeos, denomnndose 70s, frente a los eucariotas que se denominan 80s (estas
cifras corresponden a medidas de centrifugacin).

Ribosomas

En cualquier caso, no se sabe como es exactamente la forma de los ribosomas, variando


adems de unos organismos a otros. Sabemos, por ejemplo, que el ribosoma de Escrherichia
coli la subunidad grande tiene tres huecos donde se engancha la subunidad pequea, la
subunidad pequea es liberametne alargada, on un estrechamiento, situada a 1/3 de su
longitud total, por el que se introducira el ARN mensajero.

En el caso del ribosoma procariota, sus dos subunidades son, una grande 50s y una pequea
30s. La subunidad 50s est compuesta por un ARNr 23s, un ARNr 5s y 31 protenas distintas,
denominadas protenas L. La subuniad 30s est compuesta por un ARNr 16s y 21 protenas
distintas, denominadas protenas S.

En el caso del ribosoma eucariota, posee una subunidad grande 60s y una subunidad pequea
40s. La subunidad 60s est compuesta por un ARNr 28s, un ARNr 5,8s y un ARNr 5s, adems
de 49 protenas distintas. Y la subunidad 40s est ocmpuesta por un ARNr 18s y 33 protenas
distintas.

Ribosomas Procariotas y Eucariotas

Para que se mantengan unidos, debe tener una concentracin mnima de magnesio. Si la
concentracin de Mg2+ baja de 1mM, se disociarn las dos subunidades.

Cada tipo de ARNr tendr una conformacin. Alternan zonas de bases apareadas con bases
desapareadas. La concentracin de pases apareadas supondr, aproxiamadamente, el 70%.
ARNr

Las protenas de los ribosomas tienen carcter bsico, siendo ricas en cargas positivas. Pero
el ribosoma tiene, en su totalidad, carga elctrica negativa, debido sobre todo a las cargas
negativas de los grupos fosfato del ARN.

Una vez se han constituido las subunidades (a partir de sus elementos) se unen por
reconocimiento especfico. Este reconocimiento y unin tiene lugar de forma expontanea.

En el caso de clulas eucariotas podemos encontrar, adems de los ribosomas del citoplasma,
ribosomas en las mitocondrias y cloroplastos. Son ms pequeos que los citoplasmticos y se
parecen bastante a los ribosomas procariticos (constituyendo una prueba del origen procariota
de las mitocondrias y cloroplastos).

Todos los ARNr son expresiones finales de genes. Expresiones que, posteriormente, no son
traducidas (es decir, se transcribe el gen, pero no se traduce). Esto va a generar un problema
respecto a la velocidad de sntesis. Cuando se duplica la clula, debe duplicar sus ribosomas y
una clula puede tener de ocho a diez millones de ribosomas. Si solo tuviese un gen
determinado de cada tipo de ARNr, sintetizar una cantidad grande de ARN para producir
muchos ribosomas supondra demasiado tiempo. Normalmente, las clulas tienen ejemplares
repetidos de los genes del ARNr (tambin sucede con los ARNt). En el caso de los ARNm, no
se necesitan tener tambin genes estructurales de los ribosomas repetidos de esta forma(los
genes que, una vez traducidos, dan lugar a las protenas del ribosoma), ya que un solo ARNm
puede traducirse muchas veces, incluso millones de veces. Es decir, un solo ARNm puede dar
lugar a varios millones de polipptidos. Por eso estos genes no suelen venir repetidos. En
cambio, si que vendrn repetidos los genes de las histonas.

Fabricacin de protenas ribosomales y ARN ribosomal (ARNr).

El ARNr se forma a partir de precursores ms grandes, que despus son cortados (maduracin
postranscripcional). Veremos el proceso en eucariotas.

Las protenas ribosomales se tienen que sintetizar en el citoplasma. Una vez se ha traducido el
ARNm las protenas vuelven al ncleo y es en el ncleo donde se unen al resto de
componentes.

Los cuatro tipos de ARNr van a ser codificados por dos genes. Uno de ellos es el gen
encargado del ARNr 5s. Se encuentra en diversos cromosomas (como ya indicamos, hay
varias copias) y forma parte del nucleolo. Es transcrito por al ARN pol III.
ARNr 5s

Otro gen va a dar lugar a un ARN 45s. Hay varias copias, separadas por espaciadores. Al
complejo de los genes ARN 45s se le denomina organizador nucleolar, ya que a partir de ellos
se formar el nucleolo. Estos genes son transcritos por la ARN polimerasa I. Se generan copias
de un ARN 45s que contiene en su interior los ARNr 18s, 5,8s y 28s. Estos tres se separan por
la accin de exonucleasas, que eliminan lo que les sobra por los extremos y endocucleasas
que eliminan las partes interiores del ARN 45s que separa los tres fragmentos. Por metiliacin
del OH de ciertas ribosas se marca la parte del ARN 45s que debe ser degradado por las
endonucleasas y exonucleasas.

ARNr 18s, 5,8s y 28s

El ARNr 18s, junto con las protenas S, formarn la subunidad pequea. El ARNr 5,8 s, junto
con el ARN 28s, el ARN 5s y las protenas L formarn la subunidad grande.

Todo esto va a un tiempo, es decir, todo el proceso tiene lugar a la vez. Las protenas van al
nucleolo, que es el lugar donde tienen lugar todos estos procesos.
Fabricacin de ribosomas

En los procariotas, hay tres tipos de ARN: el 16s, el 23s y el 5s. Los tres se forman a partir de
un precursor ms largo, ARNr 30s. En mitad del precursor encontraremos en algunos casos
una o dos secuencias que codifica para el ARNt.

ARNr en procariotas

El proceso es, en esencia, igual al de eucariotas. Se produce la maduracin y a la vez se le


aaden las protenas.

En ciertos caos hay que eliminar intones (scplicing o corte y empalme). En vez de eliminar
intrones propiamente dichos, se eliminan los trozos del medio de ARN que tendran que estar
juntos. Se sabe que los ARNr de algunos procariotas y eucariotas unicelulares eliminan
intrones por un proceso de autosplicing o autoemplame, en el cual no intervienen enzimas que
catalicen el proceso. Este descubrimeinto fue una prueba que demostraba qu ciertos ARN
posean actividad autoenzimtica.

19.- De este modo, las secuencias reguladoras del ADN quedan accesibles. Las histonas
tambin pueden modificarse por metilacin, ribosilacin o fosforilacin; an no se conoce
en detalles cules son los mecanismos precisos con los que estn modificaciones influyen
en la regulacin gentica.

Las histonas se combinan en el ncleo de la clula con largas hebras de ADN, que
contienen los genes, para formar la cromatina, el material que constituye los
cromosomas. No hace mucho que todava se supona que esas protenas pequeas
no intervenan en la regulacin de los genes y tenan la misin exclusiva de servir
de material de empaquetamiento celular. Venan a ser una suerte de "bobinas"
dotadas de carga positiva, a cuyo alrededor se enrollaran las hebras de ADN
cargadas negativamente para as poder encajar en el interior del diminuto ncleo
celular.

CICLO CELULAR Y DUPLICACIN DEL ADN


Silvia Mrquez- Sergio Daniel Ifrn- Enrique Zabala

Ciclo celular
Las clulas de los distintos organismos pasan durante su vida por distintos perodos, cada
uno de ellos caracterstico y claramente diferenciado.

Cada tipo celular cumple con sus funciones especficas durante la mayor parte de su vida,
creciendo gracias a la asimilacin de materiales provenientes de su ambiente y con ellos
sintetiza nuevas molculas por medio de complejos procesos regulados por su material
gentico.

Cuando una clula aumenta hasta llegar a un determinado tamao, su eficiencia metablica se
torna crtica, entonces se divide. En los organismos pluricelulares, se produce un crecimiento
a partir de una clula (huevo o cigoto) como as tambin se aumenta la masa tisular y se
reparan los tejidos lesionados o desgastados, por aumento del nmero de clulas.

Las nuevas clulas originadas en esta divisin poseen una estructura y funcin similares a las
clulas progenitoras, o bien derivadas de ellas.

Fig. 12.1 - Ciclo de Divisin Celular

En parte son similares porque cada clula nueva, recibe aproximadamente la mitad de
organoides y citoplasma de la clula madre, pero en trminos de capacidades estructurales
y funcionales lo importante es que cada clula hija, reciba una rplica exacta del material
gentico de la clula madre.

Durante la vida celular, las clulas pasan por un ciclo regular de crecimiento y divisin. A esta
secuencia de fases se la denomina ciclo celular y en general consta de un perodo donde
ocurre un importante crecimiento y aumento de la cantidad de organoides (interfase) y un
perodo de divisin celular (mitosis o meiosis).

La interfase involucra perodos donde la clula realiza los procesos vitales propios de su
funcin. Durante ella, se producen tambin fenmenos a nivel nuclear imprescindibles para la
divisin posterior. Cronolgicamente podemos dividir la interfase en tres etapas G 1, S y G2.
Haciendo un esquema del ciclo celular, el tiempo en que transcurre cada una de las etapas se
representa en la Fig. 12.2.

Es necesario sealar que existen excepciones a este ciclo, ya que no en todas las clulas los
perodos tienen la misma duracin. Incluso si consideramos una poblacin celular homognea
(clulas del mismo tipo), existen variaciones particulares. Siempre que se habla de tiempos
determinados, se hace considerando los promedios de cada tipo celular.

Tambin existen clulas que dejan de dividirse por largos perodos o bien permanentemente.
Por ejemplo, las neuronas permanecen luego de la maduracin del tejido nervioso en una etapa
especial denominada G0, donde las clulas entraran como alternativa a G1. En la actualidad
es frecuente referirse a este tipo de clulas como "no cclicas" o detenidas en G 1, ya que no
es seguro que las clulas que no se dividen pasen por un solo estado.

Fig. 12.2 - Fases del Ciclo Celular

ETAPAS Y CARACTERSTICAS

Como ya se mencion, una clula tipo pasa a lo largo de su vida por etapas (G1, S y G2) antes
de dividirse. Las caractersticas ms relevantes de cada una de las mismas son:

Etapa G1: Esta etapa que sucede a la divisin celular es la ms variable en duracin. Las
clulas hijas recientemente originadas presentan una gran actividad metablica
producindose un aumento acelerado del tamao celular. Los organoides de la clula
precursora han sido repartidos de manera ms o menos equitativa entre las clulas hijas,
deben entonces aumentar de tamao y tambin en nmero para mantener las caractersticas
de su tipo celular. Se sintetizan as ribosomas y microtbulos a partir de las protenas y otras
molculas que la conforman. Los organoides del sistema de endomembranas, aumentan
considerablemente de tamao, ya que ambas clulas hijas han recibido parte de estos
organoides. Sin embargo, pueden ser sintetizados de nuevo en caso de no existir precursores.
Esto no ocurre con mitocondrias y cloroplastos que se originan por divisin de estas
estructuras preexistentes. Como se recordar ambos organoides contienen ADN y ribosomas
que les permite dividirse de forma relativamente independiente del ncleo celular.

Todos los procesos de sntesis de nuevos organoides o aumento de tamao de los existentes,
son regulados mediante activacin de complejos enzimticos en un momento determinado.

En este perodo se observa, a su vez, una gran sntesis de ARNm como as tambin ARNt y
ARNr. Estos cidos sern utilizados para la sntesis de protenas estructurales, para la
construccin y o aumento de los organoides, como as tambin la produccin de enzimas
necesarias para dicha sntesis. Cabe destacar que durante este perodo tambin se sintetizan
las enzimas que sern utilizadas en la etapa siguiente, es decir en la duplicacin del ADN,
como as tambin molculas precursoras de los cidos nucleicos.

Cuando las clulas dejan de crecer (si se agotan los nutrientes o por inhibicin por contacto)
lo hacen en G1. Esto implica que tambin se sintetizan las sustancias que estimulan o inhiben
distintas fases del ciclo celular.

Etapa S: el perodo S o de sntesis de ADN tiene como caracterstica fundamental la sntesis


de nuevo material gentico, para que las clulas hijas tengan la misma dotacin. Sin embargo
persisten los altos ndices de sntesis de ARN para obtener enzimas requeridas en la sntesis
de histonas que formarn parte de la macroestructura del ADN y tubulinas relacionadas con
el proceso de divisin celular.

Etapa G2: En esta fase, ya con el ADN duplicado, la clula ensambla las estructuras
necesarias para la separacin de las clulas hijas durante la divisin celular y la citocinesis
(separacin del citoplasma).

Etapa M: Durante M, la envoltura nuclear se desintegra, la cromatina se condensa en forma


creciente hasta ser visible los cromosomas al microscopio ptico. Estos cromosomas
formados cada uno por dos cromtidas (cromosomas duplicados) pasaran por cada una de las
fases de la divisin celular (mitosis o meiosis) para concluir con la formacin de las clulas
hijas, cada una con una nica copia de su ADN (cromosomas sin replicar) , que marcan el inicio
de un nuevo ciclo.

SISTEMA DE CONTROL DEL CICLO CELULAR

El sistema de control del ciclo celular es un dispositivo bioqumico compuesto por un conjunto
de protenas reguladoras interactivas: las ciclinas y las quinasas dependientes de
ciclinas que inducen y coordinan los procesos bsicos del ciclo, como la duplicacin de ADN y
la divisin celular, a los que denominamos procesos subordinados.

Durante un ciclo tpico, el sistema de control est regulado por factores de retraso que
pueden frenar el ciclo en puntos determinados denominados puntos de control. En estos
puntos, las seales de retroalimentacin que contienen informacin sobre los procesos
subordinados pueden detener momentneamente el avance del ciclo, evitando el inicio del
proceso siguiente antes que el precedente haya terminado. Sobre dichos factores tambin
actan seales del entorno como puede ser una hormona o un factor de crecimiento.

Una analoga que puede ayudarnos a comprender este mecanismo es comparar al sistema de
control del ciclo celular con el funcionamiento de una lavadora automtica (1. Alberts y col -
pg929-930), el programador de la lavadora slo avanza a travs de los diferentes pasos del
ciclo de lavado (etapas del ciclo celular), si recibe determinadas seales. Adentro de la
lavadora hay sensores que miden el nivel de agua o jabn que ingresan. Estos sensores envan
seales que pueden provocar el retraso o la interrupcin del ciclo de lavado. De igual manera
en la clula, las seales generadas en los procesos subordinados (por ej. la sntesis de ADN)
o por el entorno, detienen el ciclo.

A continuacin pasaremos a describir las protenas reguladoras, el mecanismo de regulacin


y los puntos de control del ciclo celular.

PROTENAS REGULADORAS DEL CICLO CELULAR

El pasaje de una clula a travs del ciclo es controlado por protenas citoplasmticas. Los
principales reguladores del ciclo en clulas animales son:

1. Las ciclinas, protenas que controlan la actividad de sus proteinquinasas


dependientes. La concentracin de ciclinas vara en forma cclica, aumentando o disminuyendo
durante el transcurso del ciclo celular. Esto se debe a variaciones en la velocidad de
degradacin de la ciclina, dado que la velocidad de sntesis es casi constante durante todo el
ciclo. En los mamferos existen 6 ciclinas como mnimo, denominadas A, B, C, D, E y F (Fig.
12.4b), pero nosotros las clasificaremos como ciclinas de G1 y ciclinas mitticas. Las ciclinas
G1 se unen a sus quinasas dependientes de ciclinas (Cdk2) durante G1 siendo necesarias para
superar el punto de control G1 y pasar a la fase S. Las ciclinas mitticas se fijan a la quinasa
Cdk1 durante G2, siendo necesaria su presencia para que el ciclo supere el punto de control
G2 y se inicie la mitosis. (Fig. 12.3 )

2. Las quinasas dependientes de ciclinas (CDK), enzimas que mediante la fosforilacin


de determinadas protenas desencadenan los procesos subordinados del ciclo celular. En los
mamferos se conocen 5 CDK las cuales forman tres grupos principales:

Fig. 12.3 - Complejo ciclina-quinasa dependiente de ciclina activo (ciclina-CDK)

CDK de G1 (Cdk2)

CDK de fase S (Cdk2)

CDK de fase M (Cdk1)


A diferencia de la concentracin de ciclinas, la concentracin de CDK se mantiene durante
todo el ciclo celular, por permanecer constantes tanto la velocidad de sntesis como la de
degradacin (Fig. 12.4 y 12.5)

Las CDK se activan slo cuando se unen a las ciclinas para formar complejos, por lo que
requieren un nivel umbral para desencadenar la transicin a la fase siguiente del ciclo celular.

3. El Complejo Promotor de la Anafase (APC) y otras enzimas proteolticas. El APC


desencadena los eventos que conducen a la destruccin de las cohesinas [1] permitiendo a las
cromtidas hermanas separarse e iniciando la degradacin de las ciclinas mitticas.

Fig. 12.4 -Generalizacin del sistema de control del ciclo celular en eucariotas
Fig. 12. 5 - Ciclinas y CDK en un ciclo celular de vertebrados

MECANISMO DE REGULACIN DEL CICLO CELULAR

Al finalizar la mitosis aumenta la expresin de la ciclina G1 (E), esta ciclina se unir a la su


quinasa (Cdk2) formando un complejo activo conocido como factor promotor de Fase S (FPS
). Este FPS slo puede actuar sobre cromosomas en estado Pre-Replicativo. As se
denominan por poseer sobre cada origen de replicacin un complejo multiproteico llamado
Pre-Replicativo.

Los orgenes de replicacin (ORI) se presentan en nmero de 20 a 80 sobre cada lazo de


cromatina y se caracterizan por poseer una secuencia comn denominada secuencia de
replicacin autnoma (ARS) formada por dos secuencias "GAGGC" sobre las que se halla
unido a lo largo de todo el ciclo celular, el complejo de reconocimiento del origen de
replicacin (ORC), uno de los complejos protecos que forma parte del complejo Pre-
Replicativo (PreR). El segundo componente del complejo PreR es la protena Cdc6p (cell
division cycle protein), que se sintetiza en G1 e inserta sobre los orgenes de replicacin al
ltimo componente, las protenas de mantenimiento de los minimicrosomas (MCM). (Fig.
12.6)

El nivel creciente de FPS al inicio de la fase S induce la apertura de los orgenes de


replicacin, activando a las molculas responsables de la sntesis de ADN e induciendo la
separacin del complejo Pre-R del componente Cdc6p y MCM. Separados estos componentes,
se inicia la sntesis, y por lo tanto el FPS no se requiere ms, siendo su componente lbil, la
ciclina de G1, degradada en los proteosomas.

Los cromosomas a partir de este momento se denominarn cromosomas Post-


Replicativos (slo presentan asociado a los orgenes de replicacin el ORC). Los cromosomas
se mantendrn en estado Post-R hasta el inicio de la anafase.
Degradadas las ciclinas G1, el nivel de ciclinas mitticas aumenta.

Un nuevo participante entra al ciclo, el complejo promotor de la mitosis, FPM, formado por
las ciclinas mitticas ms las quinasas dependientes de ciclinas de M (Cdk1). ste inicia el
ensamblado del huso mittico, la desintegracin de la envoltura nuclear y la condensacin de
los cromosomas, al inducir la fosforilacin de diferentes sustratos como las lminas
nucleares, conduciendo a la clula a la metafase.

A esta altura del ciclo, el FPM activa el complejo promotor de la Anafase, APC, que permite
la separacin de las cromtides hermanas y su migracin a los polos (anafase). As se completa
la mitosis, se destruyen las ciclinas de fase M y se activan las ciclinas de G1 para el prximo
ciclo celular.

Fig. 12.6 - Modelo simplificado propuesto para la replicacin de cromosomas eucariotas

CONTROL DE CALIDAD DEL CICLO CELULAR (Fig. 12.7)

Durante el ciclo celular, la clula pasa al menos tres puntos de control (checkpoints):

Punto de control G1, en este punto el sistema de control de la clula pondr en


marcha el proceso que inicia la fase S. El sistema evaluar la integridad del ADN (que no este
daado), la presencia de nutrientes en el entorno y el tamao celular. Aqu es donde
generalmente actan las seales que detienen el ciclo (arresto celular) .

Punto de control G2, en l se pone en marcha el proceso que inicia la fase M. En


este punto, el sistema de control verificar que la duplicacin del ADN se halla completado
(que no este daado), si es favorable el entorno y si la clula es lo suficientemente grande
para dividirse.

Punto de control de la Metafase o del Huso, verifica si los cromosomas estn


alineados apropiadamente en el plano metafsico antes de entrar en anafase. Este punto
protege contra prdidas o ganancias de cromosomas, siendo controlado por la activacin del
APC.

Fig. 12.7 - Puntos de Control e Ingreso de la informacin Reguladora al Sistema de Control del Ciclo
Celular

Protena p53, el guardin del genoma

Como hemos mencionado en los prrafos precedentes, tanto en el punto de control G1 como
G2 se verifica la integridad del ADN. Ante la presencia de ADN daado se genera una seal
que retrasa la entrada en fase M. El mecanismo depende de una protena llamada p53, que se
acumula en la clula en respuesta a las alteraciones de ADN, deteniendo el sistema de control
en G1 y por lo tanto impidiendo la posterior entrada en mitosis. El gen p53 es uno de los genes
supresores de tumores ms conocidos, que no slo detiene el ciclo (arresto celular), sino
tambin participa en la apoptosis (muerte celular programada) forzando a las clulas al
suicidio cuando el dao en el ADN es irreparable.

Las clulas que presentan los dos alelos del gen p53 mutados, tendrn protena p53 no
activa y por lo tanto continuarn dividindose a pesar del dao en su genoma, por lo tanto
desarrollarncncer. Las mutaciones del gen p53 presenta una alta incidencia en la mayora
de los cnceres humanos.

Cmo acta la p53?

Cuando el ADN presenta un dao "limitado", aumentan los niveles de protena p53. Dicha
protena activa la transcripcin del gen p21, que codifica a la protena p21. Esta ltima
protena ejerce su efecto inhibidor unindose al complejo ciclina-Cdk2 y deteniendo el ciclo.
Cuando el ADN es reparado, la protena p53 se libera del promotor del gen p21, provocando
el descenso en los niveles de p21. Esto permite restaurar la actividad del complejo ciclina-
Cdk2.

Fig. 12.8 - Accin de la Protena p53 en el Control del Ciclo Celular

ONCOGENES Y CNCER

Los genes supresores de tumores, codifican para productos celulares que inhiben la
proliferacin celular. Para impedir el efecto protector que ejercen sobre el genoma, se
requiere la mutacin de sus dos alelos.

Los genes conocidos como protooncogenes codifican protenas que estimulan la divisin
celular, por ejemplo, factores del crecimiento o receptores de factores del crecimiento.

La mutacin de uno de los dos alelos que codifican para un protooncogen, lo transforma en
un oncogen capaz de originar productos celulares que estimulan la divisin celular de forma
incontrolada conduciendo al cncer, con alteracin de los mecanismos de control del ciclo
celular.

En la siguiente tabla se mencionan a titulo informativo los oncogenes y genes supresores de


tumores mejor conocidos por su expresin durante el ciclo celular.

Tabla 12.1 - ALGUNOS GENES RELACIONADOS CON CNCERES EN HUMANOS


Genes para factores de crecimiento o sus receptores
PDGF Codifica el Factor de crecimiento derivado de las plaquetas.
Responsable de glioma (un cncer del cerebro)
erb-B Codifica al Factor de crecimiento epidrmico. Relacionado con
ONCOGENES gliobastoma (cncer del cerebro) y cncer de mama.
erb-B2 Codifica receptor de factor de crecimiento. Relacionado con
cncer de mama, glndulas salivales y ovario.
RET Codifica receptor de Factor del crecimiento. Relacionado con
cncer de tiroides.
Genes para transductores citoplasmticos en vas estimuladoras
Ki-ras Responsable de cncer de pulmn, ovario, colon y pncreas.
N-ras Relacionado con leucemias.
Genes para factores de transcripcin que activan genes promotores del
crecimiento
c-myc Relacionado con leucemias y cnceres de estmago, pulmn y
mamas
N-myc Relacionado con neuroblastoma (cncer de clulas nerviosas) y
glioblastoma
ONCOGENES
L-myc Relacionado con cncer de pulmn.
Genes para otros tipos de molculas
Bcl-2 Codifica para una protena que normalmente bloquea la apoptosis.
Relacionado con linfoma de clulas foliculares B.
Bcl-1 Tambin llamado PRADI. Codifica la ciclina D1, un ciclina
reguladora del ciclo celular. Relacionada con cncer de mama,
cabeza y cuello.
MDM2 Codifica un antagonista de la protena p53. Participa en sarcomas y
otros cnceres.
Genes de protenas citoplasmticas
APC Relacionada con cncer de coln y estmago.
DPC4 Codifica para una molcula transductora en una va que inhibe la
divisin celular. Relacionada con cncer pancretico.
NF-1 Codifica para una protena que inhibe a la protena Ras.
Relacionada con neurofibroma y feocromocitoma (cncer del
sistema nervioso perifrico) y leucemia mieloide.
GENES NF-2 Relacionado con meningioma y ependinoma (encfalo) y
SUPRESORES DE schwanoma (nervios perifricos)
TUMORES Genes de protenas nucleares
MTS1 Codifica para la protena p16, uno de los frenos del sistema de
control del ciclo celular. Relacionada con muchos cnceres.
RB Codifica para la protena RB (retinoblastoma). Esta protena es uno
de los principales frenos en el ciclo celular.
p53 Codifica para la protena p53, la cual detiene la divisin celular e
induce a las clulas anormales al suicidio (apoptosis). Relacionado
con la mayora de los cnceres .
WT1 Relacionado con el Tumor de Wilms del rin.
Genes que codifican protenas de ubicacin an no determinada
BRCA1 Relacionado en cnceres de mama y ovario.
BRCA2 Relacionado con cncer de mama.
VHL Relacionado con cncer de clulas renales.

DUPLICACIN DEL ADN

CARACTERSTICAS DE LA DUPLICACIN DEL ADN

Aunque los principios generales de la duplicacin o replicacin del ADN son sencillos y
pueden considerarse como consecuencia directa de su estructura, el proceso requiere una
maquinaria compleja que contiene una gran cantidad de enzimas y protenas que actan en
conjunto.

Fig. 12.9 - La duplicacin del ADN se produce previo desenrollamiento de las dos cadenas
de la doble hlice, usando cada una como molde para sintetizar las nuevas cadenas.

1. MLTIPLES PUNTOS DE ORIGEN

Los cromosomas eucariontes tienen una gran cantidad de ADN, el cual se halla contenido en
dos molculas lineales, una para cada cromtide. Si estas molculas se replicasen a partir
de un sitio nico de origen, la etapa S de la Interfase sera extremadamente larga. Las
clulas eucariontes resuelven este problema disponiendo de mltiples sitios de origen de la
replicacin en cada cromosoma. En ellos, el ADN presenta secuencias especiales de
nucletidos. Adems todos los orgenes tienen en comn secuencias conservadas de
aproximadamente doce pares de nucletidos, llamados ARS (autonomus replication
secuence).
Fig. 12.10 - La replicacin siempre comienza en los sitios de origen en cada cromosoma. En
ellos el ADN presenta secuencias especiales de nucletidos

2. DESENROLLAMIENTO DE LAS CADENAS DE ADN

En cada cromosoma, las dos cadenas del ADN se encuentran arrolladas una a la otra como
los hilos de una soga. Si tratamos de separarlas, la soga debe apretarse ms en las vueltas
restantes o girar. Algo similar ocurre en el ADN, cuando las cadenas complementarias se
separan para iniciar la duplicacin. En ese momento aumenta la tensin torsional en el
sector no duplicado de la doble hlice.

Fig. 12. 11 - Separacin progresiva de las dos cadenas de ADN a nivel de la horquilla de
replicacin y su posible consecuencia biolgica.

El desenrollamiento es realizado por las enzimas ADN-helicasas, las cuales recorren la


hlice desenrollando las hebras del ADN a medida que avanzan. Una vez separadas, las
cadenas se combinan con las protenas SSB, llamadas tambin protenas
desestabilizadoras, que evitan el autoapareamiento entre las bases complementarias
libremente expuestas.
Fig. 12.12 - Cadenas adelantada y retrasada del ADN durante la replicacin. La helicasa
separa a las dos cadenas del ADN y las protenas SSB evitan autoapareamientos entre las
bases complementarias libremente expuestas en la cadena atrasada.

A medida que la enzima helicasa abre la doble hlice, dos enzimas complementarias:
la topoisomerasa I y la topoisomerasa II o girasa, van disminuyendo la tensin torsional
acumulada por el superenrollamiento en el sector no replicado de la doble hlice.

La topoisomerasa I primero corta una de las cadenas del ADN, luego la cadena cortada
gira una vuelta en torno a su propio eje y finalmente vuelve a unir los extremos cortados.

La topoisomerasa II corta las dos cadenas, las cuales luego de girar una vuelta alrededor
del eje de la doble hlice, restablecen sus uniones.

Ambas enzimas utilizan energa del ATP y se comportan como nucleasas (cortando las
cadenas de ADN) y luego como ligasas (restableciendo las uniones fosfodister).

Las topoisomerasas I y II se diferencian no slo porque la primera corta una de las cadenas
y la segunda corta las dos, sino tambin porque la topoisomerasa I realiza
desenrollamientos de corto alcance y la girasa abarca una extensin de ADN bastante
mayor.
Fig. 12.12 - Efecto hipottico de la topoisomerasa II para evitar el superenrollamiento que se
produce en el ADN como consecuencia de la separacin progresiva de sus cadenas.

3. LA DUPLICACIN DEL ADN ES BIDIRECCIONAL

Al abrirse la doble hlice se forma una burbuja de replicacin, cuyo tamao aumenta a
medida que avanza la separacin de las dos cadenas del ADN, fenmeno que se produce en
ambos extremos de la burbuja en forma simultnea. Se establece de este modo, en cada
uno de los extremos, una estructura en forma de Y, a la que llamamos horquilla de
replicacin, cuyos brazos representan a las cadenas ya separadas de ADN y el tronco la
doble hlice en vas de separacin. As cada burbuja tiene dos horquillas de replicacin que
a partir de un punto de origen comn avanzan en direcciones opuestas. Las horquillas
desaparecen cuando se van integrando a las burbujas contiguas. Las horquillas que recorren
los telmeros desaparecen cuando se separa el ltimo par de nucletidos.

El segmento de ADN que se sintetiza a partir de un origen de replicacin (con sus dos
horquillas), lo llamamos replicn. De este modo la replicacin del ADN termina cuando se
ensamblan los sucesivos replicones. Esto permite que el ADN se sintetice en un tiempo
bastante breve para el ciclo de vida de una clula.
Fig. 12. 14 - Esquema que muestra dos replicones contiguos y los puntos donde se origina la
replicacin (flechas). Puede observarse el carcter bidireccional de la replicacin y los
sectores donde el ADN se sintetiza en forma continua y discontinua.

4. LA SNTESIS DE ADN ES DISCONTINUA

Una de las caractersticas de las ADN-polimerasas es que slo pueden actuar en direccin
5 3, por agregado de nucletidos en el extremo 3 de las cadenas nuevas. Como vimos,
a medida que se separan las cadenas progenitoras en la horquilla de replicacin, una
presenta sus nucletidos en direccin 5 3 y la otra en direccin 3 5. De manera
que la primera al ser copiada debera formar una cadena hija en sentido 3 5, algo que
las polimerasas no pueden hacer.

Las clulas solucionan esta situacin utilizando estrategias distintas en la construccin de


cada una de las nuevas cadenas. La cadena hija que se form en direccin 5' 3 se
construye en forma continua mediante el agregado de nucletidos en el extremo 3 a
medida que avanza la horquilla de replicacin. En cambio la otra cadena hija es sintetizada
de manera discontinua, en pequeos tramos, llamados fragmentos de Okazaki, los cuales se
unen entre s a medida que se sintetizan, por accin de la enzima ADN-ligasa.

Por lo expuesto, podemos decir que la sntesis del ADN es un proceso bidireccional, no slo
porque se produce en dos direcciones divergentes a partir de una misma burbuja de
replicacin, sino tambin porque las cadenas de la doble hlice son sintetizadas en
direcciones opuestas.

Fig. 12. 15 - Replicacin semiconservativa del ADN.

5. MODELO SEMICONSERVATIVO
Como las nuevas hlices de ADN estn formadas por una cadena original (preexistente) que
sirvi de molde y una cadena nueva (recin sintetizada) decimos que el mecanismo de
replicacin es semiconservativo.

INICIO DE LA SNTESIS DE ADN

Para iniciar la sntesis de las cadenas complementarias se requiere adems del ADN molde
un cebador o primer , que consiste en una pequea cadena de ARN de unos diez nucletidos
de largo. La sntesis del cebador es catalizada por una enzima llamada ARN-primasa y. el
cebador queda unido al ADN temporariamente. Una vez sintetizado el cebador la sntesis
contina si la ADN-polimerasa tiene disponibles suficientes desoxirribonucletidos
trifosfatados (dATP, dGTP, dCCP y dTTP). stos se agregan en la cadena nueva de acuerdo
a la secuencia de nucletidos de la cadena que sirve de molde.

Gran parte de la energa requerida durante la replicacin la aportan los


desoxirribonucletidos trifosfatados, que hidrolizan los ltimos dos grupos fosfato
(liberando energa) cuando se unen entre s.

Al iniciarse la sntesis continua del ADN, en cada origen se forman


dos cebadores orientados divergentemente uno en cada cadena de la doble hlice y a
continuacin la ADN-polimerasa cataliza la sntesis de la cadena continua agregando
nucletidos en el extremo 3 de la hebra en formacin. Mientras tanto los cebadores son
removidos por una nucleasa reparadora y su lugar es reemplazado por un fragmento de
ADN equivalente sintetizado por la ADN-polimerasa .

Como vimos la cadena continua requiere un solo cebador que se forma a comienzo de la
replicacin, en cambio la cadena discontinua necesita muchos cebadores, uno para cada
fragmento de Okazaki. La enzima responsable de la sntesis discontinua es la ADN-
polimerasa . Cabe sealar que las ADN-polimerasas son sostendas por un anillo proteico
llamado PCNA (Proliferating Cell Nuclear Antigen) mientras realiza el deslizamiento por la
cadena de ADN
Fig. 12.16 - Doble hlice de ADN desenrrollndose. Cada cadena servir de molde para la
sntesis de cadenas nuevas
Fig. 12.17 - La energa para el proceso de replicacin la proveen los mismos
desoxirribonucletidos trifosfatados, con la hidrlisis de los ltimos dos grupos fosfato-
Fig. 12. 18 - Unin del aro de PCNA a la ADN polimerasa

Los fragmentos de Okazaki alcanzan una longitud de 200 nucletidos. Una vez completa la
sntesis de un fragmento ambas enzimas se liberan y vuelven juntas hacia el ngulo de la
horquilla de replicacin, dejando atrs los 200 nucletidos del segmento que acaban de
sintetizar y otros tantos del ADN molde que se usar para copiar el prximo fragmento de
Okazaki.

Como ocurre con la polimerasa d en movimiento, la ADN-polimerasa a no se desprende del


ADN debido a que se le asocia un aro de PCNA. Luego el cebador es hidrolizado por
una nucleasa, la que se encarga tambin de reparar errores (segundo sistema de
reparacin) y los huecos son rellenados con desoxirribonucletidos por la ADN-
polimerasa . Finalmente los fragmentos de Okazaki son unidos por la ADN-ligasa.

La discontinuidad de la sntesis hace que la hebra mal orientada crezca ms lentamente que
la otra, que lo hace en forma continua, por esta razn se les asign el nombre de cadena
rezagada ycadena adelantada respectivamente.

Replicacin de la heterocromatina

La heterocromatina por estar muy compactada se replica tardamente durante la fase S


del ciclo celular.

Sntesis de histonas

Hemos sealado que el ADN se replica en forma semiconservativa, es decir que las cadenas
de la doble hlice progenitora, al separarse para su replicacin, se comparten por igual en
ambos cromosomas hijos. En cambio no se sabe como se segregan las histonas. Es posible
que al cabo de la replicacin sean heredadas totalmente por uno de los cromosomas hijos,
en este caso el otro cromosoma hijo debe procurarse de la totalidad de histonas nuevas.

En su mayor parte las histonas se sintetizan durante la fase S de la interfase y se


incorporan al cromosoma apenas es duplicado el ADN

Replicacin en Procariontes

Muchas de las caractersticas esenciales de la duplicacin del ADN son universales, aunque
existen algunas diferencias entre procariontes y eucariontes debido a que su material
gentico est organizado de manera distinta.
En las bacterias casi todo el ADN se encuentra formando una cadena circular, en cambio en
los eucariontes cada cromosoma no duplicado contiene una cadena lineal asociada a una gran
cantidad de protenas y algo de ARN.

En procariontes al existir un nico punto de origen se forma slo un ojal de replicacin.


Aqu actan tres ADN-polimerasas:

ADN-polimerasa I, es la que elimina el cebador y reemplaza los ribonucletidos de ste


por desoxirribonucletidos, rellenando los huecos dejados por la ADN-polimerasa II.
Adiciona 10 nucletidos/seg.

ADN-polimerasa II, tiene actividad de nucleasa, es decir que retira nucletidos de la


cadena de ADN en los sitios donde se produjeron errores o desemparejamientos.

ADN-polimerasa III, es la enzima responsable de alargar las cadenas en el proceso de


replicacin. Adiciona 500 nucletidos/seg.
Fig. 12.19 - Mecanismo de replicacin del ADN en clulas procariontes
Fig. 12.20 - Mecanismo de replicacin en procariotas

Cuadro 12.1 - MLTIPLES FUNCIONES DE LAS ADN-POLIMERASA EN E. COLI

Sntesis de ADN en sentido 5 3

Exonucleasa en sentido 3 5
Poli. I y Poli. III

Correccin de errores, removiendo


nucletidos en sentido 5 3
Poli. I Exonucleasa en sentido 5 3

Cuadro 12.2 - PRINCIPALES ENZIMAS QUE ACTUAN EN LA REPLICACIN


Enzimas Reacciones que catalizan
Elimina el cebador, reemplazando los
ADN-polimerasa I (procariontes) ribonucletidos por desoxirribonucletidos.
Rellena los huecos del ADN.
ADN-polimerasa II (procariontes) Nucleasa, corrige errores.
Principal enzima de la replicacin. Sintetiza
ADN-polimerasa III (procariontes) la cadena nueva a partir del cebador. Realiza
correccin de pruebas.
Sintetiza los fragmentos de ADN
ADN-polimerasa (eucariontes
discontinuos a partir del cebador.
Rellena los huecos dejados por el cebador y
ADN-polimerasa (eucariontes) repara errores como un segundo sistema de
reparacin.
Sintetiza la hebra continua a partir del
ADN-polimerasa (eucariontes)
cebador y realiza lecturas de prueba.
Rompen los puentes de hidrgeno, separando
Helicasas
las cadenas del ADN.
Primasas Sintetizan el primer o cebador.
Se extienden sobre las hebras del ADN
Protenas SSB evitando autoapareamientos entre las bases
libremente expuestas
Topoisomerasas I y II Corrigen el superenrollamiento

20.-

3.- cido
Desoxirribonucleico o ADN
o DNA
A.- ESTRUCTURA.
Est formado por la unin de muchos desoxirribonucletidos. La mayora de
las molculas de ADN poseen dos cadenas antiparalelas ( una 5-3y la otra
3-5) unidas entre s mediante las bases nitrogenadas, por medio de puentes
de hidrgeno.

La adenina enlaza con la timina, mediante dos puentes de hidrgeno, mientras


que la citosina enlaza con la guanina, mediante tres puentes de hidrgeno.

El ADN es el portador de la informacion gentica, se puede decir por tanto,


que los genes estn compuestos por ADN.

ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ADN


Se trata de la secuencia de desoxirribonucletidos de una de las cadenas. La
informacin gentica est contenida en el orden exacto de los nucletidos.
ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN
Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el almacenamiento de la
informacin gentica y el mecanismo de duplicacin del ADN. Fu postulada
por Watson y Crick,basandose en:

- La difraccin de rayos X que haban realizado Franklin y Wilkins


- La equivalencia de bases de Chargaff,que dice que la suma de adeninas ms
guaninas es igual a la suma de timinas ms citosinas.

Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas


cadenas son complementarias, pues la adenina de una se une a la timina de la
otra, y la guanina de una a la citosina de la otra. Ambas cadenas son
antiparalelas, pues el extremo 3de una se enfrenta al extremo 5de la otra.

Existen tres modelos de ADN. El ADN de tipo B es el ms abundante y es el


descubierto por Watson y Crick.
ESTRUCTURA TERCIARIA DEL ADN.
Se refiere a como se almacena el ADN en un volumen reducido. Vara segn
se trate de organismos procariontes o eucariontes:

a) En procariontes se pliega como una super-hlice en forma, generalmente,


circular y asociada a una pequea cantidad de proteinas. Lo mismo ocurre en
la mitocondrias y en los plastos.

b) En eucariontes el empaquetamiento ha de ser ms complejo y compacto y


para esto necesita la presencia de proteinas, como son las histonas y otras de
naturaleza no histona (en los espermatozoides las proteinas son las
protaminas). A esta unin de ADN y proteinas se conoce como cromatina, en
la cual se distinguen diferentes niveles de organizacin:
- Nucleosoma

- Collar de perlas

- Fibra cromatnica

- Bucles radiales

- Cromosoma.

B.- DESNATURALIZACIN DEL ADN.


Cuando la temperatura alcanza el punto de fusin del ADN, la agitacin
trmica es capaz de separar las dos hebras y producir una desnaturalizacin.
Este es un proceso reversible, ya que al bajar la temperatura se puede producir
una renaturalizacin. En este proceso se rompen los puentes de hidrgeno que
unen las cadenas y se produce la separacin de las mismas, pero no se rompen
los enlaces fosfodiester covalentes que forman la secuencia de la cadena.

La desnaturalizacin del ADN puede ocurrir, tambin, por variaciones en el


pH.

Al enfriar lentamente puede renaturalizarse.


4.- ARN o cidos
ribonucleico o RNA
A.- ESTRUCTURA
Est formado por la unin de muchos ribonucletidos, los cuales se unen entre
ellos mediante enlaces fosfodiester en sentido 5-3( igual que en el ADN ).

Estn formados por una sola cadena, a excepcin del ARN bicatenario de los
reovirus.

ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ARN


Al igual que el ADN, se refiere a la secuencia de las bases nitrogenadas que
constituyen sus nucletidos.
ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ARN
Alguna vez, en una misma cadena, existen regiones con secuencias
complementarias capaces de aparearse.
ESTRUCTURA TERCIARIA DE ARN
Es un plegamiento, complicado, sobre al estructura secundaria.

B.- CLASIFICACIN DE LOS ARN.


Para clasificarlos se adopta la masa molecular media de sus cadenas, cuyo
valor se deduce de la velocidad de sedimentacin. La masa molecular y por
tanto sus dimensiones se miden en svedberg (S). Segn esto tenemos:

ARN MENSAJERO (ARNm)


Sus caractersticas son la siguientes:

- Cadenas de largo tamao con estructura primaria.

- Se le llama mensajero porque transporta la informacin necesaria para la


sntesis proteica.

- Cada ARNm tiene informacin para sintetizar una proteina determinada.

- Su vida media es corta.

a) En procariontes el extremo 5posee un grupo trifosfato

b) En eucariontes en el extremo 5posee un grupo metil-guanosina unido al


trifosfato, y el el extremo 3posee una cola de poli-A

En los eucariontes se puede distinguir tambin:


- Exones, secuencias de bases que codifican proteinas

- Intrones, secuencias sin informacin.

Un ARNm de este tipo ha de madurar (eliminacin de intrones) antes de


hacerse funcional. Antes de madurar, el ARNm recibe el nombre de ARN
heterogeneonuclear (ARNhn ).

ARN RIBOSMICO (ARNr)


Sus principales caractersticas son:

- Cada ARNr presenta cadena de diferente tamao, con estructura secundaria


y terciaria.

- Forma parte de las subunidades ribosmicas cuando se une con muchas


proteinas.

- Estn vinculados con la sntesis de proteinas.

ARN NUCLEOLAR (ARNn)


Sus caractersticas principales son:

- Se sintetiza en el nucleolo.

- Posee una masa molecular de 45 S, que actua como recursor de parte del
ARNr, concretamente de los ARNr 28 S (de la subunidad mayor), los
ARNr 5,8 S (de la subunidad mayor) y los ARNr 18 S (de la subunidad menor)

ARNu
Sus principales caractersticas son:

- Son molculas de pequeo tamao

- Se les denomina de esta manera por poseer mucho uracilo en su composicin

- Se asocia a proteinas del ncleo y forma ribonucleoproteinas pequeo


nucleares (RNPpn) que intervienen en:

a) Corte y empalme de ARN


b) Maduracin en los ARNm de los eucariontes

c) Obtencin de ARNr a partir de ARNn 45 S.

ARN TRANSFERENTE (ARNt)


Sus principales caractersticas son.

- Son molculas de pequeo tamao

- Poseen en algunas zonas estructura secundaria, lo que va hacer que en las


zonas donde no hay bases complementarias adquieran un aspecto de bucles,
como una hoja de trebol.

- Los plegamientos se llegan a hacer tan complejos que adquieren una


estructura terciaria

- Su misin es unir aminocidos y transportarlos hasta el ARNm para


sintetizar proteinas.
El lugar exacto para colocarse en el ARNm lo hace gracias a tres bases, a cuyo
conjunto se llaman anticodn (las complementarias en el ARNm se llaman
codn).
C.- SINTESIS Y LOCALIZACIN DE LOS ARN
En la clula eucarionte los ARN se sintetizan gracias a tres tipos de enzimas:

- ARN polimerasa I, localizada en el nucleolo y se encarga de la sinteis de los


ARNr 18 S, 5,8 S y 28 S.

- ARN polimerasa II, localizada en el nucleoplasma y se encarga de la sntesis


de los ARNhn, es decir de los precursores de los ARNm

- ARN polimerasa III, localizada en el nucleoplasma y se encarga de sintetizar


los ARNr 5 S y los ARNm.

cido desoxirribonucleico
DNA redirige aqu. Para otras acepciones, vase DNA (desambiguacin).

Situacin del ADN dentro de una clula eucariota.


Animacin de parte de una estructura de ADN de doble hlice

El cido desoxirribonucleico, abreviado como ADN, es un cido nucleico que contiene las
instrucciones genticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos
los organismos vivos y algunos virus, y es responsable de su transmisin hereditaria. La
funcin principal de la molcula de ADN es el almacenamiento a largo plazo
de informacin para construir otros componentes de las clulas, como las protenas y las
molculas de ARN. Los segmentos de ADN que llevan esta informacin gentica son
llamados genes, pero las otras secuencias de ADN tienen propsitos estructurales o toman
parte en la regulacin del uso de esta informacin gentica.
Desde el punto de vista qumico, el ADN es un polmero de nucletidos, es decir,
un polinucletido. Un polmero es un compuesto formado por muchas unidades simples
conectadas entre s, como si fuera un largo tren formado por vagones. En el ADN,
cada vagn es un nucletido, y cada nucletido, a su vez, est formado por un azcar
(la desoxirribosa), una base nitrogenada (que puede
ser adeninaA, timinaT, citosinaC o guaninaG) y un grupo fosfato que acta como
enganche de cada vagn con el siguiente. Lo que distingue a un vagn (nucletido) de otro
es, entonces, la base nitrogenada, y por ello la secuencia del ADN se especifica nombrando
solo la secuencia de sus bases. La disposicin secuencial de estas cuatro bases a lo largo
de la cadena (el ordenamiento de los cuatro tipos de vagones a lo largo de todo el tren) es
la que codifica la informacin gentica: por ejemplo, una secuencia de ADN puede
ser ATGCTAGATCGC... En los organismos vivos, el ADN se presenta como una doble
cadena de nucletidos, en la que las dos hebras estn unidas entre s por unas conexiones
denominadas puentes de hidrgeno.1
Para que la informacin que contiene el ADN pueda ser utilizada por la maquinaria celular,
debe copiarse en primer lugar en unos trenes de nucletidos, ms cortos y con unas
unidades diferentes, llamados ARN. Las molculas de ARN se copian exactamente del ADN
mediante un proceso denominado transcripcin. Una vez procesadas en el ncleo celular,
las molculas de ARN pueden salir al citoplasma para su utilizacin posterior. La informacin
contenida en el ARN se interpreta usando el cdigo gentico, que especifica la secuencia
de los aminocidos de las protenas, segn una correspondencia de un triplete de
nucletidos (codn) para cada aminocido. Esto es, la informacin gentica (esencialmente:
qu protenas se van a producir en cada momento del ciclo de vida de una clula) se halla
codificada en las secuencias de nucletidos del ADN y debe traducirse para poder funcionar.
Tal traduccin se realiza usando el cdigo gentico a modo de diccionario. El diccionario
"secuencia de nucletido-secuencia de aminocidos" permite el ensamblado de largas
cadenas de aminocidos (las protenas) en el citoplasma de la clula. Por ejemplo, en el
caso de la secuencia de ADN indicada antes (ATGCTAGCATCG...), la
ARN polimerasa utilizara como molde la cadena complementaria de dicha secuencia de
ADN (que sera TAC-GAT-CTA-GCG-...) para transcribir una molcula de ARNm que se
leera AUG-CUA-GAU-CGC-...; el ARNm resultante, utilizando el cdigo gentico, se
traducira como la secuencia de aminocidos metionina-leucina-cido asprtico-arginina-...
Las secuencias de ADN que constituyen la unidad fundamental, fsica y funcional de la
herencia se denominan genes. Cada gen contiene una parte que se transcribe a ARN y otra
que se encarga de definir cundo y dnde deben expresarse. La informacin contenida en
los genes (gentica) se emplea para generar ARN y protenas, que son los componentes
bsicos de las clulas, los "ladrillos" que se utilizan para la construccin de los orgnulos u
organelos celulares, entre otras funciones.
Dentro de las clulas, el ADN est organizado en estructuras llamadas cromosomas que,
durante el ciclo celular, se duplican antes de que la clula se divida. Los organismos
eucariotas (por ejemplo, animales, plantas y hongos) almacenan la mayor parte de su ADN
dentro del ncleo celular y una mnima parte en elementos celulares llamados mitocondrias,
y en los plastos y los centros organizadores de microtbulos o centrolos, en caso de
tenerlos; los organismos procariotas (bacterias y arqueas) lo almacenan en el citoplasma de
la clula y, por ltimo, los virus ADN lo hacen en el interior de la cpside de naturaleza
proteica. Existen multitud de protenas, como por ejemplo las histonas y los factores de
transcripcin, que se unen al ADN dotndolo de una estructura tridimensional determinada
y regulando su expresin. Los factores de transcripcin reconocen secuencias reguladoras
del ADN y especifican la pauta de transcripcin de los genes. El material gentico completo
de una dotacin cromosmica se denomina genoma y, con pequeas variaciones, es
caracterstico de cada especie.

ndice
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1Historia de la gentica
2Propiedades fsicas y qumicas
o 2.1Componentes
o 2.2Apareamiento de bases
2.2.1Otros tipos de pares de bases
o 2.3Estructura
2.3.1Estructuras en doble hlice
2.3.2Estructuras en cudruplex
o 2.4Hendiduras mayor y menor
o 2.5Sentido y antisentido
o 2.6Superenrollamiento
3Modificaciones qumicas
o 3.1Modificaciones de bases del ADN
o 3.2Dao del ADN
4Funciones biolgicas
o 4.1Genes y genoma
4.1.1El ADN codificante
4.1.2El ADN no codificante
o 4.2Transcripcin y traduccin
o 4.3Replicacin del ADN
4.3.1Hiptesis sobre la duplicacin del ADN
5Interacciones ADN-protena
o 5.1Protenas que unen ADN
5.1.1Interacciones inespecficas
5.1.2Interacciones especficas
o 5.2Enzimas que modifican el ADN
5.2.1Nucleasas y ligasas
5.2.2Topoisomerasas y helicasas
5.2.3Polimerasas
6Recombinacin gentica
7Evolucin del metabolismo de ADN
8Tcnicas comunes
o 8.1Tecnologa del ADN recombinante
o 8.2Secuenciacin
o 8.3Reaccin en cadena de la polimerasa (PCR)
o 8.4Southern blot
o 8.5Chips de ADN
9Aplicaciones
o 9.1Ingeniera gentica
o 9.2Medicina forense
o 9.3Bioinformtica
o 9.4Nanotecnologa de ADN
o 9.5Historia, antropologa y paleontologa
10Vase tambin
11Referencias
o 11.1Notas
o 11.2Bibliografa
12Enlaces externos

Historia de la gentica[editar]
Artculo principal: Historia de la gentica

Friedrich Miescher, bilogo y mdico suizo (1844-1895).

El ADN lo aisl por primera vez, durante el invierno de 1869, el mdico suizo Friedrich
Miescher mientras trabajaba en la Universidad de Tubinga. Miescher realizaba
experimentos acerca de la composicin qumica del pus de vendas quirrgicas desechadas
cuando not un precipitado de una sustancia desconocida que caracteriz qumicamente
ms tarde.23 Lo llam nuclena, debido a que lo haba extrado a partir de ncleos celulares.4
Se necesitaron casi 70 aos de investigacin para poder identificar los componentes y
la estructura de los cidos nucleicos.
En 1919 Phoebus Levene identific que un nucletido est formado por una base
nitrogenada, un azcar y un fosfato.5 Levene sugiri que el ADN generaba una estructura
con forma de solenoide (muelle) con unidades de nucletidos unidos a travs de los grupos
fosfato. En 1930 Levene y su maestro Albrecht Kossel probaron que la nuclena de Miescher
es un cido desoxirribonucleico (ADN) formado por cuatro bases nitrogenadas
(citosina (C), timina (T), adenina (A) y guanina (G), el azcar desoxirribosa y un grupo
fosfato, y que, en su estructura bsica, el nucletido est compuesto por un azcar unido a
la base y al fosfato.6 Sin embargo, Levene pensaba que la cadena era corta y que las bases
se repetan en un orden fijo. En 1937 William Astbury produjo el primer patrn de difraccin
de rayos X que mostraba que el ADN tena una estructura regular.7

Maclyn McCarty con Francis Crick y James D. Watson.

La funcin biolgica del ADN comenz a dilucidarse en 1928, con una serie bsica de
experimentos de la gentica moderna realizados por Frederick Griffith, quien estaba
trabajando con cepas lisas (S) o rugosas (R) de la bacteria Pneumococcus (causante
de la neumona), segn la presencia (S) o no (R) de una cpsula azucarada, que es la que
confiere virulencia (vase tambin experimento de Griffith). La inyeccin de neumococos S
vivos en ratones produce la muerte de stos, y Griffith observ que, si inyectaba ratones con
neumococos R vivos o con neumococos S muertos por calor, los ratones no moran. Sin
embargo, si inyectaba a la vez neumococos R vivos y neumococos S muertos, los ratones
moran, y en su sangre se podan aislar neumococos S vivos. Como las bacterias muertas
no pudieron haberse multiplicado dentro del ratn, Griffith razon que deba producirse algn
tipo de cambio o transformacin de un tipo bacteriano a otro por medio de una transferencia
de alguna sustancia activa, que denomin principio transformante. Esta sustancia
proporcionaba la capacidad a los neumococos R de producir una cpsula azucarada y
transformarse as en virulentas. En los siguientes 15 aos, estos experimentos iniciales se
replicaron mezclando distintos tipos de cepas bacterianas muertas por el calor con otras
vivas, tanto en ratones (in vivo) como en tubos de ensayo (in vitro).8 La bsqueda del factor
transformante que era capaz de hacer virulentas a cepas que inicialmente no lo eran
continu hasta 1944, ao en el cual Oswald Avery, Colin MacLeod y Maclyn
McCarty realizaron un experimento hoy clsico. Estos investigadores extrajeron la fraccin
activa (el factor transformante) y, mediante anlisis qumicos, enzimticos y serolgicos,
observaron que no contena protenas, ni lpidos no ligados, ni polisacridos activos, sino
que estaba constituido principalmente por "una forma viscosa de cido desoxirribonucleico
altamente polimerizado", es decir, ADN. El ADN extrado de las cepas bacterianas S muertas
por el calor lo mezclaron "in vitro" con cepas R vivas: el resultado fue que se formaron
colonias bacterianas S, por lo que se concluy inequvocamente que el factor o principio
transformante era el ADN.9
A pesar de que la identificacin del ADN como principio transformante an tard varios aos
en ser universalmente aceptada, este descubrimiento fue decisivo en el conocimiento de la
base molecular de la herencia, y constituye el nacimiento de la gentica molecular.
Finalmente, el papel exclusivo del ADN en la heredabilidad fue confirmado en 1952mediante
los experimentos de Alfred Hershey y Martha Chase, en los cuales comprobaron que el fago
T2 transmita su informacin gentica en su ADN, pero no en su protena 10 (vase
tambin experimento de Hershey y Chase).
En cuanto a la caracterizacin qumica de la molcula, Chargaff realiz en 1940 algunos
experimentos que le sirvieron para establecer las proporciones de las bases nitrogenadas
en el ADN. Descubri que las proporciones de purinas eran idnticas a las de pirimidinas, la
equimolecularidad de las bases ([A]=[T], [G]=[C]) y el hecho de que la cantidad de G+C
en una determinada molcula de ADN no siempre es igual a la cantidad de A+T y puede
variar desde el 36 hasta el 70 por ciento del contenido total.6 Con toda esta informacin y
junto con los datos de difraccin de rayos X proporcionados por Rosalind Franklin, James
Watson y Francis Crick propusieron en 1953 el modelo de la doble hlice de ADN para
representar la estructura tridimensional del polmero.11 En una serie de cinco artculos en el
mismo nmero de Nature se public la evidencia experimental que apoyaba el modelo de
Watson y Crick.12 De stos, el artculo de Franklin y Raymond Gosling fue la primera
publicacin con datos de difraccin de rayos X que apoyaba el modelo de Watson y Crick,13
14 y en ese mismo nmero de Nature tambin apareca un artculo sobre la estructura del

ADN de Maurice Wilkins y sus colaboradores.15


Watson, Crick y Wilkins recibieron conjuntamente, en 1962, despus de la muerte de
Rosalind Franklin, el Premio Nobel en Fisiologa o Medicina.16 Sin embargo, el debate
contina sobre quin debera recibir crdito por el descubrimiento.17

Propiedades fsicas y qumicas[editar]

Estructura qumica del ADN: dos cadenas de nucletidos conectadas mediante puentes de hidrgeno,
que aparecen como lneas punteadas.

El ADN es un largo polmero formado por unidades repetitivas, los nucletidos.1819 Una
doble cadena de ADN mide de 22 a 26 angstroms (2,2 a 2,6 nanmetros) de ancho, y una
unidad (un nucletido) mide 3,3 (0,33 nm) de largo.20 Aunque cada unidad individual que
se repite es muy pequea, los polmeros de ADN pueden ser molculas enormes que
contienen millones de nucletidos. Por ejemplo, el cromosoma humano ms largo,
el cromosoma nmero 1, tiene aproximadamente 220 millones de pares de bases.21
En los organismos vivos, el ADN no suele existir como una molcula individual, sino como
una pareja de molculas estrechamente asociadas. Las dos cadenas de ADN se enroscan
sobre s mismas formando una especie de escalera de caracol, denominada doble hlice.
El modelo de estructura en doble hlice fue propuesto en 1953 por James Watson y Francis
Crick (el artculo Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic
Acid fue publicado el 25 de abril de 1953 en Nature), despus de obtener una imagen de
la estructura de doble hlice gracias a la refraccin por rayos X hecha por Rosalind
Franklin.22 El xito de este modelo radicaba en su consistencia con las propiedades fsicas
y qumicas del ADN. El estudio mostraba, adems, que la complementariedad de
bases poda ser relevante en su replicacin, y tambin la importancia de la secuencia de
bases como portadora de informacin gentica.232425 Cada unidad que se repite, el
nucletido, contiene un segmento de la estructura de soporte (azcar + fosfato), que
mantiene la cadena unida, y una base, que interacciona con la otra cadena de ADN en la
hlice. En general, una base ligada a un azcar se denomina nuclesido y una base ligada
a un azcar y a uno o ms grupos fosfatos recibe el nombre de nucletido.
Cuando muchos nucletidos se encuentran unidos, como ocurre en el ADN, el polmero
resultante se denomina polinucletido.26
Componentes[editar]
Estructura de soporte: La estructura de soporte de una hebra de ADN est formada por
unidades alternas de grupos fosfato y azcar (desoxirribosa).27 El azcar en el ADN es una
pentosa, concretamente, la desoxirribosa.

cido fosfrico:

Enlace fosfodister. El grupo fosfato(PO43-) une el carbono 5' del azcar de un nuclesido con
el carbono 3' del siguiente.
Su frmula qumica es H3PO4. Cada nucletido puede contener uno
(monofosfato: AMP), dos (difosfato: ADP) o tres (trifosfato: ATP) grupos de cido
fosfrico, aunque como monmeros constituyentes de los cidos nucleicos solo
aparecen en forma de nuclesidos monofosfato.

Desoxirribosa:
Es un monosacrido de 5 tomos de carbono (una pentosa) derivado de la ribosa,
que forma parte de la estructura de nucletidos del ADN. Su frmula es C 5H10O4.
Una de las principales diferencias entre el ADN y el ARN es el azcar, pues en el
ARN la 2-desoxirribosa del ADN es reemplazada por una pentosa alternativa,
la ribosa.25
Las molculas de azcar se unen entre s a travs de grupos fosfato, que
forman enlaces fosfodister entre los tomos de carbono tercero (3, tres prima) y
quinto (5, cinco prima) de dos anillos adyacentes de azcar. La formacin
de enlaces asimtricos implica que cada hebra de ADN tiene una direccin. En
una doble hlice, la direccin de los nucletidos en una hebra (3 5) es opuesta a
la direccin en la otra hebra (5 3). Esta organizacin de las hebras de ADN se
denomina antiparalela; son cadenas paralelas, pero con direcciones opuestas. De la
misma manera, los extremos asimtricos de las hebras de ADN se
denominan extremo 5 (cinco prima) y extremo 3 (tres prima), respectivamente.

Bases nitrogenadas:
Las cuatro bases nitrogenadas mayoritarias que se encuentran en el ADN son
la adenina (A), la citosina (C), la guanina (G) y la timina (T). Cada una de estas
cuatro bases est unida al armazn de azcar-fosfato a travs del azcar para
formar el nucletido completo (base-azcar-fosfato). Las bases son compuestos
heterocclicos y aromticos con dos o ms tomos de nitrgeno, y, dentro de las
bases mayoritarias, se clasifican en dos grupos: las bases
pricas o purinas (adenina y guanina), derivadas de la purina y formadas por dos
anillos unidos entre s, y las bases pirimidnicas o bases
pirimdicas o pirimidinas (citosina y timina), derivadas de la pirimidina y con un solo
anillo.25 En los cidos nucleicos existe una quinta base pirimidnica,
denominada uracilo (U), que normalmente ocupa el lugar de la timina en el ARN y
difiere de sta en que carece de un grupo metilo en su anillo. El uracilo no se
encuentra habitualmente en el ADN, solo aparece raramente como un producto
residual de la degradacin de la citosina por procesos de desaminacin oxidativa.

Timina: 2, 4-dioxo, 5-metilpirimidina.

Timina:
En el cdigo gentico se representa con la letra T. Es un derivado pirimidnico con
un grupo oxo en las posiciones 2 y 4, y un grupo metil en la posicin 5. Forma
el nuclesido timidina (siempre desoxitimidina, ya que solo aparece en el ADN) y
el nucletido timidilato o timidina monofosfato (dTMP). En el ADN, la timina siempre
se empareja con la adenina de la cadena complementaria mediante 2 puentes de
hidrgeno, T=A. Su frmula qumica es C5H6N2O2 y su nomenclatura 2, 4-dioxo, 5-
metilpirimidina.
Citosina: 2-oxo, 4-aminopirimidina.

Citosina:
En el cdigo gentico se representa con la letra C. Es un derivado pirimidnico, con
un grupo amino en posicin 4 y un grupo oxo en posicin 2. Forma
el nuclesido citidina (desoxicitidina en el ADN) y el nucletido citidilato o
(desoxi)citidina monofosfato (dCMP en el ADN, CMP en el ARN). La citosina siempre
se empareja en el ADN con la guanina de la cadena complementaria mediante un
triple enlace, CG. Su frmula qumica es C4H5N3O y su nomenclatura 2-oxo, 4
aminopirimidina. Su masa molecular es de 111,10 unidades de masa atmica. La
citosina se descubri en 1894, al aislarla del tejido del timo de carnero.

Adenina: 6-aminopurina.

Adenina:
En el cdigo gentico se representa con la letra A. Es un derivado de la purina con
un grupo amino en la posicin 6. Forma el nuclesido adenosina(desoxiadenosina
en el ADN) y el nucletido adenilato o (desoxi)adenosina monofosfato (dAMP, AMP).
En el ADN siempre se empareja con la timina de la cadena complementaria
mediante 2 puentes de hidrgeno, A=T. Su frmula qumica es C5H5N5 y su
nomenclatura 6-aminopurina. La adenina, junto con la timina, fue descubierta en
1885 por el mdico alemn Albrecht Kossel.

Guanina: 6-oxo, 2-aminopurina.

Guanina:
En el cdigo gentico se representa con la letra G. Es un derivado prico con un
grupo oxo en la posicin 6 y un grupo amino en la posicin 2. Forma el nuclesido
(desoxi)guanosina y el nucletido guanilato o (desoxi)guanosina monofosfato
(dGMP, GMP). La guanina siempre se empareja en el ADN con la citosina de la
cadena complementaria mediante tres enlaces de hidrgeno, GC. Su frmula
qumica es C5H5N5O y su nomenclatura 6-oxo, 2-aminopurina.
Tambin existen otras bases nitrogenadas (las
llamadas bases nitrogenadas minoritarias), derivadas
de forma natural o sinttica de alguna otra base
mayoritaria. Lo son por ejemplo la hipoxantina,
relativamente abundante en el tRNA, o la cafena, ambas
derivadas de la adenina; otras, como el aciclovir, derivadas
de la guanina, son anlogos sintticos usados en terapia
antiviral; otras, como una de las derivadas del uracilo, son
antitumorales.
Las bases nitrogenadas tienen una serie de caractersticas
que les confieren unas propiedades determinadas. Una
caracterstica importante es su carcter aromtico,
consecuencia de la presencia en el anillo de dobles
enlaces en posicin conjugada. Ello les confiere la
capacidad de absorber luz en la
zona ultravioleta del espectro en torno a los 260 nm, lo
cual puede aprovecharse para determinar el coeficiente de
extincin del ADN y hallar la concentracin existente de los
cidos nucleicos. Otra de sus caractersticas es que
presentan tautomera o isomera de grupos funcionales,
debido a que un tomo de hidrgeno unido a otro tomo
puede migrar a una posicin vecina; en las bases
nitrogenadas se dan dos tipos de tautomeras:
tautomera lactama-lactima, donde el hidrgeno migra del
nitrgeno al oxgeno del grupo oxo (forma lactama) y
viceversa (forma lactima), y tautomera imina-
amina primaria, donde el hidrgeno puede estar formando
el grupo amina (forma amina primaria) o migrar al nitrgeno
adyacente (forma imina). La adenina slo puede presentar
tautomera amina-imina, la timina y el uracilo muestran
tautomera doble lactama-lactima, y la guanina y citosina
pueden presentar ambas. Por otro lado, y aunque se trate
de molculas apolares, las bases nitrogenadas presentan
suficiente carcter polar como para establecer puentes de
hidrgeno, ya que tienen tomos
muy electronegativos (nitrgeno y oxgeno) que presentan
carga parcial negativa, y tomos de hidrgeno con carga
parcial positiva, de manera que se forman dipolos que
permiten que se formen estos enlaces dbiles.
Se estima que el genoma humano haploide tiene
alrededor de 3000 millones de pares de bases. Para indicar
el tamao de las molculas de ADN se indica el nmero de
pares de bases, y como derivados hay dos unidades de
medida muy utilizadas, la kilobase (kb), que equivale a
1000 pares de bases, y la megabase (Mb), que equivale a
un milln de pares de bases.
Apareamiento de bases[editar]
Vase tambin: Par de bases
Un par de bases CG con tres puentes de hidrgeno.

Un par A=T con dos puentes de hidrgeno. Los puentes de


hidrgeno se muestran como lneas discontinuas.

La dble hlice de ADN se mantiene estable mediante la


formacin de puentes de hidrgeno entre las bases
asociadas a cada una de las dos hebras. Para la formacin
de un enlace de hidrgeno una de las bases debe
presentar un "donador" de hidrgenos con un tomo de
hidrgeno con carga parcial positiva (-NH2 o -NH) y la otra
base debe presentar un grupo "aceptor" de hidrgenos con
un tomo cargado electronegativamente (C=O o N). Los
puentes de hidrgeno son uniones ms dbiles que los
tpicos enlaces qumicos covalentes, como los que
conectan los tomos en cada hebra de ADN, pero ms
fuertes que interacciones hidrfobas individuales, enlaces
de Van der Waals, etc. Como los puentes de hidrgeno no
son enlaces covalentes, pueden romperse y formarse de
nuevo de forma relativamente sencilla. Por esta razn, las
dos hebras de la doble hlice pueden separarse como una
cremallera, bien por fuerza mecnica o por
alta temperatura.28 La doble hlice se estabiliza adems
por el efecto hidrofbico y el apilamiento, que no se ven
influidos por la secuencia de bases del ADN.29
Cada tipo de base en una hebra forma un enlace
nicamente con un tipo de base en la otra hebra, lo que se
denomina complementariedad de las bases. As, las
purinas forman enlaces con las pirimidinas, de forma que
A se enlaza solo con T, y C solo con G. La organizacin de
dos nucletidos apareados a lo largo de la doble hlice se
denomina apareamiento de bases. Este emparejamiento
corresponde a la observacin ya realizada por Erwin
Chargaff (1905-2002),30 que mostr que la cantidad de
adenina era muy similar a la cantidad de timina, y que la
cantidad de citosina era igual a la cantidad de guanina en
el ADN. Como resultado de esta complementariedad, toda
la informacin contenida en la secuencia de doble hebra
de la hlice de ADN est duplicada en cada hebra, lo cual
es fundamental durante el proceso de replicacin del ADN.
En efecto, esta interaccin reversible y especfica entre
pares de bases complementarias es crtica para todas las
funciones del ADN en los organismos vivos.18
Como se ha indicado anteriormente, los dos tipos de pares
de bases forman un nmero diferente de enlaces de
hidrgeno: A=T forman dos puentes de hidrgeno, y CG
forman tres puentes de hidrgeno (ver imgenes). El par
de bases GC es por tanto ms fuerte que el par de bases
AT. Como consecuencia, tanto el porcentaje de pares de
bases GC como la longitud total de la doble hlice de ADN
determinan la fuerza de la asociacin entre las dos hebras
de ADN. Las dobles hlices largas de ADN con alto
contenido en GC tienen hebras que interaccionan ms
fuertemente que las dobles hlices cortas con alto
contenido en AT.31 Por esta razn, las zonas de la doble
hlice de ADN que necesitan separarse fcilmente tienden
a tener un alto contenido en AT, como por ejemplo la
secuencia TATAAT de la caja de Pribnow de
algunos promotores.32 En el laboratorio, la fuerza de esta
interaccin puede medirse buscando la temperatura
requerida para romper los puentes de hidrgeno,
la temperatura de fusin (tambin denominado valor Tm,
del ingls melting temperature). Cuando todas las pares de
bases en una doble hlice se funden, las hebras se
separan en solucin en dos hebras completamente
independientes. Estas molculas de ADN de hebra simple
no tienen una nica forma comn, sino que algunas
conformaciones son ms estables que otras.33
Otros tipos de pares de bases[editar]

Par de bases A=T de tipo Watson-Crick. En azul el donador


de hidrgenos y en rojo el aceptor.
Par de bases A=T de tipo Watson-Crick reverso. En azul el
donador de hidrgenos y en rojo el aceptor. Ntese que la
pirimidina ha sufrido un giro de 180 sobre el eje del carbono
6.

Existen diferentes tipos de pares de bases que se pueden


formar segn el modo como se forman los puentes de
hidrgeno. Los que se observan en la doble hlice de ADN
son los llamados pares de bases Watson-Crick, pero
tambin existen otros posibles pares de bases, como los
denominados Hoogsteen y Wobble u oscilante, que
pueden aparecer en circunstancias particulares. Adems,
para cada tipo existe a su vez el mismo par reverso, es
decir, el que se da si se gira la base pirimidnica 180 sobre
su eje.

Watson-Crick (pares de bases de la doble hlice): los


grupos de la base prica que intervienen en el enlace
de hidrgeno son los que corresponden a las
posiciones 1 y 6 (N aceptor y -NH2 donador si la purina
es una A) y los grupos de la base pirimidnica, los que
se encuentran en las posiciones 3 y 4 (-NH donador y
C=O aceptor si la pirimidina es una T). En el par de
bases Watson-Crick reverso participaran los grupos
de las posiciones 2 y 3 de la base pirimidnica (ver
imgenes).

Hoogsteen: en este caso cambian los grupos de la


base prica, que ofrece una cara diferente (posiciones
6 y 7) y que forman enlaces con los grupos de las
pirimidinas de las posiciones 3 y 4 (como en Watson-
Crick). Tambin puede haber Hoogsteen reversos.
Con este tipo de enlace pueden unirse A=U
(Hoogsteen y Hoogsteen reverso) y A=C (Hoogsteen
reverso).

Wobble u oscilante: este tipo de enlace permite que se


unan guanina y timina con un doble enlace (G=T). La
base prica (G) forma enlace con los grupos de las
posiciones 1 y 6 (como en Watson-Crick) y la pirimidina
(T) con los grupos de las posiciones 2 y 3. Este tipo de
enlace no funcionara con A=C, ya que quedaran
enfrentados los 2 aceptores y los 2 donadores, y solo
se podra dar en el caso inverso. Encontramos pares
de bases de tipo oscilante en el ARN, durante el
apareamiento de codn y anticodn. Con este tipo de
enlace pueden unirse G=U (oscilante y oscilante
reverso) y A=C (oscilante reverso).
En total, en su forma tautomrica mayoritaria, existen 28
posibles pares de bases nitrogenadas: 10 posibles pares
de bases purina-pirimidina (2 pares Watson-Crick y 2
Watson Crick reverso, 1 par Hoogsteen y 2 pares
Hoogsteen reverso, 1 par oscilante y 2 pares oscilante
reverso), 7 pares homo purina-purina (A=A, G=G), 4 pares
A=G y 7 pares pirimidina-pirimidina. Esto sin contar con los
pares de bases que pueden formarse si tambin tenemos
en cuenta las otras formas tautomricas minoritarias de las
bases nitrogenadas; stos, adems, pueden ser
responsables de mutaciones puntuales por sustitucin de
tipo transicin.
Estructura[editar]
El ADN es una molcula bicatenaria, es decir, est
formada por dos cadenas dispuestas de forma antiparalela
y con las bases nitrogenadas enfrentadas. En su estructura
tridimensional, se distinguen distintos niveles:3435
Estructura primaria
Secuencia de nucletidos encadenados. Es en estas cadenas donde se encuentra
la informacin gentica, y dado que el esqueleto es el mismo para todos, la diferencia
de la informacin radica en la distinta secuencia de bases nitrogenadas. Esta
secuencia presenta un cdigo, que determina una informacin u otra, segn el orden
de las bases.
Estructura secundaria
Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el almacenamiento de la
informacin gentica y el mecanismo de duplicacin del ADN. Fue postulada por
Watson y Crick, basndose en la difraccin de rayos X que haban realizado Franklin
y Wilkins, y en la equivalencia de bases de Chargaff, segn la cual la suma de
adeninas ms guaninas es igual a la suma de timinas ms citosinas.
Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas cadenas
son complementarias, pues la adenina y la guanina de una cadena se unen,
respectivamente, a la timina y la citosina de la otra. Ambas cadenas son
antiparalelas, pues el extremo 3 de una se enfrenta al extremo 5' de la homloga.
Existen tres modelos de ADN. El ADN de tipo B es el ms abundante y es el que
tiene la estructura descrita por Watson y Crick.
Estructura terciaria
Se refiere a cmo se almacena el ADN en un espacio reducido, para formar
los cromosomas. Vara segn se trate de organismos procariotas o eucariotas:

1. En procariotas el ADN se pliega como una sper-hlice, generalmente en


forma circular y asociada a una pequea cantidad de protenas. Lo mismo
ocurre en orgnulos celulares como las mitocondrias y en los cloroplastos.
2. En eucariotas, dado que la cantidad de ADN de cada cromosoma es muy
grande, el empaquetamiento ha de ser ms complejo y compacto; para ello
se necesita la presencia de protenas, como las histonasy otras protenas de
naturaleza no histnica (en los espermatozoides estas protenas son
las protaminas).34
Estructura cuaternaria
La cromatina presente en el ncleo tiene un grosor de 300 , pues la fibra de
cromatina de 100 se enrolla formando una fibra de cromatina de 300 . El
enrollamiento de los nucleosomas recibe el nombre de solenoide. Dichos solenoides
se enrollan formando la cromatina del ncleo interfsico de la clula eucariota.
Cuando la clula entra en divisin, el ADN se compacta ms, formando as
los cromosomas.
Estructuras en doble
hlice[editar]

De izquierda a derecha, las


estructuras de ADN A, B y Z.

El ADN existe en muchas


conformaciones.27 Sin embargo, en organismos vivos slo se han observado las
conformaciones ADN-A, ADN-B y ADN-Z. La conformacin que adopta el ADN depende de
su secuencia, la cantidad y direccin de superenrollamiento que presenta, la presencia
de modificaciones qumicas en las bases y las condiciones de la solucin, tales como la
concentracin de iones de metales y poliaminas.36 De las tres conformaciones, la forma "B"
es la ms comn en las condiciones existentes en las clulas.37 Las dos dobles hlices
alternativas del ADN difieren en su geometra y dimensiones.
La forma "A" es una espiral que
gira hacia la derecha, ms amplia que la "B", con una hendidura menor superficial y ms
amplia, y una hendidura mayor ms estrecha y profunda. La forma "A" ocurre en condiciones
no fisiolgicas en formas deshidratadas de ADN, mientras que en la clula puede producirse
en apareamientos hbridos de hebras ADN-ARN, adems de en complejos enzima-ADN.38
39

Los segmentos de ADN en los


que las bases han sido modificadas por metilacin pueden sufrir cambios conformacionales
mayores y adoptar la forma "Z". En este caso, las hebras giran alrededor del eje de la hlice
en una espiral que gira a mano izquierda, lo opuesto a la forma "B" ms frecuente. 40 Estas
estructuras poco frecuentes pueden ser reconocidas por protenas especficas que se unen
a ADN-Z y posiblemente estn implicadas en la regulacin de la transcripcin.41
Estructuras en
cudruplex[editar]
Estructura de un ADN en cudruplex
formada por repeticiones en los telmeros. La conformacin de la estructura de soporte del ADN
difiere significativamente de la tpica estructura en hlice.42

En los extremos de los


cromosomas lineales existen regiones especializadas de ADN denominadas telmeros. La
funcin principal de estas regiones es permitir a la clula replicar los extremos cromosmicos
utilizando la enzima telomerasa, puesto que las enzimas que replican el resto del ADN no
pueden copiar los extremos 3' de los cromosomas.43 Estas terminaciones cromosmicas
especializadas tambin protegen los extremos del ADN, y evitan que los sistemas
de reparacin del ADNen la clula los procesen como ADN daado que debe ser
corregido.44 En las clulas humanas, los telmeros son largas zonas de ADN de hebra
sencilla que contienen algunos miles de repeticiones de una nica secuencia TTAGGG.45
Estas secuencias ricas en
guanina pueden estabilizar los extremos cromosmicos mediante la formacin de
estructuras de juegos apilados de unidades de cuatro bases, en lugar de los pares de bases
encontrados normalmente en otras estructuras de ADN. En este caso, cuatro bases guanina
forman unidades con superficie plana que se apilan una sobre otra, para formar una
estructura cudruple-G estable.46 Estas estructuras se estabilizan formando puentes de
hidrgeno entre los extremos de las bases y la quelatacin de un metal inico en el centro
de cada unidad de cuatro bases.47 Tambin se pueden formar otras estructuras, con el juego
central de cuatro bases procedente, o bien de una hebra sencilla plegada alrededor de las
bases, o bien de varias hebras paralelas diferentes, de forma que cada una contribuye con
una base a la estructura central.
Adems de estas estructuras
apiladas, los telmeros tambin forman largas estructuras en lazo, denominadas lazos
telomricos o lazos-T (T-loops en ingls). En este caso, las hebras simples de ADN se
enroscan sobre s mismas en un amplio crculo estabilizado por protenas que se unen a
telmeros.48 En el extremo del lazo T, el ADN telomrico de hebra sencilla se sujeta a una
regin de ADN de doble hebra porque la hebra de ADN telomrico altera la doble hlice y
se aparea a una de las dos hebras. Esta estructura de triple hebra se denomina lazo de
desplazamiento o lazo D (D-loop).46
Hendiduras mayor y
menor[editar]
Animacin de la estructura de una
seccin de ADN. Las bases se encuentran horizontalmente entre las dos hebras en espiral. Versin
ampliada49

Doble hlice: a) Dextrgira, b)


Levgira.

La doble hlice es una


espiral dextrgira, esto es, cada una de las cadenas de nucletidos gira a derechas; esto
puede verificarse si nos fijamos, yendo de abajo a arriba, en la direccin que siguen los
segmentos de las hebras que quedan en primer plano. Si las dos hebras giran a derechas
se dice que la doble hlice es dextrgira, y si giran a izquierdas, levgira(esta forma puede
aparecer en hlices alternativas debido a cambios conformacionales en el ADN). Pero en la
conformacin ms comn que adopta el ADN, la doble hlice es dextrgira, girando cada
par de bases respecto al anterior unos 36.50
Cuando las dos hebras de ADN
se enrollan una sobre la otra (sea a derechas o a izquierdas), se forman huecos o hendiduras
entre una hebra y la otra, dejando expuestos los laterales de las bases nitrogenadas del
interior (ver la animacin). En la conformacin ms comn que adopta el ADN aparecen,
como consecuencia de los ngulos formados entre los azcares de ambas cadenas de cada
par de bases nitrogenadas, dos tipos de hendiduras alrededor de la superficie de la doble
hlice: una de ellas, la hendidura o surco mayor, que mide 22 (2,2 nm) de ancho, y la otra,
la hendidura o surco menor, que mide 12 (1,2 nm) de ancho.51 Cada vuelta de hlice, que
es cuando sta ha realizado un giro de 360 o lo que es lo mismo, de principio de hendidura
mayor a final de hendidura menor, medir por tanto 34 , y en cada una de esas vueltas hay
unos 10,5 pb.

Hendiduras mayor y menor de la


doble hlice.

La anchura de la hendidura mayor


implica que los extremos de las bases son ms accesibles en sta, de forma que la cantidad
de grupos qumicos expuestos tambin es mayor lo cual facilita la diferenciacin entre los
pares de bases A-T, T-A, C-G, G-C. Como consecuencia de ello, tambin se ver facilitado
el reconocimiento de secuencias de ADN por parte de diferentes protenas sin la necesidad
de abrir la doble hlice. As, protenas como los factores de transcripcin que pueden unirse
a secuencias especficas, frecuentemente contactan con los laterales de las bases
expuestos en la hendidura mayor.52 Por el contrario, los grupos qumicos que quedan
expuestos en la hendidura menor son similares, de forma que el reconocimiento de los pares
de bases es ms difcil; por ello se dice que la hendidura mayor contiene ms informacin
que la hendidura menor.50
Sentido y
antisentido[editar]
Artculo principal: Antisentido

Una secuencia de ADN se


denomina sentido (en ingls, sense) si su secuencia es la misma que la secuencia de
un ARN mensajero que se traduce en una protena. La secuencia de la hebra de ADN
complementaria se denomina '"'antisentido (antisense). En ambas hebras de ADN de la
doble hlice pueden existir tanto secuencias sentido, que codifican ARNm,
como antisentido, que no lo codifican. Es decir, las secuencias que codifican ARNm no estn
todas presentes en una sola de las hebras, sino repartidas entre las dos hebras. Tanto
en procariotas como en eucariotas se producen ARN con secuencias antisentido, pero la
funcin de esos ARN no est completamente clara.53 Se ha propuesto que los
ARN antisentido estn implicados en la regulacin de la expresin gnica mediante
apareamiento ARN-ARN: los ARN antisentido se aparearan con los ARNm
complementarios, bloqueando de esta forma su traduccin.54
En unas pocas secuencias de
ADN en procariotas y eucariotas este hecho es ms frecuente en plsmidos y virus, la
distincin entre hebras sentido y antisentido es ms difusa, debido a que presentan genes
superpuestos.55 En estos casos, algunas secuencias de ADN tienen una funcin doble,
codificando una protena cuando se lee a lo largo de una hebra, y una segunda protena
cuando se lee en la direccin contraria a lo largo de la otra hebra. En bacterias, esta
superposicin puede estar involucrada en la regulacin de la transcripcin del gen,56
mientras que en virus los genes superpuestos aumentan la cantidad de informacin que
puede codificarse en sus diminutos genomas.57
Superenrollamiento[editar]

Estructura de molculas de ADN


lineales con los extremos fijos y superenrolladas. Por claridad, se ha omitido la estructura en hlice
del ADN.

El ADN puede retorcerse como


una cuerda en un proceso que se denomina superenrollamiento del ADN (supercoiling, en
ingls). Cuando el ADN est en un estado "relajado", una hebra normalmente gira alrededor
del eje de la doble hlice una vez cada 10,4 pares de bases, pero si el ADN est retorcido
las hebras pueden estar unidas ms estrechamente o ms relajadamente.58 Si el ADN est
retorcido en la direccin de la hlice, se dice que el superenrollamiento es positivo, y las
bases se mantienen juntas de forma ms estrecha. Si el ADN se retuerce en la direccin
opuesta, el superenrollamiento se llama negativo, y las bases se alejan. En la naturaleza, la
mayor parte del ADN tiene un ligero superenrollamiento negativo que es producido
por enzimas denominadas topoisomerasas.59 Estas enzimas tambin son necesarias para
liberar las fuerzas de torsin introducidas en las hebras de ADN durante procesos como
la transcripcin y la replicacin.60

Modificaciones
qumicas[editar]

Estructura de la citosina con y sin el


grupo metilo. Tras la desaminacin, la 5-metil-citosina tiene la misma estructura que la timina.

Modificaciones de bases
del ADN[editar]
Vase tambin: Metilacin
La expresin de los genes est
influenciada por la forma en la que el ADN est empaquetado en cromosomas, en una
estructura denominada cromatina. Las modificaciones de bases pueden estar implicadas en
el empaquetamiento del ADN: las regiones que presentan una expresin gnica baja o nula
normalmente contienen niveles altos de metilacin de las bases citosina. Por ejemplo, la
metilacin de citosina produce 5-metil-citosina, que es importante para la inactivacin
del cromosoma X.61 El nivel medio de metilacin vara entre organismos: el
gusano Caenorhabditis elegans carece de metilacin de citosina, mientras que
los vertebrados presentan un nivel alto hasta 1 % de su ADN contiene 5-metil-citosina.62
A pesar de la importancia de la 5-metil-citosina, sta puede desaminarse para generar una
base timina. Las citosinas metiladas son por tanto particularmente sensibles a mutaciones.63
Otras modificaciones de bases incluyen la metilacin de adenina en bacterias y
la glicosilacin de uracilo para producir la "base-J" en kinetoplastos.6465
Dao del ADN[editar]
Vase tambin: Mutacin

Molcula de benzopireno, mutgeno


presente por ejemplo en el humo del tabaco, ligada una hlice de ADN.66

El ADN puede resultar daado


por muchos tipos de mutgenos, que cambian la secuencia del ADN: agentes alquilantes,
adems de radiacin electromagntica de alta energa, como luz ultravioleta y rayos X. El
tipo de dao producido en el ADN depende del tipo de mutgeno. Por ejemplo, la luz UV
puede daar al ADN produciendo dmeros de timina, que se forman por ligamiento cruzado
entre bases pirimidnicas.67 Por otro lado, oxidantes tales como radicales libres o el perxido
de hidrgeno producen mltiples daos, incluyendo modificaciones de bases, sobre todo
guanina, y roturas de doble hebra (double-strand breaks).68 En una clula humana
cualquiera, alrededor de 500 bases sufren dao oxidativo cada da.6970 De estas lesiones
oxidativas, las ms peligrosas son las roturas de doble hebra, ya que son difciles de reparar
y pueden producir mutaciones puntuales, inserciones y deleciones de la secuencia de ADN,
as como translocaciones cromosmicas.71
Muchos mutgenos se
posicionan entre dos pares de bases adyacentes, por lo que se denominan agentes
intercalantes. La mayora de los agentes intercalantes son molculas aromticas y planas,
como el bromuro de etidio, la daunomicina, la doxorubicina y la talidomida. Para que un
agente intercalante pueda integrarse entre dos pares de bases, stas deben separarse,
distorsionando las hebras de ADN y abriendo la doble hlice. Esto inhibe la transcripcin y
la replicacin del ADN, causando toxicidad y mutaciones. Por ello, los agentes intercalantes
del ADN son a menudo carcingenos: el benzopireno, las acridinas, la aflatoxina y
el bromuro de etidio son ejemplos bien conocidos.727374 Sin embargo, debido a su capacidad
para inhibir la replicacin y la transcripcin del ADN, estas toxinas tambin se utilizan
en quimioterapia para inhibir el rpido crecimiento de las clulas cancerosas.75
El dao en el ADN inicia una
respuesta que activa diferentes mecanismos de reparacin que reconocen lesiones
especficas en el ADN, que son reparadas en el momento para recuperar la secuencia
original del ADN. Asimismo, el dao en el ADN provoca una parada en el ciclo celular, que
conlleva la alteracin de numerosos procesos fisiolgicos, que a su vez implica sntesis,
transporte y degradacin de protenas (vase tambin Checkpoint de daos en el ADN).
Alternativamente, si el dao genmico es demasiado grande para que pueda ser reparado,
los mecanismos de control inducirn la activacin de una serie de rutas celulares que
culminarn en la muerte celular.

Funciones
biolgicas[editar]
Las funciones biolgicas del ADN
incluyen el almacenamiento de informacin (genes y genoma), la codificacin de protenas
(transcripcin y traduccin) y su autoduplicacin (replicacin del ADN) para asegurar la
transmisin de la informacin a las clulas hijas durante la divisin celular.
Genes y genoma[editar]
Vanse tambin: Ncleo
celular, Cromatina, Cromosoma y Genoma.
El ADN se puede considerar
como un almacn cuyo contenido es la informacin (mensaje) necesaria para construir y
sostener el organismo en el que reside, la cual se transmite de generacin en generacin.
El conjunto de informacin que cumple esta funcin en un organismo dado se
denomina genoma, y el ADN que lo constituye, ADN genmico.
El ADN genmico (que se
organiza en molculas de cromatina que a su vez se ensamblan en cromosomas) se
encuentra en el ncleo celular de los eucariotas, adems de pequeas cantidades en
las mitocondrias y cloroplastos. En procariotas, el ADN se encuentra en un cuerpo de forma
irregular denominado nucleoide.76
El ADN codificante[editar]

ARN polimerasa T7 (azul)


produciendo un ARNm (verde) a partir de un molde de ADN (naranja).77

Vase tambin: Gen


La informacin gentica de
un genoma est contenida en los genes, y al conjunto de toda la informacin que
corresponde a un organismo se le denomina su genotipo. Un gen es una unidad
de herencia y es una regin de ADN que influye en una caracterstica particular de un
organismo (como el color de los ojos, por ejemplo). Los genes contienen un "marco de
lectura abierto" (open reading frame) que puede transcribirse, adems de secuencias
reguladoras, tales como promotores y enhancers, que controlan la transcripcin del marco
de lectura abierto.
Desde este punto de vista,
las obreras de este mecanismo son las protenas. Estas pueden ser estructurales, como las
protenas de los msculos, cartlagos, pelo, etc., o funcionales, como la hemoglobina o las
innumerables enzimas del organismo. La funcin principal de la herencia es la
especificacin de las protenas, siendo el ADN una especie de plano o receta para
producirlas. La mayor parte de las veces la modificacin del ADN provocar una disfuncin
proteica que dar lugar a la aparicin de alguna enfermedad. Pero en determinadas
ocasiones, las modificaciones podrn provocar cambios beneficiosos que darn lugar a
individuos mejor adaptados a su entorno.
Las aproximadamente treinta mil
protenas diferentes en el cuerpo humano estn constituidas por
veinte aminocidos diferentes, y una molcula de ADN debe especificar la secuencia en que
se unen dichos aminocidos.
En el proceso de elaborar una
protena, el ADN de un gen se lee y se transcribe a ARN. Este ARN sirve como mensajero
entre el ADN y la maquinaria que elaborar las protenas y por eso recibe el nombre de ARN
mensajero o ARNm. El ARN mensajero sirve de molde a la maquinaria que elabora las
protenas, para que ensamble los aminocidos en el orden preciso para armar la protena.
El dogma central de la biologa
molecular estableca que el flujo de actividad y de informacin era: ADN ARN protena.
No obstante, en la actualidad ha quedado demostrado que este "dogma" debe ser ampliado,
pues se han encontrado otros flujos de informacin: en algunos organismos (virus de ARN)
la informacin fluye de ARN a ADN; este proceso se conoce como "transcripcin inversa o
reversa", tambin llamada "retrotranscripcin". Adems, se sabe que existen secuencias de
ADN que se transcriben a ARN y son funcionales como tales, sin llegar a traducirse nunca
a protena: son los ARN no codificantes, como es el caso de los ARN interferentes.3435
El ADN no codificante[editar]
El ADN del genoma de un
organismo puede dividirse conceptualmente en dos: el que codifica las protenas (los genes)
y el que no codifica. En muchas especies, solo una pequea fraccin del genoma codifica
protenas. Por ejemplo, solo alrededor del 1,5 % del genoma humano consiste
en exones que codifican protenas (20 000 a 25 000 genes), mientras que ms del 90 %
consiste en ADN no codificante.78
El ADN no codificante (tambin
denominado ADN basura o junk DNA) corresponde a secuencias del genoma que no
generan una protena (procedentes de transposiciones, duplicaciones, translocaciones y
recombinaciones de virus, etc.), incluyendo los intrones. Hasta hace poco tiempo se
pensaba que el ADN no codificante no tena utilidad alguna, pero estudios recientes indican
que eso es inexacto. Entre otras funciones, se postula que el llamado "ADN basura" regula
la expresin diferencial de los genes.79 Por ejemplo, algunas secuencias tienen afinidad
hacia protenas especiales que tienen la capacidad de unirse al ADN (como
los homeodominios, los complejos receptores de hormonas esteroides, etc.), con un papel
importante en el control de los mecanismos de trascripcin y replicacin. Estas secuencias
se llaman frecuentemente "secuencias reguladoras", y los investigadores suponen que solo
se ha identificado una pequea fraccin de las que realmente existen. La presencia de tanto
ADN no codificante en genomas eucariticos y las diferencias en tamao del genoma entre
especies representan un misterio que es conocido como el "enigma del valor de C".80 Los
elementos repetitivos tambin son elementos funcionales. Si no se considerasen as, se
excluira ms del 50 % de los nucletidos totales, ya que constituyen elementos de
repeticin. Recientemente, un grupo de investigadores de la Universidad de Yale ha
descubierto una secuencia de ADN no codificante que sera la responsable de que los seres
humanos hayan desarrollado la capacidad de agarrar y/o manipular objetos o
herramientas.81
Por otro lado, algunas secuencias
de ADN desempean un papel estructural en los cromosomas:
los telmeros y centrmeros contienen pocos o ningn gen codificante de protenas, pero
son importantes para estabilizar la estructura de los cromosomas. Algunos genes no
codifican protenas, pero s se transcriben en ARN: ARN ribosmico, ARN de
transferencia y ARN de interferencia (ARNi, que son ARN que bloquean la expresin de
genes especficos). La estructura de intrones y exones de algunos genes (como los
de inmunoglobulinas y protocadherinas) son importantes por permitir los cortes y empalmes
alternativos del pre-ARN mensajero que hacen posible la sntesis de diferentes protenas a
partir de un mismo gen (sin esta capacidad no existira el sistema inmune, por ejemplo).
Algunas secuencias de ADN no codificante representan pseudogenes que tienen valor
evolutivo, ya que permiten la creacin de nuevos genes con nuevas funciones.35 Otros ADN
no codificantes proceden de la duplicacin de pequeas regiones del ADN; esto tiene mucha
utilidad, ya que el rastreo de estas secuencias repetitivas permite estudios de filogenia.
Transcripcin y
traduccin[editar]
Artculos principales: Transcripcin
(gentica) y Traduccin (gentica).
En un gen, la secuencia de
nucletidos a lo largo de una hebra de ADN se transcribe a un ARN mensajero (ARNm) y
esta secuencia a su vez se traduce a una protena que un organismo es capaz de sintetizar
o "expresar" en uno o varios momentos de su vida, usando la informacin de dicha
secuencia.
La relacin entre la secuencia de
nucletidos y la secuencia de aminocidos de la protena viene determinada por el cdigo
gentico, que se utiliza durante el proceso de traduccin o sntesis de protenas. La unidad
codificadora del cdigo gentico es un grupo de tres nucletidos (triplete), representado por
las tres letras iniciales de las bases nitrogenadas (por ej., ACT, CAG, TTT). Los tripletes del
ADN se transcriben en sus bases complementarias en el ARN mensajero, y en este caso
los tripletes se denominan codones (para el ejemplo anterior, UGA, GUC, AAA). En el
ribosoma cada codn del ARN mensajero interacciona con una molcula de ARN de
transferencia (ARNt o tRNA) que contenga el triplete complementario, denominado
anticodn. Cada ARNt porta el aminocido correspondiente al codn de acuerdo con
el cdigo gentico, de modo que el ribosoma va uniendo los aminocidos para formar una
nueva protena de acuerdo con las "instrucciones" de la secuencia del ARNm. Existen 64
codones posibles, por lo cual corresponde ms de uno para cada aminocido (por esta
duplicidad de codones se dice que el cdigo gentico es un cdigo degenerado: no es
unvoco); algunos codones indican la terminacin de la sntesis, el fin de la secuencia
codificante; estos codones de terminacin o codones de parada son UAA, UGA y UAG (en
ingls, nonsense codons o stop codons).34
Replicacin del
ADN[editar]
Esquema representativo de la
replicacin del ADN.

Artculo principal: Replicacin de


ADN
La replicacin del ADN es el
proceso por el cual se obtienen copias o rplicas idnticas de una molcula de ADN. La
replicacin es fundamental para la transferencia de la informacin gentica de una
generacin a la siguiente y, por ende, es la base de la herencia. El mecanismo consiste
esencialmente en la separacin de las dos hebras de la doble hlice, las cuales sirven de
molde para la posterior sntesis de cadenas complementarias a cada una de ellas, que
llevar por nombre ARNm. El resultado final son dos molculas idnticas a la original. Este
tipo de replicacin se denomina semiconservativa debido a que cada una de las dos
molculas resultantes de la duplicacin presenta una cadena procedente de la molcula
"madre" y otra recin sintetizada.
Hiptesis sobre la duplicacin
del ADN[editar]
En un principio, se propusieron
tres hiptesis:

Semiconservativa: Segn el
experimento de Meselson-Stahl, cada hebra sirve de molde para que se forme una hebra
nueva, mediante la complentariedad de bases, quedando al final dos dobles hlices
formadas por una hebra antigua (molde) y una nueva hebra (copia).
Conservativa: Tras la
duplicacin quedaran las dos hebras antiguas juntas y, por otro lado, las dos hebras nuevas
formando una doble hlice.
Dispersiva: Segn esta
hiptesis, las hebras resultantes estaran formadas por fragmentos en doble hlice ADN
antiguo y ADN recin sintetizado.

Interacciones ADN-
protena[editar]
Todas las funciones del ADN
dependen de sus interacciones con protenas. Estas interacciones pueden ser inespecficas,
o bien la protena puede unirse de forma especfica a una nica secuencia de ADN. Tambin
pueden unirse enzimas, entre las cuales son particularmente importantes las polimerasas,
que copian las secuencia de bases del ADN durante la transcripcin y la replicacin.
Protenas que unen
ADN[editar]
Interacciones
inespecficas[editar]

Interaccin de ADN
con histonas (en blanco, arriba). Los aminocidos bsicos de estas protenas (abajo a la
izquierda, en azul) se unen a los grupos cidos de los fosfatos del ADN (abajo a la derecha, en
rojo).
Las protenas estructurales que
se unen al ADN son ejemplos bien conocidos de interacciones inespecficas ADN-protenas.
En los cromosomas, el ADN se encuentra formando complejos con protenas estructurales.
Estas protenas organizan el ADN en una estructura compacta denominada cromatina.
En eucariotas esta estructura implica la unin del ADN a un complejo formado por pequeas
protenas bsicas denominadas histonas, mientras que en procariotas estn involucradas
una gran variedad de protenas.8283 Las histonas forman un complejo de forma cilndrica
denominado nucleosoma, en torno al cual se enrollan casi dos vueltas de ADN de doble
hlice. Estas interacciones inespecficas quedan determinadas por la existencia de residuos
bsicos en las histonas, que forman enlaces inicos con el esqueleto de azcar-fosfato del
ADN y, por tanto, son en gran parte independientes de la secuencia de bases.84 Estos
aminocidos bsicos experimentan modificaciones qumicas
de metilacin, fosforilacin y acetilacin,85 que alteran la fuerza de la interaccin entre el
ADN y las histonas, haciendo al ADN ms o menos accesible a los factores de
transcripcin y por tanto modificando la tasa de transcripcin.86
Otras protenas que se unen a
ADN de manera inespecfica en la cromatina incluyen las protenas del grupo de alta
movilidad (HMG, High Mobility Group) que se unen a ADN plegado o distorsionado.87 Estas
protenas son importantes durante el plegamiento de los nucleosomas, organizndolos en
estructuras ms complejas para constituir los cromosomas88 durante el proceso
de condensacin cromosmica. Se ha propuesto que en este proceso tambin intervendran
otras protenas, formando una especie de "andamio" sobre el cual se organiza la cromatina;
los principales componentes de esta estructura seran la enzima topoisomerasa II
(topoIIalpha) y la condensina13S.89 Sin embargo, el papel estructural de la topoIIalpha en
la organizacin de los cromosomas an es discutido, ya que otros grupos argumentan que
esta enzima se intercambia rpidamente tanto en los brazos cromosmicos como en
los cinetocoros durante la mitosis.90
Interacciones
especficas[editar]
Un grupo bien definido de
protenas que unen ADN es el
conformado por las protenas que
se unen especficamente a ADN
monocatenario o ADN de hebra
sencilla (ssDNA). En humanos,
la protena A de replicacin es la
mejor conocida de su familia y
acta en procesos en los que la
doble hlice se separa, como
la replicacin del ADN,
la recombinacin o la reparacin
del ADN.91 Estas protenas
parecen estabilizar el ADN
monocatenario, protegindolo
para evitar que forme estructuras
de tallo-lazo (stem-loop) o que
sea degradado por nucleasas.

El factor de transcripcin
represor del fago lambda unido a
su ADN diana mediante un
motivo hlice-giro-hlice (helix-
turn-helix).92

Sin embargo, otras protenas han


evolucionado para unirse
especficamente a secuencias
particulares de ADN. La
especificidad de la interaccin de
las protenas con el ADN procede
de los mltiples contactos con las
bases de ADN, lo que les permite
"leer" la secuencia del ADN. La
mayora de esas interacciones
con las bases ocurre en
la hendidura mayor, donde las
bases son ms accesibles.93
Las protenas especficas
estudiadas con mayor detalle son
las encargadas de regular la
transcripcin, denominadas por
ello factores de transcripcin.
Cada factor de transcripcin se
une a una secuencia concreta de
ADN y activa o inhibe la
transcripcin de los genes que
presentan estas secuencias
prximas a sus promotores. Los
factores de transcripcin pueden
efectuar esto de dos formas:

En primer lugar, pueden


unirse a la polimerasa de
ARN responsable de la
transcripcin, bien
directamente o a travs de
otras protenas mediadoras.
De esta forma. se estabiliza la
unin entre la ARN
polimerasa y el promotor, lo
que permite el inicio de la
transcripcin.94
En segundo lugar, los
factores de transcripcin
pueden unirse a enzimas que
modifican las histonas del
promotor, lo que altera la
accesibilidad del molde de
ADN a la ARN polimerasa.95
Como los ADN diana pueden
encontrarse por todo
el genoma del organismo, los
cambios en la actividad de un tipo
de factor de transcripcin pueden
afectar a miles de genes.96 En
consecuencia, estas protenas
son frecuentemente las dianas de
los procesos de transduccin de
seales que controlan las
respuestas a cambios
ambientales o diferenciacin y
desarrollo celular.

La enzima de
restriccin EcoRV (verde) formando
un complejo con su ADN diana.97
Enzimas que modifican el
ADN[editar]
Nucleasas y ligasas[editar]
Las nucleasas son enzimas que
cortan las hebras de ADN
mediante la catlisis de
la hidrlisis de los enlaces
fosfodister. Las nucleasas que
hidrolizan nucletidos a partir de
los extremos de las hebras de
ADN se
denominan exonucleasas,
mientras que
las endonucleasas cortan en el
interior de las hebras. Las
nucleasas que se utilizan con
mayor frecuencia en biologa
molecular son las enzimas de
restriccin, endonucleasas que
cortan el ADN por determinadas
secuencias especficas. Por
ejemplo, la enzima EcoRV, que
se muestra a la izquierda,
reconoce la secuencia de 6 bases
5-GAT|ATC-3, y hace un corte
en ambas hebras en la lnea
vertical indicada, generando dos
molculas de ADN con los
extremos romos. Otras enzimas
de restriccin generan sin
embargo extremos cohesivos, ya
que cortan de forma diferente las
dos hebras de ADN. En la
naturaleza, estas enzimas
protegen a las bacterias contra
las infecciones de fagos, al digerir
el ADN de dicho fago cuando
entra a travs de la pared
bacteriana, actuando como un
mecanismo de defensa.98
En biotecnologa, estas
nucleasas especficas de la
secuencias de ADN se utilizan
en ingeniera
gentica para clonar fragmentos
de ADN y en la tcnica de huella
gentica.
Las enzimas denominadas ADN
ligasas pueden reunir hebras de
ADN cortadas o rotas.99 Las
ligasas son particularmente
importantes en la replicacin de
la hebra que sufre replicacin
discontinua en el ADN, ya que
unen los fragmentos cortos de
ADN generados en la horquilla de
replicacin para formar una copia
completa del molde de ADN.
Tambin se utilizan en
la reparacin del ADN y en
procesos de recombinacin
gentica.99
Topoisomerasas y
helicasas[editar]
Las topoisomerasas son enzimas
que poseen a la vez actividad
nucleasa y ligasa. Estas
protenas varan la cantidad
de ADN superenrollado. Algunas
de estas enzimas funcionan
cortando la hlice de ADN y
permitiendo que una seccin rote,
de manera que reducen el grado
de superenrollamiento. Una vez
hecho esto, la enzima vuelve a
unir los fragmentos de ADN.59
Otros tipos de enzimas son
capaces de cortar una hlice de
ADN y luego pasar la segunda
hebra de ADN a travs de la
rotura, antes de reunir las
hlices.100 Las topoisomerasas
son necesarias para muchos
procesos en los que interviene el
ADN, como la replicacin del
ADN y la transcripcin.60
Las helicasas son unas protenas
que pertenecen al grupo de
los motores moleculares. Utilizan
energa qumica almacenada en
los nuclesidos trifosfatos,
fundamentalmente ATP, para
romper puentes de hidrgeno
entre bases y separar la doble
hlice de ADN en hebras
simples.101 Estas enzimas son
esenciales para la mayora de los
procesos en los que las enzimas
necesitan acceder a las bases del
ADN.
Polimerasas[editar]
Las polimerasas son enzimas qu
e sintetizan cadenas de
nucletidos a partir de
nuclesidos trifosfatos. La
secuencia de sus productos son
copias de cadenas de
polinucletidos existentes, que se
denominan moldes. Estas
enzimas funcionan aadiendo
nucletidos al grupo hidroxilo en
3' del nucletido previo en una
hebra de ADN. En consecuencia,
todas las polimerasas funcionan
en direccin 5 --> 3.102 En
los sitios activos de estas
enzimas, el nuclesido trifosfato
que se incorpora aparea su base
con la correspondiente en el
molde: esto permite que la
polimerasa sintentice de forma
precisa la hebra complementaria
al molde.
Las polimerasas se clasifican de
acuerdo al tipo de molde que
utilizan:

En la replicacin del ADN,


una ADN polimerasa
dependiente de ADN realiza
una copia de ADN a partir de
una secuencia de ADN. La
precisin es vital en este
proceso, por lo que muchas
de estas polimerasas tienen
una actividad de verificacin
de la lectura (proofreading).
Mediante esta actividad, la
polimerasa reconoce errores
ocasionales en la reaccin de
sntesis, debido a la falta de
apareamiento entre el
nucletido errneo y el
molde, lo que genera un
desacoplamiento (mismatch).
Si se detecta un
desacoplamiento, se activa
una
actividad exonucleasa en
direccin 3 --> 5 y la base
incorrecta se elimina.103 En la
mayora de los organismos
las ADN polimerasas
funcionan en un gran
complejo
denominado replisoma, que
contiene mltiples unidades
accesorias,
como helicasas.104

Las ADN polimerasas


dependientes de ARN son
una clase especializada de
polimerasas que copian la
secuencia de una hebra de
ARN en ADN. Incluyen
la transcriptasa inversa, que
es una enzima viralimplicada
en la infeccin de clulas
por retrovirus, y
la telomerasa, que es
necesaria para la replicacin
de los telmeros.10543 La
telomerasa es una
polimerasa inusual, porque
contiene su propio molde de
ARN como parte de su
estructura.44

La transcripcin se lleva a
cabo por una ARN
polimerasa dependiente de
ADN que copia la secuencia
de una de las hebras de ADN
en ARN. Para empezar a
transcribir un gen, la ARN
polimerasa se une a una
secuencia del ADN
denominada promotor, y
separa las hebras del ADN.
Entonces copia la secuencia
del gen en un transcrito
de ARN mensajero hasta que
alcanza una regin de ADN
denominada terminador,
donde se detiene y se separa
del ADN. Como ocurre con
las ADN polimerasas
dependientes de ADN en
humanos, la ARN polimerasa
II (la enzima que transcribe la
mayora de los genes del
genoma humano) funciona
como un gran complejo
multiproteico que contiene
mltiples subunidades
reguladoras y accesorias.106

Recombinacin
gentica[editar]
Estructura de un intermedio
en unin de Holliday en
la recombinacin gentica. Las
cuatro hebras de ADN separadas
estn coloreadas en rojo, azul,
verde y amarillo.107
Artculo principal: Recombinacin
gentica

La recombinacin implica la rotura y


reunin de dos cromosomas
homlogos (M y F) para producir dos
cromosomas nuevos reorganizados
(C1 y C2).

Una hlice de ADN normalmente


no interacciona con otros
segmentos de ADN, y en las
clulas humanas los diferentes
cromosomas incluso ocupan
reas separadas en el ncleo
celular denominadas territorios
cromosmicos.108 La separacin
fsica de los diferentes
cromosomas es importante para
que el ADN mantenga su
capacidad de funcionar como un
almacn estable de informacin.
Uno de los pocos momentos en
los que los cromosomas
interaccionan es durante
el sobrecruzamiento
cromosmico(chromosomal
crossover), durante el cual
se recombinan. El
sobrecruzamiento cromosmico
ocurre cuando dos hlices de
ADN se rompen, se intercambian
y se unen de nuevo.
La recombinacin permite a los
cromosomas intercambiar
informacin gentica y produce
nuevas combinaciones de genes,
lo que aumenta la eficiencia de
la seleccin natural y puede ser
importante en la evolucin rpida
de nuevas protenas.109 Durante
la profase I de la meiosis, una vez
que los cromosomas homlogos
estn perfectamente apareados
formando estructuras llamadas
bivalentes, se produce el
fenmeno de sobrecruzamiento o
entrecruzamiento (crossing-
over), en el cual las cromtidas
homlogas no hermanas
(procedentes del padre y de la
madre) intercambian material
gentico. La recombinacin
gentica resultante hace
aumentar en gran medida la
variacin gentica entre la
descendencia de progenitores
que se reproducen por va sexual.
La recombinacin gentica
tambin puede estar implicada en
la reparacin del ADN, en
particular en la respuesta celular
a las roturas de doble
hebra (double-strand breaks).110
La forma ms frecuente de
sobrecruzamiento cromosmico
es la recombinacin homloga,
en la que los dos cromosomas
implicados comparten secuencias
muy similares. La recombinacin
no-homloga puede ser daina
para las clulas, ya que puede
producir translocaciones
cromosmicas y anomalas
genticas. La reaccin de
recombinacin est catalizada
por enzimas conocidas
como recombinasas, tales
como RAD51.111 El primer paso
en el proceso de recombinacin
es una rotura de doble hebra,
causada bien por una
endonucleasa o por dao en el
ADN.112 Posteriormente, una
serie de pasos catalizados en
parte por la recombinasa,
conducen a la unin de las dos
hlices formando al menos
una unin de Holliday, en la que
un segmento de una hebra simple
es anillado con la hebra
complementaria en la otra hlice.
La unin de Holliday es una
estructura de unin tetrahdrica
que puede moverse a lo largo del
par de cromosomas,
intercambiando una hebra por
otra. La reaccin de
recombinacin se detiene por el
corte de la unin y la reunin de
los segmentos de ADN
liberados.113

Evolucin del
metabolismo de
ADN[editar]
Vase tambin: Hiptesis del
mundo de ARN
El ADN contiene la informacin
gentica que permite a la mayora
de los organismos vivientes
funcionar, crecer y reproducirse.
Sin embargo, no est claro
durante cunto tiempo ha ejercido
esta funcin en los ~3000
millones de aos de la historia de
la vida, ya que se ha propuesto
que las formas de vida ms
tempranas podran haber
utilizado ARN como material
gentico.114115 El ARN podra
haber funcionado como la parte
central de un metabolismo
primigenio, ya que puede
transmitir informacin gentica y
simultneamente actuar
como catalizador formando parte
de las ribozimas.116 Este
antiguo Mundo de ARN donde los
cidos nucleicos funcionaran
como catalizadores y como
almacenes de informacin
gentica podra haber influido en
la evolucin del cdigo
gentico actual, basado en
cuatro nucletidos. Esto se
debera a que el nmero de bases
nicas en un organismo es un
compromiso entre un nmero
pequeo de bases (lo que
aumentara la precisin de la
replicacin) y un nmero grande
de bases (que a su vez
aumentara la eficiencia cataltica
de las ribozimas).117
Desafortunadamente, no se
cuenta con evidencia directa de
los sistemas genticos
ancestrales porque la
recuperacin del ADN a partir de
la mayor parte de los fsiles es
imposible. Esto se debe a que el
ADN es capaz de sobrevivir en el
medio ambiente durante menos
de un milln de aos, y luego
empieza a degradarse
lentamente en fragmentos de
menor tamao en solucin.118
Algunas investigaciones
pretenden que se ha obtenido
ADN ms antiguo, por ejemplo un
informe sobre el aislamiento de
una bacteria viable a partir de un
cristal salino de 250 millones de
aos de antigedad,119 pero estos
datos son controvertidos.120121
Sin embargo, pueden utilizarse
herramientas de evolucin
molecular para inferir los
genomas de organismos
ancestrales a partir de
organismos contemporneos.122
123 En muchos casos, estas

inferencias son suficientemente


fiables, de manera que una
biomolcula codificada en un
genoma ancestral puede
resucitarse en el laboratorio para
ser estudiada hoy.124125 Una vez
que la biomolcula ancestral se
ha resucitado, sus propiedades
pueden ofrecer inferencias sobre
ambientes y estilos de vida
primigenios. Este proceso se
relaciona con el campo
emergente de la paleogentica
experimental.126
A pesar de todo, el proceso de trabajo hacia atrs desde el presente tiene limitaciones inherentes, razn por
la cual otros investigadores tratan de elucidar el mecanismo evolutivo trabajando desde el origen de la Tierra
en adelante. Dada suficiente informacin sobre la qumica en el cosmos, la manera en la que las sustancias
csmicas podran haberse depositado en la Tierra, y las transformaciones que podran haber tenido lugar en
la superficie terrestre primigenia, tal vez podramos ser capaces de aprender sobre los orgenes para
desarrollar modelos de evolucin ulterior de la informacin gentica127 (vase tambin el artculo sobre
el origen de la vida)