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Resumen

Arqueas
Joshelin Huanca; Paulo Laya
Departamento de Biologa, Facultad de Ciencias. UNALM, Lima: Per

Generalidades Aislamiento, Cultivo y Caracterizacin


Al igual que las bacterias, son consideradas Es muy complicado el aislamiento de las arqueas
procariotas por carecer de ncleo celular y sistema porque simular las condiciones donde stas
de endomembranas, pero son diferentes a ellas, por usualmente se desarrollan es difcil, considerando las
lo cual tienen su dominio propio. condiciones de temperatura, pH, presin, salinidad y
anaerobiosis en muchos casos. En la bibliografa
Adems de su conocida capacidad para habitar consultada, se resalta el aislamiento de
ambientes extremos de temperatura, salinidad y pH, Halobacterium tomando como referencia su
su importancia radica en la participacin en ciclos propiedad de fermentar arginina (Oren & Litchfield;
biogeoqumicos como el de sulfuro, nitrgeno y 1999).
carbono. Por ejemplo, en sedimentos pantanosos
salados de New England, Massachusetts, se hall la Usando muestras de Israel y Estados Unidos
predominancia de arqueas amonio oxidadoras (California), donde estaban los gneros
respecto a las beta-proteobacterias gracias al anlisis Halobacterium, Haloferax, Halorubrum,
de los genes 16S rRNA, donde el gen amoA fue Haloarcula, utilizaron una cromatografa de capa
utilizado, considerando que presentaba diferencias fina para separar lpidos extrados de medio
entre los encontrados en arqueas y proteobacterias enriquecidos con arginina segn el tiempo de
(Moin et al., 2009). retencin. Usando condiciones aerobias y anaerobias
hicieron la corrida. Tomando como caracterstica que
Por la dificultad de aislamiento de las arqueas debido existen 2 glicolpidos que caracterizan al gnero
a los rigurosos ecosistemas donde habitan, segn los Halobacterium, el S-TGD-1 (galactosa-manosa-
papers ledos, la oxidacin de amonio parece ser un glucosa) y S-TeGD (galactosa-manosa-
buen mtodo para medir la distribucin de estos galactofuranosa) se realiz la corrida. Se comprueba
organismos (Falb et al., 2008). Ello se corrobora al que el S-TGD-1 es el principal glicolpido para
ver las arqueas amonio oxidadoras abundan en caracterizar a este gnero respecto a otros en
suelos donde la proporcin carbono:nitrgeno es condiciones anaerobias, ya que se ubic en la parte
menor, indicando mayor cantidad de este ltimo y su inferior de la cromatografa, notndose la separacin
funcin como nitrificadores del suelo , que en este respecto de otros lpidos (Oren & Litchfield; 1999).
caso, fueron muestras diversas de Amrica y la Pese a ello, la secuenciacin de genes 16S rDNA
Antrtida (Bates et al., 2011). sigue siendo ideal para este tipo de caracterizaciones.

En nuestro pas, cualquier hbitat con condiciones El experimento por otro lado, confirm que
extremas puede ser considerado como posible Halobacterium tiene complejos requerimientos
albergador de arqueas. Por ejemplo, el gnero nutricionales (necesarios entre 10 a 15 aminocidos
Haloferax fue encontrado en las salinas solares de diferentes en su medio de crecimiento) lo cual lo
Huacho, cuya importancia es la produccin de diferencia de otros gneros como Haloferax y
betacaroteno (Esquerre et al., 2003). Otros ambientes Haloarcula que crecen en medios inorgnicos que
pueden ser la Cordillera de los Andes, donde el contengan fuentes bsicas de carbono. Las vesculas
Huascarn podra albergar psicrfilos, o aqu en de gas que forma Halobacterium pueden ser vistas
Lima los Pantanos de Villa que muy probablemente ocasionalmente en medios de cultivo anaerobios,
alberguen alcalfilos. Nuestro mar tambin es un sirviendo como otro punto de diferenciacin con
probable hbitat de barfilos. otros gneros (Oren & Litchfield; 1999).
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Viendo otras herramientas para detectar arqueas a La sntesis puede ser inhibida gracias a Sulfonamidas
nivel clnico, lo ideal es simular un ambiente anxico (Liu et al., 2012) y Benzilpirimidinas, las cuales
para cultivarlas (80% H2 y 20% CO2) y presurizar a inhiben la sntesis de cido flico, que como
2 atmsferas (Dridi, B; 2012). sabemos es un cofactor importante para sintetizar
purinas y pirimidinas en procariotas (Khelaifia &
La utilizacin de la secuenciacin de los 16S rDNA Drancourt; 2013).
es bsica, sin embargo, la deteccin de gen mcrA Finalmente, a nivel de protenas, encontramos que el
que codifica para formar la metil coenzima M cido Fusdico y los Fenicoles alteran la sntesis
reductasa es muy til porque esta enzima es vital proteica, donde el primero inhibe la elongacin de la
para la produccin de metano en el intestino humano cadena polipeptdica al unirse a ribosom evitando su
e incluso pudo dar especies como M. smithii que separacin de las subnidades para hacer la sntesis;
habitan en la cavidad bucal. mientras que el segundo probablemente inhiba la
unin de pptidos, bloqueando la elongacin
Tambin se han desarrollado protocolos para utilizar (Khelaifia & Drancourt; 2012).
el espectrmetro de masas MALDI-TOF MS como
identificador de arqueas extremfilas utilizando Para enzimas industriales, por ejemplo S.
perfiles nicos de protenas de cada especie y solfataricus es utilizada para producir nucletidos
generando una biblioteca de datos que puede ser carbocclicos que los usan en tratamientos de
comparada para reportes futuros (Dridi, B; 2012). infecciones virales e incluso el tratamiento de VIH,
ello gracias a una gamma-lactamasa, la cual produce
Para el caso de metangenas, su extrema intolerancia un sustrato primordial para bloquear la actividad
al oxgeno y su produccin de metano mediante la HIV (Littlechild; 2015)
reduccin de metanol con H2 usando acetato como
fuente carbonada (Khelaifia & Drancourt; 2013) es Otra enzima es la aminoacilasa de T. litoralis que
primordial conocer para generarles un medio de tiene importancia para la produccin de compuestos
cultivo apropiado. Utilizando una variante del medio activos farmacuticos, ya que al ser sobreexpresada
de cultivo hecho por Dridi (2012), donde se le aade en E.coli puede producir aminocidos de donde se
una solucin de selenito/tungstato a un medio SAB utiliza el nitrgeno para los farmacuticos
con metanol y metales traza en una determinada (Littlechild; 2011).
concentracin. Luego, la deteccin de los
microorganismos puede ser verificada mediante La alcohol deshidrogenasa de Aeropyrum pernix es
microscopa ptica, cromatografa de gases, otra enzima con gran termoestabilidad y tolerancia a
espectrofometra, y PCR, del cual este ltimo es el altas temperaturas (90 C por 2 horas), mientras que
ms utilizado por la eficiencia de la secuenciacin de la serina transaminasa de S. solfataricus convierte el
los genes 16S rDNA. piruvato y la serina en hidroxipiruvato y alanina
(Littlechild; 2011) ello mediante una combinacin
Aplicaciones con una transquetolasa para sintetizar intermediaries
quirales de frmacos (Littlechild; 2015).
A nivel clnico, considerando la suceptibilidad/
resistencia a antimicrobianos, podemos hablar a 3 En S. tokodaii se ha encontrado una dehalogenasa
niveles: pared, DNA y protenas. cuya aplicacin es para producir cidos halo-
En pared no encontramos inhibidores de sntesis, carboxlicos quirales (industria qumica) y en
pero la Escualamina tiene la propiedad de alterar la procesos de biorremediacin por presentar
formacin de pared. estabilidad en ambientes salinos (Littlechild; 2015)
A nivel de DNA, las Quinolonas (ingresar por
difusin simple a las clulas) alteran su replicacin y Otra enzima clonada en E.coli es una carboxiesterasa
superenrrolamiento, y las Novobiocina son usadas de S. shibatae, que tiene preferencia por sustratos
para demostrar la accin de agentes antimicrobianos que contengan grupos aromticos (Littlechild; 2015)
en procesos de digestin anaerobia; mientras que el
Nitrofurano (encontrado en Halobiforma y En biorremediacin, la familia Halobacteriaceae ha
Halogeometricum) altera su composicin porque sido encontrada capaz de metabolizar cido
induce mutaciones, siendo usado para tratamientos hidroxibenzoico (Bonete et al., 2015), el cual es
de infecciones intestinales. utilizado en cosmtica y tiene un impacto
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contaminador en suelos. Tambin gneros de esta Khelaifia, S., & Drancourt, M. (2012).
misma familia, la cual crece en ambientes Susceptibility of archaea to antimicrobial
hipersalinos, es capaz de crecer en altas agents: applications to clinical
concentraciones de metales pesados. Como ejemplo, microbiology. Clinical Microbiology and
Haloferax puede reducir la concentracin de iones Infection, 18(9), 841-848.
Pb, Cr, Zn y Ni mediante procesos de biosorcin Littlechild, J. A. (2015). Archaeal enzymes
(Bonete et al., 2015). and applications in industrial
biocatalysts. Archaea, 2015.
Para el tratamiento de aguas residuales, posterior al Littlechild, J. A. (2011). Thermophilic
tratamiento primario, donde observamos floculacin archaeal enzymes and applications in
y degradacin anaerobia, viene el tratamiento biocatalysis. Biochemical Society
secundario, donde microorganismos aerobios Transactions, 39(1), 155-158.
continan con la degradacin y al final en el Liu, Y., Beer, L. L., & Whitman, W. B.
tratamiento terciario se realiza el removimiento del (2012). Sulfur metabolism in archaea reveals
nitrgeno y fosfatos (Bonete et al., 2015) novel processes. Environmental
microbiology, 14(10), 2632-2644.
Las perspectivas finales respecto al uso de arqueas es Moin, N. S., Nelson, K. A., Bush, A., &
que, con los progresos en los mtodos de Bernhard, A. E. (2009). Distribution and
caracterizacin y aislamiento, es posible obtener diversity of archaeal and bacterial ammonia
mayor cantidad de metabolitos aplicables para la oxidizers in salt marsh sediments. Applied
industria, adems de poder utilizarlos para el and environmental microbiology, 75(23),
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