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Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001 Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo: Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López

Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001

Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

  • 1. ASIGNATURA / COURSE

1.1.

Nombre / Course Title

ECOLOGÍA MICROBIANA/

MICROBIAL ECOLOGY

1.2.

Código / Course Code

13794

1.3.

Tipo / Type of course

Formación optativa /Elective subject

1.4.

Nivel / Level of course

 

Grado / Grade

1.5.

Curso / Year of course

4º /4 th

1.6.

Semestre / Semester

2º/ 2 nd

1.7.

Número de créditos / Number of Credits Allocated

9 créditos: 6 Teóricos, 3 Prácticos

1.8.

Requisitos Previos / Prerequisites

Se recomienda haber cursado previamente las asignaturas de Microbiología, Bioquímica y Ecología

It is highly recommended that Microbiology, Biochemistry and Ecology courses

have been followed in advance

     

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Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001 Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo: Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel Lópezanabel.lopez@uam.es Página Web: http://www.uam.es/anabel.lopez Horario de Tutorías Generales: A determinar consensuadamente con los alumnos 1.11. OBJETIVOS DEL CURSO / OBJETIVE OF THE COURSE OBJETIVOS - El objetivo general es que el alumno alcance un cuerpo de conocimientos básicos sobre el papel y la importancia del mundo microbiano y sus actividades en el funcionamiento del ecosistema terrestre global. - Los objetivos específicos se enmarcan dentro de los distintos bloques temáticos en los que se divide la asignatura: - Ser conscientes de la enorme diversidad metabólica del mundo microbiano y su impacto sobre la dinámica de la biosfera, actual y pasada. - Reconocer el papel de los microorganismos en el funcionamiento de los ecosistemas, dentro de sus distintos niveles tróficos, y en la dinámica de los ciclos biogeoquímicos - Conocer la amplia red de interacciones que establecen los microorganismos con todo el resto de seres vivos y la influencia que ejercen, a través de ellas, sobre su actividad - Analizar la composición, diversidad e importancia de la actividad microbiana en los ambientes naturales. - Reconocer el papel que juegan los microorganismos como reguladores del equilibrio global de nuestro planeta y analizar las posibles consecuencias derivadas de la perturbación, sobre todo antrópica, de estos mecanismos de control 2 de 9 " id="pdf-obj-1-2" src="pdf-obj-1-2.jpg">

Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001

Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

  • 1.9. ¿ Es obligatoria la asistencia class mandatory?

? / Is attendance to

SI / Yes

  • 1.10. Datos del profesor/a / profesores / Faculty Data

Ana Isabel López Archilla

Departamento: Ecología Facultad: Ciencias Teléfono: 91 4978013 e-mail: anabel.lopez@uam.es Página Web:

Horario de Tutorías Generales: A determinar consensuadamente con los alumnos

  • 1.11. OBJETIVOS DEL CURSO /OBJETIVE OF THE COURSE

OBJETIVOS

  • - El objetivo general es que el alumno alcance un cuerpo de conocimientos básicos sobre el papel y la importancia del mundo microbiano y sus actividades en el funcionamiento del ecosistema terrestre global.

  • - Los objetivos específicos se enmarcan dentro de los distintos bloques temáticos en los que se divide la asignatura:

  • - Ser conscientes de la enorme diversidad metabólica del mundo microbiano y su impacto sobre la dinámica de la biosfera, actual y pasada.

  • - Reconocer el papel de los microorganismos en el funcionamiento de los ecosistemas, dentro de sus distintos niveles tróficos, y en la dinámica de los ciclos biogeoquímicos

  • - Conocer la amplia red de interacciones que establecen los microorganismos con todo el resto de seres vivos y la influencia que ejercen, a través de ellas, sobre su actividad

  • - Analizar la composición, diversidad e importancia de la actividad microbiana en los ambientes naturales.

  • - Reconocer el papel que juegan los microorganismos como reguladores del equilibrio global de nuestro planeta y analizar las posibles consecuencias derivadas de la perturbación, sobre todo antrópica, de estos mecanismos de control

     

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C OMPETENCIAS Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001 Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo: Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana

COMPETENCIAS

Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001

Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

En esta asignatura se pretende que el alumno adquiera la capacidad de relacionar distintos tipos de fenómenos medioambientales con las diversas actividades desarrolladas por los microorganismos en el medio.

Se pretende también que aborden los problemas desde una perspectiva

multidisciplinar que facilite su resolución de una forma perspectiva holística.

eficaz bajo

una

Así mismo, a través de las técnicas aprendidas en las clases prácticas, los alumnos podrán manejar las metodologías básicas para el estudio de la comunidad microbiana de medios naturales y aplicar las normativas en vigor para el control microbiológico ambiental, requeridas en el mundo laboral.

Mediante la elaboración de la memoria de prácticas y el desarrollo de trabajos bibliográficos y seminarios, los alumnos adquirirán las habilidades de síntesis, análisis y exposición requeridas para su formación universitaria, con vistas a su inserción en el mundo laboral

1.12 . Contenidos del Programa / Course Contents

CONTENIDOS TEÓRICOS

PARTE I: INTRODUCCIÓN. ENERGÉTICA Y EVOLUCIÓN MICROBIANA 1.- Desarrollo histórico y perspectivas futuras de la Ecología Microbiana 2.-Tipos fisiológicos de microorganismos. Bases de la energética microbiana 3.- Diversidad de los mecanismos energéticos microbianos 4.- Registro fósil microbiano. Evolución de los mecanismos energéticos 5.- Ecosistemas microbianos en la tierra primitiva. Características de nuestro planeta derivadas de la actividad microbiana 6.- Diversidad Filogenética microbiana.

PARTE

II:

LOS

MICROORGANISMOS

EN

EL

FUNCIONAMIENTO

DE

LOS

ECOSISTEMAS

 

7.- Estructura y funcionamiento de los ecosistemas: El papel de los microorganismos. Crecimiento planctónico y en biopelículas (biofilms). Efecto de las condiciones ambientales sobre el crecimiento de los

microorganismos 8.- Los microorganismos como productores primarios.

     

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Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001 Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo: Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López

Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001

Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

9.- Los microorganismos como consumidores/descomponedores. El bucle microbiano. 10.- Papel de los microorganismos en el funcionamiento y regulación de los ciclos biogeoquímicos. Implicaciones microbianas en el cambio climático. Ciclo del carbono. Ciclo del nitrógeno 11.-. Ciclo del azufre. Transformaciones microbianas del fósforo. Ciclo del hierro

PARTE III: INTERACCIONES MICROBIANAS 12.-Tipos de interacciones biológicas. El papel de las interacciones en el proceso evolutivo. Interacciones microorganismo-microorganismo 13.- Interacciones microorganismos-plantas 14.- Interacciones microorganismos-animales

PARTE IV: COMUNIDADES MICROBIANAS EN AMBIENTES NATURALES. MICROBIOLOGÍA AMBIENTAL 15.- El ambiente terrestre: Características y origen del suelo. Comunidades microbianas edáficas. Flujo energético. La biosfera del subsuelo profundo 16.- El ambiente acuático. Tipos de medios acuáticos. Los sedimentos como hábitat microbiano. Comunidades microbianas en el medio marino. Flujo energético. Comunidades microbianas quimiolitotrofas en los oasis de las profundidades. 17. Comunidades microbianas en medios acuáticos continentales. Lagos, humedales y ríos. Flujo energético 18.- Microbiología del aire. Características generales. Dispersión de microorganismos. Microorganismos en ambientes cerrados y abiertos.

CONTENIDOS PRÁCTICOS

Prácticas intensivas de laboratorio, que abordarán las técnicas básicas de

Ecología Microbiana aplicadas a diferentes tipos de sistemas naturales, la aplicación de normativas de control microbiológico, cultivos de enriquecimiento y estudio de comunidades microbianas

  • Microorganismos del suelo

  • Análisis Microbiológico Ambiental

    • Control Microbiológico del Aire

    • Control Microbiológico de Superficies

    • Control Microbiológico de Personal

  • Control Microbiológico de Calidad de Aguas

  • Efecto de la Radiación Ultravioleta sobre los Microorganismos

     

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Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001 Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo: Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López

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Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

  • Columna de Winogradsky

  • Tapetes Microbianos

1.13 . Referencias de Consulta Básicas / Recommended Reading.

ATLAS, R.M. and BARTHA, R (4th ed). Ecología Microbiana y Microbiología

Ambiental (2002) Prentice Hall. ATLAS, R.M. (1990) Microbiología: Fundamentos y aplicaciones. CECSA, México BROCK, T.D., BROCK, K. & WARD, D. (1986). Basic Microbiology with Applications. Prentice Hall COYNE, M. (2000) Microbiología del suelo: Un enfoque exploratorio. Paraninfo DIXON, B. (1994). Power unseen: How Microbes Rule the World. W.H.Freeman FENCHEL, T., KING, G.M. & BLACKBURN, T.H. (1998). Bacterial Biogeochemistry: The Ecophysiology of Mineral Cycling. Academic Press GRANT, W.D. & LONG, P.E. (1981). Environmental Microbiology. Black. HURST, CH.J. (1997). Manual of Environmental Microbiology. American Society for Microbiology Press

LYNCH,

I.M.

&

POOLE,

M.J. (1988)

(2nd ed). Microorganisms in

Action:

Concepts and Applications in Microbial Ecology. Blackwell. LYNCH, I.M. and POOLE, M.J. (1984) Microbial Ecology: A Conceptual Approach. MADIGAN, M.E., MARTINKO, J.M. & PARKER, J. (2004) (10 ed). Brock Biología de los microorganismos. Pearson Educación, Prentice Hall McARTHUR, J.V. (2006) Microbial Ecology: An Evolutionary Approach. Academic Press (Elsevier)

MITCHELL, R. (1992). Environmental Microbiology. Wiley-Liss MUÑOZ, E. (1991). Genes para cenar. Ediciones Temas de Hoy. PARÉS, R. and JUÁREZ, A. (1997) Bioquímica de los microorganismos. Ed. Reverté PETTS,G. and CALOW, P. (1996). River biota. Diversity and Dynamics. Blakcwell Sci. POSTGATE, J. (2000) (4th). Microbes and Man. Cambrigde University Press. POSTGATE, J. Las fronteras de la vida (1995). Ed Crítica (Grijalbo Mondadori)

SCHAECHTER, M; INGRAHAM, J.L. and NEIDHARDT, F.C. (2006) Microbe. ASM Press, Washington SCHOPF, J.W. (1992) Major Events in the History of Life. Jones& Bartlett SECKBACH, J. (2000) Journey to Diverse Microbial Worlds. Adaptation to Exotic Environments. Kluwer Acad. Publ. SIGEE, D.C. (2005). Freshwater Microbiology. J. Wiley&Sons

     

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Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001 Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo: Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel LópezBonkowski, M. (2004) Protozoa and plant growth: The microbial loop in soil revisited. New Phytologist, 162:617-631 Artículo sobre transformaciones del hierro Weber, K.A, Acenbach, L.A. & Coates, J.D.(2006) Microorganisms pumping iron: anaerobic microbial iron oxidation Nature Reviews/Microbiology, 4:752- 764 (www.nature.com/reviews/micro) Artículo sobre el papel de los antibióticos en los medios naturales D avies, J. (2006). Are antibiotics naturally antibiotics? J.Ind.Microbiol.Biotech., 33:496-499 Blogs de Microbiología http://weblogs.madrimasd.org/microbiologia/ http://schaechter.asmblog.org/schaechter/ http://curiosidadesdelamicrobiologia.blogspot.com/ 6 de 9 " id="pdf-obj-5-2" src="pdf-obj-5-2.jpg">

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Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

STOLP, H. (1988). Microbial Ecology: Organisms, Habitat and Activity. Cambridge University Press. THURMAN, H.V. (1993) (4 th ed) Essentials of Oceanography. Macmillan Pu.Co

Enlaces de Interés

Artículos sobre biofilms

Harrison J.J., Turner, R.J, Marques, L.L. & Ceri, H. (2006) Biopelículas. Investigación y Ciencia, Marzo, 2006

Hall-Stoodley, L., Costerton, J.W. & Stoodley, P. (2004) Bacterial biofilms:

From the natural environment to infectious diseases. Nature Reviews Microbiology, 2:95-108

Nikolaev, Yu.A. & Plakunov, V.K. (2007) Biofilm- "City of Microbes" or an analogue of multicellular organisms? Microbiology, 76 (2): 125-138

ParseK, M.R. & Greenberg, E.P. (2005) Sociomicrobiology: The connections between quorum sensing and biofilms Trends in Microbiology,13 (1):27-33

Artículo loop microbiano en suelos

Artículo sobre transformaciones del hierro

Weber, K.A, Acenbach, L.A. & Coates, J.D.(2006) Microorganisms pumping iron: anaerobic microbial iron oxidation Nature Reviews/Microbiology, 4:752- 764 (www.nature.com/reviews/micro)

Artículo sobre el papel de los antibióticos en los medios naturales

Blogs de Microbiología

http://curiosidadesdelamicrobiologia.blogspot.com/

     

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Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001 Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo: Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel Lópezhttp://www.revistaecosistemas.net/ Año 2005, nº2 Artículos recientes de revisión sobre microbiología del medio marino www.nature.com/reviews/micro Vol 5 (Octubre 2007) 2 Métodos Docentes / Teaching methods • Actividades presenciales - Clases teóricas. Cuatro horas por semana - Clases prácticas. Cinco sesiones de prácticas de laboratorio (4 horas de duración cada una), una salida de campo (5 horas), ejercicios prácticos de gabinete de autoevaluación de los conocimientos que se van adquiriendo a lo largo del desarrollo del temario (5 horas). • Actividades dirigidas - Trabajos individuales: Trabajos bibliográficos y exposición de seminarios en clase, realizados individualmente (5 sesiones de 1 hora). La orientación de los trabajos se discute en las horas de tutoría - Docencia en red: Página web de docencia, con toda la información del curso (programa, prácticas, actividades, normas de la asignatura), presentaciones de clase, bibliografía específica y enlaces recomendados - Tutorías ( Incluidas virtuales): Presenciales, en el horario indicado, y virtuales a través del correo electrónico 7 de 9 " id="pdf-obj-6-2" src="pdf-obj-6-2.jpg">

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Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

Monografía de Ecología Microbiana

Selección de artículos monográficos de Ecología Microbiana

Año 2005, nº2

Artículos recientes de revisión sobre microbiología del medio marino

Vol 5 (Octubre 2007)

2

Métodos Docentes / Teaching methods

Actividades presenciales

  • - Clases teóricas.

Cuatro horas por semana

  • - Clases prácticas. Cinco sesiones de prácticas de laboratorio (4 horas de duración cada una), una salida de campo (5 horas), ejercicios prácticos de gabinete de autoevaluación de los conocimientos que se van adquiriendo a lo largo del desarrollo del temario (5 horas).

Actividades dirigidas

  • - Trabajos individuales:

Trabajos bibliográficos y exposición de seminarios

en clase, realizados individualmente (5 sesiones de 1 hora). La

orientación de los trabajos se discute en las horas de tutoría

  • - Docencia en red:

Página web de docencia, con toda la información del

curso (programa, prácticas, actividades, normas de la asignatura), presentaciones de clase, bibliografía específica y enlaces recomendados

  • - Tutorías ( Incluidas virtuales): Presenciales, en el horario indicado, y virtuales a través del correo electrónico

     

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Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001 Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo: Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López

Guía Docente AS0001-GR0001-PR0001

Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

3 Tiempo estimado de Trabajo del Estudiante / Estimated workload for the student
3
Tiempo
estimado
de
Trabajo
del
Estudiante / Estimated workload for the
student

168 horas Factores de ponderación:

  • 60 horas de teoría x 2 = 120

  • 30 horas de prácticas x 1,5 = 45

Un examen = 3 horas Complemento de trabajo individual = 20 horas (optativo)

  • 4 Métodos de Evaluación y Porcentaje en la Calificación Final / Assessment Methods and Percentage in the Final marks

Descripción detallada del procedimiento para la evaluación

Para la evaluación de la asignatura se tienen en cuenta dos aspectos:

  • - Un examen escrito realizado al finalizar el curso

-

Una

memoria de

prácticas que refleje las actividades realizadas y la

comprensión de las mismas.

Para superar la asignatura ambos aspectos tienen que ser aprobados por separado. La asistencia a prácticas consume convocatoria (aún cuando el alumno no se presente al examen de teoría).

Dado el carácter voluntario de los trabajos bibliográficos y exposición de seminarios, la calificación obtenida de esta actividad sólo será tenida en cuenta para mejorar la nota final. El estudiante que no haya superado el examen escrito pero haya cursado y superado las prácticas de la asignatura, podrá solicitar la convalidación de las mismas para el curso siguiente, en cuyo caso conservará la calificación obtenida. En este caso, se considerarán consumidas las convocatorias que medien hasta que apruebe la teoría, independientemente de que se presente a las mismas o no.

Porcentaje en la calificación final

Examen escrito: 70% Memoria de actividades prácticas: 30%

     

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Asignatura:Ecología Microbiana Código: 13794 Grupo:

Titulación: Licenciatura en Biología Profesor/a: Ana Isabel López Archilla Curso Académico: 2011-2012

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Cronograma de Actividades (opcional) /

Activities Chronogram (optional)

Calendario de pruebas periódicas:

Habrá una prueba escrita ordinaria y otra extraordinaria cuyas fechas serán aprobadas por la Junta de Facultad.

     

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