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Proyecto 025/2010
El desarrollo de listas rojas y reas prioritarias a nivel global, como la lista roja de la IUCN y los
Hot-spots de Biodiversidad, han tenido un importante auge en las ltimas dcadas lo que ha
estimulado el desarrollo de acciones locales para la conservacin de la biodiversidad en los
pases sealados como claves. Sin embargo las diferentes realidades de los pases ha impedido
que la implementacin de dichas iniciativas haya sido homognea a nivel mundial, lo que ha
generado que algunas ecorregiones consideradas como prioritarias se encuentren escasamente
protegidas (e.g. ecorregin mediterrnea de Chile Central), y que el desarrollo de listas rojas en
algunos pases se vea obstaculizado por la falta de informacin ecolgica bsica de las especies
componentes de dichos ecosistemas (Cofr & Marquet, 1999; Brooks et al., 2004; Rodriguez et
al., 2004; Hoekstra et al., 2005).
Una de las zonas catalogadas como prioritarias para su conservacin a nivel mundial (Hot-spots
de Biodiversidad) corresponde a la zona central de Chile (Mittermeier et al., 2004). Esto debido
al alto grado de endemismo de las especies que habitan dicha zona y al avanzado estado de
deterioro que presentan sus hbitats originales (Myers et al., 2000). De las 3539 especies de
plantas vasculares distribuidas en la zona centro y norte de este hot-spot, el 50% (1769
Arroyo et al., (2008) sealan que es urgente desarrollar una estrategia de conservacin
integrada para la zona central de Chile, incluyendo objetivos como la conservacin de las
especies amenazadas, la creacin de reas protegidas y la restauracin de la vegetacin nativa.
Consistente con ello, Conama (2003) en su Estrategia Nacional de Biodiversidad incluye
dentro de las lneas estratgicas para el pas asegurar la preservacin de especies y del
patrimonio gentico, as como tambin asegurar la conservacin y restauracin de ecosistemas.
As, el desarrollo de estudios que permitan generar informacin ecolgica relevante sobre las
especies de la zona central de Chile es una tarea fundamental para el impulso de iniciativas de
conservacin, incluyendo el desarrollo de listas rojas, la creacin de nuevos sitios prioritarios, y
la evaluacin de sitios para acciones de restauracin. Adems dichas acciones se enmarcan en
los objetivos que el pas se ha propuesto como lneas estratgicas para conservar su patrimonio
natural.
En Chile los estudios genticos con especies nativas son escasos y se centran principalmente en
seis especies amenazadas de un total de 153 especies de plantas catalogadas bajo alguna
categora de amenaza (Cuadro 1) (CONAMA, 2008).
Cuadro 1: Lista de especies nativas amenazadas en las cuales se han desarrollado estudios
genticos.
En la ltima dcada, junto con los avances tericos, las aplicaciones prcticas de la conservacin
gentica se han ido extendiendo. En algunos pases, como en Estados Unidos, desde hace
algunos aos se ha incorporado la informacin gentica en la toma de decisiones para la
clasificacin de especies en listas de especies amenazadas.
Si bien la informacin gentica es importante, las decisiones no deben pasar slo por sta, sino
que debe ser integrada con otras fuentes de informacin de igual o mayor importancia como
son la informacin ecolgica y geogrfica (Fallon, 2007). En este sentido contar con mapas de
distribucin actual y potencial de las especies es una herramienta fundamental, tanto para
evaluar el estado de conservacin de las especies, como para evaluar potenciales sitios para
desarrollar iniciativas de restauracin.
La condiciones ambientales pueden ser caracterizadas por medio de dos enfoques: mecanstico
o correlativo. Los modelos mecansticos incorporan mecanismos fisiolgicos que limitan la
tolerancia de ciertas especies a las condiciones ambientales. Por otro lado, los modelos
correlativos estiman las condiciones ambientales adecuadas para las especies por medio de la
Hoy en da existen aproximadamente 16 modelos de este tipo que utilizan distintos mtodos,
modelos y datos para desarrollar las predicciones (Elith et al, 2006). Uno de estos es el mtodo
de modelamiento que propone el software Maxent, (version 3.3.1), el cual corresponde a un
mtodo multiuso, basado en una aproximacin estadstica llamada mxima entropa, que
permite hacer predicciones utilizando informacin incompleta, en este caso datos de presencia
u ocurrencia, de la distribucin potencial de una especie. Para una descripcin ms detallada
revisar Philips et al, 2004; 2006 y Phillips & Dudik, 2008.
A pesar de que existe un amplia gama de mtodos similares, Maxent pareciera ser el ms
plausible de aplicarse por tres razones principales; 1) se requiere slo datos de presencia, 2) su
consistente buen desempeo en comparacin con otros 16 mtodos similares, (Elith et al,
2006), especialmente con un nmero pequeo de muestras (datos de ocurrencia) (Elith et al,
2006; Phillips et al, 2006; Hernndez et al, 2008) y 3) su disponibilidad gratuita (disponible en
http://www.cs.princeton.edu/~schapire/maxent).
Adems existen diversos estudios que han usado este mtodo de modelamiento en especies
vegetales con diversos fines (Saatchi et al 2008, Wolfgang et al 2008, Phillips & Dudik, 2008).
Kumar and Stohlgren (2009), utilizaron el mtodo de modelamiento en base a mxima entropa
o Maxent, para predecir el hbitat potencial apropiado para la especie Canacomyrica monticola,
una especie de arbrea amenazada de Nueva Caledonia. Los investigadores usaron un nmero
pequeo de datos de ocurrencia (11), obteniendo un alto porcentaje de xito (91%, baja tasa de
omisin) y estadsticamente significativo (P=0.0025) para la prediccin del hbitat de la especie
estudiada. Con estos resultados los autores concluyen que el modelamiento de la distribucin
de especies amenazadas, de las que en general se tiene poca informacin, es posible usando un
pequeo nmero de datos de ocurrencia, capas con informacin climtica y Maxent.
En Chile, Ziska et al (2009) utilizaron Maxent para determinar las reas de distribucin de 27
especies de plantas monocotiledneas, pertenecientes a la familia de las bromeliceas, de la
Dos especies de plantas que actualmente se encuentran catalogadas como amenazadas son el
Lcumo Chileno (Pouteria splendens), catalogada como en peligro de extincin, y el Belloto del
Norte (Beilschmiedia miersii), catalogada como vulnerable (Conama, 2008). Ambas especies son
P. splendens posee una forma de vida predominantemente arbustiva, pudiendo llegar a tomar
caractersticas de rbol pequeo (5 metros de altura) si las condiciones son adecuadas. Habita
tpicamente en el litoral sobre lomajes y quebradas secas sujetas a la influencia de neblinas
costeras. Actualmente se conocen solamente 2 poblaciones de P. splendens, las cuales se
encuentran separadas por ms de 100 kilmetros, sin embargo existen registros histricos de su
presencia en las cercanas de Quillota (Avils, 2009a). La poblacin ms septentrional crece
sobre terrazas marinas desde el lmite norte de la regin de Valparaso (Los molles-Pichidangui)
hasta el norte de Los Vilos. Mientras que la poblacin meridional crece entre la Quebrada Los
Lcumos en los Acantilados de Playa Ancha hasta Punta del Gallo (Hechenleitner et al., 2005).
Posee frutos que son consumidos por roedores, aves y zorros, por lo que puede jugar un rol
clave en el equilibrio del ecosistema. En la actualidad su hbitat est fuertemente impactado
por incendios y proyectos de desarrollo urbano, que incluyen loteos, caminos, ensanches para
rutas de acceso, extraccin de lea, pastoreo y reemplazo (Hechenleitner et al., 2005; Avils,
2009a). Por el momento ninguna de sus poblaciones ha sido incorporada dentro del SNASPE.
B. miersii es un rbol siempreverde que alcanza una altura de hasta 25 metros (Rodrguez y
Quezada, 2001). Las poblaciones actuales se encuentran restringidas principalmente a cauces de
quebradas con agua corriente y a laderas de exposicin sur de alta hmedad entre la cuesta El
Meln (Regin de Valparaso) y las cercanas de Doihue (Regin del Libertador Bernardo
OHiggins) (Gajardo, 1994; Novoa, 2004; Ramrez et al., 2004; Hechenleitner et al., 2005). Las
poblaciones actuales corresponden en gran medida a remanentes de comunidades
desarrolladas bajo condiciones ambientales diferentes a las actuales (Avils 2009b). La
urbanizacin, actividades mineras, la conversin de bosques hacia terrenos agrcolas y
problemas asociados como el sobre pastoreo se puede expresar en poblaciones de baja
diversidad gentica con individuos provenientes de rebrotes y con escasa a nula regeneracin
natural por va de reproduccin sexual por semillas (Henrquez & Simonetti, 2001;
Hechenleitner et al., 2005; Avils 2009b). La especie fue listada como Monumento Natural en
General
Especficos
4. Evaluar el grado de amenaza de las especies en estudio en funcin de los resultados de los 3
objetivos anteriores.
Priorizacin de sitios para conservacin y restauracin de dos especies de flora endmica de Chile
amenzazadas (B. Miersii y P. Splendens), basada en un modelo biogeogrfico multicriterio.
Introduccin.
La condiciones ambientales pueden ser caracterizadas por medio de dos enfoques: mecanstico o
correlativo. Los modelos mecansticos incorporan mecanismos fisiolgicos que limitan la tolerancia de
ciertas especies a las condiciones ambientales. Por otro lado, los modelos correlativos estiman las
condiciones ambientales adecuadas para las especies por medio de la asociacin de datos de ocurrencia
de individuos con datos ambientales que potencialmente limitan su crecimiento. En general los modelos
ms usados son los correlativos debido a que la informacin de entrada necesaria es ms fcil de
obtener, ya que slo necesitan dos tipos de datos de entrada, sitios de ocurrencia y variables
ambientales.
Hoy en da existen aproximadamente 16 modelos de este tipo que utilizan distintos mtodos,
modelos y datos para desarrollar las predicciones (Elith et al, 2006). Uno de estos es el mtodo
de modelamiento que propone el software Maxent, (version 3.3.1), el cual corresponde a un
mtodo multiuso, basado en una aproximacin estadstica llamada mxima entropa, que
A pesar de que existe un amplia gama de mtodos similares, Maxent pareciera ser el ms
plausible de aplicarse por tres razones principales; 1) se requiere slo datos de presencia, 2) su
consistente buen desempeo en comparacin con otros 16 mtodos similares, (Elith et al,
2006), especialmente con un nmero pequeo de muestras (datos de ocurrencia) (Elith et al,
2006; Phillips et al, 2006; Hernndez et al, 2008) y 3) su disponibilidad gratuita (disponible en
http://www.cs.princeton.edu/~schapire/maxent).
Adems existen diversos estudios que han usado este mtodo de modelamiento en especies vegetales
con diversos fines (Saatchi et al 2008, Wolfgang et al 2008, Phillips & Dudik, 2008). Kumar and Stohlgren
(2009), utilizaron el mtodo de modelamiento en base a mxima entropa o Maxent, para predecir el
hbitat potencial apropiado para la especie Canacomyrica monticola, una especie de arbrea amenazada
de Nueva Caledonia. Los investigadores usaron un nmero pequeo de datos de ocurrencia (11),
obteniendo un alto porcentaje de xito (91%, baja tasa de omisin) y estadsticamente significativo
(P=0.0025) para la prediccin del hbitat de la especie estudiada. Con estos resultados los autores
concluyen que el modelamiento de la distribucin de especies amenazadas, de las que en general se
tiene poca informacin, es posible usando un pequeo nmero de datos de ocurrencia, capas con
informacin climtica y Maxent.
Si bien el desarrollo de la metodologa anteriormente enunciada es una tarea de gran relevancia para la
conservacin de la biodiversidad, la eleccin de las especies en la cual se validar constituye una pieza
clave a la hora de evaluar sus resultados.
Dos especies de plantas que actualmente se encuentran catalogadas como amenazadas son el Lcumo
Chileno (Pouteria splendens), catalogada como en peligro de extincin, y el Belloto del Norte
(Beilschmiedia miersii), catalogada como vulnerable (Conama, 2008). Ambas especies son endmicas de
la zona central de Chile, poseen una distribucin geogrfica restringida con poblaciones altamente
fragmentadas y la informacin ecolgica utilizada para su clasificacin es ms bien escasa (Avils,
2009a,b; Hechenleitner et al., 2005). En ese sentido enfocar el trabajo en un primera instancia en estas
especies catalogadas actualmente como amenazadas podra cumplir con dos objetivos complementarios;
primero, validar la aplicacin de la metodologa propuesta, y segundo, generar informacin ecolgica
que permita evaluar el estado de conservacin actual de dichas especies.
Se implemento el programa Maxent versin 3.3 (Phillips, Anderson y Schapire, 2006) para
modelar las distribuciones potenciales de las poblaciones de Bellotos del Norte y Lcumo,
basndose para ello en datos validados de distribucin actual y reciente. Las localidades
actuales con presencia de dichas especies fueron determinadas en base a registros de la
literatura, antecedentes de los propios investigadores, y prospecciones de terreno realizadas
durante el desarrollo del proyecto.
Tabla 1: Variables climticas utilizadas para modelar la distribucin de especies. Tras un anlisis de correlacin para
Belloto del Norte se decidi slo utilizar las variables enegrecidas.
BIO2 = Isotermalidad
BIO3 = Estacionalidad de la T
Para asegurar la calidad del modelo final se analiz la correlacin existente entre las 19
variables bioclimticas a implementar en el modelo, mediante la estimacin del coeficiente de
correlacin de Pearson disponible en el programa ENMTools versin 1.3. (Warren et al. 2010).
Para entrenar el modelo a generar por Maxent, se tomaron dos vas distintas dependiendo de
las especies estudiadas.
En el caso del Belloto del Norte, especie con un alto nmero de datos de presencia
muestreadas, y con una distribucin medianamente amplia en relacin a la resolucin de las
capas climticas implementadas, se decidi utilizar como rea de estudio las zonas definidas
previamente por Gajardo (1994) como Subregiones en las que la especie se encontraba
presente, debido al significado bioclimtico de esta categora de clasificacin territorial. No se
utiliz un rea de estudio mayor debido a que en esos casos es ms probable la inclusin de
hbitats con condiciones climticas aptas para la especie, pero que se encuentran actualmente
desocupadas como resultado de interacciones biticas entre las especies, limitaciones a la
dispersin, y factores exgenos como la intervencin del hombre, provocando finalmente un
modelo muy conservador, con tendencia a sobre ajustarse a las condiciones encontradas en las
localidades aledaas a las utilizadas para entrenar el modelo y (Anderson y Raza, 2010).
Tabla 2: Contribucin relativa de cada variable implementada en el modelo de Maxent para Bellotos del Norte. El %
de contribucin representa la contribucin en el aumento de ganancia del algoritmo de entrenamiento. La
importancia de permutacin representa el efecto sobre los valores de AUC que provoca la permutacin azarosa de
los valores de cada capa climtica. Mediante estos mtodos de evaluacin la precipitacin anual sobresale como la
variable climtica ms influyente sobre la distribucin espacial de los Bellotos del Norte.
Importancia de
Variable % de contribucin Permutacin
Tabla 3: Contribucin relativa de cada variable implementada en el modelo de Maxent para Lcumos. Mediante
estos mtodos de evaluacin temperatura mnima tambin sobresale como la variable climtica mas influyente
sobre la distribucin espacial de los Lcumos.
Importancia de
Variable % de contribucin Permutacin
bio_18 5.7 0
bio_17 0.5 0
Figura 1: Curva de caracterstica de funcionamiento del receptor (ROC) para la modelacin de Bellotos del Norte. La
especificidad del modelo es definida por el rea predicha. El rea bajo la curva obtenida (AUC) es alta de 0.945 el
modelo presenta un muy buen desempeo. Valores mayores a 0.9 son considerados excelentes (Swets 1988, Elith
2002).
Lcumo Chileno
Figura 2: Resultados de la importancia de cada variable para el modelo de Lcumo, mediante la prueba de Jacknife
evaluando los efectos a nivel de la ganancia del modelo para el entrenamiento, no se evala el efecto en el AUC o
en la ganancia de prueba, debido a que se uso toda la informacin para el entrenamiento a diferencia del caso de
los Bellotos. La variable con ms informacin por si sola, o sea con ms ganancia para explicar la distribucin
espacial de los Lcumos, es la T mnima del mes ms fro.
Para determinar los sitios potenciales a restaurar se decidi implementar una evaluacin multicriterio
representado por un modelo lineal sin ponderacin, con cuatro variables de entrada consistentes en las
capas de distribucin potencial obtenida por Maxent, distancia a los caminos y ciudades (a mayor
distancia de un camino o zona poblada es menor el grado de alteracin antrpica), distancia a los
parques protegidos por el Sistemas Nacional de reas Protegidas del Estado (SNASPE) y los sitios
definidos por Conama como Prioritarios para la Conservacin de la Biodiversidad. A cada una de las
variables se les asoci un puntaje de 1 a 10 como se muestra en la Tabla 4.
Para la variable distancia a los parques SNASPE se crearon buffers de 10 km cada uno. Se decidi incluir
esta variable basado en el hecho de que los Parque Nacionales poseen ecosistemas de alto valor que
podran actuar como parches fuentes dentro de un sistema de metapoblaciones. En el caso de la variable
de sitios prioritarios para la conservacin de la Biodiversidad se gener una capa binaria otorgando el
mximo puntaje a las reas contempladas dentro del sistema. Esta capa se decidi utilizar tomando
como antecedentes que en la Estrategia Nacional de Biodiversidad dichos sitios poseen prioridad para la
conservacin y restauracin a nivel nacional.
Tabla 4: Tabla de intervalos y sus puntajes asociados para la evaluacin Multicriterio. Puntajes mayores estn
asociados a sitios que poseen mejores caractersticas para realizar iniciatiavas de restauracin.
Distancia a Sitio
Distancia a los caminos SNASPE Prioritario Probabilidad de Probabilidad de
y ciudades (mts.) (km.) conservacin presencia de belloto presencia de Lcumo Puntaje
La clasificacin de intervalos para las capas de probabilidad de presencia de especie producidas por
Maxent, se obtuvo aplicando el mtodo de optimizacin de Jenkins disponible en Arcgis 9.2, el que
genera clases maximizando la varianza entre grupos y disminuyendo la varianza al interior de cada
categora formada. Una vez definido los intervalos de las variables se creo un raster con una unidad
bsica de mapeo de 30 mts a partir de las actualizaciones del Catastro del Bosque Nativo, eliminando
previamente aquellos usos de suelo consideradas como restrictivas a la restauracin de las especies
(Tabla 5).
Tabla 5: categoras del Catastro del Bosque Nativo eliminadas para la seleccin de los sitios a restaurar y para
determinar los sitios de presencia reales de Bellotos y Lcumos.
Minera Industrial
Dentro de los resultados principales del estudio, e independiente de las especies que se utilizaron para
modelar, se encuentra una capa de priorizacin multicriterio basado en tres componentes principales:
Cercana a SNASPE, Incorporacin en Sitios Prioritarios y Cercana a caminos o zonas pobladas. En la
figura 3 es posible ver los resultados de la modelacin de estas tres variables que posteriormente se
encuentran integradas en una sola capa de superficies prioritarias para restauracin de ecosistemas
(Figura 4).
Figura 3. Capas base resultantes de modelacin por variable identificada para su incorporacin en modelo de
priorizacin para zonas de restauracin multicriterio. Izquierda, cercana a SNASPE; Centro, Sitios Prioritarios;
Derecha, distancia a caminos y zonas pobladas.
Figura 4. Capa de priorizacin multicriterio utilizada para la incorporacin de variables de distribucin de las
especies evaluadas en este estudio. Las capas utilizadas para el modelo no se encuentran ponderadas, por lo que
todas tienen el mismo peso dentro de los clculos.
En total se identificaron 268 puntos (75 poblaciones validadas) con presencia de Belloto del Norte,
ubicadas entre el lmite de las regiones de Coquimbo y Valparaso por el norte (sector Trapiche), y la
zona sur de la Regin Metropolitana (Alhu), (Figura 5). En la gran mayora de los casos las poblaciones
se encontraron asociadas a sectores hmedos, de preferencia de exposicin sur y/o este, y muchas veces
con presencia de cuerpos de agua en las cercanas, lo que refleja la importancia que el recurso hdrico
posee para la presencia de esta especie. Respecto al nivel de agregacin de las poblaciones existentes,
existen tres zonas principales de distribucin (sector norte del Ro Aconcagua, Sector La Campana y Altos
de Cantillana), todas ellas asociadas a la Cordillera de la Costa.
Figura 5. Distribucin actual de las poblaciones de Belloto del Norte (B. miersii). A la izquierda (imagen Landsat
espectral) es posible ver que la distribucin de esta especie se encuentra asociada a sectores hmedos y de
abundante vegetacin nativa. A la derecha se muestran los mismos puntos, pero sobre un mapa que permite ver la
distribucin geogrfica y nivel de agregacin de las poblaciones existentes.
Al realizar la modelacin de la distribucin potencial de Belloto del Norte mediante la inclusin de las
variables bioclimticas en Maxent, es posible observar que la especie posee un rango de distribucin
potencial levemente superior al que actualmente tiene (Figura 6). La probabilidad de ocurrencia (entre 0
y 1) muestra que los sitios que poseen las mejores caractersticas climticas para la especie
corresponden a aquellos que se encuentran en la zona norte de la cordillera de la costa de Regin de
Valparaso, lo cual es concordante con las poblaciones ms grandes que actualmente sobreviven de esta
especie, asociadas principalmente a ecosistemas de la cordillera del Meln.
Figura 6 Distribucin potencial de las poblaciones de Belloto del Norte (B. miersii). Los colores de la leyenda indican
probabilidad de ocurrencia de la especie en funcin de la modelacin con variables bioclimticas en Maxent, donde
el blanco corresponde al rango entre 0 y 20% de ocurrencia y el rojo entre 80 y 100% de ocurrencia.
La integracin de la capa de priorizacin desarrollada para la zona de estudio (ver figura 4) y la capa de
distribucin potencial de Belloto del Norte genera un mosaico de sitios con sus respectivos valores de
priorizacin. Los valores mayores (rojos) son aquellos que poseeran mejores condiciones para
potenciales iniciativas de restauracin (figura 7). Segn el modelo las zonas prioritarias para la
restauracin de poblaciones de Bellotos del Norte seran aquellas ubicadas en la vertiente occidental de
la Cordillera de la Costa, vinculadas a la Cordillera del Meln y cercanas del Parque la Campana. Junto
con ello resaltan tambin como prioritarias dos sectores que se encuentran ligados al sector conocido
como Valle de Colliguay (ambos en la regin de Valparaso).
En total se identificaron 23 puntos (6 poblaciones validadas) con presencia de Lcumo Chileno, ubicadas
entre la quebrada de Huentelauqun por el norte y el sector de Quintay por el sur (Figura 8). En la gran
mayora de los casos las poblaciones se encontraron asociadas a sectores costeros, de preferencia en
planicies costeras, quebradas y roqueros de exposicin oeste. Salvo las poblaciones ubicadas entre el
sector de Pichidangui-Los Molles, la cual se podra tomar como un continuo, las dems poblaciones se
encuentran muy fragmentadas, y en varios casos corresponden slo a unas decenas de individuos.
Respecto al nivel de agregacin de las poblaciones existentes, existen dos zonas principales de
distribucin, sector Pichidangui-Los Molles y Laguna Verde-Quintay. El resto de las poblaciones
prospectadas posean un nivel bajo de individuos, y en algunos casos los registros existentes en la
literatura no fueron posible de validarse en terreno.
Figura 8. Distribucin actual de las poblaciones de Lcumo Chileno (P. splendensi). A la izquierda (imagen Landsat
espectral) es posible ver que la distribucin de esta especie se encuentra asociada slo a sectores costeros. A la
derecha se muestran los mismos puntos, pero sobre un mapa que permite ver la distribucin geogrfica y nivel de
agregacin de las poblaciones existentes. El registro ubicado al interior de la Regin de Valparaso no fue posible de
ser validado en terreno.
Figura 9. Distribucin potencial de las poblaciones de Lcumo Chileno (P. splendens). Los colores de la leyenda
indican probabilidad de ocurrencia de la especie en funcin de la modelacin con variables bioclimticas en
Maxent, donde el blanco corresponde al rango entre 0 y 20% de probabilidad de ocurrencia y el rojo entre 80 y
100%.
La integracin de la capa de priorizacin desarrollada para la zona de estudio (ver figura 4) y la capa de
distribucin potencial de Lcumo Chileno genera un mosaico de sitios con sus respectivos valores de
priorizacin. Los valores mayores (rojos) son aquellos que poseeran mejores condiciones para
potenciales iniciativas de restauracin (figura 10). Segn el modelo existiran escasas zonas que renan
condiciones para desarrollar iniciativas de restauracin para esta especie, lo cual es consecuente con el
grado de alteracin producto de proyectos inmobiliarios al que se han visto sometidas las zonas del
litoral costero donde esta especie se encuentra presente. Dentro de las zonas que an poseen niveles de
amenaza menores se encuentran el borde costero ubicado en el sector de Pichidangui y Los Molles, y
una pequea franja costera situada al sur-oeste de Laguna Verde.
Figura 10. Modelo de priorizacin para seleccin de sitios para la restauracin de poblaciones de Lcumo Chileno
(P. splendens). Los colores de la leyenda indican nivel de prioridad del sector, donde el verde indica un nivel de
prioridad menor y el rojo un nivel de prioridad mximo. A la derecha se muestran los puntos con presencia
registrada de Lcumo Chileno sobre el mapa de priorizacin.
Los resultados de este proyecto permiten demostrar la utilidad de la utilizacin de una herramienta
como Maxent para la modelacin de distribucin de especies. Si bien esta herramienta ya haba sido
utilizada con anterioridad para pronosticar distribuciones potenciales de algunas especies de flora
chilena (i.e. Ziska et al., 2009), hasta el momento no existen registros de su uso para establecer
potenciales sitios de restauracin de especies amenazadas, ni tampoco de la integracin de los
resultados de distribuciones potenciales con otras capas de informacin dentro de un modelo
multicriterio de priorizacin de sitios.
La utilizacin del modelo desarrollado en este trabajo para la priorizacin de sitios para restaurar
permite generar una visin ms acuciosa, respecto al estado de conservacin de las especies
prospectadas, no slo en base a la informacin referente a la distribucin que estas especies
probablemente posean en el pasado (distribucin potencial), sino tambin en relacin a la cantidad y
calidad de sectores que actualmente poseen caractersticas ideales para que estas especies puedan ser
conservadas en el largo plazo.
Por tanto cobra vital relevancia evaluar potenciales sitios que permitan desarrollar iniciativas de
restauracin de dichas especies, sobre todo tomando en cuenta que probablemente las amenazas a las
cuales estn sometidas las poblaciones de estas especies sigan presionndolas en el futuro. En lo que
respecta a este punto, los resultados son particularmente dismiles para ambas especies, lo cual remarca
Anlisis de la estructura gentica del Belloto del Norte (Beilschmiedia miersii (Gay) Koster) y
del Lcumo chileno (Pouteria splendens (A.DC.) Kuntze), mediante marcadores moleculares
ISSR (Inter Simple Sequence Repeat).
Introduccin
Las poblaciones naturales de plantas, son habitualmente afectadas por numerosos eventos de
tipo demogrfico, ambiental y gentico. El efecto de tales eventos mantiene en constantemente
riego de desaparecer a las especies que se encuentran vulnerables y/o en peligro de extincin
(Kohn et al., 2006). Lande en la dcada de los 80 (Lande, 1988) sugiri que los procesos
estocsticos tanto, demogrficos como ambientales, seran los responsable primarios de
conducir a una especie a la extincin, incluso antes de que el deterioro de la base gentica,
alcance a ser un problema. Sin bien, el rol de los factores genticos en la extincin de las
poblaciones naturales, han sido controversiales, la evidencia actual muestra que contribuyen
significativamente al riesgo de extincin. Al respecto, se ha observado que la depresin por
efecto de la consanguinidad (inbreeding) y la prdida de variabilidad gentica incrementa el
riego en las poblaciones naturales de especies algamas (Frankham, 2003; 2005).
Materiales y Mtodos
Material vegetal
Para llevar a cabo el anlisis se colectaron muestras de brotes foliares para las especies bajo
estudio. El material vegetal fue introducido en criotubos de 2,7 mL los que se congelaron en
nitrgeno lquido durante cada recoleccin. En el laboratorio las muestras son mantenidas a -
20C hasta su procesamiento para la extraccin de ADN. Cada individuo se identifico y se
determin su posicin geogrfica con GPS.
Se colectaron brotes foliares de 121 ejemplares de Lcumo chileno (Pouteria splendens), desde
6 zonas a lo largo de la distribucin geogrfica natural de la especie, en la zona costera entre la
regin de Coquimbo y la regin de Valparaso. Los individuos fueron agrupados en tres
diferentes poblaciones dado a su cercana geogrfica para su posterior anlisis, las cuales fueron
identificadas como Fundo Palo Colorado, Pichidangui-Los Molles y Quintay. (Tabla 1).
Lcumo
Belloto
Adicionalmente, se recolectaron brotes foliares de 187 Bellotos del Norte (Beilschmiedia miersii)
desde 7 localidades distribuidas entre la regin de Coquimbo y la regin de Valparaso, tanto
en zonas cordilleranas , valles centrales y zonas costeras. Las poblaciones fueron denominadas
Quebrada el Ajial, Fundo La Represa, Via Las Vertientes/ Quebrada del Cura, Via
Errzuriz, Quebrada El Tigre, Aculeo y Cerro La Campana. (Tabla 1).
El ADN genmico fue extrado desde pequeas porciones de 0.5mg del tejido vegetal, mediante
el protocolo del CTAB (Doyle, 1987). La concentracin y calidad del ADN fue verificada mediante
la utilizacin del espectrofotmetro Nanodrop 2000c/2000. Se seleccionaron las muestras
vegetales que tenan una mejor calidad de ADN ya que con estas condiciones los posteriores
anlisis se obtendrn satisfactoriamente. (Tabla 1).
Para obtener los marcadores moleculares, cada una de las muestras se someti a la tcnica de la
Reaccin en Cadena de la Polimerasa, con las condiciones especficas para el marcador ISSR
utilizado. Antes de llevar a cabo la amplificacin de los marcadores moleculares ISSR se
realizaron gradiente de temperatura para determinar las condiciones ptimas de amplificacin y
adems para seleccionar el marcador que present un patrn de bandeo legible y que aportara
una mayor informacin. Para el anlisis de la variabilidad gentica de las poblaciones naturales
de Lcumo y Belloto del Norte, se utilizaron un total de 5 loci ISSR (Tabla 2).
Las condiciones de PCRs, utilizadas para la obtencin de los marcadores ISSR fueron las
siguientes : para cada muestra una mezcla que contena 2l de ADN a una concentracin de 20
ng/l, 2.5l de Buffer para PCR (Tris-HCl 100mM pH: 8,3, KCL 500mM), 1.25l de MgCl2 50mM,
0.2l de Taq ADN polimerasa (Invitrogen), 0,4l de dNTPs 15 mM (Invitrogen), 0,4l de cada
partidor correspondiente (15mM), finalmente para llegar al volumen final de 25l se complet
con 18,25 l de agua ultrapura. La amplificacin se efectu en un termociclador marca Corbett
Research, modelo GC1-96, segn las siguientes condiciones: 94C por 3 minutos, 40 ciclos de
94C por 40 segundos, 1.30 minutos a temperatura de alineamiento segn el partidor, 72C por
2 minuto y finalmente 20 minutos a 72C.
Visualizacin de ISSRs
Para poder visualizar el resultado de del patrn de bandeo generado por cada uno de los
diferentes muestras de los marcadores moleculares ISSR, primero se llev a cabo una
Tamao de
N Partidor Secuencia T alineamiento (C)
fragmentos (pb)
Lcumo
Belloto
En ambas especies los datos para cada locus ISSR fueron registrados como 0 cuando la banda
est ausente y 1 cuando est presente, lo que da origen a una matriz de datos binarios. Se
analizaron los datos con el programa GenAlEx (Peakall and Smouse 2006). Se estimaron
parmetros genticos tales como : Polimorfismos, diversidad gnica (H; Nei, 1973) e ndice de
Shannon (I; Shannon and Weaver ,1949). Para determinar la distribucin de la variabilidad
gentica entre poblaciones (st), se aplico el Anlisis de Variabilidad Molecular (AMOVA;
Excoffier et al., 1992) . Para visualizar la organizacin de variabilidad genticas de las
poblaciones estudiadas se realizo un Anlisis de Componentes principales (PCA) a partir de las
distancias genticas estimadas por el programa GenAlEx.
Finalmente, las relaciones genticas de los individuos estudiados de ambas especies, fue
analizada mediante el programa Structure v.2.1(Pritchard et al.2000). Este mtodo utiliza un
procedimiento bayesiano y Cadenas de Markov (MCMC) para asignar probabilsticamente los
individuos a K grupos, de manera que el equilibrio de Hardy Weinberg y el desequilibrio de
ligamiento sean maximizados. La eleccin del numero ms probable de K grupos, fue realizada
comparando el logaritmo de la probabilidad posterior de los datos [Ln Pr (X/K)]. La corrida con el
valor ms alto de Probabilidad posterior (K/X) fue elegida y la proporcin de ancestro
(membership) de cada poblacin fue calculada promediando el coeficiente de membership
(Q) de los individuos. El programa fue corrido para probar la hiptesis de que existen 1 a 3
grupos genticos en el Lcumo y 1 a 8 grupos en el Belloto. Se utiliz un modelo de
admixture y frecuencias allicas correlacionadas. Las corridas fueron llevadas a cabo usando
un burn in period de 100.000 y un largo de MCMC de 1.000.000 con 3 iteraciones para cada
corrida. Un valor de Q 0.8 fue utilizado para asignar un individuo a un grupo. Aquellos
individuos con valores de Q< 0,8 fueron considerado genticamente mezclados (admixured).
Extraccin de ADN
Se extrajo ADN desde 187 muestras de Belloto del Norte y 121 muestras de Lcumo chileno.
De estas extracciones se obtuvo en promedio de 369,1 ng/L ( 261,5 ng/L) de ADN genmico
de Beilschmiedia miersii y para la especie Pouteria splendens se obtuvo un promedio de 1199,6
ng/L ( 688,1 ng/L) de ADN genmico de (Anexos 1 y 2).
Para el Lcumo chileno se seleccionaron 5 partidores ISSR (Tabla 1), de los cuales se pudo
obtener un total de 184 loci polimrficos (Figuras 1 y 2). El tamao de los fragmentos fluctu
entre 410 pb a 2700pb dependiendo del partidor utilizado (Tabla 3).
Con respecto al belloto del Norte, se seleccionaron 5 partidores ISSR (Tabla 1) de los cuales se
obtuvo un total de 147 loci polimrficos (Figuras 3 y 4). El tamao de los fragmentos fluctu
entre 260 pb a 2500 pb dependiendo del partidor utilizado (Tabla 2).
Variabilidad gentica
Lcumo chileno
El nivel de variabilidad gentica fue similar entre las 3 poblaciones estudiadas como indican los
resultados de la tabla 3. No existieron diferencias notables entre los indicadores de variabilidad
gentica. El nivel de polimorfismo vario entre 98 a 100% para los loci estudiados, mientras que
Los resultados adems indican, que la mayor parte de la variabilidad gentica se encuentra
distribuida dentro de las poblaciones, representando un 97% de la variabilidad observada
(Figura 5). El anlisis de componentes principales (PCA) explic un 55% de la variabilidad de los
datos, como se aprecia en la figura 6. Es posible observar, una escasa diferenciacin entre las 3
poblaciones analizadas. Se observa una gran poblacin con individuos genticamente similares.
Solo algunos de ellos se escapan, lo que podra estar dando cuenta del 3% de diferenciacin
encontrada en el AMOVA.
Tabla 3. ndices de variabilidad gentica para 147 loci ISSR en 121 individuos de Lcumo chileno.
Poblacin N I He P (%)
LUCUMO BELLOTO
3%
st st
5%
97% 95%
El anlisis de cluster bayesiano dio similares resultados, fue posible identificar 3 grupos (Figura
7). El valor de K=3 dio la mejor estimacin de la probabilidad posterior de los datos (P(K/X=1,0)
y el mejor asignamiento por grupo (Q0,8). Es as como, el grupo 1 contiene un total de 23
individuos, 15 provenientes de la poblacin Fundo Palo Colorado, 6 de la poblacin
Pichidangui-Los Molles y 2 de la poblacin Quintay El grupo 2 est formado por 19 individuos,
4 de la poblacin Fundo Palo Colorado, 7 de Pichidangui-Los Molles y 8 de Quintay. El grupo
3 est formado por 9 individuos de la poblacin de Pichidangui-Los Molles. Finalmente, 70
rboles mostraron valores Q 0,8 por lo que fueron considerados como un grupo de individuos
genticamente mezclados (Tabla 4).
Figura 6. Anlisis de Componentes Principales para 121 individuos de lcumo chileno y 147 loci
ISSR. PC = Palo colorado; PM = Pichidangui Los Molles; Q = Quintay.
CP2 ( 18,7%)
PC1 (19,5%)
Tabla 4. Logaritmo de la probabilidad de los datos (Ln Pr (X/K)) y probabilidad posterior (P(K/X)
para 121 individuos de lcumo chileno analizados con 147 loci ISSR. Se realizaron simulaciones
para valores K desde 1 a 5 posibles grupos Adems, para cada Cadena de Markov se realizaron 3
iteraciones.
Ln Pr (X/K) P (K/X)
___________________________________________________________
Iteracin
K 1 2 3 Promedio
1 -9372 -9372 -9372 -9372 0
2 -9216 -9216 -9216 -9216 0
3 -9448 -9149 -9149 -9149 0
4 -9172 -9190 -9195 -9186 0
5 -9112 -9112 -9113 -9112 1.0
___________________________________________________________
Figura 8. Anlisis discriminante a partir de los valores Q dados por structure para los 121
lcumos estudiados. 1=grupo 1; 2=grupo 2; 3= grupo 3; 4= individuos mezclados.
Regression Scores
0,80
I1
1
2
0,55 3
4
Score1
0,30
0,05
-0,20
-0,40 -0,10 0,20 0,50 0,80
Score2
El nivel de variabilidad gentica fue similar entre las 7 poblaciones estudiadas como indican los
resultados de la tabla 5. No existieron diferencias notables entre los indicadores de variabilidad
gentica. El nivel de polimorfismo vari entre 94,6 y 98,9% para los loci estudiados, mientras
que la heterocigosidad (He) y el ndice de Shannon (I) fluctuaron entre 0,21-0.24 y 0,35-0,39
respectivamente.
En el belloto del norte slo un 5% de la variabilidad gentica (st= 0,05, P=0,01; Fig. 5) se
distribuy entre las poblaciones estudiadas, con un 95% de la variabilidad distribuida dentro de
las poblaciones. El anlisis de componentes principales (PCA) explic un 60,8% de la variabilidad
de los datos, como se aprecia en la figura 9. Es posible apreciar, una escasa diferenciacin entre
las 7 poblaciones analizadas. Se observa una gran poblacin con individuos genticamente
relacionados. Solo algunos de ellos se escapan, lo que podra estar dando cuenta del 5% de
diferenciacin encontrada en el AMOVA. Dados los resultados expresados en la figura 9, no es
posible distinguir claramente las 7 poblaciones desde donde fueron colectadas las muestras.
El anlisis de cluster bayesiano entrego resultados similares. El valor de K=7 dio la mejor
estimacin de la probabilidad posterior de los datos (P(K/X=1,0). Sin embargo, el asignamiento
por grupo, indica que la mayora de los individuos pueden ser considerados admixture, es
decir, no pueden ser asignados claramente a un grupo pues, comparten similitudes genticas
con varios grupos a la vez. En este caso los valores de membership para la mayora de los
individuos fue 0,8.
_______________________________________________________________________________________
Poblacin N P(%) I He
_______________________________________________________________________________________
________________________________________________________________________________________
1,5
1,0
CP3(16,5%)
0,5
0,0
1,0
-0,5 0,5
0,0
)
%
,5
-0,5
25
-1,0
1(
0,5 -1,0
CP
0,0
-0,5 -1,5
-1,0
CP2( -1,5 -2,0
18,7% -2,0
)
Ln Pr (X/K) P (K/X)
______________________________________________________________________
Iteracin
K 1 2 3 Promedio
1 -18.167 -18.166 -18.165 -18.166 0
2 -17.938 -17941 -17.943 -17.941 0
3 -17.689 -17691 -17.689 -17.690 0
4 -17.518 -17.5827 -17.519 -17.521 0
5 -17.423 -17.416 17.400 -17.413 0
6 -17.268 -17.278 -17.275 -17.273 0
7 -17.206 -17.203 -17.214 -17.207 1.0
8 -17.101 -17.173 -17.378 -17.217 0.5
______________________________________________________________________
Figura 9. Bar Plot mostrando agrupamiento de 187 bellotos estudiados basado en los valores
Q dados por structure para un K=7. En el eje y de observa rango de valores de Q (valor de
corte Q0,8). Todos los individuos con valores de Q0,8 fueron considerados individuos con
admixture.
Las poblaciones de lcumo chileno (P=98% a 100%; He=0,21-0.24; I= 0,35-0,40) y belloto del
norte (P= 94,6% a 98,9%; He= 0,21-0.24 I=0,35-0,39) mostraron valores similares de variabilidad
gentica a los encontrados en otras especies vegetales para marcadores del tipo dominante (H
RAPD = 0.22; H AFLP = 0,23; H ISSR = 0,22 ; Nybom, 2004). Sin embargo, el valor del ndice de
Shannon (I) de ambas especies (I=0,35-0.40) fue considerablemente ms bajo que el reportado
en otras especie arbreas tales como, Araucaria araucana (I=0.65; Bekessy et al., 2002), Fitzroya
cupresoides (I=0.54, Allnutt et al., 1999), Pilgerodendron Uviferum (I = 0.337 to 0.716; Alnutt et
al.,2003 Nothofagus nervosa (I=0.75) y Populus tremuloides (I=0.65, Yeh et al., 1995),
Podocarpus salignus (I= 0.692, H=0.314). Es importante sealar que los indicadores de
variabilidad gentica fueron similares entre todas las poblaciones estudiadas en ambas
especies.
En el lcumo y el belloto, la diversidad gnica fue concordante con la descrita para especies
perennes, endmicas, algamas y cuyas semillas son dispersadas por gravedad y/o ingestin por
animales (Tabla 7).
Una escasa estructura gentica fue detectada con los ISSR. Al respecto, AMOVA mostr una
escasa diferenciacin entre poblacin tanto, en las poblaciones de lcumo (ST =0.03; P=0.01)
como de Belloto (ST =0.05;p=0.01). Estos valores son menores a los encontrados en plantas
para marcadores dominantes (RAPDs ST= 0.34; AFLP ST=0.35; ISSR ST= 0.35; Nybom, 2004) y
que los reportados en especies que comparten caractersticas de su historia natural (Tabla 7).
Algunos ejemplos son, Araucaria araucana (RAPDs, ST=0.128; Bekessy et al., 2002) and
Pilgerodendron uviferum (RAPDs, ST=0.186; Allnutt et al., 2003).
________________________________________________
Variable He ST
________________________________________________
Forma de vida
Rango Geogrfico
Sistema reproductivo
Dispersin semillas
___________________________________________
Por otro lado, debido al tamao de los fruto del lcumo y el belloto (6 a 8 cm de largo), su
dispersin debera estar restringida alrededor de la planta madre, aunque es posible que una
parte importante de los frutos sea dispersada por mamferos pequeos. Por cierto, este factor
no debera ser de relevancia para explicar la escasa diferencia entre poblaciones.
Introduccin
En la ltima dcada, junto con los avances tericos, las aplicaciones prcticas de la conservacin gentica
se han ido extendiendo. En algunos pases, como en Estados Unidos, desde hace algunos aos se ha
incorporado la informacin gentica en la toma de decisiones para la clasificacin de especies en listas
de especies amenazadas. Lamentablemente la informacin gentica descriptiva necesaria para
desarrollar planes de conservacin usualmente no es colectada para especies nativas, ni menos para
especies amenazadas (Edmands, 2007; Severns, & Liston, 2008). Por el contrario la gran mayora de
informacin gentica disponible proviene de estudios de plantas comunes o con amplios rangos de
distribucin (Young, & Brown, 1996).
Si bien la informacin gentica es importante, las decisiones no deben pasar slo por sta, sino que debe
ser integrada con otras fuentes de informacin de igual o mayor importancia como son la informacin
ecolgica y geogrfica (Fallon, 2007). En este sentido contar con mapas de distribucin actual y potencial
de las especies es una herramienta fundamental, tanto para evaluar el estado de conservacin de las
especies, como para evaluar potenciales sitios para desarrollar iniciativas de restauracin.
Diagnstico y recomendaciones
El estudio gentico de las poblaciones de Lcumo Chileno y de Belloto del Norte sugieren que las
poblaciones actualmente existentes seran remanentes de una gran poblacin que probablemente se
extenda dentro de los rangos de distribucin potencial generados por el modelo bioclimtico que se
presenta en el captulo I del presente proyecto. En este sentido, y tomando en cuenta la baja
diferenciacin gentica existente entre las poblaciones de ambas especies y alta variabilidad
intrapoblacionales, es posible sugerir que por el momento no existira alguna poblacin (a nivel de
especies) que particularmente requiera ms atencin que otra, esto en relacin a programas de
conservacin que dentro de sus lneas objetivos busquen conservar tanto las especies, como la
variabilidad gentica de stas. Si bien el estudio de la estructura gentica mediante ISSR es relevante
como una primera aproximacin, para desarrollar estrategias de conservacin efectivas, los anlisis
genticos deben ser complementados con estudios de caracteres relacionados con la adecuacin
biolgica de ambas especies, como tambin se deben considerar la informacin de los cambios
demogrficos de las poblaciones asociados al efecto de las actividades humanas histricas y recientes,
as como tambin a los potenciales efectos del cambio global sobre su distribucin (Byrne et al., 2011).
Por tanto, y tomando en cuenta que uno de los principales objetivos de este proyecto era proponer y
evaluar una metodologa complementaria para la clasificacin de especies en las listas rojas,
consideramos que la informacin obtenida aqu es sumamente relevante para establecer nuevos
criterios que pueden ser incorporados.
El primero de ellos sera incorporar dentro de los anlisis, modelaciones que permitan estimar de una
forma objetiva las distribuciones originales que las especies probablemente tenan previo a la
intervencin del hombre. Si bien en la actualidad existen algunos documentos que proponen
distribuciones potenciales (i.e. Gajardo 1994), las escalas de anlisis de estos documentos son
demasiado amplias como para ser representativas de especies particulares.
Por ello la incorporacin, en los anlisis del estado de conservacin de las especies, de factores como
potenciales sitios para restauracin, se vuelve una estrategia proactiva (actualmente son reactivas) que
podra dar luces del potencial de viabilidad de las especies en peligro en zonas donde actualmente no
estn presentes, pero que renen caractersticas idneas para la generacin de futuras poblaciones
viables.