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ENZIMAS.

DEFINICIN.
CARACTERSTICAS GENERALES.
ESTRUCTURA DE LAS ENZIMAS.
COMPONENTES DE UN SISTEMA ENZIMTICO.
PASOS DE LA REACCIN ENZIMTICA.
CONCEPTO DE COENZIMA, HOLOENZIMA, APONEZIMA, ISOENZIMA.
NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS.
CLASIFICACIN DE LAS ENZIMAS SEGN SU FUNCIN.
CINTICA ENZIMTICA.
VELOCIDAD DE UNA REACCIN ENZIMTICA.
EFECTO DE LA CONCENTRACIN DE LA ENZIMA SOBRE LA VELOCIDAD
DE LA REACCIN.
CONSTANTE DE MICHAELIS-MENTEN O KM.
INHIBICIN ENZIMTICA.
INHIBIDORES COMPETITIVOS, NO COMPETITIVOS Y ACOMPETITIVOS,
ALOSTRICOS.
PROENZIMAS O ZIMGENOS.
ISOENZIMAS.
MECANISMOS DE REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA.
Dr. Ricardo Remes Ruiz.
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E N Z I M A S.
Dr. Ricardo Remes Ruiz.
Las ENZIMAS O CATALIZADORES son sustancias capaces de aumentar la
velocidad de una reaccin qumica, sin modificar su estructura qumica al final de la
reaccin, pudiendo ser utilizadas nuevamente.

La gran mayora de las enzimas son PROTENAS.

Las enzimas aumentan la velocidad de la reaccin hasta que alcanzan el equilibrio


qumico.

Hay dos hechos importantes que conviene resaltar. En primer lugar, un catalizador
verdadero, aunque participa en la reaccin no se modifica su estructura por esta. As,
por ejemplo, tras catalizar la descomposicin de H2O2, la catalasa vuelve a
encontrarse exactamente en el mismo estado que antes, preparada para una nueva
reaccin. En segundo lugar, las enzimas aumentan la velocidad de las reacciones,
pero no afectan la posicin de su equilibrio .Un proceso termodinmicamente
favorable no pasa a ser ms favorable por la presencia de una enzima, ni esta hace
tampoco que un proceso desfavorable pase a ser favorable. Simplemente se alcanza
ms rpidamente el estado de equilibrio.

CARACTERSTICAS GENERALES.

1. Estn constituidas por ms de 100 aminocidos.

2. Disminuyen la energa de activacin.

3. Se requieren cantidades mnimas ya que las enzimas no se agotan, pues al


trmino de la reaccin se liberan y vuelven a catalizar.

4. Tiene alta especificidad. Es decir, una reaccin bioqumica solo puede ser
catalizada por una sola enzima.

5. Puede ser regulable.

6. Son susceptibles de ser inhibidas.

7. Modifican la estructura qumica del sustrato.


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8. Son capaces de intercambiar diferentes formas de energa. La energa que


proviene de los alimentos es atrapada en enlaces de alta energa en el ATP.

COMPONENTES DE UN SISTEMA ENZIMTICO.

ENZIMA (E).
SUSTRATO (S) es la sustancia sobre la que acta la enzima
PRODUCTO (P) es el resultado de la accin de la enzima sobre el sustrato.
COMPLEJO ENZIMA SUSTRATO (E-S) es la unin del sustrato al sitio de enlace
de la enzima.

E + S E-S P + E

ESTRUCTURA DE LAS ENZIMAS

La enzima activa completa se llama HOLOENZIMA y est formada por la porcin


protenica o APOENZIMA que suele carecer de actividad cataltica, y el COFACTOR
que es el componente NO protenico de la enzima. La naturaleza qumica del cofactor
es variada: en muchos casos el cofactor es un ion metlico, mientras que en otro es
de naturaleza orgnica, recibiendo el nombre de COENZIMA. Cuando este
componente se encuentra unido fuertemente a la apoenzima por medio de algn
enlace covalente se denomina GRUPO PROSTTICO.

SITIO ACTIVO. Es el rea especfica de la molcula de la enzima que interacta con


el sustrato. Este sitio activo es el responsable de la especificidad cataltica de la
enzima.

SITIO ALOSTRICO. No se encuentra en el sitio activo o sitio de unin del sustrato


,sino en cualquiera otra parte de la enzima .En este sitio se pueden unir molculas
pequeas llamadas efectores alostricos los cuales modifican la configuracin y la
actividad cataltica de la enzima .

ISOENZIMAS. Son enzimas con estructura diferente que catalizan la misma reaccin.
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PASOS DE LA REACCIN ENZIMTICA.

La enzima (E) y el sustrato (S) deben acercarse para que se acople el sustrato al
sitio activo de la enzima.

Se forma el COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO mediante enlaces covalentes y no


covalente.

REACCIN CATALTICA, en la que el sustrato (S) se modifica por diferentes


mecanismos.

Desprendimiento del sustrato modificado o PRODUCTO (P) de la reaccin, del


sitio activo de la enzima, la cual vuelve a asumir la forma que tena antes del
encuentro con el sustrato, sin sufrir modificacin alguna, por lo que puede volver a
interactuar con una nueva molcula de sustrato.
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SITIO ACTIVO DE LA ENZIMA.

COFACTOR Y EFECTOR ALOSTRICO


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REACCIN CATALIZADA POR UNA ENZIMA.

Esquema de una reaccin catalizada por una enzima, en la cual dos molculas de
reactantes se unen para formar una sola molcula de producto. El sitio activo muestra
una forma complementaria con las dos molculas reactantes.
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MECANISMO DE LA ACCIN ENZIMTICA.

En una reaccin ordinaria, un compuesto con un determinado nivel energtico


(ESTADO INICIAL) debe alcanzar un nivel energtico ms alto (ESTADO DE
TRANSICIN), para ser transformado en un producto, con un nivel energtico final
inferior al inicial (ESTADO FINAL).

La ENERGA DE ACTIVACION es la energa que tiene que aportar el entorno para


que se alcance el ESTADO DE TRANSICIN o sea cuando los reactantes se
encuentran en la cresta de la onda de energa y listos para convertirse en productos.
La energa de activacin de las reacciones ordinarias se obtiene por incremento de
temperatura o cambios del pH entre otros factores. Esta energa de activacin
constituye una BARRERA ENERGTICA. Si una roca est en lo alto de un montculo,
es evidente que puede caer. Pero no cae hasta que algo o alguien la empuja. Si
adems tiene un obstculo en la cima del montculo, que le impide llegar al borde de
la cada, ese algo o alguien debe proporcionar primero la energa necesaria para
superar el obstculo.

Que hace entonces una ENZIMA?

DISMINUYE la ENERGA DE ACTIVACION Esto se debe a que las enzimas


aumentan enormemente la posibilidad de choques efectivos entre las molculas que
van a reaccionar. Esta explicacin parte naturalmente de la base de que, para que
haya una reaccin, las molculas reaccionantes deben ponerse previamente en
contacto. Todo lo que facilite este contacto, sobre todo si favorece el acercamiento de
los grupos qumicos reaccionantes de cada molcula (para que se formen o rompan
enlaces qumicos), resultar en una disminucin de la energa de activacin.

Cualquier reaccin enzimtica se lleva a cabo a travs de cinco etapas:

1.- Reconocimiento de la enzima (E) por el sustrato (S).


2.- Formacin del complejo enzima-sustrato (E-S).
3.- Transformacin de este complejo en un complejo intermedio de transicin (E-
I), en el que se favorece la accin cataltica de la enzima.
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4.- Formacin del complejo enzima-producto (E-P)


5.- Disociacin de este complejo en enzima y producto.
La energa del complejo intermedio de transicin (E-I) es superior a la de los complejo
E-S y E-P.

Qu es lo que la enzima NO hace?:

1.- Las enzimas NO modifican la K eq.


2.- Las enzimas NO modifican el G (energa libre).
3.- Las enzimas no hacen posible reacciones termodinmicamente imposibles
(endergnicas).Es decir, las enzimas no actan fuera de la ley (1. Ley de la
termodinmica)

MECANISMOS DE CATLISIS ENZIMTICA.


1.- ORIENTACIN DEL SUSTRATO.
Una vez que la enzima forma un complejo con el sustrato (E-S), las molculas de
sustrato pueden aproximarse mucho justo con la orientacin apropiada para facilitar la
reaccin
2.- MODIFICACIONES DE LA REACTIVIDAD DEL SUSTRATO.
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Las enzimas poseen numerosos aminocidos con cadenas laterales cidas o bsicas
capaces de donar o aceptar protones del sustrato, y por lo tanto, alterar la carga del
sustrato hacindolo mas reactivo.
3.- ADAPTACIN INDUCIDA DEL SUSTRATO
Una vez que la enzima se une al sustrato ocurren cambios en la conformacin para
mejorar la adaptacin complementaria entre la enzima y el sustrato, y los grupos
reactivos apropiados de la enzima se desplazan hacia el lugar donde puede ocurrir la
reaccin .Es decir, la enzima puede cambiar la forma y ejercer tensin sobre los
sustratos para mejorar la reactividad.
COENZIMAS.

Las COENZIMAS son componentes NO PROTECOS de las enzimas, de naturaleza


orgnica (habitualmente de bajo peso molecular), necesarias en muchas enzimas
para catalizar la transformacin del sustrato

Las COENZIMAS funcionan junto con la enzima de TRES maneras:


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a.- La coenzima acta como cosustrato, ya que los cambios qumicos que ocurren
en ella son exactamente los opuestos a los que tienen lugar en el sustrato. As, por
ejemplo, en reacciones de oxido-reduccin, mientras el sustrato es oxidado, la
coenzima es reducida, o viceversa.
Este es el caso de la oxidacin del lactato por la LACTATO DESHIDROGENASA en
la que el NAD+ (coenzima) acta como cosustrato de la reaccin

La coenzima acta como aceptor o donador de hidrogeniones.

b.- La coenzima se encuentra unida covalentemente en su sitio activo o en un lugar


prximo a l, y participa activamente en el proceso cataltico.

c.- La coenzima desempea un papel intermedio entre estos dos extremos.

d.- La coenzima participa como transportador intermediario en un sistema,


facilitando la transferencia del grupo correspondiente a un aceptor final.
Un ejemplo de este tipo de acciones es el catalizado por las transaminasas, en que el
fosfato de piridoxal (coenzima) participa en la transferencia del grupo amino de un
aminocido a un -cetocido.
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NOMENCLATURA.

El nombre recomendado de una enzima incluye:

El nombre del sustrato sobre el que acta la enzima.

El tipo de reaccin catalizada.

GLUCOSA + O2 GLUCONATO + H2O2.


Glucosa oxidasa.

El nombre acaba en A S A.

La velocidad con la que trabaja una enzima se mide en Unidades internacionales


U.I. (es la cantidad de enzima que convierte un micromol de sustrato por minuto).
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CLASIFICACIN DE LAS ENZIMAS.


OXIDORREDUCTASAS.- Catalizan reacciones de oxidorreduccin entre dos
sustratos, el sustrato que se oxida es el donador de hidrogeniones (electrones) .El
nombre recomendado por IUB. es el de DESHIDROGENASAS, pero algunas reciben
el nombre de reductasas, oxidasas, peroxidasas.

S reducido + Soxidado S oxidado + Sreducido.

TRANSFERASAS.- catalizan la transferencia de un grupo (G) diferente del hidrgeno


de un sustrato a otro. Transfieren grupos de un carbono, residuos de aldehido o
cetonas, grupos acilo, grupos alquilo, grupos que contienen azufre o fsforo. Muchas
de ellas requieren de la existencia de coenzimas.

HIDROLASAS.- catalizan la hidrlisis, al introducir una molcula de agua en el sitio de


ruptura de un enlace del sustrato. Actan sobre enlaces peptdicos (C-N), enlaces
steres (C-O), enlaces C-C, enlaces glucosdicos.

LIASAS.- catalizan la ruptura de enlaces covalentes del sustrato (C-C, C-N, C-O), sin
introducir molculas de agua, dando lugar a la formacin de dobles enlaces.

ISOMERASAS.- catalizan reacciones de isomerizacin (cambios geomtricos, pticos


o estructurales) de una molcula. Forman ismeros de posicin.

LIGASAS O SINTETASAS.- catalizan la formacin de enlaces covalentes entre dos


molculas, acoplada a la hidrlisis de un enlace de fosfato perteneciente a una
molcula de ATP. Es decir, se requiere el ingreso de energa qumica de enlaces ricos
en energa del ATP. A las ligasas se les da el nombre de SINTETASAS.
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CINTICA ENZIMTICA.

El rea de la qumica que estudia la velocidad con que una reaccin qumica ocurre se
llama CINTICA QUMICA.

La CINTICA ENZIMTICA es el estudio de la velocidad de las reacciones


catalizadas por ENZIMAS.

La VELOCIDAD DE LA REACCIN es el cambio en la concentracin de REACTIVOS


O PRODUCTOS con respecto al TIEMPO.

Reactivos(A) Productos(B)

Vel.= [A]final [A]inicial / t final - t inicial = [A] / t o [B] / t.

El trmino K o constante de velocidad es una constante de proporcionalidad entre


la velocidad de la reaccin y la concentracin de reactivos.

Velocidad
K = -------------
[A]
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K no es afectada por la concentracin del reactivo [A].Esto quiere decir que la


velocidad es mayor a mayor concentracin de reactivo, y es mas pequea a
concentraciones mas bajas del reactivo, pero el cociente de Velocidad / [A]
permanece igual .El valor de cualquier constante de velocidad depende de la
temperatura.

En cualquier reaccin qumica, al aumentar la concentracin de los reactantes


aumenta la velocidad de la reaccin.

En una REACCION CATALIZADA POR ENZIMAS la velocidad de la reaccin se


incrementa proporcionalmente a la concentracin del sustrato(S) , pero solo al
principio ; ya que al seguir aumentando el sustrato , la velocidad de la reaccin no se
eleva ya proporcionalmente , y llega el momento en el que aunque se contine
aumentado el sustrato [S] no se modificar la velocidad de la reaccin (Reaccin . de
orden 0).Este momento es en el que se alcanza la Mxima velocidad de la reaccin
(V max) y se produce cuando toda la enzima(E) que interviene en la reaccin est
saturada por sustrato (S) ; es decir, cuando la cantidad de sustrato supera a la enzima
y todos sus sitios catalticos estn ocupados por molculas de sustrato. Por ello la
velocidad de la reaccin depende de la concentracin del compuesto enzima-
sustrato o ES Una grfica de velocidad como funcin de la concentracin del sustrato
da una hiprbola rectangular.

En la Zona A , la velocidad de la reaccin depende de la concentracin del sustrato (S)


(aumenta o disminuye en funcin del incremento o decremento de la concentracin
del sustrato).Por ello la concentracin del complejo ES y la vel. de la reaccin
dependen de la concentracin de sustrato .
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En la Zona B, cuando la concentracin del sustrato es alta y se ha alcanzado la V max.


Toda la enzima se encuentra unida al sustrato y por ello aunque continuemos
aumentado el sustrato ya no cambia la velocidad de la reaccin, ya que toda la
enzima est saturada por sustrato.
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CONSTANTE DE MICHAELIS-MENTEN.

La CONSTANTE DE MICHAELIS-MENTEN o Km es la concentracin de sustrato


con la cual se alcanza la mitad de la V max de la reaccin. O la concentracin de
sustrato con la que satura en un 50% la enzima

La Km indica las relaciones de afinidad entre el sustrato y la enzima.

Una Km elevada indica que existe una baja afinidad del sustrato por la enzima ya
que se requiere una alta concentracin de sustrato para que al combinarse se alcance
la mitad de la Vmax. de la reaccin.

Una Km baja indica que existe una alta afinidad del sustrato por la enzima ya que la
concentracin requerida para alcanzar la mitad de la vel. mxima de la reaccin es
muy baja.
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CONCENTRACIN DE LA ENZIMA SOBRE LA VELOCIDAD DE LA REACCIN.


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CONCENTRACIN DEL SUSTRATO SOBRE LA VELOCIDAD DE LA REACCIN.


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SATURACIN PROGRESIVA DE LOS SITIOS ACTIVOS DE UNA ENZIMA AL


AUMENTAR LA CONCENTRACIN DE SUSTRATO.
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INHIBICIN ENZIMTICA.

INHIBIDORES son sustancias que disminuyen la actividad cataltica de una reaccin


enzimtica, actuando sobre la enzima, el complejo enzima-sustrato o ambos.

CLASIFICACIN.

INHIBIDORES IRREVERSIBLES.

Inhibidores Competitivos.
INHIBIDORES REVERSIBLES Inhibidores NO competitivos.
Inhibidores Acompetitivos.

INHIBIDORES IRREVERSIBLES: cuando una enzima se une a un inhibidor y forma


una u ion COVALENTE, por lo que no puede romperse. El complejo enzima/inhibidor
queda inactivo permanentemente .La enzima ha sido envenenada.
Por ejemplo los compuestos rgano fosforados (insecticidas o armas qumicas)
inhiben en forma irreversible la acetilcolinesterasa ocasionando una intoxicacin del
individuo.

INHIBIDORES REVERSIBLES: La enzima y el inhibidor se disocian fcilmente, sin


modificar en forma permanente la actividad de la enzima.
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A.- INHIBICIN COMPETITIVA.

Los inhibidores ( I ) competitivos tienen una estructura semejante al sustrato , por lo


que compiten con l, por el sitio activo de la enzima.

La velocidad de la reaccin ser menor mientras mayor sea la concentracin del


inhibidor. Pero si aumentamos la concentracin del sustrato (S) se invierte el efecto
del inhibidor. Por lo que a concentraciones elevadas del sustrato se alcanza la Vmax
observada en ausencia del inhibidor.

Los inhibidores competitivos aumentan la Km, pero no modifican la (Vmax)


velocidad de la reaccin. Esto quiere decir que en presencia de un inhibidor
competitivo, se requiere mas sustrato para alcanzar Vmax.
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B.- INHIBICIN NO COMPETITIVA.

Los inhibidores ( I ) NO competitivos se unen a sitios especficos de la enzima


distintos al sitio activo. Por ello, su efecto no puede revertirse aumentando la cantidad
de sustrato ( S ) .
Estos inhibidores presentan afinidad tanto por la enzima libre como por el complejo E-
S.
Los inhibidores No competitivos ANULAN la actividad cataltica de la enzima,
disminuyendo la Vmax, sin modificar su capacidad para unirse al sustrato, por la
Km no se modifica. Por ello, el sistema se comporta como si la enzima hubiera
disminuido (ya que la E-I no tiene actividad cataltica).
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Inhibicin enzimtica
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C.- INHIBICIN ACOMPETITIVA.

El inhibidor ( I ) se une al completo E-S formando un complejo ESI , que es


cataliticamente inactivo , por lo que disminuye la (Vmax) velocidad de la reaccin .En
cambio la afinidad de la enzima ( E ) por su sustrato ( S ) parece aumentar, y por ello
la Km es menor

El inhibidor carece de afinidad por la enzima libre ( E ).


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D.- INHIBICIN ALOSTRICA

Las enzimas alostricas se encuentran reguladas por molculas que se denominan


EFECTORES o MODIFICADORES que se fijas en forma no covalente a sitios
distintos que el activo. Los efectores que inhiben la actividad enzimtica se denominan
EFECTORES NEGATIVOS. Los que la incrementan se llaman EFECTORES
POSITIVOS.
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PROENZIMAS O ZIMGENOS.

Son precursores INACTIVOS de las enzimas.

Tienen una masa molecular mayor a la de la enzima activa.

Estas proenzimas sufren lisis por proteasas especficas que separan varios
fragmentos de la cadena polipeptdica dando lugar a la ENZIMA ACTIVA.

Estas PROENZIMAS son muy importantes en la coagulacin sangunea, fibrinolisis,


digestin de las protenas de la dieta, etc.

Por ejemplo:
El TRIPSINGENO (proenzima) se transforma en TRIPSINA (activa).
El FIBRINGENO en FIBRINA.
El PLASMINGENO es PLASMINA.
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ISOENZIMAS.

DEFINICIN.- es una misma especie de enzimas, que realiza la misma accin


cataltica, pero que presentan diferentes formas moleculares.

Ejemplo:
DHL 1: isoenzima del corazn.
DHL 2.
DHL 3: isoenzima del pulmn.
DHL 4:
DHL 5: isoenzima del msculo e hgado.

CPK MM (CK3): isoenzima del msculo esqueltico.


CPK MB (CK2): isoenzima del corazn.
CPK BB (CK1): isoenzima del cerebro.
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MECANISMO DE REGULACION DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA.

La forma ms simple de regulacin de un proceso enzimtico es el CONTROL POR


RETROALIMENTACIN O MECANISMO DE FEED BACK.
La inhibicin por Feed-back consiste en que la enzima es inhibida por uno de los
metabolitos producidos durante el funcionamiento de una va metablica.
El producto que inhibe a la enzima se liga al sitio alostrico, que normalmente est
alejado del sitio activo o cataltico.
Feed-back LINEAL.

Feed-back SECUENCIAL.

Feed-back CONCERTADO.