La bioinformtica, segn una de sus definiciones ms sencillas, es la aplicacin de tecnologas
computacionales a la gestin y anlisis de datos biolgicos.1 Los trminos bioinformtica,
biologa computacional y, en ocasiones, biocomputacin, son utilizados en muchas situaciones como sinnimos,2 3 y hacen referencia a campos de estudios interdisciplinares muy vinculados que requieren el uso o el desarrollo de diferentes tcnicas estudiadas universitariamente en la Ingeniera Informtica como ciencia aplicada de la disciplina informtica.4 Entre estas pueden destacarse las siguientes: matemtica aplicada,5 estadstica,6 ciencias de la computacin,7 inteligencia artificial,8 qumica9 y bioqumica10 con las que el Ingeniero Informtico soluciona problemas al analizar datos, o simular sistemas o mecanismos, todos ellos de ndole biolgica, y usualmente (pero no de forma exclusiva) en el nivel molecular.11 El ncleo principal de estas tcnicas se encuentra en la utilizacin de recursos computacionales para solucionar o investigar problemas sobre escalas de tal magnitud que sobrepasan el discernimiento humano. La investigacin en biologa computacional se solapa a menudo con la biologa de sistemas.12 Los principales esfuerzos de investigacin en estos campos incluyen el alineamiento de secuencias, la prediccin de genes, montaje del genoma, alineamiento estructural de protenas, prediccin de estructura de protenas, prediccin de la expresin gnica, interacciones protena-protena, y modelado de la evolucin.13 Una constante en proyectos de bioinformtica y biologa computacional es el uso de herramientas matemticas para extraer informacin til de datos producidos por tcnicas biolgicas de alta productividad, como la secuenciacin del genoma. En particular, el montaje o ensamblado de secuencias genmicas de alta calidad desde fragmentos obtenidos tras la secuenciacin del ADN a gran escala es un rea de alto inters.13 14 Otros objetivos incluyen el estudio de la regulacin gentica para interpretar perfiles de expresin gnica utilizando datos de chips de ADN o espectrometra de masas.15