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Árboles filogenéticos

http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/article/0_0_0/evo_05_sp

¿Cómo los cambios en las secuencias genéticas nos permiten reconstruir las relaciones evolutivas entre especies emparentadas?

¿Por qué?

El dicho "No juzgues un libro por su cubierta" podría aplicarse al tema de la evolución. Por ejemplo, los seres humanos comparten el 75% de su ADN con pollos. Los biólogos señalan esto como evidencia de que los humanos y los pollos alguna vez compartieron un antepasado común. El advenimiento de la tecnología del ADN ha dado a los científicos las herramientas mediante las cuales puede examinar la estrecha relación entre ciertas especies. El análisis de ADN permite a los científicos construir árboles filogenéticos cuyas ramas enlazan la relación de diferentes organismos.

Modelo 1 – Árboles filogenéticos

Millones de años

40 35 30 25 20 15 10 5 0 Mapache Panda Ancestro común de todos
40
35
30
25
20
15
10
5
0
Mapache
Panda
Ancestro común de
todos los
pandas, osos y
Mapaches
Panda gigante
Oso de anteojo
Oso perezoso
*
Oso del sol
Oso negro
Oso Polar
Oso pardo

1. Consulta el modelo 1.

a. ¿Hace cuánto tiempo existió el antepasado común de todos los organismos ilustrados en este árbol filogenético?

b. ¿Cuáles dos líneas divergieron hace aproximadamente 30 millones de años?

c.

Enumera a todos los descendientes modernos de la especie que estaba viva en el punto indicado por el asterisco.

2.

Según el Modelo 1, ¿cuándo divergió la línea del Panda Gigante de la línea que condujo a

los osos modernos?

3. De acuerdo con el modelo 1, ¿qué animal comparte el antepasado común más reciente con el oso pardo?

4. En una oración completa, describe lo que representan los puntos y líneas en un árbol filogenético.

5. ¿Cuál de las dos ramas del ancestro común en el Modelo 1 incluye a más especies descendientes que están vivas en la actualidad?

6. Según el árbol filogenético en el Modelo 1, ¿con cuál animal está más estrechamente relacionado el Panda Rojo?

animal está más estrechamente relacionado el Panda Rojo ? 7. ¿Cuáles organismos están más estrechamente

7. ¿Cuáles organismos están más estrechamente relacionados, el Panda Gigante con el Panda Rojo o el Panda Gigante con el Oso Polar? Justifica tu respuesta usando oraciones gramaticalmente correctas

Modelo 2 – Comparación de muestras de DNA

Modelo 2 – Comparación de muestras de DNA 8. ¿Cuántas bases nitrogenadas se encuentran en cada

8. ¿Cuántas bases nitrogenadas se encuentran en cada una de las muestras de DNA 1 - 4, así como en el DNA del organismo A del Modelo 2?

9. Usando tus conocimientos de apareamiento de bases, ¿cuál muestra de DNA del Modelo 2 es 100% complementaria al organismo A??

10. ¿Cuál otra muestra de DNA del Modelo 2 es probable que se aparee con una de las hebras del organismo A?

11. ¿Cuántas bases, del número total de pares de bases nitrogenadas de la muestra que elegiste en la pregunta 10, no son complementarias entre las hebras?

12. De tu respuesta a la pregunta 11, convierte

bases no

complementarias en un porcentaje del total de bases nitrogenadas. A esto se le

denomina grado de divergencia de la secuencias de nucleótidos entre especies.

el número de

pares de

13. Calcula el grado de divergencia de las secuencias para las dos muestras restantes. Comprueba tus cálculos dentro de tu grupo.

14. Usa los cálculos de las preguntas anteriores para completar la tabla siguiente

Más Homólogos

Más Homólogos

Menos Homólogos

Muestra

Grado de divergencia

3

0%

15. Basado en tus conocimientos previos del DNA, ¿cuál muestra del Modelo 2 se obtuvo de un organismo que está más estrechamente relacionado con el organismo A?

que está más estrechamente relacionado con el organismo A? 16. Con tu grupo, describe cómo el

16. Con tu grupo, describe cómo el grado de divergencia de la secuencia del DNA puede aportar información a los científicos sobre el parentesco entre las especies.

17. Completa el árbol filogenético con las muestras 1 a la 4 para resumir el grado de parentesco que hay entre los organismos de los cuales se obtuvo las muestras de DNA.

los organismos de los cuales se obtuvo las muestras de DNA. 4 Ancestro Común Prof. GAToledo,

4

Ancestro Común
Ancestro
Común

Prof. GAToledo, Depto. de Cs., SFC, 2016

Modelo 3 – Comparación del gen Citocromo c

http://wps.prenhall.com/wps/media/objects/1552/1590010/web_tut/22_01/22_01_01a.swf

18. La enzima citocromo c es una proteína utilizada en

18. La enzima citocromo c es una proteína utilizada en la respiración celular de muchas especies. Consulta el modelo 3 para responder las siguientes preguntas sobre la

citocromo c.

a.

¿Cuántas especies diferentes están representadas en las secuencias de amino ácidos de la citocromo c?

b. ¿Qué representan las letras individuales?

c. ¿Qué representan los Asteriscos?

19. Encierra en un círculo al par de organismos del Modelo 3 que, de acuerdo con tu predicción, tienen la mayor divergencia en su DNA. Apoya tu elección con una discusión

grupal basado en la morfología (características observables y estructura corporal), ecología y modo de vida de los animales.

a. Ballena y humano

o

Ballena y atún

b. Cerdo y mono Rhesus

o

Cerdo y pollo

c. Atún y mosca

o

Atún y pollo

¡Lee esto!

La citocromo c es una proteína que es compartida por muchos organismos debido a su papel vital en la respiración celular. A través del tiempo (miles de millones de años) se han producido mutaciones en el gen que codifica para la citocromo c que no han afectado a la función de la proteína citocromo c, es decir, la secuencia de DNA que codifica para el sitio activo se ha mantenido conservada*. A estas mutaciones se llaman mutaciones neutrales. Al observar estas mutaciones, los científicos pueden predecir cuándo los organismos divergieron de un antepasado común y unos de otros.

*Secuencias conservadas son secuencias biológicas similares o idénticas que pueden encontrarse en ácidos nucleicos, proteínas o polisacáridos, dentro de múltiples especies de organismos.

20. Consulta el modelo 3. Registra el número de diferencias entre la secuencia de aminoácidos del citocromo c en un humano y cada uno de los siguientes organismos.

a.

b.

Atún

Ballena

c. Mono Rhesus

d. Pollo

e.

f.

Cerdo

Levadura

g. Mosca

21. Basado en las diferencias en las secuencias de amino ácidos, ¿a cuál los humanos están…

a. ….más estrechamente relacionados?

b. …más distantemente relacionados?

organismo de la lista

22. Introduce los nombres de los siete organismos del Modelo 3 en el árbol filogenético
22. Introduce los nombres de los siete organismos del Modelo 3 en el árbol filogenético de
abajo, para ilustrar una relación filogenética entre estos organismos y los seres humanos,
como lo sugieren los datos del citocromo c.
23. Compara tus predicciones que hiciste sobre el parentesco basado en la morfología,
ecología y modo de vida de (pregunta 19) con la información de parentesco que entrega
el árbol filogenético desarrollado de datos del DNA (Pregunta 22).

24. Haz un círculo a todos los mamíferos en el árbol filogenético en la pregunta 22. ¿Cómo queda ilustrado en el árbol filogenético el hecho de que esos animales sean todos miembros de la misma clase, es decir, clase mamíferos?

25. Compara las diferencias en las secuencias de amino ácidos entre los mamíferos con las diferencias en otras clases de animales. ¿Hay un patrón?

26. ¿Deberían los científicos inferir relaciones evolutivas basadas en datos obtenidos de una sola proteína? Justifica tu respuesta mediante frases completas.

Preguntas de extensión ¡Lee esto!

Los científicos han descubierto que las mutaciones neutrales, como las encontradas en el citocromo c, se producen a un ritmo bastante constante a lo largo de la historia evolutiva. Por esta razón, las mutaciones neutrales se utilizan para medir el tiempo que ha pasado desde que dos especies han divergido a través de la evolución. La tasa de mutación debe ser calibrada con muestras donde el tiempo real de la divergencia de especies es conocido a partir de registros fósiles. En otras palabras, los científicos han desarrollado un reloj molecular que se puede utilizar para estimar el tiempo de divergencia entre los organismos. Revisa este link http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/article/0_0_0/molecclocks_01_sp

27. Plotea el porcentaje de divergencia de las secuencias en el eje y la edad conocida del ancestro común en el eje x de las siguientes pares de especies.

Par de Especies

Porcentaje de divergencia de las secuencias

Edad conocida del ancestro común (millones de años)

Humano-Chimpancé

9.8

5.5

Humano-Gorila

12

7.0

Chimpancé-Gorila

12.8

7.0

Humano-Orangután

16.65

11.0

la 12.8 7.0 Humano-Orangután 16.65 11.0 28. Dibuja la línea de tendencia para los puntos que

28. Dibuja la línea de tendencia para los puntos que has trazado. Utilizando la línea de tendencia, calcula la pendiente de la línea que describe la relación entre la divergencia de la secuencia y la edad conocida. Da un valor como % de divergencia / millones de años. Este es el valor de calibración para este reloj molecular.

29. En el mismo gen, la divergencia de la secuencia entre chimpancés y bonobos es del 4,2%. Usando el reloj molecular calibrado estima el tiempo en que divergieron estas especies.

30. La divergencia de secuencia entre los humanos y los neandertales en el mismo gen es del 1,2%. Usando el reloj molecular calibrado, estima el tiempo en que divergieron estas especies.

Para saber más http://www.indiana.edu/~ensiweb/lessons/whalemols.swf

http://ppongam-irsc.weebly.com/uploads/1/9/9/0/19902363/10_01_a01.swf

https://www2.edc.org/weblabs/ExploringEvolution/evolution.swf