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Molculas orgnicas naturales: son las sintetizadas por los seres vivos, y se
llaman biomolculas, las cuales son estudiadas por la bioqumica y las derivadas del
petrleo como los hidrocarburos.
ndice
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1Historia
2Clasificacin de compuestos orgnicos
o 2.2Natural
2.2.1In-vivo
2.2.1.1Carbohidratos
2.2.1.2Lpidos
2.2.1.3Protenas
2.2.1.4cidos nucleicos
2.2.1.5Molculas pequeas
2.2.2Ex-vivo
2.2.2.1Procesos geolgicos
2.2.2.2Procesos atmosfricos
o 2.3Sinttico
o 3.1Hidrocarburos
o 4.1Oxigenados
o 4.2Nitrogenados
o 4.3Cclicos
o 4.4Aromticos
5Ismeros
6Fuentes
7Variedad
8Vase tambin
9Referencias
Historia[editar]
La etimologa de la palabra orgnico significa que procede de rganos, relacionado con
la vida; en oposicin a inorgnico, que sera el calificativo asignado a todo lo que carece de
vida. Se les dio el nombre de orgnicos en el siglo XIX, por la creencia de que slo podran
ser sintetizados por organismos vivos. La teora de que los compuestos orgnicos eran
fundamentalmente diferentes de los "inorgnicos", fue refutada con la sntesis de la urea, un
compuesto "orgnico" por definicin ya que se encuentra en la orina de organismos vivos,
sntesis realizada a partir de cianato de potasio y sulfato de amonio por Friedrich
Whler (sntesis de Whler). Los compuestos del carbono que todava se consideran
inorgnicos son los que ya lo eran antes del tiempo de Whler; es decir, los que se
encontraron a partir de fuentes sin vida, "inorgnicas", tales como minerales. 1
Compuestos alifticos
Compuestos aromticos
Compuestos heterocclicos
Compuestos organometlicos
Polmeros
Clasificacin segn su origen[editar]
La clasificacin por el origen suele englobarse en dos tipos: natural o sinttico. Aunque en
muchos casos el origen natural se asocia a el presente en los seres vivos no siempre ha de
ser as, ya que la sntesis de molculas orgnicas cuya qumica y estructura se basa en el
carbono, tambin se sintetizan ex-vivo, es decir en ambientes inertes, como por ejemplo el
cido frmico en el cometa Halle Bop.
Natural[editar]
In-vivo[editar]
Los compuestos orgnicos presentes en los seres vivos o "biosintetizados" constituyen una
gran familia de compuestos orgnicos. Su estudio tiene inters en bioqumica, medicina,
farmacia, perfumera, cocina y muchos otros campos ms.
Carbohidratos[editar]
Los carbohidratos estn compuestos fundamentalmente de carbono (C), oxgeno (O) e
hidrgeno (H). Son a menudo llamados "azcares" pero esta nomenclatura no es del todo
correcta. Tienen una gran presencia en el reino vegetal (fructosa, celulosa, almidn, alginatos),
pero tambin en el animal (glucgeno, glucosa). Se suelen clasificar segn su grado
de polimerizacin en:
Sello alemn conmemorativo de 1964 con la descripcin de la estructura del benceno por Friedrich
August Kekul en 1865.
El petrleo es una sustancia clasificada como mineral en la cual se presentan una gran
cantidad de compuestos orgnicos. Muchos de ellos, como el benceno, son empleados por el
hombre tal cual, pero muchos otros son tratados o derivados para conseguir una gran
cantidad de compuestos orgnicos, como por ejemplo los monmeros para la sntesis
de materiales polimricos o plsticos.
Procesos atmosfricos[editar]
Procesos de sntesis planetaria[editar]
En el ao 2000 el cido frmico, un compuesto orgnico sencillo, tambin fue hallado en la
cola del cometa Hale-Bopp.2 ,3 Puesto que la sntesis orgnica de estas molculas es inviable
bajo las condiciones espaciales este hallazgo parece sugerir que a la formacin del sistema
solar debi anteceder un periodo de calentamiento durante su colapso final. 3
Sinttico[editar]
Desde la sntesis de Whler de la urea un altsimo nmero de compuestos orgnicos han sido
sintetizados qumicamente para beneficio humano. Estos incluyen frmacos, desodorantes,
perfumes, detergentes, jabones, fibras textiles sintticas, materiales plsticos, polmeros en
general, o colorantes orgnicos.
Vase tambin: Sntesis orgnica
Introduccin a la nomenclatura en qumica orgnica [editar]
Artculo principal: Nomenclatura qumica de los compuestos orgnicos
Hidrocarburos[editar]
El compuesto ms simple es el metano, un tomo de carbono con cuatro de hidrgeno
(valencia = 1), pero tambin puede darse la unin carbono-carbono, formando cadenas de
distintos tipos, ya que pueden darse enlaces simples, dobles o triples. Cuando el resto de los
enlaces de estas cadenas son con hidrgeno, se habla de hidrocarburos, que pueden ser:
Los radicales o grupos alquilo son fragmentos de cadenas de carbonos que cuelgan de
la cadena principal. Su nomenclatura se hace con la raz correspondiente (en el caso de un
carbono met-, dos carbonos et-, tres carbonos prop-, cuatro carbonos but-, cinco carbonos
pent-, seis carbonos hex-, y as sucesivamente...) y el sufijo -il. Adems, se indica con un
nmero, colocado delante, la posicin que ocupan. El compuesto ms simple que se puede
hacer con radicales es el metilpropano. En caso de que haya ms de un radical, se nombrarn
por orden alfabtico de las races. Por ejemplo, el 5-metil, 2-etil, 8-butil, 10-docoseno.
Alquino
Hidroxilo
ter
Aldehdo
Cetona
Carboxilo
ster
Amina
Amida
Azo
Nitro
Sulfxido
Monmero de la celulosa.
Oxigenados[editar]
Son cadenas de carbonos con uno o varios tomos de oxgeno y pueden ser:
2-Butanona o metil-etil-cetona
Aminas: Las aminas son compuestos orgnicos caracterizados por la presencia del
grupo amina (-N<). Las aminas pueden ser primarias (R-NH2), secundarias (R-NH-R") o
terciarias (R-NR-R"). Las aminas suelen dar compuestos ligeramente amarillentos y con
olores que recuerdan a pescado u orina.
Amidas: Las amidas son compuestos orgnicos caracterizados por la presencia del
grupo amida (-NH-CO-) en su estructura.
Las protenas o polipptidos son poliamidas naturales formadas por enlaces peptdicos
entre distintos aminocidos.
Isocianatos: Los isocianatos tienen el grupo isocianato (-N=C=O). Este grupo es muy
electrfilo, reaccionando fcilmente con el agua para descomponerse mediante
la transposicin de Hofmann dar una amina y anhdrico carbnico, con los hidroxilos para
dar uretanos, y con las aminas primarias o secundarias para dar ureas.
Cclicos[editar]
Son compuestos que contienen un ciclo saturado. Un ejemplo de estos son los norbornanos,
que en realidad son compuestos bicclicos, los terpenos, u hormonas como
el estrgeno, progesterona, testosterona u otras biomolculas como el colesterol.
Aromticos[editar]
Ya que el carbono puede enlazarse de diferentes maneras, una cadena puede tener diferentes
configuraciones de enlace dando lugar a los llamados ismeros, molculas tienen la misma
frmula qumica pero distintas estructuras y propiedades.
Existen distintos tipos de isomera: isomera de cadena, isomera de funcin, tautomera,
estereoisomera, y estereoisomera configuracional.
El ejemplo mostrado a la izquierda es un caso de isometra de cadena en la que el compuesto
con frmula C6H12 puede ser un ciclo (ciclohexano) o un alqueno lineal, el 1-hexeno. Un
ejemplo de isomera de funcin sera el caso del propanal y la acetona, ambos con frmula
C3H6O.
Fuentes[editar]
Los compuestos orgnicos pueden ser obtenidos por purificacin a partir de organismos o
del petrleo y por sntesis orgnica.
La mayora de los compuestos orgnicos puros se producen hoy de forma artificial, aunque un
subconjunto importante todava se extrae de fuentes naturales porque sera demasiado
costosa su sntesis en laboratorio. Estos ltimos son utilizados en reacciones de semi-sntesis.
Vase tambin: Reaccin orgnica
Variedad[editar]
El anlisis estadstico de estructuras qumicas se llama informtica qumica. La base de datos
de Beilstein contiene una amplia coleccin de compuestos orgnicos. Un estudio informtico
que implicaba 5,9 millones de sustancias y 6,5 millones de reacciones, demostr que el
universo de compuestos orgnicos consiste en una base de alrededor de 200.000 molculas
muy relacionadas entre s y de una periferia grande (3,6 millones de molculas) a su
alrededor.4 La base y la periferia estn rodeadas por un grupo de pequeas islas no-
conectadas que contienen 1,2 millones de molculas, un modelo semejante al www.
Ms estadsticas:
Las molculas de la base (solamente 3,5% del total) estn implicadas en el 35% de
todas las reacciones que dan lugar al 60% de todas las molculas.
La distancia media entre dos molculas en la base es de 8,4 pasos sintticos, y el 95%
de todas las reacciones conectan con menos de 15 pasos. Cualquier molcula de la
periferia puede ser alcanzada por una de la base en menos de 3 pasos.