Microbiología y Taxonomía Microbiana

Programa de la asignatura:
Microbiologa y taxonoma
microbiana
U1 Taxonoma microbiana
Ciencias de la Salud Biolgicas y Ambientales | Ingeniera en Biotecnologa

U1 Microbiologa y taxonoma microbiana
Taxonoma microbiana
ndice
Presentacin.............................................................................................................................. 2
Propsitos ................................................................................................................................. 3
Competencia especfica ........................................................................................................... 3
Ruta de aprendizaje .................................................................................................................. 4
1.1. Microbiologa ...................................................................................................................... 5
1.1.1. Campo de estudio de la microbiologa ............................................................................ 6
1.1.2. Taxonoma ...................................................................................................................... 7
1.1.3. Concepto de especie ..................................................................................................... 17
1.2. Nomenclatura de microorganismos ................................................................................. 18
1.2.1. Caracterizacin fentica ................................................................................................ 19
1.2.2. Pruebas bioqumicas y tinciones ................................................................................... 20
1.2.3. Caracterizacin genotpica ............................................................................................ 26
1.2.4. Filogenia microbiana ..................................................................................................... 28
1.2.5. rboles filogenticos ..................................................................................................... 29
1.3. Virus ................................................................................................................................. 31
1.3.1. Caractersticas y estructura de los virus ....................................................................... 34
1.3.2. Replicacin viral ............................................................................................................ 36
1.3.3. Cultivo de virus .............................................................................................................. 39
Actividades .............................................................................................................................. 42
Autorreflexiones....................................................................................................................... 42
Cierre de la unidad .................................................................................................................. 42
Para saber ms ....................................................................................................................... 44
Fuentes de consulta ................................................................................................................ 45
Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 1

Taxonoma microbiana
Presentacin
La microbiologa es una ciencia de estudio bsica para el biotecnlogo,

ya que los microorganismos son de gran importancia tanto benfica como
perjudicial en todas las reas de desarrollo humano. Es por ello que en
esta unidad nos adentraremos en el mundo de los microorganismos y
revisaremos algunas definiciones que son importantes para comprender
en esta rea del conocimiento.
En esta unidad estudiaremos a la microbiologa desde el punto de vista

taxonmico, por lo que aprenderemos cules son las herramientas que se emplean para
poder identificar y nombrar a los microorganismos. La taxonoma es una herramienta muy
importante en todas las ciencias biolgicas, pero nosotros nos centraremos en la taxonoma
microbiana, aprenderemos cuales son las herramientas que utiliza y en base a qu se han
realizado las diferentes clasificaciones a lo largo de la historia.
Tambin nos adentraremos en el mundo de la microbiologa estudiando a los virus, los

cuales son considerados microorganismos aunque todava no se ha llegado a un consenso
acerca de si son seres vivos o no, es por ello que no entran dentro de ninguna clasificacin
taxonmica. Vamos a estudiar las caractersticas de los virus, cmo es su replicacin y las
distintas tcnicas que se pueden emplear para cultivarlos y estudiarlos ya que stos tienen
gran importancia no solamente porque causan graves enfermedades en los humanos sino
porque tambin causan grandes daos en la agricultura y ganadera, adems de que
actualmente son uno de los principales vectores empleados para la modificacin gentica
de organismos.

Taxonoma microbiana
Propsitos
Esta unidad tiene el propsito de:
Definir a la microbiologa y su campo de estudio.

Aplicar las bases de la taxonoma en la nomenclatura de microorganismos.
Identificar la utilidad de los rboles filogenticos.
Describir las caractersticas y mecanismo de accin de los virus.
Competencia especfica
Identificar el rea de estudio y clasificacin de la microbiologa con el fin

de diferenciar el objeto de estudio de la taxonoma microbiana y la
virologa mediante la aplicacin de sus caractersticas diferenciales y el
estudio de los rboles filogenticos.

Taxonoma microbiana

Taxonoma microbiana
1.1. Microbiologa
Antes de sumergirnos en el contenido de la asignatura, revisa la infografa que se muestra
en la pgina anterior y que te permitir tener un panorama completo de los contenidos que
revisaremos en esta unidad, en caso de que tengas alguna pregunta o inquietud, consltalo
con tu docente en lnea.
La importancia de la Microbiologa deriva de la necesidad biolgica de estudiar los

organismos que no son visibles a simple vista, y que slo con ayuda de un microscopio se
pueden observar, pero que su presencia en diferentes ambientes naturales o en la industria
es indispensable, ya sea participando dentro de los ciclos de incorporacin de nitrgeno,
azufre y carbono, como aportando sus propiedades metablicas dentro de algn proceso.
Una de sus caractersticas importantes es que poseen la propiedad de adaptar su medio
encontrando rpidamente las condiciones ptimas para crecer y colonizar lugares y
ambientes tan variados e inimaginables que puedan existir, como la superficie de una
prtesis ya implantada en el cuerpo de un paciente, un geiser a altas temperaturas, aguas
con alto contenido en sales, las cavidades corporales de animales una herida, un reactor,
entre muchos otros.
Microbiologa
Etimolgicamente proviene de los vocablos griegos micro que significa

pequeo, bios que significa vida y logos que quiere decir estudio o tratado;
por lo que es la ciencia que estudia la diversidad y evolucin de los seres
vivos microscpicos.
Los primeros en visualizar la abundancia y diversidad de microorganismos a pesar de lo

rudimentario de sus instrumentos fueron Robert Hooke y Antonie van Leeuwenhoek,
observaron diferentes formas de vida microscpicas como levaduras, algunas bacterias
entre otros microorganismos presentes en el agua de lluvia encharcada, fluidos corporales,
superficies como suelos y rocas, entre otras.

Taxonoma microbiana
Figura 1. Pinturas de los pioneros de la microbiologa. A la izquierda Robert

Hooke (1635-1703) y a la derecha Antonie van Leeuwenhoek(1632-1723).
Tomado de http://www.vwmin.org/hooke-about-robert-hooke-hooke-laboratories.html y
http://www.history-of-the-microscope.org/anton-van-leeuwenhoek-microscope-history.php
El estudio de la microbiologa abarca una enorme heterogeneidad de tipos estructurales,

funcionales y taxonmicos: desde partculas no celulares como los virus y hasta organismos
celulares tan diferentes como las bacterias, los protozoos y parte de las algas y de los
hongos.
1.1.1. Campo de estudio de la microbiologa
Las caractersticas estructurales de los microorganismos, su fisiologa, bioqumica,

gentica, taxonoma, ecologa, entre otros aspectos, son del estudio de la microbiologa.
Tambin se ocupa del estudio de las diferentes actividades microbianas y su relacin con
el ser humano, ya que pueden acarrear consecuencias tanto benficas, como
perjudiciales; por esta razn se estudian los nichos ecolgicos de los correspondientes
agentes, sus modos de transmisin, los diversos aspectos de la microbiota patgena en
sus interacciones con el hospedador, los mecanismos de defensa de ste, as como los
mtodos desarrollados para combatirlos y controlarlos, no olvidndose de aquellas que
reportan beneficios por medio de los procesos microbianos para la obtencin de materias
primas o elaboradas, y de su modificacin y mejora racional con vistas a su imbricacin
en los flujos productivos de las sociedades.

Taxonoma microbiana
Microorganismos
Son seres de tamao microscpico dotados de individualidad, con una

organizacin biolgica sencilla, y que necesitan para su estudio una
metodologa propia y adecuada a sus pequeas dimensiones.
Finalmente, la Microbiologa se ocupa de todas las tcnicas y metodologas destinadas al

estudio experimental, manejo y control de los microorganismos.
En el siglo XX, se han desarrollado muchas subdisciplinas a partir de la microbiologa como

ciencia bsica, de las cuales se mencionan algunas a continuacin:
Taxonoma o sistemtica microbiana que permite la agrupacin y clasificacin de

los microorganismos.
Fisiologa microbiana que estudia los nutrientes que requieren los
microorganismos y los productos que originan.
Bioqumica microbiana que estudia los avances en el conocimiento de la
estructura fsica y qumica de las clulas y las enzimas microbianas, junto a las
reacciones que llevan a cabo.
Gentica microbiana que se ocupa del estudio de la herencia y la variacin en el
genoma de las bacterias
1.1.2. Taxonoma
Para poder comprender la gran diversidad de organismos existentes es preciso agruparlos
y organizarlos en una estructura jerrquica. De ello se encarga la taxonoma, la cual se
compone de tres partes independientes pero interrelacionadas:
Taxonoma
Etimolgicamente proviene del griego taxis, "ordenamiento", y nomos,

"norma" o "regla", se define como la ciencia encargada de la clasificacin y
denominacin de especies.

Taxonoma microbiana
Partes que integran la taxonoma
Clasificacin
Es el agrupamiento ordenado de unidades en grupos dentro de unidades
mayores.
Nomenclatura
Es la denominacin de las unidades definidas por la clasificacin.
Identificacin
Hace uso de los criterios establecidos por la clasificacin y nomenclatura
mencionados, los microorganismos se identifican comparando las
caractersticas de las unidades desconocidas y las conocidas.
Para llevar a cabo la clasificacin de las bacterias los taxnomos bacterianos se vieron
forzados a buscar adems de las caractersticas estructurales, diferentes tipos de
propiedades como las bioqumicas, fisiolgicas, ecolgicas. Dicha clasificacin se basa en
atributos funcionales, la mayor parte de las bacterias slo pueden identificarse por lo que
hacen y no simplemente por su apariencia. Esto representa un problema adicional para el
taxnomo bacteriano, el estudio de estas propiedades funcionales conlleva a la realizacin
de experimentos.
Sin embargo, est tomando auge una nueva alternativa biotecnolgica que podra resolver
pronto el problema, son las tcnicas moleculares para la caracterizacin genotpica
bacteriana, que proporcionan una posible base objetiva para la definicin de especie
bacteriana (Trtora, 2008).
En el siglo XVII Carlos Linneo desarrollo un sistema de clasificacin para nombrar a los
microorganismos como una forma de facilitar la comunicacin eficaz entre los
microbilogos, a Linneo se le conoce como el Padre de la Taxonoma (Solomon et al.,
2008).

Taxonoma microbiana
Figura 2. Dibujo de FCarl Von

Linneo. (1707-1778).
Tomado de:
http://es.wikipedia.org/wiki/Archivo:C
arl_von_Linn%C3%A9.jpg

Taxonoma microbiana
Tipos de clasificaciones
Fentica
Las agrupaciones se realizan en funcin de la semejanza en sus
caractersticas fenotpicas. Se toman en cuenta propiedades bioqumicas,
fisiolgicas, ecolgicas y estructurales de los microorganismos.
Genotpica
Compara las semejanzas genticas entre los organismos, ya sea de genes
individuales o de genomas completos y existen mltiples tcnicas por las
que pueden ser evaluados.
Filogentica
Los agrupamientos se basan en las relaciones evolutivas que actualmente
pueden determinarse por la similitud entre la secuencia del DNA, RNA y
protenas.
Numrica
El agrupamiento se realiza empleando mtodos numricos de unidades
taxonmicas basadas en la semejanza general determinada por
comparacin de numerosas caractersticas, recibiendo cada una de las
cuales el mismo valor. Despus de realizado el anlisis de caracteres se
calcula un coeficiente de variacin entre cada par de cepas del grupo, que
determina la concordancia de los caracteres que presentan ambas
bacterias.
Durante mucho tiempo, los taxnomos microbianos contaron exclusivamente con un

sistema fentico de clasificacin, pero actualmente la determinacin del gnero y la especie
de un procariota se basa en una taxonoma polifsica, donde se incluyen caractersticas,
fenotpicas, filogenticas y genotpicas, tomando en cuenta en primer lugar los
componentes individuales para posteriormente determinar cmo se evalan
cuantitativamente mediante la taxonoma numrica. Cada uno de estos criterios o tcnicas
permite la diferenciacin de los microorganismos en especies distintas, como se muestra
en la figura 3.
La identificacin de un microorganismo es importante en diferentes reas, como en la

medicina, donde se debe conocer cul es la especie microbiana que est causando cierta
patologa para poder dar un tratamiento efectivo; en el rea de alimentos e industria

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farmacutica debemos identificar cules son los posibles contaminantes presentes en los
productos para poder realizar acciones correctivas y preventivas.
Figura 3. Diferentes criterios empleados en la diferenciacin de bacterias,

arqueas y hongos. Se muestra el grado de diferenciacin que logran las
pruebas morfolgicas, fisiolgicas y bioqumicas y las moleculares.
Modificado de: Sharma et al., 2015.
La clasificacin de los microorganismos implica su disposicin en niveles taxonmicos

jerrquicos. Los microorganismos situados en cada rango o nivel comparten una serie
comn de rasgos especficos. Los rasgos se agrupan en una estructura jerrquica sin
superposiciones, de tal forma que cada nivel incluye no slo los rasgos que definen al rango
que se encuentra por encima, sino adems una nueva serie de rasgos ms restrictivos.
A lo largo de los aos han existido distintas clasificaciones de los seres vivos, en el sistema
de clasificacin actual basado en la relacin evolutiva de la secuencia 16S del rDNA se ha
reconocido una clasificacin con tres dominios mayores, de los cuales dos comprenden a
las bacterias y arqueas (procariotes) y el tercer dominio a eucariotes (Sarethy y Danquah,
2014) como se muestra en la figura 4:

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A) Archaea. Incluye las bacterias que pueden crecer en condiciones extremas

B) Bacteria. Comprende las cianobacterias, los micoplasmas y las llamadas bacterias
verdaderas.
C) Eucarya. Constituido por todos los animales, hongos y plantas.
Figura 4. rbol filogentico de la vida.
Tomado de: http://ocw.unican.es/ciencias-sociales-y-

juridicas/biogeografia/materiales/tema-1/1.2.3-evolucion-y-diversificacion-de-las-formas-
de

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Tabla 1. Caractersticas diferenciales de los dominios
Caracterstica Bacteria Archaea Eukarya
- Estructura celular procaritica S S No

- DNA circular S S No
- Histonas No S S
- Ncleo rodeado de membrana Ausente Ausente Presente
- Pared celular de peptidoglicano S No No

- Lpidos de membrana Enlaces ster Enlaces ter Enlaces
- Ribosomas 70S 70S ster
- Intrones No No 80S
S
- Plsmidos Si S Raro
- Sensibilidad de ribosomas a la toxina No S S
diftrica S No No
- Sensibilidad a cloranfenicol,
estreptomicina y kanamicina
- Metanognesis No S No
- Reduccin desasimilativa de S S No
sulfatos y frrico S No No
- Nitrificacin S S No
- Desnitrificacin
- Fijacin de nitrgeno S S No
- Fotosntesis oxignica S No S (en
- Quimiolitotrofa S S cloroplastos)
- Vesculas de gas S S No
- Sntesis de grnulos de reserva de S S No
carbono (-hidroxialcanoatos) S S No
- Crecimiento por encima de 80 No
Todos los procariotas pertenecen al domino Bacteria o Archaea. Dentro de cada dominio,
cada microorganismo est asignado (en orden descendente) a un phylum, clase, orden,
familia, gnero y especie. Algunos procariotas tambin tienen una denominacin de

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subespecie. Los grupos microbianos de cada nivel tienen un sufijo indicativo especfico de
ese rango o nivel.
La tabla 2 muestra un ejemplo de la descripcin completa taxonmica del microorganismo

fototrfico Allochromatium warmingii. (Madigan, et al. 2009).
Para poder realizar una identificacin microbiana es necesario analizar sus caracteres
morfolgicos, fisiolgicos, serolgicos y qumicos, que son los que nos van a dar pauta para
poder diferenciar entre una especie y otra, o bien identificarlos. El estudio de tales
propiedades conlleva a la realizacin de experimentos, pruebas y tcnicas para identificar
a las bacterias.

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Tabla 2. Jerarqua taxonmica para la bacteria

prpura del azufre Allochromatium warmingii
Mtodo de
Taxonoma Nombre Propiedades
confirmacin
Dominio Bacteria Clulas bacterianas; Microscopa;
secuencias de RNA anlisis de la
ribosmico tpicas de secuencia de
bacterias RNA
ribosmico
16S; presencia
de
biomarcadores
nicos, por
ejemplo el
peptidoglicano
Filum Proteobacteria Secuencias de RNA Anlisis de la
ribosmico tpicas de secuencia del
Proteobacterias RNA
ribosmico
16S
Clase Gammaproteobacteria Bacterias gram Tincin de
negativas; secuencias Gram,
de ARN ribosmico microscopia
tpicas de
Gammaproteobacteria
Orden Chromatiales Bacterias fottrofas Pigmentos
purpura caractersticos
Gnero Allochromatium Bacterias prpura del Microscopia
azufre con forma de
bastn
Especie warmingii Clulas de 3,5-4,0 m Medida de las
X 5-11 m; almacenan clulas en el
azufre principalmente microscopio
en los polos de la usando un
clula micrmetro;
determinando
la posicin de
los glbulos de
S0 dentro de la
clula
Taxonoma microbiana
Existen bases de datos microbianas en internet que se han vuelto herramientas

importantes ya que ayudan en la identificacin de especies microbianas, como las que se
mencionan a continuacin: NCBI (por sus siglas en ingls: National Center for
Biotechnology Information, www.ncbi.nlm.nih.gov), UNITE (http://unite.ut.ee/index.php),
CBS (por sus siglas en ingls: Central Bureau Schimmelcultures), ITIS (por sus siglas en
ingls: Integrated Taxonomic Information System, http://www.itis.gov/). Estas bases de
datos se enriquecen todos los das gracias a las secuencias identificadas en diferentes
regiones del mundo (Figura 5 y 6). Todas las clasificaciones taxonmicas de bacterias y
arqueas, as como las nuevas especies identificadas, deben ser aprobadas y publicadas
primero por la IJSEM (por sus siglas en ingls: International Journal of Systematic and
Evolutionary Microbiology).
Figura 5. Base de datos del NCBI. Se muestra la taxonoma descrita de Bacillus

subtilis.
Tomado de:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/index.cgi?chapter=resources

Taxonoma microbiana
Figura 6. Base de datos del ITIS. Se muestra la taxonoma descrita de Bacillus

subtilis.
Tomado de: http://www.itis.gov/.
1.1.3. Concepto de especie
El trmino especie en el aspecto microbiolgico es muy ambiguo, porque no existe un

concepto aceptado universalmente para los organismos procariotas.

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Especie y cepa
Especie
Es la unidad fundamental de la diversidad biolgica que tomando en cuenta
datos fenotpicos, genotpicos y de filogenia conforma una coleccin de
cepas que presentan un alto grado de similitud en una serie de rasgos
independientes.
Cepa
Se define como una poblacin de organismos que desciende de un nico
organismo o de un aislamiento en cultivo puro.
Las cepas dentro de una especie pueden clasificarse en:
A) Biovariedades
Variantes de cepas bacterianas caracterizadas por diferencias bioqumicas y
fisiolgicas.
B) Morfovariedades
Se diferencian desde el punto de vista morfolgico.
C) Serovariedades
Presentan propiedades antignicas diferentes.
D) Patovariedad
Se diferencan por el proceso y grado de patogenicidad.
E) Fagovariedad.
Presentan diferente especificidad por los fagos.
F) Ecotipo.
Se han adaptado a ocupar un mismo nicho ecolgico.
1.2. Nomenclatura de microorganismos
Para nombrar a los microorganismos se emplea el sistema de clasificacin de Linneo, el

cual se denomina sistema binomial de nomenclatura donde a cada especie se le asigna
un nombre latinizado compuesto de dos palabras: la primera designa el gnero, y la
segunda, la especie (Solomon et al., 2008). El nombre cientfico de los microorganismos se
debe escribir con letra cursiva, completo y la primera letra del gnero debe ir en mayscula.
La segunda vez que es nombrado un microorganismo en el mismo texto puede

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comprimirse, escribiendo nicamente la primera letra del gnero y el nombre completo de

la especie.
La principal referencia que existe para la clasificacin, identificacin y nomenclatura de las

bacterias es el Manual Bergey de Bacteriologa Sistemtica, en donde en las ltimas
versiones ya se adiciona la informacin obtenida por medio de los anlisis filogenticos, en
l se clasifican a los microorganismos con base en la secuencia del rRNA, DNA y protenas.
1.2.1. Caracterizacin fentica
Los enfoques clsicos de la taxonoma hacen uso de caractersticas morfolgicas,

fisiolgicas, bioqumicas, ecolgicas y genticas. Estas caractersticas se han utilizado en
taxonoma microbiana durante muchos aos. Son muy tiles en la identificacin rutinaria y
adems pueden proporcionar informacin filogentica.
Las caractersticas morfolgicas son importantes debido a que son fciles de estudiar y
analizar, adems, las caractersticas estructurales dependen de la expresin de muchos
genes y suelen ser estables desde el punto de vista gentico. Este tipo de caractersticas
normalmente no varan de forma sustancial con los cambios ambientales, por lo tanto, la
semejanza morfolgica a menudo es un buen indicador del parentesco filogentico.
Las caractersticas fisiolgicas y metablicas son de gran utilidad, ya que estn

directamente relacionadas con la naturaleza y la actividad de las enzimas microbianas y las
protenas de transporte. Puesto que las protenas son productos genticos, el anlisis de
estas caractersticas proporciona una comparacin indirecta de los genomas microbianos.
Las caractersticas ecolgicas como la capacidad de un microorganismo para colonizar

un ambiente concreto es una propiedad valiosa en taxonoma. Algunos microorganismos
pueden ser muy similares en muchos otros aspectos pero habitan nichos ecolgicos
diferentes, lo que sugiere que podran no estar tan estrechamente relacionados (Willey et
al., 2009).

Taxonoma microbiana
En la siguiente tabla se muestran algunos ejemplos de caractersticas fenotpicas que son

utilizadas para la clasificacin de microorganismos.
Tabla 3. Caractersticas fenotpicas con valor

taxonmico
Categora Componentes
principal
Morfologa Morfologa colonial; reaccin a tincin de Gram;
tamao y forma de la clula; patrn de distribucin
flagelar; presencia de esporas; cuerpos de inclusin;
pednculos o apndices.
Movilidad No mvil, movilidad por deslizamiento; movilidad
natatoria por flagelos; en enjambre (Swarming);
movilidad por vesculas gaseosas.
Metabolismo Mecanismos de conservacin de la energa (fottrofo,
quimioorgantrofo, quimiolittrofo); utilizacin de
compuestos de carbono, nitrgeno, o azufre;
fermentacin de azcares; fijacin de nitrgeno;
requerimiento de factores de crecimiento.
Fisiologa Rangos de temperatura, pH y sales para su
crecimiento respuesta al oxgeno (aerbico,
facultativo, anaerbico); presencia de catalasa y
oxidasa; produccin de enzimas extracelulares.
Qumica celular cidos grasos; lpidos polares; quinonas respiratorias.
Otros aspectos Pigmentos; luminiscencia; sensibilidad a antibiticos.
1.2.2. Pruebas bioqumicas y tinciones
El primer paso para la identificacin morfolgica de los microorganismos es la observacin

microscpica, para lo cual empleamos distintas tinciones que nos permiten visualizar mejor
las caractersticas de las clulas que estamos observando.
Para la tincin de las preparaciones se emplean colorantes, los cuales son compuestos
orgnicos que tiene afinidad por determinados componentes celulares. Algunos colorantes
presentan molculas cargadas positivamente, es decir son bsicos o catinicos.

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Para poder realizar una tincin es necesario primero realizar un frotis (Figura 7) en un
portaobjetos y fijarlo para posteriormente teirlo con el proceso especfico de cada tincin
y observarlo al microscopio.
Figura 7. Metodologa para realizar un frotis. Primero se esteriliza el asa, se

toma una pequea muestra de la colonia y se coloca sobre un portaobjetos que
contiene una gota de agua para posteriormente mezclarlo y expandirlo.
Tomado de: http://www.geocities.ws/urtis_micro/sesiones/Gram.htm
Existen muchos tipos de tinciones que se emplean de forma general en el laboratorio, a

continuacin se mencionan slo algunos de ellos:
Tincin de Gram: este tipo de tincin es el ms empleado de forma rutinaria, revela la

forma de la clula bacteriana, su agrupacin y grupo taxonmico al que pertenece, ya
sea Gram positivo o Gram negativo. Consiste en teir primero con cristal violeta, lavar,
agregar lugol, lavar, decolorar con alcohol acetona, teir con safranina y lavar
nuevamente. Las bacterias que retienen el cristal violeta se llaman Gram positivas
(Gram +) y las que se decoloran y se tien en rojo por el colorante de contraste son
Gram negativa (Gram -).

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Figura 8. Tincin de Gram. (a) Proceso de tincin y (b) observacin

microscpica de la tincin.
Modificado de http://estudiantesenlaboratoristaquimico.blogspot.mx/2014/12/tincion-de-
gram.html
Tincin de Ziehl-Neelsen: este tipo de tincin es esencial para aquellas bacterias

cido-alcohol-resistentes como el bacilo que causa la tuberculosis. Se realiza tiendo
con fuscina fenicada a emisin de vapor por 3 minutos, para despus decolorar con
alcohol-cido y lavar, posteriormente se tie con azul de metileno y se lava nuevamente.
Las bacterias que son capaces de resistir la decoloracin del alcohol-cido, por las
caractersticas de su membrana rica en lpidos, se observan de color rojo (BAAR =
bacilo cido alcohol resistente), mientras que las bacterias que son susceptibles a la
decoloracin se ven de color azul.
Figura 9. Tincin de Ziehl-

Neelsen. Se observa de rojo el
bacilo causante de la tuberculosis,
Mycobacterium tuberculosis.
Tomado de:
http://www.auxiliaresenfermeria.net/201
1/07/la-tincion-para-micobacterias.html

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Tincin de cpsula: las capsulas de las bacterias son frgiles, por lo que no se tien
con los mtodos comunes. Se utiliza una solucin de colorante cristal violeta que se
calienta y despus se realiza un lavado con sulfato de cobre. La capsula bacteriana se
tie de color azul plido, mientras que la clula y su interior aparecen teidas de color
azul obscuro.
Tincin de Schaeffer y Fulton: algunas especies de bacterias producen

intracelularmente estructuras especiales llamadas endosporas, que son clulas
diferenciadas resistentes al calor, agentes qumicos y radiacin. Para teir estas
estructuras se cubre el frotis con verde de malaquita y se calienta hasta observar
vapores durante medio minuto, el colorante se elimina con agua y por ltimo se agrega
safranina. Las esporas retienen el color verde y las partes vegetativas se tien de rojo.
Figura 10. Tincin de Shaeffer y Fulton. Del lado izquierdo se muestra el

proceso de la tincin y del lado derecho la observacin microscpica de Bacillus
subtilis, con las esporas teidas de verde.
Tomado de http://bacillus8.blogspot.com/
Tincin de flagelos: los flagelos de las bacterias son invisibles en las preparaciones
comunes, por lo que solo pueden visualizarse con tinciones especiales. Los flagelos se
observan en cultivos bacterianos recientes (12-18 horas) en caldo nutritivo. Se colocan 2 o
3 gotas de la muestra sin extenderlas, se fijan y se deja secar al aire, posteriormente se
agrega una mezcla de agua destilada, fucsina bsica, alcohol etlico, cido tnico y cloruro
de sodio, durante 5 a 15 minutos hasta observar un precipitado y se lava para finalmente

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observarse al microscopio electrnico. Observndose los flagelos de color rosa o rojo y el

resto de la clula se observa de color rosa tenue o bien sin color.
Figura 11. Tincin de flagelos. Se muestra la observacin microscpica de una

preparacin de Salmonella thypi con tincin de flagelos que se observan en rosa
claro.
Tomado de http://salmonellathypi.blogspot.mx/
Otra herramienta que se emplea de forma cotidiana en el laboratorio para lograr la

identificacin de los microorganismos, es el empleo de pruebas bioqumicas, las cuales
hay en una gran diversidad y ponen en evidencia distintas propiedades fisiolgicas y
bioqumicas, como se muestra en la tabla 4.
Para realizar estas pruebas es necesario conocer detalladamente qu cambios sufren las
bacterias durante los procesos metablicos, cmo es que se llevan a cabo las reacciones
bioqumicas, qu enzimas intervienen y cules son los productos intermedios que se
generan.
Para poder realizar las pruebas bioqumicas requerimos de un cultivo de microorganismos

que sea puro para posteriormente inocularlo en medios de cultivo o caldos con sustancias
nutritivas especficas e indicadores que van a poner en evidencia los cambios bioqumicos
generados por los microorganismos.

Taxonoma microbiana
Tabla 4. Algunas pruebas bioqumicas comunes

empleadas para la identificacin de bacterias
Prueba bioqumica Descripcin
Catalasa Detecta la presencia de catalasa, que convierte el

perxido de hidrgeno en agua y O2
Coagulasa Detecta la presencia de la coagulasa que provoca
la coagulacin del plasma.
Fermentacin de Se produce cido y/o gas durante el crecimiento
carbohidratos fermentador con azcares y alcoholes de azcares.
Hidrlisis de casena Detecta la presencia de la caseinasa, una enzima
capaz de hidrolizar la protena de la leche formando
colonias en el medio con un halo claro.
Hidrlisis de lpidos Detecta la presencia de lipasa, que rompe los
lpidos en cidos grasos simples y glicerol.
Licuefaccin de Detecta si la bacteria puede o no producir proteasas
gelatina que hidrolizan la gelatina y licuan el medio slido.
Oxidasa Detecta la presencia de la citocromo c oxidasa que
es capaz de reducir el O2 y aceptores de electrones
artificiales.
Reduccin de nitratos Detecta si la bacteria puede usar nitrato como
aceptor de electrones.
Sulfuro de hidrgeno Detecta la formacin de sulfuro de hidrgeno (H2S)
a partir del aminocido cistena mediante la cisteina
desulfurasa.
Ureasa Detecta la enzima que rompe la urea en NH3 y CO2
Utilizacin de citrato Cuando se utiliza el citrato como nica fuente de
carbono, esto resulta en una alcalinizacin del
medio.
Modificado de Willey et al., 2009.

Taxonoma microbiana
1.2.3. Caracterizacin genotpica
El anlisis comparativo de genomas tambin proporciona numerosos rasgos que permiten

discriminar distintas especies bacterianas. El anlisis genotpico presenta un especial
atractivo para la taxonoma microbiana porque proporciona una visin a nivel del DNA.
A continuacin se muestran en la tabla 5 las tcnicas ms empleadas para realizar la

caracterizacin genotpica y en la figura 12 la resolucin taxonmica de algunas de ellas.
Cuando la secuencia del gen 16S del rDNA tiene una similitud entre organismos 98.7%
los miembros son de diferentes especies. Los microorganismos no cultivables no pueden
ser asignados a una especie definitiva puesto que su fenotipo no se conoce, pero pueden
ser asignados a una designacin Candidata provista de la secuencia del gen 16S,
dependiendo de la similitud que presente con otras especies conocidas (Sarethy y
Danquah, 2014).

Taxonoma microbiana
Tabla 5. Mtodos genotpicos utilizados en taxonoma

bacteriana
Mtodo Descripcin/Aplicacin
Hibridacin DNA- Comparacin de similitud de genomas. til para
DNA diferenciar especies dentro de un gnero
Huella genmica Ribotipado, RFLP, rep-PCR. Mtodos rpidos para
diferenciar entre especies y entre cepas dentro de
una misma especie.
MLST Tipado de cepas utilizando las secuencias de DNA
de mltiples genes. Alta resolucin, til para
diferenciar cepas muy cercanas dentro de una
misma especie.
Contenido GC Porcentaje de pares de bases de guaninas ms
citosinas en el genoma. Es menos comn en
taxonoma porque tiene una resolucin pobre. Si el
porcentaje de GC de dos organismos difiere en ms
de un 5%, estos no pueden estar muy
emparentados, pero organismos con porcentajes
GC muy similares o incluso idnticos pueden no
tener relacin alguna.
Secuenciacin de Secuenciacin del rRNA de la subunidad pequea
cidos nucleicos (SSU rRNA). Estas secuencias desempean la
misma funcin en todos los microorganismos ya
que es necesario para la supervivencia y no
soportan grandes mutaciones.
Comparacin de Movilidad electrofortica, secuenciacin de
protenas protenas. Se basan en estudiar protenas que son
el reflejo del mRNA y por lo tanto de los genes que
las codifican.

Taxonoma microbiana
Figura 12. Resolucin taxonmica relativa de diversas tcnicas

moleculares. Se muestra el alcance de diferenciacin para cada una de las
tcnicas moleculares empleadas en taxonoma y filogenia.
Modificado de: Willey et al., 2009.
1.2.4. Filogenia microbiana
Los datos filogenticos se usan cada vez ms en la taxonoma bacteriana para

complementar la informacin fenotpica y genotpica. Adems el anlisis filogentico
permite encuadrar a los organismos en un sistema de clasificacin estructurado conforme
a sus relaciones evolutivas, lo que constituye un objetivo esencial de la sistemtica
microbiana.
La taxonoma microbiana est cambiando con rapidez. Esto se debe a los conocimientos
crecientes sobre la biologa de los microorganismos, a los avances notables realizados en
el mundo de la informtica y al uso de las caractersticas moleculares para determinar
relaciones filogenticas entre microorganismos (Willey et al., 2009).
Algunas de las tcnicas que se emplean para estudiar la filogenia microbiana son:
A) Cronmetros moleculares. Las secuencias de cidos nucleicos y protenas

cambian con el tiempo por lo que se les consideran cronmetros moleculares dentro

Taxonoma microbiana
del reloj evolutivo. La secuencia de muchos rRNA y protenas cambian

gradualmente con el tiempo sin destruir ni alterar gravemente sus funciones,
adems ocurren de forma aleatoria y se van acumulando linealmente con el tiempo.
Cuando las secuencias de molculas similares son bastantes diferentes en dos
grupos de organismos, los grupos divergieron mucho tiempo atrs
B) rboles filogenticos. Las relaciones filogenticas se representan en diagramas

ramificados o rboles.
1.2.5. rboles filogenticos

Un rbol filogentico muestra las relaciones evolutivas entre varias especies u otras
entidades que se cree que tienen un ancestro en comn y est representado por ramas y
nodos (Solomon et al 2008). Los nodos internos representan a los ancestros, los nodos
intermedios representan los puntos en el curso de la evolucin donde se produjo la
divergencia del ancestro en las nuevas entidades, y las ramas representan las nuevas
especies evolutivas. La longitud de cada rama corresponde al nmero de cambios que se
han sucedido a lo largo de dicha rama.
rbol filogentico
Es la representacin grfica de la relacin existente entre secuencias de

diferentes organismos que muestra una historia evolutiva a partir de
diferencias en la secuencia de nucletidos en un formato de tipo rbol
genealgico.
Los rboles filogenticos pueden tener raz o estar desprovistos de ella, como se observa
en la siguiente imagen:

Taxonoma microbiana
Figura 13. Ejemplos de rboles filogenticos. A) rbol sin raz que une cuatro
unidades taxonmicas. B) rbol con raz.
Modificado de Willey et al., 2009.
En los rboles filogenticos se pueden diferenciar varios grupos de especies dependiendo

del origen evolutivo de las especies (Figura 14):
A) Monofiltico: Es un grupo de organismos que presentan un antepasado comn con

todos y cada uno de sus descendientes.
B) Parafiltico: Se forma en el caso de que falten algunos de los descendientes, los
cuales han sido incluidos en otros grupos.
C) Polifiltico: Se construye cuando hay organismos de varios clados, es decir, que
no proceden de un antepasado comn cercano; simplemente, se han reunido por
conveniencia de los investigadores.
Figura 14. Diferentes grupos identificados en un rbol filogentico. De azul

se ejemplifica un grupo monofiltico, de verde uno parafiltico y de rojo uno
polifiltico.
Tomado de: Cavalier-Smith, 2010.
Los rboles filogenticos se desarrollan comparando secuencias de nucletidos o de

aminocidos. Para comparar dos molculas, primero sus secuencias deben estar alineadas
de tal forma que las partes similares coincidan. El objetivo es alinear y comparar secuencias
homlogas, que son aquellas que son similares porque tuvieron un origen comn en el
pasado. sta no es una tarea sencilla, y deben emplearse ordenadores y procesos
matemticos bastante complejos para reducir al mnimo el nmero de huecos y
apareamientos incorrectos de las secuencias que se comparan.

Taxonoma microbiana
Una vez que se han alineado las molculas, se determina el nmero de posiciones que
varan en las secuencias. Estos datos se utilizan para calcular una medida de la diferencia
entre las mismas, la cual la podemos expresar en forma de distancia evolutiva (Willey et al.,
2009).
La divergencia de los organismos representa las diferencias en las secuencias genticas

que pueden ser cambiadas en cada grupo dependiendo de su evolucin. El fenmeno de
transferencia gentico juega un rol clave en el paso de genes entre organismos en la historia
evolutiva ms temprana. Esto ocurre como respuesta a cualquier cambio en el ambiente y
provee una mejor adaptacin (Sarethy y Danquah, 2014).
Enlace
Es importante que recuerdes el significado y utilidad de los rboles

filogenticos, ya que en la asignatura de Bioinformtica construirs distintos
rboles empleando diversos fundamentos matemticos.
1.3. Virus
Los virus son los microorganismos ms numerosos de nuestro planeta y sin embargo
todava no pueden ser introducidos en la clasificacin del gran rbol de la vida, debido a
que existe el gran dilema de si clasificarlos como seres vivos o no. Es por ello que vamos
a analizar diferentes caractersticas de ellos para intentar responder esta gran interrogante.
Los virus infectan todo tipo de organismos celulares, adems de que son herramientas
importantes en el rea de la gentica microbiana y la ingeniera gentica. Estos organismos
son estudiados por la virologa.
Virus
Son elementos genticos que no pueden replicarse independientemente de

una clula viva, llamada clula hospedadora.

Taxonoma microbiana
Los virus son parsitos intracelulares obligados que tienen que introducirse en una clula
viva adecuada para llevar a cabo su ciclo de replicacin, sin embargo, los virus poseen su
propia informacin gentica y una forma extracelular denominada partcula vrica que les
permite existir fuera del hospedador durante largos periodos y que facilita la transmisin
entre una clula y otra (Madigan et al., 2009).
Transfeccin
Proceso mediante el cual los virus entran en una clula hospedera para
poder replicarse.
Despus de que los virus se introducen en la clula, explotan su maquinaria metablica y

le confiere nuevas propiedades que son heredables en el proceso de divisin celular.
Los virus se pueden clasificar con base en los hospedadores que infectan: en virus
bacterianos (bacterifagos), animales o vegetales; aunque tambin pueden clasificarse por
el genoma que presentan: si estn formados por DNA o RNA, de una o dos cadenas o si
su estructura es lineal o circular (Tabla 6 y figura 15).

Taxonoma microbiana
Tabla 6. Sistema de clasificacin de Baltimore para los

virus
Ejemplos
Descripcin del genoma y
Clase Virus
estrategia de replicacin Virus animales
bacterianos
I Genoma de DNA bicatenario Labda, T4 Herpesvirus,
viruela
II Genoma de DNA monocatenario X174 Virus de anemia
aviar
III Genoma de RNA bicatenario 6 Reovirus
IV Genoma de RNA monocatenario MS2 Poliovirus
positivo
V Genoma de RNA monocatenario Virus de la gripe,
negativo virus de la rabia
VI Genoma de RNA monocatenario Retrovirus
que se replica con un
intermediario de DNA
VII Genoma de DNA monocatenario Virus de la
que se replica con un hepatitis B
intermediario de RNA
Modificado de Madigan et al., 2009.

Taxonoma microbiana
Figura 15. Representacin de la clasificacin de Baltimore para los virus.

Se muestra en la parte superior la forma del DNA que presentan los distintos
grupos y en la parte de abajo el proceso que requieren para transformarlo a
mRNA en la clula husped.
Modificado de: http://seramix.blogs.uv.es/2013/02/28/david-baltimore-creando-orden-en-

el-caos/
1.3.1. Caractersticas y estructura de los virus
Cuando los virus se encuentra en su forma extracelular se llaman viriones y son una
partcula microscpica que contiene cido nucleico rodeado por protenas y otras
macromolculas, pero no realizan ninguna actividad metablica.
Los viriones pueden tener muchos tamaos y formas diferentes. La mayora de ellos
presentan un tamao entre los 20 y 300 nm. El cido nucleico del virin siempre est
localizado en el interior de la partcula, rodeado por una cubierta proteica llamada cpside
(Figura 16).
Esta cubierta est compuesta por una serie de molculas proteicas individuales llamadas
capsmeros, que siguen un patrn preciso y altamente repetitivo alrededor del cido

Taxonoma microbiana
nucleico. Los capsmeros son las unidades morfolgicas ms pequeas que se pueden ver
en un microscopio ptico.
Figura 16. Estructura viral. En la parte izquierda se muestra un virus desnudo,

en medio uno con envoltura y en el extremo derecho se observa la estructura de
un bacterifago.
Tomado de: https://askabiologist.asu.edu/ataque-viral-virus y

http://recursos.cnice.mec.es/biologia/bachillerato/segundo/biologia/ud07/02_07_04_02_0
21.html
Los distintos tipos morfolgicos de virus resultan principalmente de la combinacin de un

tipo particular de simetra de la cpside, con la presencia o ausencia de una envoltura.
Existen tres tipos de simetra de la cpside: helicoidal, icosadrica y compleja (Willey et al.,
2009) (Figura 17).
Al complejo completo de cido nucleico y protenas empaquetado en el virin se le da el

nombre de nucleocpside, y en algunos casos puede contener tambin enzimas
especficas del virus que ayudan en los procesos de infeccin y replicacin.
Algunos virus estn desnudos, mientras que otros poseen una membrana alrededor de la
nucleocpside, que forman lo que se conoce como envoltura. Esta envoltura consiste en
una bicapa lipdica con protenas, normalmente glicoprotenas, integradas en ella. Los
lpidos de la membrana vrica son derivados de las membranas de la clula hospedadora,
pero las protenas estn codificadas por genes del virus (Madigan et al., 2009).
Las protenas vricas se clasifican en dos categoras:

A) Protenas tempranas. Son aquellas que son sintetizadas inmediatamente despus
de la infeccin y que son necesarias para la replicacin del cido nucleico del virus.
B) Protenas tardas. Son aquellas que se sintetizan ms tarde e incluyen las
protenas de cubierta del virus.

Taxonoma microbiana
Figura 17. Principales familias de virus que infectan vertebrados. Del lado
izquierdo se muestran virus sin envoltura con diferente estructura de cpside y DNA
o RNA, del lado derecho se observan virus con envoltura con diferente forma y DNA
o RNA.
Tomado de
http://datateca.unad.edu.co/contenidos/203016/Modulo_EXE/leccin_2_clasificacin_de_los_vir
us.html
1.3.2. Replicacin viral
Para que un virus pueda replicarse, debe inducir a una clula hospedadora a sintetizar
todos los componentes esenciales necesarios para producir ms viriones. Luego, estos
componentes debern ensamblarse en nuevos viriones que escaparn de la clula. La
replicacin vrica se divide en cinco etapas (Figura 18):

Taxonoma microbiana
Replicacin viral
1. Unin (adsorcin)
Es la etapa inicial donde el virin se une a la clula hospedadora susceptible
a travs de receptores.
2. Penetracin (entrada o inyeccin)

En esta etapa el material gentico del virus o el virin completo son
introducidos en la clula.
3. Sntesis
Se sintetizan los cidos nucleicos y las protenas del virus por el metabolismo
celular redirigido por el virus.
4. Ensamblaje
Se unen las cpsides y los componentes de la membrana del virus (en caso
de que sea envuelto) y se empaquetan junto con el genoma vrico formando
nuevos viriones.
5. Liberacin
En esta ltima fase los viriones maduros son liberados de la clula hospedera.
Figura 18. Esquema de la replicacin viral. 1) Unin del virus a la clula

hospedera, 2) penetracin a la clula, 3) sntesis y ensamblaje de componentes
virales, 4) liberacin de la progenie viral.
Tomado de https://eduardosetti.wordpress.com/2014/04/04/sobre-virus-malos-y-buenos/

Taxonoma microbiana
Todos los cidos nucleicos virales, sin importar cul sea su condicin deben ser
transformados a mRNA para poder ser traducidos por la maquinaria celular, y en algunos
casos este proceso es nico de los virus, como la retrotranscripcin o la transcripcin
inversa, donde el RNA monocatenario pasa a DNA por medio de una enzima llamada
transcriptasa inversa o retrotranscriptasa (Ej. Retrovirus).
Los virus pueden infectar de diferentes maneras en las clulas:
A) Infeccin ltica, que provoca la destruccin de la clula hospedadora cuando se

liberan los virus. En algunos casos, con los virus recubiertos, la liberacin de los
viriones, que se produce por una especie de proceso de gemacin, puede ser lenta
y es posible que no se lise la clula hospedadora; as pues la clula infectada puede
seguir viva y continuar produciendo virus indefinidamente, estas infecciones se
llaman infecciones persistentes.
B) Infeccin latente, donde existe una demora entre la infeccin por el virus y los
sucesos de lisis. La etapa latente en la infeccin vrica de una clula animal se debe
a que los virus existen en un estado relativamente inactivo en el interior de las
clulas, donde sigue producindose la transcripcin a un bajo nivel pero el DNA viral
no se replica.
C) Va lisognica, ocurre en el caso de los bacterifagos, donde el virus denominado

atemperado no expresa sus genes pero su genoma (profago) se replica en sincrona
con el cromosoma del hospedador, pasando esa informacin durante la divisin
celular a las clulas de la siguiente generacin. En ciertas condiciones los virus
lisgenos pueden revertir a la va ltica y empezar a producir viriones (Figura 19).
Figura 19. Ciclo de vida de un

bacterifago. Una vez
introducido a la clula el virus
puede entrar en va ltica (a) o
lisognica (b).
Tomado de
http://biologocalentano.blogspot.mx/2
012/06/91-mecanismos-de-
transferencia-natural.html

Taxonoma microbiana
Algunos virus son parsitos de otros virus, conocidos como virus auxiliares. Algunos de
estos virus llamados defectivos dependen de virus intactos del mismo tipo para que les
proporcionen las funciones necesarias. Otro tipo de virus auxiliares son los satlite que
dependen de virus que no estn emparentados con ellos para que acten como auxiliares.
Existen otras estructuras muy similares a los virus como los viroides que ocasionan
muchos problemas en plantas y los priones que ocasionan enfermedades en animales
(encefalopata espongiforme bovina o enfermedad de las vacas locas) y en humano
(enfermedad de Creutzfeldt-Jakob) (Madigan et al., 2009).
Viroides y priones
Viroides
Se definen como molculas infecciosas de RNA que se diferencian de los
virus en que carecen de cubierta proteica.
Priones
Son partculas cuya forma extracelular diferenciada est formada
nicamente por protenas y que no contienen material gentico.
1.3.3. Cultivo de virus
Como los virus se replican nicamente en el interior de las clulas vivas, su cultivo requiere
el uso de hospederos adecuados. Para el estudio de los bacterifagos se utilizan cultivos
puros en medios lquidos o semislidos. La mayora de los virus animales y algunos
vegetales pueden crecer en cultivos tisulares o celulares, lo que ha facilitado la
investigacin sobre ellos. Los virus vegetales, son los ms difciles de trabajar, porque su
estudio requiere el uso de la planta completa en muchas ocasiones, lo que lo hace un
proceso lento.
Durante muchos aos, los investigadores han cultivado virus de animales inoculando
huspedes animales adecuados o huevos embrionados. Para ello se emplean huevos de
gallina fertilizados incubados durante aproximadamente 6 a 8 das despus de la puesta y
posteriormente se sigue el procedimiento que se muestra a continuacin (Willey et al., 2009)
(Figura 20):

Taxonoma microbiana
Cultivo en embrin de pollo
1. Desinfectar la cscara del huevo con yodo.

2. Perforar con una pequea taladradora estril uno de los extremos del
huevo.
3. Inocular la muestra de virus en el embrin, en la regin adecuada
donde se reproduzca el mismo.
4. Sellar con gelatina la abertura.
5. Incubar el huevo.
Figura 20. Cultivo de virus en embrin de pollo. Se observa la

inoculacin del virus en el embrin a travs de una opturacin en
condiciones aspticas.
Tomado de:
http://www.actualidadavipecuaria.com/alfabiol/productos/servicios/analisisdelaborato
rio/diagnostico-virologico.html
Ms recientemente se han cultivado virus de animales en cultivos de tejidos en monocapas

de clulas animales. Este tipo de cultivos derivan de clulas tomadas inicialmente de un
rgano de un animal experimental. A menos que se utilicen clulas sanguneas, los cultivos
celulares suelen obtenerse eliminando aspticamente fragmentos de tejido, disociando las
clulas mediante tratamiento con un enzima que rompa el cemento intercelular y
esparciendo la suspensin resultante en una superficie plana como la base de un matraz
de cultivo o una placa de Petri. La fina capa de clulas que se adhieren al cristal o a la placa
de plstico, llamada monocapa, se cubre con un medio de cultivo adecuado y se incuba a

Taxonoma microbiana
la temperatura adecuada. El medio de cultivo empleado es muy complejo, ya que contiene

toda una serie de aminocidos y vitaminas, sales, glucosa y un sistema regulador de pH.
Para obtener el mejor crecimiento suele ser necesaria la adicin de una pequea cantidad
de suero sanguneo y varios antibiticos para evitar la contaminacin bacteriana.
Como resultado de la infeccin viral en las clulas se forman reas localizadas de

destruccin celular y lisis denominadas placas o calvas que se pueden detectar si se tien
con colorantes como el rojo neutro o el azul tripano, que permiten distinguir las clulas vivas
de las muertas. El crecimiento vrico no siempre resulta en la lisis de las clulas para formar
una placa, en ocasiones se generan cambios o anomalas degenerativas microscpicas o
macroscpicas en las clulas husped y en los tejidos denominado efecto citoptico, los
cuales pueden ser letales en ocasiones (Figura 21).
Figura 21. Cultivo de virus en clulas eucariticas. Se muestra en color

blanco las placas formadas por la infeccin de las clulas con diferentes
concentraciones de virus.
Tomado de http://ticotal.cr/boletin-informativo/ticotal-boletin-informativo-n19-
setiembre-2014.html
Los virus de bacterias y de arqueas se cultivan en cultivos slidos o lquidos de clulas

jvenes. En algunos cultivos infectados se destruyen tantas clulas husped que los
cultivos turbios se clarifican rpidamente por la lisis celular.

Taxonoma microbiana
Los cultivos con agar se preparan de la siguiente manera:
Cultivo de virus en agar
1. Mezclar los virus con agar lquido atemperado y un cultivo de las

clulas husped adecuadas.
2. Verter la mezcla rpidamente en una placa de Petri que contenga
una capa de agar estril.
3. Dejar solidificar.
4. Incubar.
Las clulas en la capa de agar superior crecern formando una capa continua, opaca, o
csped. En el lugar donde caiga un virin se producir la lisis de las clulas y por lo tanto
una placa o zona clara en el csped en el agar debido a la infeccin de las clulas por el
virus (Willey et al., 2009).
Actividades
La elaboracin de las actividades y evidencias de aprendizaje estarn

guiadas por tu docente en lnea, mismo que te indicar, a travs de la
Planeacin didctica del docente en lnea, la dinmica que t y tus compaeros
(as) llevarn a cabo, as como la fecha de entrega de tus productos.
Para el envo de tus trabajos utilizars la siguiente nomenclatura:
BMTM_U1_A1_XXYZ, donde BMTM corresponde a las siglas de la asignatura,
U1 es unidad de conocimiento, A1 es el nmero de actividad, el cual debes
sustituir considerando la actividad que se realices, en el caso de la evidencia de
aprendizaje se deber colocar EA; asimismo, XX son las primeras letras de tu
nombre y la primera letra de tu apellido paterno y Z corresponde a la primera
letra de tu apellido materno.
Autorreflexiones
Para la parte de autorreflexiones debes de consultar el foro Preguntas de

Autorreflexin para realizar la actividad correspondiente y enviarlo a la
herramienta de Autorreflexiones. Cabe recordar que esta actividad tiene una
ponderacin del 10% de tu evaluacin.

Taxonoma microbiana
Para el envo de tu autorreflexin utiliza la siguiente nomenclatura:

BMTM_U2_ATR _XXYZ, donde BMTM corresponde a las siglas de la asignatura,
U1 es la unidad de conocimiento, XX son las primeras letras de tu nombre, y la
primera letra de tu apellido paterno y Z la primera letra de tu apellido materno.
Cierre de la unidad
En esta primera unidad vimos una introduccin al mundo de la microbiologa, con el estudio
de la taxonoma, filogenia. Conociste en qu se basan y cules son las grandes
clasificaciones de los seres vivos, adems de conocer los fundamentos de la nomenclatura
microbiana, que es tan importante para el biotecnlogo.
Tambin nos introdujimos al mundo de la virologa, conociendo las principales

caractersticas de estos organismos que son tan tiles en las nuevas herramientas de la
biologa molecular y que adems afectan muchas reas de la industria en el mundo.
Ahora te invitamos a conocer ms sobre el mundo microscpico en la segunda unidad de

esta asignatura para comprender mejor los procesos de crecimiento y cmo sacarles
provecho a nivel industrial y mdico.

Taxonoma microbiana
Para saber ms
Consulta los siguientes videos:

https://www.youtube.com/watch?v=7RGlBQlEY2w
https://www.youtube.com/watch?v=W-TvFouJhrM
https://www.youtube.com/watch?v=2vz9YcXAMoI
https://www.youtube.com/watch?v=57UKFLnYpFM
https://www.youtube.com/watch?v=GmWR8_62F1I
https://www.youtube.com/watch?v=HuPmUk842wQ
https://www.youtube.com/watch?v=1a0l5FcQQJw
https://www.youtube.com/watch?v=aO4V_LpcEJo
https://www.youtube.com/watch?v=KyI8cu-nzRc
https://www.youtube.com/watch?v=fNS9eHPXoRY

Taxonoma microbiana
Fuentes de consulta
1. Cavalier-Smith T. (2010). "Deep phylogeny, ancestral groups and the four

ages of life". Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 365(1537): 111132.
2. Madigan M. T., Martinko J.M., Dunlap P.V., Clark D.P. (2009). Brock.
Biologa de los microorganismos. Pearson Educacin. Doceava edicin.
3. Sarethy I.P., Pan S., Danquah D.K. (2014). Biodiversity - The Dynamic
Balance of the Planet. Intech.
4. Sharma R, Polkade A.V., Shouche Y.S. (2015). Species concept in
microbial taxonomy and systematics. Current Science. 108(10): 1804-1814.
5. Willey,J.M., Sherwood L. M., Woolverton C.J. (2009). Microbiologa. Mc.
Graw Hill / Interamericana. Sptima edicin.

Microbiología y Taxonomía Microbiana

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Programa de la asignatura:

Ciencias de la Salud Biolgicas y Ambientales | Ingeniera en Biotecnologa

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 1

La microbiologa es una ciencia de estudio bsica para el biotecnlogo,

En esta unidad estudiaremos a la microbiologa desde el punto de vista

Tambin nos adentraremos en el mundo de la microbiologa estudiando a los virus, los

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 2

Esta unidad tiene el propsito de:

Definir a la microbiologa y su campo de estudio.

Identificar el rea de estudio y clasificacin de la microbiologa con el fin

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 3

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 4

La importancia de la Microbiologa deriva de la necesidad biolgica de estudiar los

Etimolgicamente proviene de los vocablos griegos micro que significa

Los primeros en visualizar la abundancia y diversidad de microorganismos a pesar de lo

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 5

Figura 1. Pinturas de los pioneros de la microbiologa. A la izquierda Robert

El estudio de la microbiologa abarca una enorme heterogeneidad de tipos estructurales,

1.1.1. Campo de estudio de la microbiologa

Las caractersticas estructurales de los microorganismos, su fisiologa, bioqumica,

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 6

Son seres de tamao microscpico dotados de individualidad, con una

Finalmente, la Microbiologa se ocupa de todas las tcnicas y metodologas destinadas al

En el siglo XX, se han desarrollado muchas subdisciplinas a partir de la microbiologa como

Taxonoma o sistemtica microbiana que permite la agrupacin y clasificacin de

Etimolgicamente proviene del griego taxis, "ordenamiento", y nomos,

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 7

Partes que integran la taxonoma

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 8

Figura 2. Dibujo de FCarl Von

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 9

Durante mucho tiempo, los taxnomos microbianos contaron exclusivamente con un

La identificacin de un microorganismo es importante en diferentes reas, como en la

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 10

Figura 3. Diferentes criterios empleados en la diferenciacin de bacterias,

Modificado de: Sharma et al., 2015.

La clasificacin de los microorganismos implica su disposicin en niveles taxonmicos

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 11

A) Archaea. Incluye las bacterias que pueden crecer en condiciones extremas

Figura 4. rbol filogentico de la vida.

Tomado de: http://ocw.unican.es/ciencias-sociales-y-

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 12

Tabla 1. Caractersticas diferenciales de los dominios

Caracterstica Bacteria Archaea Eukarya

- Estructura celular procaritica S S No

- Pared celular de peptidoglicano S No No

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 13

La tabla 2 muestra un ejemplo de la descripcin completa taxonmica del microorganismo

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 14

Tabla 2. Jerarqua taxonmica para la bacteria

Existen bases de datos microbianas en internet que se han vuelto herramientas

Figura 5. Base de datos del NCBI. Se muestra la taxonoma descrita de Bacillus

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 16

Figura 6. Base de datos del ITIS. Se muestra la taxonoma descrita de Bacillus

Tomado de: http://www.itis.gov/.

1.1.3. Concepto de especie

El trmino especie en el aspecto microbiolgico es muy ambiguo, porque no existe un

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 17

Las cepas dentro de una especie pueden clasificarse en:

1.2. Nomenclatura de microorganismos

Para nombrar a los microorganismos se emplea el sistema de clasificacin de Linneo, el

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico 18

comprimirse, escribiendo nicamente la primera letra del gnero y el nombre completo de