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Bioqumica

Representacin esquemtica de la molcula de ADN, la molcula portadora de


la informacin gentica.
La bioqumica es una ciencia que estudia la composicin qumica de los seres
vivos, especialmente las protenas, carbohidratos, lpidos y cidos nucleicos,
adems de otras pequeas molculas presentes en las clulas y las reacciones
qumicas que sufren estos compuestos (metabolismo) que les permiten obtener
energa (catabolismo) y generar biomolculas propias (anabolismo). La
bioqumica se basa en el concepto de que todo ser vivo contiene carbono y en
general las molculas biolgicas estn compuestas principalmente de carbono,
hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre.
Es la ciencia que estudia la base qumica de las molculas que componen las
clulas y los tejidos, que catalizan las reacciones qumicas del metabolismo
celular como la digestin, la fotosntesis y la inmunidad, entre otras muchas
cosas.
Podemos entender la bioqumica como una disciplina cientfica integradora que
aborda el estudio de las biomolculas y biosistemas. Integra de esta forma las
leyes qumico-fsicas y la evolucin biolgica que afectan a los biosistemas y a
sus componentes. Lo hace desde un punto de vista molecular y trata de
entender y aplicar su conocimiento a amplios sectores de la medicina (terapia
gentica y biomedicina), la agroalimentacin, la farmacologa.
Constituye un pilar fundamental de la biotecnologa, y se ha consolidado como
una disciplina esencial para abordar los grandes problemas y enfermedades
actuales y del futuro, tales como el cambio climtico, la escasez de recursos
agroalimentarios ante el aumento de poblacin mundial, el agotamiento de las
reservas de combustibles fsiles, la aparicin de nuevas alergias, el aumento
del cncer, las enfermedades genticas, la obesidad, etc.
La bioqumica es una ciencia experimental y por ello recurrir al uso de
numerosas tcnicas instrumentales propias y de otros campos, pero la base de
su desarrollo parte del hecho de que lo que ocurre en vivo a nivel subcelular se
mantiene o conserva tras el fraccionamiento subcelular, y a partir de ah,
podemos estudiarlo y extraer conclusiones.
ndice [ocultar]
1

Historia

Ramas de la bioqumica

Tcnicas bioqumicas bsicas

Expectativas y retos de la bioqumica

Importantes bioqumicos espaoles

Vase tambin

Referencias

Enlaces externos

Historia[editar]
La historia de la bioqumica moderna como la conocemos ; desde el siglo se
comenz a direccionar una buena parte de la biologa y la qumica a la creacin
de una nueva disciplina integradora: la qumica fisiolgica o la bioqumica. Pero
la aplicacin de la bioqumica y su conocimiento, probablemente comenz hace
5000 aos con la produccin de pan usando levaduras en un proceso conocido
como fermentacin.
Es difcil abordar la historia de la bioqumica, en cuanto que, es una mezcla
compleja de qumica orgnica y biologa, y en ocasiones, se hace complicado
discernir entre lo exclusivamente biolgico y lo exclusivamente qumico
orgnico y es evidente que la contribucin a esta disciplina ha sido muy
extensa. Aunque es cierto que existen datos experimentales que son bsicos
en la bioqumica.
Se suele situar el inicio de la bioqumica en los descubrimientos en 1828 de
Friedrich Whler que public un artculo acerca de la sntesis de urea, probando
que los compuestos orgnicos pueden ser creados artificialmente, en contraste
con la creencia, comnmente aceptada durante mucho tiempo, de que la
generacin de estos compuestos era posible solo en el interior de los seres
vivos.
La diastasa fue la primera enzima descubierta. En 1833 se extrajo de la
solucin de malta por Anselme Payen y Jean-Franois Persoz, dos qumicos de
una fbrica de azcar francesa.1
A mediados del siglo XIX, Louis Pasteur, demostr los fenmenos de isomera
qumica existente entre las molculas de cido tartrico provenientes de los
seres vivos y las sintetizadas qumicamente en el laboratorio. Tambin estudi
el fenmeno de la fermentacin y descubri que intervenan ciertas levaduras,
y por tanto no era exclusivamente un fenmeno qumico como se haba
defendido hasta ahora (entre ellos el propio Liebig); as Pasteur escribi: la
fermentacin del alcohol es un acto relacionado con la vida y la organizacin
de las clulas de las levaduras, y no con la muerte y la putrefaccin de las
clulas. Adems desarroll un mtodo de esterilizacin de la leche, el vino y la
cerveza (pasteurizacin) y contribuy enormemente a refutar la idea de la
generacin espontnea de los seres vivos.
En 1869 se descubre la nuclena y se observa que es una sustancia muy rica en
fsforo. Dos aos ms tarde, Albrecht Kossel concluye que la nuclena es rica
en protenas y contiene las bases pricas adenina y guanina y las pirimidnicas
citosina y timina. En 1889 se aslan los dos componentes mayoritarios de la
nuclena:

Protenas (70 %)
Sustancias de carcter cido: cido nucleicos (30 %)
En 1878 el fisilogo Wilhelm Khne acu el trmino enzima para referirse a los
componentes biolgicos desconocidos que producan la fermentacin. La
palabra enzima fue usada despus para referirse a sustancias inertes tales
como la pepsina.
En 1897 Eduard Buchner comenz a estudiar la capacidad de los extractos de
levadura para fermentar azcar a pesar de la ausencia de clulas vivientes de
levadura. En una serie de experimentos en la Universidad Humboldt de Berln,
encontr que el azcar era fermentado inclusive cuando no haba elementos
vivos en los cultivos de clulas de levaduras. Llam a la enzima que causa la
fermentacin de la sacarosa, zimasa. Al demostrar que las enzimas podran
funcionar fuera de una clula viva, el siguiente paso fue demostrar cul era la
naturaleza bioqumica de esos biocatalizadores. El debate fue extenso, muchos
como el bioqumico alemn Richard Willsttter discrepaban de que la protena
fuera el catalizador enzimtico, hasta que en 1926, James B. Sumner demostr
que la enzima ureasa era una protena pura y la cristaliz. La conclusin de que
las protenas puras podan ser enzimas fue definitivamente probada en torno a
1930 por John Howard Northrop y Wendell Meredith Stanley, quienes trabajaron
con diversas enzimas digestivas como la pepsina, la tripsina y la quimotripsina.
En 1903 Mijal Tswett inicia los estudios de cromatografa para separacin de
pigmentos.
En torno a 1915 Gustav Embden y Otto Meyerhof realizan sus estudios sobre la
gluclisis.
En 1920 se descubre que en las clulas hay ADN y ARN y que difieren en el
azcar que forma parte de su composicin: desoxirribosa o ribosa. El ADN
reside en el ncleo. Unos aos ms tarde, se descubre que en los
espermatozoides hay fundamentalmente ADN y protenas, y posteriormente
Feulgen descubre que hay ADN en los cromosomas con su tincin especfica
para este compuesto.
En 1925 Theodor Svedberg demuestra que las protenas son macromolculas y
desarrolla la tcnica de ultracentrifugacin analtica.
En 1928, Alexander Fleming descubre la penicilina y desarrolla estudios sobre
la lisozima.
Richard Willsttter (en torno 1910) estudia la clorofila y comprueba la similitud
que hay con la hemoglobina. Posteriormente Hans Fischer en torno a 1930,
investiga la qumica de las porfirinas de las que derivan la clorofila o el grupo
porfirnico de la hemoglobina. Consigui sintetizar hemina y bilirrubina.
Paralelamente Heinrich Otto Wieland formula teoras sobre las
deshidrogenaciones y explica la constitucin de muchas otras sustancias de

naturaleza compleja, como la pteridina, las hormonas sexuales o los cidos


biliares.
En la dcada de 1940, Melvin Calvin concluye el estudio del ciclo de Calvin en
la fotosntesis y Albert Claude la sntesis del ATP en las mitocondrias.
En torno a 1945 Gerty Cori, Carl Cori, y Bernardo Houssay completan sus
estudios sobre el ciclo de Cori.
En 1953 James Dewey Watson y Francis Crick, gracias a los estudios previos
con cristalografa de rayos X de ADN de Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, y
los estudios de Erwin Chargaff sobre apareamiento de bases nitrogenadas,
deducen la estructura de doble hlice del ADN. En 1957, Matthew Meselson y
Franklin Stahl demuestran que la replicacin del ADN es semiconservativa.
En la segunda mitad del siglo XX, comienza la autntica revolucin de la
bioqumica y la biologa molecular moderna, especialmente gracias al
desarrollo de las tcnicas experimentales ms bsicas como la cromatografa,
la centrifugacin, la electroforesis, las tcnicas radioisotpicas y la microscopa
electrnica, y las tcnicas ms complejas como la cristalografa de rayos X, la
resonancia magntica nuclear, la PCR (Kary Mullis), el desarrollo de la inmunotcnicas.
Desde 1950 a 1975 , se conocen en profundidad y detalle aspectos del
metabolismo celular inimaginables hasta ahora (fosforilacin oxidativa (Peter
Dennis Mitchell), ciclo de la urea y ciclo de Krebs (Hans Adolf Krebs), as como
otras rutas metablicas), se produce toda una revolucin en el estudio de los
genes y su expresin; se descifra el cdigo gentico (Francis Crick, Severo
Ochoa, Har Gobind Khorana, Robert W. Holley y Marshall Warren Nirenberg), se
descubren las enzimas de restriccin (finales de 1960, Werner Arber, Daniel
Nathans y Hamilton Smith), la ADN ligasa (en 1972, Mertz y Davis) y finalmente
en 1973 Stanley Cohen y Herbert Boyer producen el primer ser vivo
recombinante, naciendo as la ingeniera gentica, convertida en una
herramienta poderossima con la que se supera la frontera entre especies y con
la que podemos obtener un beneficio hasta ahora impensable.
De 1975 hasta principios del siglo XXI, comienza a secuenciarse el ADN (Allan
Maxam, Walter Gilbert y Frederick Sanger), comienzan a crearse las primeras
industrias biotecnolgicas (Genentech), se aumenta la creacin de frmacos y
vacunas ms eficaces, se eleva el inters por las inmunologa y las clulas
madres y se descubre la enzima telomerasa (Elizabeth Blackburn y Carol
Greider). En 1989 se utiliza la biorremediacin a gran escala en el derrame del
petrolero Exxon Valdez en Alaska. Se clonan los primeros seres vivos, se
secuencia el ADN de decenas de especies y se publica el genoma completo del
hombre (Craig Venter, Celera Genomics y Proyecto Genoma Humano), se
resuelven decenas de miles de estructuras proteicas y se publican en PDB, as
como genes, en GenBank. Comienza el desarrollo de la bioinformtica y la
computacin de sistemas complejos, que se constituyen como herramientas
muy poderosas en el estudio de los sistemas biolgicos. Se crea el primer

cromosoma artificial y se logra la primera bacteria con genoma sinttico (2007,


2009, Craig Venter). Se fabrican las nucleasas con dedos de zinc. Se inducen
artificialmente clulas, que inicialmente no eran pluripotenciales, a clulas
madre pluripotenciales (Shin'ya Yamanaka). Comienzan a darse los primeros
pasos.
Ramas de la bioqumica[editar]

Esquema de una clula tpica animal con sus orgnulos y estructuras.


El pilar fundamental de la investigacin bioqumica clsica se centra en las
propiedades de las protenas, muchas de las cuales son enzimas. Sin embargo,
existen otras disciplinas que se centran en las propiedades biolgicas de
carbohidratos (Glucobiologa)2 y lpidos (Lipobiologa).3
Por razones histricas la bioqumica del metabolismo de la clula ha sido
intensamente investigada, en importantes lneas de investigacin actuales
(como el Proyecto Genoma, cuya funcin es la de identificar y registrar todo el
material gentico humano), se dirigen hacia la investigacin del ADN, el ARN,
la sntesis de protenas, la dinmica de la membrana celular y los ciclos
energticos.
Las ramas de la bioqumica son muy amplias y diversas, y han ido variando con
el tiempo y los avances de la biologa, la qumica y la fsica.
Bioqumica estructural: es un rea de la bioqumica que pretende comprender
la arquitectura qumica de las macromolculas biolgicas, especialmente de las
protenas y de los cidos nucleicos (DNA y RNA). As se intenta conocer las
secuencias peptdicas, su estructura y conformacin tridimensional, y las
interacciones fsico-qumicas atmicas que posibilitan a dichas estructuras. Uno
de sus mximos retos es determinar la estructura de una protena conociendo
solo la secuencia de aminocidos, que supondra la base esencial para el
diseo racional de protenas (ingeniera de protenas).
Qumica bioorgnica: es un rea de la qumica que se encarga del estudio de
los compuestos orgnicos (es decir, aquellos que tienen enlaces covalentes
carbono-carbono o carbono-hidrgeno) que provienen especficamente de
seres vivos. Se trata de una ciencia ntimamente relacionada con la bioqumica
clsica, ya que en la mayora de los compuestos biolgicos participa el
carbono. Mientras que la bioqumica clsica ayuda a comprender los procesos
biolgicos con base en conocimientos de estructura, enlace qumico,
interacciones moleculares y reactividad de las molculas orgnicas, la qumica
bioorgnica intenta integrar los conocimientos de sntesis orgnica,
mecanismos de reaccin, anlisis estructural y mtodos analticos con las
reacciones metablicas primarias y secundarias, la biosntesis, el
reconocimiento celular y la diversidad qumica de los organismos vivos. De all
surge la Qumica de Productos Naturales (V. Metabolismo secundario).4

Enzimologa: estudia el comportamiento de los catalizadores biolgicos o


enzimas, como son algunas protenas y ciertos RNA catalticos, as como las
coenzimas y cofactores como metales y vitaminas. As se cuestiona los
mecanismos de catlisis, los procesos de interaccin de las enzimas-sustrato,
los estados de transicin catalticos, las actividades enzimticas, la cintica de
la reaccin y los mecanismos de regulacin y expresin enzimticas, todo ello
desde un punto de vista bioqumico. Estudia y trata de comprender los
elementos esenciales del centro activo y de aquellos que no participan, as
como los efectos catalticos que ocurren en la modificacin de dichos
elementos; en este sentido, utilizan frecuentemente tcnicas como la
mutagnesis dirigida.
Bioqumica metablica: es un rea de la bioqumica que pretende conocer los
diferentes tipos de rutas metablicas a nivel celular, y su contexto orgnico. De
esta forma son esenciales conocimientos de enzimologa y biologa celular.
Estudia todas las reacciones bioqumicas celulares que posibilitan la vida, y as
como los ndices bioqumicos orgnicos saludables, las bases moleculares de
las enfermedades metablicas o los flujos de intermediarios metablicos a
nivel global. De aqu surgen disciplinas acadmicas como la Bioenergtica
(estudio del flujo de energa en los organismos vivos), la Bioqumica nutricional
(estudio de los procesos de nutricin asociados a rutas metablicas)5 y la
bioqumica clnica (estudio de las alteraciones bioqumicas en estado de
enfermedad o traumatismo). La metabolmica es el conjunto de ciencias y
tcnicas dedicadas al estudio completo del sistema constituido por el conjunto
de molculas que constituyen los intermediarios metablicos, metabolitos
primarios y secundarios, que se pueden encontrar en un sistema biolgico.
Xenobioqumica: es la disciplina que estudia el comportamiento metablico de
los compuestos cuya estructura qumica no es propia en el metabolismo
regular de un organismo determinado. Pueden ser metabolitos secundarios de
otros organismos (P. ejemplo las micotoxinas, los venenos de serpientes y los
fitoqumicos cuando ingresan al organismo humano) o compuestos poco
frecuentes o inexistentes en la naturaleza.6 La Farmacologa es una disciplina
que estudia a los xenobiticos que benefician al funcionamiento celular en el
organismo debido a sus efectos teraputicos o preventivos (Frmacos). La
farmacologa tiene aplicaciones clnicas cuando las sustancias son utilizadas en
el diagnstico, prevencin, tratamiento y alivio de sntomas de una
enfermedad as como el desarrollo racional de sustancias menos invasivas y
ms eficaces contra dianas biomoleculares concretas. Por otro lado, la
Toxicologa es el estudio que identifica, estudia y describe, la dosis, la
naturaleza, la incidencia, la severidad, la reversibilidad y, generalmente, los
mecanismos de los efectos adversos (efectos txicos) que producen los
xenobiticos. Actualmente la toxicologa tambin estudia el mecanismo de los
componentes endgenos, como los radicales libres de oxgeno y otros
intermediarios reactivos, generados por xenobiticos y endobiticos.
Inmunologa: rea de la biologa, la cual se interesa por la reaccin del
organismo frente a otros organismos como las bacterias y virus. Todo esto

tomando en cuenta la reaccin y funcionamiento del sistema inmune de los


seres vivos. Es esencial en esta rea el desarrollo de los estudios de produccin
y comportamiento de los anticuerpos.
Endocrinologa: es el estudio de las secreciones internas llamadas hormonas,
las cuales son sustancias producidas por clulas especializadas cuyo fin es de
afectar la funcin de otras clulas. La endocrinologa trata la biosntesis, el
almacenamiento y la funcin de las hormonas, las clulas y los tejidos que las
secretan, as como los mecanismos de sealizacin hormonal. Existen
subdisciplinas como la endocrinologa mdica, la endocrinologa vegetal y la
endocrinologa animal.