En su metabolismo, los lactobacilos van de la vida anaerobia a la aerobia.
Estos microorganismos carecen de sistemas de citocromos para ejecutar la fosforilacin oxidativa y no poseen enzimas superxido dismutasas ni catalasas. Los miembros de este gnero transforman la glucosa y las hexosas aldehdicas similares, los carbohidratos que producen estos azcares simples y los alcoholes polihidroxlicos en cido lctico por homofermentacin o bien, en cido lctico y otros productos finales adicionales como cido actico, etanol, dixido de carbono, cido frmico y cido succnico por heterofermentacin, constituyendo al menos un 50% de los productos finales el cido lctico, el cual usualmente no es fermentado. Las principales vas de la fermentacin para las hexosas son: la de EmbdenMeyerhof, donde se convierte 1 mol de hexosa en 2 moles de cido lctico por fermentacin homolctica y la va del 6-fosfogluconato, cuyo resultado es 1 mol de CO2, 1 mol de etanol (o de cido actico) y 1 mol de cido lctico, por fermentacin heterolctica. En condiciones aerobias, la mayora de las cepas reoxidan el NADH 2 utilizando el O2 como aceptor final de electrones, de modo que el Acetil-CoA no es, o al menos no es completamente reducido a etanol. De esta manera, se forma ATP adicional por fosforilacin a nivel de sustrato, as como proporciones variables de cido actico y etanol, en dependencia del suministro de Oxgeno En cuanto a los niveles enzimticos, los lactobacilos heterofermentativos poseen fosfocetolasas, pero no FDP aldolasas, mientras que los homofermentativos poseen FDP aldolasas, pero no fosfocetolasas