Las caractersticas geolgicas del departamento del Huila estn estrechamente
ligadas al origen y evolucin de las cordilleras Central y Oriental, y en particular al desarrollo del valle alto del ro Magdalena. Lo anterior est claramente reflejado en la gran variedad de paisajes, tipos de relieve, diversidad de litologas, suelos y unidades morfoestructurales, producto de la fuerte actividad tectnica; evidenciada en la cantidad de fallas, la intensa actividad volcnica y la actividad ssmica; los cambios climticos durante las pasadas glaciaciones que produjeron procesos erosivos responsables del modelado de los diferentes paisajes sobre la parte alta de la cordillera central. Se destaca ante todo la variedad de rocas gneas, sedimentarias y metamrficas, con edades que varan desde el Precmbrico hasta el cuaternario. Las rocas metamrficas e gneas intrusivas y extrusivas asociadas a las cordilleras central y oriental; las secuencias sedimentarias bordeando los flancos de las cordilleras central y oriental. Existen adems potentes y extensas coberturas de sedimentos cuaternarios de diferente naturaleza que rellenaron los valles y piedemontes de la elongada depresin tectnica del ro Magdalena.
La secuencia litoestratigrfica comprende rocas metamrficas de alto a bajo
grado de metamorfismo, rocas gneas intrusivas y extrusivas de composicin cida a intermedia, asociadas a los Macizos de Garzn y la Plata, localizadas sobre las cordilleras oriental y central. Existen adems potentes y extensa coberturas de rocas volcnicas de composicin cida a intermedia, con edades Trisico, Terciario y reciente. Las rocas sedimentarias de edad cretcica depositadas en ambiente marino y rocas sedimentarias de edad terciaria depositadas en ambiente continental, fuertemente plegadas y fracturadas, ocupan la parte central y los flancos de la extensa y elongada cuenca del valle alto del ro Magdalena, casi desde su nacimiento hasta donde termina la subcuenca de Neiva, a la altura del Arco de Natagaima, donde las dos cordilleras casi se unen y forman un fuerte estrechamiento de la planicie aluvial del ro Magdalena. Finalmente, existen espesos depsitos cuaternarios de origen diverso rellenando los valles y piedemontes sobre el amplio valle del ro Magdalena.
Sobre la parte alta de la cordillera Central se encuentran unidades de origen
glaciar, fluvioglaciar, volcnico y fluviovolcnico, asociadas a los volcanes nevados como el Huila, Purac, Cerro nevado, Los Coconucos, Sotar y los pramos adyacentes a stos, donde se han presentado fenmenos de volcanismo y la accin de la glaciacin durante el Pleistoceno y el Holoceno.
Sobre la parte alta de la cordillera y relacionadas con el ambiente volcnico, se
encuentran numerosas unidades asociadas a los centros efusivos del volcn nevado del Huila, el complejo volcnico de los Coconucos, Purac y el volcn Sotar; la mayora de ellos activos y con una actividad histrica importante, a juzgar por la diversidad de flujos de lava, depsitos piroclsticos, cenizas y numerosos rasgos de tipo efusivo y explosivo, muy poco estudiados hasta ahora, pero existen suficientes evidencias que reflejan la actividad histrica de estos complejos volcnicos y algunos de ellos se encuentran activos presentando actividad fumarlica. Sobre la parte alta de la cordillera y siguiendo a lo largo de los valles y laderas de las vertientes se encuentran tambin unidades de origen fluvio-glaciar y fluvio-volcnico, responsables del modelado y suavizacin de los paisajes de alta montaa que cubren la parte alta de la cordillera. Adicionalmente, vale la pena resear que existen otros centros de actividad volcnica, relativamente recientes asociados, a la parte media de las cordilleras centro-oriental, donde nace el ro Magdalena, all son especialmente visibles en los alrededores de San Agustn, San Jos de Isnos, una serie de pequeos conos de 1 a 2 km de dimetro en la base y con crteres de 300 m, que actualmente, sobresalen en la altiplanicie ignimbrtica, formada por las sucesivas emisiones de flujos volcnicos que rellenaron las faldas del flanco oriental de la cordillera centra