Clustering Jerarquico

Archivo: EjemploEstudiantes.csv
modelo<-hclust(dist(Datos),method='complete')
dist(Datos) : calcula la matriz de distancias de la matriz "Datos"
method='complete': agregacion del salto maximo es decir que entre 2 conjuntos ut
iliza la
distancia maxima entre los 2 conjuntos.
plot(modelo)
plot(modelo,hang=-1) : todos inicien de 0
rect.hclust(modelo,k=3,border="red")
agregacion de salto minimo :cuando hay 2 conjuntos
la distancia minima posible entre los elementos de esos conjuntos
modelo<-hclust(dist(Datos),method='single')
plot(modelo)
plot(modelo,k=5,border="rose")
agregacion del promedio:
modelo<-hclust(dist(Datos),method='average')
plot(modelo,k=3,border="green")
agregacion del promedio: es la agregacion que mas se usa
que es en base al centro de gravedad ponderada
modelo<-hclust(dist(Datos),method='ward')
Guardando la tabla de datos con el cluster al que perten
ece cada individuo
Grupo<-cutree(modelo,k=3)
Ndatos<-cbind(Datos,Grupo)
Ndatos
Clustering sobre Componentes Principales
res<-PCA(Datos,scale.unit=TRUE,ncp=5,graph=FALSE)
res.hcpc<-HCPC(res,nb.clust= -1,consol=TRUE,min=3,max=3,graph=FALSE)
min: minimo de cluster
max: maximo de cluster
plot.HCPC(res.hcpc,choice="bar")
grafica los valores propios; indica que sirve trabajar con los componentes 1 y
2 y que la inercia
y que las demas no tienen suficiente inercia acumulada
plot.HCPC(res.hcpc,choice="map")
plot.HCPC(res.hcpc,choice="3D.map",angle=60)
INTERPRETACION
require(rattle)
centros<-centers.hclust(Datos,modelo,nclust=3,use.median=FALSE)
use.median: Es para que use la media por defecto usa la mediana como cen
tro
rownames(centros)<-c("cluster1","cluster2","cluster3")
Cluster 1
barplot(centros[1,],col=c(2,3,4,5,6,7),las=2)
las=2 : Es para las etiquetas en sentido vertical
Interpretacion: Las importacion mas fuertes en el cluster 1 fueron de
guatemala y panama
Cluster 2

barplot(centros[2,],col=c(2,3,4,5,6,7),las=2)
Cluster 3
barplot(centros[3,],col=c(2,3,4,5,6,7),las=2)
barplot(t(centros),beside=TRUE,col=c(2,3,4,5,6,7))
Las importaciones mas grandes son de panama y guatemala
y la menor es de honduras