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Enzima

son molculas de
naturaleza proteica que cataliz
an reacciones qumicas,
siempre que sean
termodinmicamente posibles:
una enzima hace que una
reaccin qumica que es
energticamente posible
(ver Energa libre de Gibbs),
pero que transcurre a
una velocidad muy baja, sea
cinticamente favorable, es
decir, transcurra a mayor
velocidad que sin la presencia
de la enzima

Estructuras y mecanismos:

Las actividades de las enzimas vienen determinadas por su estructura


tridimensional, la cual viene a su vez determinada por la secuencia de
aminocidos.18 Sin embargo, aunque la estructura determina la funcin,
predecir una nueva actividad enzimtica basndose nicamente en la
estructura de una protena es muy difcil, y un problema an no resuelto.

Casi todas las enzimas son mucho ms grandes que los sustratos sobre los
que actan, y solo una pequea parte de la enzima (alrededor de 3 a
4 aminocidos) est directamente involucrada en la catlisis. La regin que
contiene estos residuos encargados de catalizar la reaccin es
denominada centro activo. Las enzimas tambin pueden contener sitios con
la capacidad de unir cofactores, necesarios a veces en el proceso
de catlisis, o de unir pequeas molculas, como los sustratos o productos

(directos o indirectos) de la reaccin catalizada. Estas uniones de la enzima


con sus propios sustratos o productos pueden incrementar o disminuir la
actividad enzimtica, dando lugar as a una regulacin por retroalimentacin
positiva o negativa, segn el caso.

Especificidad:
Las enzimas suelen ser muy especficas tanto del tipo de reaccin que
catalizan como del sustrato involucrado en la reaccin. La forma, la carga y
las caractersticashidroflicas/hidrofbicas de las enzimas y los sustratos son
los responsables de dicha especificidad. La constante de especificidad, es
una medida de la eficiencia de una enzima, ya que la velocidad de la
reaccin se encuentra directamente relacionada con la frecuencia con la
que se encuentran las molculas de enzima y sustrato. Las enzimas tambin
pueden mostrar un elevado grado
de estereoespecificidad, regioselectividad y quimioselectividad.

Dinmica y funcin
la dinmica interna de las enzimas est relacionada con sus mecanismos de
catlisis La dinmica interna se define como el movimiento de diferentes
partes de la estructura de la enzima, desde residuos individuales
de aminocidos, hasta grupos de aminocidos o incluso un dominio
proteico entero. Estos movimientos se producen a diferentes escalas de
tiempo que van desde femtosegundos hasta segundos. Casi cualquier
residuo de la estructura de la enzima puede contribuir en el proceso de
catlisis por medio de movimientos dinmicos.

COFACTORES Y COENZIMAS
Cofactores
Algunas enzimas no precisan ningn componente adicional para mostrar
una total actividad. Sin embargo, otras enzimas requieren la unin de
molculas no proteicas denominadas cofactores para poder ejercer su
actividad. Los cofactores pueden ser compuestos inorgnicos, como los
iones metlicos y los complejos ferrosulfurosos, o compuestos orgnicos,
como la flavina o el grupo hemo. Los cofactores orgnicos pueden ser a su
vez grupos prostticos, que se unen fuertemente a la enzima, o coenzimas,
que son liberados del sitio activo de la enzima durante la reaccin. Las
coenzimas incluyen compuestos como el NADH, el NADPH y el adenosn
trifosfato. Estas molculas transfieren grupos funcionales entre enzimas.

Un ejemplo de una enzima que contiene un cofactor es la anhidrasa


carbnica, en la cual el zinc (cofactor) se mantiene unido al sitio activo, tal y
como se muestra en la figura anterior (situada al inicio de la seccin
"Estructuras y mecanismos"). Estas molculas suelen encontrarse unidas al
sitio activo y estn implicadas en la catlisis. Por ejemplo, la flavina y el
grupo hemo suelen estar implicados en reacciones redox.
Las enzimas que requieren un cofactor pero no lo tienen unido son
denominadas apoenzimas oapoprotenas. Una apoenzima junto con
cofactor(es) es denominada holoenzima (que es la forma activa). La mayora
de los cofactores no se unen covalentemente a sus enzimas, pero s lo
hacen fuertemente. Sin embargo, los grupos prostticos pueden estar
covalentemente unidos, como en el caso de la tiamina pirofosfato en la
enzima piruvato deshidrogenasa. El trmino "holoenzima" tambin puede
ser aplicado a aquellas enzimas que contienen mltiples subunidades, como
en el caso de la ADN polimerasa, donde la holoenzima es el complejo con
todas las subunidades necesarias para llevar a cabo la actividad enzimtica.

Coenzimas: las coenzimas son


pequeas molculas orgnicas
que transportan grupos qumicos
de una enzima a otra. Algunos
de estos compuestos, como
lariboflavina, la tiamina y
el cido flico son vitaminas (las
cuales no pueden ser
sintetizados en cantidad
suficiente por el cuerpo humano y deben ser incorporados en la dieta). Los
grupos qumicos intercambiados incluyen el ion hidruro (H-) transportado
por NAD o NADP+, el grupo fosfatotransportado por el ATP, el
grupo acetilo transportado por la coenzima A, los grupos formil, metenil o
metil transportados por el cido flico y el grupo metil transportado por la SAdenosil metionina.
Debido a que las coenzimas sufren una modificacin qumica como
consecuencia de la actividad enzimtica, es til considerar a las coenzimas
como una clase especial de sustratos, o como segundos sustratos, que son

comunes a muchas enzimas diferentes. Por ejemplo, se conocen alrededor


de 700 enzimas que utilizan la coenzima NADH.
Las coenzimas suelen estar continuamente regenerndose y sus
concentraciones suelen mantenerse a unos niveles fijos en el interior de la
clula: por ejemplo, el NADPH es regenerado a travs de la ruta de las
pentosas fosfato y la S-Adenosil metionina por medio de la metionina
adenosiltransferasa. Esta regeneracin continua significa que incluso
pequeas cantidades de coenzimas son utilizadas intensivamente. Por
ejemplo, el cuerpo humano gasta su propio peso en ATP cada da.

Clula procariota
Se llama procariota o procarionte a las clulas sin ncleo
celular definido, es decir, cuyo material gentico se encuentra disperso en
el citoplasma, reunido en una zona denominada nucleoide.1 Por el contrario,
las clulas que s tienen un ncleo diferenciado del citoplasma, se
llaman eucariotas, es decir aquellas cuyo ADN se encuentra dentro de un
compartimento separado del resto de la clula.

Estructura celular
La estructura celular procariota bsica tiene los siguientes componentes: 2

Membrana plasmtica

Pared
celular (excepto
en micoplasmas y te

rm

oplasmatos)

Citoplasma

Nucleoide

Ribosomas

Compartimentos procariotas. Se han identificado compartimentos que


parecen tener el propsito de resguardar o llevar a cabo ciertos tipos de
tareas especializadas. Algunos de ellos son Clorosomas, Carboxisomas,
Anammoxosomas, Ficobilisomas, Proteosomas y Magnetosomas.

Adicionalmente tambin puede haber:

Flagelo(s)

Membrana externa (en bacterias Gram negativas)

Periplasma

Cpsula

Inclusiones citoplasmticas (nutrientes y vesculas de gas)

Pili o fimbrias

Glicoclix

Biopelcula

Capa S

Formacin de esporas.

Plsmidos

Mesosoma

Nutricin
a nutricin puede ser auttrofa (quimiosntesis o fotosntesis)
o hetertrofa (saprofita, parsita o simbitica). En cuanto al metabolismo los
organismos pueden ser: anaerobiosestrictos o facultativos, o aerobio.

La quimiosntesis es la conversin biolgica de molculas de


un carbono y nutrientes en materia orgnica usando la oxidacin de
molculas inorgnicas como fuente deenerga, sin el empleo de luz solar,
a diferencia de la fotosntesis. Una gran parte de los organismos
vivientes basa su existencia en la produccin quimiosinttica en fallas
termales, cepas fras u otros hbitats extremos a los cuales la luz solar
es incapaz de llegar.

La fotosntesis es la base de la vida actual en la Tierra. Consiste en


una serie de procesos mediante los cuales las plantas, algas y
algunas bacterias captan y utilizan la energa de la luz para transformar
la materia inorgnica de su medio externo en materia orgnica que
utilizan para su crecimiento y desarrollo.

Los organismos capaces de llevar a cabo este proceso se denominan


fottrofos y si adems son capaces de fijar el CO2 atmosfrico (lo que
ocurre casi siempre) se llaman auttrofos. Salvo en algunas bacterias, en el
proceso de fotosntesis se producen liberacin de oxgeno molecular
(proveniente de molculas de agua) hacia la atmsfera(fotosntesis
oxignica).
Es ampliamente admitido que el contenido actual de oxgeno en la
atmsfera se ha generado a partir de la aparicin y actividad de dichos
organismos fotosintticos. Esto ha permitido la aparicin evolutiva y el
desarrollo de organismos aerobios capaces de mantener una alta tasa
metablica (el metabolismo aerobio es muy eficaz desde el punto de vista
energtico).
La otra modalidad de fotosntesis, la fotosntesis anoxignica, en la cual no
se libera oxgeno, es llevada a cabo por un nmero reducido de bacterias,
como las bacterias prpuras del azufre y las bacterias verdes del azufre;
estas bacterias usan como donador de hidrgenos el H2S, con lo que
liberan azufre.

Nutricin saprofita: es a base de restos de animales o vegetales


en descomposicin.

Nutricin parsita: obtienen el alimento de un hospedador al que

perjudican pero no llegan a matar.


Nutricin simbitica: los seres que realizan la simbiosis obtienen la

materia orgnica de otro ser vivo, el cual tambin sale beneficiado.

Reproduccin
Se da de dos maneras: reproduccin asexual o parasexual
Reproduccin asexual por biparticin o fisin binaria: es la forma

ms sencilla y rpida en organismos unicelulares, cada clula se parte


en dos, previa divisin del material gentico y posterior divisin de
citoplasma (citocinesis).
Reproduccin parasexual, para obtener variabilidad y adaptarse a

diferentes ambientes, entre las bacterias puede ocurrir intercambio de


ADN como la conjugacin, la transduccin y la transformacin.

Conjugacin: Proceso que ocurre cuando una bacteria hace


contacto con otra usando un hilo llamado PILI. En el momento en el
que los citoplasmas estn conectados, el individuo donante
(considerado como masculino) transfiere parte de su ADN a otro
receptor (considerado como femenino) que lo incorpora (a travs del
PILI) a su dotacin gentica mediante recombinacin y lo transmite a
su vez al reproducirse.

Transduccin: En este proceso, un agente transmisor, que


generalmente es un virus, lleva fragmentos de ADN de una bacteria
parasitada a otra nueva receptora, de tal forma que el ADN de la
Bacteria parasitada se integra al ADN de la nueva bacteria.

Transformacin: Una bacteria puede introducir en su interior


fragmentos de ADN que estn libres en el medio (plsmidos). Estos
pueden provenir del rompimiento o degradacin de otras bacterias a
su alrededor.

Clasificacin

Segn su morfologa
.

Coco es un tipo morfolgico de bacteria. Tiene forma ms o menos


esfrica (ninguna de sus dimensiones predomina claramente sobre las
otras).

Los bacilos son bacterias que tienen forma de bastn, cuando se


observan al microscopio. Los bacilos se suelen dividir en:

Bacilos Gram positivos: fijan el violeta de genciana (tincin de


Gram) en la pared celular porque carecen de capa
delipopolisacridos.

Bacilos Gram negativos: no fijan el violeta de genciana porque


poseen la capa de lipopolisacrido.

Vibrio es un gnero de bacterias, incluidas en el grupo gamma de


las proteobacterias. Varias de las especies de Vibrio sonpatgenas,
provocando enfermedades del tracto digestivo, en especial Vibrio
cholerae, el agente que provoca el clera, y Vibrio vulnificus, que se
transmite a travs de la ingesta de marisco.

Los espirilos son bacterias flageladas de forma helicoidal o de espiral.


Se desplazan en medios viscosos avanzando en tornillo. Su dimetro es
muy pequeo, lo que hace que puedan atravesar las mucosas; por
ejemplo Treponema pallidum que produce la sfilis en el hombre. Son
ms sensibles a las condiciones ambientales que otras bacterias, por ello
cuando son patgenas se transmiten por contacto directo (va sexual) o
mediante vectores, normalmente artrpodos hematfagos

De izquierda a derecha: Cocos, espirilos y bacilos

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