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Taxonoma

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Para clasificaciones no biolgicas, vase Clasificacin.

rbol filogentico, en este caso con forma de dendrogramanota 1 , como cada nodo del
dendrograma se corresponde con un clado, entonces es un cladograma. Cada clado agrupa a
todos los descendientes de una poblacin ancestral comn, es decir es un grupo monofiltico.
Los nodos terminales (aqu simbolizados por letras individuales) no pueden ir ms all de las
especies, ya que por definicin, por debajo de la categora especie las poblaciones no
evolucionan como linajes independientes.

rbol filogentico (en este caso, las lneas representan la secuencia de organismos ancestros y
descendientes, es un filogramacita 1 ) que muestra un ejemplo de diversificacin de una especie
ancestral en tres especies presentes en la actualidad. Cada nodo del rbol (como el marcado con
un crculo rojo) representa la divergencia de un linaje ancestral en dos linajes que evolucionan
independientemente, esto es, que adquieren su propio set de cambios evolutivos. En barras rojas
se muestran las apomorfas: los nuevos estados del carcter. Un cladograma se puede interpretar
como una secuencia de ancestros y descendientes, lo cual es una hiptesis que se superpone al
dendrograma obtenido al determinar las apomorfas de los linajes ancestrales. No todos los
investigadores estn de acuerdo en interpretar un cladograma de esta forma, porque por ejemplo
la historia filogentica del grupo puede no haberse dado en forma de cladognesis.cita 2

Del rbol filogentico se puede derivar una clasificacin de los organismos. Los taxones
terminales se circunscriben y agrupan en taxones de rango sucesivamente ms alto. Los
anidamientos deben tener congruencia o "consistencia lgica" con el rbol filogentico, aunque
la forma en que se tiene que dar esta consistencia est en discusin.14 Ntese que la clasificacin
tiene forma de dendrograma.
La taxonoma (del griego , taxis, ordenamiento, y , nomos, norma o regla) es, en
su sentido ms general, la ciencia de la clasificacin. Habitualmente, se emplea el trmino para
designar a la taxonoma biolgica, la "teora y prctica de clasificar organismos"15 16 cita 3 . La
clasificacin biolgica como se la entiende en la actualidad tiene que ser congruente con el rbol
filogentico siempre que se disponga de ste, en ella, los organismos se agrupan en taxones
mutuamente excluyentes a su vez agrupados en taxones de rango ms alto tambin mutuamente
excluyentes, de forma que todos los organismos pertenecen a uno y slo un taxn de cada rango
o "categora taxonmica". En cada taxn de cada categora, los organismos poseen caracteres
(singular carcter) cuyos estados del carcter los diferencian de los organismos fuera del taxn, y
son los que en conjunto se utilizan para delimitar los taxones. La mayoracita 4 de los especialistas
ve a las especies, a las que ubican en taxones en la categora taxonmica del mismo nombre,
como una realidad objetiva, y a los diferentes conceptos de especie como diferentes
aproximaciones para reconocer esos linajes que evolucionan independientemente, por lo que a
pesar de las discrepancias acerca de los lmites de cada una suele ser considerada la categora
taxonmica ms importantecita 5 en la clasificacin.
La taxonoma biolgica es aqu tratada como una subdisciplina de la biologa sistemtica, que
adems tiene como objetivo la reconstruccin de la filogenia, o historia evolutiva, de la vida.cita 6
Como aqu comprendida la taxonoma abarca los criterios para la delimitacin y categorizacin
de taxones en una clasificacin, su nomenclatura formal, y tambin las herramientas para la
determinacin o identificacin de especmenes.cita 6 Teniendo en cuenta que slo el 10% de las
especies del planeta est descripto, y que esas descripciones son hiptesis con diferentes grados
de resolucin, la determinacin funciona recursivamente con la descripcin y delimitacin de
especies en el rea llamada alfa-taxonoma o taxonoma descriptiva.
Los taxones supraespecficos son los que agrupan especies y se jerarquizan en categoras
taxonmicas de rango cada vez ms alto: gnero (grupo de especies), familia, etc. hasta el reino.
En esta rea tambin hay un debate sobre el concepto de taxn a utilizar, an inconcluso. Muchos
especialistas afirman que slo los criterios para agrupar los organismos en taxones de la escuela
cladista logran que la clasificacin ofrezca el servicio que se espera de ella al resto de las ramas
de la biologa, pero la escuela evolucionista tiene razones para delimitar con otros criterios los
taxones, y se atribuye la creacin de sistemas de clasificacin ms tiles y predictivos.

La taxonoma tambin se ocupa de debatir y actualizar los Cdigos de Nomenclatura, que


definen el sistema taxonmico en uso y reglamentan los nombres de los taxones que lo
componen con el objetivo de proveer la mxima estabilidad en la nomenclatura. Los Cdigos no
evitan las diferencias entre taxnomos en los conceptos taxonmicos a utilizar ni en la alfa ni en
la beta taxonoma que son una fuente de inestabilidad frecuente en los nombres de los taxones.
La historia de la taxonoma ha sido largamente recorrida por stos y otros interrogantes y a lo
largo de ella fueron formndose el sistema de clasificacin y las reglas que nos han quedado
como legado.
La nueva crisis de biodiversidad, los avances en el anlisis del ADN, y la posibilidad de
intercambiar informacin a travs de internet, han revitalizado a esta ciencia en el ambiente
cientfico desde las dcadas de 1990-2000, y han generado un debate acerca de la necesidad de
hacer reformas sustanciales a los Cdigos. Algunas de estas propuestas son el "BioCode", el
"PhyloCode", el agregado de atributos al tipo nomenclatural como podran ser los nuevos
"marcadores de ADN" (ADN barcodes), y las relacionadas con la informatizacin de los datos y
la utilizacin formal de Internet.

ndice
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1 Definicin de taxn

2 La taxonoma segn las diferentes escuelas

3 Los dos objetivos de los sistemas de clasificacin

4 Construyendo una clasificacin

5 La clasificacin en la categora especie

6 Nomenclatura biolgica
o 6.1 Categora taxonmica
o 6.2 Nombre cientfico
o 6.3 Por qu cambian los nombres de los taxones?

7 Determinacin o identificacin de especmenes

8 Historia de la taxonoma

o 8.1 De la taxonoma linneana al origen de los Cdigos


o 8.2 Taxonoma y evolucin
o 8.3 Formalizacin de las normas: los Cdigos
o 8.4 Relacin con las taxonomas populares

9 Perspectivas actuales de la ciencia de la Taxonoma


o 9.1 El impedimento taxonmico
o 9.2 El rol del ADN y los "marcadores de ADN"
o 9.3 La crisis de biodiversidad
o 9.4 Biodiversidad informtica
o 9.5 La armonizacin de los Cdigos y el BioCode
o 9.6 Propuestas de un registro central de nombres
o 9.7 El PhyloCode

10 Vase tambin

11 Notas

12 Citas

13 Referencias citadas

14 Bibliografa general utilizada como referencia

15 Enlaces externos

Definicin de taxn[editar]
El taxn es un grupo de organismos con circunscripcin, posicin y rango. De la estructura de la
clasificacin biolgica como dada en la introduccin, comnmente llamada "taxonoma
linneana" (pero vercita 7 ), se deriva la definicin de taxn, que como explicitan los Cdigos de
Nomenclatura,cita 9 es un grupo de organismos que posee:

circunscripcin: el conjunto de caracteres extrados de los organismos que lo componen


que, junto con la regla de decisin propuesta al observalos, diagnostican al taxn,
establecen sus lmites o lo delimitan, vuelven al taxn nico, diferencian sus organismos
claramente de los organismos fuera del taxn; la circunscipcin se define en funcin de
poder determinar si un organismo nuevo pertenece o no al taxn mediante la observacin
de sus caracteres segn el protocolo dado, y ella puede incluir idealmente o no una lista
de caracteres diagnsticos (presentes en ese taxn y slo en ese taxn), el trmino
aristotlicocita 8 "definicin" se sigue utilizando en el Cdigo de Zoologa para referirse a
la descripcin exhaustiva que debera hacerse de un taxn al nombrarlo, de la que se
extraera la circunscripcin;cita 9

Una jerarqua absolutanota 2 o rango llamada categora taxonmica,

y una posicin taxonmica formada por los taxones que lo contienen.

El taxn se redefine segn la taxonoma, el "sistema" taxonmico, del que se est derivando, si
bien la circunscripcin es necesaria para ubicar organismos nuevos en su respectivo taxn y por
lo tanto, fundamental en todas las clasificaciones. As, puede ser modificada su definicin para
adaptarse a taxonomas que no utilizan rangos absolutos, o por taxnomos que definen los
taxones de formas ms restringidas, pero las filosofas taxonmicas que han formado tres
escuelas de la sistemtica que dejaron un legado a la materia, se diferencian en el concepto que
debe utilizarse para aglomerar los organismos en taxones, es decir su definicin conceptual, su
delimitacin conceptual, el concepto que relaciona los organismos del taxn ms entre s que con
los dems organismos, los diferentes "conceptos de taxn" o "conceptos taxonmicos"cita 10 .

La taxonoma segn las diferentes escuelas[editar]

Un cladocita 1 en una definicin ms rigurosa es el conjunto de organismos en las poblaciones


actuales (en naranja) que se hipotetiza que son todas las descendientes de una secuencia de
ancestros y descendientes con ancestro comn (en naranja y blanco). Pero se puede ser ms
riguroso todavacita 2 .
Segn la escuela cladista, la que predomina hoy en da,cita 12 la taxonoma es la ciencia que debe
decidir qu clados del rbol filogentico sern "convertidos" o representados por taxones y en
qu categora taxonmica ubicarlos.cita 13

Si bien en los libros de texto el clado en general se define como "una secuencia de una poblacin
ancestral y todos sus descendientes", resulta ser una definicin poco rigurosacita 1 : el clado, como
lo utilizan los taxnomos, agrupa slo poblaciones vivientes o al menos las que se utilizaron para
tomar los datos, las que en el mtodo original de Hennig el fundador35 , o la "voz ms
articulada"33 del cladismo se asocian como descendientes de un mismo linaje cuando se
"encuentran" o determinan sus apomorfas: los cambios de carcter en el linaje ancestral.cita 1
Otras formas de anlisis filogentico como los mtodos fenticos (cuyo punto de partida es ciego
en lo que respecta a la evolucin de los caracterescita 14 cita 15 ) fueron incorporados a la definicin
de clado, de forma que pueden hipotetizar un "clado" (poblaciones agrupadas por poseer
caracteres compartidos desde el ancestro comn ms reciente) mediante mtodos de anlisis no
Hennigianos.cita 1 El lector interesado puede recurrir a las siguientes lecturas, listadas en Judd et
al. (200718 ): Farris (197948 ), Donoghue y Cantino (198849 ), Nelson y Platnick (19815 ),
Humphries y Parenti (198650 ), Brooks y McLennan (199151 ), Forey et al. (199252 ), Cracraft y
Donoghue (200453 ).
"Clado" proviene de cladognesis.cita 1 Los grupos descendientes de un linaje comn y nico se
llaman grupos monofilticos (mono: nico, phylum: linaje) sensu Hennig,cita 11 y los trminos
usualmente son utilizados como sinnimos (pero vercita 2 ). Los taxones que representan grupos
monofilticos se llaman "taxones monofilticos", y las apomorfas del clado que representan, que
pueden haberse encontrado, no alcanzan normalmente como circunscripcin. Las apomorfas
pueden haberse perdido en algunos miembros del grupo y pueden ser compartidas por otros
clados que las hubieran adquirido independientemente. Slo despus de haber obtenido una
circunscripcin y decidido una categora se puede considerar al grupo un taxn y decidir si
nombrarlo segn las reglas formales de nomenclatura.

La taxonoma en la actualidad. La taxonoma (definida segn la escuela cladista) decide qu nodos del
rbol filogentico (cladoscita 1 ) se correspondern con taxones con su circunscripcin, posicin taxonmica,
categora taxonmica, y nombre formal o cientfico.

Hay otras escuelas de clasificacin. Quizs la ms importante, dentro de las "minoritarias"cita 12 es


la que considera que los grupos parafilticos tambin deberan ser representados por taxones
nombrados formalmente, si los grupos que los conforman son lo suficientemente similares entre
s y lo suficientemente dismiles del clado que queda afuera (escuela evolucionistacita 16 ). Los
autores listados en Judd et al. 200718 para el lector interesado: Simpson 1961,15 Ashlock 1979,57
Cronquist 1987,59 Mayr y Ashlock 1991,16 Stuessy 1983,60 200961 , Stevens 198662 . Ejemplos de
"taxones parafilticos" que se utilizan en las "clasificaciones evolucionistas" son los procariotas
(parafilticos con respecto a los eucariotas) en el clsico sistema de clasificacin en reinos
iniciado por Whittaker (196963 Margulis 197164 ) y que hoy se sigue utilizando (p.ej. CavalierSmith 1998cita 17 ), y las dicotiledneas, parafilticas con respecto a las monocotiledneas (p.ej.
Takhtajan 200965 ).

Comparacin de rboles filogenticos de grupo monofiltico, grupo parafiltico y grupo


polifiltico. Dibujado a partir de Cavalier-Smith (201035 ).
Otra escuela que fue encabezada por RR Sokal y PHA Sneath66 (Sokal y Sneath 196342 , Sneath y
Sokal 197367 , comentarios de los autores originales en Sokal 19862 y Sneath 199566 ) recordaba
que como no haba forma de testear si eran verdaderas las "hiptesis previas" sobre evolucin,
los razonamientos se hacan circulares: los "grupos preferidos" determinan las "apomorfas
preferidas" que a su vez determinan los "grupos preferidos".cita 18 En los '60 cada autor de una
clasificacin propona un rbol completamente distinto y eran pocos los grupos que se mantenan
entre autores. Sokal y Sneath no slo presentaban novedosos mtodos de anlisis "numricos"nota
3
cuantitativos que sacaban provecho de las en ese momento novedosas computadoras, sino
que tambin eran mtodos "fenticos"nota 3 : intentaban no asumir hiptesis de evolucin para
armar el rbol, que deba buscarse siempre que existiera la posibilidad.cita 14 cita 19 En las ltimas
dcadas, en que "toda la sistemtica es en alguna forma numrica"66 , esta escuela fentica perdi
visibilidad debido a la cantidad de caracteres que se obtienen a su vez de cantidad de lneas de
evidencia diferentes, a las tradicionales se sumaron los anlisis moleculares de ADN, los
caracteres bioqumicos y de ultraestructura, de forma que, a medida que se agregan hiptesis
evolutivas para aumentar la congruencia entre lneas de evidencia diferentes, los taxnomos van
llegando a un consenso acerca de cules sern las "verdaderas" de ellas con las que estimar la
filogenia, con las que inferir las relaciones cladsticas.cita 19 Desde los '90 o '2000 la sistemtica

vivi momentos emocionantes: se empezaba a vislumbrar un nico rbol predictivo y robusto, y


efectivamente, muchos grupos fueron abandonados por no estar basados en hiptesis evolutivas
correctas, incluidos algunos de larga data que causaron mucha sorpresa. Los autores enfatizaban
que slo propusieron mtodos de anlisis3 , esta tradicionalmente llamada "escuela"cita 16 dej
como legado a la sistemtica interesantes mtodos de anlisis numrico que fueron slo una parte
de importantes avances numricos en anlisis filogentico, sistemtica molecular, anlisis
morfomtrico e identificacin numrica.66
Hoy, las clasificaciones cladistas predominan por sobre las evolucionistas.cita 12 Las dos escuelas
admiten que se necesitan nombres tanto para los grupos parafilticos como para los
monofilticos que los abarcan, la discusin entre cladistas y evolucionistas radica en cul es el
sistema de nombres que debera formalizarse en una clasificacin.cita 20 Los evolucionistas
formalizan nombres de grupos parafilticos, y mencionan con nombres informales los grupos
monofilticos no clasificados (por ejemplo Cavalier-Smith 1998 en adelantecita 17 formaliza los
reinos y nombra los supergrupos de eucariotas sin formalizarlos), mientras que los cladistas
formalizan slo grupos monofilticos, llamando con nombres informales a los grupos
parafilticos (por ejemplo Adl et al. 200587 formalizan los supergrupos de eucariotas y proponen
el nombre informal procariotas o bacterias para ese grupo parafiltico).

Los dos objetivos de los sistemas de clasificacin[editar]


Ms all de los resultados de los anlisis filogenticos, la formalizacin de taxones en sistemas
de clasificacin es realizada con miras de ser un servicio para todo un abanico de usuarios
finales, quienes coinciden en dos objetivos que no siempre pueden hacerse coincidir:

Deben permitir hacer identificaciones.18 cita 21 , para lo que cada taxn debe estar
claramente delimitado: un especmen encontrado del que se pudieran extraer los estados
de sus caracteres, siempre debera poder ubicarse en un taxn conocido. Los cientficos
en todas las disciplinas deben utilizar los taxones como unidad de trabajo, y publicar los
resultados de sus trabajos en relacin con el taxn estudiado: un taxn funciona como
contenedor de informacin para el almacenamiento y recuperacin de datos. Por lo tanto
los nombres cientficos de los organismos, los taxones formales, deben representar el
consenso de la comunidad cientfica, slo de esta forma funcionan como llave de acceso
a un cuerpo de informacin que refiere siempre al mismo grupo de organismos, aunque
est disperso en libros y revistas escritos en muchas lenguas por diferentes autores, o
proceda de diferentes campos de la biologa o la divulgacin: como idealmente hacen
referencia los taxnomos, "El nombre de un organismo es la llave hacia su literatura"cita 22

Deben permitir hacer predicciones.18 cita 21 . Por ejemplo, cuando se encuentra un


compuesto de inters mdico en una planta, es comn que haya inters en investigar si
ese compuesto u otros similares se encuentran tambin en otras especies emparentadas
con ella.18

La decisin de si armar la clasificacin para predecir o para identificar recorri toda la historia de
la taxonoma. Los dos objetivos coincidiran en una clasificacin que fuera al mismo tiempo
"natural" como "artificial",cita 23 con claves de identificacin que la reensamblen en grupos con

parecidos superficiales y por lo tanto muy poco predictivos, pero con las que se llega con
facilidad al taxn terminal.cita 21 La dificultad radica en que si se hace el ejercicio de buscar un
solo carcter que sea diagnstico de un taxn (si el organismo posee un estado del carcter,
pertenece al taxn, si posee otro estado, no pertenece al taxn, invariablemente), se notar que
esta bsqueda puede fallar al menos potencialmente en todos los grupos "naturales", debido a
que todos los caracteres son inestables en algn grado y pueden evolucionar, y esto puede
suceder tambin si se toma un conjunto de caracteres. La forma alternativa de circunscripcin es
proponer los estados de forma probabilstica, esto es, un organismo es miembro de un taxn si
posee un nmero muy alto de estados de caracteres similares a la descripcin del taxn,
especialmente de los poco lbiles.cita 24 Aqu se encuentra la diferencia fundamental entre las
clasificaciones "naturales" y las "artificiales": en la clasificacin natural, la determinacin es una
probabilidad, es decir que un porcentaje de veces se espera que la determinacin est
equivocada. Esto es porque el grupo existe independientemente de si el taxnomo lo
circunscribi correctamente, e independientemente de la clave de identificacin utilizada. En las
clasificaciones artificiales, la determinacin, aunque provenga de un pesaje probabilstico de los
caracteres, siempre es la correcta, aunque el grupo no resulte ser lo que el taxnomo tena en
mente. El trabajo del taxnomo se manifiesta en su habilidad para corregir los grupos artificiales
creados por el hombre de forma de acercarlos cada vez ms a los grupos naturales con cada
agregado de informacin nueva.nota 4
Si un grupo "natural" es un grupo "predictivo" y esto, en taxones superiores a especie, se logra
debido al nmero de caracteres medidos y no medidos compartidos por los miembros del grupo,
entonces la "naturalidad" de los grupos ser una cuestin de grado, y habr grupos ms o menos
similares, o ms o menos "naturales".cita 23 Su componente ms importante es el histrico o
filogentico,2 que es el que ofrece impresas en sus similitudes fenticas las restricciones
construccionales que restringen las direcciones en la evolucin del grupo de una forma que no
puede ser explicada por factores ecolgicos.35 Tanto cladistas como evolucionistas se adjudican
las clasificaciones con mayor valor predictivo, o "ms naturales" (p.ej. Cavalier-Smithcita 25 ,
Mayrcita 26 , Platnickcita 27 , Hrandl y Stuessycita 28 ).

Construyendo una clasificacin[editar]


Hoy en da los taxnomos, aun dentro de la escuela cladista (p. ej. Judd et al. 200718 :33), tienen
claro que no es de utilidad que cada clado o concepto de taxn por arriba de especie se formalice,
es decir se corresponda con un "taxn nombrado". Las decisiones a la hora de sintetizar el rbol,
inevitables, pueden parecer un poco arbitrariascita 29 , pero se pueden generalizar algunos criterios
(18 :32-35):
1. El criterio principal es la fuerza de la evidencia que respalda al grupo18 : para convertir un
grupo en taxn nombrado debe haber un anlisis filogentico que lo respalde de forma
robusta, sobre la base de ms de una lnea de evidencia de forma que todas ellas muestren
congruencianota 5 . Segn Judd et al.18 esto se evidencia en una cantidad importante de
apomorfas que definan su ancestro.

2. Debe haber una cantidad de caracteres diagnsticos que permitan diferenciarlo


claramente del resto de los taxones.18 Segn algunos sistemticos cada taxn debera
poder ser diagnosticado morfolgicamente en lo posible (p.ej.18 ,99 ).
3. Deberan poder inferirse aspectos de su biologa nicos a ese taxn, para ello debera
tener caracteres morfolgicos interesantes ("obvios") que permitan que el taxn se
comporte como una unidad predictiva (Judd et al. 200718 :33).
4. Algunos autores18 afirman que los taxones deberan tener, en lo posible, entre tres y siete
subtaxones, un nmero que puede manejar con facilidad la memoria humana.100 En las
palabras de Davis y Heywood (196388 :83): "Debemos ser capaces de ubicar a los taxones
en taxones de categora ms alta de forma que podamos encontrarlos de nuevo". Los
sistemas de clasificacin permiten la creacin de categoras intermedias hasta lograr el
nmero de taxones deseados en cada una.
5. Por estabilidad de la nomenclatura, los taxones que ya han sido nombrados en el pasado
deben continuar con el mismo nombre en lo posible, a menos que haya fuertes
justificaciones para abandonarlos.
Hay dos criterios para decidir la categora taxonmica. Uno es el tradicional, el que existe desde
los inicios de la clasificacin y es anterior a la teora de la evolucin, el que decide la categora
taxonmica segn el grado de variacin del plan corporal entre taxones.35 A partir de la teora de
la evolucin, se interpreta a la categora taxonmica como la que deriva de un grupo de
apomorfas que aportan cierto grado de variacin en el plan corporal del taxn en relacin a los
dems taxones en la misma categora.35 Entonces los reinos y los filos (las categoras ms altas)
derivan de transformaciones evolutivas importantes que definieron de nuevo el plan corporal, a
las que sigui un batalln de novedades evolutivas forzadas a adaptarse al nuevo cambio,
mientras que las categoras ms bajas, como gneros y especies, poseen variaciones en caracteres
ms triviales, y por lo tanto ms inestables.35 Esta construccin de categoras, basada en
variacin de caracteres ms a menos estables, es la que lleg hasta nuestros das y prob ser til
para los usuarios finales de una clasificacin (ej. Cavalier-Smith 201035 ). Otro criterio de
clasificacin en categoras fue el iniciado por Hennig (1950,31 196632 ), quien propona que la
edad geolgica absoluta de un grupo fuera el criterio para decidir su categora taxonmica, y si
bien hay cientficos trabajando para lograr esta meta en algunos grupos101 segn otros parece ser
un concepto abandonadonota 6 . Las categoras resultaron ser tiles para los objetivos de la
clasificacin (ej.102 103 ,104 ), pero algunos autores las desestiman por considerarlas arbitrariasnota 7 y
hasta los hay que proponen eliminar el sistema de clasificacin con categoras (por ejemplo en de
Queiroz 2006nota 8 ). Por razones histricas se utilizan las categoras linneanas de clasificacin:
reino, filo o divisin, clase, orden, familia, gnero y especie.

La clasificacin en la categora especie[editar]


Un "concepto de taxn" particular es el de especie. La mayora de los especialistas ve las
especies, a las que ubican en taxones en el rango o categora taxonmica del mismo nombre,
como un "taxn natural", una realidad objetivacita 4 , haciendo uso los diferentes conceptos de
especie de las diferentes aproximaciones o las diferentes propiedades emergentes en el nivel de

organizacin del linaje que evoluciona independientemente, esto es, que adquiere su propio set
de cambios evolutivos. A diferencia de la situacin en los rangos ms altos, el hecho de que este
rango es objetivo y que existe al menos entre o en forma de dos cotas superior e inferior es poco
cuestionado en la prctica, le es intuitivo al lego107 , y es el concepto que hace que cobren sentido
objetivos de otras ramas como "conservar todas las especies": un linaje que se pierde no puede
ser regenerado sin cambios evolutivos en linajes emparentados. Pero como no se sabe cmo van
a evolucionar los linajes y por lo tanto cules de las delimitaciones posibles constituyen una
"unidad evolutiva" en proceso de especiacin, o cul considerar la "unidad evolutiva especie"
cuando diferentes caracteres evolucionan de a grupos de tamaos diferentes, la delimitacin a
veces se vuelve enteramente una cuestin de consenso.

Las gaviotas del gnero Larus presentan alrededor del rtico un anillo de poblaciones cuyos
extremos no son interfrtiles. Los taxnomos reconocen entre 2 y 8 especies. En base a este
grfico en el primer concepto taxonmico de la taxonoma moderna Linneo hubiera nombrado 7
"tipos" en correspondencia con los 7 nombres vulgares, y hubiera reconocido la existencia de
hbridos entre ellos, dejando a resolver el dilema de los lmites de cada especie.
Un linaje, una especie, consta de una o un grupo de poblaciones, que tambin son difciles de
definir. Normalmente se definen como un grupo de individuos de una misma especie que ocupan
una regin geogrfica ms o menos bien definida y con los individuos interactuando entre s.18
Estas "interacciones" no slo refieren al intercambio de genes que puede haberlo o no segn su
tipo de reproduccin sino tambin al hecho de que compiten por los mismos recursos, comparten
las mismas condiciones, son afectados por los mismos gremios de predadores, patgenos y
parsitos y de competidores interespecficos por algn recurso, y se reproducen y dispersan por
los mismos mecanismos, por lo que la poblacin sufre adems de los avatares del azar una
seleccin de genes mediante la supervivencia y reproduccin sexual o asexual de aquellos
individuos que los porten y cuya descendencia eventualmente ocupa el nicho que ocupaban los
dems. (El nicho en ecologa se define en funcin de la supervivencia del linaje: las
caractersticas ecolgicas del gnero o rangos superiores no alcanzaran para explicar cmo
sobreviven sus linajes; algunos taxnomos pueden utilizar una definicin ms amplia de nicho
para referirse a los espacios dimensionales que acotan el nicho de las especies involucradas en
taxones superiores, concepto que otros prefieren llamar "zonas adaptativas".nota 9 ) Estas

interacciones entre individuos son definidas tradicionalmente como "cohesin",cita 30 un concepto


que considera un nmero de factores para definir los linajes ms que la posibilidad de hibridar
pero no siempre los delimita en unidades discretas: la cohesin es una cuestin de grado, las
poblaciones se comunican entre s por "corredores" que las mantienen ms o menos cohesivas y
quizs a diferente grado en cada aspecto a evolucionar, y cada concepto de especie utilizado
puede dar resultados diferentes. Incluso si se llega a un acuerdo en estos grados los linajes
pueden constar de un continuum espacial con extremos no relacionados entre s y que entre ellos
pueden ser divididos en unidades de forma arbitraria.132 Esto llevara incluso a clasificaciones
incompatibles, cuando sus delimitaciones se solapan.107 133 En la bsqueda de la categora se
puede reconocer una cota inferior (una poblacin que no sobrevive sin su metapoblacin, es
decir que no es independiente, no es una especie) y una superior (por ejemplo, la descripcin de
un gnero no debera alcanzar para explicar cmo sobrevive cada uno de sus linajes, cmo se
mantiene su "continuidad" en el tiempo). Esa bsqueda al menos hoy en da parece ser
infructuosa en algunos taxones, especialmente microbios de reproduccin asexual, cuya cohesin
parece ser un continuum, en el que todas las categoras parecen ser arbitrarias.132
De los conceptos de especie, que son "casi tantos como especialistas dispuestos a discutirlos",
dos tuvieron importantes implicancias en la estabilidad de la nomenclatura y en las ramas de la
ciencia que los utilizan.107 Uno es el "concepto de especie biolgica" o BSC (biological species
conceptcita 31 ), que delimita a la especie como el grupo de poblaciones que puede hibridar entre s
y dar descendencia frtil, que no subdivide las comunidades reproductivas a menos que se
mantengan aisladas en simpatra, y es el concepto ms utilizado, o al menos el ms invocado,
desde su articulacin por E Mayr en los 1940-1960 hasta los '1980-'1990; el otro que gan
popularidad en las ltimas dcadas es el "concepto de especie filogentica" o PSC (phylogenetic
species conceptcita 32 ), que divide las comunidades reproductivas en un grano ms fino segn si
conservan caracteres en un anlisis de filogenia, y en muchos taxones, incluso en algunos que
parecan muy estables como Primates, se superpuso su clasificacin a la del BSC.107
Una de las intenciones del BSC como formulado por E Mayr era en parte minimizar la confusin
causada por la multitud de razas o variedades geogrficas o ecotipos dentro de las especies
biolgicas mediante el no reconocimiento de esas variedades como especies separadas salvo que
se mantengan reproductivamente aisladas en simpatra.132 Esto es porque la prctica habitual es
que se describan las especies de una pequea regin dada, que en esa regin estn bien aisladas
reproductivamente, pero un intento de integrar la informacin entre regiones ofrece una situacin
en que es comn un continuum de tipos intermediarios.132 Pero entre ellos puede haber diferentes
grados en la capacidad de hibridar, y quizs en un 10% de las especies biolgicas de animales y
un porcentaje ms alto de plantas y microbios se encuentren hbridos y no necesariamente con
especies hermanas.132 Habiendo decidido el concepto de especie a utilizar, todava se suman a la
incertidumbre las inconsistencias histricas entre la delimitacin prctica -normalmente fenticay la delimitacin conceptual de las especies132 , y debido a que los diferentes aspectos de la
cohesividad se pueden dar a diferente grado se siguen encontrando diferencias entre taxnomos a
los que se ha denominado "divisores" (splitters) y "agrupadores" (lumpers) (107 misma
terminologa que en taxones superiores134 :238-241). El requerimiento clave en estos casos es que
los cientficos sean explcitos acerca de qu concepto taxonmico y qu mtodo para alcanzar su
delimitacin estn siendo utilizados, de forma de poder superponerlas y utilizarlas

sincronizadamente cuando eventualmente se encuentran dos clasificaciones describiendo la


misma regin.107 132

Nomenclatura biolgica[editar]
Nomenclatura biolgica redirige aqu. Para otras acepciones, vase Nomenclatura
(desambiguacin).
El ltimo paso en una clasificacin consiste en buscar qu nombre cientfico le corresponde al
taxn o averiguar si se necesita publicar uno nuevo, y eso se hace segn las reglas escritas en los
Cdigos Internacionales de Nomenclatura. Por razones histricas hay un Cdigo para cada
disciplina: de Zoologa,27 de Botnica,24 y de Bacterias,25 nota 10 y se actualizan frecuentemente
como resultado de los Congresos Internacionales que renen a los cientficos para tal efecto. Por
ejemplo, a julio del 2015 el ltimo Cdigo de Botnica es el de Melbourne (revisin 2011,
publicado en 201224 ), el ltimo de Zoologa es la cuarta edicin (revisin 1999, publicado en el
200027 ), y el ltimo de Bacterias es la revisin de 1990 (publicado en 199225 ). Las ediciones
pueden no ser la ltima versin, ya que se han publicado posteriormente enmiendas. Los Cdigos
poseen algunas diferencias entre s, pero en su esencia funcionan de forma similar.
Los Cdigos buscan que cada concepto taxonmico o cada conjunto de subtaxones que ya ha
sido nombrado contine con el mismo nombre en lo posible, si vuelve a ser nombrado en una
nueva publicacin, que el nuevo nombre no tenga validez para el resto de la comunidad y pase a
ser un sinnimo del primero.nota 11 . Con este objetivo de "estabilidad en la nomenclatura" los
autores de los Cdigos enumeran sus principios, de los que el "principio de prioridad" enuncia
que cada taxn con su circunscripcin, posicin y rango posea un nico "nombre aceptado"
("nombre correcto" en Botnica, "nombre vlido" en Zoologa) para la comunicacin.139
El principio de prioridad es sencillo de expresar, lo que es dificultuoso es decidir cundo dos
autores se estn refiriendo al mismo taxn y cundo a uno diferente, o dicho con ms rigor, lo
dificultuoso decidir, cuando un nuevo autor cambia las hiptesis taxonmicas de forma de
recircunscribir los grupos o cambiarlos de posicin o rango, cul de los nuevos taxones deber
utilizar un nombre ya utilizado en el pasado. Los Cdigos decidieron que el nuevo taxn que
hereda el nombre es el que mantiene el mismo tipo dentro de l. De esta forma los Cdigos
definieron lo que en nomenclatura se llama el "taxn nominal": la asociacin permanente entre
un "nombre" y un "tipo", este ltimo establecido, en estos Cdigos, en una categora taxonmica
primaria dada.cita 33 Esta asociacin perdura a travs de los cambios de circunscripcin, necesaria
para establecer y reutilizar el taxn nominal pero variable entre autores.140 141 La asociacin
tambin perdura a travs de los cambios de posicin taxonmica, que en la categora especie
puede llevar alguna modificacin en el nombre, y a travs de los cambios de categora si se
cambia a una categora cercana que mantiene el tipo (del mismo "grupo", ver ms abajo), que
normalmente lleva tambin alguna modificacin en el nombre.

Cada especie correctamente descripta y nombrada posee un tipo (tcnicamente, es el nombre


formal el que posee un tipo). En plantas, por lo general son ejemplares de la especie que fueron
recolectados y secados (aplastndolos entre papeles de diario que se cambian todos los das hasta
que dejan de humedecerse), y luego almacenados cuidadosamente en un herbario accesible al
pblico, como un museo o un jardn botnico. Si almacenar un ejemplar como tipo es
complicado, se puede reemplazar por cuidadosas ilustraciones y fotos. En los ltimos aos es
buena prctica97 conservar una muestra del especmen de forma que se pueda extraer su ADN
para los anlisis.

En especies de aves y mamferos los tipos suelen ser animales disecados, almacenados en
colecciones en general en museos. En zoologa se suelen conservar partes duras como huesos,
caparazones, valvas, y en frascos en formol los animales blandos.
El "tipo", lo que se fija permanentemente al nombre, es algo diferente si estamos hablando de un
nombre en la categora especie o inferior, o de un nombre de una categora superior a especie. En
la categora especie o inferior a especie (las categoras del grupo especie), "el espcimen tipo
nomenclatural" es un espcimen especfico de la especie idealmente completo y en buenas
condiciones, almacenado en una coleccin cuya manutencin y crecimiento son dirigidos por un
taxnomo especializado (un curador), que idealmente debera permitir al pblico un acceso a los
tipos aunque sea restringido. Cuando es posible, las colecciones se encuentran en instituciones
dedicadas a la ciencia como museos de historia natural, herbarios, jardines botnicos. Cuando el
tipo utilizado en la publicacin original (el holotipo) se ha perdido o vuelto irreconocible, no hay
otro espcimen de la coleccin original que pueda reemplazarlo (un lectotipo), y hay necesidad
de un tipo para reutilizar un nombre, el nombre no se pierde sino que se puede seleccionar de los
especmenes depositados en colecciones e identificados con el mismo nombre y localidad que el
original, un neotipocita 34 . En los casos particulares de bacteriascita 35 , protozooscita 36 , algas y
hongoscita 37 cuyas colecciones constan de cepas vivas, el tipo no es un nico organismo muerto
sino que es una cepa cultivada viva, en general congelada, y disponible en al menos unacita 35 o
doscita 37 colecciones diferentes segn el Cdigo.

Con respecto a los taxones superiores a especie, el nombre del gnero -y de las dems categoras
del grupo gnero- posee como "tipo" al taxn nominal de aquella especie contenida en l que fue
publicada primero; y el nombre de una familia -y de las dems categoras del grupo familiaposee como "tipo" al taxn nominal del gnero contenido en ella que fue publicado primero.
Ntese que en estos casos el "taxn nombrado" es un grupo de organismos cuyo tipo es un
gnero o una especie contenidos en l, aunque, como est nombrado segn las reglas de
nomenclatura, el tipo contiene a su vez un especmen tipo o un taxn que eventualmente lo
anida. Con los cambios de circunscripcin, el especmen es lo nico que se mantiene dentro de
los lmites de cada taxn de cualquier categora.
Si dentro de la extensinnota 12 (la composicin de organismos) del taxn no hay ningn ejemplar
especificado como un "tipo", el autor de la circunscripcin puede decidir nombrarla
formalmente, es decir, crear un taxn nominal que pasar al terreno de los "nombres cientficos"
por el resto de la historia de la taxonoma. El tipo ser un ejemplar identificado dentro de la
extensin del taxn, debidamente depositado en una coleccin, y el nombre ser un nombre en
latn o latinizado construido segn ciertas reglas explicitadas en los Cdigos (algunas de las
cuales se vern ms abajo). Todos los datos del nuevo taxn (el nombre, la posicin, la categora
taxonmica, la descripcin o la diagnosis escrita en forma de caracteres expresados en palabras,
los datos de la ubicacin del tipo) son "efectivamente publicados" si lo son donde sean accesibles
para otros cientficos y expertos locales, como una revista cientfica, o un libro. No se consideran
efectivamente publicados los nombres publicados en medios efmeros de publicacin como un
catlogo de semillas, un diario, o por correo electrnico. Todos estos datos efectivamente
publicados convierten al taxn nominal en un nombre establecidocita 38 ("vlidamente publicado"
en Botnica, "disponible" en Zoologa), y es cuando decimos que un nombre tiene el estatus de
"nombre cientfico" o de "nombre formal".cita 39
Cuando se encuentra ms de un "tipo" dentro del taxn, los dems nombres pasan a ser
sinnimos taxonmicos del primero, el "nombre aceptado" ("nombre correcto" en Botnica,
"nombre vlido" en Zoologa) del taxn. Pero si al descubrirse este hecho un nombre ms
reciente ya est muy extendido, puede proponerse a la Comisin respectiva como excepcin al
principio de prioridad y en aras de la estabilidad, agregar el nombre a la lista de nomina
conservanda, nombres que se consideran el nombre aceptado por razones prcticas.
Los dos tipos de sinonimia se denominan:

(1) los sinnimos subjetivos en Zoologa, sinnimos taxonmicos o heterotpicos


en Botnica: los nombres que compiten por un mismo taxn, y

(2) los sinnimos objetivos en Zoologa, sinnimos nomenclaturales u


homotpicos en Botnica, todos los taxones que "heredan" el mismo nombre, con
el mismo autor original y diferente autor de la descripcin. En los casos de las
especies, que necesitan adems especificar la "posicin taxonmica" en el
nombre, ya que su nombre es el del gnero + un epteto, cuando una especie
"hereda" el taxn nominal en otra posicin taxonmica que la original (en otro
gnero), se crean dos nombres cientficos con diferente gnero y mismo epteto,

con el mismo autor original y diferente autor de la posicin taxonmica, aunque


tuvieran la misma circunscripcin.cita 40
Los nombres tambin pueden ser establecidos pero ilegtimos. Esto es porque las reglas
enunciadas para establecerlos no han impedido su formacin, pero se descubre que no cumplen
con los principios que se intentan cumplir mediante las reglas y que son enunciados en la
primera parte de cada Cdigo. Por ejemplo los principios ms importantes son que debe haber un
solo nombre para cada taxn, y el principio de prioridad. Las dos razones principales por las que
un nombre puede ser ilegtimo son que al momento de la publicacin no se ha evitado que (a)
fuera redundante, es decir que el autor establece un nombre cientfico para un taxn que en la
composicin de organismos posee un ejemplar que ya forma parte de un taxn nominal y es as
de una forma "evidente", y (b) que fuera homnimo -no sinnimo- de otro anterior, es decir que
un "nombre" que ya formaba parte de un taxn nominal fuera asociado a un "tipo" nuevo.
Mientras no haya un registro central de nombres incluido en las reglas estas situaciones no son
evitables mediante ellas, y a pesar de que se lo intenta no son todava fciles de detectar, se
publican decenas de miles de nombres nuevos por ao142 y slo se ha logrado establecer un
registro central mandatario de nombres y publicaciones en bacterias, que existe desde 1980.143
No se han terminado de informatizar los datos de la literatura publicada en papel para indexarlos,
y botnicos y zologos no consensan la creacin de "ndices de nombres adoptados"143 ("no
suprimidos") en los taxones que les tocan por temor a que unos pocos especialistas dejen
publicaciones fuera de la indexacin y acaparen la nomenclatura de un grupo.133
Cuando la aplicacin estricta de un Cdigo resulta en confusin o ambigedad, como en las
propuestas de conservacin o las de supresin de nombres pobremente establecidos, la situacin
se presenta ante su Comisin respectiva, que tiene la responsabilidad de tomar una decisin al
respecto.cita 41 La composicin y funciones de cada Comisin estn contempladas en su respectivo
Cdigo, y tanto las propuestas como las decisiones tomadas en relacin a ellas son publicadas en
su respectiva revista especializada. Las decisiones tomadas por la Comisin Internacional de
Nomenclatura Zoolgica son publicadas en su revista, The Bulletin of Zoological
Nomenclature,144 las tomadas por los Comits auspiciados por la Asociacin Internacional para la
Taxonoma de Plantas (IAPT) son publicadas en su revista, Taxon,145 y las tomadas por el Comit
Internacional de Sistemtica de Procariotas y Bacteriologa son publicadas en su revista, el
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM)146 .
Finalmente, la nomenclatura botnica, la nomenclatura zoolgica y la nomenclatura
bacteriolgica son independientes la una de la otra. Como consecuencia, el mismo nombre puede
ser utilizado para una planta, para un animal o para una bacteria, con pocas restricciones,nota 13 y
aunque no es lo aconsejable hoy en da animales y plantas pueden estar compartiendo el 13% de
sus nombres genricos147 .

Categora taxonmica[editar]

Dominio
Reino
Filo o
divisin
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie
Categoras taxonmicas

Por arriba de reino no hay categoras propuestas en los Cdigos, los taxnomos que las utilizan pueden hacer
uso del Dominio, el Superreino o el Imperio.

Son 7 las categoras primarias o principales:cita 42 Reino, Filo o Divisin, Clase, Orden,
Familia, Gnero, Especie. Histricamente, el Cdigo de Zoologa utiliz la categora de Filo
(Phylum en ingls y en latn), y el de Botnica, del que se escindi el de Bacterias, la de Divisin
(Division en ingls, Divisio en latn), hoy en da en una direccin hacia la armonizacin se los
trata como sinnimos.cita 42
Una regla mnemotcnica para recordarlas es la siguiente:

Reino Filum Clase Orden Familia Gnero Especie

La reina es una diva de mucha clase que ordena para su familia g

Reino Divisin Clase Orden Familia Gnero Especie

El establecimiento de un nombre en una categora primaria genera un "tipo" en lo que los


Cdigos llaman el "grupo de categoras" que abarca todas las categoras intermedias por arriba y
por debajo de la categora primaria, que poseern, justamente, el mismo "tipo". Estos taxones
sern establecidos cuando se los publique por primera vez.cita 42
Luego de establecer las categoras primarias, pueden intercalarse algunas categoras
secundarias, pero no necesariamente en todos los taxones nombrados en una categora (lo que
las diferencia de las categoras primarias, que no pueden ser salteadas): tribu entre familia y
gnero (perteneciente al grupo familia), seccin entre gnero y especie (perteneciente al grupo
gnero); o recurrir a prefijos: superfamilia, subfamilia.cita 42 Las categoras secundarias propuestas
por cada Cdigo se presentarn en la seccion siguiente.

Nombre cientfico[editar]
Artculo principal: Nombre cientfico

En los Cdigos de Nomenclatura, cada especie queda designada por un binomio (una expresin
de dos palabras) en latn, donde la primera palabra, el "nombre de gnero", es compartida por las
especies del mismo gnero; y la segunda, el "adjetivo especfico" o "epteto especfico", hace
alusin a alguna caracterstica o propiedad distintiva de esa especie en particular, como pueden
ser el color (albus, blanco; cardinalis, rojo cardenal; viridis, verde; luteus, amarillo;
purpureus, prpura; etc.), el origen (africanus, africano; americanus, americano; alpinus,
alpino; arabicus, arbigo; ibericus, ibrico; etc.), al hbitat (arenarius, que crece en la
arena; campestris, de los campos; fluviatilis, de los ros; etc.), un homenaje a una
personalidad de la ciencia o de la poltica o atender a cualquier otro criterio. No es necesario que

el nombre est en latn, slo es necesario que est latinizado. Los nombres de gnero siempre van
con la primera letra en maysculas, los eptetos especficos siempre van en minsculas, y los
nombres de gnero y de especie van siempre en itlicas (o subrayados, si se escribe a mano).nota 14
Al escribir el nombre de especie, el epteto especfico nunca es utilizado solo, y es mandatario
que est precedido por el nombre del gnero, de forma que el nombre de la especie sea el
binomio completo. La abreviacin a la primera letra del nombre del gnero precediendo el
epteto especfico completo tambin es aceptable una vez que el nombre ya apareci en su forma
completa en la misma pgina o en un artculo pequeo. As por ejemplo, la lombriz de tierra fue
llamada Lumbricus terrestris por Linneo, y si el nombre ya apareci antes en el artculo y no hay
ambigedad, puede volver a referirse a ella como L. terrestris. Con respecto a los taxones
ubicados en la categora de gnero y superior, los nombres son uninomiales (constan de una sola
palabra) y siempre se escriben con la primera letra en maysculas (aunque solamente en la
categora de gnero van en itlicasnota 15 ). Como los Cdigos de Nomenclatura prohben que
dentro de cada Cdigo haya dos taxones con el mismo nombre, no puede haber dos gneros con
el mismo nombre (ni dos taxones por arriba de gnero con el mismo nombre), pero como ocurre
que el epteto especfico de las especies slo se usa despus del nombre del gnero, puede haber
dos especies diferentes pertenecientes a gneros diferentes que compartan el mismo epteto
especfico. Una vez fijado, un nombre no es sustituido por otro sin un motivo nomenclatural. Por
ejemplo el roble de los alrededores de Madrid fue bautizado como Quercus pyrenaica
errneamente, puesto que no se encuentra en los Pirineos, pero tal circunstancia no justifica un
cambio de nombre.
La recomendacin es que los nombres sean fciles y descriptivos,cita 45 pero no hay reglas que
impidan a los investigadores utilizar su propia inventiva para crear los nombres cientficos ms
inslitos: el nombre de la araa Pachygnatha zappa, porque tiene una mancha en el abdomen
igual al bigote del artista Frank Zappa; algunas moscas chupadoras de sangre del gnero
Maruina: Maruina amada, M. amadora, M. cholita, M. muchacha, M. querida, M. chamaca, M.
chamaguita, M. chica, M. dama, M. nina, M. tica y M. vidamia, todos adjetivos cariosos; el
dinosaurio que fue llamado Bambiraptor debido al Bambi de Disney; el molusco bivalvo Abra
cadabra (aunque despus se lo cambi de gnero); y quizs el caso ms sobresaliente, el gnero
de araas brasileas Losdolobus, llamado as porque los investigadores que lo describieron,
queriendo homenajear a dos argentinos que haban colaborado, les pidieron a stos que
inventasen un nombre para el nuevo gnero, que qued como Losdolobus por "los dolobus",
trmino del lunfardo argentino intraducible en una enciclopedia.150 El llamado a la
responsabilidad de los Cdigos: "Los autores deberan ejercitar un razonable cuidado y
consideracin en la formacin de nombres nuevos para asegurarse de que son elegidos con sus
subsecuentes usuarios en mente y que, mientras sea posible, sean apropiados, compactos,
eufnicos, fciles de memorizar y no causen ofensa".cita 45
En las categoras superiores a gnero los nombres cientficos son la raz del tipo (un gnero del
taxn, en los rangos ms bajos el ms antiguo) con un sufijo que denota la categora en la que el
taxn fue ubicado,cita 46 segn se indica en la siguiente tabla:
Categora
taxonmica

Plantas
(Rev.201124
)

Algas
(Rev.201124
)

Hongos
(Rev.201124
)

Animales
(Rev.199927 )

Bacterias
(Rev.199025 )

-phytacita 47 o -phycotacita 47 -mycotacita 47 Hay


nombre
o nombre
o nombre
recomendacione
descriptivocit descriptivocit descriptivocit s en el
a 46
a 46
a 46
BioCode.cita 48

-phytinacita 47 -phycotinacita -mycotinacita Hay


47
Subdivisin/Subfil o nombre
o nombre 47 o nombre recomendacione
cit
o
descriptivo descriptivocit descriptivocit s en el
a 46
a 46
a 46
BioCode.cita 48

Divisin/Filo

Clase

-opsidacita 47 -phyceaecita 47 -mycetescita 47 Hay


Nombre
o nombre
o nombre
o nombre
recomendacione
descriptivocita
descriptivocit descriptivocit descriptivocit s en el
49
a 46
a 46
a 46
BioCode.cita 48

Subclase

-idae (pero
cita
Hay
cita -phycidae
no -iridae)
mycetidaecita
Nombre
47
o
nombre
recomendacione
47
47
o nombre
o
nombre
descriptivocita
cit
cit descriptivo
cit s en el
49
descriptivo a 46
descriptivo
cita 48
BioCode.
a 46
a 46

Orden

Suborden
Superfamilia

-alescita 50 o nombre descriptivocita 46

Hay
recomendacione
-alescita 51
s en el
BioCode.cita 48

-ineaecita 50 o nombre descriptivocita 46

Hay
recomendacione
-ineaecita 51
s en el
BioCode.cita 48
-oideacita 52

cita 53

Familia

-aceae

Subfamilia

-oideaecita 54

-idae

cita 52

-aceaecita 51

-inaecita 52

-oideaecita 51

Tribu

-eaecita 55

-inicita 52

-eaecita 51

Subtribu

-inaecita 55

-inacita 52

-inaecita 51

Las celdas coloreadas indican los taxones para los que el principio de prioridad en la eleccin del
gnero tipo es mandatario en cada Cdigo.
Un "nombre descriptivo" es por ejemplo Monocotyledoneae ("un cotiledn"), o un nombre con
una raz descriptiva en lugar de derivar de un gnero tipo como Coniferales (raz: "Conifer-"
sufijo: "ales").cita 46 Estos nombres no estn asociados a un gnero "tipo" en Botnica, sino a la
descripcin del nombre (p.ej. las monocotiledneas pueden recircunscribirse de forma de dejar
cualquiera de sus subtaxones fuera del grupo, pero poseer "un cotiledn"), en cambio s estn
asociados a un gnero tipo en Bacteriascita 46 . Los Cdigos llaman a los nombres descriptivos sin
gnero tipo typeless ("sin tipo"), algunos autores definen como "tipo" al contenido del taxn que
est asociado al nombre en un taxn nominal, por lo que la descripcin en un nombre descriptivo

sera tambin un "tipo". El tipo debe necesariamente estar contenido en el taxn al que se aplica
el nombre. En taxones superiores al grupo familia (desde superfamilia hasta subtribu), o
superiores al grupo orden en bacterias, el primer nombre no se hereda de forma mandataria en
los Cdigos.
Un ejemplo de taxn es el orden Primates. En esta expresin, "orden" especifica la categora
taxonmica del grupo, ms abarcativa que la categora de familia y menos abarcativa que la de
clase. "Primates" es el nombre del taxn. El orden Primates est incluido en la clase Mammalia
(los mamferos), y a su vez incluye diversas familias como la familia Cebidae (cbidos, las
monas americanas) o la familia Hominidae (homnidos, nuestra propia familia).
Por debajo de la categora especie se encuentran la subespecie, variedad y forma. Su nombre se
arma con el nombre de la especie seguido de subsp. o de var. o f. respectivamente, seguido de un
epteto subespecfico: Carpinus caroliniana subsp. caroliniana, Lyonia ligustrina var. ligustrina,
salvo en las subespecies de animales que no llevan la partcula subsp: Canis lupus familiaris. Son
nombres trinomiales.
Adems, en todos los taxones, la primera vez que se nombra un taxn en una publicacin
cientfica, el nombre cientfico puede verse seguido del apellido del autor de su descripcin
(normalmente llamado la "autoridad"), mejor an si se sigue del ao en que el taxn fue descrito.
El nombre del autor puede estar abreviado, por ejemplo a Linneo se lo abrevia con una L.. Las
veces posteriores que se nombra al taxn en la publicacin se evita el autor y el ao de
publicacin. A veces se encuentran variaciones en la forma en que autor y ao son escritos (por
ejemplo hay dos autores conectados por palabras en latn como in o et o ex, o el autor est entre
parntesis), y cada una de estas variaciones tiene su significado en Nomenclatura. Por ejemplo,
en el caso de los animales, si en la actualidad una especie en particular est ubicada en un gnero
diferente al que le fue asignado por su autoridad original, el nombre del autor y el ao se ponen
entre parntesis indicando as que originalmente se la describi con otro nombre. As, el len en
la actualidad es Panthera leo (Linnaeus, 1758), y se pone autor y ao entre parntesis porque
Linneo lo describi originalmente como Felis leo. El autor y ao de publicacin no son reglas
sino recomendaciones de los Cdigos de Nomenclatura, pero son de uso corriente en la literatura
y recomendados por muchos autores. Cuando se hace referencia a la circunscripcin de un
concepto taxonmico utilizado en la actualidad que difiere de la circunscripcin de la
publicacin del taxn nominal, se puede encontrar el conector sensu151 (p.ej. "Arenaria sensu
McNeill (1962)"). El autor y ao del taxn nominal original se mantienen tiles para evitar
errores con nombres homnimos, y esperablemente en el futuro ambos autores puedan
reemplazarse por un Identificador Global de Conceptos Taxonmicos, que cuando se resuelva
gue a la cita del concepto utilizado con todas sus referencias y quizs un enlace a la
publicacin.29 152 151

Por qu cambian los nombres de los taxones?[editar]


La descripcin formal y la tipificacin de los taxones son procedimientos en los que es frecuente
observar errores e inconsistencias, y esto ocurra an en mayor medida antes de que los Cdigos
Internacionales reglamentaran estos trabajos muy pormenorizadamente. Los nombres de los
taxones pueden cambiar cuando son redescubiertas descripciones ms antiguas del mismo taxn,

y se aplica el principio de prioridad, o cuando se observa que la descripcin original en realidad


refera a un taxn diferente. No suelen darse estos casos en los grupos ya bien estudiados, y en
los Cdigos hay adems mecanismos para la supresin de nombres pobremente definidos en los
grupos ms complicados. Una vez asentada la taxonoma fundamental de un grupo, es poco
probable que los cambios de nombres se den por esta clase de motivos.153
Los nombres cambian cuando el descubrimiento de nueva informacin obliga a modificar las
circunscripciones, pero tambin -y sin necesariamente nueva informacin que lo justifique-, los
nombres cambian por diferencias de criterio entre los especialistas.99 153
Por ejemplo, es muy comn que a distintos grupos de organismos recin descubiertos se les d
nombres de especie (y de gnero incluso) nuevos y que aos despus un taxnomo que los
estudie llegue a la conclusin de que todos pueden hibridar entre s y dar descendencia frtil, y
unifique todos los taxones en una nica especie (en este caso todos los nombres cambian al
nombre de la primera especie descrita dentro del grupo), dejando, en todo caso, los antiguos
nombres de especies como subespecies. Con posterioridad puede llegar otro taxnomo que
considere que esos grupos de organismos deberan dividirse en dos especies distintas, que en la
naturaleza conviven sin hibridarse (aunque pudieran), debido a que cada una de las especies que
l propone forma una unidad monofiltica en un anlisis de filogenia. Entonces a los que se
encuadran en la "nueva" especie, se les cambia el nombre de especie por el nombre de la especie
ms antigua descrita dentro de la "nueva" especie. Otro taxnomo podra argumentar ms tarde
que todos los grupos originalmente descritos son especies vlidas del mismo gnero, debido a
que cada uno de ellos puede ser identificado por su propio grupo de caracteres morfolgicos, y
que dentro de cada uno de ellos hay un patrn de ascendencia y descendientes. En este caso,
todos los nombres de especies cambiaran al primer nombre dado a cada grupo cuando fue
descrito, pero todos los nombres de gnero se unificaran en uno solo, por lo que todos los
gneros pasaran a nombrarse como el gnero ms antiguo descrito dentro del grupo. Esta
inestabilidad de los nombres se habra producido casi nicamente por cambios de "filosofa
taxonmica": lo que cada autor considera que se corresponde con la categora especie. Estas
diferencias conceptuales entre taxnomos son extremadamente comunes hoy en da, lo cual lleva
a una gran inestabilidad potencial en los nombres de los taxones (Vane-Wright 2003).153

Determinacin o identificacin de especmenes[editar]

Captura con red de los insectos que sobrevuelan el estrato herbceo de una comunidad dominada
por gramneas. Con una boca ms pequea es ms fcil evitar que se escapen.

La disciplina de la determinacin, o identificacin de especmenes, es el proceso de observar los


caracteres de un especmen hasta encontrar el taxn en el que se ubica ("determinarlo") o
reconocer que es nuevo para la ciencia en la categora taxonmica en la que se lo desea ubicar.
Como slo el 10 % de las especies del planeta est descripto, y esas descripciones son hiptesis
con diferentes grados de resolucin154 , la determinacin funciona recursivamente con la
descripcin y delimitacin de especies en el rea llamada alfa-taxonoma o taxonoma
descriptiva. Este rea se ocupa adems de depositar los especmenes utilizados como referencia
de las hiptesis taxonmicas en colecciones y de publicar las nuevas claves de identificacin y
las nuevas descripciones, con las que en conjunto se llega a los taxones redefinidos, en las
llamadas floras, faunas y monografas taxonmicas.155 En reas donde la biodiversidad presenta
una tarea desafiante, como en los trpicos debido al nmero de especies y tambin al vasto
nmero de especies que no ha sido an publicado, o exhaustivamente fotografiado el rol del
especialista en la determinacin es crtico. (18 :7)
Adems de la finalidad en s misma de generar una taxonoma slida y estable, hay varias otras
razones por las que se puede necesitar una identificacin, y todas si estn correctamente
documentadas e informadas en sitios de acceso al pblico general y a la comunidad cientfica,
alimentan a la alfa-taxonoma. Los taxnomos necesitan identificar los organismos sobre los que
extraen nuevas lneas de evidencia con las que ajustar los anlisis de filogenia en taxones de
categoras ms altas, y tampoco ha faltado en ese rea algn papeln por arrastre de errores de
una mala identificacin. En biogeografa se utilizan los datos de especmenes identificados por
localidad u "ocurrencias", lo que se llama "datos georreferenciados", en los anlisis156 , cuyas
conclusiones a su vez pueden debilitar o robustecer hiptesis taxonmicas. Muchos trabajos de
investigacin realizados por bilogos eclogos implican un conteo de alguna unidad taxonmica
de biodiversidad en cierta rea, como en las investigaciones relacionadas con la conservacin,157
o en las relacionadas con las invasiones biolgicas y su impacto en el ecosistema, o en los
cambios en patrones de sucesin en relacin a algn otro disturbio. Una correcta identificacin
se necesita cuando se sospecha que una enfermedad o muerte en humanos, animales o plantas es
causada por un ser vivo, como cuando se sospecha que el ganado est consumiendo una planta
txica que le produce enfermedad o muerte,158 159 o cuando un animal salvaje pica o muerde a un
humano, o un microbio patgeno lo infecta,160 la correcta identificacin en estos casos abre la
literatura que indica las formas de control y tratamiento conocidas, y estas ocurrencias agregadas
pueden analizarse en la bsqueda de correlaciones y patrones predictivos. Los fabricantes de
pesticidas y herbicidas161 y los servicios relacionados con la salud pblica162 pueden requerir un
monitoreo de insectos o plantas dainos en cada zona con el objetivo de mantener regulada su
abundancia y para probar efectividad de tratamientos cuando se decide aplicarlos. En el campo
de la biologa forense la identificacin de especmenes puede esclarecer asuntos legales.163 164
Slo si las circunstancias lo permiten, porque pueden ser raros, difciles de colectar o estar en
peligro de extincin, los especmenes a identificar pueden colectarse con cuidado de no daar
ninguno de sus caracteres. Los especmenes no tienen ningn valor si se pierde el dato de la
localidad de la que se extrajeron y el momento en que fueron encontrados, los datos de
especmen/localidad-momento se llaman "ocurrencias",165 sean stos colectados o slo
ingresados como dato (segn el nivel de confiabilidad del colector se le puede pedir que sostenga
su ocurrencia con pruebas fotogrficas, o no, las pruebas fotogrficas en conjunto tambin son
una coleccin, las ocurrencias en conjunto son otra coleccin). Al colectar el especmen o al

fotografiarlo se realiza una ficha de coleccin con datos de localidad, fecha y colector; y otros
que se perdern al llegar al lugar de identificacin como hbitat, si estaba asociado a alguna otra
especie, su abundancia en esa localidad, si era de noche o llova, el mtodo por el que fue
colectado, y cualquier informacin sobre el estado del espcimen que el colector piense que
pueda no ser evidente una vez llegue a su lugar de identificacin: fotografiar claramente el color
y textura de los rganos que podra cambiar debido a la preservacin, anotar la fragancia,
etctera (18 :553). Si se colecta ms de un espcimen de especies diferentes, debe hacerse una
ficha de coleccin para cada ejemplar. Luego de la identificacin debe agregarse la misma a la
ficha y tambin quin es el identificador, que no necesariamente es la misma persona que hizo la
coleccin, o cules fueron los mtodos utilizados para la identificacin (claves o colecciones con
las que se lo compar), para poder sincronizar el taxn con las dems clasificaciones. Despus de
una campaa de coleccin se posee tpicamente para cada especmen, un id, una ficha de
coleccin y un set de fotos asociados a ese id, una ubicacin en la coleccin (una entrada o
accession, no todos los especmenes fueron colectados y poseen nmero de accession, y hay
entradas que albergan un lote de varios organismos similares colectados en el mismo momento,
por lo que corresponden con varios id de especmen), y esperablemente tambin posee asociada
una lista de los estados de los caracteres que posee, necesarios para llegar a la identificacin y
que fueron convenientemente dejados por escrito. Cada id de especmen representa una fila en
una coleccin de "ocurrencias". Si se ingresan las fichas en un formato electrnico, debe
preveerse que cumpla con los estndares provistos por el Biodiversity Information Standards
(anteriormente TDWG) para facilitar su acceso (ver el estndar para ocurrencias Darwin Core);
un software para manejar datos de herbarios muy extendido es BRAHMS.
Si se han realizado identificaciones para un trabajo que se est por publicar, es buena prctica166
167
citar cul fue el taxnomo consultado o las publicaciones taxonmicas que fueron utilizadas
para identificar las especies, y agregar una seccin de "especmenes examinados"168 , donde se
cite la ubicacin de los especmenes que fueron enviados o visitados en la coleccin que los
preserva como referencia (voucher169 ) de los datos sobre los que se realiz la hiptesis
publicada. La seccin "especmenes examinados" debera incluir el nombre cientfico actual, el
nmero de identificacin del especmen individual dentro de la coleccin (el accesion), el
nombre de la coleccin o su acrnimo, la localidad donde fue colectado, y si se las obtuvieron,
los accession de las secuencias de ADN depositadas por ejemplo en GenBank.168 Si fue
publicado el dataset de ocurrencias, puede citarse el mismo o las ocurrencias dentro del mismo
utilizadas. Las colecciones de especmenes poseen una infraestructura especfica para cada
taxn, y cuando es posible se alojan en instituciones apropiadas como museos o jardines
botnicos, que son los sitios ms estables y las hacen perdurar por centurias, el taxnomo
especializado que dirige su manutencin y crecimiento el curador idealmente debera permitir
al pblico un acceso a los especmenes aunque sea restringido. Las colecciones suelen tener
catlogos electrnicos con la informacin de los especmenes que poseen, que son cada vez ms
fciles de acceder y, a pesar de que en sus inicios carecan de estandarizacin en sus formatos, se
prev que en el futuro muchas de esas bases de datos puedan ser accedidas por un mismo portal,
esperablemente mediante los estndares TDWG. En las colecciones, no es raro que los
especmenes se reclasifiquen si estn lo suficientemente bien documentados, se calcula que un
porcentaje que puede llegar a ser de hasta un 20% o un 25% de los especmenes puede ser
reclasificado durante el rechequeo (ver166 ); algunos de ellos podrn ser designados como el
"tipo"170 de un nombre de especie nueva o de una ya nombrada cuyo tipo original se ha perdido18

19 171 172

. Son cada vez ms comunes los softwares que formatean la seccin de especmenes
examinados a partir de la planilla de datos, y tambin puede formatearse en forma de data paper
un set de ocurrencias para publicacin.
Caja entomolgica de dpteros, contiene una plancha de telgopor en la que se insertan los
alfileres entomolgicos en los que estn montados los dpteros y sus etiquetas.
El primer paso en una identificacin es una observacin a simple vista, que implica una
apreciacin inconsciente de muchos caracteres del espcimen al mismo tiempo, en la que se
asocia el espcimen a cierto taxn formal o informal (lo que se llama apreciacin gestalt u
holstica del espcimen173 ), los mtodos ms formales de identificacin entran en juego cuando
el interesado necesita que la identificacin contine hasta taxones ms especficos, o cuando
necesita confirmar una posible apreciacin (18 :6-7;173 ). Los mtodos formales tienen en cuenta
pocos caracteres, expresados adems de forma "tipolgica"174 , resultando ser una simplificacin
de la apreciacin gestalt del taxnomo que los realiza; pero siempre que se dispone de ellos, es
importante seguirlos. Comparar directamente con las colecciones o las fotos puede inducir
errores, ya que en las fotos pueden no mostrarse o no ser evidentes para el lector no entrenado
los caracteres que diferencian el taxn de los dems.161
Los taxnomos concuerdan en que la mejor forma (19 :498) y la ms rpida (18 :6-7) de identificar
un espcimen con mtodos formales es consultar a un especialista, sea profesional o experto
local, al que le sean familiares la flora o la fauna de la regin y que est bien entrenado y al tanto
de las ltimas actualizaciones publicadas sobre el taxn. La determinacin que l haga ser
muchas veces ms exacta y actualizada que el nombre que el usuario final pueda obtener con la
literatura y los instrumentos a los que tenga acceso (19 :498).
La identificacin de plantas y artrpodos, por ejemplo, hace uso de lupa de mesa y elementos
para manipular la muestra en la lupa (dos agujas de diseccin y una pinza de punta fina), en el
caso de las plantas un bistur para seccionar rganos, tambin puede ser til un calibre para hacer
las mediciones, y saber hacer preparados al microscopio (18 :557). Si adems se tiene acceso a las
fotografas del especmen vivo o recin colectado la tarea de identificacin se ve muy facilitada.
Raramente dos especies no pueden discernirse morfolgicamente y se debe recurrir al envo de
muestras para la extraccin y anlisis de ADN.

Herramientas para la identificacin de plantas y artrpodos

En la lupa se observan los caracteres con un aumento de hasta unos 40x (amplifica una imagen 40 veces su
tamao).

Homemade dissecting needle and a flora.jpg

Aguja de diseccin para manipulacin en la lupa (la aguja, de coser, debe ser ms firme que en la foto), y
una flora detrs.

Pinza de punta fina para manipulacin en la lupa.

Bistur de hoja delgada para seccionar rganos de plantas, tambin puede ser una hoja de afeitar.

El microscopio ptico tiene un aumento de 40x a 400x. A diferencia de la lupa, la muestra debe presionarse
entre dos vidrios (portaobjetos y cubreobjetos) hasta formar una capa delgada, y a veces es necesario
teirla.

Las lupas de mano o de bolsillo, que se pueden llevar al campo, tienen un aumento de unos 2x a 6x. Las de
bolsillo consisten de una lente con tapa rebatible similar a la de la foto.

Field guides and a camera.JPG

Guas de campo, tiles para conocer a priori algunos de los caracteres que convendra fotografiar durante la
colecta.


Calibre.(18 :557)

Las herramientas literarias para la comparacin formal de esos datos son las claves de
identificacin, que hacen uso de los estados de los caracteres del espcimen para descartar
posibilidades hasta llegar al nombre del taxn173 ; de ellas el mtodo ms difundido todava es la
-arcaica- clave dicotmica (18 :557).
En la clave dicotmica se elige siempre uno de dos caminos, dos descripciones mutuamente
excluyentes de los estados de algunos caracteres. La eleccin enva al usuario al siguiente par de
descripciones, hasta que, si el usuario no cometi un error, se llega al nombre del taxn (18 :558,19
:496-497). La tarea se ve muy facilitada si la clave tiene fotografas del aspecto de los estados de
los caracteres.
Clave dicotmica de plantas que parte de la familia de las ninfceas (una familia de nenfares), y llega hasta el gnero (tomada de la Wikipedia):

Flores hipginas. pice del gineceo formando un disco plano a ligeramente cncavo con estigmas radiales. Spalos 5-14. Polen
anasulcado, espinoso.
Subfamilia Nupharoideae Mot. Ito, 1987.
Gnero nico: Nuphar Sm. in Sibth. & Sm., 1809. Holrtico.

Flores perginas a epginas. pice del gineceo en forma de copa, toda su superficie estigmtica. Spalos 4-5. Polen de otro tipo.
Subfamilia Nymphaeoideae Arn., 1832.

Plantas con acleos. Hojas escutiformes, peltadas.

Borde del limbo levantado formando un reborde continuo. Envs foliar aculeado. Estaminodios y apndices
carpelares presentes.

Gnero Victoria Lindl., 1837. Amrica meridional tropical.

Borde del limbo no levantado. Haz y envs foliares aculeados. Estaminodios y apndices carpelares ausentes o
inconspicuos.

Gnero Euryale Salisb., 1805. Asia, de la India al Japn.

Plantas sin acleos. Hojas de diversas formas, peciolo inserto en una escotadura del borde del limbo.

Spalos 4-5. Estambres pndulos, epiptalos sobre la cara interna del tubo de la corola. Semillas espinosas, sin
arilo.

Gnero Barclaya Wall., 1827. Sureste de Asia.

Spalos 4(-5). Estambres erectos, perginos sobre la cara externa del tubo de la corola. Semillas lisas, papilosas o
pelosas, con arilo.

Ptalos 0-5. Eje floral central prominente por encima de la copa estigmtica. Hojas sumergidas lineares con bordes
fuertemente ondulados.

Gnero Ondinea Hartog, 1970. Australia occidental.

Ptalos (6-)8-40(-50). Eje floral central visible como pequea proyeccin en la base de la copa estigmtica. Hojas
sumergidas (si existen) anchas, de bordes apenas ondulados.

Gnero Nymphaea L., 1753. Cosmopolita.

Ms moderna es la clave multi-acceso o policlave, en la que se puede utilizar cualquier conjunto


de caracteres en cualquier orden, de forma que el usuario selecciona los caracteres utilizados
para la identificacin. Estas claves normalmente contienen mucha ms cantidad de caracteres
que las claves dicotmicas, y son muy ventajosas cuando se posee un espcimen incompleto o
cuando se tiene informacin incompleta sobre el espcimen. Se han escrito programas de
computadora de claves multi-acceso, en que de forma interactiva se ingresan los caracteres y el
programa devuelve los posibles taxones. Programas de identificacin asistidos por computadora
son por ejemplo el antiguo sistema DELTA ("Descriptive Language for Taxonomy") (Askevold y
O'Brien 1994,175 Dallwitz 1993,176 2000,177 Dallwitz et al. 2002,178 Pankhurst 1978,179 1991,180 Watson y Dallwitz
1991,181 1993182 ) (hoy superado por el TDWG estndar SDD), en la web se pueden encontrar otros

como el sistema LucID (Norton 2012183 ), el sistema Xper2184 ; y es seguro que se volvern ms
importantes en el futuro185 . Los programas sirven tanto para utilizar claves ya existentes como
para construirlas a partir de una matriz de taxones x caracteres, y estn adaptados a que se
agreguen fotos, videos y sonido. Hoy en da, la mayor desventaja de las claves multi-acceso es su
disponibilidad (18 :558,19 :496-497), aunque ya hay que identifican las plantas de cualquier regin
del mundo hasta familia (como en colby186 , discoverlife187 ), hormigas (antweb188 ), saltamontes
(Common Western Grasshoppers189 ), mariposas y polillas (Butterflies and Moths190 ), y muchas
todava estn siendo creadas191 . Hay esfuerzos crecientes para computarizar las claves de
identificacin, incluidas las multi-acceso.192
Si bien las claves informticas son valiosas, la mayor parte de las claves de identificacin todava
se encuentra, junto con las respectivas descripciones e ilustraciones de cada taxn, en enormes
volmenes en papel publicados en series llamadas floras y faunas, que renen la informacin
sobre la presencia de las plantas o animales pertenecientes a un rea particular, a una pequea
regin, o a todo un continente (18 :560). Las floras y faunas son esfuerzos conjuntos que muchas
veces tardan dcadas en completarse. Un problema que deben enfrentar los usuarios de estas
claves es que muchas veces estn desactualizadas. Los nombres recin descriptos para la ciencia
pueden no encontrarse en ellas, como tambin pueden no encontrarse especies exticas que se
hayan instalado hace poco en la regin. Otro problema es que dos floras o faunas que afecten la
misma rea (como una flora o fauna local y una regional) pueden diferir en sus conceptos de
taxn o en sus circunscripciones y por lo tanto dar resultados diferentes. Las claves
computarizadas poseen muchos de los mismos problemas que las claves en papel, aunque es
esperable que en el futuro ofrezcan mejores facilidades para ser actualizadas y para la bsqueda
rpida de sinnimos.192 Las actualizaciones se encuentran en las monografas (monographs), un
estudio extenso con claves, descripciones y fotos de un taxn en particular, y en las revisiones
taxonmicas (taxonomic revisions), similares a las monografas pero menos exhaustivas.18 Las

dos ltimas se publican en revistas cientficas (18 :560). Las guas de campo (field guides), que
todava son ms fciles de acceder y poseen muchas fotografas e ilustraciones de las especies de
un taxn en una regin particular, se han vuelto muy populares y son tiles como una primera
aproximacin a conocer la flora o la fauna de una regin dada, siempre que se utilicen con
cautela y teniendo en cuenta que slo describen las especies ms vistosas y no siempre pueden
hacer uso de las herramientas que diferencian un grupo de especies emparentadas.193 173 159
Al utilizar una clave, siempre hay que leer cuidadosamente las dos opciones, tener en cuenta
todos los caracteres mencionados, no estimar las mediciones sino realizarlas, buscar en el
glosario todos los trminos que no se conozcan, y tener en cuenta que los seres vivos poseen
cierta variabilidad, as que si existe la posibilidad de ver un carcter varias veces (por ejemplo en
varias hojas de una planta) se ganar en precisin. (18 :558) Muchas veces no es evidente que una
descripcin se corresponde con el especmen, porque no necesariamente todos los caracteres de
una descripcin se correspondern con todos los caracteres del especmen. Al utilizar una clave
es muy probable que en algn momento se llegue a un par de descripciones donde el camino a
seguir sea confuso. Cuando es as, hay que seguir los dos caminos, si alguno de los dos es muy
incoherente (por ejemplo si pide la observacin de varios caracteres que no existen en el
espcimen) se descarta. Si no se pueden descartar caminos, se llegar a ms de un posible taxn
(159 ,18 :558,19 :496-497). Aunque se obtenga un solo resultado, es importante chequearlo. Una forma
de hacerlo es leer la descripcin y ver las ilustraciones del taxn o los taxones a los que se lleg,
especialmente evaluando la lista de sus caracteres diagnsticos, que es una lista de todos los
estados de caracteres del taxn que lo distinguen de los dems taxones. Si coinciden con los
caracteres del espcimen, entonces se ha realizado la identificacin (18 :558,19 :495). Otras formas
de hacerlo son la comparacin con alguna coleccin de especmenes, con colecciones de fotos, o
en especmenes dificultosos donde an queden dudas, envirselo a un especialista mejor
entrenado en ese taxn (19 :497).
Vase tambin: Seguir leyendo en Identificacin de especmenes

Historia de la taxonoma[editar]
Los orgenes de la taxonoma se remontan a los orgenes del lenguaje, cuando las personas
llamaban con los mismos nombres a organismos ms o menos similares, sistema que persiste hoy
en da en lo que llamamos los "nombres vulgares" de los organismos. Todas las sociedades
humanas poseen un sistema taxonmico que nombra a las especies y las agrupa en categoras de
orden superior. El ser humano posee un concepto intuitivo de lo que constituye una especie,
producto de agrupar a los organismos segn las propiedades emergentes observadas a ese nivel
de organizacin, y esto se ve reflejado en que todas las clasificaciones populares de los
organismos poseen remarcables similitudes entre ellas y tambin con las utilizadas hoy en da
por los bilogos profesionales194 .
La taxonoma biolgica como la disciplina cientfica que conocemos hoy en da naci en Europa.
All, a mediados de la Edad Media se haban formado las primeras universidades, donde se
discutan temas de ndole filosfica y tcnica. Pronto los naturalistas se dieron cuenta de que, si
bien los nombres vulgares son tiles para el habla cotidiana, necesitaban un sistema ms
universal y riguroso para nombrar a los organismos: cada especie deba ser nombrada, cada

especie deba poseer un nico nombre, y cada especie deba ser descripta de forma inambigua. Al
finalizar la Edad Media, con la dominacin militar y cultural que una Europa revitalizada
sostendra sobre el resto del mundo, el sistema all consensuado se extendera a todo el globo.

De la taxonoma linneana al origen de los Cdigos[editar]


Vase tambin: Taxonoma de Linneo

Portada de la obra de Linneo Species Plantarum (1753), su largo ttulo informa al lector la
estructura del contenido, en la que encontrar los gneros "naturales" y las clases y rdenes
"artificiales". Est escrito en latn, el idioma universal de la poca.
Ya en 1583, el italiano Andreas Caesalpinus haba delineado cules deban ser las caractersticas
de un sistema de clasificacin "natural": deba ser fcil de usar y de memorizar, estable en el
tiempo, conciso, y adems predictivo (ver Greene 1983195 ). Por lo tanto exista la conciencia de
que un sistema de clasificacin no slo deba reflejar la naturaleza, sino tambin servirle de
utilidad a una comunidad de usuarios.
Por un tiempo los naturalistas construyeron diferentes clasificaciones con el objetivo de ordenar
la informacin disponible sobre los organismos y reglamentar sus nombres. Pero sin duda alguna
fue en el siglo XVIII en que la taxonoma recibi un empujn definitivo, gracias al naturalista
sueco Carlos Linneo, quien tena la ambicin de nombrar a todos los animales, plantas y
minerales, agruparlos segn sus similitudes, y normalizar su denominacin. Si bien ya haba
publicado trabajos ms modestos antes, fue en 1753 cuando public un gigantesco trabajo de dos
volmenes en que almacen y orden toda la informacin disponible sobre las plantas, y debido
a su xito, termin siendo el trabajo que defini las bases del sistema de clasificacin que se
utiliza hoy en da. El libro se llamaba Species Plantarum ("Las especies de plantas"), y estaba
escrito en latn, que era el idioma universal de la poca. En el libro los "tipos de plantas" de
Linneo estaban agrupados por similitudes morfolgicas en una categora de orden superior
llamada gnero, en lo que l llamaba gneros "naturales", al describir una especie slo deba
describir los caracteres de la misma que la diferenciaban de las dems especies del mismo
gnero, con su propia descripcin. Al enfatizar el uso de similitudes morfolgicas, quizs sin

saberlo, Linneo estaba clasificando a los organismos en virtud de sus similitudes genticas, y por
lo tanto tambin evolutivas. En su libro, cada especie era descripta con una frase en latn limitada
a 12 palabras, en donde la primera de las 12 palabras siempre era el gnero al que perteneca la
especie. A estas pequeas descripciones, o polinomios, l las llam "el nombre propio de cada
especie", pero hizo un importante agregado que haba sido inventado en su momento por Caspar
Bauhin (1560-1624): la nomenclatura binominal o binomios, como el "nombre corto" de las
especies. En los mrgenes de su Species Plantarum, seguido del nombre "apropiado" polinomial
de cada especie, escribi una sola palabra. Esta palabra, combinada con la primera palabra del
polinomio (todava hoy llamada gnero), formaba un nombre ms fcil de recordar y corto para
cada especie. Por ejemplo, la hierba de gato fue nombrada "apropiadamente" con el polinomio:
Nepeta floribus interrupte spicatus pedunculatis (en espaol, "Nepeta con flores en una espiga
interrumpida pedunculada"). Linneo escribi la palabra cataria en el margen del nombre
apropiado de la especie, que quiere decir "relacionada con los gatos", haciendo referencia a un
atributo familiar de la especie. Tanto l como sus discpulos adoptaron el nombre Nepeta cataria
para esa planta, y rpidamente sus contemporneos empezaron a llamar a las especies del libro
con su nombre binominal.
Ubicar esos pequeos grupos naturales de especies en el rango de gnero tampoco fue un invento
de Linneo, de hecho, en 1694 Joseph Pitton de Tournefort ya haba provisto guas para describir
gneros de plantas: los caracteres de los gneros deban ser reconocibles en todos los miembros
del gnero y ser visibles sin el uso de un microscopio. En lo posible, estos caracteres deban ser
tomados de la flor y el fruto. Linneo crea que tanto los gneros como las especies (y algunas
familias) existan en la naturaleza, eran "grupos naturales", mientras que las categoras ms altas
slo fueron utilizadas por l por conveniencia humana. Esta distincin entre categora "real" y
categora "artificial" no era menor, ya que el creer que los gneros fueran reales (es decir, que
existen independientemente de nuestro discernimiento), gua al investigador de una forma
diferente de la que lo hace una categora artificial. En palabras de Linneo:

Los caracteres no hacen al gnero, el gnero nos da sus caracteres.

Carlos Linneo 1751:119196

Con estas palabras, Linneo reconoca que las especies se agrupaban de forma diferente si se
elegan caracteres diferentes, pero haba "algo ms" que la mera similitud de caracteres que
agrupara a las especies en un mismo gnero, y haba que saber elegir los caracteres a considerar
para que la agrupacin resultara corresponderse con un "grupo natural". Esta afirmacin, fruto de
la intuicin de Linneo, no tendra base cientfica hasta que pudo publicarse la teora de la
evolucin197 .

Linneo fall en encontrar caracteres que fueran comunes a todos los miembros de una familia,
aun en las ms "naturales" de ellas, como las umbelferas.
En la foto: hojas de apio (Apium) con sus pequeas inflorescencias, hbito de la zanahoria (Daucus), inflorescencias
de hinojo (Foeniculum), inflorescencias del cardo corredor (Eryngium), raz de perejil (Petroselinum).

La clave del "sistema sexual", clasificacin en categoras superiores a familia.


Linneo agrup a los gneros naturales en rdenes y clases artificiales, utilizados cual clave de
identificacin, tiles para que los gneros sean fciles de encontrar en una lista o un herbario.
Los caracteres que utiliz para ello fueron el nmero de estambres y el nmero de estigmas de
los carpelos, que eran caracteres estables dentro de cada gnero. Por ejemplo, en el orden
Pentandria Digyna de la clase Pentandria ubic a los gneros cuyas flores albergaban 5
"maridos" y 2 "esposas", como la umbelfera Daucus y el olmo Ulmus; mientras que a las
criptgamas como no tienen flores las llam "plantas de nupcias clandestinas".
Tambin trat de agrupar algunos gneros en familias "naturales", una categora intermedia entre
el gnero natural y el orden artificial (la idea de que existan familias naturales tampoco era
nueva y databa de Pierre Magnol en 1689198 ), si bien fall en encontrar caracteres que pudieran
funcionar como diagnsticos de las mismas, y para 1751 ya haba reconocido 67 familias

(Linneo 1751196 ), dejando muchos gneros sin ubicacin. Linneo buscaba caracteres que fueran
encontrados en todos los miembros de cada familia, pero su bsqueda fall an en las ms
"naturales" de ellas, como Umbelliferae.
El xito del libro de Linneo se deba no slo a la claridad de sus descripciones y clasificacin
sino tambin a que se haba convertido en la revisin ms exhaustiva de la literatura taxonmica
hasta el momento, con una notacin cuidadosa de sinnimos. De esta forma se lo consideraba un
"pasaje en limpio" y nuevo punto de partida de la literatura taxonmica, solventando as los
problemas de comunicacin producidos por la variedad de nombres y sistemas de clasificacin
locales. A partir de ese momento las actualizaciones de la clasificacin hechas por el mismo
Linneo o por autores posteriores, intentaron no abandonar la nomenclatura binominal ni el
sistema de clasificacin impuestos por Species Plantarum.
En 1758 le llegara el turno a los animales cuando Linneo publica la dcima edicin de su
Systema Naturae, en el que por primera vez los clasific como haba hecho en 1753 con las
plantas, adoptando la nomenclatura binominal. Linneo nombr unas 4.400 especies de animales,
incluyendo Homo sapiens, lo que demuestra que la poca ya no tena reticencias en clasificar al
hombre con los animalesnota 16 . Sin embargo, una diferencia con la tendencia hoy en da es que su
concepto taxonmico de especies era el que hoy ubicaramos en especies, subespecies y razas o
variedades segn si el taxn presenta las ltimas o no (y en la poca las razas y variedades no
sufran la dispersin por factores humanos que sufren hoy en da), por lo que toda una
comunidad reproductiva (lo que posteriormente se llamara "la especie biolgica") era dividida
por l en especies del gnero con sus respectivos nombres binomiales.
Las excepciones fueron siendo agregadas al sistema de clasificacin, algunas especies eran
clasificadas en un orden diferente que el resto del gnero. Desde la aparicin de los libros de
Linneo a varios autores, como a Michel Adanson (1763-1764198 ), se les hizo evidente que todos
los caracteres podan variar y que no hay caracteres esenciales para definir a un "grupo natural",
que deban ser definidos slo mediante un conjunto de caracteres tomados de todo el organismo,
de los cuales la mayora, pero no necesariamente todos, estaran en cada organismo de la especie,
en cada especie del gnero, en cada gnero de la familia. As se abandonaba el concepto de taxn
monottico al tiempo que se empezaba a entrar en una era de taxonoma cuantitativa, o
polittica, con numerosos caracteres combinados probabilsticamente en un diagnsticocita 56 cita 23
cita 24
. Las claves y las clasificaciones deban divergir.
En 1778 Lamarck sugiri que los caracteres utilizados por los cientficos para dividir los taxones
no necesariamente tenan que ser los mismos que la gente utilizara para identificar algn
organismo encontrado. Lamarck promovi el uso de claves de identificacin, clasificaciones
artificiales unitticas en las que los usuarios no expertos podan llegar al taxn natural de un
organismo dado mediante caracteres que estuvieran a su alcance y con reglas de decisin
explcitas. De esta forma se mitig el conflicto entre los creadores de los sistemas de
clasificacin, y los usuarios de esos sistemas, que estaban ms interesados en la utilidad del
sistema que en la "naturalidad" de sus grupos.
En 1789, Antoine-Laurent de Jussieu en su libro Genera plantarum200 describi tanto gneros
como familias de plantas y agrup a estas ltimas en clases. Por primera vez apareca un

tratamiento taxonmico que ubicara a todos los taxones por arriba de gnero en un sistema
natural, describa a todos los taxones de todas las categoras claramente, y enumeraba los
principios con los cuales se haba armado su sistema (un "mtodo").201
El trmino "taxonoma" (del francs taxonomie) fue empleado por primera vez por el bilogo
suizo Augustin Pyrame de Candolle a comienzos del siglo XIX.202
Un cierto nmero de sistemticos, especialmente en Francia y Alemania, adopt el concepto de
"espcimen tipo". Estos "tipos" eran plantas depositadas en un herbario que representaban la
forma ms comn del taxn (o quizs la forma ms "perfecta", de la que el resto del taxn el
autor considerara que eran plantas degradadas, en la poca era tendencia considerar la simetra
radial y la bisexualidad ms perfectas que las dems formas, por lo que se ha dado el caso de que
guardaran mutantes como ejemplar tipo).
Durante varias dcadas despus de la edicin de los libros de Linneo proliferaron los nombres
para animales y plantas y muchas veces hubo ms de un nombre para una especie dada. Cuando
as era, el nombre de uso comn era normalmente el ms descriptivo, o simplemente el utilizado
por la autoridad ms eminente del momento. A esto se sumaba que algunos nombres de gneros
y algunos eptetos especficos eran compuestos por ms de una palabra. Esta falta de estabilidad
nomenclatural hizo peligrar el logro de Linneo de una nica clasificacin para la comunicacin.
Eso llev a, en 1813, la adopcin de un cdigo para nombrar a las plantas, llamado Thorie
Elmentaire de la Botanique (Teora Elemental de la Botnica) donde se reglamentaba cul era
el nombre vlido para cada taxn. Por lo mismo y para los animales, en 1842, se adopt un
cdigo de reglas formuladas bajo el auspicio de la British Association for the Advancement of
Science (Asociacin Britnica para el Avance de la Ciencia), llamado el Strickland Code
("Cdigo de Strickland", Strickland et al. 1842203 ). Un borrador de un Cdigo que unira al de
Zoologa y al de Botnica fue escrito entre 1842 y 1843, pero terminara olvidado (Minelli
2008204 ).
De esta forma, desde Linneo hasta los Cdigos, nacieron las reglas de nomenclatura zoolgica y
botnica.

Taxonoma y evolucin[editar]

Charles Darwin evit escrupulosamente proponer rboles filogenticos para organismos reales,
para evitar el ridculo que le hubiera quitado mrito a su misin: demostrar la evolucin como
hecho, mostrando cmo la lucha por la existencia explica la adaptacin, y tratando de explicar el
cambio evolutivo (transformacin) por variacin gentica y la multiplicacin diferencial de

genotipos. Al enfatizar cmo la ascendencia comn ms la divergencia de fenotipos explica los


patrones de similitudes y diferencias que nos permiten clasificar organismos en taxones
sucesivamente anidados dentro de taxones superiores, Darwin astutamente utiliz un rbol
abstracto inmune al ridculo o al error filogentico. l correctamente arguy que el plan corporal
compartido por miembros de un filo estaba presente en su ancestro comn ms reciente, y que
fue heredado de forma estable generacin tras generacin, sin cambios fundamentales por
cientos de millones de aos. Descendiendo en las categoras a travs de clases, rdenes, familias,
gneros y especies, cada grupo subordinado sucesivo difera de sus relativos ms cercanos en
caracteres de estabilidad decreciente. (35 :112)
Darwin en 1859 no fue el primer proponente, pero nunca antes la evolucin como hecho haba
tenido tal penetracin en el ambiente cientfico. Cuando irrumpi a mediados del siglo XIX su
teora de la evolucin pronto se admiti, tal como formul el propio Darwin en El origen de las
especies, que el grado de similitud morfolgica entre las especies era explicado por la existencia
de un rbol filogentico que las conectaba por el parentesco de sus ramas ancestrales. El debate
entre los partidarios de los sistemas artificiales y los defensores de la construccin de un sistema
natural fue uno de los conflictos tericos ms intensos de la biologa de los siglos XVIII y XIX,
hasta que la teora de la evolucin ofreci un criterio convincente de "naturalidad": la
ascendencia comn. A principios del siglo XIX, los creadores de las clasificaciones "naturales"
haban aumentado significativamente la cantidad de caracteres con los que delimitaban sus
taxones, y a partir de este momento se interpretara que no hay caracteres "esenciales" en una
clasificacin natural porque todos tienen el potencial de evolucionar dentro de un grupo.
El sistema linneano de clasificacin est formado por grupos anidados, y un rbol filogentico
tambin puede dividirse de la misma manera, por lo que un sistema de clasificacin linneano
"natural" es congruente con la filogenia de las especies: las relaciones entre taxones en las
taxonomas naturales fueron reinterpretadas como el resultado de la evolucin, y las categoras
taxonmicas como indicadoras de la estabilidad evolutiva de los caracteres que los definen. Pero
la incorporacin del concepto de evolucin a las clasificaciones fue al principio modelada de
forma errtica. Por ejemplo, de las clasificaciones basadas en filogenias, algunas de esas
filogenias se componan slo de taxones que todava contenan miembros vivientes, como los
rboles de Charles Edwin Bessey (1845-1915) y los de Arthur Cronquist (1919-1992). En estos
rboles no haba ancestros extintos (18 p. 43). En la clasificacin de Rolf Dahlgren, los ancestros
eran slo miembros extintos, el rbol filogentico era un rbol tridimensional, y los miembros
vivientes podan representarse por un corte de un plano de ese rbol, en un diagrama llamado
"Dahlgrenograma" con relaciones similares a las de los pases en un mapa. Un paso crtico fue la
adquisicin de los mtodos de reconstruccin filogentica atribuidos a la escuela que hoy
llamamos cladismo, para la cual el bilogo Willi Hennig fue el que hizo el ms valioso aporte en
la dcada de 1960. Hennig model que las especies se conectaban entre ellas a travs de especies
ancestrales en su modelo original siempre extintas, y que poda rastrearse la transformacin de
especies ancestrales a especies derivadas a travs de las apomorfas generadas durante una
cladognesis: los cambios de carcter en cada lnea luego de la divergencia de un linaje en dos.
Estos rboles, hoy llamados cladogramas, fueron propuestos por Hennig como material para
construir los taxones, que siempre deban ser, a su criterio, monofilticos. Estos cladogramas
tenan la limitacin de que la historia evolutiva de un grupo no siempre ocurre por procesos de
cladognesis (divergencia en dos y adquisicin de apomorfas), y no siempre es fcil "descubrir"

el orden de las apomorfas ancestrales. En la misma dcada la escuela fentica creaba mtodos
numricos de anlisis de datos intentando que fueran "ciegos", sin hiptesis de evolucin previas
(sin hiptesis previas de cules seran las apomorfas). Por la poca en que Hennig se
popularizaba y en respuesta al cladismo la escuela tradicional, que incorpor los mtodos de
construccin de dendrogramas Hennigianos y los mtodos numricos en la bsqueda del rbol
filogentico, pero difera en cul es el dendrograma que debe trasladarse a una clasificacin, fue
llamada evolucionismo, la escuela evolucionista propone, como antiguamente, que puede haber
grupos parafilticos "naturales" que deben formar parte de una clasificacin formal. Hacia fines
de la dcada de 1970, cladistas como G Nelson, NI Platnick y C Patterson evolucionaron el
pensamiento cladista hacia un "cladismo de patrones" o pattern-cladism, el cual separaba
tericamente los rboles filogenticos, es decir los rboles de secuencias de organismos ancestros
y descendientes, de los rboles de apomorfas, que pueden haberse correspondido o no linaje por
linaje con el rbol de organismos.
Hoy en da la sistemtica se alimenta de una cantidad de caracteres en varias lneas de evidencia
diferentes, lneas que pueden considerarse bastante independientes entre s: se desarrollaron
mtodos de anlisis del ADN, mtodos bioqumicos (isozimas, flavonoides...), se agregaron los
caracteres de ultraestructura y micromorfologa tomados con los microscopios electrnicos de
transmisin y de barrido, y se han hecho avances en paleontologa. Estas matrices con una
cantidad enorme de datos pueden analizarse con los mtodos de anlisis filogentico para los que
la escuela fentica fue pionera, y aprovechando el uso de computadoras, que han producido en la
dcada del 90 y la del 2000 taxones nunca antes tan consensuados y muchos de ellos hasta
inesperados, lo cual ha obligado a modificar las clasificaciones al uso, deshaciendo grupos de
larga tradicin para definir otros nuevos. En la actualidad los sistemas de clasificacin se
publican en colaboracin de una larga lista de autores: para las angiospermas el grupo que se ha
llamado APG (1998, 2003, 2009205 ), para los taxones superiores Adl et al. (2005206 ), etc. El
debate que todava perdura entre taxnomos es si deben aceptarse grupos parafilticos o no en
las clasificaciones.

Formalizacin de las normas: los Cdigos[editar]


El que originalmente fuera Thorie Elmentaire de la Botanique en 1813 fue siendo reemplazado
por sucesivos Cdigos, aunque a veces su uso no era universal y se lleg a superponer, situacin
que se termin en 1930 con el alto consenso que tuvo el International Code of Botanical
Nomenclature (Cdigo Internacional de Nomenclatura Botnica o ICBN), que trata sobre la
nomenclatura de plantas y hongos. El que originalmente fuera el Strickland Code formado en
1842, que reglaba los nombres de los animales, fue revisado y renombrado como International
Code of Zoological Nomenclature (Cdigo Internacional de Nomenclatura Zoolgica o ICZN) en
1901. El principio bsico de los dos Cdigos era el principio de prioridad, que promovera su
objetivo bsico: la estabilidad en la nomenclatura. El de Botnica estableci el ao de la
publicacin de Species Plantarum, 1753, como el ao en que se inicia la nomenclatura botnica
moderna, dejando sin efecto los nombres publicados para las plantas antes de esa fecha. De la
misma forma, el Cdigo de Zoologa estableci el ao 1758, el ao en que Linneo public la
dcima edicin del Systema Naturae y el primero en que utiliz su nomenclatura binominal para
los animales, como el de inicio de la nomenclatura zoolgica, dejando sin efecto los nombres
publicados para animales antes de esa fecha. Los dos Cdigos compartieron los mismos

"principios de Nomenclatura", y desde su aparicin se realizaron peridicamente Congresos


Internacionales para su revisin. Por ejemplo, en 1958 el Cdigo de Botnica agreg que la
indicacin de un "tipo" al establecer un nombre fuera mandataria.207
Los bacterilogos, que se haban atenido al Cdigo Botnico, con el tiempo desarrollaron su
propio Cdigo (Cdigo Internacional de Nomenclatura de Bacterias, publicado en 1958). El
Cdigo Internacional de Plantas Cultivadas a su vez escindi los cultivares de las variedades
botnicas en 1952, con su ltima publicacin en 2009.208 Hace relativamente pocos aos se
fueron revisando versiones de lo que hoy se llama el Cdigo Internacional de Nomenclatura y
Clasificacin de Virus209 (nacido como "internacional" en 1998210 Actualmente se debate sobre la
urgencia de formalizar de manera equivalente la nomenclatura de genes y protenas.
A lo largo del tiempo fueron constantes las propuestas de armonizar, unificar, o reemplazar los
Cdigos, pero ninguna haba logrado un alto consenso (Dall 1877,211 ver tambin Savory
1962212 ).

Relacin con las taxonomas populares[editar]


Sabemos muy poco acerca de la relacin entre los naturalistas profesionales y los aficionados y
el pblico en general, si bien estas relaciones forman parte del trasfondo histrico que ayud a
modelar la biologa sistemtica (Judd et al. 2007, pero ver por ejemplo Allen 1976213 ).
Como la sistemtica tuvo su origen en Europa, los primeros grupos que se formaron fueron
aquellos que eran obvios en la flora europea. Adems, la disciplina estuvo dominada por
europeos durante centurias. Fuera de Europa, especialmente en aquellos lugares que fueran
colonias europeas, la dominacin europea fue especialmente evidente en que las floras de los
pases fueron escritas por botnicos europeos y basadas en materiales guardados en instituciones
europeas (Judd et al. 2007:41). Fuera de Europa, los cientficos muchas veces desvalorizaron los
conocimientos que tenan sobre las especies los nativos que posean un profundo conocimiento
de la Naturaleza en el lugar del que eran originarios. Por ejemplo, cuando los europeos
descubrieron Amrica y se relacionaron con sus pueblos originarios, desatendieron esa valiosa
fuente de conocimiento.

Los nombres nativos parecen perder toda importancia y repetidamente los


expedicionarios los sealan como nombres ilegtimos. Para Antonio de
Ulloa, "el lenguaje Quechua de los Incas se aproxima ms al lenguaje de los
nios". Al parecer, los nativos no comprendan las palabras y los
conocimientos propios de cualquier sociedad civilizada como Dios,
virginidad o inmaculada concepcin. Los indgenas americanos tenan
innumerables nombres para plantas pero no una nica palabra que se
pudiera traducir como rbol. Culturas cuya supervivencia dependa del
conocimiento y uso de la vegetacin circundante, reconocan numerosas

plantas de utilidad, saban cules eran sus usos, y les haban dado nombres
descriptivos. Sin embargo, es obvio que no compartan con los naturalistas
europeos [sus] conceptos de especie, gnero o clase. Para conquistar plantas
extraas, el europeo se deb[a] deshacer de contingencias locales y fabricar
"tipos ideales" conformes con el sistema de clasificacin europeo.

Nieto Olarte (2003214 )

Pocas veces los conocimientos locales han sido utilizados tanto con criterios antropolgicos
como para la investigacin farmacutica. La adecuacin o no de las taxonomas tradicionales al
criterio cientfico ha sido objeto de algunas investigaciones. nota 17

Perspectivas actuales de la ciencia de la Taxonoma[editar]


En la dcada de 2000 se ha vuelto a poner de moda la ciencia taxonmica en el ambiente
cientfico,133 216 217 218 debido en parte al revolucionario enfoque que posibilita la cantidad de
datos derivados del anlisis de ADN a los problemas taxonmicos,133 y en parte a la conciencia
de su utilidad, dada la crisis de biodiversidad que estamos viviendo. Nuevas tecnologas
relacionadas con la digitalizacin de los datos y la utilizacin de internet ofrecen un potencial sin
precedentes para la diseminacin de los productos de la investigacin, sin embargo al mismo
tiempo que stas emergen se observan "vigorosos intentos" hacia el encapsulamiento y el
establecimiento de nuevas barreras para la comunicacin.219 Las nuevas herramientas disponibles
generan un debate acerca de la utilidad de las reglas de la nomenclatura en su estado actual, y
plantean la necesidad de reformar los Cdigos, reformas que an se estn debatiendo y algunas
de ellas ya se han incorporado.143

El impedimento taxonmico[editar]

La taxonoma como una construccin centenaria de una tortuosa catedral.29


Quizs sorpenda que la descripcin de las especies hoy se calcula realizada slo en un 1% o
hasta un 15%, porque las plantas y los animales grandes de regiones bien pobladas como las

regiones templadas estn relativamente bien descriptos, pero fuera de ellas, como en los estratos
arbreos ms altos de las selvas tropicales o en el mundo microbiano con sus tiempos
generacionales tan pequeos que lo vuelven vasto y lo hacen evolucionar a una velocidad mucho
mayor que las plantas y animales de los que acostumbramos a vernos rodeados, las descripciones
tienen actualmente una resolucin muy baja. Como muchos autores nos recuerdan, las
descripciones de especies "nunca estn completas",155 98 220 ya que los descubrimientos de nuevos
caracteres y nuevas poblaciones que trae cada nueva lnea de evidencia y cada nueva colecta
obligan a retestear las hiptesis y chequear cmo evolucionaron los linajes. Las dems ciencias
de la vida (life sciences) se ven limitadas cuando las hiptesis taxonmicas de las que hacen uso
son poco resueltas o confiables,166 216 221 222 , lo que vuelve los objetivos de esta ciencia hoy en da
muy alejados de la demanda223 , a lo que se refiere desde224 la Convention on Biological Diversity
de 1995 como "el impedimento taxonmico".155 223 Las causas del impedimento fueron llamadas
por los cientficos "la crisis taxonmica"155 97 , o tambin "el impedimento a la taxonoma"223 , en
referencia a la relativa223 falta de recursos trasladados a alfa-taxonoma y a los impedimentos
sociales para su desarrollo, una ciencia que debe competir por los recursos limitados en
universidades y subsidios con las mismas ciencias que la tienen de impedimento.
Por recursos en alfa-taxonoma concretamente el taxnomo se refiere a225 (1) el mantenimiento a
largo plazo de las colecciones226 220 225 en instituciones dedicadas como museos y jardines
botnicos, algunos de ellos con colecciones ya centenarias que preservan los ejemplares de la
distribucin de especies en otras pocas y son una referencia de su evolucin, que deben
independizarse de los arbitrios de un investigador o "pequeo lab"cita 57 que quizs deba
deshacerse peridicamente de las colecciones que no utiliza para hacer lugar en el espacio
limitado que le es asignado en la universidad para depositar colectas nuevas; que hoy se estiman
entre 1,2 y 2,1227 o 3 mil millones228 de unidades; y cuyos curadores hacen el valioso trabajo de
re-identificacin de especies para garantizar su actualidad y evitar propagaciones de errores226
220
; y (2) el entrenamiento de nuevos taxnomos a quienes emplear en universidades y que ganen
subsidios con el objetivo de publicar trabajos de literatura taxonmica primaria (ya que slo
prepararlos, la finalidad del impresionante programa PEET224 , no funcion porque luego no
consiguieron trabajo225 ). Como la mayor parte del trabajo cientfico, el trabajo del alfa-taxnomo
es conducido en proyectos relativamente pequeos -quizs en alfa-taxonoma particularmente
pequeos220 , con un investigador principal con un laboratorio asignado en la universidad y
dedicacin part-time al proyecto, y con suerte dos o tres estudiantes de doctorado o
investigadores part-time del staff.229 La mayor parte de los subsidios (grants) otorgados por
agencias gubernamentales o internacionales dedicadas a la manutencin de la ciencia (me
gustara conocerles la cara) son otorgados a la "pequea ciencia" (small science), con una
duracin promedio de 3 aos,229 ; los investigadores mantienen su estabilidad laboral gracias a su
empleo en una universidad, a las que dedican la otra parte de su tiempo de trabajo.229 Las
universidades perciben un porcentaje de los subsidios adquiridos por sus investigadores por lo
que tienen preferencia por ocupar investigadores que los obtengan. En ciencia, pocos proyectos
son ambiciosos e involucran docenas de cientficos, normalmente enfocados en la toma de datos
relativamente homogneos y en cantidad gigantesca organizados alrededor de alguna
instrumentacin cara y dedicada,229 la llamada "big science" que aporta "big data", de la que los
ejemplos que suelen mencionarse son la astronoma y la fsica de las partculas de alta energa.230
Las agencias de subsidios obligan a la alfa-taxonoma a competir con otros proyectos para ganar
los grants, pero sta termina relegada por razones en apariencia emocionales216 -muchos usuarios

y hasta cientficos ven a la alfa-taxonoma o taxonoma descriptiva como una "ciencia


polvorienta",231 232 ocupada de tomar caracteres de las colecciones como si no fuese hacer
ciencia216 98 97 232 233 o hacen lo que no es "top" ni trending220 ni los pequeos taxones de los que se
ocupa cada uno pueda afectar al trabajo del resto de la facultad220 ni generar puntos
sobresalientes en un currculum.216 Los estudiantes que lo perciben no tienen inters en esa
especializacin.225 234 "Las cuevas" los llaman a sus laboratorios, "las cuevas del cuarto piso".220
Para que vuelva el atractivo de recursos a la alfa-taxonoma, se necesita un cambio cultural tanto
en la comunidad cientfica como en las agencias que la subsidian.235 225 El trabajo de un cientfico
debe ser visible para que pueda ser evaluado,236 232 de forma de promocionar la calidad y
desalentar las conductas inadecuadas.236 Hace dcadas que se lo evala en lo que se convirti uno
de los puntos ms sobresalientes en el currculum de un cientfico:220 235 la cantidad de
publicaciones en revistas cientficas y el prestigio de cada revista en la que se ha publicado
medido en forma de "factor de impacto", este ltimo calculado por el Institute of Scientific
Information (ISI), desde los '90 parte de Thomson Reutersnota 18 . El factor de impacto como
actualmente calculado es, en cada ao determinado, de las revistas indexadas en la Web of
Science (WoS) -ndice mantenido por Thomson Reuters-, la cantidad de veces que se han citado
durante el ao los artculos publicados en esa revista en los 2 aos anteriores a ese, dividido el
nmero total de artculos publicados por esa revista en esos dos aos225 238 . Los cientficos
intentan publicar en revistas de alto impacto para alimentar su currculum, pero stas suelen
rechazar los trabajos de ndole taxonmica debido a que ocupan mucho espacio en la revista y
argumentan239 que su baja cantidad de citas -que no necesariamente lo son de hecho, sino por
convencin240 225 241 - en los 2 aos siguientes les disminuir el factor de impacto. Las
publicaciones taxonmicas son largas, requieren muchas ilustraciones, y tpicamente tienen una
audiencia muy especializada que dura por muchos aos: la vida promedio de una monografa
taxonmica puede calcularse en dcadas o hasta centurias, en lugar de en meses o en aos como
el comn de las publicaciones.242 225 Al autor a su vez le toma aos o incluso dcadas la
realizacin de una monografa.235 Siendo una parte fundamental aunque implcita de la estructura
de un trabajo cientfico, artculos muy diversos utilizan la informacin o las claves recogidas de
cada publicacin de alfa-taxonoma, pero no hay costumbre de citarlos en las referencias
(algunas revistas requieren que al nombrar un taxn se cite el autor del nombre y la primera
descripcin, pero tampoco requieren que se los cite en las referencias).241 225 232 235 La informacin
recogida impresiona como si no necesitara un autor que la respalde, no hay inters de las
editoriales en citarlos243 , ni una vez publicados se agrega la cita correspondiente en los ndices
de los que se hacen los anlisis de rnkings, por lo que los autores de las descripciones y claves
no son adecuadamente reconocidos por su trabajo235 . Payne et al. (2012235 ) encontraron que las
"citas perdidas" (missing citations) de publicaciones de alfa-taxonoma en las referencias pueden
ser de 18 hasta ms de mil veces el nmero de citas realizadas, lo cual demuestra la cantidad de
veces que puede utilizarse y reutilizarse un dato taxonmico que pasa desapercibido en las
mediciones de impacto. Adems, la necesidad de cumplir con un umbral de impacto, que no
mide la calidad ni la necesidad de la descripcin de un taxn, sino la "atencin"244 que se le
presta al mismo, provoca la desercin en sub-campos de investigacin pequeos o impopulares245
, por lo que los llamados "taxones subrepresentados", con pocas especies pobremente descriptas,
se mantendrn en esa situacin si se los sigue ignorando225 . Otro sesgo lo da la popularidad que
ganan los estudios que testean las hiptesis taxonmicas exclusivamente por mtodos
moleculares, y publicaciones sobre los muy publicitados ADN barcodes, si bien sta es slo una

de las herramientas utilizadas por los taxnomos para testear los lmites de los taxones y para
identificarlos225 . Siendo investigadores que trabajan y publican en general en solitario en
laboratorios aislados del resto de la facultad,220 el nmero de citas de las publicaciones de un
taxnomo se reduce entonces a las que hacen los pocos, si es que hay alguno, taxnomos
especializados en el mismo taxn en los dos aos siguientes a las espordicas publicaciones, y a
su vez si estos colegas publican en las -hasta hace unos aos pocas- revistas taxonmicas
cubiertas por el ndice de Thomson Reuters.242 Los trabajos publicados para el lego o no
intencionados para ser citados, como las guas de campo, no son valorados. El taxnomo no
percibe la conveniencia de publicar todo el material que tiene,224 245 246 y una fuente de
conocimiento valiosa se pierde con el retiro del especialista, volvindose atrs en las hiptesis
taxonmicas sobre su taxn.224 247 La alfa-taxonoma es claramente uno de los campos que ms
ganarn si cambia el modo de calcular el rnking de una publicacin cientfica, en esta "era del
factor de impacto" (HCJ Godfray104 , S Knapp104 , I Agnarsson225 , M Kuntner225 , YL Werner245 ,
R Page248 , MC Ebach223 249 , AG Valdecasas250 251 223 249 , QD Wheeler223 249 , S Castoviejo250 , LF
Marcus250 , MR de Carvalho249 , DM Williams249 , SS Nihei249 , MT Rodrigues249 , T Grant249 , LF
Silveira249 , H Zaher249 , AC Gill249 , RC Schelly249 , JS Spaks249 , FA Bockmann249 , B Sret249 , HC Ho249 , L Grande249 , O Rieppel249 , A Dubois249 , A Ohler249 , J Faivovich249 , LCS Assis249 , PZ
Goldstein249 , EAB de Almeida249 , G Nelson249 , JL Payne235 , FA Smith235 , M Kowalewski235 ,
RA Krause Jr235 , AG Boyer235 , CR McClain235 232 , S Finnegan235 , PM Novack-Gottshall235 , L
Sheble235 , CHC Lyal, AL Weitzman193 , T Borsch, P Hernndez-Ledesma, WG Berendsohn, H
Flores-Olvera, H Ochoterena, FO Zuloaga, S von Mering y N Kilian 2015 manuscrito
aceptado252 , JV Crisci253 , F Boero237 , H Wgele233 , A Klussmann-Kolb233 , M Kuhlmann233 , G
Haszprunar233 , D Lindberg233 , A Koch233 y JW Wgele233 , KA Seifert254 , PW Crous254 , JC
Frisvad254 , P Pyek240 , PE Hulme240 , LA Meyerson240 , GF Smith240 , JS Boatwright240 , NR
Crouch240 , E Figueiredo240 , LC Foxcroft240 , V Jarok240 , DM Richardson240 , J Suda240 , JRU
Wilson240 , van der Velde255 , F-T Krell256 , J Ellis257 , HA Bentez258 , LA McDade259 , DR
Maddison259 , R Guralnick259 ,HA Piwowar259 , ML Jameson259 , KM Helgen259 , PS Herendeen259 ,
A Hill259 , ML Vis259 , GH Pyke260 , B Pll-Gergely261 , P Venu262 , M Sanjappa262 , a pesar de la
respuesta del creador del IF, E Garfield263 ). PA Lawrence recordaba en el 2008243 que la forma
ms segura de evaluar un trabajo cientfico es leyndolo, lo cual era la forma habitual de hacerlo
en el pasado.
La autora de la publicacin de datos crudos, como secuencias de ADN, imgenes, datos de
ocurrencia o de coleccin y de caracteres de cada especmen (R Page248 , MJ Costello264 265 266 , B
Vanhoorne264 , W Appeltans264 , WK Michener265 , M Gahegan265 , ZQ Zhang265 , PE Bourne265 , E
Vanden Berghe266 , X Huang246 , BA Hawkins246 , F Lei246 , GL Miller246 , C Favret246 , R
Zhang246 , G Qiao246 , VS Chavan267 228 , L Penev267 , D Hobern267 , P Ingwersen228 , Thomson
Reuters 2012268 ), evaluara al taxnomo con la evaluacin de la calidad de los mismos y del
trabajo que respaldan264 265 267 . Los datos crudos son el fundamento del trabajo taxonmico, y
hace dcadas era algo ms usual publicarlos,265 pero luego se bajaron los costos de la publicacin
en papel265 y a pesar de que revistas electrnicas como Zootaxa y Phytotaxa y repositorios
externos con la infraestructura y la capacidad de almacenamiento requeridas han reabierto esa
posibilidad265 al 2015, como en biologa en general, la situacin no se ha revertido y todava son
raramente publicados, como son raramente citados formalmente.269 270 Cuando se les pregunta, la
mayora de los cientficos contesta que guarda datos no publicados de experimentos publicados y
tambin de experimentos "que no dieron" (que no rechazaban una hiptesis nula y no seran

aceptados para publicacin), que "descansan en el sector inferior de la cajonera del lado
izquierdo de su escritorio", y la mayora de las veces termina en la basura al momento del retiro
del especialista, "an en los retiros ms planificados", porque nadie -ni siquiera el cientficosabe exactamente qu hay en esos medios de almacenamiento y formatos que van quedando
obsoletos ya que les falta la documentacin adecuada para retomarlos cuando los metadatos no
anotados ya fueron olvidados.229 En las encuestas como la publicada en Huang et al. (2012246 ) o
la hecha por Thomson Reuters en 2010 (Fig.1270 ) la mayora de los cientficos estara de acuerdo
en publicar sus datos en internet de forma open access si recibiera reconocimiento por ello en
alguna forma similar a la publicacin en revistas cientficas, como coautora o citas indexadas en
bases de datos utilizadas en clculos de mtricas relevantes como las mediciones de factor de
impacto270 246 236 . Sin embargo, y a pesar de que parece evidente que la publicacin de los datos
aumenta el nmero de citas de la publicacin cientfica que hace uso de ellos271 , al 2010 la
proporcin de datos subidos a GBIF, el repositorio ms grande de ocurrencias de especmenes
creado en el 2001 para satisfacer un objetivo clave de la Convention on Biological Diversity,265
baj ao a ao en relacin a la que se detecta o "encuentra",265 y de ella slo fragmentos estn
asociados a publicaciones cientficas, siendo la mayor parte datos de colecciones financiadas por
organizaciones gubernamentales265 , y ms de la mitad de los que lo haban hecho que
contestaron la encuesta denegaban la responsabilidad de la calidad de los datos subidos a ese
repositorio265 . Al 2013 est demostrado que una poltica que hiciera mandataria la publicacin de
los datos con un aseguro de su preservacin y acceso al momento de la publicacin del paper
altera este paisaje para los autores,272 y desde el 2011 se han reforzado polticas en esta direccin
por parte de varias editoriales, gobiernos y organizaciones (p.ej. Canad273 , USA274 , UK275 , la
National Science Foundation NSF276 , Evolution277 278 , The American Naturalist278 , Journal of
Evolutionary Biology278 , otras adherentes a la poltica JDAP279 279 278 , PLOS journals280 ). El
mismo presidente Obama resalt en su discurso al estilo inicio de sesiones State of the Union
2012 que la "data management" ser una de las habilidades crticas de trabajo en este siglo
XXI.281
Volviendo al caso particular de la alfa-taxonoma, algunas conductas pueden reducir la calidad de
la informacin taxonmica y repercuten en el prestigio de la rama en general225 97 . No hay
requisitos mnimos para nombrar una nueva especie, y algunos autores estn de acuerdo en
nombrar una colecta de la que no pudo determinarse el taxn al que perteneca luego de la
revisin taxonmica siempre que est correctamente depositada en una coleccin accesible por
otros taxnomos, como si se fijara un epteto a un "tipo" para despus circunscribir las especies
cuando pueda presupuestarse282 , pero muchos autores denuncian que hay colectas que estn
siendo nombradas formalmente sin que el paper brinde la posibilidad a los dems bilogos de
retomar o testear sus hiptesis, o sin haber hecho una revisin taxonmica exhaustiva que lo
justificara.97 225 Al 2011, el nmero de descripciones de especies ha aumentado, pero el nmero
de revisiones de su taxonoma ha disminuido, lo que se evidencia en cmo disminuy el nmero
de taxones tratado por cada investigador (Joppa et al. 2011283 , Von Staden et al. 2013284 ).
Decenas de miles de nombres nuevos se publican por ao142 , de los cuales un porcentaje muy
alto, que segn el autor y el taxn tratados puede ser estimado entre el 25 y el 75%, sern
sinnimos de nombres previos de especies ms ampliamente distribuidas o ms variables que lo
originalmente descripto.285 En plantas angiospermas, quizs el grupo ms estudiado, se calcula
que hay 5 veces ms nombres cientficos que especies segn los conceptos taxonmicos
actuales.286 No parece que se valoren los data papers, las publicaciones que exponen los datos de

las colectas sin cambios en las hiptesis taxonmicas, y se sobrevaloran los papers que contienen
actos nomenclaturales como el establecimiento de nombres nuevos, lo cual alimenta las
conductas inadecuadas.287 . Su programacin es sencilla, pero las iniciativas tecnolgicas que
actualmente se ofrecen pblicamente difcilmente buscan la transparencia en los "conceptos de
taxn" y delimitaciones y los enlaces correspondientes a la literatura existente, nombres,
protologos, especmenes, tipos, matrices de datos de caracteres, etc.252
Ms all del reconocimiento, variadas propuestas se han hecho del tipo de modernizar la
infraestructura para mejorar la eficiencia del trabajo, algunas de las cuales se vern en las
secciones siguientes. La que sobrevuela todas ellas es la de digitalizar y proveer acceso online a
los recursos taxonmicos.285 Se propone digitalizar la literatura en papel288 289 290 , que las
publicaciones sean de contenido libre (ej.155 291 292 , pero ver293 ), que los museos digitalicen sus
colecciones294 292 227 295 , que stas sean de contenido libre292 296 , que se digitalicen otras fuentes
de informacin taxonmica como datos de observaciones/localidad u "ocurrencias"297 y listas de
especies por regin o "checklists"298 , que hubiera "megarrevistas" electrnicas para las
publicaciones taxonmicas -que pueden llevar ms de mil pginas-,299 300 , que stas sean openaccess300 , que se alojen los datos "crudos" (raw data) utilizados en las publicaciones en bases de
datos pblicas para verificacin235 , que esos datos estn relacionados con claves interactivas217 285
, que stas sean accesibles217 , que sean actualizables.285 Son muchas las propuestas de un nico
portal que tenga acceso a todas las bases de datos, tanto de colecciones como de bibliografa
(p.ej. EOL286 ), a veces asociada a la propuesta de relacionar esos datos en una nica
clasificacin, como son comunes las propuestas de crear listas de taxones establecidos301 .
Tecnologas que se promueven son la digitalizacin 3D de imgenes de preparados al
microscopio (ej217 ,rSEM302 ), la creacin de fotografas focus stacking de especmenes tipo,
ensamblarlas en imgenes 3D294 302 , que los museos compren la tecnologa para el anlisis de
ADN y quizs encontrar "barcodes" (ej. Tautz et al. 2003247 ), que se implemente la toma de
datos telemtricos y monitoreo satelital de distribucin y ecologa (Patterson et al. 2006286 ).
Estas iniciativas son tecnolgicamente sencillas, en este momento las principales dificultades son
la falta de estandarizacin de los formatos -para lo cual est trabajando el TDWG-, las
dificultades en la creacin de registros centrales143 , ndices especializados e Identificadores
Globales reusables303 , y la financiacin, que no debe perder el objetivo que es obtener
descripciones de taxones que incluyan claves de identificacin bien documentadas193 y
accesibles217 193 que eviten la duplicacin de esfuerzos en el futuro. La curacin de datos
primarios, que salvo en algunos pocos taxones en su mayora estn desactualizados o ya son
poco confiables217 , ha probado ser el primer paso217 143 y si bien se financiaron proyectos
"horizontales" en miras de organizar una "big science" a partir de una "small science"
articulada,229 como GBIF (repositorio de ocurrencias y fichas de coleccin de especmenes) o el
registro de nombres y actos nomenclaturales Zoobank; al '2010 ha demostrado ser ms realista
organizarse por taxones de tamao ms pequeo143 y con ellos facilitar la creacin y evaluacin
de monografas taxonmicas216 , las que parecen demostrar ser la forma ms segura de reduccin
de la sinonimia, y la puerta de entrada ms firme a la era digital217 225 .
El copyright ("derecho de copia") es de concernimiento en la preservacin de la literatura
taxonmica. La literatura taxonmica primaria en una distribucin sin formato no se vera
afectada por las leyes que restringen la realizacin de copias y su distribucin (p.ej. el Convenio

de Berna), pero son pocos los investigadores que publican comentarios al respecto (p.ej. Costello
2009) y parece que las editoriales no se hacen eco del tema.
nicamente las publicaciones de De Carvalho y colaboradores brasileos denuncian la existencia
de "piratas de la biodiversidad".

El rol del ADN y los "marcadores de ADN"[editar]


Los anlisis moleculares de ADN se utilizan hoy habitualmente en los anlisis filogenticos y
unos pocos cientos de bases, con su cantidad enorme de combinaciones potenciales, parecen
bastar para hacer anlisis de identificacin y parentesco.133 Esto llev a autores como Hebert et
al. (2003304 ) y Tautz et al. (2003247 ) a proponer asignar un rol central al ADN en la descripcin e
identificacin de las especies, de forma que una muestra de ADN y la lectura de una de sus
secuencias de bases debera ser una especie de marcador para ubicar el taxn al cual pertenece un
espcimen. La lectura de una secuencia de ADN se utilizara de una forma similar a como se usa
el cdigo de barras en los supermercados. Tautz et al.247 incluso proponen refomar los Cdigos
para que este "identificador" sea un carcter agregado al "tipo". Esta "Taxonoma basada en
ADN" an adolecera de muchos de los mismos problemas que tienen las dems propuestas de
identificaciones o de agregar atributos al "tipo": por ejemplo, hay que decidir qu secuencia usar,
ya que algunas secuencias no dan una informacin que diferencie al taxn de los dems. Esto
puede ser porque un mismo gen puede mantenerse inalterado durante millones de generaciones y
especiaciones despus de su formacin, o debido al fenmeno de introgresin, de forma que un
gen que se haba diferenciado vuelve a su estado anterior. Por lo tanto, de la misma forma en que
no es conveniente confiar en un solo carcter morfolgico para identificar una especie, tampoco
es conveniente confiar en una sola secuencia de ADN. An cuando la "Taxonoma basada en
ADN" fuera financiada, habra que preguntarse si es necesario agregar un requerimiento extra al
ya lento proceso de describir nuevos taxones, en especial teniendo en cuenta que se calcula que
slo el 10 % de las especies del planeta ha sido descrito. Debido a eso, probablemente la mayora
de los bilogos ver las secuencias de ADN como un complemento de la informacin
morfolgica, ms que intentar reemplazarla buscando verdaderos barcodes. Otro problema es
que aunque se agreguen caracteres a la descripcin, los cambios de nombres que ms molestan y
aburren a los bilogos son los que se dan no por deficiencias en la anterior circunscripcin de los
taxones, sino porque cambian los conceptos utilizados para definirlos. De todas formas, los
Cdigos no especifican ningn carcter en particular para diagnosticar nuevos taxones, as que la
"Taxonoma de ADN", con el tipo nomenclatural de costumbre, ya es vlida, aunque la
identificacin mediante caracteres visibles puede ser de uso ms inmediato y econmica que la
lectura de un verdadero barcode.133 193 305 306 307 253 308
Al 2003 ya era rutina que los microorganismos se delimitaran con mtodos moleculares,308 133 y
est claro que para dilucidar el rbol de la vida completo, sera til secuenciar los mismos genes
en muchos taxones diferentes133 . Para lograr esto, sera necesario un "proyecto genoma
horizontal" y un sistema de archivo de ADN, ms all de si el ADN se vuelve un requerimiento
en la descripcin o identificacin de especies o si se lo agrega al "tipo"133 . Dos proyectos han
recibido el millonario presupuesto para comprar la tecnologa para la secuenciacin de
barcodes306 98 -nombre que qued a las secuencias seleccionadas por los proyectos
presupuestados-, el Barcode of Life Data System309 (BOLD)308 310 , y el Consortium for the

Barcode of Life311 (CBOL, "Consorcio para el cdigo de barras de la vida") formado en el


2004.308 Sus seguidores promocionan los casos de macroorganismos en que el agregado de esa
lnea de evidencia molecular a las hiptesis taxonmicas llev al esclarecimiento de problemas
de sinonimias, como cuando sta logr diferenciar en 4 especies "crpticas" la sanguijuela
medicinal europea.312 ,313 ). Pero para que un barcode de un especmen fuera til debe estar
acompaado de la matriz de caracteres del especmen tomados de otras lneas de evidencia, al
menos la morfolgica, de forma de poder utilizarlo en una matriz de anlisis filogenticos -y slo
posteriormente se podra hacer una clave de identificacin.97 98 314 132 Al 2013, los barcodes se han
producido a una velocidad mayor que la revisin taxonmica que debera acompaarlos, lo que
ha hecho proliferar en repositorios como el estadounidense GenBank los llamados "taxones
oscuros" (dark taxa), que podran pertenecer a taxones conocidos en los que el organismo del
que se extrajo el ADN an no haya sido ubicado, o a taxones nuevos.30 Muchos barcodes "sin
nombre" (unnamed) haban sido suprimidos por GenBank, pero aun as su nmero sigui
aumentando en los ltimos aos.30
En respuesta a la intensa propaganda220 realizada a favor de esta tecnologa -que para muchos
autores desbalanceaba las necesidades presupuestarias de la alfa-taxonoma98 97 -, el trmino
"taxonoma integrativa" fue acuado independientemente y casi al mismo tiempo110 por Dayrat
(200597 ) y Will et al. (200598 ), el ltimo luego de una conferencia, el DNA barcoding debate
Will vs. Hebert,98 el "padre del barcode"231 . Desde esa fecha un considerable218 110 nmero de
estudios taxonmicos se hizo eco del trmino. La taxonoma o aproximacin integrativa alude a
la prctica tradicional, y la esperable en taxonoma, de integrar lneas de evidencia durante la
generacin de hiptesis taxonmicas, y en particular a la integracin de los mtodos moleculares
con los morfolgicos como la nica primera aproximacin vlida para delimitar especies.97 98

La crisis de biodiversidad[editar]
La crisis de biodiversidad causada por actividades humanas, como las que llevan a la prdida del
hbitat y la introduccin de especies exticas, es tal vez comparable en magnitud a las grandes
extinciones registradas en los perodos geolgicos (PH Raven 2002315 ). El trmino
"biodiversidad" fue acuado316 por EO Wilson en 1985317 como un reemplazo eufnico de
"diversidad biolgica", en una serie de populares ensayos donde pona el foco en sta y su crisis;
en 1992, el tratado internacional llamado Convenio sobre la Diversidad Biolgica (Convention
on Biological Diversity), ratificado por todos los pases miembros de la ONU salvo Estados
Unidos, reconoci como un derecho internacional la valoracin de la biodiversidad en el
contexto de su conservacin y uso sustentable, sin embargo, existe una conciencia general de que
no ser posible conservar toda la biodiversidad.318 Los especialistas deben calcular en qu
hbitats y en qu especies focalizar los magros presupuestos asignados a la conservacin,
priorizar los hotspots (regiones con una concentracin de especies endmicas con peligro de
perder el hbitat319 283 ), y generar modelos predictivos acerca del futuro de la biodiversidad.320 . A
1995, se haba hecho evidente para el CBD que los especialistas no pueden medir una
biodiversidad no descripta, lo que bautizaron como "el impedimento taxonmico",155 223 a raz del
cual el organismo impuls el desarrollo de la alfa-taxonoma. Las medidas concretas
encaminadas a cumplir estos objetivos empezaron a ser visibles en algunos pases e instituciones
internacionales a fines de 1990296 , momento a partir del cual se hizo evidente un segundo
impedimento: la eleccin del concepto taxonmico a utilizar tiene sus consecuencias en las

decisiones de conservacin. Por ejemplo, Peterson y Navarro-Sigenza (1999321 ) analizaron la


cantidad de especies de aves endmicas de Mxico utilizando dos clasificaciones diferentes
basadas en distintos conceptos de especie. Segn el concepto biolgico de especie o BSC (que
agrupa dentro de la misma especie a los organismos con capacidad de hibridar y dar
descendencia frtil), obtuvieron 101 especies, con la mayor concentracin de especies endmicas
en las regiones montaosas del sur y del oeste. En cambio segn el concepto filogentico de
especie o PSC (que asigna como miembros de una especie a los que poseen evidencia de
conservar caracteres en un anlisis de filogenia, ms all de si pueden hibridar con otras
poblaciones o no), obtuvieron 249 especies endmicas, con la mayor concentracin en zonas
tanto llanas como montaosas del oeste. La eleccin de una clasificacin u otra, por lo tanto,
afecta enormemente las prioridades de conservacin de cada hbitat. La estabilidad que
presentaron por al menos dos dcadas hasta 1985 algunos taxones bien conocidos como los
primates, contrasta fuertemente con la reciente incertidumbre sobre el concepto de especie a
utilizar y la "inflacin" en su nmero, que especialmente en los grupos bien estudiados, ocurri
en parte significativa por un cambio en la preferencia de los taxnomos del concepto de especie
biolgica o BSC al concepto de especie filogentica o PSC.107
La preferencia de conservacin de la categora especie trajo un problema extra a la
clasificacin.107 Esto ha animado la elevacin al rango de especie a las poblaciones que
necesitaban proteccin, ms all de si la decisin poda ser respaldada cientficamente.107 El
fenmeno fue descrito en la tortuga negra Chelonia agassizi, pero es probable que haya ocurrido
tambin en otros taxones.107 Esta inflacin de especies estara sesgada hacia formas carismticas,
de gran tamao, raras y en peligro de extincin, que atraigan inters del pblico y cientfico para
su conservacin.107 Un inters local puede llevar a una poblacin a ser listada aparte, pero su
sobrevivencia puede ser ms probable si se la gestiona como un componente de una
metapoblacin viable. (Isaac et al. 2004107 ) Ha habido otras propuestas de medidas de
biodiversidad, con sus consecuencias en las propuestas de conservacin, se ha propuesto como
medida de biodiversidad la categora de gnero (incluso en primates, como en Harcourt et al.
2002322 ) o las poblaciones, otros estudios abandonaron la taxonoma biolgica para describir la
biodiversidad con medidas de "diversidad filogentica"107 . Sin embargo, esas medidas pueden
quitar atractivo presupuestario debido a que la opinin pblica favorece los taxones especie
como unidad de medida.107 Una solucin sera que los checklists o inventarios (listas de especies
por regin) se agreguen de forma globalizada especificando el concepto de especie utilizado y se
enlazaran a sinonimias bajo otros conceptos de especie,107 de forma que se sincronicen todas las
clasificaciones que afectan una regin para presentar su diversidad taxonmica sin dejar de lado
ninguna autoridad. La tecnologa para hacerlo est disponible, pero se necesita una inversin
institucional fuerte y de largo plazo107 .

Biodiversidad informtica[editar]
La digitalizacin de la taxonoma entra en su mayor parte en el campo de la informtica de la
biodiversidad (biodiversity informatics), la informatizacin de la diversidad biolgica en la
categora de los organismos,323 delimitada de la bioinformtica (bioinformatics), que trabaja a
nivel molecular y otras lneas relacionadas como la fisiologa -y que es donde se clasificaran las
secuencias de ADN archivadas en GenBank-, y de la ecoinformtica (ecoinformatics), a nivel de
los ecosistemas. (Berendsohn et al. 2011323 )

El material a digitalizar consta de los "datos crudos" y sus metadatos, y de la literatura


taxonmica primaria o "datos primarios" y sus respectivos metadatos. La digitalizacin requiere
un id nico para cada uno de ellos, idealmente "global", es decir nico en internet. Por ejemplo la
forma ms directa de crear un id global es concatenar el id del dato en la base de datos con el
identificador de esa base de datos en internet. Hay varias propuestas de formacin de id globales
y alguna de ellas puede volverse estandarizada en el futuro, cuando la aceptacin por parte de la
comunidad de usuarios lo decida. En internet adems se busca que este GUI (identificador global
nico, global unique identifier) pueda "resolverse", enlazarse a travs de internet a un archivo
con sus metadatos y quizs una lista de enlaces a copias del dato taxonmico, los dos alojados en
su base de datos online, en lo que cuando son adecuadamente citados se llam el mundo
emergente de los Linked Open Data de la Big New Biology, la "Nueva Biologa Gigante" ms
"data-cntrica".230 Las discusiones en la comunidad de la informtica de la biodiversidad se
enfocan en 3 tipos de GUIs: los HTTP URIs (es decir URLs), los GUI recomendados como
estndar por el TDWG que son los LSID (que hacen uso de los DNS de internet para resolverse),
y los DOI, que hacen uso de una autoridad central para resolverse y son por ejemplo los
asignados por CrossRef para publicaciones cientficas152 . Los GUIs no ocupan espacio en las
publicaciones taxonmicas porque los metadatos y el material al que hacen referencia pueden
agregarse en bases de datos externas, las bases de datos deberan ser "copiables" para amortiguar
la posibilidad de que metadatos y datos se pierdan, y para independizarse de las autoridades que
mantienen las bases de datos mediante buscadores -search engines- especficos o inespecficos
que indexen los GUI, sus metadatos, sus locaciones y usos posteriores de los mismos30 . Como la
unidad de trabajo en la clasificacin es el organismo, los datos crudos y la literatura primaria
deberan enlazarse a los id de los organismos o cepas referenciados en ellos, por lo que implican
la necesidad de un GUI por organismo/cepa. Los id de los organismos son el taxn terminal de
las clasificaciones segn cada autor.
Los datos crudos y primarios pueden agregarse en proyectos "verticales" de un taxn algo
superior o con lneas de evidencia que requieren diferentes especialistas, la digitalizacin de los
metadatos primarios, al menos de ellos los que tengan "actos nomenclaturales" (establecimientos
de nombres, etc.) por taxn "vertical" en miras de crear los tan esperados registros centrales de
nombres necesarios para los Cdigos en uso es considerada una prioridad para el BioCode.143
Tambin hay proyectos "horizontales" como los de ADN barcodes, la Biodiversity Heritage
Library que digitaliza literatura taxonmica, los proyectos que digitalizan los especmenes y sus
metadatos (ficha de coleccin, etc.) de las colecciones de los museos. Algunos sitios web, como
la Encyclopedia of Life (EoL) son "iniciativas globales", funcionan como portales que presentan
la informacin "agregada" de "asociados" (partners), las bases de datos indexadas en ellos. El
candidato obvio para ser el id que combinara bases de datos diversas haba sido el nombre
cientfico, como fue utilizado en iSpecies y EOL, pero pronto se vieron sus limitaciones como
identificadores debido a que no son ni completamente estables ni globalmente nicos: en los
nombres cientficos son permitidas, o inevitables, las sinonimias y las homonimias.152 Idealmente
en el futuro los nombres cientficos sean reemplazados por id de conceptos taxonmicos29 30 , que
al resolverse guen a la cita a la que corresponde la descripcin del taxn utilizada con todas sus
referencias30 .
Entre las iniciativas ms populares desde el 2003 quizs estn:133

GBIF324 Financiado por agencias gubernamentales en acuerdos internacionales luego del


CBD. Portal de acceso a los datos de ocurrencias provenientes de cientos de instituciones
de todo el mundo. Recomienda enviar las colaboraciones individuales a iNaturalist325 ,
eBird326 o la Encyclopedia of Life (EOL).327

Species 2000328 . Al 2015 se lee: "ITIS y Species 2000 se han asociado para formar el
Catlogo de la Vida (Catalogue of Life, CoL) que orgullosamente provee el esqueleto de
la Enciclopedia de la Vida (Encyclopedia of Life, EOL329 )".330 331 La Enciclopedia de la
Vida naci en el ao 2003332 y se puede agregar informacin, registrndose como usuario.
Es muy publicitada en Science (por ejemplo en Stuart et al. 2010333 ).

Tree of Life334 , desarrollado en los '90 y anunciado formalmente en 1996,335 el esqueleto


taxonmico lo provee la comunidad cientfica, la comunidad de usuarios puede agregar
contenido multimedia por taxn. Al 2007 se lea, "muchos usuarios y contribuyentes de
Tree of Life han notado el extenso solapamiento en los objetivos de EOL y ToL, y ha
habido algn concernimiento acerca de la supervivencia a largo plazo de ToL corriendo
en paralelo de un proyecto similar pero mucho ms grande, financiado a una escala de
rdenes de magnitud por encima de los recursos de ToL. En orden de evitar la
duplicacin de esfuerzos, ToL y EOL han acordado coordinar cercanamente las
actividades futuras, compartir contenido y herramientas de software".336 El proyecto se
dej de actualizar en el 2011.337

Pero hubo ms de 50 proyectos en todo el mundo.133 Un problema comn a muchos de ellos


fueron las expectativas irrealistas de los usuarios respecto al nmero de datos que deban ser
curados, por lo que luego de la fundacin inicial los recursos se desvanecan y los proyectos
quedaban detenidos.338 Un ejemplo fue All Species Foundation, creado en el 2001 por un
ambicioso grupo de "Silicon-Valley types" entre los que estaban prominentes investigadores
como EO Wilson de Harvard, y Peter Raven del Missouri Botanical Garden.339 Su objetivo era
catalogar todas las especies del planeta en 25 aos, pero en el 2005 el proyecto haba muerto.339
Se haban terminado las donaciones luego de finalizada la "explosin de la burbuja punto com"
(dot.com bubble burst), una visita del 2005 a su pgina web slo deca, "Nos fuimos"
("Gone").339 Ni los assets fueron reusados.339 Pero EO Wilson ya haba retomado la idea340 en su
nuevo proyecto, la Encyclopedia of Life (EOL), con el objetivo a plazos ms modestos de una
pgina web para cada especie del planeta, presentada por el mismo EO Wilson en el 2003.341

Cajones entomolgicos en un corredor de la torre 4 del museo del Naturalis Biodiversity Center.

Pero si bien ya en el 2010 Padial et al.218 calcularon que tomara 400 aos de trabajo taxonmico
constante llegar a describir las cerca de 10 millones342 de especies de eucariotas, al 2012, la
realidad es que las colecciones de historia natural estn casi tan lejos de la digitalizacin
completa como 20 aos atrs, y an no hay una verdadera database central de acceso a
colecciones, ni un registro completo de las mismas para ofrecer a los usuarios.227 A travs de
GBIF, la fuente ms grande de informacin, Ario (2010343 ) estim que eran accesibles no ms
del 3% de los datos de especmenes preservados en las colecciones de todo el mundo.227
Blagoderov et al. (2012227 ) calcularon que el costo de la digitalizacin de los cerca de 30
millones de especmenes de insectos alojados en la coleccin de entomologa del Museo de
Historia Natural de Londres, por ejemplo, tomara 23 aos de trabajo continuo de las 65 personas
que componen el staff del departamento, y en el mundo, dependiendo de la coleccin los costos
varan entre 0,50 a unos cuantos dlares por especmen para capturar sus datos completamente,
por lo que la digitalizacin completa de todas las colecciones de historia natural del planeta
costara unos 150 mil millones de euros y tomara unos 1500 aos.227 La solucin ms comn
propuesta es la prioridad de la digitalizacin en base a la demanda, tambin se propone financiar
los costos de una digitalizacin "industrial" de las colecciones.227
Zootaxa fue la primera "megarrevista"299 electrnica con referato. Creada en el 2001,299 lleg a
publicar monografas de ms de mil pginas299 , y en el 2004 ya se perfilaba como la mayor
revista en taxonoma zoolgica,299 momento en el que entr a las mediciones de factor de
impacto de ISI.299 344 Al 2008 se promocion como la primera en publicar un "paper
cibertaxonmico" con enlaces y otras utilidades.299 A ella sigui una generacin de nuevas
"revistas rpidas" en taxonoma,299 incluyendo Phytotaxa (2009345 346 ) y Zookeys (2008302 ).
Pensoft (Zookeys, Phytokeys, Mycokeys) distribuye desde el 2011 de rutina los datos
taxonmicos publicados hacia una serie de recursos online que incluyen GBIF, EOL, y la
indexacin en Zoobank,347 al 2015, una actualizacin del software permite que estas bases de
datos externas "cosechen" los datos de los papers que corrigen datos de papers anteriores, as los
datos se corrigen dinmicamente en ellas.347 Estas revistas tambin hicieron las primeras pruebas
de publicar papers "de datos" (data papers).267 En el 2012 los dos Cdigos permitieron la
publicacin electrnica de actos nomenclaturales, facilitando el uso de este recurso.299 348 345
Las revistas tradicionales en papel tambin han aprovechado la publicacin electrnica. Algunas
de ellas exigen que los datos crudos (raw data) sobre los que fueron tomados los datos de
publicaciones taxonmicas sean alojados en bases de datos pblicas de forma de volver las
hiptesis taxonmicas ms transparentes y verificables.235 Tambin es usual que utilicen la
opcin de publicar artculos que remitan a artculos "suplementarios", publicados en formato
exclusivamente electrnico.
Por otro lado, al 2014, las bases de datos externas ofrecen la posibilidad de publicar monografas
taxonmicas fuera del circuito de las revistas cientficas, con las facilidades que podra dar una
base de datos interactiva.285 252 Algunos softwares para monografas son las plataformas
Scratchpads, KE-EMU, Diversity Workbench Platform, EDIT Platform for Cybertaxonomy (el
ltimo el nico de los listados con capacidad de alojar clasificaciones alternativas), softwares
para alojar una base de datos descriptivos y crear claves son Lucid, Xper2.252

La armonizacin de los Cdigos y el BioCode[editar]

La IUBS es un organismo que tiene su participacin en los Cdigos en uso y en 1985 form un
Comit de Nomenclatura Biolgica, el cual desde ese momento ha organizado numerosos
congresos y reuniones, a los que se han sumado el auspicio de la IUMS (International Union of
Microbiological Societies) y del IAPT, y el apoyo de organismos como CAB International, el
Linnean Society of London, la Royal Society of London, entre otras. En 1994 se form el
IUBS/IUMS International Committee on Bionomenclature (ICB). Fue el ICB quien propuso un
primer borrador de un Cdigo unificado de nomenclatura despus de sus esperables congresos y
revisiones que fue presentado como el "Borrador del BioCdigo 1997" (Draft BioCode 1997)
(DL Hawksworth, presidente de la IUBS143 ).
El Biocode propuso que fuera utilizado en reemplazo de los Cdigos en uso, pero su uso no fue
implementado por los autores de publicaciones taxonmicas. La crtica principal consista en que
haba baja disposicin de botnicos y zologos en aprenderse todo un conjunto de reglas
nuevas349 , argumentando que los problemas existentes podan superarse reformando cada
Cdigo en uso, lo que quizs est relacionado con la crtica de haber sido "poco maduros"350 351
352 353
al presentar una propuesta semejante.
La crtica fue escuchada y la nueva versin del BioCode, el Draft BioCode 2011, ha sido
sustancialmente reescrita de forma no de reemplazar los Cdigos actuales, sino para proveer un
marco comn que los englobe. Est repensado para ser utilizado junto con los Cdigos en uso -a
los que llama los Cdigos Especiales-, como su complemento, y est listo para su
implementacin inmediata. Es un "terso texto de slo 35 artculos", que refiere a los dems
Cdigos cuando lo considera apropiado, pero para la mayora de los propsitos puede funcionar
por s mismo. Propone un nmero de mejoras futuras, que dependen de que se hagan reformas en
los Cdigos Especiales para poder efectuarse "y que esperablemente disparen esas reformas".
Una de ellas es el requerimiento de registrar nombres nuevos y actos nomenclaturales (por
ejemplo las designaciones de lectotipos), que en la nueva versin fue modificada para tomar
ventaja de los recientes progresos tecnolgicos. Otras innovaciones propuestas son el
requerimiento de que las descripciones de nuevos taxones sean en ingls o latn (en el 2011
todava se deban hacer en latn para plantas, y en cualquier lengua en animales), la opcin de
proteger nombres y sus atributos por medio de Listas de Nombres Adoptados, el prospecto de
evitar los homnimos entre-Cdigos para los nombres futuros, y el permiso, para los llamados
organismos "ambirregnos", de usar sufijos de cualquier Cdigo para los nombres supragenricos,
independientemente del Cdigo que se est aplicando. Introduce rangos adicionales a los
primarios (profamilia entre familia y subfamilia, prognero entre gnero y subgnero, proespecie
entre especie y subespecie) de forma de implementar las reglas de forma retroactiva para todos
los tipos de organismos sin efectos desestabilizadores en el sistema actual de nombres. (W
Greuter, secretario de la ICB354 ).
A comienzos de este siglo, la rpida evolucin de las bases de datos dej en evidencia que es ms
prctica la produccin de listas de nombres adoptados por taxn, y la nueva edicin fue creada
para que sus provisiones puedan ser adoptadas en diferente momento por diferentes taxones
dentro de cada Cdigo, lo cual estara determinado por el cuerpo internacional mandatario
apropiado para cada taxn si fuera operacional. (DL Hawksworth143 ).

Algunos cambios menores fueron realizados en los Cdigos Especiales desde 1997143 355 Con la
llegada de los anlisis moleculares aument la cantidad de grupos que fueron tratados
sucesivamente bajo los Cdigos de Botnica y Zoologa, por lo que se acentu la necesidad de
armonizar la nomenclatura de protistas, que al 2011 queda pendiente. Tambin queda pendiente
un registro mandatario de nombres y una lista de nombres en uso, que al 2011 slo sigue
existiendo en bacterias (DL Hawksworth143 ).
Las variaciones de terminologa entre Cdigos, y la terminologa unificada propuesta:
BioCode
BC (de
ICBN (de
(unificado)
Bacterias)
Botnica)
Publicacin y fecha de los nombres
efectivamente efectivamente
publicado
publicado
publicado
fecha
fecha
fecha (o prioridad)
precedencia
prioridad
prioridad
anterior
senior
anterior
posterior
junior
posterior
Estatus nomenclatural
vlidamente vlidamente
establecido
publicado
publicado
registro
validacin
registro
aceptable

legtimo

legtimo

Estatus taxonmico
aceptado
correcto
correcto
Tipos o especmenes de referencia

ICNCP (de Plantas


Cultivadas)

ICZN (de
Zoologa)

publicado

publicado

fecha
precedencia
anterior
posterior

prioridad
precedencia
senior
junior

establecido

disponible

registro

-----potencialmente
vlido

----aceptado

vlido

estndar nomenclatural
(nombre del especmen o
tipo portador de tipo
fotos de referencia; ya
tipo
tipo nomenclatural
nombre
nomenclatural
que el "tipo" es toda la nomenclatural
descripcin original, que
es invariable)nota 19
taxn nominal nombre y tipo nombre y tipo
-----taxn nominal
Sinonimia
nomenclatural u
homotpica
objetiva
-----objetiva
homotpica
taxonmica o
heterotpica
subjetiva
------subjetiva
heterotpica
sustituto declarado
nombre de
(avowed substitute)
reemplazo
reemplazo
------o nombre de
------explcito (explicit
(replacement
reemplazo
replacement)
name)
(replacement name)

Prescindiendo de las reglas


conservacin conservacin
supresin
rechazo

conservacin
------supresin explcita -------

conservacin
supresin

Propuestas de un registro central de nombres[editar]


Para cerrar las "listas de nombres adoptados" Charles Godfray (2002357 ) propuso una "primera
revisin a travs de la web" como el nuevo punto de partida de la nomenclatura en cada grupo,
de forma que los sinnimos utilizados en publicaciones anteriores fueran invalidados a partir de
la validacin en Internet. El Cdigo de Bacterias ya tiene un registro central de nombres: todos
los nombres establecidos de las bacterias ahora son publicados en una nica revista, con una
nueva fecha de comienzo de la nomenclatura fijada en 1980.358 Se esperaban reformas similares
en los Cdigos de macroorganismos, pero la posibilidad de que unos pocos especialistas
pudieran monopolizar la nomenclatura fue una de las preocupaciones que llev a los botnicos a
rechazar las llamadas para un registro central de los nombres en el Congreso Internacional de
Botnica en 1999359 , propuestas similares fueron rechazadas en el Congreso de Zoologa de
199927 .133
La posible reglamentacin que haba sido parte del borrador del BioCode 1997, fue modificada
en el borrador del BioCode 2011 para incorporar las nuevas tecnologas. En el ao 2012 una
enmienda360 del Cdigo de Zoologa oficializ un registro central de nombres llamado
Zoobank,361 , la enmienda no modifica sin embargo el principio de prioridad, ni el registro es
mandatario, slo insta a que a partir del momento se informen las publicaciones taxonmicas en
esa web. En Botnica slo el Mycobank, que haba sido creado en el 2004, se adopt como
registro mandatario desde el 2013.362 Al 2015 las listas no estn cerradas.

El PhyloCode[editar]
Algunos autores argumentan problemas usando el sistema linneano de clasificacin cuando se lo
basa en el rbol filogentico (p. ej. de Queiroz y Gauthier 199093 ). El PhyloCode
(http://www.ohio.edu/phylocode363 ), creado en 1998 y actualizado peridicamente, est basado
en lo que sus autores llaman una "aproximacin filogentica" a la nomenclatura. Con su objetivo
de ser un cdigo de nomenclatura, tiene "varias similitudes en sus metas y en sus mtodos" con
lo que los autores llaman la "nomenclatura basada en rangos" (lo que otros autores llaman la
nomenclatura linneana): provee mtodos inambiguos para aplicar nombres a los taxones, para
seleccionar un nico nombre aceptado para cada taxn, y no impide a los taxnomos aplicarles
rangos taxonmicos, "contrariamente a un concepto errneo frecuente". Una de las diferencias es
que el PhyloCode aplica los nombres a "la secuencia de ancestros y descendientes, o sus
productos, los clados"; en lugar de aplicarlos "a una circunscripcin + rango". De esta forma el
Cdigo define un taxn nominalcita 58 cuando realiza la asociacin entre un nombre y un clado,93 o
ms rigurosamente, entre un nombre y las hiptesis cladsticas delimitadas por los
especificadores (otros taxones o especmenes y apomorfas) de un clado, como publicadas en la
primera descripcin.cita 58 Por ejemplo tres tipos de "tipo" o de "definiciones del nombre" son la
basada en nodos, la basada en ramas, y la basada en apomorfas. Una definicin del nombre
Asteraceae podra ser "el clado que se deriva del ancestro comn ms reciente de Barnadesia y
Aster".cita 58 Los nombres de los taxones no cambiaran con los cambios de circunscripcin

mientras se mantenga ese tipo, y como esos nombres no dependen del rango taxonmico (como
en la nomenclatura de los Cdigos que tiene reglas relacionadas al respecto, como el uso de
sufijos), entonces cuando hay cambios de categoras taxonmicas no es necesario que cambien
los nombres de los taxones (de Queiroz 201223 ).
Los autores del PhyloCode pretenden reemplazar los Cdigos de la nomenclatura linneana con
su nuevo Cdigo, lo cual no lleg a discutirse en el debate acerca de una taxonoma unitaria en el
ambiente cientfico.133 365
Sin embargo, el PhyloCode ha sido intensamente debatido en revistas cientficas de prestigio
como Taxon21 138 , y hasta aparecieron remeras universitarias con inscripciones "anti-rangos" que
fueron sospechadas de propaganda hacia ese Cdigo103 10 . La crtica principal hacia el
PhyloCode es que el sistema linneano es compatible con el rbol filogentico, por lo que no hay
necesidad de cambiar todo un sistema nomenclatural por otro; las reformas pueden proponerse
en los Cdigos en uso por los canales habituales.138 10 Otras crticas son que ese "tipo" no prob
ser en realidad ms estable138 10 , y aun dentro de una taxonoma cladista debe convivir con otros
Cdigos en especial en la categora especie138 y categoras muy altas.138 Quitar las categoras
absolutas quitara informacin sobre exclusiones y la mayora de los taxnomos ve como
suficientemente til para la comunicacin que estn impresas en los sufijos como para
abandonarlos en las categoras del grupo familia.10 103 La posibilidad de intercalar categoras sin
rango entre categoras primarias -que de hecho se hace, informalmente-, la posibilidad de que
ms de un especmen de referencia, y las apomorfas o la descripcin de un epteto descriptivo
puedan agregarse formalmente al "tipo" -lo ltimo de hecho reglamentario en taxones de
categoras ms altas-, y otras propuestas se podran hacer bajo los Cdigos en uso (p.ej.138 ,103 ),
que seran aprobadas despus de un debate adecuado y un amplio consenso. Los "nombres
descriptivos" de categoras altas de hecho cuando hacen referencia a un carcter o un plan
corporal sobresaliente se interpretan como derivados de hiptesis cladsticas que contienen las
apomorfas que definieron el plan corporal en su linaje ancestral y que le dan el nombre al grupo
-que no necesariamente es monofiltico. Por ejemplo Cavalier-Smith (2013366 ) define al reino
Fungi como derivado del linaje que adquiri rizoides absorbentes, tempranamente acoplado en
su desarrollo a la adquisicin de una pared celular de quitina con prdida de la fagocitosis,
mientras que propone abandonar el nombre del supergrupo Unikonta ("un cilio"), ya que se haba
determinado que el cilio se haba originado dos veces independientemente dentro del grupo.366
Del aluvin de publicaciones referentes al PhyloCode, las dos lecturas recomendadas por el FAQ
del ICZN son Wheeler (2004216 ) y Knapp et al. (2004148 ).

El nombre "Unikonta" bajo el PhyloCode no hubiera podido seguir utilizndose para referir a la
composicin de organismos esperada del grupo.
El PhyloCode fue slo una de las manifestaciones de los taxnomos que, en general bajo la
nomenclatura de los Cdigos en uso, sealan que es buena prctica que sea explicitado el
"concepto de taxn" utilizado (p.ej.107 ,132 ,110 ,120 para los conceptos de especie,252 en categoras
intermedias). En taxones intermedios, un ejemplo del 2007 en subfamilias de rosceas ha
quedado as:367

Subfamily Dryadoideae Juel, Kongl. Svenska


Vetensk. Akad. Handl. n.s. 58: 55 (1918):

Subfamilia Dryadoideae Juel, Kongl. Svenska


Vetensk. Akad. Handl. n.s. 58: 55 (1918):

The most inclusive clade containing Dryas (as


typified by Dryas octopetala L.), but not
Rosoideae (cf. above) nor Spiraeoideae (cf.
below).

El clado ms inclusivo conteniendo a Dryas


(como tipificado por Dryas octopetala L.), pero
no Rosoideae (cf. ms arriba) ni Spiraeoideae
(cf. ms abajo).

Included taxa: Cercocarpus H. B. and K.,


Chamaebatia Benth., Dryas L., Purshia DC.
(including Cowania D. Don)

Taxones includos: Cercocarpus H. B. and K.,


Chamaebatia Benth., Dryas L., Purshia DC.
(incluyendo Cowania D. Don)

Distinctive non-molecular features: Shrublets,


shrubs, or small trees. Symbiotic nitrogen
fixation present. Cyanogenic glycosides present.
Sorbitol present in trace amounts. Leaves
compound in Chamaebatia, simple in the other
genera. Stipules present. Hypanthium free from
ovary. Pistils 1 (Cercocarpus, Chamaebatia,
Purshia) or 4-many (Cowania, Dryas). Fruit an
achene or achenetum. Base chromosome number
x=9.

Caractersticas distintivas no moleculares:


Arbustillos, arbustos, o arbolillos. Fijacin de
nitrgeno simbitica presente. Glucsidos
cianogenticos presentes. Sorbitol presente en
cantidades traza. Hojas compuestas en
Chamaebatia, simples en los dems gneros.
Estpulas presentes. Hipanto libre del ovario.
Pistilos 1 (Cercocarpus, Chamaebatia, Purshia)
o 4-muchos (Cowania, Dryas). Fruto aquenio o
aquenetum. Nmero de cromosomas bsico x=9.

Potter et al. 2007367

La diferencia entre ambos Cdigos est en el tipo, que se traspasa de forma inalterable de taxn a
taxn

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