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Determinacin y caracterizacin de la
actividad nitrato reductasa de la bacteria
fototrfica Rhodobacter capsulatus
Conrado Moreno Vivin
Departamento de Bioqumica y Biologa Molecular, Campus Universitario de Rabanales,
Edificio Severo Ochoa, 14071-Crdoba
RESUMEN
1. INTRODUCCIN Y OBJETIVOS
Las enzimas son catalizadores biolgicos que aceleran las reacciones
metablicas. Generalmente son protenas de elevada masa molecular, cuya
actividad cataltica depende de una estructura tridimensional precisa
(conformacin nativa), de tal manera que su alteracin puede afectar negativa
o positivamente a su actividad. Para ser activas, muchas enzimas requieren la
unin, ya sea mediante interacciones dbiles o por enlaces covalentes, de
compuestos adicionales de naturaleza no proteica llamados cofactores. Estos
cofacotres pueden ser inorgnicos (metales como Fe, Cu, Ni o Mo, entre otros)
u orgnicos, en cuyo caso se denominan coenzimas. La enzima inactiva
desprovista del cofactor es la apoenzima, mientras que el complejo enzimtico
activo formado por la apoenzima unida al cofactor se conoce como
holoenzima.
En general, una reaccin enzimtica consiste en la transformacin de uno o
varios sustratos en uno o varios productos en un proceso catalizado por la
enzima. Esto se suele esquematizar de la siguiente forma:
E + S ES E + P
3. PROTOCOLO A REALIZAR
Cada grupo de prcticas dispondr de una serie de tubos de ensayo en
gradillas y de viales Eppendorf, as como las correspondientes pipetas y
soluciones a utilizar. En primer lugar se realizar una cintica de aparicin del
producto en funcin del tiempo, en segundo lugar se realizarn ensayos de
actividad utilizando diferentes concentraciones de enzima, en tercer lugar se
analizar el efecto del pH, en cuarto lugar se estudiar el efecto de la
temperatura y finalmente se realizar el clculo de la KM aparente de la nitrato
reductasa para el nitrato. En todos los casos, la mezcla de reaccin para el
ensayo de la actividad nitrato reductasa incluir el sustrato (0,1 mL de KNO3
100 mM, o concentraciones variables en el caso del clculo de la KM), un
tampn (0,2 mL de tampn BTP 0,5 M a pH 9, o a diferentes pH para el estudio
del efecto del pH), la suspensin celular como fuente de enzima (0,1 mL), el
sistema donador de electrones (0,1 mL de metil violgeno 2 mM y 0,1 mL de
una solucin recin preparada con 8 mg mL-1 de ditionito sdico en tampn
BTP 0,5 M, pH 9), y agua destilada hasta un volumen final de 1 mL. La
reaccin se inicia con la adicin del ditionito, lo que produce la aparicin de un
color azul-violeta por reduccin del metil violgeno (MV), y los tubos se incuban
durante 10 minutos (o distintos tiempos en el caso de la cintica de aparicin
del producto) a 30 C (o a diferentes temperaturas entre 0 y 60 C cuando se
estudia el efecto de la temperatura). La reaccin se detiene al agitar en un
vortex los diferentes tubos, lo que provoca la oxidacin del MV y la prdida del
color azul-violeta. En todos los casos se realizar un blanco en el que no se
deja transcurrir la reaccin porque se agita a tiempo cero, inmediatamente
despus de aadir el ditionito, para reoxidar el MV e impedir la transferencia de
electrones a la enzima. Tras realizar los ensayos, se proceder a cuantificar el
nitrito formado en las diferentes reacciones mediante la adicin de 1 ml del
reactivo de sulfanilamida y 1 mL del reactivo de N-NEDA. Como la suspensin
celular utilizada produce una cierta turbidez en las muestras, antes de medir la
absorbancia a 540 nm se transfiere 1 mL de cada uno de los ensayos a viales
Eppendorf para precipitar las clulas por centrifugacin en una microcentrfuga
de mesa a la mxima velocidad (13.000 rpm) durante 3 min. Los
sobrenadantes se trasfieren a cubetas de 1 mL para medir en el
espectrofotmetro la absorbancia a 540 nm de cada muestra respecto a su
correspondiente blanco. Para conocer la concentracin de nitrito
correspondiente a cada uno de los valores de absorbancia obtenidos se
utilizar el coeficiente de extincin (51,9 mM-1 cm-1) obtenido a partir de una
recta de calibrado elaborada en las mismas condiciones con distintas
concentraciones conocidas de nitrito ((ver prctica 8, apartado II,
correspondiente a la determinacin espectrofotomtrica de nitrito). Para
calcular la actividad especfica, el profesor proporcionar el dato de la
4
KNO3 100 mM
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
Tampn BTP 0,5 M, pH 9
0,2 ml
0,2 ml
0,2 ml
0,2 ml
0,2 ml
0,2 ml
Agua
0,5 ml
0,495 ml 0,49 ml 0,45 ml
0,4 ml
0,3 ml
MV 2 mM
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
Suspensin celular
0 ml
0,005 ml 0,01 ml 0,05 ml
0,1 ml
0,2 ml
Ditionito sdico (8 mg ml-1)
0,1 mla
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
Absorbancia a 540 nm
0
a
Agitar en el vortex inmediatamente despus de aadir el ditionito hasta que desaparezca el
color azul-violeta.
KNO3 (concentracin)
Blanco (B)
0 ml
1
0,1 ml
(0,5 mM)
0,2 ml
0,4 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
2
0,1 ml
(1 mM)
0,2 ml
0,4 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
3
0,1 ml
(5 mM)
0,2 ml
0,4 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
4
0,1 ml
(10 mM)
0,2 ml
0,4 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml
5
0,1 ml
(100 mM)
0,2 ml
0,4 ml
0,1 ml
0,1 ml
0,1 ml