La verdadera revolucin vino con la llegada del anlisis del ARN ribosomal 16S y 5S

desarrollado por C. Woese, el cual fue el ms grande avance en taxonoma procariota

desde el descubrimiento de la tincin de Gram en 1884 y permiti al fin integrar en forma
real el anlisis filogentico a la microbiologa, el cual era aplicable casi exclusivamente a
plantas y animales.
A continuacin se muestra una sntesis del reino Monera o Procaryotae (Procariota) de
inicios de los 1980:

Divisin 1 Mendosicutes (arqueobacterias)

Methanocreatrices
Bacterias halfilas
Termoacidfilas

Divisin 2 Tenericutes (micoplasmas)

Divisin 3 Gracilicutes (gram negativas)

Clase Scotobacteria (bacterias quimitrofas)
Spirochaetes
Thiopneutes (sulfato reductoras)
Bacterias aerobias fijadoras de nitrgeno
Pseudomonads
Omnibacteria
Bacterias quimioauttrofas (nitrificantes)
Myxobacteria
Rickettsias
Chlamydias

Clase Anoxyphotobacteria (fottrofas anoxignicas)

Bacteria prpura
Bacteria verde del azufre
Bacteria verde no del azufre

Clase Oxyphotobacteria (fottrofas oxignicas)

Cianobacteria
Chloroxybacteria

Divisin 4 Firmicutes (gram positivas)

Bacterias fermentadoras
Aeroendospora (aerobios o anaerobios)
Micrococci
Actinomycetes

Divisin 1
Las arqueas (Archaea, Et: del griego arkhaa: las antiguas) son un grupo
de microorganismos unicelulares que al igual que las bacterias, son de
morfologaprocariota (sin ncleo ni, en general, orgnulos membranosos internos), pero
que son fundamentalmente diferentes a stas, de tal manera que conforman su
propiodominio y reino.
En el pasado las arqueas fueron clasificadas como bacterias procariotas enmarcadas en
el antiguo reino Monera y reciban el nombre de arquebacterias, pero esta clasificacin
ya no se utiliza.2 En realidad, las arqueas tienen una historia evolutiva independiente y
muestran muchas diferencias en su bioqumica con las otras formas de vida, por lo que
fueron clasificadas en un dominio separado dentro del sistema de tres
dominios: Archaea, Bacteria y Eukaryota.
Las arqueas metangenas son microorganismos procariontes que viven en medios
estrictamente anaerobios y que obtienen energa mediante la produccin de gas natural,
el metano (CH4). Gracias a esta caracterstica, este tipo de organismo tiene una gran
importancia ecolgica, ya que interviene en la degradacin de la materia orgnica en la
naturaleza, y en el ciclo del carbono.1
Las metangenas son un grupo filogenticamente heterogneo en donde el factor comn
que las une es la produccin de gas metano y sus cofactores nicos.2
Halobacteria o Halomebacteria y ms recientemente Haloarchaea,1 es
unaclase de arqueas que se encuentran en el agua saturada o casi saturada de sal.
Tambin son llamados halfilos extremos, aunque este nombre tambin se refiere a otros
organismos que viven en medios con alta concentracin salina. Crean mareas rojas con
su pigmento bacteriorodopsina. Este pigmento lo utilizan para absorber la luz, que ser la
fuente de energa para crear el ATP. Este proceso no est relacionado con otras formas
de fotosntesis. Son incapaces de fijar carbono a partir del dixido de carbono.
Las crenarqueotas (Crenarchaeota), tambin
llamadas eocitos,1 sulfobacterias2o crenotas3 son un filo de arqueas. Inicialmente se
pensaba que inclua slo organismos hipertermfilos,
frecuentemente quimiosintetizadores dependientes delazufre. Sin embargo, estudios
recientes los han identificado como las arqueas ms abundantes en el ecosistema
marino.4 Crenarchaeota es uno de los dos grupos principales de arqueas y originalmente
fue separado del otro grupo (Euryarchaeota) basndose en las secuencias del ARNr. Esta
divisin se ha visto apoyada por algunas caractersticas fisiolgicas, como la carencia
de histonas. (Sin embargo, se ha encontrado alguna especie de Crenarchaeota que
poseehistonas).5

Se ha encontrado que a diferencia de otros grupos de organismos, Crenarchaeota tiene

una nica maquinaria de divisin celular.6

Divisin 2
Mollicutes o Tenericutes es un grupo inusual de bacterias que se distinguen por carecer
de pared celular y comnmente son llamados micoplasmas. Son parsitos primarios de
varios animales y plantas viviendo dentro de las clulas husped. Son microorganismos
muy pequeos, tpicamente con un tamao de slo 0,2-0,3 m y forma variada aunque la
mayora tiene esteroles que hacen la membrana de la clula algo ms rgida. Muchas son
capaces de desplazarse mediante deslizamiento. La clase Mollicutes
incluye Phytoplasma y Spiroplasmaque son patgenos de las plantas asociados a
vectores insectos. Phytoplasma ySpiroplasma son los procariontes ms pequeos debido
a la ausencia de pared celular. El inusual gnero Spiroplasma es helicoidal y se mueve
retorcindose.

Divisin 3
Gracilicutes o Hydrobacteria es un supergrupo de bacterias. Dentro de lafilogenia
bacteriana,
est
conformada
a
su
vez
por
los
grupos Spirochaetes,Proteobacteria, Planctobacteria y el grupo FCB.

Clase Scotobacteria (bacterias quimitrofas)

Las espiroquetas (Spirochaetes o Spirochaetae)

son
un filo de bacterias Gramnegativas que tienen clulas alargadas y enrolladas helicoidalmente.1 Tienen una longitud
comprendida entre 5 y 500 m y un dimetro de alrededor de 0,1-0,6 m. Casi todas
son unicelulares, si bien se sospecha que Spirochaeta plicatis pudiera ser pluricelular.
Poseen una membrana externa formada por mltiples capas llamada "envoltura celular" o
"vaina externa" que rodea completamente el cilindroprotoplasmtico.
Las bacterias reductoras de sulfato comprenden varios grupos de bacterias que utilizan
el sulfato como agente oxidante, reducindolo a sulfuro. La mayora pueden tambin
utilizar compuestos de azufre oxidados tales como sulfito y tiosulfato o azufre elemental.
Es un metabolismo disimilativo de azufre puesto que no se asimila ningn compuesto
orgnico. Las bacterias reductoras de sulfato se han considerado como un posible
tratamiento para las aguas cidas de las minas que otras bacterias originan.
Rhizobiales es un orden de proteobacterias alfa. Los rizobios que fijan nitrgeno y que
son simbiontes en las races de las plantas se clasifican en este grupo en diferentes
familias.
Pseudomonas es un gnero de bacilos rectos o ligeramente curvados, Gram
negativos, oxidasa positivos, aerbicos estrictos aunque en algunos casos pueden utilizar

el nitrato como aceptor de electrones. El catabolismo de los glcidos se realiza por la ruta
de Etner-Doudoroff y el ciclo de los cidos tricarboxlicos. Algunos miembros del gnero
son psicrfilos, mientras que otros sintetizan siderforosfluorescentes de color amarilloverdoso con gran valor taxonmico. Es comn la presencia de plsmidos y no
forman esporas.
Las proteobacterias (Proteobacteria) son uno de los principales grupos debacterias.
Incluyen
una
gran
variedad
de
patgenos,
tales
como Escherichia
coli,Salmonella, Vibrio, Helicobacter, Neisseria
gonorrhoeae, Burkholderia
glumae y
muchos otros.1 Otras son de vida libre, e incluyen muchas de las bacterias responsables
de la fijacin del nitrgeno.
Los organismos quimitrofos o quimiosintticos son
aquellos
capaces
de
utilizar compuestos inorgnicos reducidos como sustratos para obtener energa y utilizarla
en el metabolismo respiratorio. Es una facultad conocida con el nombre dequimiosntesis.
Estos pueden ser quimioauttrofos o quimiohetertrofos.
Las mixobacterias (orden Myxococcales) son un grupo de bacterias que viven
principalmente en el suelo y que tienen genomas muy grandes comparados con otras
bacterias, del orden de 9-10 millones de nucletidos. Polyangium cellulosumtiene el
genoma ms grande conocido (en 2003) para una bacteria, con 12,2 millones de
nucletidos. Las mixobacterias se incluyen entre lasdeltaproteobacterias, un grupo
de bacterias Gram negativas.
Las Rickettsiales o rickettsias son pequeas bacterias del filo de lasproteobacterias. La
mayora de las especies descritas slo puden vivir enendosimbiosis con otras clulas.
Algunas son patgenos notables, incluyendo el gnero Rickettsia, que causa diversas
enfermedades en el hombre.
Las clamidias (Chlamydiae)
son
un filo de bacterias cuyos
miembros
1
sonendosimbiontes o patgenos intracelulares obligados. Muchas Chlamydiae coexisten
en sus hospedadores especficos cuyo estado asintomtico, se cree, proporciona
un reservorio natural para estas bacterias.2

Clase Anoxyphotobacteria (fottrofas anoxignicas)

Las bacterias
prpuras,
tambin
llamadas bacterias
prpuras
fotosintticas o bacterias rojas, son proteobacterias del cladoRhodobacteria, y
son fottrofas, esto es, capaces de producir energa a travs de la fotosntesis. Poseen
pigmentos de bacterioclorofila a ob, junto con varios carotenoides. Estos les proporcionan
unos colores que incluyen el prpura, rojo, marrn y naranja. La fotosntesis tiene lugar en
centros reactivos sobre la membrana celular, la cual se dobla dentro de la clula para
formar sacos, tubos u hojas, incrementando la superficie disponible.
Las bacterias verdes
debacterias del

del

azufre o Chlorobia constituyen

filo Chlorobi que

un

pequeo

grupo
realizan

la fotosntesis anoxignica.1 Sonfotolitoauttrofas obligadas

que
usan sulfuro
de
hidrgeno (H2S) o azufre (S) como donantes de electrones (por comparacin, las plantas
durante la fotosntesis usan agua como donante de electrones y producen oxgeno). Las
estructuras donde se almacenan los pigmentos fotosintticos estn unidas a la membrana
y se conocen como clorosomas o vesculas clorobiales. Estos clorosomas
contienenbacterioclorofila "c", "d" y "e".
Chloroflexia o Chloroflexi, tambin llamadas bacterias verdes no del azufre, es la
clase principal del filo homnimo Chloroflexi. Estas bacterias obtienen energa
mediante fotosntesis anoxignica. Su denominacin se debe a su pigmento verde
(bacterioclorofila), que se encuentra asociado a los clorosomas. Son tpicamente
filamentosas, desplazndose por deslizamiento.

Clase Oxyphotobacteria (fottrofas oxignicas)

Las cianobacterias (Cyanobacteria, gr. kyans,

"azul"),
antiguamente
llamadas algas verde azuladas, son un filo del dominio Bacteria que comprende las
bacterias capaces de realizar fotosntesis oxignica. Son los nicos procariontesque
llevan a cabo ese tipo de fotosntesis, por ello tambin se les llam oxifotobacterias
(Oxyphotobacteria).1
Prochlorales es un grupo de cianobacterias verdes que son importantes componentes
del picoplancton fotosinttico. Tambin fueron llamadasProchlorophyta (Lewin, 1976)
y Chloroxybacteria. Durante mucho tiempo slo se conocieron las cepas del
gnero Prochloron, que proceden del ocano Pacfico en su mayora. Son formas
cocoides (esfricas) que aparecen asociadas contunicados y fuera de sus huspedes han
sido de difcil cultivo. Luego se encontraron dos gneros ms de vida
libre: Prochlorococcus,
tambin
cocoide,
yProchlorothrix,
filamentosa.
Son
fisiolgicamente como las algas verdes, puesto que realizan la fotosntesis oxignica,con
los
mismos
pigmentos
principales
(clorofila a y clorofila b, carotenoides,
fundamentalmente -caroteno) y carecen deficobilinas; sin embargo, morfolgicamente se
parecen a las cianobacterias o algas verdeazuladas.

Divisin 4
Firmicutes (del latn firmus = fuerte y cutis = piel en referencia a su gruesa pared celular)
o Endobacteria (referencia a la presencia de endosporas) son un filo debacterias, la
mayora de las cuales tienen una estructura celular Gram-positiva. Algunas de ellas
(Mollicutes, entre las que se encuentran los micoplasmas) carecen de paredes
celulares por lo que no se colorean con la tincin de Gram y adems carecen de la
segunda membrana encontrada en la mayora de lasbacterias Gram negativas

Lactobacillales es un orden de bacterias Gram-positivas, dentro de la DivisinFirmicutes.

Gneros representativos
son Enterococcus, Streptococcus,Lactococcus, Leuconostoc y Lactobacillus.
Producen cido lctico como el mayor metabolito de la fermentacin del azcar. Son
usados en la produccin de productos lcteos fermentados,
como yogur,queso, manteca, crema de leche, kfir y koumiss.
Las LAB son tambin responsables de la fermentacin malolctica en la produccin
de vino, y en la fermentacin del repollo a sauerkraut chucrut.

Aeroendospora (aerobios o anaerobios)

Los Bacillales son un orden de bacterias Gram positivas, con clulas en forma de bastn,
ubicadas
dentro
de
las Firmicutes.
Los
gneros
representativos
incluyenBacillus, Listeria y Staphylococcus.
Los clostridia son una clase de bacterias del filo Firmicutes. Se caracterizan por
ser bacilos anaerobios mayormente Gram positivos. La mayora de gneros no forman
esporas, pero algunos s como los Clostridium.
Segn muchos rboles filogenticos, no son un grupo monofiltico, y sus relaciones no
son totalmente ciertas. Actualmente la mayora de clostridia se incluyen en un orden
llamado Clostridiales.
Los rdenes Halanaerobiales y Natranaerobiales son halfilos y el
ordenThermoanaerobacteriales es termfilo.

Micrococcus (mi kr kk s) es un gnero de bacterias del filo Actinobacteria. 'Se

encuentran en ambientes diversos, incluyendo agua y suelo. Son bacterias Grampositivas con clulas esfricas de dimetro comprendido entre 0,5 y 3 micrmetros que
tpicamente aparecen en ttradas. Micrococcus tiene una gruesa pared celularque puede
abarcar tanto como el 50% del materia celular. Su genoma es rico
enguanina y citosina (GC), tpicamente en porcentaje del 65 al 75% de contenido GC. A
menudo contienen plsmidos (de tamao comprendido entre 1 y 100MDa) que
proporcionan al organismo caractersticas tiles.
Las Actinobacterias o actinomicetos son un filo y clase de bacterias Gram positivas. La
mayora de ellas se encuentran en la tierra, e incluyen algunas de las ms tpicas formas
de vida terrestre, jugando un importante rol en la descomposicin de materia orgnica,
tales como la celulosa y quitina. Estas bacterias renuevan las reservas de nutrientes en la
tierra y son fundamentales en la formacin de humus. La adaptacin al hbitat terrestre es
muy antigua, en el suelo son los seres ms abundantes, promediando un 64% de la
biomasa bacteriana.1