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POSTGRADO EN BIOLOGA CELULAR

CENTRO DE INGENIERA GENTICA (CIGEN)


FACULTAD DE CIENCIAS
UNIVERSIDAD DE LOS ANDES

Nombre de la Asignatura
Unidades crdito

Mdulo I: Bioqumica Avanzada


3

Horas teora/prctica

48 horas tericas

Horas por semana

Cuerpo docente

Profs. Juan Lus Concepcin, Wilfredo Quiones y Hctor


Acosta.

Justificacin

El contenido del mdulo pretende que los estudiantes


adquieran conocimientos avanzados del metabolismo
intermediario, cintica enzimtica, importacin de
protenas a diferentes organelas, estructura de protenas,
interaccin protena-protena como un ejemplo del uso de
tcnicas para el anlisis del funcionamiento de los
organismos vivos. En este mdulo se pretende no slo
impartir un conocimiento avanzado de la bioqumica de
organismos parsitos de importancia mdica sino hacer
discusiones profundas sobre tcnicas avanzadas, que
preparen al estudiante para el empleo de las mismas en
cualesquiera sean los campos de su investigacin.
Que el estudiante sea capaz de interpretar procesos y
tcnicas bioqumicas.
Objetivo Terminal

Objetivo General
Unidad 1
Bioqumica metablica

Distinguir los diferentes procesos metablicos; anablicos y


catablicos, empleando a los kinetoplastides como organismos
modelo de estudio.

Contenido

Objetivos especficos

1.1 Repaso de metabolismo


energtico
1.2 Metodologas usadas en el
estudio del metabolismo
1.3
Metabolismo
de
Trypanosomatidae, en particular de
Trypanosoma brucei, T. cruzi y
Leishmania spp.
1.4 El glicosoma y su metabolismo
(en particular a nivel de los
balances de energa y redox
(NAD/NADH). Cadena
respiratoria
1.5 Metabolismo energtico en base

Repasar los conocimientos bioqumicos obtenidos en pregrado,


mediante exposicin de la informacin.
Conocer las distintas metodologas empleadas en estudios
bioqumicos, a travs de lecturas comentadas.
Conocer las distintas particularidades del metabolismo de estos
parsitos y contrastarlo con el de otras clulas, a travs de lecturas
comentadas.
Conocer el metabolismo glicosomal como una particularidad de los
kinetoplastides, a travs de lecturas comentadas.

Conocer el metabolismo del pirofosfato, a travs de lecturas

Fac. de Ciencias-ULA. La Hechicera, Mrida 5101. Mrida. Telf: 0274-2401307. Fax: 0274-2401286.
E-mail: pbcigen@ula.ve; www.pbcigen.ciens.ula.ve

1.7 Sntesis de esteroles en


glicosoma y peroxisoma.

comentadas.
Recordar los conocimientos de esta ruta metablica usando como
modelo los kinetoplastidos, mediante exposicin de la informacin.
Conocer los componentes de esta va de sntesis que estn presentes
en estas organelas, a travs de lecturas comentadas.

Unidad 2

Objetivo Terminal

Cintica enzimtica

Describir los diferentes mecanismos de accin enzimtica.

Contenido

Objetivos Especficos

2.1 Michaelis-Menten: Km, Vmax,


Kcat

Explicar el significado de este mecanismo de accin enzimtica y la


manera de obtener las distintas constantes cinticas, mediante
discusin de trabajos relacionados con el tema.
Identificar los distintos mecanismos de accin enzimtica, mediante
discusin de trabajos relacionados con el tema.
Conocer este mecanismo de accin distinto al Michaelis-Menten, a
travs de exposicin de este modelo.

a pirofosfato.
1.6 Repaso de sntesis de esterol

2.2 Inhibicin: Competitiva, no


competitiva, acompetitiva y mixta.
2.3 Enzimas con sitios mltiples y
alosterismo: sitios no cooperativos,
unin cooperativa, modelo sencillo
de interaccin secuencial,
representacin y ecuacin de Hill y
modelo de simetra o de transicin
concertada.

Unidad 3

Objetivo Terminal

Estructura de protenas.
Esencialmente enfocado sobre
protenas de membrana.

Distinguir las diferentes estructuras de protenas de membrana y las


particularidades de stas con respecto a protenas que no son de
membrana.

Contenido

Objetivos Especficos

3.1 Repaso de estructura y


propiedades de los aminocidos y
reglas generales para entender la
estructura de las protenas.
Hidrofobicidad e hidrofilicidad.
3.2
Estructuras
secundarias,
hlices, beta-configuraciones, betabarril.
3.3 Clasificacin de las protenas
de membrana
3.4 Protenas involucradas en
transporte de electrones: fumarato
reductasa, citocromo b, centros
hierro/azufre

Recordar las nociones de estructura a travs de exposicin de


contenidos relacionados

Unidad 4

Objetivo Terminal

Importacin de protenas.

Describir los diferentes mecanismos de importacin de protenas a


diferentes organelas subcelulares.

Contenido

Objetivos Especficos

4.1
Protenas
del
retculo
endoplasmtico.
4.2 Protenas de la mitocondria,
cloroplasto y sus membranas.
4.3 Protenas del glicosoma

Conocer el mecanismo de importacin de protenas al Retculo a


travs de la discusin de trabajos relacionados.
Conocer el mecanismo de importacin de protenas a la mitocondria,
cloroplasto a travs de la discusin de trabajos relacionados.
Conocer el mecanismo de importacin de protenas al glicosoma, a
travs de la discusin de trabajos relacionados.

Unidad 5

Objetivo Terminal

Interaccin protena-protena

Conocer los diferentes mecanismos de interaccin protena


protenas y los efectos de estas interacciones en la regulacin de
diferentes procesos metablicos.

Identificar los distintos tipos de estructura proteicas a travs de la


discusin de trabajos relacionados.
Conocer los distintos criterios usados para la clasificacin de estas
protenas a travs de la discusin de trabajos relacionados.
Identificar desde el punto de vista estructural y funcional estas
protenas a travs de la discusin de trabajos relacionados.

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5.1 Interacciones homlogas y


heterlogas
5.2 Interacciones: hidrofbicas,
inicas y Van der Walls.
5.3 Histresis

5.4
Cambios
de
actividad
enzimtica
debido
a
las
interacciones de protenas con
diferentes
ligandos
y
otras
protenas.
5.5 Control del flujo metablico por
interacciones de protenas con
ligandos y otras protenas.

Estrategias de enseanza

Recursos didcticos

Estrategias de evaluacin

Referencias Bibliogrficas

Recordar en que consisten este tipo de interacciones a travs de


ejemplos discutidos en trabajos relacionados.
Recordar en que consisten este tipo de interacciones a travs de
ejemplos discutidos en trabajos relacionados.
Conocer la Histresis como un mecanismo que se origina de la
interaccin entre sub-unidades de la misma protena a travs de la
discusin de trabajos relacionados.
Conocer como la actividad de una enzima puede ser afectada por
estas interacciones a travs de la discusin de trabajos relacionados.

Conocer el concepto de flujo metablico y como este se puede ver


afectado por las interacciones protena protena, a travs de la
discusin de trabajos relacionados.

Se dictarn clases magistrales de los principales temas


donde el objetivo especfico implique recordar contenido;
se realizarn adems discusiones de trabajos asignados
semanalmente, relacionados con el tema a discutir.
En las clases se emplean marcadores y pizarrn acrlico y
eventualmente de ser necesario video beam o proyector de
transparencia.
Se recomiendan artculos actualizados de las siguientes
revistas:
Molecular and Biochemical Parasitology
Nature
Science
Biochemistry
FEBS Journal
The Journal of Biological Chemistry
Experimental parasitology
Parasitology Research
Archives Biochemical and Biophysical
Analytical Biochemistry
Biochemical Journal
Estos artculos sern aportados antes de la clase para su
discusin.
La evaluacin se basa en la discusin de los trabajos
asignados semanalmente; se consideran las intervenciones
durante la discusin, se realizan exmenes que abarcan el
contenido programtico de la asignatura, generalmente al
final del curso.
- Libros texto:
- Voet, Donald - Voet, Judith. 2005. Fundamentos de
Bioqumica. La vida a nivel molecular. Editorial
PANAMERICANA
- Berg, Jeremy M.; Tymoczko, John L.; y Stryer, Lubert.
Biochemistry. 2005. New York: W. H. Freeman and Co.

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- David, L. Nelson; Michael, M. Cox. 2006. Lehninger.


Principios de Bioqumica. 4Ed. Editorial: Omega.
Edicin.
- Lodish, Harvey; Berk, Arnold; Zipursky, S. Lawrence;
Matsudaira, Paul; Baltimore, David; Darnell, James E.
2000. Molecular Cell Biology. New York: W. H. Freeman
& Co.
- Alberts, Bruce; Johnson, Alexander; Lewis, Julian; Raff,
Martin; Roberts, Keith; Walter, Peter. 2002. Molecular
Biology of the Cell. New York and London: Garland
Science.
- Segel, Irwin H. 1976. Biochemical Calculations: How to
Solve Mathematical Problems in General Biochemistry.
Publisher: John Wiley & Sons, Inc. Second edition.

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