http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?

book=mboc4

Capitulo 2

Dra. van Zundert

www.whfreeman.com/lodish

Capitulo 2

Estructura y Componentes qumicos

de las clulas

5. Est estrechamente regulada

4. Est dominada por la presencia de polmeros

3. Es enormemente compleja

2. Las reacciones qumicas ocurren casi exclusivamente en fase acuosa

1. La qumica de la vida est basada en carbono

Los seres vivos son sistemas qumicos complejos que funcionan lejos
del equilibrio con el ambiente

Figure 2-3 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

De qu estamos hechos...?

Electron microscopy:

ALH84001

Elementos quimicos

Clulas de la bacteria GFAJ1 cultivadas en fsforo.

Clulas de la bacteria GFAJ-1

cultivadas en arsnico.

Qumica de Vida: vida extraterrestre

Figure 2-1 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

http://www2.estrellamountain.edu/faculty/farabee/biobk/biobookchem1.html

Adems, existe atraccin electroesttica entre la

nube electrnica de un tomo y el ncleo.

Nube electrnica:
Ligera, compuesta por electrones, partculas
electricamente negativas y casi sin masa. El
nmero de electrones es igual al nmero de
protones, por lo que la carga neta del tomo es
cero.

Ncleo:
Denso, con carga elctrica positiva, formado por
protones (poseen carga +) y neutrones
(electricamente neutros). Aportan la masa del
tomo

La unidad mnima de la materia: tomo

Figure 2-1 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

La unidad mnima de la materia: tomo

12

(y los electrones?)

Peso atmico (A):

Masa relativa del tomo de la
molcula respecto a la del tomo de
hidrgeno (suma de
protones+neutrones)

Nmero atmico (Z):

Se refiere al nmero de protones
presentes en el ncleo de un tomo

Atom???

Atom???

4.

3.

2.

1.

Cmo interactan los tomos?

van der Waals

Metal + Non-metal ionic binding

Non-metal + Non-Metal covalent binding
Metal + Metal metallic binding

class 2-3 ionic part I covalent and Metallic bonding.mp4

Figure 2-3 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Cmo interactan los tomos?

Capa de valencia completa

Capa de valencia no completa

Capa de valencia completa

Capa de valencia no completa

Nmero mgico????

La tendencia es tener la capa de valencia completa!

Cmo lograrlo?

No reactivo

No reactivo

Figure 2-3 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Elementos
Qumicamente
reactivo

No reactivo

Excepto:

Cmo interactan los tomos?

Figure 2-5 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Enlaces covalente

Cmo interactan los tomos?

Enlaces inicos

Las sales permanecen unidas entre s nicamente por enlaces inicos

Carga (-) debido a que tiene ms e- que el

nmero de protones que tiene su ncleo: anin

Carga (+) debido a que tiene menos e- que el

nmero de protones que tiene su ncleo: catin

Cmo interactan los tomos?: Enlace inico

Geometra del enlace

Fuerza del enlace

Distancia de enlace

Distancia en la que los ncleos no se repelen.

Se mantienen las fuerzas de atraccin y
repulsin equilibradas

Propiedades de los enlaces covalentes

Los enlaces formados al compartir electrones completan los orbitales externos de

ambos tomos.

Los tomos unidos entre s por enlaces covalentes forman molculas.

Cmo interactan los tomos?: Enlace covalente

covalente > inico > puente de hidrgeno > van der Waal

Es la cantidad de energa necesaria para

romper el enlace. Se expresa en unidades de
Kcal/mol

Longitud de enlace: van der Waals > puente de hidrgeno > inico > covalente

Fuerza de enlace:

Geometra del enlace

Fuerza del enlace

Distancia de enlace

Propiedades de los enlaces covalentes

Electropositive elemental metals, such as lithium, sodium,

magnesium, iron, zinc, and aluminium, are good reducing
agents. These metals donate or give away electrons readily

oxidizing agent is also called an electron acceptor

When A loses its electrons it is oxidized (oxidation reaction);

when B gains the electrons it is reduced (reduction reaction)

Geometra del enlace

Fuerza del enlace

Distancia de enlace

Figure 2-8 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Se van a formar tantos enlaces covalentes

como sea necesario para completar el
nmero de e- del orbital ms externo.
Cuando se forma el enlace, la orientacin
del mismo en el espacio es definida. Quedan
ngulos de enlace definidos.

Propiedades de los enlaces covalentes

Figure 2-8 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Geometra del enlace

Fuerza del enlace

Distancia de enlace

Propiedades de los enlaces covalentes

https://www.youtube.com/watch?v=MlgKp4FUV6I
Ionic bonding lose or gain (opposite ions)
covalent bonding sharing negative electrode

class 2-3 part II ionic and covalent bonding.mp4

https://www.youtube.com/watch?v=MlgKp4FUV6I
Ionic bonding lose or gain (opposite ions)
covalent bonding sharing negative electrode

class 2-3 part II ionic and covalent bonding.mp4

Figure 2-29 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Propiedades del agua

Figure 2-12 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

3 maneras distintas para representar una molcula de agua

Propiedades del agua

https://www.youtube.com/watch?v=DAilC0sjvy0

fuerzas cohesivas y tensin superficial

Propiedades del agua: Puentes de hidrgeno

Figure 2-10 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Cuando los electrones de un enlace covalente se

comparten de manera equitativa se forma un enlace
apolar

Cuando los electrones en un enlace covalente son

atrados con mayor fuerza por uno de los tomos se
forman 2 polos: uno negativo (d-) en el tomo que
ms atrae los electrones y uno positivo (d+) en el
tomo que cede los electrones

Enlaces covalentes polares y apolares

Figure 2-14 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Molculas hidrofbicas: Forman pocos o ningn enlace de hidrgeno, no se

disuelven en agua (Ej. Aceites, hidrocarburos).

Molculas hidroflicas: Tienen carga (iones) o polos e interactan favorablemente con el

agua (Ej. azcares, DNA, protenas, etc).

Comportamiento de las molculas en agua:

Bases:
Sustancias que cuando se disuelven
en agua liberan iones hidroxilo,
o sustancias que captan protones.

cidos:
Sustancias que cuando se disuelven
en agua liberan protones

Comportamiento de las molculas en agua: Escala de pH

cidos: Sustancias que cuando se disuelven en agua liberan protones

Comportamiento de las molculas en agua:

NaOH

Na+ + OH-

Bases: Sustancias que cuando se disuelven en agua liberan iones hidroxilo, o

sustancias que captan protones.

Comportamiento de las molculas en agua:

Figure 2-29 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Biomolculas

Compuestos de carbono: molculas orgnicas.

Unin C-C es por enlace covalente muy estable (se

requiere mucha energa para romperlo).

Posee 4 espacios vacantes en el orbital externo (por lo

tanto, puede formar 4 enlaces covalentes).

Capacidad de formar grandes molculas

Biomolculas: Carbono y los compuestos orgnicos

Grupos
Grupos
Grupos
Grupos
Grupos
Grupos

CH3 (metilo)
OH (hidroxilo)
COOH (carboxilo)
C=O (carbonilo)
NH2 (amino)
(PO3)-2 (fosfato)

Tienen caractersticas qumicas y

fsicas propias que influyen sobre
el comportamiento de la molcula

Ciertas combinaciones de tomos se encuentran de forma reiterada en las

molculas orgnicas:

Biomolculas: Carbono y los compuestos orgnicos

Biomolculas: Carbono y los compuestos orgnicos

cidos Nucleicos

Protenas

Lpidos

Carbohidratos / Polisacridos