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Biotecnologa Vegetal
pNOS
NPT-II
tNOS
p35S
Uid-A (GUS)
tNOS
RB
LB
pBI-121
T-DNA
vir
pAL4404
pBI121
ch
LBA4404-pBI121
OBTENCION DE DISCOS
COCULTIVO
MEDIO DE SELECCIN
MICROCALLOS
BROTES
ENRAIZAMIENTO
Figura 1
4
Transformacin
Mezclar 50 l de las bacterias con 1 g de plsmido (250 ng/l)
y 50 l de LB.
Congelar en N2 lquido durante 5 min y descongelar en bao a
37 C durante 20 min.
(Efectuar paralelamente un control de viabilidad y un control de seleccin).
Control de
viabilidad
Control de
seleccin
pBI-121 (DNA)
4 l
A. tumefaciens.
50 l
50 l
50 l
Medio LB
50 l
50 l
50 l
Rif
Str
Kan
+
+
+
-
+
+
Suplementar las
placas LB agar con:
TRANSFORMACION DE DISCOS
MEDIANTE AGROBACTERIUM (4)
DE
HOJAS
DE
TABACO
Cocultivo
Soluciones
MS30:
Macronutrientes MS 20 X
Micronutrientes MS 200 X
Fe-EDTA 200 X
Sacarosa
Agar
H20
Llevar a pH 5,8 con KOH.
50 ml
5 ml
5 ml
30 g
8g
c.s.p. 1 litro.
VITAMINAS MS:
Myo-inositol
Acido nicotnico
Piridoxina-HCl
Tiamina-ClH
Glicina
100.0 mg/l
0.5 mg/l
0.5 mg/l
0.1 mg/l
2.0 mg/l
HORMONAS:
Benciladenina (BA)
Acido naftalenactico (ANA)
ANTIBITICOS:
Cefotaxime (cef)
Kanamicina (kan)
Rifampicina (rif)
Estreptomicina (str)
200 mg/l
50 mg/l
100 mg/l
100 mg/l
MACRONUTRIENTES:
NH4NO3
33.0 g/l
KNO3
38.0 g/l
CaCl2.2H2O
8.8 g/l
MgSO4.7H2O
7.4 g/l
KH2PO4
3.4 g/l
MICRONUTRIENTES:
KI
H3BO3
166 mg/l
1240 mg/l
MnSO4 .4H2O
4460 mg/l
ZnSO4 .7H2O
Na2MoO4 .2H2O
1720 mg/l
CuSO4 .5H2O
CoCl2.6H2O
5 mg/l
50 mg/l
5 mg/l
5.56 g/l
Na2EDTA.2H2 O
7.46 g/l
50 mM
10 mM
10 mM
0.1 %
0.1 %
0.5 mg/ml.
Protocolo de PCR:
Solucin de DNA:
Colocar en un tubo Eppendorf de 0,5 ml:
DNA de planta
250 ng
H2O
c.s.p. 25 l
Calentar 5 min a 100 C y colocar inmediatamente en hielo.
Mezcla de reaccin:
Colocar en un tubo Eppendorf de 1,5 ml, por cada reaccin de PCR:
Buffer PCR 10x
5 l
dATP 10 mM
1 l
dGTP 10 mM
1 l
dCTP 10 mM
1 l
dTTP 10 mM
1 l
Primer 1 (150 ng/l)
0,5 l
Primer 2 (150 ng/l)
0,5 l
MgCl2 25 mM
3 l
H2O
c.s.p. 25 l
Taq DNA pol 5 u/l
0,25 l
Soluciones
EB: BUFFER DE EXTRACCIN
Tris pH 8
EDTA pH 8
NaCl
SDS
-mercaptoetanol
50 mM
10 mM
100 mM
1%
10 mM
TE
Tris pH 8
EDTA
10 mM
1 mM
12
Acrilamida-bisAcrilamida
(30:1)
Tris-HCl 1.5M pH 8.8
Agua destilada
SDS 10%
Persulfato de Amonio 10%
TEMED
30% 4.0 ml
2.5
3.3
0,1
0.1
5.0
ml
ml
ml
ml
l
30% 0,83 ml
0,63 ml
50.0 l
3.4 ml
25 l
5 l
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TRANSFERENCIA
WESTERN BLOT
DE
PROTEINAS
NITROCELULOSA:
Electrotransferencia
-Luego de la corrida sumergir el gel en buffer de
electrotransferencia (50 mM Tris-HCl, pH 7,5; 196 mM Glicina;20%
metanol).
-Cortar un trozo de nitrocelulosa (Schleicher & Schuell, BA 85 0,45
um) del tamao del gel y dejar hidratando unos minutos en el
buffer.
Cuidando no queden burbujas colocar el gel sobre la nitrocelulosa y
con esto hacer un sandwich entre 3 hojas de papel filtro Whatman
3MM y las esponjas tipo Scotch Brite.
-Se emsambla en el cartucho de transferencia y este se coloca
dentro de la cuba de electrotransferencia (Bio-Rad), que luego se
llena de buffer. La transferencia se hace durante toda la noche a 30
V. voltaje constante a 100 V. voltaje constante durante 1 hora.
DETECCION INMUNOLOGICA DE LAS PROTEINAS
ELECTROTRANSFERIDAS
Bloqueo e incubacin con el anticuerpo
-Incubar los filtros durante 30 min. con solucin de bloqueo.
-Incubar con el anticuerpo en una dilucin 1/2000 preparada en
solucin de bloqueo, durante 1 hora con agitacin a temperatura
ambiente,.
-Recuperar el anticuerpo y lavar el filtro 3 veces durante 15 min.
cada lavado con TBS-T.
-Incubar con el anticuerpo anti-IgG de conejo conjugado a fosfatasa
alcalina diludo 1/1000 en solucin de bloqueo, durante 60 min. a
temperatura ambiente.
-Lavar con TBS-T durante 10 min.repetir este lavado dos veces ms
-Lavar una vez con buffer fosfatasa durate 10 min a temperatura
ambiente.
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REFERENCIAS
1- Jefferson, R.A. (1987) Plant Mol.Biol.Rep. 5: 387-405
2- Hofgen R. (1988) Nucleic Acids Res. 16: 9877.
3- Birmboim, H.C. y Doly J. (1979) Nucleic Acids Res. 7: 15131523.
4- Horsch RB, Rogers SG and Fraley RT (1985 ) Transgnic plants.
Cold Spring Harb Symp Quant Biol 50: 433-437
5- Murashige T. y Skoog G. (1962) Physiol. Plant 15: 473-477
6- Jefferson, R.A. (1987) Plant Mol. Biol. Rep. 5: 387-405
7- Saiki R.K., Gelfand D.H., Sytoffel S., Scharf S.J., Higuchi R., Horn
G.T., Mullis K.B., Erlich H.A. (1988) Primer directed enzimatic
amplification of DNA with a thermostable DNA polimerase.
Science 239: 487.
8- Dellaporta S.L., Wood J., Hicks J.B. (1983) A plant DNA
minipreparation: Version 2. Plant Molecular Biology reporter. 1:
19-22.
16
17
corto. Huisman et al. (1992) sugieren que, adems de la inactivacin de la informacin por la acumulacin de mutaciones, la
desaparicin fsica de la informacin por recombinacin del RNA
es un proceso muy rpido. La rapidez con la que este proceso
ocurra es, pues, una cuestin a considerar en el diseo de esta
clase de vectores. Idealmente, el virus quimrico debera
recombinarse lo suficientemente rpido para producir efectos
mnimos en el ambiente, pero no tanto como para impedir que la
produccin de la protena recombinante sea eficiente. Debe
destacarse que estos lapsos se miden en el nmero de
generaciones virales que ocurren a partir de la inoculacin y que,
en un sistema productivo, el ciclo finalizara con la recoleccin del
material vegetal infectado, debindose proceder a una nueva
inoculacin en la siguiente generacin de plantas.
En este trabajo prctico utilizaremos una copia completa de cDNA
de PVX y un vector viral derivado de esta capaz de expresar el gen
marcador Uid-A, a partir de ellos, mediante una reaccin de
transcripcin in vitro obtendremos RNAs infectivos.
Estos RNAs sern utilizados para infectar plantas de tabaco,
finalmente la infeccin se pondr de evidencia mediante el uso de
anticuerpos anti-cpside (clon infectivo) y midiendo la actividad del
gen indicador (vector viral).
Fig.1 Vectores virales desarrollados utilizando al virus PVX
replicasa viral
psg
24 K
CP
12K
poli A
8K
pT7
replicasa viral
psg
24 K
GUS
poli A
12K
pT7
8K
19
replicasa viral
psg
24 K
GUS
psg
CP
12K
8K
pT7
TRANSCRIPCION IN VITRO
Linealizacin
Se digieren 20 g del plsmido purificado utilizando 50-100 U de la
enzima de restriccin adecuada, en 350 l de reaccin. Se verifica
el corte corriendo una alcuota en un gel de agarosa.
Tratamiento con proteinasa K
A los 350 l del plsmido linealizado se agregan 7 l de proteinasa
K (SIGMA) 5 mg/ml y se incuba 20 min a 37C.
A partir de este punto todas las manipulaciones se deben realizar
en condiciones libres de ARNasa.
Realizar 2 extracciones con fenol:cloroformo:isoamlico (25:24:1) y
una extraccin con cloroformo:isoamlico (24:1).
Recuperar la fase acuosa final y precipitar los cidos nucleicos con
1/2 vol. de AcNH4 y 3 vol. de etanol absoluto fro.
Dejar 30 min en hielo y centrifugar igual que antes.
Lavar el pellet 2 veces con 500 l de etanol 70% fro, centrifugar 5
min a mxima velocidad y eliminar el sobrenadante.
Secar el pellet en un bloque seco a 37C, y resuspendee en T.E.
10:1 pH 7.5 para que quede aproximadamente 0.5g/l
Transcripcin in vitro utilizando T7 ARN polimerasa
Se lleva a cabo la reaccin en las siguientes condiciones:
DNA molde lineal
100 mM DTT
1 mg/ml BSA
5x Tsc Buffer
rRNAsin
2 g totales
5 l
5 l
10 l
1.2 l (50 U)
20
poli A
H2O DEPC
c.s.p. 50 l (totales)
Klenow
1 l (10 U)
Incubar 15min a temperatura ambiente y agregar
5x rNTPs (5 mM A, C y UTP; 0.5 mM GTP; )
10 mM CAP [m7G(5')ppp(5')G
T7 RNA polimerasa
10 l
2.6 l
40 U
21