3.

BACTERIAS
3.3. Clasificacin
3.3.1. Definicin sistemtica

Definicin sistemtica: taxonoma

Taxonoma: ciencia que clasifica a los seres vivos
Taxonoma
1. Clasifica:
Clasifica agrupa a los organismos en grupos (taxones*
*)
caractersticas comunes
2. Nombra
Nombra: asigna nombres a los taxones cdigos internacionales

Especie: grupo taxonmico bsico

Especie
Organismos superiores: grupos de poblaciones que pueden cruzarse
entre s, aisladas de otros grupos en cuanto a reproduccin
Bacterias grupo de cepas
Bacterias:
cepas*
* que comparte propiedades estables y
difiere significativamente de otros grupos

* Grupo de organismos emparentados

* Poblacin de organismos que desciende
de un organismo o de una sola clula

Denominacin de especies
Clasificacin taxonmica: una especie se agrupa en categoras
taxonmicas de orden superior clasificacin jerrquica:
jerrquica
especie gnero familia orden clase divisin reino dominio
(phylum)

La jerarqua se establece con base en relaciones evolutivas

(genotpicas
genotpicas) clasificacin filogentica
Sistema binomial de nomenclatura cada especie tiene un
nombre en latn compuesto por dos palabras:
1. Gnero grupo definido, integrado por una o ms especies
2. Especie de ese gnero categora taxonmica bsica

Categoras taxonmicas
Categora

Taxn

Dominio

Bacteria

Reino

Proteobacteria

Phylum

Gamma proteobacteria

Clase

Zymobacteria

Orden

Enterobacteriales

Familia

Enterobacteriaceae

Gneros

Escherichia

Especies

coli

Sistema binomial
binomial::
SIEMPRE en cursivas

Escherichia coli o E. coli

Subespecies

Gnero: 1 letra SIEMPRE en maysculas

Gnero

Especie: 1 letra SIEMPRE en minsculas

Especie

Antgenos, fagos, diferencias bioqumicas,

fisiolgicas y morfolgicas, patogenicidad

3. BACTERIAS
3.3. Clasificacin
3.3.2. Sistemas de clasificacin

Sistemas de clasificacin
No consideran relacin evolutiva

Taxonoma clsica
(fentica)

Taxonoma
numrica

Taxonoma
molecular

Similitud entre
caractersticas
fenotpicas

Similitud entre
caractersticas
fenotpicas

Similitud entre
caractersticas
genotpicas (ADN)

Agrupa por comparacin entre caracteres

con valor taxonmico

Agrupa mediante el
uso de mtodos num
numricos (comparacin)

Agrupa usando varios

mtodos de biologa
molecular

Comparacin: morfologa,
fisiologa, metabolismo
(caract. visibles)

Semejanzas y
diferencias: coef.
asociacin la similitud
depende de la proporcin
de caracteres comunes

Comparacin entre
composicin del
ADN/ARNr:
%GC
hibridacin de ADN,
secuenciacin de ARNr

Taxonoma molecular
1. Contenido de guanina y citosina (%GC): tcnica ms simple
% GC la secuencia de bases vara con los cambios en la secuencia
completa (bacterias: % GC 24 - 76%)
Variacin: < 3% misma especie; > 10% diferente gnero

2. Hibridacin de ADN
ADN: tcnica ms directa
Desnaturalizacin de ADNbc mezcla de ADNmc enfriamiento
reasociacin de cadenas complementarias ADNbc hbrido
70% de similitud y <5% de diferencia en Tm misma especie

3. Secuenciacin del ARNr (mtodo ms usado):

Ribosomas bacterianos: secuencias de ARNr 5S y 16S
Comparacin con bases de datos mundiales 97% de similitud
(ARNr 16S) misma especie
Tm: temperatura de fusin; ADNbc: ADN bicatenario; ADNmc: ADN monocatenario

Manual de Bergey
Sistema ms usado y aceptado para la identificacin y
clasificacin de clulas procariotas
Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (19231984):
identificacin
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (1984 y 2001) 2
ediciones: clasificacin relacin entre microorganismos
1984: 1 Ed. clasificacin fenotpica
1984
fenotpica: Gram 4 volmenes
2001: 2 Ed. clasificacin filogentica
2001
filogentica: ARNr 5 volmenes
Cambios desde 1984 DOS Dominios, 2200 especies y 390 gneros
Edicin con arreglos y cambios en nomenclatura:

26 filos o divisiones

2 Archaea
26 Bacteria

Volumen I
Introduccin (taxonoma)
Clasificacin de Archaea (165 gneros) y bacterias fottrofas

Volumen II
Proteobacterias (Gram [-]): 538 gneros
Parte B: g -proteobacteria (Enterobacteriaceae)
Parte C: a - b - d - e -proteobacterias (Agrobacterium, Rhizobium)

Volumen III
Firmicutes (Gram [+] con %GC): 250 gneros en 40 familias
(Staphylococcus, Streptococcus, Clostridium, Bacillus)

Volumen IV
Bacterias Gram (-) sin caractersticas comunes: 153 gneros en 29 familias
(planctomicetes, espiroquetas, bacteroides, fibro- y fuso-bacterias)

Volumen V
Clasificacin de actinobacterias
actinobacterias: 200 gneros en 49 familias
Actualmente (2009) en revisin

3. BACTERIAS
3.3. Clasificacin
3.3.3. Grupos ms importantes
en Biotecnologa

Enterobacterias:: caractersticas
Enterobacterias
Clasificacin

Phylum: g -proteobacteria
Orden: Enterobacteriaceae

Gram

Negativo

Forma

Bacilos

Hbitat

Tracto intestinal de mamferos

Movilidad

Inmviles y mviles (flag. pertricos)

Esporulacin

No

Req. O2

Anaerobios facultativos

Req. nutricionales

Simples

T ptima

22 - 37 C

Caracterstica
distintiva:
fermentan lactosa y
viven en el intestino

Fermentan azcares (lactosa) 2 grupos:

grupos
cido-mixta cidos lctico, actico y succnico (NO
cidoNO butanodiol):
Escherichia, Salmonella, Shigella
Butanodiolica EtOH, CO2, butanodiol: Erwinia, Enterobacter

Importancia
Algunas causan intoxicaciones alimentarias
Patgenos para humanos y para plantas:
Escherichia coli:

Algunas cepas causan infecciones en el tracto intestinal

Microorganismo modelo estudios genticos y bioqumicos

Parte de la flora normal del intestino sintetiza vitaminas del

complejo B e impide el desarrollo de orgs. proteolticos

Shigella dysenteriae: disentera bacilar (dolor abdom., fiebre, diarrea)

Salmonella typhimurium: gastroenteritis (infeccin del tracto digest.)
Salmonella typhi: fiebre tifoidea (fiebre, diarrea, lceras)
Yersinia pestis: peste bubnica (no habitan en el intestino)
Erwinia: todas las especies son patgenas de plantas

Bacterias lcticas (BAL): caractersticas

Clasificacin

Phylum: Firmicutes
Orden: Lactobacillales

Gram

Positivo (bajo G-C)

Forma

Cocos y bacilos

Hbitat

Lcteos, plantas, boca

Movilidad

Inmviles

Esporulacin

No

Req. O2

Anaerobias aerotolerantes

Gneros ms importantes:
Streptococcus y Lactobacillus
Algunas especies flora normal de la boca (placa y caries)
Algunos estreptococos
patgenos

Req. nutricionales Complejos

T ptima

22 - 37 C

Caracterstica distintiva:
fermentacin lctica

Fermentan azcares con base en el producto final: dos grupos

Homolcticas un solo producto: cido lctico
Heterolcticas varios productos: cido lctico + EtOH + CO2 +
acetaldehdo

Importancia: industria alimentaria

Probiticos: organismos vivos con efectos benficos en la salud
Probiticos
(BAL: Streptococcus termophilus y Lactobacillus)

Quesos: cuajada ( pH por la fermentacin lctica); maduracin:

Quesos
cambios qumicos por BAL y hongos

Enologa: fermentacin malolctica (BAL: Leuconostoc, Lactobacillus y

Enologa
Pediococcus ): transforman c. mlico en c. lctico y CO2

Sabores y aromas
aromas: c. lctico sabor; acetaldehdo aroma/sabor
Conservadores: cido lctico pH
Conservadores
Producto

Bacteria lctica

Queso cheddar, cottage

Lactococcus lactis

Queso azul

Lactococcus lactis

Queso mozzarella,
parmesano

Streptococcus thermophilus, Lactobacillus delbrueckii, L. helveticus

Yogurt

S. thermophilus, L. delbrueckii

Mantequilla

Lactococcus lactis

Otros microorg
microorg..
Penicillium roqueforti

Leuconostoc + L. lactis

Formadoras de endosporas
endosporas::
caractersticas
Clasificacin

Phylum: Firmicutes
Clase: Bacilli, Clostridia, Mollicutes

Gram

Positivo (bajo G-C)

Forma

Bacilos

Hbitat

Suelos, sedimentos, intestinos

Movilidad

Mviles e inmviles

Esporulacin

Si

Req. O2

Aerobios y anaerobios estrictos

Req. nutricionales Requieren vitaminas y aa

T ptima

30 - 45C (la mayora)

Caracterstica
distintiva: produccin
de endosporas

Gneros ms importantes:
Bacillus (aerobios obligados y facultativos) y Clostridium (anaerobios estrictos)
Otros gneros importantes: Sporosarcina, Saccharopolyspora
Algunas especies son patgenas para animales exotoxinas

Importancia
Bacillus anthracis (aerobio, inmvil) exotoxina
exotoxina: ntrax
En productos derivados de animales (lana)

Bacillus subtilis (aerobio, inmvil): organismo modelo

Estudios de esporulacin y regulacin de expresin de genes

Bacillus thuringensis (Bt): patgeno de insectos: control biolgico

Produce un cristal de protena txico para insectos d-endotoxina
Larvas ingesta de cristales activacin de toxina protelisis
del intestino lisis celular del aparato digestivo
Plantas letales: insercin del gen Bt que codifica para la d-endotoxina

Clostridium botulinum (anaerobio, mvil, flagelos pertricos y esporas

subterminales deformantes): botulismo neurotoxina (botulina
botulina)

Actinomicetos:: caractersticas
Actinomicetos
Clasificacin

Phylum: Actinobacteria
Clase: Actinomycetales

Gram

Positivo (alto contenido de G-C)

Forma

Bacilos y cocos

Hbitat

Principalmente suelos + boca

Movilidad

Mviles e inmviles

Esporulacin

La mayora

Req. O2

Aerobios y anaerobios facultativos

Req. nutricionales

Muy verstiles (pueden degradar

sustratos complejos)

T ptima

25 - 30C (algunos 55 65C)

Caracterstica
distintiva: formacin
de filamentos
ramificados (micelio)

Gneros ms importantes:
Streptomyces: producen el mayor nmero de antibiticos: bactericidas (neomicina,
estreptomicina) y fungicidas (nistatina), muchos metabolitos secundarios
Frankia: bacterias fijadoras de N2 viven en simbiosis con plantas
Algunos patgenos: Mycobacterium, Corynebacterium, Nocardia, Rhodococcus

Importancia
Descomposicin de residuos animales y vegetales
Participan en procesos de humificacin liberan molculas tiles
para la nutricin de las plantas
En ecologa descomponen materia orgnica en el suelo
Enzimas que degradan material vegetal, lignina y quitina
Importantes para la produccin de composta
Producen el olor a tierra mojada (geosmina)

En salud producen antibiticos y compuestos

bioactivos (anti-helmnticos y anti-cncer):
Gnero ms importante: Streptomyces produce
~ 70% de los antibiticos comercialmente
importantes estreptomicina
Gota de antibitico en
colonia de Streptomyces