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TFG

EUETIB - UPC

Simulacin de
crecimiento celular
en tumores

Autora: Vanessa Garca Garca


Director: R. Javier Prncipe Rubio
Especialidad: Biomdica

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

EUETIB - UPC

Tumor

Simulacin

Modelo
2

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

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Tumor

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

EUETIB - UPC

Tumor

benigno

maligno

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

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Tumor
glioma

sarcoma carcinoma

linfoma/
mieloma

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Mecanismos supresores

regulacin
de seales

reparacin
ADN

apoptosis
6

Simulacin de crecimiento celular en tumores

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Caractersticas

Inhibicin mecanismos supresores

Anaplasia

Angiognesis

Metstasis

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

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Simulacin

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

In vitro

Entrada
de
parmetros

Validacin
de
resultados

In silico

In silico: de computadora

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

CA (autmata celular )
dinmico
discreto
local

ABM (modelo basado en agentes)


comportamiento y
objetivos propios
local + global
Toma de decisiones

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Modelo espiral + prototipo


Evaluacin

Requisitos

Prueba

Anlisis

Implementacin

Diseo

prototipo#01
prototipo#02
prototipo#03

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Requisitos

Condiciones mitosis

Mecanismos supresores

Vecindad

Herencia

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Evaluacin

Requisitos

Prueba

Anlisis

Implementacin

Diseo

prototipo#01
prototipo#02
prototipo#03
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Marcadores genticos

M1 ausencia sigGo

M2 ignora inhibidores

M3 evasin apoptosis

M4 inmortalidad telmero

M5 inestabilidad gentica

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Datos iniciales

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Apoptosis (fallo reparacin ADN) = 1/1.000


Largo telmero = 100
Mutacin = 1/100.000
Evasin apoptosis = 1/10
Ignorar inhibidores sigGo = 1/10
Inestabilidad gentica = 1/100

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Evaluacin

Requisitos

Prueba

Anlisis

Implementacin

Diseo

prototipo#01
prototipo#02
prototipo#03
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Diagrama del modelo

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Evaluacin

Requisitos

Prueba

Anlisis

Implementacin

Diseo

prototipo#01
prototipo#02
prototipo#03
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

MatLab

(www.mathworks.com)

GNU Octave

(www.iprium.com)

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

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Modelo

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Evaluacin

Requisitos

Prueba

Anlisis

Implementacin

Diseo

prototipo#01
prototipo#02
prototipo#03
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 25x25
1 clula sana inicial
40 ciclos

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
3 clulas sanas (amarillo)
2 clulas mutadas (azul)
40 ciclos

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
1 clula mutada
40 ciclos

Can clulas mutadas


Azul oscuro clulas muertas
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
1 clula mutada
75 ciclos

Can clulas mutadas


Azul oscuro clulas muertas
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
2 clulas sanas (amarillo)
3 clulas mutadas (azul)
25 ciclos

Can clulas mutadas


Azul oscuro clulas muertas
Naranja clulas sanas
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
2 clulas sanas (amarillo)
3 clulas mutadas (azul)
75 ciclos

Can clulas mutadas


Azul oscuro clulas muertas
Naranja clulas sanas
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
2 clulas sanas (amarillo)
3 clulas mutadas (azul)
175 ciclos

Can clulas mutadas


Azul oscuro clulas muertas
Naranja clulas sanas
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

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Salida de resultados

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Tiempo transcurrido
Nmero de ciclos efectuados
Estado de las clulas en cada intervalo
Condiciones mitosis
Posicin de la clula progenitora e hija
Motivo apoptosis
Herencia

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Evaluacin

Requisitos

Prueba

Anlisis

Implementacin

Diseo

prototipo#01
prototipo#02
prototipo#03
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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 25x25
1 clula sana
250 ciclos
s-1

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 25x25
1 clula mutada
250 ciclos
s-1

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
2 clulas sanas
3 clulas mutadas
25 ciclos

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EUETIB - UPC

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
2 clulas sanas
3 clulas mutadas
75 ciclos

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EUETIB - UPC

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Rejilla de 50x50
2 clulas sanas
3 clulas mutadas
175 ciclos

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Conclusiones

El crecimiento celular es de tipo Gompertz, tal y


como se ha demostrado en otros estudios

El ritmo de proliferacin de las clulas


tumorales es mayor al de las clulas sanas, as
como su tasa de mortalidad

Las clulas tumorales tienen una capacidad de


carga mucho mayor que las clulas sanas

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Concepto

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Programadora
junior
Software
Octave
MatLab
PC (laptop)

otros

Uds
365 h

Precio
2.555

Licencia GNU/GPL
Licencia estudiante (sin complementos)

0
35

CPU P8700 @ 2'53GHz x 2


4GB DDR3-1066 MHz
NVIDIA GeForce G 105M

599

21,75
TOTAL

3210,75

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

Mejoras

EUETIB - UPC

Implementar en Pandora/GPL (en curso)


Aadir protenas sintetizadas y rutas metablicas
Simular seales del medio extracelular
Distinguir diferentes regiones dentro del tumor
Aadir capacidad angiognesis y metstasis

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Simulacin de crecimiento celular en tumores

GRACIAS POR VUESTRA ATENCIN

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