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Resumen miercoles 18 de febrero

La relacin entre la estructura y la funcin de las imuno globulinas


Tomaremos de jeemplo al BRC o IgM, este permite interaccion a los linfocitos
B con el enotrno, conectan a la matriz extracelular con maquinaria de
sealizacin intracelular la secrecin de anticerpos es importante ya que
median la neutalizacioon de los antgenos , procesan el reclutamiento de
clulas efectoras y ademas ayudan a la fijacion del complemento, las Ig
tiene dos funciones, una de sealizacin y otra de reconocimiento
(seailazacion hacia la propia celula, y reconocimiento de antgenos).
Siguiento con el ejemplo, si el AC logra enconrar a un antgeno, la otra parte
del anticuerpo mandara una sealizacin.
Dominios de las inmunoglobulinas. Es explicado debido a la concervacion
estructural y la apacifdad de variabilidad infinita en una sola molecula, dado
por la estructura del dominio, el dominio es una secuecia repetisa dentro de
uan msima proteia, los dominios de la ijnmuno globulina son derivados de
un gen qyes e ha duplicado, diversificado y modificado para presentar una
amplia variedad de cualidades, caractersticas o capacidades en una
estructura bisica en comn.
Los mominio es estn limitados a los AC, esto, explicndose debido a que
este dominio tiene cokmmo caracterstica principal los puentes de disulfuro
que se extienden a lo largo de 110 aminoacidos (asi todos lo que vim,os de
las superfamilia de la inmunoglobulinas
Superfamilia de las inmunoglobulinas
Losgenes que coficican dominios de Ig nop estn restringidos a los dominio
de IG, las molculas de la superfamilia se encuentra en la mayora de las
clulas y no es nica del se humano, su estructura es resistente a la
proteasas, las protena que pueden descompines a una IG en conjunto es la
pepsina y la papana, si la papana corta, las cadenas pesadas tendr
puentes de disulfiuro, pero si en cambio es la pepsina las cadenas no
tendrn puentes de disulfuro.
Por que es importante el plegamiento de las inmunoglobulinas, es
caracterstico estructural de los AC, formar una especie de barril, cuya
caracterstica es tener 7 cadenas constantes ligeras y 8 cadenas variables
ligeras, conectads por enlaces y ornenados con su porcin hifrofobica
interior, la regin de las cadenas ligeras variables muestra las cadenas
antiparalelas conectadas por enlaces.
La cadena variable ligera es la que presenta muchos cambios de
amnoacisods para poder fijarse al antgeno, y es laque se encuentra mas
extera en el AC, esta variabilidad es la quele ermite reconoces un numero
infinito de AG comtario a la regin comnstante la cual tine que ser asi para
poder interactuar con un numero finito de receptores
Resumen Jueves 20 de febrero
Los anticuerpos prsentan cierta variedad en los aminocidos que esta dada
por los CDR que etan anclados a la estructura de la IG por ls FC (fracciones
constantes), lla variabilidad de sals secuencias de los enlacesde los CDR
determina la hidrofobicidad y la carga de la regin FAB.

Los AG varian en tamao y variabilidad pues de ello depende si llegaran a


ser mas o menos inmunogenos, la flexividad y la variabilidad de las IG es
dada por la regin de la bisagra

Que fuerzas son las que propician la unin del antgeno-Anticuerpo?


Principalmente son 4, Las fuerzas electrostticas, los puentes de hidrogeno,
las fuerzas del vandelvals y las fuerzas hidrofobicas
Como funciona el FC: esta estructurado de la sig manera: IGA, IGB E IGD
tienen cadenas esadas con dominio C (1 y 2) y una bisagra mas amplia, la
IGE e IGM seles agrega un dominio C agragado al final que ayuda e la
polimerizacin de los AC y una bisagra mas corta aun asi es mes
masomenos comn; el FC actuacomo un receptor para protenas del
complemento y como un ligando para los sitios de unin a la clulas,
adems en en te sitio es donde actua el cmplemento
Multemerizacion:
Hay una IgM monomerica que es de baja afinidad por el antgeno y los
dominios (1234) cuando se espresa el dominio 4 tiene una porcin
trnsmembranal y citoplasmtica (removida por el splicing al secretar una
IGM soluble) asi qu si lo encontramos completo ira hacai la membrana pero
cuando se necesita producir el pentmero de IGM una fraccin de M4 sera
eliminada y no tendr la propiedad de anclarse ne la membrana y la
encontraremos pentamerica, (sdi tiene m4 pero no tiene esa regin
trnsmembrana) adems el M3 se une a C1Q que inicia la activacin clsica
del complemento, el M1 se une a C3B para facilitar el ingreso de lso
antgenos opzonizados por los macrfagos, se cree que M3 y 4trabajan en la
multemirezacion, al final de las cadenas pezadas trieen sisteina, tiene 2
IGM monomericas, las ds sisteinas frman una cadena J que lo van uniendo y
esto hace que se facilite un cambio en un hecho ara que etren 2 disulfuros
cuyando se suelta J ya qudan unidas por puentes de disulfurpo y como se
dio la orgen de que se produzcan IGM monomericas sin la porcin
trnsmembranal, se encontraran con otra y pasara lo mismo formaran en el
extremo distal una cadena J y despus en el hueco se formaraun ente de
disulfuro y asi hasta que se fomra el pentaero la ultima unin es por el J,
esta conformacin entamerica sufre diferente cambios cuando interactua
con el antgeno, la prwssentacion PLANA no hace nada pero cambia a una
forma de grapa o cangrejo cuando entraen contacto con el entugeno, esto
mejora su fijacin y ahesion adems de que se une eficazmente al
coplemento
DATOS DOBRE IGM
Cadena pesada: (1234)
Vida media 5-10 dias
Porcentaje en suero 10%
Nivel serico: .25-3.1
Activacin del complemento: via clsica (atraves de C1Q
Interaccion con: fagocitos(receptores C3B) Celepiteliales ( receptor de
inmunoglobulinas)
Tansplacentaria: NO
Afinidad por antgeno: Monomerica: baja, heptamero:alta avides de 10
IGD:

Cadena pesada:
Vida media 2-8 DIAS
Porcentaje en suero 0.2
Nivel serico: .04- .4
Activacin del complemento: NO LO ACTIVA
Interaccion con: via receptores de LT para IGD
Transplacentaria: NO
Afinidad por antgeno: puede activar, eliminar o anergizar los LB
Su regin de bisagra es mas extendida por lo cual es mas suceptible a una
degradacin proteoltica
Multemirazacion de IGA: parecida al la de la IGM pero existen 2 subclases de
IGA, la IGA1 es mas frecuente en el suero y esproducida por los LB d ela
medula osea, la IGA2 se encuentra en la secrecin de las mocusas, calostro
Leche maerna y es producida por los LB de las mucosas
Cadena pesada:
Vida media IGA1 5-7 dias IGA2 4-6 dias
Porcentaje en suero
Nivel serico: IG11.4-4.2 IGA2 0.2-0.5
Activacin del complemento: IGA1 por la via alternativas y de la leitina la
IGA2 no
Interaccion con: con el receptor PIGR de cel epiteliales y los fagocits con los
recep de IGA
TRansplacentaria: no
Afinidad por antgeno:
Para resucir la vulnerabilidad de la bisagra de proteasas microciabana la
IGA1 el altamente glucosilada y la IGA2 esta truncada esto evita la unin de
estas protenas a la regin de l bisagra por tanto no se corta y le da
supervivencia
IGE
Cadena pesada:
Vida media 1-5 DIAS
Porcentaje en suero BAJO
Nivel serico: BAJO
Activacin del complemento: NO
Interaccion con: ES ALTO, AFINIDAD POR RECEPTOREES EN mastocitos
eusinofilos basofilod cel de Langerhans y recepres de baja afinidad de LB y
monocitos
TRansplacentaria: NO
Afinidad por antgeno:
Tiene un pael al final de la respuesta inmune contra infecciones parasitarias,
la mayora de las IGE es captada por los receptores de alta afinidad de las
clulas efectoras y por ende esta relacionada por las reacciones alrgicas.
VIERNES 20 FEBRERO
IGG
Cadena pesada: gamma 1234
Vida media 22-24 DIAS
Porcentaje en suero G1 MENOR MAYO G4
Nivel serico:
Activacin del complemento: G3 MAYO
Interaccion con: MACROFAGOS, FAGOCITOS

TRansplacentaria: SI UN POCO MENOS LA G2


Afinidad por antgeno:
Receptores para IgG para el recin nacido donde de una el C1Q
Receptores para cadenas gamma,
Receptor 1: macrfagos, neutrfilos eosinofilos, cel dendrticas que ocaciona
la fagocitosis ynel estallido respiratorio
Receptor 2a: macrfagos, neutrfilos cel de Langerhans, desencadena
fagocitosis y degranulacion
Receptor 2B1: en LB y mastocitos pero inhibe la estimulacin
Receptor 2b2: en macrfagos, neutrfilos eosinofilos, propicia la fagocitosis
pero inhibe la circulacin de la cel
Recpeor 3: promueve la lisis de la celula, presente en NK eosinofilos,
macrfagos, mastocitos netrofilos.
Receptor GAMMA neonatal: se une a ala IgG materna secretada en el
calostro pasa al recin nacido hacia el estomago y ala mucosa y de ah al
torrente sanguneo y es liberado.
Los Ac tiene diversidad en un mismo individuo,se debe a la diversidad
gentica propia del individuo que a las mutaciones propias del DNA, las
cadenas pesadas estn codificadas en el cromosoma 14, lasdenas Kapa de
cadenas ligeras en el cromosoma 12 y las lamda en el 22,
Como es posible explicar geneticamen la naturaleza bifuncional de los
anticuerpos?
Dreyer y Bennet dijeron que para un solo isotipo de AC debe de haber:
Una regio de genhes C en la via germinal separa dela regin terminal de
genes V
Mulltiples opciones de genes V disponibles
Un mecanismo de reodenamiento de gees V y C en el genoma para que se
puedan complementa ry producir una inmunoglobulina.y psara probar su
hiptesis: tenemos la lnea germinal con C separado de los genes V para su
rearreglo
Se marcaban con un florofolo (brillo) se cortaban con una enzima de
restriccin y un ADN rearreglado, se corta el dna germinal con la enzima de
restriccin que contienes regiones variables o constantes se corre en un gel
de electroforesis para ordenarlo por tamaos, se utilizan las tcnicas blot
(ibridacion) para la regin V (donde se encuentere la regin V se colorea) y
ah mismo material cortado se debe encontrar una regio C asi que se pone
una sonda para la regin C y se hace lo mismo en en un LB pero aqu ya va
a haber una regin VC asiq ue se iluminara el mismo pedazo de ADN y asi
comprueban su hiptesis, pero la secuenciacin gentica complica la teora,
pues la cadena V la compona 95 aminoacidos y la cadena C 100
aminoacidos y rearreglado son 208 aminoacidos por los genes J y el Gen de
la diversidad (D), la cadena pesada requiere 3 eventos recombinantes v+j /
VJ+D / VJD+D
La cadena ligera son eventos recombinantes V+j / VJ+C,
Dando varias preguntas :
1. Como es posible que que haiha una diversidad infinita de
especificidasd a partir de una cantidad finita de DNA?
2. Como se encuentran las degiones VJ y por que no se unen antes con
la regin C?
3. Como hace el ADN para romperse y adherirse?
RESUMEN LUNES 23 DE FEBRERO gasto media clase en recordar la clase
anterior asi que es poco

Como puede la misma especificidad del anticuerpo puede estar presente


en la membrana y de manera soluble? Debido a la pas y la pam
Los locus para la cadena pesada variable son 123genes mas 40genes con
productos identificados mas 79 pseudgenes, 4 genes sin productos
identificados y 24 no funcionales en CROMOSOMAS 15 y 16, para cadena de
unin de la cadena pesada hay 9 genes, 6 funcionales con productos
identificados, 13pseudogenes y el gende diversidad hay 27 genes 23
funcionales con productos identificados 3 pseoudogenes secuencias no
funcionales en el cromosoma 15 y 3 marcos de lectura (los aminocidos se
sintetizan a partir de codones, los marcos de lectura abiertods quiere decir
que la polimeraza se puede dherir y puede empoezar a reconocer esos
codones con productos identificados)
Ademas tenemos las cadenas ligeras KAPPA y LAMDA que son MUCHOS! UN
CHINGO PUES!
La recombinacin de todos estos genes dara como resultado una varabilidad
casi infinita para reconoces antgenos
El mecanisco para unis las regiones V J D C es atraves de corte y empalme
La regio constante, tiene exones adicionales u obcionales, aqu se entiende
como es posible que se pueda equedar o liberar en la memebrana, antes de
las cadenas pesadas, estas codificadas por exones separados, se tiene una
secuencia que doficica para la secrecin o membrana pegadas a M4 , antes
de esta secuencia ya sea de secrecin o membrana se encuentra un sitio de
poliadenilacion (PAS y PAM) si se quita PAM se hace de secrecin, y se quita
PAS se hace de membrana
Se responden las primeras preguntas
1. Como es posible que que haiha una diversidad infinita de
especificidasd a partir de una cantidad finita de DNA?
matematicamente, hasta cierto punto
2.
Como puede la misma especificidad del anticuerpo puede estar
presente en la membrana y de manera soluble? A travs del uso de
sitios alternos de poliadenilacion
3. Como se encuentran las degiones VJ y por que no se unen antes con
la regin C? Como hace el ADN para romperse y adherirse?
Esto es debido a secuencias flanqueadoras que se encuentran en 7-23-9- y
12 nucleotidos, donde siempre se encuentran constantes:
LAMDA7-23-9 9-12-7ALGO7-12-9 REGION CODIFICANTE,
ASI SE PUDO ENCONTRAR EL GEN DE LA DIVERSIDAD.

RESUMEN MARTES 24 DE FEBRERO


Modificaciones posibles de encontrar en la IgM
La regin constante o FC tiene exones adicionales u obcionales que son los
sitios de poliadenilacios para la secrecin o para la membrana
Como se procesa el RNA
Se tiene el trnascrito primario con todod sus intrones , debido al solicing
producir un RNA con la cadena pesada completa

El RNA de de la cadena pesada es completado por el splacing de la region


VDJ y asi se tiene completo junto la cadena variable cuyas regiones son la
caneda ligera regin variable y y la cadena ligera regin constante, la regin
constante es importante por que sirve para unin con la cadena pesada y
con la regin de la bisagra
1.COMO ES POSIBLE QUE EXISTAN TANTA CANTIDAD DE ANTICUERPOS A
PARTIR DE UNA CANTIDAD DE ADN? Por al diversidad de combinacin y por
la diversidad de la unin
2.COMO PUEDE LA MISMA ESPECIFICIDAD DEL ANTICUERPO ESTAR
PRESENTE EN 2 SIIOS A LA VEZ? DEVIDO LOS SITIOS ALTERNOS DE
POLIADENILINACION
POR QU NO SE UNEN V CON J PREVIO ALA UNION CON D? Por que existen
las secuencias flaqueadoreas recuerda V-7-23-9 9-12-7-D-7-23-9 ETC LA
REGLA DE 12-23
Las secuencias repetidas de nucletidos en el ADN se miestran en 2 giros
cuando son 23 nucleitdos repetidos o en 1 giro cuando son 12 n repetidos
Como hace la maquinaria de transcripcin del RNA para sintetizar todo el
RNS, pues con los intrones por que son la seal para que se empice a
sintetizar los aminohacidos, dobla las regiones que no srven par quw se
pegen V con DJ (el arco donde 7- 23- 9 se quedaban fuera) FORMANDO UN
LUG, ALINEANDO LOS EPTAMEROS Y ELIMINANDO todo el DNA que no sirve
(7-23-9/9-12-7)
Existen eventos imprecisos y al azar que pueden ocurrir cyuando el AND se
rompe y se une cuando V se une a DJ se introducen nucletidos al azar lo que
le da la diversida de unin
Tenemos a V1 y todoslos dems elemento s de la regin variable esto solo
es til si todos los elementos estn orientados hacia el mismo sentido,
cuand encontramos una regin en sentido contrario (ejemplo v4) esta
inhibe la sintetizacion de la cadena, lo que se hace es una recombinacin
sin delecion, no se va sacar el gen, lo que se hace es girar alinenando VJ
con V4 para que queden empalmados, pero ingen igual en sentido contrario,
asi se corta la unin de V4 con sus secuencias flaquedoras, y la unin de VJ
con sus secuencias flanqueadoras, y cerramos y luego giramos V4 para que
den alineados (TODO UN ROLLO)
3.COMO SE ENCUENTRAN LAS REGIONES V Y J Y POR QUE NO S EUNENN
ANTES CON LA REGION C? DEVIDO A LA REGLA 12-23
SE TIEEN CIERTAS PROTEINAS Y FACTORES QUE PROVEEN LA
TRANSCRIPCION el rna recozca las protenas pero estn alreves pero aqu si
hay una delecion y se cierra, aun sigue desorienado, se mee una enzinma
que corta el And y se alinea pero al momento de cortar se van tambin

cierto nucletidos y se meten cierto nucletidos para que no quede un


hueco,
El complejo de la recombinaza hace corte en sitios aleatorios cerca de la
regin final de V y de D para que pueda separarse de los eptameros, asun
asi se ciera por complementaridad
G=A y A=T
Pero la regin recombinante queda arriba y se tiene que abrir de nuevo y
tiene que estar alado uno del otro, estando yuxtapuestas las endonucleasas
cortan en otros sitios de manra aleatoria en los segmentos V y D
propiciando que las bases complementarias pasen a formar una sola
cadena, para formar una avertura que va propiciar la adecion de
nucletidos diferentes, los nucletidos que se invierten forman una cadena
de AND complementaria, la unin de multiples nucletidos aleatorios forman
diversidad, pero siemre y cuando sean complementarios unos con otros y
los no complementarios son cortada por las exonucleasas, al final la
polimeraza agraga los nucleitidos complementarios.

MIERCOLES 25 DE FEBRERO
MUCHAS PARTICIPACIONES Y DE NUEVO LO MISMO DE AYER
Sera posible que exista una mutacion durante la respuesta inmunolgica y
de ser asi como afectara la especifidad del AC? La hiprmutacion somatica
produce maduracin de afinidad, una cloa de LB procuce anticuerpos y exite
una mutacion neutral (queda igual), en otros queda uan mutacuion bene
fica y en otros una mutacion deleteria, los sitios de mutacion pueden variar,
ya sea en regiones hipervariables, y en regiones o del marco, una mutacion
benfica de conceder al AC una alta especificidad y conviene obtener mas
copias de este AC, cuando hay una mutacion deleteria este AC se elimina,
cuando hay una mutaciuon neutral no pasa nada.
JUEVES 26 DE FEBRERO
La hiper mutacion somatica ocurre mas frecuentemente en los CDR, la
maduracin de afinidad es el cambio que producen los anticuerpos frente a
un estimulo , el cual se va a decuar para adapterse de una mejor manera al
antgeno, las clulas que resenten un anticuerp mas efectivo, son las que
se van a seleccionar para clonarse,
Como se puede dar el cambio de isotipo? A lo largo de la esecificidad del
anticuerpo va a permanecer igual, sin tomar en cuenta la maduracin por
afinidad, la funcin efectora del los AC a lo largo de la respuesta necesita
cambiar dramticamente mientras la respuesta progresa para hacer un
cambio de isotipo, si se produce una IG de cierto isotipo y no hay cambio se
cambia, , los AC intercambian regiones constante que contienen las
estructuras de interaccion celular, si la regin variable funciona bien pero la
regin copnctante no interactua bien con las clulas se necesita cambiar el
AC mas especficamente la parte FC, el cambio se da gracias a una seriue
de nucletidos repetidos que se encuentran previo a los dominios de las IG
de las cadenas pesadas, el cambio es similar al cambio con la regin VDJ y
unicamnete se realiza en los LB activos. Es por esto que las alergias no se
curan, oues la IGE es la que esta en penltimo lugar de genes de

codificacin, siendo asi que es de mayor afinidad de todos y nunca pasa al


alfa2

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