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Tema 0.
Introduccin a la bioenergtica
El flujo de energa y el flujo de informacin biolgica son los dos aspectos ms bsicos
para el mantenimiento de la vida. Las transformaciones energticas constituyen un proceso
esencial de los seres vivos. Los seres vivos han desarrollado diversas y sofisticadas mquinas
moleculares que permiten un control extraordinario del flujo de la energa. El segundo de los
aspectos que hemos mencionado est relacionado con la capacidad de los seres vivos de
generar orden. En este captulo plantearemos cmo las leyes de la Qumica y la Fsica y ms
concretamente la Termodinmica nos permiten comprender estos aspectos bsicos en los que
se fundamenta la vida, proporcionndonos una imagen unificadora en la que veremos cmo las
leyes que nos permiten entender las transformaciones energticas, la generacin de orden y la
direccionalidad de los procesos que ocurren en los seres vivos son las mismas leyes que rigen
el comportamiento de la materia y de la energa en el universo.
Objetivos de la Bioenergtica:
1) Aclarar el origen de la energa biolgica, el otro gran componente de las reacciones y
procesos biolgicos, que generalmente no se identifica numricamente en Bioqumica ni en
otras disciplinas biomdicas. Junto al balance material que la conservacin de la materia
obliga a tener en cuenta en la estequiometra de las reacciones y de los procesos
metablicos que ocurren en la clula y en el organismo, no debemos olvidar que existe
tambin un balance energtico de transcendencia similar.
2) Desarrollar la base conceptual que nos permita decidir sobre la direccionalidad de las
reacciones y procesos biolgicos.
La Fsica y la Qumica son el marco conceptual que nos permitir abordar estos aspectos.
Cualquier sistema biolgico por simple o complejo que sea puede ser considerado como una
coleccin compleja de reacciones qumicas interconectadas. Estas reacciones qumicas son
responsables del crecimiento (implica fabricar ms compuestos qumicos y ensamblarlos),
reproduccin (implica crear nuevos sistemas biolgicos independientes), movimiento (implica
ejercer una fuerza en el exterior), etc.
Por complejo y sofisticado que llegue a ser un sistema biolgico obligatoriamente debe de
respetar una serie de restricciones impuestas por el entorno (abundancia de los elementos y su
posibilidad de utilizacin por los seres vivos, condiciones fsicas externas: gravedad, presin,
temperatura, niveles de radiacin; fuentes de energa; etc) y por las leyes de la Fsica y la
Qumica ( son leyes universales aplicables a todo tipo de sistemas. Son las restricciones ms
bsicas que estn relacionadas con la forma en la que se comporta la materia y la energa. Son
las leyes que nos unifican con el entorno en el que vivimos). La Qumica-Fsica es la disciplina
que intenta comprender las restricciones que las leyes de la Qumica y la Fsica imponen a los
compuestos qumicos y sus reacciones y usar este conocimiento para predecir cmo se
comportarn los sistemas qumicos. En este sentido, la Biofsica tendra como objetivo analizar
las restricciones que las leyes de la Fsica y la Qumica imponen en los sistemas biolgicos.
La bioenergtica utiliza la base conceptual de la Termodinmica (disciplina englobada en la
Qumica-Fsica) para responder a las preguntas que hemos planteado. La Termodinmica es
un marco conceptual que nos permite analizar la disponibilidad de energa en un sistema y la
forma en la que la energa puede ser utilizada y redistribuida (convertida de una forma en otra).
Es, adems, una herramienta para comprender y predecir la forma en la que un sistema puede
cambiar, permitindonos predecir la direccin en la que ocurren los procesos.
Preguntas que nos permite abordar la termodinmica en relacin con los sistemas
biolgicos:
Son estables los sistemas biolgicos?
Cul es el coste energtico de las funciones celulares?
Cmo almacenan energa los seres vivos y cmo la hacen disponible?
Tema 12.
Conceptos bsicos de Termodinmica. Las leyes de la
Termodinmica. Primer principio de la Termodinmica.
Objetivos:
Introducir los conceptos bsicos de la termodinmica.
Formular el Primer Principio de la Termodinmica que incluye la observacin experimental
de que la energa no se puede crear ni destruir.
Analizar los cambios de energa que tienen lugar en los procesos fsicos y qumicos
considerando la primera ley de la Termodinmica.
Analizar el intercambio de energa de un sistema con sus alrededores en trminos del
trabajo que pueda realizar el sistema o del calor que pueda producir.
Introducir el concepto de entalpa y su aplicacin para cuantificar los cambios de calor que
tienen lugar en procesos fsicos o reacciones qumicas a presin constante.
La Termodinmica es un marco conceptual muy preciso, aplicable a casi cualquier tipo de
sistema, desde una mquina trmica a un ser vivo. Uno de los atractivos de esta disciplina es,
por lo tanto, su amplio grado de generalidad y el hecho de que no es necesario poseer ningn
conocimiento acerca de la naturaleza del sistema que estamos estudiando.
Tenemos que empezar por conocer las herramientas bsicas con las que la termodinmica
describe sus objetos de estudio. Para ello empezaremos por describir los conceptos bsicos
que se usan en termodinmica y que nos permitirn abordar la formulacin de las leyes de la
Termodinmica. Nuestro objetivo ser aplicar las leyes de la Termodinmica para comprender
los principios que rigen las transformaciones energticas y la direccin de los procesos en los
sistemas biolgicos.
2.1. Conceptos bsicos de Termodinmica.
Termodinmica.
Estudio de las transformaciones energticas.
Concepto de Sistema.
Parte del universo objeto de estudio
Interior del sistema
Barrera de separacin definida
Regin fuera del sistema en la que hacemos nuestras medidas
Ambiente externo
Tipos de Sistema.
Sistema abierto
Sistema con una barrera a travs
Sistema cerrado
Sistema con una barrera a travs
Sistema aislado
Sistema con una barrera a travs
Sistema adiabtico
Sistema con una barrera a travs
Cualquier variable extensiva, se convierte en intensiva dividiendo su valor por otra variable
extensiva, por ejemplo, masa, nmero de molculas, volumen, etc.
Funciones de Estado o Propiedades del Sistema (Ve). Se llaman as a las que dependen
slo del estado concreto en que se encuentra el sistema.
1. Si consideramos un proceso en el que el sistema pasa del estado 1 al 2: Ve = Ve2 - Ve1
2. Podemos elegir cualquier camino o transformacin para calcular la variacin de la Ve entre
el estado 1 y 2.
3. En un proceso circular, en el que volvemos al mismo estado inicial del que partimos, la
variacin de cualquier funcin de estado es 0, as,
dVe = "Ve = 0 . En un proceso
infinitesimal podemos asumir que el sistema permanece en el mismo estado y por tanto dVe =0
por lo que la integracin de esta funcin Ve = constante. En un sistema aislado (no entra ni sale
materia ni energa, los valores de las variables de estado conservativas permanecen
constantes).
4. El problema surge de que, al menos dos formas de energa, tanto la variacin de calor (dq)
como la variacin de trabajo (dw) no son funciones de estado, sino que su valor depende del
camino seguido por la transformacin. Este problema llev al desarrollo conceptual de la
Termodinmica en el siglo XIX. Como veremos a continuacin, esta situacin nace del hecho
de que aunque tanto el calor como el trabajo son formas de energa, por tanto interconvertibles,
existe una diferencia bsica entre ambas, el calor representa la energa distribuida en forma de
energa cintica en las molculas del sistema, que slo puede extraerse de alguna forma
ponindolo en contacto con otro cuerpo a menor temperatura, limitando este fenmeno el valor
de la energa (trabajo) til que podemos extraer del sistema. Adems este fenmeno, junto a
otros semejantes donde el sistema evoluciona para igualar los valores de las variables
intensivas alcanzando el equilibrio es la base de la direccin de los procesos que ocurren en el
Universo.
5. Ciertas combinaciones matemticas de las funciones de estado son tambin funciones de
estado.
Energa.
Concepto bsico que surgi en Fsica en el siglo XIX. Un concepto fundamental es que la
energa existe en diversas formas que se pueden interconvertir. Veremos cmo un principio
bsico en cualquier transformacin es la conservacin de la energa. En cualquier
transformacin la energa total permanece constante.
La fuente primaria de energa en los seres vivos es el sol. Los seres vivos han desarrollado
mquinas moleculares que les permiten capturar, almacenar y usar la energa. Estudiaremos
en detalle uno de los mecanismos ms generales y verstiles de almacenamiento de energa
en los seres vivos; el almacenamiento de energa en forma de energa qumica en una
pequea molcula, el ATP. La energa qumica almacenada en el ATP se puede utilizar para
realizar una gran variedad de procesos que requieren energa. Dicho en otros trminos, la
energa qumica almacenada en el ATP se puede transformar en otros tipos de energa.
Formas de la Energa. Calor y trabajo.
Hemos mencionado que existen diversas formas de energa. De una manera ms precisa
deberamos decir que existen diversas formas de transferencia de energa. El calor y el trabajo
son dos formas diferentes en las que se puede transferir o transformar la energa. El calor y el
trabajo son formas de transferencia de energa a travs de la barrera de un sistema.
Calor. Forma de transferencia de energa que hace uso del movimiento molecular aleatorio o
desordenado. El calor o energa trmica es el cambio de energa de un sistema que se origina
cuando la temperatura del sistema difiere de la de sus alrededores. El calor fluye de una
regin de ms temperatura (ms movimiento molecular) a otra de ms baja temperatura
(menor movimiento molecular).
Trabajo. Forma de transferencia de energa que hace uso del movimiento molecular ordenado.
Se realiza trabajo cuando un objeto se mueve en una determinada direccin en contra de una
fuerza oponente.
Podemos distinguir diversos tipos de trabajo:
Trabajo general dw = - Fdl
Trabajo de expansin y contraccin dw = - PdV
Trabajo elctrico dw=dq
Trabajo qumico dw=dn
Estas expresiones incluyen el producto de una variable intensiva (conjugada) y una variable
extensiva, definidas de tal modo que su dimensin son la de la energa (Julio = Newton m).
Qu tipo de funcin son el calor y el trabajo, son funciones de estado?
Es decir, la variacin de calor a volumen constante es una funcin de estado que nos mide la
variacin de la energa interna del sistema.
El problema es que las variaciones que ocurren en nuestro cuerpo y en las condiciones
ordinarias en la naturaleza (en el laboratorio) ocurren a presin constante y no a volumen
constante, por eso se introdujo otra variable de estado que cuantifica la energa del sistema de
una forma diferente y que se denomin entalpa.
2.2.2. Entalpa (H).
Definicin. =E+PV
H es una combinacin de funciones de estado y por tanto tambin una funcin de estado. No
tiene un sentido fsico tan intuitivo como la Energa interna, pero da una informacin muy
importante deducida de la expresin
dH=dE+PdV+VdP
sustituyendo el valor de dE, y considerando la P constante
dH=dqp
es decir, la variacin de la entalpa en un sistema en el que se solamente se realiza trabajo de
expansin a presin constante es una magnitud medible experimentalmente ya que coincide
con el calor transferido en el proceso. Los calormetros permiten medir el calor transferido en un
proceso.
Los procesos de transferencia de calor a presin constante son especialmente interesantes en
nuestro contexto ya que las reacciones que tienen lugar en los seres vivos ocurren a presin
constante.
Entalpa estndar.
Los cambios en entalpa (y en otras funciones de estado) se tabulan generalmente para
procesos que ocurren en condiciones denominadas estndar. En tablas de datos
termodinmicos las condiciones estndar se definen como temperatura 25oC (298oK),
1atmsfera de presin y concentraciones 1molar. Las condiciones estndar se indican con un
cero como superndice derecho (Ho, variacin de entalpa en condiciones estndar).
Qu utilidad tiene introducir la funcin de estado H?
La entalpa est relacionada con una nueva funcin de estado (G), que introduciremos ms
adelante y que se trata de la funcin de estado ms til para abordar las cuestiones bsicas
relacionadas con la bioenergtica.
Qu tipo de informacin nos puede aportar determinar Qp?
Informacin sobre la desnaturalizacin de macromolculas. Estudios de plegamiento y
desplegamiento de protenas; relevante en el desarrollo de numerosas patologas
(Alzheimer, priones)
Informacin sobre la interaccin entre macromolculas. Determinacin de los parmetros
que definen la unin de ligandos a macromolculas.
Informacin sobre la energtica de transporte de iones.
Nos permite la Primera ley de la Termodinmica predecir si un proceso ocurrir o no?
Consideremos un ejemplo:
En el proceso de disolucin de NaNO3 en agua H>0
En el proceso de disolucin de NaOH en agua H<0
El proceso de difusin de Na+ a favor de un gradiente de concentracin H=0
Los tres procesos mencionados son procesos espontneos, aunque ocurren con variaciones
muy diferentes de H. El cambio de entalpa no nos da informacin acerca de si un proceso
ocurre o no. La primera ley de la termodinmica no nos da informacin sobre si un proceso
ocurrir o no; solamente nos dice que si el proceso ocurre se llevar a cabo de forma que la
energa total permanezca constante. Por lo tanto, para predecir si una reaccin o un proceso
ocurrir o no necesitamos considerar algo diferente del cambio en la energa total del sistema.
Ese algo es una nueva funcin de estado, S, denominada entropa. Introduciremos ms
adelante esta nueva funcin de estado, cuya expresin formal constituye el Segundo Principio
de la Termodinmica, que nos permitir predecir la espontaneidad de los procesos.
2.2.3. Calorimetra
Calor.
Es la forma de energa que cuando se introduce en un sistema conduce al aumento de la
temperatura del mismo y cuando se extrae conduce a su disminucin. Tradicionalmente se ha
empleado como unidad de calor, la calora o cantidad de calor que cuando aadida a 1 gr de
agua aumenta 1 grado Centgrado su temperatura (de 14.5 a 15.5). Tambin se usan las
Kilocaloras o tambin llamadas antiguamente caloras grandes. Es importante recordar que los
datos que aparecen en buena parte de los medios de comunicacin y de las publicaciones de
nutricin, hablan de caloras cuando se tendran que referir a Kilocaloras. Desde los trabajos
de Joule se sabe que 1 cal = 4,18 Julios, es decir, 1 Kcal = 4,18 Kjulios.
Calorimetra. Medida Experimental de la Variaciones de Energa Interna y de Entalpa de las
reacciones. El primero se hace en un calormetro cerrado o bomba calorimtrica en cuyo
interior se produce la reaccin o transformacin sin variacin de volumen. El calor desprendido
o absorbido lo es a V constante, por lo que mide la variacin de la Energa Interna. Los
calormetros abiertos mantienen la presin constante y por tanto miden el calor absorbido o
desprendido a presin constante, es decir la variacin de la entalpa.
Entalpa de Formacin de los compuestos qumicos. Es el calor desprendido (o absorbido)
cuando los compuestos qumicos se forman a partir de sus elementos en la forma ms estable
cuya entalpa de formacin en condiciones standard se asume que vale cero. En termoqumica
es importante indicar el estado fsico de los distintos compuestos que intervienen en la
reaccin. Introducimos un estado de referencia, el estado standard, en el que se tabulan la
mayora de los valores termodinmicos que utilizaremos en Bioenergtica. La aplicacin de
este estado de referencia es central en la obtencin de los valores concretos de las distintas
funciones de estado. El estado standard usualmente utilizado es el de la temperatura de 25 y 1
atmsfera de presin.
Principio de Hess, tambin conocido por la ley de la adicin de los calores. Es consecuencia
del hecho de que la entalpa sea una funcin de estado, que slo depende de las condiciones
del punto en que se encuentra y no de la historia o forma como lo ha alcanzado. Nos permite
calcular los cambios entlpicos que ocurren en procesos que no pueden medirse directamente,
siempre que conozcamos los cambios entlpicos asociados a otros estados y cuya
combinacin reproduzca el proceso cuya variacin entlpica queramos conocer.
Extensin a otras Funciones de Estado. Este mismo razonamiento se puede extender a
cualquiera de las otras de las propiedades del sistema que estamos introduciendo.
Entalpa de reaccin. Mide los cambios entlpicos asociados a las reacciones qumicas de
acuerdo con la ecuacin:
.
Reacciones endo y exotrmicas. Son aquellas asociadas con H > 0 (endo) y H< 0
(exotrmicas).
Calorimetra Animal. Los organismos vivos cumplen la ley de la conservacin de energa en
sus transformaciones, por lo que podemos escribir la siguiente ecuacin:
V. C. del O2
5,0 Kcal/lO2
4,7 Kcal/lO2
4,5 Kcal/lO2
4,2 Kcal/lO2
El valor calrico por gramo superior de las grasas y del alcohol es consecuencia de su
mayor grado de reduccin. De hecho, necesitan mayor cantidad de oxgeno para su
metabolismo y como consecuencia, el valor calrico por litro de oxgeno es prcticamente el
mismo para todos los tipos de principios inmediatos.
Calorimetra Indirecta.
Este tipo de datos permite realizar medidas del metabolismo, de la produccin calrica de un
organismo midiendo la produccin de CO2, el consumo de O2 y la excrecin de urea en la orina.
Con esos datos se puede calcular tambin los gramos metabolizados de cada uno de los
principios. El dato ms importante para establecer la normalidad del metabolismo, es el llamado
metabolismo basal, es la produccin calrica de una persona en condiciones basales, que son
despierto, despus de haber descansado y en ayunas 12 horas, en reposo fsico y mental,
temperatura agradable.
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Tema 13.
Segundo Principio de la Termodinmica. Entropa.
Objetivos:
Explicar el origen de la espontaneidad de los cambios fsicos y qumicos.
Definir una nueva propiedad, la entropa, que nos permitir analizar de forma
cuantitativa el grado de espontaneidad de los procesos.
Nuestra experiencia nos indica que hay procesos que ocurren espontneamente y
procesos que nunca ocurren de forma espontnea. La expansin de un gas para llenar un
cierto volumen, el enfriamiento de un cuerpo caliente para igualar la temperatura de sus
alrededores, reacciones qumicas que ocurren en una determinada direccin; son ejemplos de
procesos que ocurren espontneamente en una determinada direccin y que nunca ocurren
espontaneamente en la opuesta. Debe de existir algn principio bsico que determine la
direccin espontnea de los cambios en el universo. De una forma ms precisa deberamos
matizar que nos estamos refiriendo a identificar la direccin de los cambios en la que no se
requiere realizar trabajo para que el cambio se lleve a cabo, ya que podemos confinar un gas
en un volumen ms pequeo si realizamos trabajo, o podemos enfriar un objeto en un
refrigerador e incluso forzar ciertas reacciones a que tengan lugar en el sentido inverso. El
reconocimiento de dos tipos de procesos en el universo, espontneos y no espontneos se
contempla en la Segunda ley de la Termodinmica.
Qu determina la direccin de cambio espontneo?
Podemos predecir la direccin de cambio espontneo a partir de la Primera Ley de la
termodinmica?
Un gas ideal se expande espontneamente en el vaco manteniendo constante su energa
interna.
Si la energa de un sistema disminuye durante un proceso espontneo, la energa de los
alrededores debe de aumentar (si tenemos en cuenta la Primera Ley de la Termodinmica). El
aumento de energa interna de los alrededores es un proceso tan espontneo como la
disminucin de energa interna del sistema. Cuando ocurre un cambio la energa total de un
sistema aislado permanece constante, pero se distribuye en formas diferentes. Podra ser que
la direccin de cambio espontneo est relacionada con la distribucin de la energa?.
Veremos cmo esta es una idea clave. Los cambios espontneos estn siempre asociados con
una dispersin de la energa hacia formas ms desordenadas.
Segundo Principio de la Termodinmica.
La Segunda Ley de la Termodinmica se expresa en trminos de una funcin de estado
denominada entropa, S. La entropa es una medida del desorden molecular de un sistema, que
nos permite decidir si un estado es accesible desde otro mediante un cambio espontneo. La
Primera Ley identifica los cambios permitidos y la Segunda Ley indentifica entre esos cambios
permitidos los que ocurrirn de forma espontnea.
La Segunda ley de la Termodinmica se puede expresar de la siguiente forma:
La entropa de un sistema aislado aumenta en el curso de un cambio espontneo
La definicin termodinmica de la entropa est basada en la expresin Stotal>0, en la que Stotal
es la entropa total del sistema y sus alrededores.
La entropa es un ndice de la tendencia de un sistema hacia el cambio espontneo. Dicho en
otras palabras, la entropa nos indica en qu medida un sistema est cerca del estado de no
cambio o estado de equilibrio. La entropa es un rbitro de los cambios que ocurren en la
naturaleza. Ningn proceso que ocurra en la naturaleza ser posible a menos que conduzca a
un aumento de entropa total.
Entropa. Definicin Termodinmica.
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dS =
dqrev
T
"S = !
dqrev
T
Para calcular la diferencia de entropa entre dos estados cualesquiera de un sistema, se busca
un camino reversible entre ellos y se integra el calor suministrado en cada etapa del camino
dividido por la temperatura a la que se suministra el calor.
La entropa fue introducida en el siglo XVIII por Sadi Carnot, basndose en sus estudios sobre
mquinas trmicas. En una mquina trmica una cierta cantidad de calor se puede transformar
en trabajo mecnico. Carnot pretenda formular una ley que permitiera determinar la cantidad
de calor que se puede transformar en trabajo til. El trabajo til siempre es menor que el calor
suministrado. La segunda ley de la Termodinmica contempla la observacin de que no es
posible un proceso que consista en la absorcin de calor y su conversin completa en trabajo.
Carnot demostr que en un ciclo:
dqrev
=0
T
dqrev
es una funcin de estado, a la que se denomin entropa.
T
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Tema 14.
Energa Libre de Gibbs y Potencial Qumico.
Objetivos:
Introducir la funcin de estado Energa libre de Gibbs.
Criterio de espontaneidad utilizando la energa libre.
Aplicar los conceptos de la Termodinmica a las reacciones qumicas. Propiedades molares
parciales. Concepto de potencial qumico.
La entropa es el concepto bsico para discutir la direccin de los cambios naturales, pero para
usarla es necesario analizar los cambios en el sistema y en los alrededores. En este captulo
vamos a definir una nueva funcin de estado que nos permitir analizar la espontaneidad de los
procesos teniendo en cuenta solamente las propiedades del sistema.
dS "
dq
!0
T
(1)
dS "
dE
!0
T
(2)
dH
!0
T
TdS ! dH (a presin constante y no trabajo adicional)
dS "
(4)
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A = E ! TS
Y la otra es la energa de Gibbs, G:
G = H ! TS
Todos los smbolos en las dos definiciones se refieren al sistema.
De esta forma cuando un sistema cambia a temperatura constante
(5)
dA = dE ! TdS
(6)
dG = dH ! TdS
teniendo en cuenta las ecuaciones (3) y (4) obtenemos como criterios de cambio espontneo:
(7)
dA ! o
T ,V
dGT , p ! 0
(8)
dS alrededores = !
dH
, a presin constante.
T
Relacin entre de la energa libre de Gibbs y el trabajo mximo que se puede obtener de
un sistema.
La energa libre de Gibbs tiene un significado adicional a la informacin que acabamos de
describir en relacin al criterio de espontaneidad de los cambios que pueden tener lugar en un
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sistema. El cambio en la energa libre de Gibbs es igual al mximo trabajo que acompaa a un
proceso, o que se puede obtener de un proceso.
dG = dH ! TdS ! SdT
dH = dq + dw + d (PV )
dG = dq + dw + d (PV )! TdS ! SdT
sustituyendo el valor de
dG = dq + dw + d (PV )! TdS
Cuando el cambio es reversible
Como
dG = dWotro , rev
Al tratarse de un proceso reversible este trabajo se puede demostrar que es el trabajo mximo.
Esta interpretacin nos indica que el valor de la energa libre de Gibbs es la energa del
sistema disponible para realizar trabajo en condiciones isotrmicas. Este es un parmetro til
para el anlisis de los sistemas biolgicos, ya que los seres vivos deben de disponer de
energa til para realizar diversos tipos de trabajo en condiciones isotrmicas y a presin
constante. La energa libre de un sistema es una medida de su capacidad para realizar trabajo.
Hemos definido previamente como direccin de cambio espontneo dG<0. Si consideramos la
relacin entre energa libre y trabajo podramos formular el criterio de espontaneidad de la
siguiente forma:
la direccin de cambio que no requiere la realizacin de trabajo es la direccin de cambio
espontneo
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& 'V #
!
Vj = $
$ 'n !
% j " p ,T , n '
Donde en subndice n indica que las cantidades de todas las dems sustancias presentes en la
mezcla permanecen constantes. Vj se puede visualizar de una forma muy sencilla como la
pendiente de la grfica que resulta al representar el volumen de la mezcla a medida que vara
la cantidad del componente J en condiciones de presin y temperatura constantes.
Para una mezcla de dos componentes A y B, la variacin del volumen total de la mezcla al
aadir dnA de A y dnB de B ser:
& 'V #
& 'V
!!
dV = $$
dn A + $$
% 'n A " p ,T ,nB
% 'n B
#
!!
dn B = V A dn A + VB dn B
" p ,T ,n A
V = n AVA + nBVB
El concepto de cantidad molar parcial se puede extender a cualquier variable extensiva que sea
una funcin de estado.
La energa libre molar parcial o potencial qumico de un componente J (j) se define:
& 'G #
!
j = $
$ 'n !
% j " p ,T , n '
Es decir, el potencial qumico es la pendiente de la grfica en la que se representa la energa
libre de Gibbs frente a la cantidad del componente J, en condiciones de presin y temperatura
constantes y mantenindose las cantidades de las dems sustancias n constantes.
De forma anloga, la energa total de Gibbs de una mezcla de dos componentes A y B ser:
dG = Adn A + B dnB (10)
La variacin en la energa libre al modificar infinitesimalmente la cantidad del componente i (dni)
viene dada por la expresin
dG = ! i dni (a T y P constantes)
i
G = n A A + nB B (11)
Para una sustancia pura:
G = i ni , i =
G
ni
A p T constantes:
dG = ! i dni (12)
i
y en condiciones de equilibrio:
! dn
i
=0
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Tema 15.
Variacin de la Energa Libre de las reacciones.
Equilibrio qumico.
Objetivos:
Introducir el uso del potencial qumico para determinar la composicin de equilibrio de las
reacciones qumicas.
Relacin de la constante de equilibrio con la energa libre de Gibbs estndar.
Las reacciones qumicas evolucionan hacia condiciones de equilibrio dinmico en las que tanto
los reactivos como los productos estn presentes pero no tienen una tendencia a experimentar
cambios netos. En algunos casos la concentracin de los productos en la mezcla de equilibrio
es mucho mayor que la de reactivos, de forma que podemos considerar que la reaccin es
completa. Sin embargo, en muchos casos la mezcla de equilibrio tiene cantidades
significativas de reactivos y productos. En este tema vamos a utilizar la Termodinmica para
predecir la composicin en el equilibrio en funcin de las condiciones de reaccin.
Descripcin termodinmica del equilibrio.
Vamos a considerar el caso sencillo de una mezcla de gases ideales.
El comportamiento de los gases ideales se describe con la expresin:
PV = nRT (1)
Para una mezcla de varios gases:
n = ! ni ; sustituyendo en (1)
P=
n1 RT n2 RT
+
+L
V
V
De donde se deduce
P = ! Pi ; donde
Pi =
ni RT
(2); que es la presin Pi cuando solamente el gas i est presente.
V
Por lo tanto en una mezcla de gases ideales cada componente se comporta como una
sustancia pura que ocupa todo el volumen V y se encuentra a la temperatura T. Este
razonamiento nos permite calcular el potencial qumico de cada gas en la mezcla como si se
tratara de un gas aislado.
En el tema anterior vimos que para una sustancia pura a T constante
dGi = VdPi
(recordar que la expresin general deducida a partir de las definiciones de dE, dH y dG es
dG = VdP ! SdT )
Sustituyendo la ecuacin (2)
dGi =
ni RT
dPi (3)
Pi
Integrando la ecuacin (3) desde el estado inicial 0 al estado final con presin Pi y tomando el
estado 0 como el estado de referencia (1atmsfera)
Gi (T , Pi )" Gio (T ) = ni RT !
Pi
1atm
dPi
Pi
i =
Gi
y reagrupando trminos:
ni
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& P #
i (T , Pi )' io (T ) = RT ln$ i ! .
% 1atm "
i = io + RT ln Pi (4)
Esta ecuacin nos dice que cuanto mayor es la presin parcial de un gas mayor ser su
potencial qumico.
Es importante tener en cuenta:
1. Esta ecuacin es vlida para una T constante
aA + bB ! cC + dD
siendo a, b, c y d los coeficientes estequiomtricos de la reaccin, que llamaremos
! i . En este
caso concreto " A = ! a , " B = !b , ! C = c y ! D = d . Se puede demostrar que dni = " i d!
(5), donde ! es el grado de avance de la reaccin.
Sustituyendo (4) y (5) en la ecuacin dG = 0 = ! i dni , que introdujimos en el tema anterior
i
llegamos a la expresin:
! (
0
i
+ RT ln Pi # i d" = 0
!"
i
0
i
+ RT !" i ln Pi = 0
i
"G 0 = !# i i0
i
"G 0
= ! ln Pi$ i
RT
i
0
Pc Pd
!G
"
= ln Ca Db
RT
PA PB
#
PCc PDd
KP = a b
PA PB
de donde
"G 0 = ! RT ln K P (5)
La constante de equilibrio KP slo depende de T.
Se puede definir otra constante de equilibrio en funcin de concentraciones en vez de en
funcin de presiones parciales. Para ello usamos la definicin de concentracin ci = ni / V y la
sustituimos en la ecuacin de los gases ideales:
Pi = ci RT .
Sustituyendo en la expresin (4):
i0,C = i0 + RT ln( RT )
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"GC0 = ! RT ln K C
donde
cCc c Dd
KC = a b
c AcB
"GC0 = !# i i0,C
i
Ntese que
que tan solo depende de T; por tanto KC slo depende de T y no de las concentraciones. Esta
es la constante de equilibrio en funcin de las concentraciones de los gases de la mezcla. Esta
ecuacin es muy importante ya que nos permite determinar la constante de equilibrio de
cualquier reaccin a partir de los datos de energa libre estndar tabulados a una T dada y
poder predecir, por lo tanto la composicin de equilibrio de una mezcla de reaccin a esa
misma T. En la mayor parte de los casos, las energas libres estndar se han determinado a
o
temperatura ambiente, T=298 K, por lo que, salvo que se indique lo contrario, todos los valores
o
tabulados de las energas libres estndar corresponden a P=1atm y T=298 K. Pero no debe
olvidarse que los valores de la constante de equilibrio cambian al cambiar la T.
Cuando no nos encontramos en el equilibrio, debemos utilizar la ecuacin (12) del tema
anterior
!G = !G + RT ln QP
!G = !GC0 + RT ln QC
donde
PCc PDd
QP = a b
PA PB
cCc c Dd
QC = a b
c AcB
QP y QC no deben confundirse con las constantes de equilibrio KP y KC, ya que para las dos
primeras las concentraciones de las sustancias no corresponden a una situacin de equilibrio.
Para el caso de reacciones en disolucin, que es el caso que nos interesa, el potencial qumico
de cada sustancia viene dado por la ecuacin:
i = io + RT ln ai (6)
donde ai es la actividad de la sustancia i que se relaciona con su concentracin molar ci
mediante la ecuacin:
a i = ! i ci
donde
que en lugar de Pi aparece ai. Repitiendo el mismo desarrollo que para los gases ideales, se
llega a expresiones totalmente anlogas en trminos de actividades
!G = !Ga0 + RT ln Qa
aCc a Dd
Qa = a b
a AaB
"Ga0 = !# i i0
i
20
"Ga0 = ! RT ln K a
#Greaccin = ! ( p p ) " ! (r r )
"Greaccin = (c c + d d ) ! (a a + bb )
"Greaccin !0
Si
"Greaccin ! 0
Si
!Greaccin = 0
21
Molar y pH 7 Estos valores de referencia se utilizarn siempre que el pH sea 7 y evitar tener
que introducir el trmino de la concentracin de los protones en estas ecuaciones (por ejemplo,
el clculo de la Greaccin, de la constante de equilibrio, de la ecuacin de Nernst, etc.). Estos
valores bioqumicos se distinguen con un apstrofe: G, Keq, etc.
Si inclumos el trmino de la concentracin de los protones en la constante de referencia G,
encontraremos que :
[ ]
n
RTLn
C c Dd
Aa B b
C c Dd
Una breve reflexin nos har ver que si RTLn a b es lo suficientemente positivo, puede
A B
hacer no espontnea una reaccin aunque su G (o G en condiciones bioqumicas) sea
C c Dd
.)
Aa B b
C c Dd
Otra forma de indicar lo mismo es decir que cuando la relacin
> Kc (o que Kc en
Aa B b
negativo (si su valor numrico es inferior al del trmino
RTLn
C c Dd
Cuando la relacin
< Kc (o que Kc en condiciones bioqumicas), la reaccin directa es la
Aa B b
espontnea.
Evidentemente cuando
C c Dd
= Kc, estaremos en equilibrio.
Aa B b
22
Tema 16.
Variacin de energa libre de las reacciones Redox:
ecuacin de Nernst.
Objetivos:
Anlisis termodinmico de equilibrios electroqumicos. Relacin entre el potencial
elctrico y la concentracin. Ecuacin de Nernst.
Potencial redox de reacciones de importancia biolgica. Potenciales redox estndar
bioqumicos. Prediccin de las condiciones de equilibrio para reacciones de xidoreduccin.
23
o= - 0,763 Voltios
Zn++ + 2e-- Zn
o
Cu++ + 2e- - Cu
= 0,337 Voltios
Si operamos con ambas semirreacciones de forma que le par con el potencial ms negativo
done los electrones, tenemos que restar esta semi-reaccin de la ms positiva, en este caso,
restar la de arriba de la de abajo:
Cu++ + Zn -----> Cu + Zn++.
= 1,1Voltios
dni = " i d!
dG = dWelec = "nFEd! (2). Esta expresin nos dice que la fuerza que dirige una clula ()
es proporcional a la pendiente de la energa libre respecto del avance de la reaccin. Cuando
la reaccin est lejos del equilibrio (valor elevado de la pendiente) tendr una tendencia
elevada a dirigir electrones a travs de un circuito externo. Cuando la pendiente es prxima a
cero ( cuando la reaccin est prxima al equilibrio), la ser pequea.
Igualando las expresiones (1) y (2):
"#
i
= !nFE
24
Utilizando la expresin del potencial qumico para cada sustancia (aqu escogemos la
expresin en trminos de actividades)
! (
0
i
+ RT ln ai # i = "nFE
Dividiendo por nF
"Ga0 RT aCc a Dd
RT
E=!
!
ln a b = E a0 !
ln Qa
nF
nF a A a B
nF
E = Ea0 !
RT
ln Qa (ecuacin de Nernst)
nF
donde:
Ea0 = "
!Ga0
es la fem estndar, que se puede interpretar como la fem cuando todos los
nF
25
Tema 17
Estrategias Metablicas de los Seres vivos
Anlisis termodinmico de las vas metablicas y de su funcionamiento. Aplicacin a la
Reversin de las vas metablicas.
Los seres vivos han llevado a sus ltimas consecuencias la disponibilidad de mltiples
funciones disminuyendo su dependencia del medio ambiente. Por ello, el mapa metablico de
los seres vivos es tan complejo y an ms, el conjunto de componentes codificados en su
genoma. Esto ha sido el resultado de la evolucin. Por un lado, evidentemente se utilizan
reacciones qumicas que pueden llevarse a cabo espontneamente en las condiciones
relativamente suaves que reinan en el interior de las clulas. Por otro, su genoma codifica por
una serie amplia de enzimas que acelera an ms la consecucin de los productos metablicos
necesarios. Sin embargo, los enzimas no alteran las condiciones de espontaneidad,
simplemente aceleran en mayor o menor medida las reacciones espontneas como la reaccin
actualmente paradigmtica para obtener la energa, la combustin de la glucosa.
C6H12O6 + 6O2 6 CO2 + 6 H2O reaccin extraordinariamente espontnea ya que G
asociada a la misma es igual a 2800 KJ / mol. De hecho, si calculamos su Keq (de equilibrio),
es 101216, un nmero escalofriantemente grande, lo que en principio podra implicar la
irreversibilidad de esta reaccin.
La paradoja que esconde este dato es que tanto el oxgeno molecular como la glucosa que
encontramos en la Bioesfera son productos de la actividad de los seres vivos. Luego stos son
capaces de revertir incluso reacciones tan desplazadas como la de la oxidacin de la glucosa.
Ms an, deben ser capaces de almacenar de forma utilizable la energa libre desprendida en
dichas reacciones, al menos en una parte importante para su utilizacin posterior por el ser
vivo. La combustin de los compuestos del carbono es una reaccin que puede llegar a ser
muy violenta, como se demuestra en el caso de distintos productos explosivos. Desde los
experimentos de Lavoisier, a finales del siglo XVIII, sabemos que la produccin de calor en la
oxidacin metablica de un compuesto determinado, es la misma que en su combustin
directa, comprobndose as de nuevo el principio de conservacin de la energa.
Para poder revertir estas reacciones y utilizar de forma eficiente la energa, los seres vivos
utilizan una serie de estrategias y adaptaciones que permiten conseguir estos resultados como
vamos a ver a continuacin. La complejidad de las reacciones metablicas que encontramos en
los seres vivos es consecuencia de estas estrategias. Como ocurre casi siempre en los
procesos y adaptaciones que han evolucionado y se llevan a cabo en los seres vivos, estas
estrategias tienen casi siempre ms de una consecuencia y aplicacin.
1) Fragmentacin de las vas.
Al subdividir las reacciones qumicas que encontramos en el metabolismo celular, los
seres vivos consiguen varios objetivos.
Primero, asociar valores ms moderados de G a cada una de las reacciones. Por ejemplo, si
en la gliclisis anaerobia, la transformacin de glucosa+2ADP+2Pi --> 2 lactatos+2ATP, lleva
asociada una G de 127 kJ/mol, lo que significa una Keq = 1022, la reversibilidad se favorece
por la fragmentacin de esta transformacin en un conjunto de etapas. La reversibilidad se
asegura al subdividir el proceso en ms de 10 reacciones, con lo que la G global se
distribuye entre ellas, haciendo que las G de cada etapa sean inferiores y por tanto sus Keq
menores y ms facimente reversibles. De hecho la conversin de glucosa en lactato se revierte
de forma habitual, por ejemplo, en el hgado humano en el proceso conocido como
gluconeognesis.
Segundo, la menor energa libre asociada a cada una de las etapas mejora el control de la va,
permitiendo que parte de la energa se almacene de forma eficiente en forma de ATP.
26
27
NADH, dndole un papel crucial a las grasas en el metabolismo energtico de los organismos
vivos actuales.
5) Regulacin.
Todo lo indicado anteriormente sera inviable si la clula y los organismos vivos no
hubieran desarrollado potentes mecanismos de regulacin que les permiten de acuerdo con las
circunstancias que atraviesan regular la puesta en funcionamiento de una determinada va
metablica. La regulacin biolgica es la piedra angular que permite el fenmeno de la vida.
Como se estudia en detalle en Bioqumica, existen diferentes mecanismos de regulacin que la
clula utiliza de forma complementaria para conseguir mantener su actividad y viabilidad. A)
Mecanismos de regulacin de la cantidad de los enzimas (regulando bien la sntesis, a travs
de la activacin gnica, bien la degradacin de los mismos), propios de situaciones donde las
clulas experimentan un rpido recambio molecular. B) Mecanismos de regulacin de la
actividad enzimtica. Existen dos grandes tipos, la regulacin alostrica de carcter
esencialmente intracelular (basada en cambios en compuestos crticamente sealizadores,
reguladores del estado metablico celular) y la regulacin por modificacin covalente, en la que
debemos destacar el control del grado de fosforilacin de determinadas protenas (mediante la
activacin de determinadas protein kinasas y fosfatasas) que suministra un mecanismo de
sealizacin
intercelular, cuando la seal que active o inhiba estos mecanismos de
modificacin viene del exterior de la clula que se controla.
6) Optimizacin.
Finalmente, y en un aspecto que no conocemos todava suficientemente bien, hay que
sealar que los procesos metablicos (y en general el conjunto de procesos que se producen
en los seres vivos) son la consecuencia sutil de dos mecanismos antagnicos generales que
sin duda explican de forma convincente aunque an fragmentariamente las propiedades de los
organismos vivos tales como existen en la actualidad. La optimizacin de los procesos que se
ha producido como consecuencia de la seleccin natural que ha ido mejorando y conservando
los procesos que permiten el funcionamiento competitivo de los organismos vivos actuales
unido a la existencia de acontecimientos histricos posiblemente casuales que fueron decisivos
en que la vida siguiera un determinado curso. Ejemplos de esta optimizacin/decisiones
histricas, podemos encontrarlos en muchos fenmenos, a saber, en la identificacin de
distintos mecanismos de regulacin que juegan papeles semejantes en distintas clulas y/o
organismos, en la dificultad que estn encontrando los biotecnlogos en mejorar la
productividad de los organismos vivos tales como existen hoy en da, en el xito de la simbiosis
entre distintas clulas precursoras en la aparicin del diseo de la clula eucaritica y las
propiedades de las mitocondrias y cloroplastos, incluyendo el trasvase de informacin gentica
entre los orgnulos celulares y el ncleo. Otro ejemplo pertinentes de la importancia de este
fenmeno de optimizacin de eventos inicialmente desencadenados de forma contingente por
el azar histrico, lo presentan lo que todava aparecen como ejemplos aislados de excepciones
al modelo metablico universal (muchas veces propio de los organismos bien estudiados).
Destacan aqu las excepciones identificadas al mecanismo glicoltico universal, que organismos
parsitos habitantes del intestino de ciertos mamferos como el Ascaris han desarrollado, en los
que se producen una alteracin sustancial a la va glicoltica. Finalmente, anlisis aplicados a
diferentes vas metablicas como por ejemplo, el ciclo de las pentosas, han llevado a la
conclusin de que las transformaciones finalmente seleccionadas corresponden al nmero
mnimo compatible con los resultados deseados.
TEMA 18
Anlisis Biofsico del Papel del ATP en Bioenergtica
Inadecuacin Biofsica del Concepto de Enlace rico en energa. Representacin de la
Energa asociada a un enlace.
28
Los enlaces qumicos llevan asociados un mnimo de energa, si no, no seran estables.
Por lo tanto no existen enlaces ricos en energa. Lo que ocurre es que hay molculas que
cuando reaccionan pasan a un estado ms estable. Lo que en los Bioqumicos denominamos
enlaces ricos en energa, es una forma de hablar para describir la situacin de molculas que
son menos estables, llevan asociadas mnimos de energa menos importantes, ms elevados, y
cuando reaccionan se transforman en otras molculas cuyos enlaces llevan asociados mnimos
de energa ms importantes. Por tanto, la variacin de energa libre de una reaccin no est
relacionada slo con la rotura y formacin de un solo enlace, sino que refleja todas las
reorganizaciones que han tenido lugar durante la reaccin. Como es una variable de estado,
depende slo del estado inicial, los valores de las molculas reactivas, y del estado final, los
valores de las molculas producto.
Por tanto el nombre correcto de este concepto es el de potencial de transferencia de Grupo.
Existen distintos tipos de molculas en que este concepto es til, molculas fosforiladas
dotadas de diferente potencial de transferencia de grupo fosfato, molculas aciladas, con
mayor o menor potencial de transferencia de grupo acilo, molculas reducidas con mayor o
menor potencial reductor, molculas metiladas con mayor o menor tendencia a transferir el
grupo metilo. Cuando esto es posible, la determinacin del grado del potencial de transferencia
de grupo se hace comparando los valores de G asociados a una reaccin comn a todos
ellos, concretamente la reaccin de hidrlisis. As se establece una escala de potenciales de
transferencia. Utilizando dicha escala podemos establecer la direccionalidad de la transferencia
de grupo entre molculas.
Entre estas molculas destaca por su importancia metablica el ATP. Es una molcula dotada
de un considerable potencial de transferencia de grupo fosfato, responsable de la mayor parte
de las transferencias energticas en Biologa. De hecho, una parte central del anlisis del
metabolismo energtico es la identificacin y cuantificacin de los mecanismos de sntesis del
ATP. En el sentido que usamos esta expresin aqu, no nos estamos refiriendo a la sntesis
completa de la molcula, sino slo a su estado de fosforilacin. Las estructuras nucleosdicas
(la adenina y la ribosa) no se modifican en el metabolismo energtico, sino slo el grado de
fosforilacin que puede pasar de AMP a ADP y ATP. Por eso se le ha denominado la moneda
energtica de la clula, porque slo se intercambia en las reacciones biolgicas. En este
sentido energtico, no establecemos distinciones entre los distintos nucletidos trifosfatos ATP,
CTP, GTP y UTP, interconectados por enzimas que los mantienen en el mismo nivel de
fosforilacin, aunque la especificidad enzimtica los diversifica en vas metablicas diferentes,
otro ejemplo de compartimentacin qumica. De hecho, el concepto de moneda energtica es
una analoga algo desafortunada porque en el caso biolgico, el ATP (GTP, CTP, UTP) no son
simplemente un documento de cambio sino que tambin intervienen en la construccin de
elementos decisivos para la clula como es el RNA.
Sntesis de ATP en la Glicolisis y de GTP en el Ciclo de Krebs. Cuantificacin y
eficiencia.
La pregunta principal es cmo la clula puede obtener de forma eficiente las cantidades
enormes de molculas de ATP que se necesitan para su funcionamiento, cantidades que no se
acumulan sino que se van recargando conforme se van utilizando.
El concepto de acoplamiento explica uno de los mecanismos biofsicos cuya consecuencia es
la sntesis, la recarga, del ATP. Histricamente, este mecanismo fue el primeramente propuesto
y se denomina fosforilacin a nivel de sustrato. La produccin de intermediarios fosforilados
como el 1, 3 DPG (1,3 difosfoglicerato) o el PEP (fosfoenolpiruvato) con mayor potencial de
trasferencia de grupo fosfato que el ATP, hace espontneas las reacciones glicolticas
catalizadas por la fosfoglicerato kinasa y la piruvato kinasa, en donde a partir de estos
intermediarios se produce el ATP glicoltico.
De hecho si pensamos que en la reaccin glicoltica anaerobia que se produce en el proceso
conocido como fermentacin lctica en el msculo esqueltico de los mamferos, la reaccin
29
global de degradacin y rotura de la glucosa conocida como gliclisis que estudiaris en detalle
en Bioqumica, podemos representarla as
Glucosa -----> 2 lactatos es espontnea ya que lleva asociada una variacin en G = - 189
kJ/mol
Cuando se acopla a la formacin de 2 molculas de ATP queda en
C6 H1 2O6 + 2ADP + 2Pi " 2CH3 CHOHCOOH+ 2ATP con una G = - 127 kJ/mol,
todava espontnea.
La gliclisis anaerobia tiene pues un rendimiento relativamente bajo, Eficiencia = 62/189, de
casi el 33%. La enorme potencia cataltica de los enzimas glicolticos compensa con creces el
escaso rendimiento de 2 ATP/ glucosa, convirtiendo a este proceso en el mecanismo ms
rpido y ms independiente de las condiciones externas de produccin del ATP que tiene la
clula. Las fibras musculares rpidas tpicas del msculo blanco, responsables de los esfuerzos
asociados al sprint son una maquinaria glicoltica casi exclusiva. En este caso, el lactato se
libera y se transfiere al hgado donde se vuelve a formar la glucosa en el proceso
gluconeognico.
Otro ejemplo de fosforilacin a nivel de sustrato basado en un acoplamiento algo diferente lo
encontramos en el ciclo de Krebs, la fase inicial de la degradacin ulterior de la glucosa, a
partir del piruvato en la mitocondria:
Succinil-CoA ----> Succinato + CoA con una G = - 34 kJ/mol
Es acoplada por la succinil tiokinasa mitocondrial en
Succinil-CoA + GDP + Pi ------> Succinato + CoA + GTP con una G = - 3 kJ/mol donde el
potencial asociado a la hidrlisis del SuccinilCoA se emplea en sintetizar una molcula de ATP
Se acaba aqu la produccin de ATP a partir de la glucosa? No, en presencia de oxgeno, el
metabolismo contina en la mitocondria, a partir del piruvato que se forma antes del lactato (la
fermentacin lctica es un mecanismo de regenerar el NAD necesario para que la gliclisis no
se detenga):
En la mitocondria y a travs del ciclo de Krebs, se incia el proceso conocido como fosforilacin
oxidativa:
30
Tema 19
EL MECANISMO QUIMIOSMTICO
Durante mucho tiempo los investigadores buscaron la explicacin de la enorme
produccin de ATP en las mitocondrias sin mucho xito. Era posible aislar mitocondrias y
purificarlas, conservando in vitro su capacidad de producir ATP siempre que se les
suministraran los sustratos apropiados (02, ADP, Pi y un intermediario como el piruvato,
succinato, etc). Estas mitocondrias purificadas producan ATP con el rendimiento esperado.
Durante mucho tiempo los bioqumicos pensaron que este ATP se generara por un
mecanismo semejante al de la fosforilacin a nivel de sustrato. Buscaron pues, identificar un
intermediario X-P que tuviera un potencial de transferencia de grupo fosfato lo suficientemente
elevado para justificar la produccin de ATP mitocondrial. Para ello, aplicaban la frmula
tradicional de la metodologa bioqumica, romper las estructuras para encontrar e identificar el
intermediario. A pesar de todos los intentos, una vez rota la mitocondria se perda
inmediatamente la capacidad de sntesis de ATP y el intermediario X-P segua indetectable. En
esos extractos, aparecan una serie de actividades enzimticas, unas solubles (la mayora de
los enzimas del ciclo de Krebs), otros ligados a membranas. Entre estos destacaba una potente
actividad ATPasa, finalmente identificada con unas protuberancias que aparecen en la parte
interior de la membrana interna mitocondrial, primeramente descritas al microscopio electrnico
por Fernndez-Morn, un investigador venezolano. De hecho, muchos pensamos que a
mediados del siglo XX, no exista ningn problema en la Bioqumica que suscitara ms
perplejiddad que la naturaleza del acoplamiento energtico mitocondrial.
31
La situacin permaneci as sin avanzar durante aos hasta que un investigador algo
atpico ingls, Peter Mitchell propuso una hiptesis que cambiando radicalmente el punto de
vista, pero utilizando elementos conocidos poda resolver el misterio. Era un investigador algo
atpico porque no trabajaba en un Instituto de investigacin sino en un laboratorio privado que
haba mismo diseado y construido en una mansin en ruinas en la campia de Cornualles.
Como Charles Darwin haba abandonado una carrera ms convencional en Ciencia por razn
de su mala salud. Ayudado por su colaboradora Jennifer Moyle, P. Mitchell, ms dado a los
desarrollos tericos, y utilizando como equipo instrumental un simple pHmetro, encontr
pruebas experimentales a favor de sus ideas. Cuando una preparacin purificada de
mitocondrias se les proporcionaban los sustratos de la fosforilacin oxidativa (oxgeno, ADP, Pi
y un intermediario metablico apropiado), las mitocondrias comenzaban a sintetizar ATP, pero
tambin se detectaba una cada de pH, una acidificacin del tampn que las baaba.
Posteriormente, se pudo ver que adems se generaba una diferencia de potencial elctrico
entre el interior y el exterior de la mitocondria.
Peter Mitchell desarroll un nuevo concepto, el mecanismo quimiosmtico. Explic la
incapacidad de identificar el intermediario X-P, por su inexistencia. En su lugar, la energa se
almacenaba en forma de potencial electroqumico separado por la membrana interna
mitocondrial. La energa libre asociada a este potencial era la que se acoplaba a la sntesis del
ATP. De ah la importancia de la membrana, ya que una vez rota, el potencial se disipaba
dejando de sintetizar ATP.
Durante muchos aos, la comunidad cientfica se resisti a aceptar las ideas de
Mitchell, pero la evidencia experimental sigui acumulndose y en el ao 1976, cuando se le
concedi el premio Nobel a Peter Mitchell, era ya aceptada casi universalmente.
Vamos a cuantificar este gradiente electroqumico. La cadena de transporte electrnico
mitocondrial est formada de una serie de complejos, algunos de los cuales son bombas de
protones que expulsan dichas cargas positivas al exterior, al espacio intermembranoso,
generando un potencial electrico = ie = 0,1 a 0,15 voltios, el interior es ms negativo
que el exterior, y con una diferencia de pH, pH = pHi - pHe, de 1 a 1,5 unidades de pH, el pH
interior (entre 8 y 8,5) es ms alto que el exterior (alrededor de 7).
El potencial electroqumico est compuesto de dos trminos, el potencial qumico y el
potencial elctrico. El potencial qumico es consecuencia del gradiente de protones entre el
exterior y el interior, lo podemos expresar como
" = i # e = RT ln([Hi+ ]/[H e+]) = 2,3RT log([H i+ ]/[He+ ]) = #2,3RT (pH i # pHe ) ,
ya que 0 , el potencial qumico de referencia es el mismo en cualquier sitio de la clula, pues
slo depende de las condiciones de referencia. Por otra parte, la energa libre asociada al
trabajo elctrico, como ya hemos visto, es igual a dq, donde q son las cargas, igual a Fdn (F
la constante de Faraday y n el nmero de moles de cargas que contribuyen al gradiente, en
este caso, los protones. Por tanto, la diferencia de potencial elctrico desde el exterior al interior
de la mitocondria, o de cualquier compartimento, es ziF(ie). Como estamos hablando de
protones, zi = +1.
Por tanto el potencial electroqumico entre el exterior al interior de la mitocondria es,
32
!$ = "
!G
Mitchell postul que la ATPasa mitocondrial era tambin una bomba de protones, que
puede acoplar la energa libre asociada al potencial electroqumico que se ha creado a travs
de la membrana interna mitocondrial (entre el espacio intermembranoso y la matriz
mitocondrial) como consecuencia de la salida de protones asociada al funcionamiento de la
cadena de transporte electrnico en este orgnulo celular. Investigaciones posteriores de
numerosos investigadores han verificado la realidad de este concepto. El complejo proteico de
este verdadero motor celular ha sido analizado hasta un nivel de detalle impensable hace unas
pocas dcadas. Como todo buen catalizador enzimtico es reversible, y se puede demostrar
que puede sacar protones al exterior de la mitocondria, rompiendo entonces el ATP (actividad
ATPsica) o actuar como ATP sintasa producciendo ATP cuando aprovecha el gradiente
electroqumico de los protones, que entran entonces hacia el interior de la matriz celular (Fig
14). Hemos dicho que es un motor celular, porque se ha podido ver que en este proceso, la
ATP sintasa gira produciendo movimiento. El complejo, que denominaremos complejo V por
razones que sern evidentes en el tema siguiente, est compuesto de dos partes, la porcin
Fo, que atraviesa la membrana interna y a travs de la que se establece el canal de protones, y
la porcin F1 que se encuentra baada por la matriz y donde reside el centro activo
responsable de la sntesis (degradacin) del ATP, dependiendo si funciona como cintaza (o
como ATPasa) que corresponde a las protuberancias identificadas por Fernndez-Morn. Cada
una de las porciones estn formadas por varias subunidades ( a, b y c la porcin Fo y , y la
porcin F1), muchas de ellas repetidas. De hecho, la parte principal de la porcin F1 es un
trmero compuesto por dmeros y , que forma pues tres sitios catalticos que van pasando
sucesivamente por los diferentes pasos de la catlisis, girando acopladamente con el resto del
complejo. La Fo gira en direccin opuesta a la porcin F1.
Como hemos visto el valor del potencial electroqumico asociado al gradiente
mitocondrial no alcanza el valor de la energa libre de hidrlisis del ATP, que como hemos visto
vale unos 31 kJ/ mol. Por tanto, habrn de entrar ms de una mol de protones para revertir la
reaccin de hidrlisis del ATP. Cul es ese valor?. Tenemos que recordar que realmente lo
que hay que revertir es esta reaccin en condiciones celulares, es decir, a las concentraciones
intramitocondriales de los metabolitos. Podemos proponer que sern semejantes a las medidas
experimentalmente en los eritrocitos humanos, 2,25, 0,25 y 1,65 mM respectivamente para el
ATP, ADP y Pi.
Por tanto si recordamos que Greaccin =Greaccin + RT ln ((Cc Dd )/ (Aa Bb))
G(ATP sintasa) = 31 + RT ln ([ATP]/[ADP][Pi]
= 31 + 0,0083 (298) ln ((0,00225)/(0,00025)(0,00165) = 52 kJ/mol
por tanto, vemos que para revertir sta reaccin necesitamos la energa libre asociada a la
entrada de al menos unos 4 moles de protones por mol de ATP sintetizado o viceversa cuando
el complejo funcione como ATPasa y bomba de protones.
El acoplamiento entre estos dos factores es ms bien un tema que se debe abordar
desde el punto de vista de la termodinmica de procesos irreversibles, propia de los sistemas
abiertos que son los seres vivos, pero que no hemos desarrollado en estas lecciones.
Tema 20
33
Fosforilacin
oxidativa,
cadena
de
transporte
electrnico, respiracin mitocondrial y sntesis de ATP.
Topologa mitocondrial
Como ya hemos indicado, la mitocondria es la principal central energtica de la clula,
no siempre en intensidad, pero s en capacidad total a largo plazo, ya que es la fuente ms
importante de ATP en los organismos aerobios. La mitocondria est rodeada por dos tipos de
membranas, la externa y la interna, separadas por un espacio intermembranoso. Realmente, la
membrana interna es un resto actual de la membrana del organismo procaritico primitivo que
al entrar en simbiosis con los precursores de las clulas eucariticas, acabaron
transformndose en la mitocondria tal como la conocemos hoy en da. Su composicin
fosfolipdica es pues ms cercana a la de una bacteria que a la del resto de membranas de la
clula eucaritica y es impermeable a casi todos los compuestos. La membrana externa es de
composicin fosfolipdica semejante al resto de membranas eucariticas y est provista de
abundantes poros que permiten la libre circulacin de los metabolitos pequeos usuales de la
clula. La membrana interna, lugar donde se encuentra la maquinaria principal de la
mitocondria, requiere de una dimensin mayor que la acomoda el volumen de la mitocondria y
por eso obliga a plegarse a la membrana en una serie de recovecos denominados crestas
mitocondriales. En su parte interior sobresalen las partculas F1 de la ATP sintasa mitocondrial.
Finalmente, en el interior de la mitocondria se encuentra la matriz mitocondrial, mezcla soluble
donde se encuentran extraordinariamente concentrados la mayora de los enzimas del ciclo de
Krebs y dems componentes solubles de la mitocondria. La mitocondria de las clulas
animales alberga un pequeo genoma mitocondrial que codifica por un nmero pequeo pero
crucial de componentes mitocondriales que iremos sealando a continuacin.
La fosforilacin oxidativa, proceso que tiene lugar en la membrana interna de la
mitocondria, consiste en la transferencia de electrones desde el NADH o el FADH2 hasta el O2
por un proceso de xido-reduccin. Como consecuencia, la energa que se libera en el proceso
de emplea para generar un gradiente de protones que impulsar la sntesis de ATP.
Principales Complejos del transporte electrnico mitocondrial. Reacciones catalizadas.
Composicin qumica y papel como bombas de protones. Localizacin y papel de la ubiquinona
y del citocromo c.
1)
Complejo I: NADH-Q oxidorreductasa. Complejo en forma de L compuesto por
un nmero muy grande de subunidades, con un peso molecular de ms de 900 KDa, varios de
las cuales se encuentran codificadas por el genoma mitocondrial. Contiene una protena con un
grupo FMN (flavin mononucletido) y al menos cinco centros ferrosulfurados, todos
involucrados en la transferencia de electrones del NADH a la Ubiquinona (Q).
La Ubiquinona es una de las molculas transportadoras de electrones ms abundantes.
Es un coenzima de oxidorreduccin tambin llamado coenzima Q que, en contraste a otros
como el NADH, es liposoluble, por lo que se encuentra en el interior de la membrana
mitocondrial y puede viajar a travs de ella, interaccionando como sustrato de otros complejos.
El complejo I cataliza la siguiente reaccin:
NADH + 5H
matriz
+ Q NAD + QH2 + 4H
citosol
34
2)
Complejo II: Succinato-Q reductasa. Est compuesto de cinco subunidades,
ninguna de las cuales est codificada por el genoma mitocondrial. Contiene la succinato
deshidrogenasa, el coenzima FAD y grupos ferrosulfurados, que transfieren los electrones del
succinato primero al FADH2 y finalmente de ste a la ubiquinona (Q).
Las reacciones que cataliza este complejo son las siguientes:
Succinato + FAD Fumarato + FADH2
FADH2 + Q FAD + QH2
Y la reaccin global es:
Succinato + Q + 2 H
matriz
Fumarato + QH2
3+
)+2H
matriz
Q + 2 citocromo c (Fe
2+
)+4H
citosol
35
2+
) + 1/2 O2 + 4 H
matriz
2 citocromo c (Fe
3+
) + H2O + 2 H
citosol