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Louis Pastur.
clsicos de mutacin;:
rpida...
La seleccin y uso de microorganismos en microbiologa industrial y biotecnologa son desafos que requierenun
conocimiento profundo del crecimiento y manipulacin
microbianos, as como de las interacciones con otros organismos. La utilizacin de microorganismos en microbiologa industrial y biotecnologa sigue una secuencia lgica.En
primer lugar, es necesario identificar o crear unos microoH
ganismos que realicen el proceso deseado de la formams
eficiente. A continuacin, estos microorganismos se utilizan
en un ambiente adecuado, como un gran incubador (fermen~,
tador), o en un sistema complejo, como en el suelo o las
aguas, para lograr los objetivos especficos.
42.1
Eleccin de microorganismos
para la microbiologa industrial
y biotecnologa
organIsmo.
in vitro.
Adaptado de: D. A. Cowan. 2000. Microbial genomes-the
Tibtech 18:14-16. Tabla 1, p. 15.
untapped resource.
1084
Captulo 42
Estas mutaciones dirigidas por el entorno tienen la capacidad potencial de producir microorganismos con nuevas
propiedades degradativas o biosintticas.
Aunque est generando mucha controversia, las respuestas de microorganismos al estrs proporciona un nuevo
potencial en la generacin de microorganismos con nuevas
capacidades para su empleo en la microbiologa industrial y
la biotecnologa.
Conservacin de microorganismos
Una vez que se selecciona o crea el microorganismo deseado
para ser utilizado con un propsito especfico, el inters se
centra en la conservacin del mismo para su posterior
empleo. La transferencia peridica de cultivos a medios frescos se ha empleado en el pasado, aunque este mtodo puede
derivar en mutaciones y cambios fenotpicos en los microorganismos. Para evitar estos problemas, pueden utilizarse
diversas tcnicas de conservacin de cultivos para mantener
las caractersticas deseadas del cultivo (Tabla 42.6). Con frecuencia se utilizan la liofilizacin o deshidratacin por congelacin, y el almacenamiento en nitrgeno lquido de los
microorganismos. Aunque estas dos tcnicas son complicadas y requieren un equipo costoso, permiten almacenar los
cultivos microbianos durante aos sin que pierdan viabilidad
ni acumulen mutaciones.
Tabla 42.6
Crechniento de microorganismos
en ambientes controlados
En numerosos procesos industriales, los microorganisD;lQs
deben multiplicarse utilizando medios especficamentedis~
ados y en condiciones cuidadosamente controladas,in~u::!
yendo la temperatura, aireacin y adicin de nutri&J1t~
durante el curso de la fermentacin. El crecimientod~
Mtodo
Comentarios
Transferencia peridica
Las variables de transferencia peridica a los nuevos medios son: la frecuencia de transferencia,
eJ
medio utilizado y la temperatura de conservacin; esto puede conducir a aumentarlastasasde
mutacin y la produccin de variantes
El cultivo madre crece sobre un slant cubierto con aceite mineral esterilizado; el slantpuede
almacenarse a la temperatura del refrigerador
No es fiable; puede producir daos en las estructuras microbianas; sin embargo, en algunos
microorganismos puede constituir un medio til para mantener el cultivo
Deshidratacin
Los cultivos se secan en suelo estril, en discos de papel de filtro estriles o en gotasde gelatina;
stos pueden almacenarse en un desecador a temperatura de refrigeracin o congelarsepara
mejorar la viabilidad
Ultracongelacin
42.2
Tabla 42.7
Fermentacin: un trmino
con muchos significados
Tabla 42.8
Los niveles y el equilibrio de los minerales (especialmente hierro) y los factores de crecimiento pueden ser cruciales en la formulacin del medio. Por ejemplo, la biotina y
la tiamina controlan la acumulacin del producto en muchas
fermentaciones al influir en las reacciones biosintticas. El
medio tambin puede disearse de forma que el carbono, el
nitrgeno, el fsforo, el hierro o un factor de crecimiento
especfico se haga limitante tras un tiempo de fermentacin
dado. En tales casos, esta limitacin suele ocasionar un desplazamiento del crecimiento a la produccin de los metabolitos deseados.
Crecimiento de microorganismos
en un sistema industrial
Una vez que se desarrolla un medio, se debe definir el
ambiente fsico para el funcionamiento microbiano en el sistema de cultivo masivo. Esto suele conllevar un control preciso de la agitacin, refrigeracin, cambios de pH y oxigenacin. Pueden utilizarse bferes fosfato para controlar el
pH al mismo tiempo que actan como fuente de fsforo. Las
limitaciones de oxgeno pueden ser especialmente decisivas
en los procesos de crecimiento aerbicos. La concentracin
de O2y la tasa de flujo deben ser suficientemente altas como
para disponer de O2 en exceso en el interior de las clulas
con objeto de que esto no constituya un factor limitante.
Esto es especialmente cierto en el crecimiento de un cultivo
microbiano denso. Cuando se cultivan hongos filamentosos
Fuentede
Materia prima
Fuente de
Materia prima
Carbono y energa
Melazas
Suero
Semillas
Desechos de agricultura (mazorcas de maz)
Vitaminas
Bferes
Agentes antiespumantes
Nitrgeno
1085
un proceso y control del producto meticulosos. Las condiciones ambientales pueden ser cambiadas o mantenerse
constantes en el tiempo, dependiendo de los objetivos particulares del proceso.
A menudo, se aade de forma continua -alimenta.
cin continuaun componente esencial del medio, que
suele ser la fuente de carbono, de forma que el microorganismo no disponga en ningn momento de un exceso d~
sustrato. Un exceso de sustrato puede originar una acumulacin indeseable de productos metablicos de desecho.
Este fenmeno es particularmente importante con glucosay
otros carbohidratos. Si existe un exceso de glucosa en el
inicio de la fermentacin, podr ser catabolizada para pro.
ducir etanol, que se pierde como producto voltil reduciendo el rendimiento final. Esto puede ocurrir incluso en condiciones aerbicas.
Adems del tradicional fermentador de agitacin aer-
42.3
Principales productos
de la microbiologa industrial
o
o
00
o
1"1"
o.
o
.\..
Entrada de aire
Entrada
de flujo
Material
de soporte
fijado
Salida de flujo
L-
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,
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Partculas
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~~ ~~ ."..~~..~~..:
"
' Flujodesalida
de soporte
suspendidas
:. '~f)
Flujode---.
entrada
(e) Unidad de cultivo en dilisis
Los productos de desecho se
separan del cultivo por
difusin. Elsustrato puede
difundiral cultivoa travs de
la membrana
Medio
o bfer
Entrada---.
~'
del medio
(1)Unidad de cultivo
Mediofresco entra en la
unidad, y salen el exceso de
medio y algunas clulas ya
utilizadas
'.' ,.
.:>
.'
l<J.
o indirectamente, en ocasiones desapercibidamente, e incluso nuestra esperanza de vida. Entre estos productos se
encuentran productos industriales y agrcolas, aditivos de
alimentos, productos mdicos para la salud animal y humana, y biofueles (Tabla 42.9). Particularmente, en los ltimos
aos, compuestos no-antibiticos empleados en medicina
han hecho grandes contribuciones para mejorar el bienestar
de los animales y el hombre. En esta seccin se tratarn nicamente algunos de los compuestos ms importantes de
cada categora.
Antibiticos
Muchos antibitico s son producidos por microorganismos,
principalmente actinomicetos del gnero Streptomyces, y
hongos filamentosos (vase la Tabla 35.2). En este captulo se discutir la sntesis de algunos antibiticos importantes para ilustrar el papel fundamental de la formulacin del
medio y el control ambiental en la produccin de estos
importantes compuestos. Antibiticosen medicina(Captulo 35).
456
Conceptos
1. Para poder comprender la gran diversidad de organismos existentes es
preciso agrupar los organismos similares y organizar estos grupos en una
estructura jerrquica sin superposiciones. La taxonoma es la ciencia de la
clasificacin biolgica.
2. Los grupos de los procariotas (Arquea y Bacteria) parecen haber sido los
primeros en desarrollarse, seguidos de los eucariotas. Esto dio lugar a tres
dominios: Bacteria, Archaea y Eucarya. Estos dominios se diferencian entre
s en sus secuencias de rRNA y en muchos otros aspectos.
3. El grupo taxonmico bsico es la especie, que se define en trminos de
reproduccin sexual o bien de semejanza general.
prctico de la taxonoma,
19.2
457
458
-.:
r"
(\;-
t.4
Bacteria
Archaea
Eucarya
Animales
Bacterias verdes
no del azufre
Espiroquetas
Bacterias
Gram
positivas
Entamoeba
Mohos
~
Halobacterias
mucosos
,\,
,,"
~~
Thermotoga
Aquifex
~~
'
Flagelados
Tricomonas
Microsporidia
Figura 19.3 rbol filogentico universal. Las relaciones se determinaron a partir de comparaciones'de las secuencias del rRNA. Fuente:
Adaptado de G. J. Olsen y C. R. Woese. Ribosomal RNA: A key to phylogeny en The FASEBJournal, 7:113-123,1993.
20.1
Introduccin a Archaea
491
Metabolismo
Taxonoma de Archaea
Teniendo
en cuenta la diversidad de sus estilos de vida, no
msultasorprendenteel hecho de que
Archaeavarenotablemente entre los
el metabolismo de las
miembros de los diferentesgrupos.Algunas arqueas son organotrofas; otras son
autotrofas.
Unas pocas llevan a cabo una forma poco comn
defotosntesis.
Elmetabolismo de los hidrato s de carbono en las arqueasseconocecon una mayor exactitud. La enzima fosfofructoquinasano se ha encontrado en las arqueobacterias, y
stasno parecen degradar la glucosa mediante la ruta de
Untner-Doudoroff.Los halfilos extremos y los termfilos
catalizanla glucosa utilizando una forma modificada de la
rutadeEntner-Doudoroff(vase la p. 179 Y el Apndice IJ)
Como se muestra en las Figuras 19.3 y 19.13 Y en la Tabla 19.8 (vase la p. 472), las arqueas constituyen un grupo
muy bien diferenciado de otros tipos de organismos vivos.
Dentro de su grupo, sin embargo, existe una gran diversidad
(vanse las Figuras 19.13 y 19.14). La primera edicin del
Manual Bergey divide las arqueas en cinco grupos principales en base a las diferencias fisiolgicas y morfolgicas. La
Tabla 20.1 resume algunas de las principales caractersticas
de estos cinco grupos y cita representantes de cada uno de
ellos.
Sobre la base de los datos del rRNA, la segunda edicin del Manual Bergey dividir las arqueas en los phyla
Euryarchaeota [del griego eurus, amplio; y archaios, antiguo o primitivo] y Crenarchaeota [del griego crene, fuente
o manantial; y archaios]. Los euriarqueotas reciben este
nombre por el amplio nmero de nichos ecolgicos que
ocupan y presentan diversos patrones metablicos. El phylum Euryarchaeota es muy diverso con cinco clases (Methanobacteria, Methanococci, Halobacteria, Thermoplasmata, Thermococci, Archaeglobi y Methanopyri), nueve
6.4
rabia. 6.3
pH
Acidfilo
Neutrfilo
A1calfilo
Temperatura
Psicrfilo
Psicrotrofo
Mesfilo
Termfilo
Hipertermfilo
Concentracin de oxgeno
Aerobioobligado
Anaerobio facultativo
Anaerobio aerotolerante
Anaerobioobligado
Microaerfilo
129
Factory trminodescriptor
Presin
Barfilo
Definicin
Microorganismos representativos
Streptococcus pyogenes
Clostridium, Bacteroides, Methanobacterium, Trepomonas agilis
Campylobacter, Spirillum volutans, Treponemapallidum
11
:
./
122
Captulo 6
Crecimiento microbiano
90
80
1.500
70
-I
60
50
1.000
UJ
.!
U)
.!!! 40
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O
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E
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Z
0.500
20
s::
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...
O')
.2
= Poblacin en un tiempo t
Nt
20
60
40
80
100
0.000
120
Minutos de incubacin
Figura 6.3 Crecimiento microbiano exponencial. En esta figura se
han representado grficamente los datos de la Tabla 6.1 para seis
generaciones, en forma lineal (-) y logartmica (0-0). La curva de
crecimiento es exponencial, como muestra la linealidad de la grfica
logartmica.
= log No + n . log 2 y
n= log Nt -log No
log 2
log Nt -log No
0.301
velocidad de crecimiento (k). Equivale al nmero de generaciones por unidad de tiempo, expresado a menudo como
generaciones por hora.
Tabla 6.1
-I
exponencial
cin (g)-.
Tiempoa
de divisiones
Zn
Poblacin
(No x Zn)
O
20
40
60
80
100
120
O
1
2
3
4
5
6
2 = 1
i= 2
22 = 4
23 = 8
24 = 16
25 = 32
26 = 64
1
2
4
8
16
32
64
10gNt-logNo
0.301t
A partir de las frmulas anteriores se puede calcular el tiempo que tarda una poblacin en duplicar su nmero -esto es,
el tiempo medio de generacin o tiempo medio de duplica-
Ejemplo de crecimiento
Nmero
k=-=n
t
0.000
0.301
0.602
0.903
1.204
1.505
1.806
k=~
6.1
Tabla 6.2
= log 10
- log 103 9 - 3
(0.301)(10 h) = 3.01 h
3.00
Fase
exponencial
(lag)
2.00
1.00
- - - - -...- ....- - - -
X
tn
1
1
I
:a>
I
1
T""
.!!!
CI)
'C
o
'CI)
------.-------
0.50
Bacterias
Beneckea natriegens
Escherichia coli
Bacillus subtilis
Staphylococcus aureus
Pseudomonas aeruginosa
Clostridium botulinum
Rhodospirillum rubrum
Anabaena cylindrica
Mycobacterium tuberculosis
Treponema pallidum
37
40
40
37
37
37
25
25
37
37
0.16
0.35
0.43
0.47
0.58
0.58
4.6-5.3
10.6
:::::: 12
33
Algas
Scenedesmus quadricauda
Chlorella pyrenoidosa
Asterionella formosa
Euglena gracilis
Ceratium tripos
25
25
20
25
20
5.9
7.75
9.6
10.9
82.8
Protozoos
Tetrahymena geleii
Leishmania donovani
Paramecium caudatum
Acanthamoeba castellanii
Giardia lamblia
24
26
26
30
37
2.2-4.2
10-12
10.4
11-12
18
Hongos
Saccharomyces cerevisiae
Monilinia fructicola
30
25
2
30
,E
1
I
1
1
I
Tiempo (horas)
1
2.0 gen/h
= 0.5 h/gen
O30 min/generacin
1
1
0.10
g=
1
1
.1
1
I
1
1
1
-----.
Tiempo de
generacin (horas)
Fase de
latencia
(lag)
Temperatura
(OC)
Microorganismo
o.;;:;.
r--
123
g=T
El tiempo medio de generacin (g) puede determinarse
directamente a partir de una grfica semilogartmica con los
datos de la multiplicacin (Figura 6.4), y la constante de
velocidad de crecimiento se calcular a partir del valor g. El
tiempo de generacin puede tambin calcularse directamente a partir de las ecuaciones anteriores. Por ejemplo, supongamos que una poblacin bacteriana aumenta de 103a 109
clulas en 10 horas.
Curva de crecimiento