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Biologa Celular, clase 8

DNA
El DNA contiene la informacin gentica que codifica el RNA y por lo tanto la informacin
necesaria para crear las protenas necesarias para la vida celular. El DNA es copiado en
un proceso que se llama replicacin y transmitido a las clulas hijas en un proceso que se
llama mitosis. Las mutaciones son producidas por un proceso de replicacin que no es fiel
o por la inhabilidad de corregir errores, es algo fundamental, el proceso de replicacin en
la clula debe ser sumamente especifico, no se puede equivocar la clula al replicar el
DNA porque si se replica mal se genera una mutacin y por lo tanto esa clula hija tendr
una informacin gentica errnea, puede ser, que quizs a esa clula no le pase nada con
el DNA mutado pero tambin puede ser que all mutado justo en un gen que era muy
importante y por lo tanto esa clula hija puede que no sobreviva o que sobreviva y se
transforme en una clula cancergena por ejemplo. Por lo tanto la mantencin de la
integridad del DNA, es fundamental para todas las clulas y esa integridad se mantiene
en el proceso de replicacin, gracias a que el proceso de replicacin puede corregir
cuando encuentra errores.
El DNA es copiado (replicado) y transmitido a las clulas hijas a travs del proceso de
mitosis que es una parte del ciclo celular.
Mecanismos de replicacin del DNA

Adems de mantener la integridad de las secuencias del DNA mediante los


mecanismos de reparacin del DNA, todos los organismos vivos han de duplicar
su DNA de una forma muy exacta, antes de cada divisin celular. No le puede
faltar nada y tampoco le puede sobrar nada.

La replicacin del DNA supone unas velocidades de polimerizacin de


aproximadamente 500 nucletidos por segundo en las bacterias (tiene sentido que
sea rpido porque se multiplican cada media hora), y de unos 50 nucletidos por
segundo en los mamferos.

El proceso de replicacin debe ser rpido y preciso, por lo tanto la replicacin es


un proceso altamente complejo (ocurre de forma exacta dentro de la clula) que
esta ayudado por protenas.
El proceso de replicacin se basa fundamentalmente en el apareamiento de bases, es la
misma idea de cmo est formado el DNA de doble hebra. Tenemos una hebra molde,
madre y segn la informacin que este contenida en esa hebra, es decir, los nucletidos
que ah estn presentes, la otra hebra que se est polimerizando va a ir agregando
nucletidos si hay una A pondr una T si hay una G va a poner una C, es decir, por
complementariedad de bases a travs de puentes de hidrogeno. Siempre las hebras
crecen hacia el 3, nunca se polimeriza en el 5, qumicamente solo se puede formar el
enlace fosfodiester en el 3 no en el 5, por eso es fundamental el concepto de que las

hebras son polarizadas, que tienen un lado que es 5 y otro que es 3. Y eso me da la
direccin de los procesos, como ocurren dentro de la clula.
La replicacin del DNA es semiconservativa, esto quiere decir, primeramente el DNA se
abre completamente y cada una de las hebras se duplica, es decir, se copia y estas dos
luego se separan a las clulas hijas por lo tanto cada una de las clulas hijas va a tener
una molcula de DNA que estar formado por una hebra antigua y una hebra nueva, y
eso es lo que se conoce como un proceso semiconservativo.
Entonces tenemos nuestro DNA que se abre y cada hebra debe ser copiada en base a la
informacin que contienen por apareamiento de bases. Cada doble hebra nueva es
idntica a la original. Adems la hebra nueva y la hebra molde son qumicamente iguales
pero complementarias. El proceso de replicacin se lleva a cabo por un conjunto de
protenas que forman una maquinaria de replicacin. Este es un proceso que es tan
complejo y que tiene que ser realizado con tanta eficiencia que en l participan una serie
de protenas diferentes que van a permitir que esto se realice de forma exitosa.
La replicacin en una clula de DNA comienza en lugares precisos del DNA y se llaman
orgenes de la replicacin los cuales son sectores del DNA en cada cromosoma (hebra de
DNA independiente), son sectores del DNA ricos en AT (adenina y timina), que se unen
por medio de dos puentes de hidrogeno es decir, son ms dbiles por ende es mucho
ms fcil abrirlas. Son puntos que se generan como globitos en la secuencia de DNA,
cada uno de ellos es un origen de replicacin, por ende una zona rica de AT, cada uno de
ellos se comienza a replicar hacia cada lado, en ambas direcciones, en cada hebra
habrn mltiples orgenes de replicacin y esto se abre hasta que se juntan al centro
todas, replicando toda la hebra.
En el caso de los cromosomas circulares (un solo cromosoma circular) bacterianos hay un
solo origen de replicacin en un solo lugar, un origen de replicacin y dos horquillas de
replicacin, es decir, en un punto se abre y la replicacin avanza hacia ambos sentidos
(sentidos opuestos), donde en cada sentido hay una horquilla de replicacin. Siempre
cada origen de replicacin tiene dos horquillas de replicacin que son las maquinarias por
donde avanza la replicacin hacia los lados opuestos. En los procariontes solo hay un
origen de replicacin en los eucariontes hay muchos orgenes de replicacin.
En el corazn de cada maquinaria de replicacin se encuentra la enzima responsable, la
ms importante dentro del proceso de replicacin que se llama DNA polimerasa que es la
responsable entonces de sintetizar o polimerizar la nueva hebra de DNA.
Fragmentos de Okazaki
Focalizndonos en una horquilla de DNA podemos ver que avanza hacia un lado si lo
amplificamos veremos la doble hebra de DNA, con su orientacin 5 3 y 3 5 replicndose
ambas hebras. La DNA polimerasa esta enzima que es capaz de polimerizar el DNA, que
es capaz de leer la informacin que est dentro de la hebra molde y generar a partir de
esa informacin la hebra nueva, es decir, de generar esta copia, esta enzima agrega los
nucletidos al extremo 3 de la cadena del DNA en crecimiento, porque qumicamente, es

ah donde se puede formar el enlace fosfodiester, entonces esta hebra original 3 5


genera una hebra de copia 5 3 y por lo tanto hacia esa direccin va sintetizando el DNA
polimerasa va agregando los nucletidos segn la informacin que le de la hebra molde.
Mientras que en la otra hebra esta al revs, debe empieza de 3 a 5 y eso no puede ser,
ya que siempre se polimeriza hacia 3 no hacia 5, para avanzar hacia el otro lado no
puede hacerlo. La primera hebra entonces, que se copia directamente se llama cadena
conductora o adelantada y la otra que sebe formarse por pedacitos se llama cadena
retrasada, y cada uno de los pedacitos fragmentos de okazaki. Debido a que las dos
cadenas de DNA se sintetizan en la direccin 5 a 3, el DNA sintetizado sobre la cadena
retrasada es producido en forma de cortas molculas de DNA, denominadas fragmentos
de Okazaki.
Siempre en un origen de replicacin al partirlo por la mitad tendremos dos horquillas de
replicacin, cada uno avanza hacia el lado opuesto del otro, en cada horquilla tendremos
una hebra adelantada y una hebra retrasada, pero como la direccin es diferente las
hebras sern opuestas. Las horquillas de replicacin del DNA son asimtricas por que
avanzan en direcciones opuestas la hebra que debe crecer hacia el 5 se desarrolla
discontinuamente en pequeas partes sucesivas denominadas fragmentos de okazaki,
estos fragmentos luego son unidos para formar una cadena continua, esto lo realiza una
enzima llamada ligasa. La que hace todo este trabajo entonces es la enzima DNA
polimerasa que es una enzima grande que rodea el DNA y tiene la capacidad de ir
agregando los desoxiribonucleotidos al extremo 3 OH libre de la cadena que se est
formando, adems de ello la DNA polimerasa puede mirar hacia atrs y ver si se equivoco
en la lectura y la copia del DNA replicado, por lo tanto tiene una actividad polimerasa 5 3,
es decir, avanza desde el 5 hacia el 3, polimerizando generando esta nueva hebra, pero
adems tiene una actividad correctora, porque tambin se llaman proofreading en la otra
direccin 3 5 , entonces avanza y copia los nucletidos que corresponde pero tambin
puede ver hacia atrs y ver si se equivoco, si es as se devuelve pero en la otra direccin,
polimeriza entonces 5 3 pero cuando recorrige avanza 3 5. Tenemos entonces nuestra
hebra que se va polimerizando 5 3 cuando se da cuenta que comete un error se
devuelve saca al nucletido mal apareado, incorpora el nucletido que corresponde y
sigue avanzando. Entonces el DNA polimerasa no solo polimeriza si no que tambin
corrige y gracias a ello la replicacin es un proceso de alta fidelidad, si no fuera as, se
cometeran muchos errores.
Entonces, la hebra retrasada de DNA es sintetizada por fragmentos de okazaki. En los
eucariontes ocurre que tenemos nuevamente nuestra hebra, una continua o adelantada
que se va agregando los nucletidos hacia 3. El problema es la otra hebra que se tiene
que ir formando de a pedacitos, los cuales se inician con los llamados primers. Entonces
en la hebra retrasada se pone originalmente un primer, partidor o cebador que es una
pequea molcula de RNA que es complementaria a un pequeo segmento de DNA ,
entonces en los eucariontes los ARN cebadores o primers se forman cada 200 pares de
bases aproximadamente, la hebra se abre y cada 200 pares de bases se ponen estos
primer de RNA cebadores que es como un pedacito de secuencia (longitud de 10 pares
de bases) y a partir de ellos viene le RNA polimerasa y completa el espacio que hay entre

un primer y el otro polimerizando hacia el 3 agregando los nucletidos que corresponden


hacia el 3 , cada uno de estos fragmentos que originalmente comienza con un primer de
RNA y que luego termina con la secuencia de DNA se llama fragmento de okazaki.
Claramente esta hebra tendr algo raro, porque no queda con los pedacitos de RNA
metidos entremedio, debe quedar una doble hebra de DNA continua, es por ello que viene
una nucleasa (enzima que rompe nucletidos) y elimina los primers de RNA, luego viene
una DNA polimerasa reparadora y rellena los huequitos que quedaron de los primers,
luego viene la ligasa que une todos los pedacitos generando entonces la hebra continua
de DNA. En todo esto participan entonces una serie de protenas.
En resumen en la replicacin tenemos nuestra hebra original que se abre en los orgenes
de replicacin y avanza en cada origen de replicacin en las horquillas de replicacin en
direcciones opuestas. Una es la hebra adelantada y la otra hebra es la retrasada que se
va haciendo de a pedacitos (va en direccin opuesta, hacia 5), los pedacitos se llaman
fragmentos de okazaki, cada fragmento de okazaki comienza con un primer o cebador
ARN, de 10 pares de bases de RNA que se forman cada 200 pares de bases de ADN,
luego viene la RNA polimerasa y rellena el espacio que hay entre un cebador y el
siguiente, luego la nucleasa elimina los cebadores de ARN, y luego el ADN reparador
genera los nucletidos donde estaban los ARN y luego la ligasa une todos los fragmentos
de DNA.

La helicasa rompe los puentes de hidrgeno de la doble hlice permitiendo el


avance de la horquilla de replicacin.
La topoisomerasa impide que el ADN se enrede debido al superenrollamiento
producido por la separacin de la doble hlice.
La ADN polimerasa sintetiza la cadena complementaria de forma continua en la
hebra adelantada y de forma discontinua en la hebra retrasada.
La ARN primasa sintetiza el cebador de ARN necesario para la sntesis de la
cadena complementaria a la cadena rezagada.
La ADN ligasa une los fragmentos de Okazaki.
El cebador: son pequeas unidades de RNA que se unen a los fragmentos para
que la ADN polimerasa reconozca donde debe unirse.
La DNA polimerasa reparadora: elimina los finalmente los cebadores de RNA

Mutaciones
Las mutaciones en el DNA pueden ser puntuales, es decir, que cambia un nucletido en
toda la secuencia del DNA, puede ser que esa mutacin puntual de lo mismo, no sea
parte de un gen importante y por lo tanto nisiquiera sabremos que existi esa mutacin
por que no tiene una consecuencia para la clula, sin embargo, hay otras mutaciones
puntuales en el que solo el cambio de un nucletido es sumamente importante. Las
mutaciones entonces, aunque puntuales pueden tener grandes consecuencias para un
individuo. La anemia falciforme por ejemplo es una enfermedad hereditaria que se
caracteriza por presentar glbulos rojos con forma anormal que genera el transporte
incorrecto de oxigeno, esto es causado por una mutacin sobre la cadena beta de la
hemoglobina ( dos alfa dos beta, una de las beta tiene una mutacin puntual en un

nucletido y ese cambio genera una beta globina que cambia su conformacin, la protena
que se genera aunque tenga un nucletido diferente es distinta y no se puede asociar a
las otras subunidades de la hemoglobina y por lo tanto no se puede formar correctamente
el glbulo rojo y se genera la enfermedad). Sndrome de Werner o progeria, es el
envejecimiento prematuro de las personas, es causada por un defecto en la DNA
helicasa, como hay un defecto ella no hace bien su trabajo no abre bien la hebra y la
replicacin no es correcta, normalmente no se replica todo el DNA por lo tanto se generan
individuos con trastornos severos. Por lo tanto la presencia de mutaciones en el DNA es
una conducta fundamental, sin embargo, algunas mutaciones en el DNA puede que sea
favorables para la especie y eso es evolucin, los humanos evolucionamos lentamente ,
tenemos un ciclo de vida muy largo, pero las bacterias que se dividen cada media hora
evolucionan rpidamente, en cada una de esas divisiones pueden adquirir una
caracterstica gentica nueva, un cambio una mutacin que le permita por ejemplo crecer
en una situacin de stress que antes no tenan. Hay cambios entonces en el DNA que se
mantienen en la evolucin por que generan algo favorable para la especie, hay otros que
generan un dao en la especie. Para que sobrevivan los individuos requiere una
estabilidad gentica, para mantenerse en el tiempo requerimos que nuestro ADN se
mantenga estable para transferirlo a los hijos de forma estable. Por lo tanto necesitamos
un proceso de replicacin que sea fiel y adems necesitamos un proceso de reparacin
de DNA que sea eficiente, cuando hay una falla en estos dos procesos tenemos una
mutacin que puede ser puntual o puede ser mayor. Hay factores externos que tambin
pueden generar un dao en el DNA no solo porque la DNA polimerasa se equivoco, hay
otros factores que tambin pueden daarla. La fuente de los cambios de la secuencia
DNA puede ser:
1. Desanimacin: Se genera la prdida de un grupo amino de uno de los nucletidos,
tenemos nuestra secuencia de DNA ya con su esqueleto azcar fosfato en la orilla
y las bases nitrogenadas hacia el centro y una de estas bases nitrogenadas pierde
el grupo amino, cuando pierde el grupo amino cambia qumicamente. Cuando la
citosina pierde su grupo amino especficamente cuando la citosina pierde su grupo
amino por un proceso de desanimacin queda qumicamente igual a un uracilo. Lo
que ocurrir es que, tenamos nuestra doble hebra de DNA, en un lugar haba
citosina pero ella sufre un proceso de desanimacin por lo tanto perdi su grupo
amino, lo que pasara cuando se replique la hebra es que la DNA polimerasa
cuando vea este nucletido creer que es un uracilo lo que har ser agregar una
adenina complementaria al supuesto uracilo esta clula entonces tendr una
mutacin puntual, si esta dao es fundamental para la clula puede que no
sobreviva o que sobreviva pero tenga un dao que ser heredado a las clulas
hijas, si estos daos ocurren en las clulas somticas nuestros hijos tendrn
daos.
2. Depurinaciones: es la perdida completa de una purina (AG) , se pierde
completamente , en este caso entonces se pierde la base nitrogenada y solo
queda el esqueleto azcar fosfato, entonces cuando ocurra la replicacin del DNA
aparecer como que hay un nucletido menos en este lugar por lo tanto la DNA
polimerasa solo copiara lo de alrededor y se saltara el nucletido que estaba ah
porque no lo va a ver, esta clula tambin ser mutada, pero en este caso ser

severa ya que le falta un nucletido, cambia la secuencia genmica


completamente, en la otra clula no pasara nada ya que leer la otra hebra.
3. Cambios qumicos por agentes mutagenicos: Como por ejemplo la formacin de
los dmeros de timina esto lo forma la radiacin ultravioleta, la radiacin ultravioleta
sobre el DNA genera dmeros timina (cncer a la piel), si tenemos una secuencia
de DNA donde hay dos o ms timinas juntas, estas timinas se unen y generan
enlaces entre ellas, por lo tanto cuando se tengan que replicar las hebras la DNA
polimerasa (enzima) no sabe como replicar esa estructura no la reconoce como un
nucletido, as que detiene la replicacin y es una clula daada que no puede
replicar su DNA, siempre ocurre para los dmeros de timina.
Por suerte nuestro sistema tiene mecanismos de reparacin del DNA que comprende tres
etapas la primera es la eliminacin del error, luego genera la nueva sntesis de la hebra
corregir y poner el nucletido que corresponda y finalmente ligar las dos hebras la que se
genero recin y la que estaba desde antes para generar nuevamente esta doble hebra
continua. Entonces si tenemos un DNA con un error puntual viene una enzima nucleasa y
saca el nucletido que estaba mal , luego viene la DNA polimerasa reparadora y agrega
un nucletido y luego la DNA ligasa une todo generando la doble hebra. Si satura el
sistema igualmente se termina saturando el sistema de correccin del DNA. Si le hebra no
se repara hay una clula hija que heredara el error y eso puede significar para esa clula
muerte o puede significar para esa clula estar enferma por ejemplo cncer, o bien puede
ser nada. Los sistemas de reparacin son tan importantes en la clula que han permitido
conservar ciertos genes muy conservados despus de millones de aos de evolucin que
es muy similar a lo que ocurre con las histonas, los sistemas de reparacin conservan las
secuencias exactas en las diferentes especies y a lo largo de aos y aos de evolucin.
Por ejemplo el gen que determina sexo entre ballenas y humanos es muy parecido solo
tiene tres diferencias y esto es gracias a los sistemas de reparacin que hacen que se
mantenga estable las secuencias.
Tenemos entonces la informacin contenida en el DNA ( almacenada la informacin
gentica), cuando necesitamos ejecutar esa informacin no se usa directamente el
DNA, en este caso se usa una molcula mensajera que copia un segmento del
DNA , es decir, copia ese programa que nosotros necesitamos en ese momento
especifico lo saca del disco duro y lo lleva al citoplasma y ah el programa es
ejecutado, se sintetiza la protena a partir de ese RNA, el DNA doble hebra se copia
en un proceso que se llama transcripcin a una hebra de RNA , que puede ser
mensaje, ribosomal, transferencia, etc. El RNA que se convierte o traduce en
protena es el RNAm que trae la informacin desde el RNA para poder generar la
protena , posteriormente este RNAm por un proceso de traduccin se genera la
protena.
Las clulas leen o expresan instrucciones que tienen en los genes. Nuestro DNA dentro
de la clula est lleno de diferentes genes, programas, informacin para generar
diferentes cosas dentro de la clula, hay genes por ejemplo el A que se transcribe muchas
veces , osea, a partir de un mismo gen se pueden formar muchas molculas de RNAm y
a partir de cada una de ellas se pueden sintetizar muchas protenas, se pueden cada una

de ellas traducir muchas veces y por lo tanto a partir de un solo gen en un momento
determinado de la clula podemos tener gran cantidad de la protena A, porque la clula
necesita la protena A pero no la B, solo necesita la A. Por ejemplo las clulas
pancreticas que solo sintetizan las enzimas pancreticas o los folculos pilosos que
sintetizan pelo, necesitan mucha informacin del gen que codifica para el pelo necesita
traducir esta informacin muchas veces generando muchas protenas de keratina.
GEN - Regin del ADN que controla una caracterstica hereditaria discreta, que
Generalmente corresponde a una protena o ARN nicos.
Clulas sintetizan gran cantidad de protenas rpidamente.
La sntesis de las protenas de cada clula depender de cada organismo, de cada
estadio, por que cuando se es bebe se necesita de ciertas protenas y de adulto se
necesita de otras, por lo tanto depende de cada individuo, clula y del estadio en que se
encuentre el individuo que tipo de protena expresara cada clula. Todas las clulas tienen
la informacin para expresarlas todas pero va a expresar diferencialmente unas de otras y
por eso cada clula puede cumplir diferentes funciones.
ARN
Siempre son hebras nicas, simples, no son dobles como el ADN, el DNA siempre es una
molcula de doble hebra, el RNA no siempre es una molcula simple. Al encontrarse en la
forma de hebra nica, el ARN es capaz de interactuar consigo mismo, lo que le confiere
una estructura tridimensional. Una molcula de RNA entonces se pliega sobre s mismo,
muy parecido a lo que ocurre en las protenas, tenemos originalmente una hebra de DNA
que se puede ir enrollando sobre si misma adquiriendo entonces una estructura
tridimensional gracias a los puentes de hidrogeno se enrolla sobre si mismo, que forma
por complementariedad de bases, es decir, hay regiones de la secuencia que al plegarse
son complementarias y se unen por puentes de hidrogeno. A su vez, esta estructura
tridimensional le puede conferir una actividad a los RNA, y no solo tenemos a los RNAm si
no que tambin hay RNA que son catalticos dentro de la clula (pueden tener actividad
enzimtica a pesar de no ser enzimas o protenas, pero pueden realizar cosas dentro de
la clula) o un rol estructural (RNA ribosomales que nos permite formas ribosomas, son
RNA que permiten formar estructuras dentro de la clula).
Etapas de la Transcripcin
Segmentos de regiones de ADN son transcritos a ARN, no se transcribe todo el ADN,
solamente pedazos que son los que la clula necesita en ese momento de su vida, esos
genes particulares son los que se transcriben no todos.
Los procesos de replicacin y transcripcin son dos procesos completamente diferentes
que ocurren dentro de la clula, la replicacin solo ocurre cuando la clula tiene que
dividirse y no todas las clulas se dividen, por ejemplo, las neuronas no se dividen, por lo
tanto no hay replicacin de ADN en ese tipo de clulas, pero si hay transcripcin para
poder generar todas las protenas que ella necesita como los canales inicos de sus

membranas, los neurotransmisores que deben generar, etc. Hay otras clulas que se
replican constantemente como las clulas de la piel, esas clulas deben replicarse.
La transcripcin produce un ARN que es complementario a una de las hebras del ADN,
entonces si tenemos una cierta secuencia de ADN, tenemos una hebra que se ama
codificante o no templado, o la hebra templado, la hebra que se copia para formar el
RNAm es la hebra templado o la hebra molde la que va en la direccin 3 5, porque ahora
la RNA polimerasa, es decir, la enzima que genera la transcripcin, RNA polimerasa por
que es capaz de generar una molcula de RNA a partir de DNA, tambin polimeriza hacia
el 3, por lo tanto copia la hebra que va de 3 a 5 para crear una hebra transcrita de 5 a 3
de forma complementaria reemplazando las T por U (uracilos). El RNA transcrito ser
igual a la hebra codificante pero en lugar de tener T tendr U. Entonces hay segmentos de
RNA que son transcritos, la transcripcin produce ARN complementarios a una hebra del
DNA y se pueden producir diferentes molculas de ARN, no todos sern ARNm, cuando
se genera un ARNm lleva la informacin para poder sintetizar protenas, lo RNAr forman
parte de los ribosomas, los RNAt (transferencia) son utilizados para poder producir las
protenas y los small RNA participan en la maduracin del RNA cuando hay intrones.
La RNA polimerasa entonces en la enzima que se encarga de realizar este proceso de
transcripcin, la RNA polimerasa es una enzima grande que se asocia a un segmento del
DNA, abre el DNA en un punto especifico y empieza a copiar a partir de la hebra templado
o molde el RNAm polimerizando hacia el 3 agregando los ribonucleotidos por que
estamos hablando de un RNA. Por lo tanto en este caso la direccin de la transcripcin
ser hacia 3 copiando la hebra que va hacia el 5. A diferencia de lo que ocurre con el
ADN en la replicacin, el ARN que se forma es desplazado de la doble hebra, permitiendo
que la doble hebra de ADN se vuelva a formar. Se abre parcialmente el DNA en una
regin especifica, se comienza a copiar, y una vez que se copio se vuelve a formar la
doble hebra inmediatamente. Entonces, tendremos una parte de RNA que ya se
transcribi a partir del DNA, esta parte ya esta suelta del DNA (para que este vuelva a ser
una doble hebra), mientras que las otras partes que aun no se transcriben siguen unidas
al DNA, a medida que se vayan polimerizando en ARN irn soltando al ADN, a diferencia
de la replicacin donde la nueva hebra queda unida a su hebra original formando las
llamadas hebras semiconservativas (unidas por puentes de hidrogeno) que se heredan a
las clulas hijas. Entonces la hebra de DNA se vuelve a unir o cerrar inmediatamente una
vez que ya se transcribi al RNA que corresponde (r, t, m, s). Otra caracterstica del ARN
es que siempre es una molcula de un tamao mucho menor que el ADN, por que el ADN
es la hebra total que forma al cromosoma en cambio el ARN solo corresponde a la
secuencia de un gen, algo mucho ms pequeo. Son hebras pequeas siempre de
cadena simple, sencilla o nica.
Cmo sabe la clula cuales son los genes que tiene que transcribir y cules no,
como sabe donde comienza ese gen para transcribirlo bien y no equivocarse, como
sabe la clula donde comenzar la transcripcin?
Cada gen, antes que comience la secuencia propia del gen. Hay secuencias entre un gen
y otro, las regiones intergenicas, en estas regiones al comienzo de cada gen hay una

secuencia que se llama promotor y es ese promotor el que regula la transcripcin de ese
gen, cada gen entonces tiene su promotor, si hay un gen en una secuencia de DNA que
no tiene promotor no se pude transcribir, se llaman pseudogenes, siguen en la secuencia
pero no tienen promotor por lo tanto no se pueden transcribir.
Entonces tenemos un gen, pero antes de este gen tenemos una regin que se llama
promotor y cuando termina el gen hay otra cosa que se llama terminador, que es una
secuencia de DNA cortito que esta al final del gen, entonces el promotor que esta al
principio del gen y el terminador que esta al final del gen son regiones del DNA que
regularan la transcripcin, el promotor me dir donde empiezo y el terminador me dir
donde termino, cada gen tiene su promotor y su terminador. Entonces la RNA polimerasa
que es la enzima que genera el RNA a partir del DNA se une al promotor en esa regin
del DNA porque sabe que a continuacin de ese promotor viene el gen y que de ah en
adelante comenzara a transcribir, no se puede equivocar, no le puede faltar nada al gen o
generara una protena que no es la que requiere la clula, por que ser una protena que
le faltaran aminocidos o tendr aminocidos de mas.
La RNA polimerasa que es la enzima que sintetiza el DNA, agrega ribonucleotidos
(diferente DNA polimerasa), tiene actividad polimerasa (5 3) en esa direccin hace crecer
la molcula y se polimeriza, no necesita un cebador o un partidor como la DNA
polimerasa, corrige sus errores en la direccin 3 5, existen tres tipos de RNA polimerasa
diferentes que son RNA polimerasa I es la que sintetiza el RNA ribosomal y los small
nuclear, la II genera el RNAm y la III genera el RNAt. Dependiendo entonces de que
secuencia se est transcribiendo, que informacin se est transcribiendo, es la RNA
polimerasa que se utiliza. El ARN polimerasa II es el que genera el ARNm que luego se
traduce a protenas.

Segmentos de regiones del ADN son transcritos a ARN.


La transcripcin produce ARN complementarios a UNA HEBRA del ADN.
Se producen varios tipos de ARN
Seales presentes en el ADN indican adonde empieza y adonde termina la
transcripcin.
Las secuencias de esas seales son heterogneas, pero conservan algn
nivel de similitud.
Secuencias Reguladoras
La clula sabe donde comienza a transcribir porque cada gen al comienzo tiene un
promotor, que es el que maneja la transcripcin, son los que le dicen a la ARN polimerasa
que debe transcribir desde un punto en adelante, as que si el promotor est mal todo lo
dems estar mal. Los promotores entonces tienen secuencias reguladoras dentro de
ellas, los promotores pueden variar en su tamao de un gen a otro, promotores de mil
pares de bases, de dos mil pares de bases, tres mil pares de bases, los ms pequeos
tienen como 500 pares de bases. Son largos, no son cortitos, es una regin del DNA en la
cual hay numerosas secuencias reguladoras que le dirn a la RNA polimerasa donde

comenzar a transcribir, esas secuencias reguladoras son por ejemplo, la caja TATA, que
estn presentes en todos los promotores en una posicin precisa, y adems el sitio de
inicio de la transcripcin. Entonces si tengo un gen en el cual comienzo a transcribir (+1)
todo lo que esta antes del gen toda la secuencia que esta antes del gen es la regin
promotora y eso se conoce como rio arriba, cuando hablo de una secuencia de ARN o
ADN desde un punto lo que esta ms abajo es el rio debajo de esa secuencia o corriente
a bajo de esa secuencia cuando hablo del punto hacia arriba es corriente arriba de la
secuencia. Entonces siempre desde el inicio del gen rio arriba esta el promotor rio abajo
estar el terminador. El +1 es el punto donde inicia la transcripcin aqu en el promotor
estarn las secuencias reguladoras que le dicen a la RNA polimerasa donde debe
posicionarse para comenzar a transcribir desde el +1 en adelante toda la secuencia hasta
el terminador, se generara un RNA de esa secuencia solamente.
Dentro de nuestra regin promotora normalmente tenemos la caja TATA se llama as
porque es una secuencia rica en T y en A que es variable, no siempre es la misma
secuencia, pero esta caja TATA es fundamental para que se unan protenas que se llaman
factores de transcripcin, que se unen a la caja TATA y cuando estos factores de
transcripcin estn unidos ellos son los que le indican en definitiva a la RNA polimerasa
que ah hay un gen que necesita ser transcrito, entonces viene la RNA polimerasa se
asocia a todos esos factores de transcripcin y comienza a transcribir si no hay promotor,
no hay caja TATA, no se unen los factores de transcripcin por lo tanto nunca habr
transcripcin de ese gen por que la RNA polimerasa nunca vera a los factores de
transcripcin, en definitiva la RNA polimerasa no sabe nada ms que poner los
nucletidos ella donde ve los factores de transcripcin unidos va y se posiciona para
transcribir. Donde comienza la transcripcin siempre es conocido como +1 lo que esta
corriente arriba es con nmeros negativos lo que esta despus hacia abajo es con
nmeros positivos, por lo tanto, uno dice por ejemplo, tengo un promotor de -2000 pares
de bases y la caja TATA esta en el -40 de un gen en particular.
Algunos genes se transcriben mucho, para generar muchos RNAm para traducir despus
mucho y generar muchas protenas, y otros transcriben poquito. Lo que hace esta
diferencia, lo que regula que algo se transcriba o no, en la clula, es la necesidad proteica
de cada clula.
Hay mltiples RNA polimerasa asocindose al promotor de este gen para
transcribirlo, a partir de un DNA se generan cientos de RNA simultneamente a
partir de un solo gen.
Toda la transcripcin anterior es visto en eucariontes.
En los procariontes
Tenemos nuestro DNA, con doble hebra antiparalela y con una regin codificante, pero en
el caso de la informacin gentica de las bacterias no hay un promotor por cada gen, si no
que hay conjuntos de genes regulados por un solo promotor, en este caso tenemos un
gen al lado de otro y de otro regulado por un solo promotor y eso facilita la vida de la
bacteria (ciclo de vida ms corto), por ello ella necesita sintetizar sus protenas de forma

mucho ms rpida por lo tanto tiene solo un promotor que regula la transcripcin de varias
protenas, obviamente todas van a ser protenas relacionadas, no son protenas
diferentes, cuando sintetiza una tambin sintetiza a la otra. En procariontes los mRNA no
son procesados y adems se generan molculas de mRNA con la informacin para
mltiples protenas (RNA policistrnico). Entonces los RNA policistronicos solo existen en
las bacterias no existen en las clulas eucariontes.
El promotor es el lugar donde estn las secuencias reguladoras antes del gen y
varan en nmero de bases (1000, 2000, 3000, 500, etc.). Se encuentran las
secuencias reguladoras como la caja TATA que regulan e indican a la clula donde
transcribir un gen en particular. A la caja TATA se unen factores de transcripcin
(protenas especificas) que le indican al RNA polimerasa que ese gen se debe
transcribir. Entonces dentro de una clula habrn genes que se transmiten mucho y
otros que se expresan menos o que incluso no se expresan. Por ejemplo, solo las
clulas nerviosas transcriben los genes para neurotransmisores, las clulas
epiteliales o las clulas del ojo por ejemplo, no tienen la necesidad de crear
neurotransmisores por ende no transcriben esos genes, solo las clulas nerviosas
transcribirn los genes para neurotransmisores. En el caso de la insulina es lo
mismo, solamente las clulas pancreticas tienen la capacidad de generar insulina,
toda las otras clulas del organismo jams transcriben el gen para la insulina,
solamente la clula pancretica transcribe ese gen y lo hace mucho porque solo el
necesita secretar gran cantidad de insulina. Dependiendo del tipo celular que
hablemos habr genes que se transcribirn ms o menos y tambin dependiendo
del momento de la vida que estemos viviendo, las clulas se adaptan a las
condiciones y van transmitiendo los genes que necesitan en ese momento
secretando la protena que necesitan en ese momento. Si un gen no tiene promotor
no se puede transcribir. Hay genes sin promotores en las clulas eucariontes
humanas, se llama pseudo genes y no se pueden transcribir nunca, pero jams,
existe en la clula eucarionte que el promotor de un gen regule la expresin de otro
gen.
En las clulas procariontes hay un promotor que regula la expresin de varios genes por
lo tanto se generara un solo RNAm que llevara la informacin para varias protenas y ese
RNAm se llama RNAm policistronico, esto tiene sentido en las bacterias ya que tienen
ciclos de vida muy cortos, por lo tanto no pueden transcribir cada gen, sera una prdida
de tiempo, mejor transcriben un conjunto de genes relacionados entre s generando solo
un RNAm policistronico, eso jams ocurre en una eucarionte, en ella cada gen tiene su
promotor.
En las clulas eucariontes hay otro grado de complejidad dentro de los genes y es que
algunos genes, no todos, poseen dentro de su secuencia regiones que son codificantes y
regiones que son no codificantes que se llaman intrones y exones. Donde comienza el
gen propiamente tal lo que debe ser transcrito se llama inicio de la transcripcin y siempre
se determina con el numero +1 todo lo que est arriba de eso es corriente arriba o rio
arriba y lo que est abajo es corriente abajo. Y adems dentro de cada gen eucarionte (no

pasa en las procariontes), dentro de la secuencia hay regiones codificantes que se llaman
exones y no codificantes que se llaman intrones, la cantidad de intrones que hay dentro
de un gen es variable y cul ser el tamao del intron tambin es variable, cambia de un
gen a otro y de una especie a otra. Hay genes eucariontes que no tienen intrones, si hay,
pero la gran mayora si tiene intrones. Entonces, sabemos que el promotor siempre esta
corriente arriba del gen, esta antes del gen, es lo que determina la cadena que ser
transcrita para poder generar el RNA, es el lugar donde unir la RNA polimerasa que
generara la transcripcin, por ende la molcula de RNA, determinara cuantas veces ese
gen ser transcrito por lo tanto pueden existir promotores fuertes (generara que el gen se
transcriba muchas veces, por ejemplo, el promotor de la insulina es un promotor fuerte en
el pncreas por que necesita generar mucha protena insulina) y tambin hay promotores
dbiles (transcriben poco, crean una cantidad de protenas pequeas, las que son menos
abundantes dentro de la clula).
Entonces dentro de las clulas procariontes (bacterias y archeas), tenemos que no tienen
una separacin entre el ncleo y el citoplasma, en estas clulas entonces tenemos el DNA
de doble hebra donde ser transcrito alguno de sus genes por lo tanto se generara un
RNAm, y este RNAm se unir a los ribosomas para generar la protena a partir de la
informacin que est en el RNAm. Como en las clulas procariontes no existe una
separacin entre ncleo y citoplasma todos estos procesos, es decir, la transcripcin y la
traduccin posteriormente ocurren en el mismo espacio y de forma simultnea, es un
proceso muy rpido, casi simultneamente que se est creando el RNAm en un extremo,
por el otro extremo se le estn uniendo los ribosomas para sintetizar la protena altiro, es
bastante sencillo el proceso.
En las clulas eucariontes por tener un ncleo delimitado y dentro de ese ncleo estar
contenido el DNA, el proceso es bastante ms complicado. Tenemos entonces la
transcripcin del DNA, que va a generar una molcula de RNAm pero en este caso el
RNAm ser inmaduro o tambin conocido como pre RNAm, y para que este RNAm pueda
salir desde el ncleo hacia el citoplasma para unirse a los ribosomas y poder se traducido,
necesita madurar, necesita un procesamiento especifico que diga que el RNAm est listo
para ser traducido. Por lo tanto el proceso transcripcin y de procesamiento del RNA
ocurre dentro del ncleo y el proceso de traduccin ocurre en el citoplasma, es decir,
ocurre todo en dos espacios separados, esto obviamente implica un proceso. Finalmente
los niveles de protena que encontremos en una clula van a depender de que cada una
de estas etapas sea realizada de forma efectiva, si algo pasa en el camino de todo esto
no llegaremos finalmente a la protena, si hay un problema en la transcripcin, si hay un
problema en la maduracin, si hay un problema en la traduccin no vamos a lograr tener
la protena correcta en la clula.
Procesamiento RNAm en eucariontes
El RNAm inmaduro tiene tres procesos de maduracin que son:

En el 5 del RNAm inmaduro se le agrega una molcula que se llama CAP y el


proceso se llama capping del 5 y la molcula que se agrega es un nucletido de
guanina modificado qumicamente.
En el 3 del RNAm inmaduro se agrega una cola de poli A que es una secuencia
lineal sucesiva de adenina que se agrega simplemente en el extremo 3.
Se deben procesar los intrones (secuencias no codificantes de un gen,
informacin que no es para una protena) por lo tanto hay que eliminarla del
RNAm para que cuando el RNAm sea traducido se genere la protena correcta.

El capping del 5, es decir, se agrega este nucletido modificado en el extremo 5


del RNAm para evitar que all una degradacin del RNA. Por ejemplo cuando
vimos los fragmentos de okazaki, cada fragmento tena un fragmento de RNA
original inicial, que era un primer de RNA, un partidos de RNA, un cebador de
RNA, y ese partidor despus tena que ser eliminado por una nucleasa que es una
enzima que elimina nucletidos, entonces, estn estas nucleasas que con
enzimas que degradan nucletidos y esas enzimas no discriminan degradan lo
que encuentren, por lo tanto, si se encuentran con un RNAm tambin lo pueden
degradar. Por eso es importante que a este RNAm se le agreguen estas
secuencias o estas molculas como el 5 CAP, para evitar la degradacin por las
nucleasas y que de esa forma puedan viajar desde el ncleo hacia el citoplasma
correctamente para poder ser traducidos. Auxilia el procesamiento del mRNA
inmaduro. Ayudar en paso del RNA desde el ncleo al citosol.

El corte y empalme de los intrones, un proceso que en realidad se llama splicing,


es un proceso para eliminar los intrones. Tenemos entonces nuestro gen en el cual
hay intrones que estn interfiriendo nuestra secuencia y por lo tanto para generar
el ARNm maduro hay que eliminar todas esas secuencias y unir correctamente las
regiones que son codificantes para que despus se pueda generar correctamente
la protena.

El ltimo paso del procesamiento es la poliadenilacion en el extremo 3 del RNAm,


que es agregar esta cola de adenina. La cola poli A puede tener hasta 200
nucletidos de adenina en su cola, es larga, siempre se agrega en su extremo 3,
solo los RNAm tienen cola Poli A. Uno de transferencia o ribosomal no lo tienen,
tampoco tienen el 5 CAP.

Entonces en el caso de los RNAm en los procariontes son sper sencillos, la mxima
complejidad que pudieran tener es que pueden ser RNAm policistronicos, es decir, un
solo RNAm lleva la informacin para varias protenas. Lo que se debe tener en cuenta es
que siempre estas protenas que estn juntas en el RNAm policistronico son protenas
relacionadas dentro de una misma ruta metablica, por ejemplo, cuando la bacteria
necesita generar pared celular, transcribe todos esos genes necesarios para crear esa
pared celular juntos en un mismo RNAm policistronico. Es una forma de ahorrar tiempo.
Y en el caso entonces en el caso de los RNAm eucariontes los RNAm inmaduros deben
ser procesados agregando el extremo 5 CAP, la cola Poli A y generando el splicing.

Splicing de los intrones


Tenemos un gen sencillo solo con un intron al medio interrumpiendo la secuencia
codificante. Entonces lo que tiene que hacer la clula es eliminar este intron de forma que
pueda juntar el primer exn con el segundo exn y generar solo la secuencia codificante.
Ahora este proceso debe ser preciso, porque si la clula se equivoca en este
procesamiento del intron y deja un nucletido del intron entremedio cambiara el marco de
lectura hacia adelante o si se equivoca en el procesamiento y saca un pedacito del exn
perder secuencia que es importante para la generacin de la protena. En este
procesamiento no se puede perder ni ganar ni un solo nucletido, tiene que ser preciso y
liberar solo lo que corresponde. Esto se logra gracias a una maquinaria compleja en la
que participan muchas protenas y enzimas y tambin los small RNA. La clula sabe qu
y reconoce lo que tiene que sacar y mantener dentro de la secuencia gracias a que en
todos los intrones siempre en su comienzo se encuentra una secuencia particular y al final
tambin hay una secuencia particular y al centro tambin hay una secuencia particular
que se conoce como A que es una A reactiva que es sumamente importante en el
procesamiento del intron. Gracias a esas secuencias es que la clula reconoce que hay
un intron y que por lo tanto ese es el segmento que debe eliminar de ese RNAm. En
muchos genes eucariontes complejos, genes que tienen muchos intrones, adems puede
haber un procesamiento alternativo de los exones, es decir, a partir de un gen que tiene
muchos intrones y por ende muchos exones, se puede procesar de tal forma que por
ejemplo, se genera un RNAm maduro uniendo el primer exn con el tercer exn
saltndose el segundo exn, eliminando no solo el intron, sino que tambin el exn, y
junto el primero con el tercero y despus se salto el 5to, tampoco uni el 4to y de esa
manera genero un RNAm que le permitir sintetizar una protena particular, pero en otra
situacin de la clula, o en otro tipo celular, ese mismo gen, puede se procesado de otra
manera uniendo otros exones, por ejemplo en otro caso se une el primer exn con el
segundo exn y de ah se sala al quinto y no une ni el 3ro ni el 4to, por lo tanto este
RNAm ser diferente al anterior, la protena que se genere ser diferente, es una protena
parecida por que viene en base al mismo gen, y hay muchas partes de la secuencia que
la comparten, pero no es la misma protena, dependiendo entonces de cmo se procesen
los intrones y los exones se generaran diferentes RNAm y por lo tanto se podrn
diferenciar diferentes protenas y eso se llama procesamiento alternativo de intrones, que
no le ocurre a todos los genes pero si en algunos complejos que son importantes para la
vida de la clula. El procesamiento del intron ocurre gracias a la A reactiva que interacta
con el comienzo del intron con la secuencia que esta al comienzo formando una especie
de lazo y finalmente el final del primer exn se junta con el principio del siguiente exn y
se elimina el intron como un lazo siempre unido a travs de esa A reactiva. El que hace
este proceso es una maquinaria compleja que se llama spliceosome que est formado por
diferentes molculas formadas por muchas protenas, pero adems de estas protenas
que forman al spliceosome, hay RNA pequeos nucleares que forman el spliceosome que
permite el splicing de los intrones. Finalmente una vez que tenemos nuestro RNAm
maduro, tiene su CAP 5 su cola Poli A en el 3 y ya se eliminaron los intrones de forma
correcta este RNAm sale hacia el citoplasma a travs de unos poros nucleares que se
encuentran en la membrana nuclear, en estos poros nucleares hay complejos proteicos

que confirman que el RNAm que est saliendo este maduro y que no se salga nada que
no est listo para ser traducido y una vez que sale entonces este RNAm maduro se le
unen los ribosomas en el citoplasma y se traduce la protena que estaba contenida ah en
la informacin de ese RNAm. Un grupo especializado de protenas de unin al RNA
marca los mRNA maduros para ser exportados al citoplasma. Los intrones una vez
que son sacados de la secuencia son reutilizados desgenerandose en nucletidos
individuales para formar un nuevo RNAm. Una vez que se genera el ARNm maduro en las
clulas eucariontes y sale al citoplasma este RNAm se asocia a los ribosomas, el
ribosoma se ensambla sobre el RNAm, se pueden ensamblar muchos ribosomas en un
mismo RNAm y cada uno de estos ribosomas puede generar una protena. Un
poliribosoma es la asociacin de mltiples ribosomas sobre un mismo RNAm para
sintetizar muchas protenas a partir de un mismo RNAm.
Resumen
1. Las bacterias tienen un solo un tipo de RNA polimerasa, en cambio los
eucariontes tienen 3 RNA polimerasas designadas I, II y III.
2. El mRNA de eucariontes es sintetizado por la RNA polimerasa II.
3. En algunos genes el producto final es una molcula de RNA y no una
protena. Para esos genes, el DNA es transcrito por la RNA polimerasa I o la
RNA polimerasa III.
4. La RNA polimerasa I hace el RNA ribosomal. Despus de su sntesis como
un precursor voluminoso, el rRNA es modificado qumicamente, cortado y
ensamblado en un ribosoma. Este proceso ocurre en el nuclolo, una
estructura sub-nuclear especializada en el procesamiento de complejos
RNA-protena.
5. Los mRNA eucariontes sufren un proceso de maduracin (5CAP,
poliadenilacin y splicing) necesarios para ser exportados hacia el
citoplasma, en donde sern traducidos por los ribosomas.
Transcripcin Inversa o Reversa
Es un proceso que nunca ocurre en las clulas eucariontes y procariontes de forma
natural por lo tanto si no ocurre en las eucariontes ni en las procariontes ocurre en los
virus. Cuando generamos una hebra de DNA de doble hebra a partir de una molcula de
RNA ese proceso se llama transcripcin inversa o reversa, que no es lo que ocurre de
forma natural, donde todo flua desde DNA hacia RNA, es opuesto, se genera un DNA de
doble hebra a partir de un RNA. Esto ocurre solo en los virus. La transcripcin reversa es
un proceso que se da en los retrovirus, hay varios tipos de virus sumamente variados y
diferentes que son capaces de infectar diferentes tipos celulares, aun no son escritos los
virus que infectan archeas. Cada uno de estos virus est formado por una molcula que
en el centro tiene informacin gentica que vara de un virus a otro, puede ser contenida
en DNA o en ARN, el DNA puede ser nica, doble, circular, ms de una hebra, al igual que
el RNA. Alrededor de la molcula de informacin gentica hay una cubierta proteica que
forma la capside que protege la informacin gentica, en los retrovirus esta informacin

gentica est formada por una molcula de RNA que es lineal y tiene alrededor una
cubierta formada por protenas y en algunos virus esa cubierta es casi como una
membrana, un virus no tiene organelos, citoplasma, etc., solo es material gentico
cubierto por protenas. En este material gentico lleva informacin justa y precisa para
infectar una clula y replicar su material y generar su cubierta proteica, todo el resto que
necesita el virus lo parasita la clula que infecta, en este caso de los retrovirus contiene
un RNA que contiene la informacin un gen que sintetiza una protena que se llama
transcriptasa reversa que es la enzima capaz de sintetizar DNA a partir de RNA. Que no
existe en la naturaleza en ningn otro tipo celular, solamente existe en los retrovirus.
El ciclo ltico (mata la clula husped que parasita, genera una lisis, explota, el mejor
ejemplo son los virus, los herpes uno siente que explota y es efectivamente eso lo que
pasa, la clula explota por la cantidad de virus que contiene) de estos retrovirus. Un virus
fusiona su membrana, sus protenas de su capside a la membrana de la clula que esta
parasitando, e inyecta su contenido gentico al interior de la clula, en este caso el
retrovirus inyecta su RNA y como tiene su transcriptasa reversa a partir de este RNA se
genera una molcula de DNA de doble hebra que entra al ncleo de la clula y se integra
entonces al DNA de la clula husped, y cuando esta clula husped transcriba sus
genes tambin transcribe los gens del virus, cuando la clula husped replique su DNA se
replicara tambin la parte del DNA del virus y de esa manera se multiplica el virus, se va a
transcribir, se van a generar las protenas necesarias para formar dentro de la clula miles
de millones de nuevas partculas virales hasta que la clula se revienta y libera al medio
extracelular miles de partculas virales que infectan otras clulas. Hay dos enfermedades
provocadas por el retrovirus que son tpicas en los humanos el SIDA y el virus
linfotrpicos de clulas T humanas, que son dos tipos de virus que infectan linfocitos,
afectan el sistema inmune de los individuos que atacan por eso la gente son SIDA es
inmunodeprimida, por que las clulas del sistema inmune estn infectadas por estos virus,
generalmente mueren por neumonitis u otra cosa.

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