INTRODUCCIN AL METABOLISMO

Metabolismo: conjunto de reacciones qumicas que ocurren en un ser vivo.

El metabolismo se organiza en rutas metablicas, que pueden ser centrales o del me
tabolismo
secundario.
El metabolismo se divide en metabolismo intermediario y metabolismo informaciona
l.
Catabolismo: conjunto de reacciones de degradacin.
Anabolismo: conjunto de reacciones de sntesis.
De dnde viene la materia y la energa que se usa en el metabolismo?
o
Rutas principales del metabolismo: Gluclisis/gluconeognesis, fermentaciones, ciclo
de Krebs,
fosforilacin oxidativa, degradacin/sntesis de polisacridos, degradacin/sntesis de
aminocidos y lpidos.
Relaciones energticas entre
rutas catablicas y
anablicas. Las rutas
catablicas suministran
energa qumica en forma de
ATP. NADH, NADPH y
FADH2. Estos
transportadores de energa se
utilizan en las rutas
anablicas para convertir
precursores pequeos en
macromolculas celulares.
Las rutas anablicas y catablicas complementarias siguen vas diferentes puesto que a
mbas:
1) deben ser exergnicas,
2) han de ser controladas independientemente
3) han de prevenirse los ciclos intiles.
La viabilidad termodinmica de las reacciones metablicas es determinada por el incr
emento de
energa libre (.G), que podemos calcular a partir del incremento de energa libre es
tndar (.G).
1

aA + bB . cC + dD
[C]c [D]d
.G = .G + RT ln -------------;
[A]a [B]b
[C]eq [D]eq
0 = .G = RT ln --------------- .G = - RT ln Keq
[A]eq [B]eq
Aunque los valores de .G para dos reacciones que se suman en una tercera son aditi
vos, la Keq para una
reaccin que es la suma de otras dos reacciones es el producto de los valores de Ke
q individuales. Ejemplo:
(1) Glucosa + Pi . glucosa 6-fosfato + H2O .G = 13,8 Kj / mol
(2) ATP + H2O . ADP + Pi .G = - 30,5 Kj / mol
Suma: ATP + glucosa . ADP + glucosa 6-fosfato .G = 13,8 Kj/mol + (- 30,5 Kj/mol) =
- 16,7 Kj / mol
[glucosa 6-fosfato]
Keq 1 = --------------------------- = 3,9 x 10-3 M-1
[glucosa] [Pi]
[ADP] [Pi]
Keq 2 = ---------------- = 2 x 105 M
[ATP]
[glucosa 6-fosfato] [ADP] [Pi]
Keq 3 = -------------------------------------- = (Keq1) (Keq2) = (3,9 x 10-3 M-1) x
(2 x 105 M) = 7,8 x 102
[glucosa] [Pi] [ATP]
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La variacin de energa libre estndar en la hidrlisis del ATP es grande y negativa

Cul es la base estructural del elevado potencial de transferencia de fosforilos de
l ATP?
1) La hidrlisis al causar la separacin de cargas, elimina la repulsin electrosttica
entre las cuatro cargas
negativas del ATP.
2) El fosfato inorgnico liberado por la hidrlisis est estabilizado por
e un hbrido de
resonancia, en el que cada uno de los enlaces P-O tiene el mismo grado de
de doble enlace mientras
que el in hidrgeno no est asociado de manera permanente con ninguno de
En los fosfatos
implicados en enlaces anhidro o ster tiene lugar tambin un cierto grado
izacin por resonancia
pero son posibles menos formas de resonancia que para el Pi.

la formacin d
carcter
los oxgenos.
de estabil

3) El ADP2- producido en la hidrlisis se ioniza inmediatamente, liberando un protn

a un medio de [H+] muy
baja (pH = 7).
4) El mayor grado de solvatacin (hidratacin) de los productos Pi y ADP con relacin
al ATP, que estabiliza
an ms los productos con relacin a los reactivos
3

Energa libre de hidrlisis del ATP dentro de las clulas

Eritrocitos
[ADP] [Pi]
.Gp = .G + RT ln -------------;
[ATP]
(2,5 x 10-4) (1,65 x 10-3)
.Gp = - 30.500 J/mol + (8,315 J/mol . K) (298 K) ln -------------------------------- =
2,25 x 10-3
-30.500 J/mol + (2,480 J/mol) ln (1,83 x 10-4) = - 30.500 J/mol
51.800 J/mol

21.300 J/mol = -

.Gp = - 51,8 Kj/mol

Una reaccin de sustitucin
nucleofilica. Un nuclefilo rico en
electrones (Z) ataca un centro pobre en
electrones (por ejemplo un tomo de
carbono) y desplaza un grupo
nucleoflico (W) que se denomina
grupo saliente.
Dos clases de de reacciones de
sustitucin nucleoflica. (a) SN1: el
grupo saliente (W) se lleva un electrn
del enlace, dejando un carbocatin,
antes de que llegue el nuclefilo
atacante (Z). (b) SN2: el nuclefilo
atacante (Z) se acerca a un lado del
carbono electroflico mientras que el
grupo que se elimina (W) permanece
unido al otro lado, lo que resulta en un
intermedio pentacovalente transitorio.
La salida de W deja al compuesto
sustituido con una configuracin
completamente invertida del carbono
que reacciona.
El ATP proporciona energa por transferencia de grupo y no por simple hidrlisis
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Reacciones de desplazamiento
nucleoflico del ATP Cualquiera de los
tres tomos de P (a, o .) puede servir
como diana electroflica para un ataque
nucleoflico en este caso, por el
nuclefilo marcado R-18 O:-. El
nuclefilo puede ser un alcohol (ROH),
un grupo carboxilo (RCOO-) o un
fosfoanhidrido (un nuclesido mono- o
difosfato, por ejemplo). (a) Cuando el
oxgeno del nuclefilo ataca la posicin
., se marca el oxgeno enlazante del
producto, lo que indica que el grupo
transferido desde el ATP es un fosforilo
(-PO3
2-), no un fosfato (-OPO3
2-). (b) El
ataque sobre la posicin desplaza
AMP y conduce a la transferencia de un
grupo pirofosforilo (no pirofosfato) al
nuclefilo. (c) El ataque sobre la
posicin a desplaza PPi y transfiere el
grupo adenililo al nuclefilo.
Transferencia de fosforilo. Ejemplo.
Hidrlisis del ATP en dos pasos. La contribucin del
ATP a una reaccin se muestra a menudo como un
nico paso (a), pero es casi siempre un proceso en
dos pasos, tal como el que se muestra aqu para la
reaccin catalizada por la glutamina sintetasa
dependiente de ATP (b). (1) Se transfiere
inicialmente un grupo fosforilo desde el ATP al
glutamato y a continuacin (2) el grupo fosforilo es
desplazado por NH3 y liberado como Pi
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Transferencia de pirofosforilo. Ejemplo

Transferencia de adenililo. Ejemplo.
Reaccin de adenilacin en la activacin
de un cido graso. Los dos enlaces
fosfoanhidros del ATP se rompen
finalmente en la formacin del palmitoilcoenzima
A. En primer lugar, el ATP
dona adenilato (AMP), formando el acil
graso adenilato y liberando PPi, el cual es
hidrolizado por la pirofosfato inorgnico
hidrolasa. El grupo acil graso
energizado se transfiere seguidamente
al coenzima A (CoASH), con el que
forma un enlace tioster que conserva
parte de la energa invertida del ATP.
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Otros compuestos que tambin tienen energas libres de hidrlisis elevadas

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Clasificacin de los compuestos

biolgicos fosforilados segn sus
energas libres estndar de hidrlisis.
Se muestra el flujo de grupos
fosforilos representados por P, desde
donadores de elevada energa va
ATP hasta molculas aceptoras (tales
como glucosa y glicerol) para formar
sus derivados fosfato de baja
energa. Este flujo de grupos
fosforilo, catalizado por enzimas
denominados quinasas, transcurre
con una prdida global de energa
libre en las condiciones
intracelulares. La hidrlisis de los
compuestos fosfato de baja energa
libera Pi, que tiene un potencial de
transferencia de grupo fosforilo an
menor.
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Reacciones de oxidacin-reduccin: El flujo de electrones realiza trabajo

Estados de oxidacin del carbono en la biosfera
Cuando un tomo de carbono comparte un par de
electrones con otro tomo, lo comparte de manera
desigual a favor del tomo ms electronegativo.
Orden de electronegatividad creciente:
H < C < S < N < O
Los estados de oxidacin se ilustran con algunos
compuestos representativos. Observe el carbono en
rojo y sus electrones enlazantes. Cuando este tomo
est enlazado al tomo de hidrgeno, menos
electronegativo, ambos electrones enlazantes (en
rojo) se asignan al carbono. Cuando el carbono est
enlazado a otro carbono, los electrones enlazantes se
comparten por igual, de forma que uno de los dos
electrones se asigna al carbono en rojo. Cuando el
carbono en rojo est unido al tomo de oxgeno, ms
electronegativo, los electrones enlazantes se asignan
al oxgeno. El nmero a la derecha de cada
compuesto es el nmero de electrones que
pertenecen al carbono en rojo, una expresin
aproximada del estado de oxidacin de este carbono.
Cuando el carbono en rojo se oxida (pierde
electrones), el nmero se hace menor. Por tanto el
orden del estado de oxidacin creciente es alcano <
alqueno < alcohol < alquino < aldehdo < cetona <
cido carboxlico < dixido de carbono. No en todas
las reacciones biolgicas de oxidacin-reduccin
interviene el carbono. Por ejemplo, en la conversin
de nitrgeno molecular en amonico:
6H+ + 6e-+ N2 . 2 NH3
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En las oxidaciones biolgicas interviene con frecuencia la deshidrogenacin

Los electrones se transfieren de una molcula (donador de electrones) a otra (acep
tor de electrones) de cuatro
formas diferentes:
1) Directamente como electrones.
El par redox Fe2+ / Fe3+ puede transferir un electrn al par Cu+ / Cu2+
2) En forma de tomos de hidrgeno
AH2 . A + 2e-+ 2H+
AH2 + B . A + BH2
3) En forma de in hidruro (: H-)
4) A travs de una combinacin directa con el oxgeno. El oxgeno se combina con un redu
ctor orgnico
y se incorpora de forma covalente, tal como sucede en la oxidacin de un hidrocarb
uro a alcohol:
R-CH3 + O2 . R-CH2-OH
Las reacciones de oxidacin-reduccin se pueden describir en forma de semirreaccione
s:
Fe2+ + Cu2+ . Fe3+ + Cu+ (oxidacin del in ferroso por el in cprico)
Semirreacciones
(1) Fe2+ . Fe3+ + e -(par redox conjugado)
(2) Cu2+ + e -. Cu+ (par redox conjugado)
Las transferencias de electrones en las reacciones de oxido reduccin de los compu
esto orgnicos no difieren
de las especies inorgnicas. Veamos la oxidacin de un azcar reductor por el in cprico.
Reaccin de Fehling. Oxidacin del
carbono anomrico de la glucosa. El in
cuproso en medio alcalino forma un
precipitado rojizo de xido cuproso
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H+ + e .
H2 (gas)
Los potenciales de reduccin son una medida de la afinidad por los electrones
Medicin del potencial de reduccin estndar
(E) de un par redox. Los electrones fluyen desde
el electrodo de ensayo al electrodo de referncia, o
viceversa. En ltimo trmino la semicelda de
referencia es el electrodo de hidrgeno, tal como
se muestra aqu. La fuerza electromotriz (fem) de
este electrodo se toma como 0,00 V. A pH 7.00,
E del electrodo de hidrgeno es
0,414 V. La
direccin del flujo de electrones depende de la
presin o potencial electrnico relativo de las
dos celdas. Un puente salino que contiene una
disolucin saturada de KCl proporciona una va
para el movimiento de contraiones entre la celda
de ensayo y la celda de referencia. A partir de la
fem observada y la fem conocida de la celda de
referencia, se obtiene la fem de la celda de ensayo
que contiene el par redox. Por convencin, la
celda que gana electrones tiene el potencial de
reduccin ms positivo.
Potencial de reduccin de una semicelda. Ecuacin de Nernst, que relaciona el potenc
ial de reduccin
estndar (E) con el potencial de reduccin (E) a cualquier concentracin de especies oxi
dadas y reducidas
en la celda:
RT [aceptor electrones]
E = E + -------ln --------------------------n F [donador electrones]
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12

Relacin entre potenciales de reduccin y energa libre

.G = - n F .E, o .G = - n F .E
Consideremos la reaccin en la que el acetaldehdo es reducido por el NADH:
Acetaldehdo + NADH + H+ . etanol + NAD+
Las semirreacciones y sus valores de E son:

(1) Acetaldehdo + 2 H+ + 2 e-. etanol E = - 0,197 V

(2) NAD+ 2 H+ + 2 e-. NADH + H+ E = - 0,320
Por convencin, .E se expresa como E para el aceptor de electrones menos E para el do
or de
electrones. En el ejemplo el acetaldehdo es el aceptor y el NADH el donante. Por
tanto:
.E = - 0,197 V
(- 0,320 V) = 0,123 V, y n es 2.
Entonces .G = - n F .E = - 2 ( 96,5 KJ/V.mol) (0,123 V) = - 23,7 KJ/mol
Esta es la variacin de energa libre para la reaccin de oxido-reduccin a pH 7 cuando
sustratos y productos
estn a una concentracin de 1 M.
Si se tratara de concentraciones diferentes como: acetaldehdo y NADH a 1M, pero e
l NAD+ y etanol
estuvieran a 0,1 M; el valor de .G se calculara de la siguiente manera: Primero s
e determinan los valores de
E para los dos pares redox conjugados.
RT [Acetaldehdo]
E acetaldehido = E + ------ ln ---------------------n F [Etanol]
0,026 V 1,0
= - 0,197 V + -------------- ln ----- = - 0,167 V
2 0,1
RT [NAD+]
E NADH = E + ------ ln -------------n F [NADH]
0,026 V 0,1
= - 0,320 V + ------------ ln ------ = - 0,350 V
2 1.0
A continuacin se utiliza .E para calcular .G:
.E = - 0,167 V (- 0,350 V) = 0,183 V
.G = - n F .E
= - 2 (96,5 KJ / V.mol) (0,183 V) = - 35,3 KJ /mol
As es posible calcular la variacin de energa libre para cualquier reaccin redox biolg
ica a cualquier
concentracin de los pares redox.
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Transportadores universales de electrones

1) Coenzimas hidrosolubles: NAD+ y NADP+, FMN y FAD
2) Quinonas liposolubles (membranas): Ubiquinona y plastoquinona (tambin donadore
s de protones)
3) Protenas ferro-sulfuradas y citocromos.
Bencenoide Quinoide
(b)
NAD y NADP (a) El dinucletido de nicotinamida y adenina (NAD+) y su anlogo fosfori
lado NADP+ se
reducen a NADH o NADPH, aceptando un in hidruro (dos electrones y un protn) a part
ir de un sustrato
oxidable. El in hidruro se puede adicionar en la parte frontal (cara A) o posteri
or (cara B) del anillo plano de
nicotinamida. (b) Espectro de absorcin UV del NAD+ y del NADH. La reduccin del ani
llo de nicotinamida
produce una nueva banda de absorcin, ancha, con un mximo a 340 nm. La produccin de
NADH durante la
oxidacin catalizada enzimticamente puede seguirse de forma conveniente observando
la aparicin de la
absorbancia a 340 nm; e340 = 6.200 M-1cm-1
AH2 + NAD+ . A + NADH + H+
A + NADPH + H+ . AH2 + NADP+
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Las flavoprotenas contienen nucletidos de flavina unidos fuertemente

Estructuras de FAD y FMN oxidados y reducidos. El FMN
consiste en la estructura que se muestra por encima de la
lnea a trazos en la estructura oxidada (FAD). Los
nucletidos de flavina aceptan dos tomos de hidrgeno
(dos electrones y dos protones) que aparecen ambos en el
sistema anular de la flavina. Cuando el FAD o el FMN
aceptan un solo tomo de hidrgeno, se forma la
semiquinona, que es un radical libre estable.
.
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