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Bioqumica

Las reacciones bioqumicas son las reacciones que ocurren en los organismos vivos, y son
distintas de las del mundo de la qumica (inanimado).Constan de las siguientes caractersticas:
Ocurren a temperaturas constantes, en los seres humanos, por eemplo, es de !"# (con una
peque$a variaci%n), &uera de la cual se genera una incompatibilidad con la vida.
La presi%n tambi'n debe ser constante.
Los reactantes del mundo de la bioqumica son, en general, e(clusivos, como protenas, )cidos
grasos, gl*sidos (glucosa), nucle%tidos, etc., todas las cuales se denominan biomol'culas. +ay
e(cepciones, como el agua.
Las mol'culas de la bioqumica son de gran peso molecular, por lo que se denominan
macromol'culas, lo que tambi'n las di&erencia de las mol'culas de la qumica.
Las reacciones bioqumicas ocurren a alta velocidad, condici%n para una compatibilidad con la
vida. ,sto es posible gracias a las en-imas.
Las reacciones bioqumicas son reguladas y regulables de acuerdo a ciertas circunstancias. .e
puede regular, por eemplo, la cantidad y velocidad de producci%n de insulina de acuerdo a la
cantidad de glucosa presente en la sangre.
/oda reacci%n bioqumica implica un cambio. 0l organismo llegan una serie de sustancias
(nutrici%n), como sales, agua, gl*cidos, etc.1 y salen de 'l (e(creci%n) otras distintas: urea, CO2,
)cido *rico. ,sto evidencia la presencia de cambios. ,stos cambios se involucran en el concepto de
metabolismo.
,n el metabolismo se distinguen 2 conceptos:
.ntesis o anabolismo.
3egradaci%n o catabolismo, donde se obtiene energa para la sntesis.
Las biomol'culas son caractersticas de cada organismo. 0s, las protenas de un rat%n son
distintas a las humanas. Lo importante son los elementos que las &orman, en el caso de las protenas,
los amino)cidos.
MACROMOLCULAS
4eneralmente son biomol'culas, aunque no todas. Las biomol'culas son: gl*cidos, protenas, lpidos
y )cidos nucleicos, todas ellas &ormadas de peque$as mol'culas que se untan, o sea, son polmeros
de unidades &undamentales (llamadas tambi'n sillares o ladrillos de construcci%n).
GLCIDOS
Los &undamentales son: glic%geno, almid%n y celulosa.
,stos son macromol'culas, pero tambi'n hay micromol'culas, como la lactosa. La unidades
&undamental que los &orma es la glucosa. La lactosa est) &ormada por una unidad de glucosa y otra
de galactosa (es un disac)rido). ,l glic%geno y las dem)s macromol'culas tienen miles de miles de
mol'culas de glucosa (polisac)rido). ,l gluc%geno est) en los animales1 el almid%n y la celulosa, en
los vegetales.
.on mol'culas necesarias y se recurre a ellas a trav's de la nutrici%n. ,n toda dieta debe ir glic%geno
y almid%n (la celulosa se ingiere pero no nutre, s tiene &ibras).
La glucosa se une a otra mol'cula de glucosa a trav's de los carbonos 567, liberando una mol'cula
de agua, llamadas uniones glucosdicas. /ambi'n puede haber una uni%n en los carbonos 568 y las
siguientes de esa rama, en 567. 3e esta &orma se crea un polmiero rami&icado.
,steban 0rriagada
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Bioqumica
,l hombre necesita en la dieta almid%n, glic%geno y disac)ridos. ,stos elementos entran al
organismo en sus unidades de glucosa. La degradaci%n en glucosa se llama digesti%n. ,n el caso de
los gl*cidos esto ocurre en el intestino delgado gracias a las encimas digestivas, una de las cuales se
denomina amilasa pancre)tica.
La glucosa es una mol'cula necesaria. 9na ve- en el L,C, pasa la membrana celular (ver esquema).
:ara ser utili-ada la mol'cula de glucosa, debe trans&ormarse a trav's de muchas vas, o sea, se va a
metaboli-ar.
La primera trans&ormaci%n que le ocurre es trans&ormarse en glucosa686&os&ato,
gracias a la adici%n de &os&ato de un 0/:, que queda como 03:. ,sta trans&ormaci%n se llama
activaci%n de la mol'cula de glucosa, para trans&ormarse en una mol'cula reactiva (la glucosa es
poco reactiva).
La glucosa686&os&ato se polimeri-a y trans&orma en glic%geno. ,sto ocurre cuando no
se necesita la glucosa, entonces se guarda. :ero no se puede guardar glucosa ni glucosa686
&os&ato. La glic%genog'nesis implica guardar glucosa y liberar grupos &os&ato.
Cuando se necesita glucosa, se degrada glic%geno en glucosa (glicogenolisis), la
glucosa hay que degradarla, &orm)ndose 2 triosas, hasta 2 piruvatos (ver esquema). 3egradar
glucosa686&os&ato implica liberar energa. /odos los procesos biol%gicos cuestan energa. La
degradaci%n hasta piruvato se llama glucolisis.
,l piruvato entra a la mitocondria, degrad)ndose hasta 2 mol'culas, que son CO2 y
agua. 0s la glucosa se ha degradado completamente. ,ste proceso ha dado como resultado la
&ormaci%n de varias mol'culas de 0/:, lo que signi&ica la aparici%n de energa.
/odos los procesos biol%gicas implican consumo de energa. ,l cerebro es un gran consumidor de
energa, tanto que las c'lulas cerebrales no trans&orman glucosa en glic%geno. 9no de los procesos
cerebrales m)s consumidores de energa es el sentido de la vista, por lo que se dice que es
enderg%nico (necesita de mucha energa). ,n cambio, la degradaci%n de glucosa es e(erg%nica.
(La glicog'nesis y la glicolisis son llamadas vas metab%licas.)
3esde el ciclo ctrico sale el CO2, y el piruvato se trans&orma en 0cetil6Co0.
LIPIDOS
.on macromol'culas &ormadas por una unidad &undamental que se repite: )cido graso. 0dem)s de
este denominador com*n, e(isten otros elementos m)s.
;ientras m)s dobles enlaces tenga, el material lipdico se va haciendo m)s lquido, y viceversa. ,l
aceite, por eemplo, tiene abundancia de )cidos grasos con dobles enlaces1 en las grasa s%lidas hay
abundancia de )cidos grasos sin dobles enlaces, por tanto, con m)s hidr%geno.
,n la glicerina (! carbonos) se unen ! )cidos grasos. ,sto se llama trialcilglic'rido (/04). .i tiene 2
)cidos grasos, 304, y si tiene 5, ;04. Lo m)s abundante en la dieta son los /04.
Otro lpido es un colesterol unido a un )cido graso.
Otro lpido es cuando la glicerina tiene 2 )cidos grasos y un &os&oro y un nitr%geno, lo que se llama
&os&olpido.
La digesti%n est) a cargo de las lipasas, producto del p)ncreas. 9na ve- dentro de la c'lula,
reacciona con 0/: y con 0cil6Co0 (0cil coen-ima 0). ,sto es para activarlo, porque el )cido graso
no es reactivo. Luego se puede &ormar /04 o &os&olpido. ,sta sntesis ocurre cuando no se necesita
energa. ,sto puede volver a ser 0cil6Co0, y 'ste entra a la mitocondria, donde se va a degradar en
el ciclo ctrico, con la &ormaci%n de 0/:. ,ste mecanismo se llama lipolisis, es e(erg%nico y se
producir) cuando se necesita liberar energa. ,l mecanismo en que la mitocondria sinteti-a 0cido
graso (ver esquema) se reali-a cuando se est) en reposo1 es enderg%nico porque requiere de energa,
pero en una magnitud muy in&erior a la obtenida cuando se degrada.
,steban 0rriagada
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Bioqumica
9nidades que se repiten <unciones
4l*cidos glucosa energ'tica
Lpidos )cidos grasos energ'tica, estructural (en las membranas est)n
presentes los &os&olpidos)
:rotenas amino)cidos multi&uncionales (en-imas, membranas, transporte)
0cidos nucleicos nucle%tidos in&ormaci%n: contenerla, preservarla y trasladarla.
Cada una de estas mol'culas generalmente las sinteti-a el organismo. :or eemplo, la necesidad de
gl*cidos se satis&ace en la dieta a partir de las &uentes nutricionales1 el organismo toma estos
polmeros de glucosa los digiere y construye los gl*cidos propios para el organismo. Lo mismo pasa
con los lpidos, protenas y )cidos nucleicos.
Cualquier hepatocito va a tener glucosa, la que puede venir desde la dieta (la mayora) o de la
sntesis de la propia c'lula. Lo mismo pasa con los lpidos1 los &os&olpidos que &orman la membrana
pueden venir de la dieta o ser sinteti-ados por el organismo. Lo mismo para los amino)cidos, pero
algunos no los puede hacer el organismo, llamados esenciales (para el hombre, pero no para un pe-,
por eemplo), hay otros inesenciales. ,n el caso de los nucle%tidos, la mayora son sinteti-ados por
el organismo.
Cuando se degrada algo para su uso, hay que restituirlo, lo que usti&ica el tener que alimentarse
constantemente.
PROTENAS
1. ESTRUCTURA
,st)n hechas sobre la base de unas unidades que se denominan amino)cidos (5). La variaci%n del
redical =>? va a dar origen a los distintos amino)cidos, puede ser +, tener un grupo a-u&rado,
arom)tico, un grupo O+, un grupo carbo(ilo (caso en el que sera dicarbo(lico), amino)cido
(resultando monocarbo(ilico diamonado). /ienen la posibilidad de unirse unos (2) con otros gracias
a un grupo )cido de uno de ellos y un grupo )mino del otro, perdi'ndose una mol'cula de agua y se
establece una uni%n entre carbono6nitr%geno, llamada uni%n peptdica (resistente), semi o casi de
doble enlace (por lo que esa parte no puede rotar). 0l unirse ! amino)cidos hablamos de un
trip'ptido (con 2 uniones peptdicas), y as hasta polip'ptido. Cuando este polip'ptido alcan-a un
cierto peso molecular de m)s o menos @.AAA (promedio :; de amino)cidos 5AA), hablamos de una
protena.
+ay protenas &ormadas e(clusivamente por amino)cidos, llamadas simples. Las compleas est)n
unidas a otras estructuras:
unidas a metales, como la hemoblobina que tiene &ierro.
glucoprotenas: unidas a glucosa
lipoprotenas
nucleoprotenas, asociadas a estructuras de los )cidos nucleicos.
,steban 0rriagada
!
+
2
B C COO+
>
+ 5
C +
2
B C C
>
+
B COO+
>
+ 2
+
O
C
+
!
B C COO
>
+ !
Bioqumica
(ver amelogeninaD)
,n la naturale-a los amino)cidos no est)n como aparece en el esquema (5), sino de una &orma que
tiene cargas el'ctricas (!), por lo que un amino)cido es un i%n bipolar, porque puede llegar a tener
dos polos. Eue el amino)cido se presente con dos o una carga depende de:
.i est) en agua se presenta como dipolar
.i el medio es )cido, por tanto con m)s protones, llenar)n el grupo carbo(ilo deando
s%lo cargado el grupo amino positivamente.
.i agregamos una soluci%n b)sica (medio alcalino), neutrali-an el prot%n del grupo
amino, deando el grupo carbo(ilo cargado negativamente.
:or tanto, el comportamiento de un amino)cido va a depender del medio en que se encuentre. +ay
un p+ (C") en que se encontrar) con carga neta igual a cero, llamado punto isoel'ctrico. Baando el
p+, el amino)cido se carga positivamente1 sobre el punto isoel'ctrico los amio)cidos se cargan en
&orma negativa.
.i un amino)cido tiene un radical cargado, por eemplo, negativamente, no est) en su punto
isoel'ctrico, sino sobre 'l1 para que est' en el punto isoel'ctrico hay que agregar )cido. :ara este
amino)cido el punto isoel'ctrico est) en un p+ bao " ()cido).
Otro amino)cido (lisina) con un segundo grupo amino, est) bao el punto isoel'ctrico por el
predominio de cargas positivas, para neutrali-ar una de estas cargas hay que agregar una soluci%n
b)sica. :ara este amino)cido el punto isoel'ctrico est) a un p+ sobre " (b)sico).
0l tener una me-cla de amino)cidos a p+ " habr) amino)cidos en el punto isoel'ctrico, otros con
cargas positivas y otros con cargas negativas.
,sto es lo que se conoce como comportamiento el'ctrico de los amino)cidos.
/rasladando esto a una protena, las uniones peptdicas no se pueden cargar, por lo que las
posibilidades de cargarse estar)n en los e(tremos y en los radicales. 9na protena de 5AA
amino)cidos tiene un m)(imo de 5A2 grupos cargables (las cargas de los grupos de los e(tremos y
las de los radicales) y un mnimo de 2 (s%lo los e(tremos). :or tanto una protena es un poli6i%n. La
protena tambi'n tienen un punto isoel'ctrico donde se igualen las cargas y un punto bao el
isoel'ctrico.
,L,C/>O<O>,.F.
,s una manera de separar las protenas aprovechando las cargas el'ctricas de ellas de acuerdo al
medio en que se encuentren (p+), coloc)ndolas en un campo el'ctrico que permite su migraci%n o
no migraci%n en uno u otro sentido. 3espu's de un tiempo la corriente se corta y se determina
cuanto han migrado las protenas de la me-cla. La velocidad de migraci%n depender) de cuan leos
est' la protena del punto isoel'ctrico, mientras m)s aleada este, migrar) m)s.
La electro&oresis permite cuanti&icar la cantidad de protenas que se encuentran en una me-cla. 9n
densitograma mide la densidad o concentraci%n de cada una de las protenas.
Le electro&oresis del suero sanguneo tiene un per&il determinado, lo que permite compararla con el
de un paciente determinado. ,n la sangre hay normalmente una peque$a cantidad de en-imas
provenientes, por eemplo, del hgado, porque las c'lulas se renuevan permanentemente1 pero si esta
en-ima se encuentra e(ageradamente en la sangre, signi&ica que las c'lulas del hgado se est)n
destruyendo anormalmente.
,steban 0rriagada
7
Bioqumica
,./>9C/9>0 :>F;0>F0:
.e con&orman de acuerdo a un orden de amino)cidos, uni'ndose a trav's de uniones peptdicas. ,l
orden en que se encuentren los amino)cidos es &undamental, y est) comandado por el material
gen'tico. 0s la estructura de la hemoglobina est) in&ormada en un gen, para trasladar esa
in&ormaci%n al lugar de la sntesis proteica se crea un m>B0 que va al ribosoma. ,sto es tan estricto
que si est) da$ado el material gen'tico y se altera un amino)cido se crea una hemoglobina anormal
que no &unciona, mutaci%n que a veces no es compatible con la vida (albinismo, hemo&ilia).
,./>9C/9>0 .,C9B30>F0:
,nrollamiento denominado al&a h'lice (resorte)
:liegue sobre s mismo denominado estructura B plegada.
+ay enlaces espec&icos que estabili-an la &ormaci%n de estas estructuras: los puentes de hidr%geno.
.e establece entre las mol'culas de carbono y o(geno, ambas mol'culas tienen a&inidad con el
hidr%geno del o(geno, comparti'ndolo sin quedarse con 'l.
,./>9C/9>0 /,>CF0>F0
:legamientos en las ! dimensiones del espacio. .e estabili-a a trav's de:
9niones el'ctricas o salinas: grupos cargados en la cadena que se atrae por tener cargas opuestas.
9niones hidro&%bicas: las protenas est)n en estado natural disueltas en agua1 el radical
arom)tico de ciertos amino)cidos tiene repulsi%n por el agua, por lo que tiende a untarse con
otro grupo hidro&%bico para alearse del agua.
<uer-as de GanderHalls
9niones que se producen entre 2 amino)cidos cuyos radicales tengan grupos .+: puente
disul&uro. .i uno agrega protones, desaparece este puente.
,./>9C/9>0 C90/,>B0>F0.
9na subunidad se unta con otras m)s, cada una de las cuales tiene estructura primaria, secundaria y
teriaria. :ero para que la protena &uncione bien, necesitan estar las 7 unidas. Las subunidades no
necesariamente deben ser iguales. La hemoglobina est) &ormada por 7 subunidades, dos cadenas al&a
y dos cadenas beta.
9na protena sin estructura cuaternaria no est) &ormada necesariamente por una sola cadena. La
subunidad puede estar &ormada por dos cadenas, lo que no signi&ica que la mol'cula tenga estructura
cuaternaria.
3,.B0/9>0LFI0CFJB , +F3>OLF.F.
9na protena que se encuentra en su naturale-a se dice que est) en estado nativo. .i se estira y dea
lineal, el &en%meno se llama denaturali-aci%n y la protena pierde su &unci%n biol%gica. ,l agente
denaturali-ante puede ser temperatura, )cidos, bases, etc.
Lo que se conserva es la estructura primaria, la que puede desaparecer en &orma parcial (quedando
p'ptidos) o total (amino)cidos), para ello se rompen uniones peptdicas, lo que se llama hidr%lisis
proteica o proteolisis, proceso que es irreversible. +ay agentes de proteolisis: )cidos o bases muy
&uertes y muy concentrados, a altas temperaturas, etc1 y en-imas (estas usa el organismo).
,steban 0rriagada
@
Bioqumica
+ay un m'todo para separar las protenas basado en el tama$o de ellas. Consiste en colocar me-cla
de protenas en un dep%sito que contiene un conunto de mol'culas llamadas sephade(, material
poroso que sobre una estructura rgida presenta una serie de poros. Las protenas se retienen en los
poros y pueden salir a trav's de una corriente. Las que no se retuvieron salen primero, luego, de las
retenidas, salen de la m)s grande a las m)s chicas. ,sto se recolecta en tubos de ensayo.
/area: ver 0melogenina.
<9BCFOB,.
Lo que m)s o *nico que caracteri-a a los seres vivos son las protenas. :or eemplo, las protenas de
la piel del caballo son distintas de las de la piel del hombre.
,./>9C/9>0L: &ormando partes de membranas o piel, pelo, etc. ,: col)geno.
<9BCFOB,. 3, />0B.:O>/,: hemoglobina, por la sangre se transportan lpidos
(lipoprotenas), otras protenas transportan metales. +ay protenas de transporte intracelular.
3,<,B.0: como los anticuerpos, las protenas de la coagulaci%n (que nos de&ienden de una
hemorragia).
,BIF;0.: todas las en-imas son protenas. ,K: e(oquinasa.
+O>;OB0L: algunas hormonas tienen caracter proteico.
B9/>FCFJB: como las protenas de la leche materna.
Las protenas son, por tanto, espec&icas, esto es, sirven e(clusivamente para una &unci%n
determinada.
,steban 0rriagada
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Bioqumica
FORMAS IONICAS DE LOS AMINOCIDOS
Las &ormas i%nicas de los amino)cidos son muy variadas y dependen de la estructura y del medio en
que se encuentren.
Cuando las cargas son iguales, est) en su punto isoel'ctrico, lo que es muy poco probable en la
realidad.
,sto ayuda a entender la &unci%n y estructura de las protenas. La con&ormaci%n terciaria y
cuaternaria se debe en gran medida a la presencia de cargas el'ctricas que se atraen. ,sta condici%n
es dable en los organismos superiores, donde no se soportan variaciones de p+. .i la &unci%n de la
protenas es dear un espacio, 'ste se puede conseguir de acuerdo a las cargas1 si baamos el p+,
predominan las cargas positivas y se alterar) su &orma, y con ello su &unci%n.
,steban 0rriagada
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