1

La Biotecnologa mirada
desde la Interdisciplina
Dr. Claudio Martnez Debat
LaTraMA ::: Laboratorio de Trazabilidad Molecular Alimentaria
Seccin Bioqumica. Facultad de Ciencias.
Uniersidad de la !e"#blica
Monteideo. Uru$ua%
clau&'cien.edu.u%


El paradigma
Teora sinttica de la Evolucin / Neodarwinismo
Integracin de la teora de la evolucin de las especies (por seleccin natural, de Darwin),
teora gentica de Gregor endel (como !ase de la "erencia !iolgica),
la mutacin gentica aleatoria (como #uente de variacin)
$ la gentica de po!laciones
Unidad de la evolucin: los genes
Mecanismo de la evolucin: la seleccin

%&a !iologa molecular es
el campo cient#ico
relacionado con el estudio
de las estructuras 'umicas $
procesos de #enmenos !iolgicos
a nivel molecular(
Enciclopedia Britannica

La BM como herramienta integradora
en el campo de la biociencias
Qumica Bioqumica
Biologa Celular
Bioinformtica
Biofsica
BM
Microbiologa
irologa
!nmunologa
"en#tica
$cologa
%aleontologa
&isiologa
$volucin
$tc etc
%rotemica
&sica
"enmica
B'
Matemticas
(stronoma
Dr) *laudio artne+ De!at
,eccin -io'umica $ -iologa olecular
.*/0dela1

Interdisciplina:
Integracin de saberes proveniente de diferentes disciplinas
para el abordaje de problemas multidimensionales.
El concepto interdisciplina es de trabajosa y debatida definicin
como se desprende de la amplia literatura cientfica dedicada a tal intento
Desde las diversas vertientes
que estudian la produccin del conocimiento cientfico
se ha definido a la interdisciplina como
un abordaje, una metodologa o una epistemologa de convergencia.
En diferentes mbitos se le otorg una complejidad
que parece desafiar la posibilidad de definicin.
Esta complejidad del concepto impone desafos especficos
al quehacer interdisciplinario y a su desarrollo

)osalind &ran*lin (3456/78) biofsica,cristalgrafa,
se gradu en la0niversidad de *am!ridgeen 3493,
con estudios de microestructuras delcar!n$ delgra#ito
Este tra!a:o #ue la !ase de su doctorado en 'umica #sica,
'ue o!tuvo en la 0niversidad de *am!ridge en 3497 ,
Maurice -il*ins (343;/5669) fsico. cristalgrafo<
Estudi.sicaen la0niversidad de *am!ridge
$ se doctor en la0niversidad de -irming"am)
=l comen+ar la ,egunda Guerra undialse traslada a
Estados 0nidosen donde tra!a:a en el
>ro$ecto an"attanpara el per#eccionamiento delradar
$ en laseparacin de istoposmediante
espectrgra#o de masaspara construccin de la!om!a atmica
La Carrera por la /oble 0#lice

&rancis Cric* 343; ?5669) /fsico.bilogo molecular
, neurocientfico1, >N medicina 34;5)
Estudi#sicaen el0niversit$ *ollege &ondon,
despus de ser rec"a+ado por la
0niversidad de *am!ridge,
licenci@ndose en *iencias en34ABa los 53 aCos)

En la,egunda Guerra undial, se incorpora en34A4
$ tra!a:a en minas su!marinas magnticas $ acDsticas)
=l terminar la guerra, se interes por la!iologa$ la'umica)
Neuro!iologaE demostr en #orma eFperimental
la transmisin de im@genes #i:as a 76 G+ por la retina al cere!ro,
un aporte #undamental para el conocimiento de la percepcin visual
(portes: /0. dogma de la biologa moderna. cdigo gen#tico

2ames /e3e, -atson , bilogo
(3458/H) >N edicina 3475

Linus %auling (3463/3449) ?fsico.
qumico (estructura de los enlaces 'umicos,
estr) de nDcleo atmico), cristalgrafo. activista poltico.
bioqumico. bilogo molecular. genetista molecular
e investigador m#dico (vitaminas, medicina ortomolecular)
>N Ica 3479, >N >a+ 34;5,
(tra!a: so!re sustitutos delplasma sanguneo durante la JJII,
=utomvil elctrico #ines dcada 76 )

Una estructura tan bonita tiene,
por fuerza, que existir
James D !atson "n #$%&, '( #$)%*

+osalind , -ran.lin "#$%/0#$1&*
"2ing3s 4ollege, Londres*
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

KKit "as not escaped our notice t"at t"e speciLc pairing we
"ave postulated immediatel$ suggests a possi!le cop,ing
mechanism #or t"e genetic material)MM (Jatson and *ricN,
347Aa))
KKit t"ere#ore seems liNel$ t"at t"e precise se'uence o#
t"e !ases is t"e code w"ic" carries t"e genetical
information)MM (Jatson and *ricN, 347A!))


$l cdigo de 4chr5dinger
Erwin ,c"rOdinger 388B?34;3), >N #sica 34AA
What is life?, 3499E
Hgenes contain a KKcode1scriptMM t"at determine
KKt"e entire pattern o# t"e individualMs #uture development
and o# its #unctioning in t"e mature state)MM
!nformacin, Jarren Jeaver (3849?34B8)
The Mathematical Theory of Communication(3494)
Punto a *laude ,"annon (343;?5663)
>"D in t"e KKalge!ra o# t"eoretical geneticsMM
$
Nor!ert Jiener (3849?34;9)
Cibern#tica. retroalimentacin
=lan Turing (3435?3479)
(lgoritmo. computacin. cdigo $nigma. morfog#nesis. &ibonacci

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Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

!e"licacin
5D(
Transcri"cin Traduccin
5+( 'rotena
6 letras 6 letras %/ letras
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.
$l dogma central de la biologa moderna
6Cric*7
$8presin g#nica

genotipo fenotipo

Claudio artne! Debat, "#, $hD

%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

+egulaci7n de la expresi7n g8nica
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

'4+
2 9ullis #$66 ,,UU '( #$$:
Secuenciacin
(enmica
- ;anger #$#& Inglaterra '( #$1& < #$&/
4raig =enter
#$6) ,,UU
=ida 5rtificial
Single Cycle
)C!

"4raig =enter, U;5, n #$6)*
Claudio Martinez Debat, QF, PhD
LaTraMA Laboratorio de Trazabilidad Molecular Ali!entaria
Seccion "io#ui!ica y "iologia Molecular
Facultad de Ciencia$% &ni'er$idad de la (e)ublica%
Monte'ideo% &ruguay%
Tel% (*++5,-./ 5.5 .+ ,5 Fa0 (*++5,-./ 5.5 -1 12

*u+ es un (en,

Hwe o!served an increased overlap o# genic regions) ,ince t"e determination o# genic regions
is currentl$ de#ined !$ t"e cumulative lengt"s o# t"e iso#orms and t"eir genetic association
to p"enot$pic c"aracteristics, t"e liNel$ continued reduction in t"e lengt"s o# intergenic regions
will steadil$ lead to t"e overlap o# most genes previousl$ assumed to !e distinct genetic loci)
T"is supports and is consistent wit" earlier o!servations
o# a "ig"l$ interleaved transcri!ed genome,
!ut more importantl$, prompts the reconsideration of the definition of a gene)
=s t"is is a consistent c"aracteristic o# annotated genomes,
3e 3ould propose that the transcript be considered as the basic atomic unit of inheritance)
*oncomitantl$, t"e term gene would t"en denote a "ig"er/order concept
intended to capture all t"ose transcripts (eventuall$ divorced #rom t"eir genomic locations)
t"at contri!ute to a given p"enot$pic trait)

Definici7n re>isada del flu?o de la Informaci7n @8nica
en ,ucariotas
-ormaci7n de +edes 4omple?as de Interacciones
,structurales, -uncionales < +egulatorias
'D.
'-.
$rotena




EpigenticaE Lamarck is back
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.
lo natural Q lo ad'uirido))


H epigenetic processes pla$ a role in memor$ consolidation
and "elp to transmit ac'uired memories
even across generations in a &amarcNian manner)
Drugs t"at target t"e epigenetic mac"iner$
were #ound to en"ance memor$ #unction in
rodents and ameliorate disease p"enot$pes
in models #or !rain diseases suc" as
=l+"eimerMs disease, *"orea Guntington, Depression
or ,c"i+op"renia)



Arang, @or, Bs, Bon, 4Cimp
;omos monos
$&&D de identidad
gen8tica
con el cCimpanc8

Eodos los seres Cumanos compartimos un
$$$D de identidad gen8tica
Cada ser humano es un mosaico de bloques haplotpicos/
El genoma de cada uno de nosotros contiene
una vasta proporcin
de la variacin gen0tica total encontrada en nuestra especie/
Cada individuo presenta 1234 de la variacin haplotpica
total de nuestra especie

5perrios, 6722,&arsila do 'maral 8699:;67<2=
paradigma del genoma mosaico >ariable
Las razas no estFn caracterizadas por
diferencias gen8ticas fi?as

,vante >Ra!o


,>a
5D( mitocondrial


2arl !ilCem (aundorff "#G&1H0#&61*
!econstruccin -istrica


-eina 'nna de -umania n. 67>2, $aris, $rincesa 'nne 'ntoinette #ran?oise Charlotte de *ourbon;$arma
$rincesa argrethe
de Dinamarca
$rince -en0 de
*ourbon;$arma
*, 1212312-+
4
125+3121.
125131212
1-1.31-5+,
(eina de
"5lgica
1-6+31,.2,
7!)eratriz de
M50ico
1256312,8
1255312,8
12-5312,59
Caroline,
125.31-16

-irmanI Luis 5lfonso de Bourbon < Luis -elipe de Arleans
C
i
-
g

t

C
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-
g

t

L
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N
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a
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i
e



Mi AD. % /



J qu8 Ca< de 5dFnH
,l cromosoma J




-iologa ,inttica

Sida
,inttica



%a c0lula sint0tica creada por el +nstituto @enter, esconde un secreto(
Los creadores han incluido susnombres en el ADN de la clula
!"AI# $%N&%" codificado(
&&''C&'AC&''&A&CA&AC''&&AA'A&'A'A''C'C'A''CA'&&''C&'AC&''
$%N&%"IN'&I&$&%(
&&''C&'AC&''A&'A''''C'CCA''CA''&&''&&C&'CA'&&'CCA&A'C&A'A
&&''C&'AC&''
(A)')I&(( &&''C&'AC&''C'&AC''&A&CA'&A'&&'CCC'C&&''C&'AC&''
!INDIAND!L*D%(
&&''C&'AC&''&AC'&'''CA'C'&CAC&''&A'C&A&C&&&'&A'&A''&&''C&'
AC&''&AAA&CA'&A&&&A'&A&&'&AA'AC'AC''CA'&A&&'CAC'AC'AAAC'A&
CACCC&''''C'''A&&'''C'&C'&A
#LA''AND!L*D%(
&&''C&'AC&''AA&C&'AC&'A&'ACACA''&A'C&ACC&'&'CA'&A'A &&''C&'AC&''

La situaci7n de los A@9s ni>el cientfico

5spectos del tema
EconmicoB$oltico
Cientfico
)alud
edioambiental
*io0tico
)ocial
C

Eodos somos transg8nicos

HT"e K!igM pro!lems o# t"e !rain demand interdisciplinar$
approac"es)
Hdevelopments in t"e parallel #ields o# neuroscience, molecular
!iolog$, immunolog$ and cell !iolog$ (#or eFample, stem cell
!iolog$)H
Ht"e development o# di##erent areas o# associated tec"nologies,
suc" as optogenetics, s$nt"etic !iolog$, nanotec"nologies,
microelectronics and computational anal$sis o# large/scale
datasets)
))) Je are at t"e stage in t"e "istor$ o# neuroscience in w"ic"
eFperiment, t"eor$ and simulation will start to merge) EFcitingT

=llen Institute #or -rain ,cience (0),)=))
0U 766)666)666
-rain =ctivit$ ap (0),)=))

-1=IN Initiative (-rain 1esearc" t"roug" =dvancing

Innovative Neurotec"nologies Initiative))
0U 3)666)666)666 (NIG, N,., D=1>=)
Guman -rain >ro:ect (0)E))

Bienestar Bed7nico >s ,udaim7nicoH
$udaimonia
=utonom$
>ersonal growt"
,el#/acceptance
>urpose in li#e
Environmental master$
>ositive relations wit" ot"ers
C% D% (y::/
The good co!)o$ed o: all good$< an ability =hich $u::ice$ :or li'ing =ell<
)er:ection in re$)ect o: 'irtue< re$ource$ $u::icient :or a li'ing creature
Plat>n/


La 9editaci7n cambia el patr7n de expresi7n g8nica
11 practice en"anced eFpression o# genes associated wit" energ$ meta!olism,
mitoc"ondrial #unction, insulin secretion and telomere maintenance,
and reduced eFpression o# genes linNed to in#lammator$ response and stress/related pat"wa$s)
Interactive networN anal$ses o# 11/a##ected pat"wa$s identi#ied mitoc"ondrial =T> s$nt"ase
and insulin (IN,) as top upregulated critical molecules (#ocus "u!s)
and N./N- pat"wa$ genes as top downregulated #ocus "u!s)
Vur results #or t"e #irst time indicate t"at 11 elicitation, particularl$ a#ter long/term practice,
ma$ evoNe its downstream "ealt" !ene#its !$ improving mitoc"ondrial energ$ production
and utili+ation and t"us promoting mitoc"ondrial resilienc$ t"roug" upregulation o# =T>ase
and insulin #unction) itoc"ondrial resilienc$ mig"t also !e promoted
!$ 11/induced downregulation o# N./N-/ associated
upstream and downstream targets t"at mitigates stress)

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Las 9etFforas en las Biociencias
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

Meta"0ora: traslado1
2m3s all3 de lo que es com#n4
Tro"o que consiste en usar
"alabras con un sentido distinto del "ro"io1
en irtud de una com"aracin t3cita % sutil
5A"licar una6 met3'ora es desi$nar al$o
a tra+s de otra cosa1
mediante un e7ercicio de similitud
% sustitucin entre dos "alabras
Las met3'oras tienen la ca"acidad
de or$anizar los conce"tos
a al ez co$nitia % emocionalmente

%l ADN +genoma, como te-to
%l dogma central de la .iologa )olecular +!ric/,
ADN A"N 0rotena
%-presin gnica:
%l ADN se replica1
se transcribe a A"N1 2ue se traduce a 0rotena.
* seg3n las met4foras mecanicistas:
%l ADN 5fabrica6 A"N 2ue 5fabrica6 0rotena.

AD. 5$enoma6 te8to1 libro1 enciclo"edia1
receta
Bases nitro$enadas letras
Codones "alabras
(enes oracin
9"i$+nesis 2'ormateado4
9etFforas de texto en las Biociencias

9l $enoma
como un
)alim"sesto
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

:tras Met3'oras
Fo8 ;eller1 )aton1 (ri''it0s:
4odificaci7n de la Informaci7n
,mmecCe K Boffme<erI
;emi7ticas o naturaleza0como Llengua?e
Aise:
cuentas de rosario1
AD. e$osta1 AD. basura 5!. Da<=ins6
Condit > Condit:
9Msica, 9apa, DiseNo, +eceta

Nelkin: Mets. 9sencialistas
2los $enes son la esencia
de la identidad "ersonal4
!eli$iosas
2los $enes son entidades sa$radas4
Fatalistas 5'atalismo
2los $enes son 5"redicen6
nuestro destino4
Comerciales
2los $enes son bienes 5commodities64
Met3'oras "ost?$enmicas
"eP5 .++6

4aractersticas de los +eplicadoresI
fidelidad, fecundidad < longe>idad
?
(e)licaci>n de una @n:or!aci>n
?
*
?
Aariaci>n
?
*
?
Selecci>n de una Aariaci>n
?
B
?
7'oluci>nC
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%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

MC 7$cher
Drawing hands
E+5(;9I;IO(
D, L5 I(-A+954IO(
Los replicadoresI
genes,
memes,
priones

:tro re"licador % nueo "aradi$ma del len$ua7e:
Meme
E8rmino acuNado por !ic0ard Da<=ins
"enI ,l @en ,gosta, #$G)*,
por analoga con gene,
que define a un m7dulo de informaci7n
contagioso que infecta < parasita la mente Cumana,
donde se replica < altera su conducta,
pro>ocando su propagaci7n

Unidad de Cerencia cultural +eplicador 9emotipoH
,?emplosI esl7ganes, frases CecCas < melodas
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

Unidad de 0erencia cultural.
Meme
Unidad de imitaci7n
5quello que es imitado
9emotipoH
,?emplosI
esl7ganes,
frases CecCas
< melodas
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

D %os virus informticos se apoyan en los memes
para su propagacin. %as cadenas de e;mails
son ejemplos de memes que utili!an las
triquiEuelas de las amena!as yBo promesas.
97em"los mem+ticos
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

97em"los mem+ticos
D emes F )eG( El seGo es en s mismo un gran
meme, y coevoluciona con los genes. .o as el
celibato, el onanismo y el control de natalidad,
memes que conspiran contra la evolucin de los
genes.
D 'dems eGisten diversos y conspicuos memes,
sobre todo vinculados a las campaEas polticasC
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.

Los orgenes del lengua?e
segMn DaP.ins et al
Q La teora sugiere que el idioma se cre7 como
una manera de me?orar la repetici7n de los
memes aumentando su fidelidad, fecundidad <
longe>idad
Q ,xiste una competencia mem8tica < una co0
e>oluci7n de memes < genes
Q ,l prop7sito del lengua?e es replicar el meme
(uestra gran inteligencia < nuestro lengua?e
Can sido manipulados por los memes
Claudio artne! Debat, "#, $hD
%a&ra' ((( %aboratorio de &ra!abilidad olecular 'limentaria
)eccin *ioqumica. #acultad de Ciencias.
Comisin Directiva Espacio +nterdisciplinario.
,niversidad de la -epublica.ontevideo. ,ruguay.


Be'8, %//6
5rs R
;cientis


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ECe @reat 9asturbator
in a ;urrealist Landscape
PitC D(5 #$1GL#$1&
;al>ador Dali, -igueres, #$/60#$&$

Dr Joe Da>is
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9icro>enus
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Dr Bunter AS+eill< ,,UU

Bunter AS+eill<, 5ntCrax 4loc., digital, %//%

,duardo 2ac #$)% Brasil
@enesis, #$$$

2ac, @enesis, #$$$

2ac, 5lba, %///

2ac, Bistoria (atural del ,nigma, ,dunia, %//$

5rs longa >ita bre>is

Q 9ucCas graciasTT
Dr 4laudio 9artnez Debat
LaEra95 III Laboratorio de Erazabilidad 9olecular
5limentaria
;ecci7n Bioqumica -acultad de 4iencias
Uni>ersidad de la +epMblica
9onte>ideo Urugua<
clauUfcieneduu<
5gradecimientosI Be'8, 4omit8 Arganizador IV 44(