Receptor: protena Respuesta: cambio metablico, estructural Clasificacion segn sealizacin: 1. Paracrina: mensajero quimico(ligando), clulas cercanas, difusin por medio extracelular. 2. Autocrina: un caso especial de paracrina.Celula nerviosa es la emisora. Mensajero--- neurotransmisor. Prolongacion nerviosa(presinaptica) hasta celula blanco(postsinaptica) de dos maneras 1) membranas plasamticas en contacto y el mensaje se transmite directamente por corrientes elctricas que alteran el AV y abren canales ionicos 2) sinapsis qumica donde el contacto no es intimo. La neurona libera neurotransmisores al espacio intracelular que se unen a los receptores especificos de la membrana de la celula a la que se le pasara la informacin 3. Endocrina: Mensajero quimico a sangre y a partir de all a celula alejada(cel blanco o diana). Celulas especializadas capaces de fabricar y secretar seales: clulas y glndulas endocrinas y paracrinas y el sistema circulatorio las distribuye. 4. Directa: por uniones que conectan las clulas
Complejo ligando-receptor: respuesta Receptor en : 1)Membrana---- de superficie: Ligando es hidrofilico(no puede atravesar la bicapa) y se genera una transduccin de la seal. 2)Intracelular--- citosol o nucleo: Ligando es hidrofobico 1-Receptores de superficie(protena integral): Ionotropico(canal): ligando---cambio conformacional---pasaje ion. se abre cuando se une un neurotransmisor para dejar pasar la informacin. Son proteinas formadas por varias cadenas(5) que atraviesan varias veces la membrana. Son receptores de neurotransmisores y transducen muy rapido la seal. Catalitico(enzima): el ligando la activa. en general son pptidos. Suelen estar formados por una proteina integral que atraviesa una sola vez la membrana cuyo domino intracelular puede tener actividad enzimtica o estar acoplado directamente a una enzima los mas importantes son los relacionados con la tirosina-kinasas Receptores acoplados a proteina G: capaces de asociarse a una proteina de membrana que liga GTP que a la vez traduce la seal por activacion o inhibicin de otra enzima. Son monomericos y atraviesan la membrana siete veces la membrana. Algunas de las proteinas G(trimerica) son capaces de activar(con GTP el trmero se desarma al disociarse la subunidad ) la enzima adenilato ciclasa que produce el mensajero intracelular AMPc, otras lo inhiben(queda inactiva cuando se une a GDP) y otras activan fosfolipasas que degradan fosfolpidos. Otras actuan sobre canales ionicos modificando su estado. Ligando + receptro:cambio conformacional, por lo que interactua con proteinaG lo que desencadena sua ctivacion: -liberacion de GDP, captacin de GTP(no hay fosforilacion). se disocia y puede traslocarse (desplazarse por membrana) para contactar con un canal, que sufre un cambio conformacional y se abre, o una enzima que se activa o inhibe.La subunidad es la que tiene capacidad GTPasa(degrada GTP,desfosforila, y se rearma el dimero---Prot G inactiva). Con enzima por ejemplo la Adenilato Ciclasa que toma ATP y forma AMPc y PPi.+AMPc----segundo mensajero, se una a una PKA(kinasa:fosforila)por lo que las enximas se activan o inhiben (algunas vas metablicas se activan y otras se frenan) Receptores intracelulares: ligando difunde simplemente.Cambio conformacional donde el complejo Receptor-ligando ingresa al nucleo para trabajar sobre la expresin gnica(prmuevo o inhibo transcripcin gnica).ligando hidrofobico ej: derivados del colesterol y corticoesteroides. TRANSDUCCION DE LA SEAL: la respuesta a una seal del tipo de un neurotransmisor esta medida por un receptor de membrana cuya activacion producira cambios en la concentracion de algun mensajero intracelular que finalmente actuara sobre una proteina kinasa que comenzara la casacada de reacciones de fosforilacion y desfosforilacion de ciertas protenas que llevan a la respuesta. Entre las protenas que pueden ser fosforiladas estan los propios receptores y canales ionicos de la membrana. Los otros receptores de membrana son en general protenas que atraviesan una sola vez la membrana y tienen actividad de proteinas kinansas en el dominio intracelular del receptor. AMPLIFICACION DE LA SEAL: Las cascadas de reacciones catalizadas por distintas enzimas que se activan por protenas G acopladas a receptores de membrana pueden ser amplificadas en las distintas etapas. Por ejemplo una seal que active una molcula de receptor capaz de acoplarse a Gs, activara muchas de estas protenas G que a su vez activaran a la AC. Pero ademas cada Gs estara activada mientras no se hidrolice el GTP unido lo que tomara algunos segundos, en ese intervalo estara activada la AC a la que se unio y seguira produciendo AMPc. Proteina G media la respuesta de distintos receptores Nucleo Estructura ms destacada de la clula eucarionte. Tienen tres funciones primarias: almacenar la informacin gentica en el ADN, recuperar la informacin almacenada en el ADN en la forma de ARN, ejecutar, dirigir y regular las actividades citoplasmticas, a travs del producto de la expresin de los genes: las protenas. En el ncleo se localizan procesos como: duplicacin del ADN y su ensamblado con histonas (cromatina), transcripcin de los genes de ARN, el procesamiento de estos a sus formas maduras y transportadas al citoplasma para su traduccin, y regulacin de la expresin gnica. ESTRUCTURA: esta rodeado por la envoltura nuclear (doble membrana con poros nucleares, que actan como compuerta selectiva) que esta sostenida desde el exterior por una red de filamentos intermedios e internamente por la lamina nuclear( formada por protena laminina que cuando se fosforila en divisin celular se desorganiza la membrana nuclear y se reparte en clulas hijas) Posee un nucleoplasma, en el que estn disueltos los solutos y la matriz celular (que provee soporte a los cromosomas y a los grandes complejos que intervienen en la replicacin y la transcripcin). Los cromosomas ocupan lugares especficos (los cromosomas que codifican ARNr se agrupan de forma tal que los genes de los ARNr estn todos juntos en el nucleolo, donde se sintetizan, procesan y ensamblan los ARNr.Se tie mas sntesis y armado de subunidades ribosomales.No esta separado por ningn limite). El nuclolo es un conglomerado de distintas molculas: Cromatina (organizadores nucleolares que son los genes que codifican para ARN 45s) ARNr Se arman las subunidades ribosomales (proribosomas se arman y se sueltan) Proteinas ribosomales (no hay pptidos seal---provienen del ribosoma libre y entran por poro) Hay dos zonas: la interna que es fibrilar(fibras de cromatina y de ARNr) y una externa que es rugosa(all se forman las subunidades).Cuando se entrea en divisin celular el nuclolo desaparece como unidad organizada -Envoltura nuclear: formada por dos membranas concntricas interrumpidas por poros nucleares y por la lmina nuclear. La membrana externa (en contacto con el citoplasma) tiene ribosomas adheridos que sintetizan protenas que se vuelcan al espacio perinuclear (intermembrana), dicho espacio se continua con el REG. La interna tiene protenas integrales que se unen a la lmina nuclear y a los cromosomas. La lamina nuclear esta formada por protenas (polmeros de laminina); su funcin es la de conferir estabilidad mecnica y al interactuar con la cromatina determina la organizacin del ncleo interfasico. La fosforilacin de la misma provoca su desensamble causando la ruptura de la envoltura al inicio de la divisin celular. Complejo del poro: La envoltura nuclear presenta estructuras discoidales (CPN) cuyo nmero es variable. Es una estructura macromolecular compleja constituida por un gran nmero de protenas de disposicin octamerica. Presenta uno o varios canales acuosos a travs de los cuales pequeas molculas solubles en agua difunden. Las molculas de gran tamao utilizan transporte activo (requieren energa y molculas transportadoras). Al ncleo se importan protenas sintetizadas en el citoplasma, necesarias para ensamblar ribosomas, los factores de transcripcin (activacin o inactivacin genes) y los factores de empalme (maduracin ribosomas); puede exportar: subunidades ribosomales, ARNm, ARNt y factores de transcripcin que son devueltos al citoplasma. Es una barrera selectiva entre el ncleo y el citoplasma, constituyendo la principal va de comunicacin entre estos. Molculas de gran tamao (protenas, ARN) necesitan de seales para ser ingresadas o expulsadas. Las NSL (seal de localizacin nuclear) y NES (seal nuclear de exportacin) son dichas seales. Consisten en cadenas cortas de aminocidos. Las molculas ms grandes necesitan una cariotransportina (familia compuesta por importinas y exportinas para mediar la importacion). Las importinas son heterodimeros formados por dos subunidades (alfa y beta). La subunidad alfa se une a la NSL permitiendo la unin con la subunidad beta (complejo importina funcional) se ponen en contacto con los filamentos citosolicos y llega al poro nuclear. La translocacin es regulada por la GTPasa Ran que se une a la subunidad beta importina (es ella la que provoca la dilatacin del poro y posibilita el ingreso de la protena). Cuando entran al complejo las subunidades se separan y es liberada la carga. Se deja al descubierto la NES que es reconocida por otras proteinas y retornan al citoplasma las subunidades.Es decir que necesito GTP para separar alfa de beta.Despues alfa se separa de la protena y la libera dentro del nucleo.Alfa y beta salen a travs del poro. Exportacin del ARNm: los ARNm se asocian a protenas (transbordadores) permitiendo el pasaje del ARN al citoplasma. Los ARN maduros presentan poli A se asocian con varias protenas formando ribonucleoproteinas (RNP), al igual que las importinas las RNP son recicladas hacia el ncleo. En el citoplasma las RNP son reemplazadas por las CRBP para guiar a los ARN a sus destinos citosolicos correctos. -Cromosoma y cromatina: el ncleo contiene los cromosomas, cada unos consiste en una nica molcula de ADN con igual cantidad de protenas. El ADN con sus protenas asociadas se denomina cromatina. Las protenas son en su mayora copias de cinco tipos de histonas (protenas bsicas cargadas positivamente por lo que se unen fcil a los grupos fosfato (-) del ADN,polianion,---union inespecifica) H1 (acerca los nucleosomas entre si), H2A, H2B, H3, H4 (core). Tambin tiene protenas no histonicas y RNP (ribonucleoproteinas). La mayora de ellas son factores de transcripcin. La cromatina puede estar en dos estados: eucromatina (laxa y acetilada) o heterocromatina (densa, transcripcionalmente inactiva y meteilada). La eucromatina puede ser a la vez, accesible, es decir que los genes se estn transcribiendo; o poco accesible, mas condensada, los genes no se transcriben. Los nucleosomas (formados por un core de histonas) son las unidades de enrollamiento de la cromatina---dos vueltas completas de ADN alrededor del core. La unin de las histonas al ADN depende de la secuencia de aminocidos de las histonas.nucleosomas +H1 unidos entre si por ADN espaciador: fibra 10nm. Estos a la vez se organizan en fibras de 30nm llamadas solenoide girando en forma de resorte alrededor de un eje virtual la cual es mantenida por la interaccin de las H1 entre los nucleosomas cercanos. En siguiente nivel de empaquetamiento se forman bucles o asas superenrolladas (300nm) las cuales son estabilizadas por la interaccin de las protenas con la matriz nuclear (protenas de la matriz sostienen la estructura), cada bucle representa un dominio funcional o unidad de replicacin (hasta ac g1, s, g2). Durante la profase los cromosomas aparecen en forma ms condensada, alcanzando la cromatina su mayor nivel de condensacin en metafase (700nm)---ya en division celular. El empaquetamiento del ADN (2 metros) en forma de cromatina le permite entrar dentro de los lmites del ncleo y lo protege del ataque de las nucleasas.Durante la profase los cromosomas aparecen en forma mas condensada alcanzando en metafase la max condensacin (1400nm) a causa de la fosforilacion de la H1 y otras protenas que generan un mayor plegamiento. La unin entre la cromatina y la matriz se da en las secuencias SAR.
Cromosoma eucariota: consiste en una molcula de ADN lineal. La molcula de ADN de un cromosoma eucariota contiene un conjunto lineal de genes que codifican para ARN y protenas interrumpido por muchas secuencias de ADN no codificante (Secuencias de nucletidos de ADN satlite-centrmeros, secuencias repetitivas en los extremos-telomeros, secuencias sealizadoras-origen de replicacin). El centrmero se encuentra centralmente o en los extremos de cada cromosoma, el ADN centromerico es altamente repetitivo, condensado formando parte de la heterocromatina. Antes de que la clula se divida los cromosomas deben ser duplicados (fase S). Al inicio de la divisin celular los cromosomas se condensan en estructuras que pueden teirse fcilmente y se ven en el microscopio. Los cromosomas duplicados se mantienen juntos por el centrmero. El cinetocoro es una estructura proteica discoidal que forma parte del centrmero y ayuda a separar las cromatidas hermanas, es el sitio de unin con los microtbulos del huso que tiran a los cromosomas en la anafase. Segn donde se ubique puede ser metacntrico (en el centro, brazos de igual longitud), submetacentrico (centrmero alejado del centro, un par de brazos es mas corto que el otro) o acrocentricos (centrmero prximo a uno de los extremos, un par de brazos es casi inexistente, el brazo mas corto es p y el mas largo es q). Los telomeros son necesarios para la duplicacin completa del cromosoma, protegen a los cromosomas de las nucleasas y le facilitan la interaccin con la envoltura nuclear (evitando la fusin entre si mismos). La telomerasa (RNP) es una enzima que agrega nuevas unidades al extremo 3 de la cadena rica en guanosina, es una retrotranscriptasa ya que sintetiza ADN a partir de un molde de ARN. La telomerasa activa se encuentra en las clulas de la lnea germinal, eucariotas unicelulares y clulas cancerosas.
CARIOTIPO: representacin grafica o fotogrfica de los cromosomas presentes en el ncleo de una sola clula somtica. Para poder hacerlo, normalmente se bloquean las clulas (glbulos blancos) durante la mitosis con colchicina. El anlisis del cariotipo involucra la comparacin de cromosomas por su longitud, la ubicacin de los centrmeros y la ubicacin y tamaos de las bandas G (regiones ricas en nucletidos A-T). Todas las especies tienen un nmero diploide de cromosomas homlogos (2n). - Nuclolo: en el se forman subunidades ribosmicas, la sntesis y procesamiento de ARNr y participa en la regulacin del ciclo celular. Es un aglomerado de fibras de cromatina de distintos cromosomas, todos acocentricos. Es una estructura carente de componente membranoso, presenta dos regiones: zona fibrilar central (ADN ribosmico y ARNr naciente) y la zona granular perifrica (subunidades ribosmicas en proceso de ensamblado). Los nucleolos desaparecen en la mitosis y se reorganizan alrededor de los segmentos de ADNr que codifican ARNr. Gen: unidad informativa discreta responsable de una caracterstica transmisible. Es un fragmento de ADN localizado en determinado lugar de un cromosoma. Los genes especifican la estructura de las protenas individuales. Es una secuencia de ADN con la informacin necesaria para la sntesis de una protena en particular. La informacin del ADN se expresa a travs de otras molculas. El ADN dirige la sntesis de protenas y estas determinan las caractersticas fsicas y qumicas de la clula. Un gen es una secuencia de ADN transcripta que genera un producto con funcin celular especifica (definicin no satisfactoria al 100%). Genoma: conjunto de genes de una especie. Utilizan al ADN como depositario de la informacin gentica.
GENOMA EUCARIOTA: se distingue en tres tipos de secuencias: 1) altamente repetidas: son cortas, y se repiten en forma consecutiva sin interrupcin. Se hallan en heterocromatina y no hay evidencia de que se expresen. Representan el 10% del ADN de los vertebrados. Puede ser ADN satlite (secuencias cortas de 5 a 10 pares de bases, muchas poseen bases bien diferentes de la del resto del genoma. En centrifugacin se separan en bandas distintas. Ej.: ADN centrmeros), minisatlite (15 pares de bases en grupos de 1000 a 3000 repeticiones) y microsatlite (2 a 5 pares de bases grupos de 100 copias dispersos en el genoma). 2) Medianamente repetitivas: 20-80% ADN total. Pertenecen a distintas familias y sus copias se encuentran dispersas a lo largo del genoma. Algunas codifican productos conocidos otras no. Secuencias con funcin codificadora: secuencias que codifica al ARNt, ARNr y genes de histonas. Se ubican en serie. Secuencias sin funcin codificadora: ADN medianamente repetido. Secuencias dispersas 2 tipos: ECIN Y ELIN. 3) De copia nica: nucletidos que codifican para protenas. GENOMA PROCARIONTE
GENOMA EUCARIONTE
ADN: nica molcula circular ADN: ms de una molcula, lineal, cada una corresponde a un cromosoma cuyo n es cte. Excepto gametas. ADN desnudo (no histonas) Asociado a diferentes protenas (histonas) ADN en contacto directo con citosol. Transcripcin y traduccin no separados en tiempo ni espacio. Cromosomas en compartimiento nuclear (transcripcin), Traduccin en citoplasma. Ambos separados espacial y temporalmente. Cada cromosoma tiene una sola copia de cualquier gen particular. Se expresa todo el ADN ADN innecesario 95%, hay exceso.
Ciclo celular Interfase: preparacin para la divisin celular que se divide en G1: donde la celula se aboca a aumentar su volumen--. Sntesis activa de protenas, ARN y duplicacin organelas citoplasmticas. Necesita mucha energa que obtendr de una activo metabolismo. fibra de 300nm S: donde se replica el ADN y se sintetizan histonas por lo tanto tambin sus ARNm que son degradados cuando termina la duplicacion.(no aumenta la cantidad de cromosomas pero si la de ADN).No varia la cantidad de info gentica sino que se duplica la misma G2: donde ya tiene su conjunto cromosmico duplicado y se sintetizan algunas protenas como las del huso mittico. fibra de 300nm Fase M (mittica): divisin nuclear (cariocinesis) y divisin citoplasmtica(citocinesis) Las clulas del cuerpo humano se dividen a velocidades muy diferentes y mucho mas lento que los organismos unicelulares. Casos atpicos: o clulas con especializacin estructural extrema como las nerviosas o musculares normalmente no se dividen y permanecen en G1 (G0) o Celulas que pueden ser estimuladas a abandonar G0 como las hepticas o los linfocitos que proliferan cuando interactan con el antgeno apropiado. o Clulas con un nivel relativamente alto de actividad mittica como las germinales, estirpes y epiteliales Pares de cromosomas homologos: mismo tamao y ubicacin centrmero.Tienen los mismos genes pero distintos alelos Replicacin del ADN Ocurre una nica vez en la vida de la celula (en etapa S de interfase).Eucromatina: mas laxa, replicacin temprana y la heterocrmatina que en transcripcionalmente inactiva es mas compacta y tiene una replicacin tardia. Es un proceso: Endergonico Anabolico Semiconservativo: se conserva una cadena parental y la otra se fabrica a nuevo Bidireccional: Tanto en eucariontes(muchos) como en bacterias(solo uno) se determino que la replicacin tiene un sitio de origen y ocurre en forma bidireccional(en ambos sentidos): sitios especficos a partir de los cuales se generan a ambos lados las horquillas (sitios en donde la doble hlice parental rompe sus puentes de H permitiendo la entrada del aparato enzimtico que iniciar la polimerizacin de las cadenas hijas utilizando la molde) de replicacin que determinan el proceso bidireccional. Discontinuo: La sntesis de ADN se produce siempre en sentido 5- 3 determinando que una de las cadenas se sintetice de forma discontinua: las ADNpol poseen un nico sentido de sntesis 5-3, esto hace que en cada horquilla solo una de las dos hebras hijas ser sintetizada en forma continua (cadena adelantada) utilizando como molde la hebra parental 3- 5. La otra hebra hija (cadena retrazada) debe necesariamente ser sintetizada en forma de pequeos trozos denominados fragmentos de Okasaki. Se necesita un ADN molde, materia prima (dATP, dCTP, dGTP, dTTP) y energia (ATP,CTP,GTP,TTP) ADN/ARN polimerasa: romper enlace entre fosforos y armar el fosfodiester.Sin embargo esa energia no es suficiente (se pierde algo por calor) por lo que tiene que actuar la Pirofosfatasa que se encarga de romper el pirofosfato (PPi) a 2Pi( dos molecuals de fosforo inorgnico)---sin esto no hay replicacion adems existe un gran aporte de la energa liberada por las interacciones dbiles. Antes de esto muchas enzimas abren las cadenas y exponen las bases. INICIACION: Proteina de iniciacin o reconocedor a de ORI(secuencia de bases). A las molculas simples de ADN se unen mltiples protenas desestabilizadoras(SSBP) que mantienen las cadenas separadas impidiendo su renaturalizacion.Se forma la horquilla de replicacion ELONGACION: Helicasas que con ATP se meten entre las cadena y rompen los puentes de H(desnaturalizan)--- dos por cada ORI.Se genera tensin por el desenrrollamiento(avance de helicasas) que se alivia con otras enximas que cortan los enlaces fosfodiester, permiten giros y las vuelven a unir inmediatamente (TOPOISOMERASA II O GIRASA).La ADN POL III necesita un soporte porque inmediatamente fija, necesita un grupo 3OH (necesita al primer).Por otra parte la ARNpol si puede, solo necesita un lugar para meterse.La PRIMASA(un tipo de ARNpol) fabrica el primer o cebador (corto fragmento de ARN que le sirve a la ADNpol para comenzar a fijar nucletidos). A partir de los cebadores la replicacin transcurre bidireccionalmente ya que la ADN pol III solo polimeriza en direccion 5- 3. Por esto se forma una cadena adelantada (continua) y otra retrasada (discontinua), esta ultima requiere una proceso de sntesis mas complejo, ya que implica la sntesis de sucesivos cebadores, la horquilla se va abriendo por accin de la helicasa. Cada uno de estos cebadores ofrece un extremo 3OH a la ADN pol III para la sntesis del fragmento de Okasaki. Los cebadores sintetizados son removidos y reemplazados por desoxirribonucletidos gracias a la ADN pol I (nucleasa en sentido 5 3 , y exonucleasa en ambos sentidos--- saca ARN o sea el primer y pone nucletidos de ADN) La ADNpol III es exonucleasa en sentido 3- 5 puede hidrolizar,sacar, si se equivoca----reelectura o correccin de pruebas Por esto la tasa de error del ADN es mucho menor que la del ARN. La ligasa(con ATP) cataliza la formacin de enlaces fosfodiester entre los distintos fragmentos de ADN. .La velocidad de sntesis se iguala ya que la molecual de ADN es anti paralea(una hebra discontinua y otra continua a cada lado del ORI) TERMINACION: se encuentran ambas horquillas de replicacin y se separan las dos molculas hijas de ADN. Procariontes: un solo ORI,con velocidad de replicacin mayor. ADNpol I(remover primer,exonucleasa en ambos sentidos) II (SOS) III(sntesis en continua y discontinua).Primer de 50 nucleotidos Eucariota: velocidad de replicacin mucho menor que se compensa por la existencia de muchos ORI. ADNpol (para discontinua) (continua) (II).Primer de 9 nucleotidos que no puede sintetizarse a partir del ultimo nucletido(no puede estar en la punta) lo que conducir al acortamiento progresivo de los extremos cromosmicos (telomeros, secuencias altamente repetitivas TTAGGG que evitan ciclamiento) lo que llevara eventualmente a la perdida de informacin gentica).Esto se soluciona con la enzima telomerasa (ribonucleoproteina) que puede realizar una retrotranscripcion al ser una transcriptasa inversa. Tiene un molde interno de ARN a partir del cual sintetiza ADN y por un apareamiento no convencional de bases permite un plegamiento que aporta un extremo 3OH.Tmabie en euca hay un bloqueo de re- replicacion. La telomerasa se deja de fabricar en clulas diferenciadas, solo se presenta en clulas embrionarias, madre y permanece activa en tumores. Reparacin del ADN Mecanismo de correccin de pruebas: es llevado a cabo por las ADNpol que tienen actividad exonucleasa 3- 5. Esto hace que les permita de comprobar que el nucletido adicionado es incorrecto y que existe un deficiente apareamiento entre las bases, eliminarlo y reemplazarlo por el nucletido correcto antes de seguir la polimerizacin en sentido 5 3. Transcripcin Sintesis de ARN a partir de un molde de ADN.Se transcribe solo la eucromatina. En eucariotas solo ocurre en interfase(en G1 es mas activa, en S los el ARN que codifica para prot histonas,en G2 proteinas que tienen que ver con la divisin celular).Cuando la celula entra en divisin no hay transcripcin(excepto en ovognesis) Primer paso de la transcripcin: la ARN polimerasa se une al promotor (secuencia especfica de bases con alta afinidad por la enzima)---la interaccion puede ser directa o indirecta y se encuentra rio arriba del gen-, es una seal que indica cual cadena se ha de transcribir.La enzima debe reconocer al promotor desde afuera:por depresiones que generan una interaccion por complementariedad de bases Es un proceso asimtrico ya que no se transcriben las dos cadenas. La transcripta es la cadena molde y la otra, la antimolde (positiva, codificante--- no se transcribe). La ARN polimerasa se desplaza sobre la cadena molde recorrindola en direccin 3 5 y transcribindola(de 5 a 3) a partir del nucletido (+1) que el promotor seala como punto de inicio. Se mueve desde el extremo 3 al 5. Para que la enzima pueda moverse y transcribir la doble hlice debe desenrollarse (se rompen los puentes de hidrogeno entre las bases). Para que suceda se forma en la cadena una burbuja de transcripcin que se mueve hacia el extremo 3 que desaparea la cadena molde, la cual expone sus bases.La burbuja avanza rio abajo junto con la enzima y a medida que lo hace la doble hlice se recompone por detrs(A-T mas fuerte que A-U por lo que se genera tensin en la cadena molde). Esto causa un superenrollamiento hacia el extremo 5 que se corrige con la enzima topoisomerasa I(corta,gira y vuelve a unir). A medida que la ARN polimerasa avanza va colocando junto a cada base el ribonucletido trifosfatado complementario (se aparean mediante puentes de hidrogeno. A, T, C, G=U, A, G, C). Una vez ubicados los dos primeros ribonucletidos la enzima cataliza la formacin del puente forfodiester (extremo 3 primer nucletido y el grupo fosfato interno del segundo 5) (inicia cadena ARN). Al sintetizar de manera antiparalela, se dice que la ARN polimerasa sintetiza de 5 a 3. Transitoriamente el ADN forma una hlice corta con el ARN. El proceso termina cuando la ARN polimerasa alcanza una seal (secuencia especifica de ADN) que acta como seal de terminacin. Producto obtenido: ARN transcripto primario, copia complementaria y antiparalela. Repite la direccin y la secuencia de la hebra antimolde (positiva o codificante)(solo cambia T por U). Requisitos de la transcripcin: molcula de ADN molde con regin promotora que indica el inicio de la transcripcin, con secuencia de terminacin. Enzima ARN polimerasa que: reconoce las secuencias sealizadoras, abre la hlice, lee el molde, reconoce y ubica los sustratos complementarios polimeriza los sustratos. Cofactores enzimticos de la ARN polimerasa: Mg++ o Mn++. Sustratos: UTP, ATP, GTP, Y CTP. Fuente de energa (los mismos sustratos por estar trifosfatados, una vez ubicados los 2 primeros ribonucletidos la enzima cataliza la formacin del puente fosfodiester entre ambos). Pirofosfatasa (puente fosfodiester entre oxidrilo 3 del primer nucletido y el grupo fosfato interno en posicin 5 del segundo libera un grupo pirofosfatado que se transforma en 2 fosfatos por accin de la pirofosfatasa) y una Topoisomerasa I. TRANSCRIPCION EN PROCARIONTES: poseen un solo tipo de ARN polimerasa, que consiste en un complejo proteico, constituido por 5 subunidades (alfa, beta, beta, omega y w) 2 alfa 1c/u del resto. Todas las subunidades menos la omega, forman el ncleo enzimtico capaz de realizar la transcripcin pero incapaz de reconocer los sitios correctos donde iniciar la transcripcin. Para esto, omega (factor de inicio de la transcripcin) se une al ncleo enzimtico formando una holoenzima para leer adecuadamente las secuencias promotoras. Los promotores bacterianos constan de dos secuencias consenso o caja (TATAAT - 10 Y TTGACA -35) indispensables para la unin de la enzima y la sealizacin del punto de inicio. Sustituciones en las secuencias consenso alteran la tasa de transcripcin, por tal motivo funcionan tambin como sitios de control de la expresin gentica. Al iniciar la transcripcin la holoenzima ARN polimerasa forma en principio un complejo promotor cerrado, pero inmediatamente la enzima cataliza el desenrollamiento del ADN y forma al complejo promotor abierto, de esta manera comienza a copiar en el nucletido +1, luego el factor omega se disocia de la ARN polimerasa y la transcripcin es continuada por el ncleo de la enzima. La seal de terminacin puede ser: independientes y dependientes de la protena Rho. Independiente de Rho: El ARN transcripto lleva dos seguidillas de CG y varias U(en el ADN: GC y cadena de poli A) en su extremo 3. Esta secuencia repetida en la terminacin del ARN le permite la autocomplementaridad, las citosinas y guaninas de la misma cadena se aparean entre si(mucha atraccin) dando origen a una estructura de tallo-bucle, lo que impide el avance de la ARN polimerasa. La secuencia de adeninas de la plantilla de ADN permanece emparejada con los uracilos de su transcripto, como el par AU tiene la conformacin mas inestable de sus puentes de hidrogeno, contribuye a la separacin de ARN polimerasa poniendo fin a la transcripcin. Dependiente de Rho: tambin se forma la estructura tallo-bucle. La protena Rho se enlaza a la cadena de ARN y se desliza sobre ella hidrolizando ATP hasta alcanzar el extremo 3, es all donde se produce la liberacin del transcripto..Reconocimiento del promotor de forma directa.Apenas asoma el mensajero puede ser traducido (cotranscripcional) --- no hay nucleo en proca. ARNm puede llevar info para una o varias cadenas polipeptidicas(cistron)--- monocistronico vs policistronico.Secuencia directora en 5 que no se traduce, todo lo dems si.Genes continuos.Inicio AUG
TRANSCRIPCION EN EUCARIONTES: se lleva a cabo por tres tipos de ARN polimerasa: I, II y III (todas protenas cuaternarias constituidas por distintas subunidades).ARN pol I, se encuentra en el nucleolo y sintetiza ARN45s, transcribe organizador nucleolar (solo transcribe en el nucleolo); ARN pol II, se encuentra en el nucleoplasma y sintetiza todos los ARNm y la mayora de los ARN pequeos nucleares, transcirbe genes de copia unica; ARN pol III, se encuentra en el nucleoplasma y sintetiza ARNt, ARN pequeos citoplasmticos y el resto de los ARN pequeos nucleares, transcribe genes medianamente repetitivos . Reconocen al promotor en forma indirecta. Solo se unen al promotor por medio de protenas llamadas factores basales de transcripcin (son especficos para cada tipo de polimerasa que no siempre estn disponibles y su presencia garantiza el inicio de la transcripcion,). Las clulas eucariotas poseen adems factores de transcripcin especficos (controlan la tasa de transcripcin) los cuales relacionan las regiones reguladoras del gen con los factores basales exponiendo el FTB si es activador (sec aceleradora) o tapando el FTB con el plegamiento del ADN si es inhibidor (sec silenciadora). Los promotores para la ARN polimerasa II suelen comprender tres sitios (ro arriba), uno de ellos en posicin -25 es la caja TATA (secuencia consenso heptanucleotidica formada por restos de timina y adenina). Las cajas TATA estn rodeadas por secuencias ricas en GC, en interaccin con los factores basales estn encargados de que la transcripcin se inicie en el sitio correcto. Otros sitios del promotor son las cajas CAAT y GC. La transcripcin comienza con la insercin de un ribonucletido y el ARN transcripto primario, el cual ser modificado (cuando tenga 30 nucletidos). La secuencia AAUAAA de los pre-ARNm es reconocida por una endonucleasa como una seal de terminacin ponindole fin al transcripto primario, esta se llama seal de poliadenilacion. (No hay en los genes que codifican histonas, en algunos hay ms de una seal, en ese caso el mismo gen puede ser transcripto dos veces en dos productos diferentes dependiendo de la seal). VER CUADRO 12.2 PAGINA 43.TRaduccion:Postranscripcional, monocistronicos, continuos y discontinuos. Diferencias transcripcin procariotas y eucariotas: Existe una sola ARN polimerasa en proca y tres en euca. La ARN polimerasa en proca no requiere factores de transcripcin. Las euca requieren factores de transcripcin basales y especficos. Las secuencias sealizadoras son diferentes.
El cdigo gentico usa distintos codones para nombrar a un mismo aminocido. La mayora de los aminocidos estn codificados por ms de un codn, se denominan codones sinnimos. El cdigo es degenerado gracias a la presencia de estos codones sinnimos(un aminocido puede estar codificado por diferentes codones). Aminocidos con propiedades semejantes van a ser codificados por codones semejantes. La flexibilidad del cdigo no indica que sea ambiguo, cada codn especifica a un solo aminocido. Hay tres codones que no especifican ningn aminocido: son codones de terminacin o stop: UGA, UAG, UAA (seal de terminacin en traduccin o sntesis de protenas). El cdigo es universal, ya que todos los organismos comparten un mismo origen. Una excepcin es el ADN mitocondrial, en el que algunos codones se leen de manera diferente. Los ARNm tienen un codn de iniciacin: AUG, interpretado por los ribosomas, da el marco de lectura. Las mutaciones modifican el marco de la lectura y alteran el mensaje. El cdigo es ledo sin solapamiento. Traduccin ARNm: molculas lineales de cadena simple donde residen las instrucciones para la elaboracin de un producto proteico. Presentan una secuencia continua de codones que se extienden desde el principio al fin del mensaje gentico. Se lee en direccin 5-3. Presenta un codn iniciador (AUG) y uno de terminacin o stop (UGA, UAA, UAG). Posee otras dos secuencias: directora y seguidora las cuales no se traducen a protena. ARNm EUCARIOTA: - Presentan la secuencia del mensaje interrumpido. Coexisten sectores que codifican para la protena (exones)---se transcriben y traducen y sectores sin informacin (intrones)--- solo se transcriben - Los ARNm transcriptos primarios sufren modificaciones post-transcripcin (antes de salir al citoplasma como ARNm maduro): capping y poliadenilacion. Capping: se agrega en el extremo 5 una molcula de 7 metil-guanosina (nucletido metilado) a la que se conoce como cap (capuchn---base modificada) al ser una modificacin simultnea a la transcripcin se dice que es co-transcripcional. El cap impide la degradacin del ARNm inmaduro por nucleasas y fosfatasas nucleares (degradacin). Participa en la remocin de intrones y en el inicio de la traduccin. Sirve para identificar a 5 e inciar traduccin. Poliadenilacion: se agrega en el extremo 3 del ARNm alrededor de 250 adenosinas o cola poli ---seal de exportacion. El ARNm presenta una seal de poliadenilacion (secuencia especfica de nucletidos AAUAAA). Una nucleasa corta el pre-ARNm, este se libera y la enzima poliA-polimerasa le agrega las adenosinas de a una por vez. La cola poli A sirve para proteger al extremo 3 del a degradacin y ayudar a los ARNm a salir del ncleo. (ARNm de histonas no tienen cola poli A ya que no tienen seal de poliadenilacion. Otra modificacin que se realiza es el splicing (postranscripcional): la secuencia codificadora sufre un acortamiento debido eliminacin de intrones quedando como producto final los exones empalmados. Para que pueda llevarse a cabo se necesita una batera de ribonucleoproteinas nucleares: RNPpn (partculas ricas en uridinas y diversas protenas) las cuales se combinan de a una por vez en los extremos de cada intron, el complejo resultante de denomina espliceosoma)desp se degrada o queda como RNP). ARNpn(ARN de las ribonucleoprot) del espliceosoma responsables de reconocer seal de corte escindir los intrones y empalmar los exones entre ellos produciendo una molcula de ARNm maduro.Se reconocen cortas sec dentro del intron: GU en extremo 5 o sitio dador, AG en extremos 3 o sitio aceptor y el sitio de ramificacin dentro del intron.(queda como un bucle entre GU y sit ramificacin y una colita an el AG) -Los ARNm maduros son monocistronicos: el sector codificador dicta la secuencia para una sola cadena polipeptdica.Vida media corta
PROCARIOTA: - Presentan secuencias codificadoras continuas ya que carecen de intrones. - No sufren modificaciones post-transcripcionales. - Muchos ARNm procariotas son policistronicos, una sola molcula de ARNm contiene informacin para varias protenas. Posee codones de terminacin e iniciacin de la traduccin, por lo cual se traducen varias molculas de protena distintas. ARNt: son molculas (70 a 93 ribonucletidos) monocatenarias que interactan con la cadena polinucleotidica (ARNm) y a la vez con los aminocidos que van a formar parte de la cadena polipeptdica. En la molcula se distinguen el extremo aceptor (3) donde se encuentra el trinucleotido CCA en donde se une el aminocido, esta unin es catalizada por la aminoacil ARNt sintetasa. Y el extremo anticodn (triplete de nucletidos), cuya secuencia vara en cada tipo de ARNt, cada anticodn es complementario de un codn del ARNm, aunque podra acoplarse a ms de un codn.Vida media larga ARNr: son los componentes de los ribosomas junto a las protenas. Los ribosomas y los ARNt intervienen en la traduccin de la informacin codificada en el ARNm. Los ribosomas son considerados fbricas de protenas. Cada ribosoma esta formado por una subunidad mayor y una menor. El ARNm se inserta en el surco formado entre las superficies de contacto de las subunidades(separadas cuando no hay traduccin. En proca 30s y 50s y en euca 40s y 60s----70s y 80s).La menor sirve de apoyo para el mensajero y la mayor contiene los sitios activos: el sitio A (aminoacidito) donde se recibe cada aminoacido y el P (peptidilico) donde queda la cadena peptidica. Las subunidades ribosmicas trabajan conjuntamente para la sntesis proteica. La subunidad menor aloja al ARNm, sobre el cual se acomoda el ARNt para que se puedan unir los aminocidos que transportan. La mayor, cataliza la unin peptdica con la ayuda de la peptidil transferasa(ribozima). Los ribosomas procariotas y eucariotas se diferencian en tamao, coeficiente de sedimentacin, tipo y numero de ARNr y protenas que los forman. Ambos sufren modificaciones post-transcripcionales. ARN pequeos: forman, junto con protenas especificas, las partculas ribonucleoproteicas (RNP). Las que se encuentran en el ncleo (RNPpn) forman un complejo multienzimatico: espliceosoma, encargado del splicing. Las del citoplasma (RNPpc) junto con protenas componen la partcula de reconocimiento de la seal o SRP. Activacin de los aminocidos o aminocilacion: antes de la traduccin cada ARNt se une a su aminocido especfico. Esta reaccin de aminoacilacion es catalizada por la enzima aminoacil ARNt sintetasa. Primero se utiliza la energa de la hidrlisis del ATP para unir a un aminocido con un AMP formando un aminoacil- AMP. Luego sin dejar la enzima, el aminocido se transfiere al ARNt especifico formando la molcula aminoacil-ARNt (se libera el AMP). La aminoacil-ARNt sintetasa presenta dos sitios de unin: uno para el ARNt y otro para su aminocido especifico. Una vez que el aminocido se acopla al ARNt, el complejo aminoacil-ARNt se une a una sola secuencia de nucletidos complementaria (codn) en el ARNm. El ARNt es el que lleva unido el lugar en el que ser aadido el aminocido durante la sntesis proteica. La activacin de los aminocidos tiene dos funciones: proporcionar el primer paso en la traduccin del mensaje gentico a una secuencia de aminocidos, y activar al aminocido antes de incorporarlo a la protena. El enlace entre el ARNt y el aminocido libera, al hidrolizarse, la energa necesaria para la formacin del enlace peptdico. Reactivos: Aa + ATP + ARNt aminoacil ARNt + 2Pi + AMP. De ATP a AMP se consumen 2Pi AMP monofosfatado: costo energtico 2ATP Traduccin: mecanismo por el cual se traduce el mensaje del ARNm. Se divide en 3 etapas: P-A 1) INICIACION: Se renen los componentes que constituyen el complejo de iniciacin, disparador de la sntesis proteica. El complejo esta compuesto por una molcula de ARNm, una subunidad mayor, una menor, ARNt iniciador y factores proteicos de iniciacin. El complejo se forma con la unin a la subunidad menor del ARNm y del aminoacil-ARNt iniciador, gracias a los factores proteicos (con gasto de GTP). La subunidad menor se desliza por el ARNm hasta encontrar el codn de iniciacin (AUG). Una vez acoplados, se liberan los factores de iniciacin y se acopla la subunidad mayor (dos sitios: A abarca el 2do codn, el que tengo que leer para comenzar con la sntesis; y P abarca el 1er codn) quedando el aminoacil-ARNt iniciador en el sitio P del ribosoma. 2) ELONGACION: la molcula de aminoacil-ARNt ingresa al sitio A el sitio P esta ocupado por el iniciador-, complementando sus bases con las del segundo codn del ARNm; intervienen factores de elongacin y GTP. El aminocido iniciador se desacopla del ARNt que esta en el sitio P (implica un catalizador: ribosima el cual es ARN con actividad cataltica), liberando energa y haciendo que se forme un enlace peptdico entre los dos aminocidos que se encuentran en el ribosoma; es catalizada por la peptidil transferasa. Como consecuencia el ARNt del sitio P queda sin aminocido y el dipptido resultante queda enganchado al ARNt del sitio A (peptidil ARNt). El peptidil ARNt que esta en el sitio A es translocado al sitio P ya que el ribosoma se desplaza tres lugares sobre la ARNm (se necesita energa y factores de elongacin). Como parte del proceso de translocacin, la molcula de ARNt libre se libera del ribosoma al ser ocupado el sitio P, as el sitio A queda desocupado para aceptar una nueva molcula de aminoacil ARNt para volver a iniciar todo de nuevo.)se gastan 2 GTP, uno por ingreso aminoacil ARNt y otro por corrimietnto) 3) TERMINACION: ocurre cuando llega al sitio A uno de los tres codones de terminacin: UGA, UAA, UAG, que son reconocidos por los factores de terminacin. La asociacin del codn stop con el factor de terminacin modifica la actividad de la peptidil transferasa que agrega agua al peptidil ARNt(hidroliza unin del ultimo Aa con transfer) en lugar de un nuevo aminocido. Como consecuencia el polipptido se desacopla del ARNt liberndose al citoplasma. El ARNm se desacopla del ribosoma y las dos subunidades se disocian las cuales se podrn reensamblar sobre otra molcula de ARNm reinicindose as el proceso de traduccin. La sntesis proteica consume mas energa que cualquier proceso anablico, para lograr cada enlace peptdico se intervienen 4 enlaces de alta energa: 2 en la activacin del aminocido, otro en la unin aminoacilARNt a la subunidad menor y el tercero en la translocacin del ribosoma.
POLIRIBOSOMAS: en cuanto un ribosoma ha traducido una secuencia de aminocidos lo suficientemente larga como para dejar libre el extremo 5 del ARNm un nuevo ribosoma puede iniciar la traduccin. Traducen simultneamente el mismo mensaje. Los ribosomas operan independientemente sintetizando una cadena polipeptdica. La ventaja es energtica ya que ahorra mucha energa y el ARNm puede ser ledo varias veces simultneamente.
Diferencias en la traduccin en procariotas y eucariotas
En eucariotas la traduccin es post transcripcional, el ARNm es ledo despus de que haya abandonado el ncleo a travs de los poros nucleares. En procariotas la traduccin es simultanea a la transcripcin, mientras se esta terminando de transcribir el extremo 3, el extremo 5 se asocia a un ribosoma y al ARNt iniciador comenzando la traduccin.
Procesos de fidelizacin de la traduccin La unin del aminocido a su ARNt correspondiente. La actividad correctora de la aminoacil ARNt sintetasa minimiza errores en la seleccin del aminocido correcto, en caso de que se haya colocado un aminocido incorrecto en el ARNt lo libera por hidrlisis. El factor de elongacin que forma el complejo aminoacil ARNt y el GTP chequea el correcto apareamiento de bases codn- anticodn. Esto posibilita que se elimine el ARNt incorrecto antes que el residuo aminoacidito que transporta pueda enlazarse en la protena en crecimiento. OPERON: los procariotas tienen una notable capacidad de adaptarse a la variedad de condiciones del medio; esto se debe a la habilidad que tienen para regular la expresin de genes especficos. Este proceso requiere mucha energa. Los genes que codifican para la sntesis de enzimas se agrupan dentro de un cromosoma en un complejo llamado operon. Un operon consta de Genes estructurales: codifican para las enzimas de la va metablica. Son transcriptos en una sola molcula de ARNm policistronico. Promotor: secuencia de nucletidos del ADN en donde se une la ARN polimerasa para iniciar la transcripcin. Operador: secuencia de nucletidos que se interpone entre el promotor y los genes estructurales en donde se inserta una protena reguladora denominada protena represora. Gen regulador: codifica a la protena represora. -Operon lac: (va catablica) genes que intervienen en la utilizacin de la lactosa como fuente de energa. La permeada, la beta galactosidasa y la transacetilasa son las enzimas que intervienen en la degradacin de la misma. El operon esta formado por tres genes estructurales: z, y, a. Cuando no hay lactosa, la protena represora se une al operador e impide la transcripcin (que la ARN polimerasa se una al promotor y los genes se transcriban). Ejerce un control negativo, (activa la prot represor). En presencia de lactosa, esta se une a la protena represora impidiendo que se una al ADN del operador (inactiva la protena represora) , por lo que se transcriben los genes estructurales que degradan la lactosa. Es inducible, ya que la presencia de lactosa induce la transcripcin de los genes estructurales. Tambin se encuentra bajo control positivo, cuando en el medio hay glucosa. Cuanto menos glucosa hay, mas concentracin de AMPc. Este ultimo acta unindose a una protena(reguladora) llamada CAP, cuando la concentracin es alta el CAP-AMPc se fija al sitio promotor aumentando la afinidad(por un cambio conformacional) por la ARN polimerasa, estimulando la transcripcin. Igualmente tiene que haber lactosa porque sino ,de todas maneras, la protena represora estara activa. La presencia del metabolito Promueve la transcripcin: OPERON INDUCIBLE Impide la trascripcin: OPERON REPRIMIBLE Cuando la protena reguladora esta unida a su regin especifica y Promueve la transcripcin: CONTROL POSITIVO Impide la transcripcin: CONTROL NEGATIVO -Operon triptfano: (va anablica) es reprimible dado que la presencia del triptfano reprime la transcripcin de los genes estructurales(si hay, no hay que fabricarlo). Consiste en 5 genes estructurales que se agrupan en una unidad de transcripcin con un promotor y un operador. En ausencia de triptfano, la ARN polimerasa se une al promotor y transcribe (proteina represora rebota, esta inactiva). Si hay triptfano, el aminocido se une a la protena represora formando el complejo represor(activo) que se acopla al operador impidiendo que la ARN polimerasa transcriba. MECANISMOS DE CONTROL A NIVEL TRANSCRIPCIONAL a) Los factores de transcripcin y la expresin gentica
Para la transcripcin de un gen eucariota se necesita: - Secuencia promotora: secuencias de nucletidos necesarias para la fijacin de la ARN polimerasa - Secuencias reguladoras: intensificadoras o enhacer (estimulan la transcripcin) y silenciadoras o silencers (inhiben la transcripcin). - Factores basales de transcripcin: complejo proteico que interacciona con el sitio promotor. - Factores especficos de transcripcin: protenas reguladoras. Activadoras (interactan con secuencias intensificadoras del gen) o represoras (interactan con secuencias silenciadoras del gen). La unin de los factores al sitio promotor provoca un plegamiento del ADN que permite conectar a los factores especficos, unidos a regiones reguladoras, con una o mas protenas blanco asociadas al complejo de transcripcin basal; as se estimula la transcripcin por parte de la ARN polimerasa. b) La estructura de la cromatina y la expresin gentica En cada tipo celular solo se expresan determinados conjuntos de genes mientras el resto del genoma se mantiene silencioso. Existen dos tipos de cromatina: la eucromatina, transcripcionalmente activa, ms desplegada y la heterocromatina, transcripcionalmente inactiva, ms condensada. La transcripcin solo ocurre cuando el ADN esta desplegado. Es decir las regiones de cromatina condensada y dispersa varan segn el tipo celular. c) El grado de metilacin y la expresin gentica En algunos eucariotas la presencia de grupos metilo en el gen afecta su expresin. La mayora de los genes que no se expresan estn metilados, mientras que en otra clula donde esos genes se expresan tienen un menor nivel de metilacin. Ejemplo: en las mujeres el cromosoma X condensado (corpsculo de Barr) presenta alto grado de metilacin inactivando as parte del genoma.
MECANISMOS DE CONTROL A NIVEL PROCESAMIENTO DEL ARNm
MECANISMOS DE CONTROL A NIVEL TRADUCCIONAL
a) modificacin de la tasa de traduccin del ARNm que codifica para la protena ferritina La ferritina acta capturando tomos de hierro del medio intracelular ya que el hierro en estado libre es toxico para la clula. La aconitasa, regula la traduccin del ARNm, cuya actividad depende de la concentracin libre de hierro en el citosol. Cuando la concentracin de hierro es baja la aconitasa se une a una secuencia especfica en el ARNm provocando un plegamiento que bloquea la traduccin. Cuando aumenta la concentracin de hierro, este se asocia a la aconitasa y libera al ARNm. b) Control de la estabilidad del ARNm. La integridad de la cola poli a es determinante para la supervivencia del mensaje. El acortamiento de la cadena por accin de nucleasas reduce la vida media del ARNm.
MECANISMOS DE CONTROL DESPUES DE LA TRADUCCION
Factores determinantes en la vida media de una protena: correcto plegamiento y secuencia aminoacidica de su extremo aminoterminal. Desde que la protena sale del ribosoma, chaperonas se unen a la cadena en sntesis ayudndola a adquirir la conformacin nativa. Esto evita que las protenas alcancen un estado de agregacin irreversible. Respecto al extremo aminoterminal existen secuencias estabilizadoras y secuencias desestabilizadoras las cuales conduciran a una vida media prologada o a su degradacin (regla del aminoterminal). Si la protena adquiere un plegamiento anormal, o se desnaturalizo, o su extremo es desestabilizante pasa a un proceso de ubiquitinizacion. La ubiquitinizacion consiste en la adicin de varias molculas de ubiquitina (mediado por enzimas y gasto de energa ATP). Las protenas pueden en una etapa previa o temprana de la ubiquitinizacion recuperar el plegamiento nativo gracias a una chaperona que la conduce hasta una chaperonina, en caso contrario la protena ubiquitinizada ser captada por un complejo enzimtico denominado proteasoma (formado por mas de una docena de proteasas). La protena ubiquitinizada es reconocida por la partcula regulatoria del proteasoma perdiendo su plegamiento por accin de las ATPasas con gasto de energa, la protena desenrollada se traslada a la cmara central donde es degradada por las proteasas. Se producen oligopeptidos. - Gnica: a nivel del ADN, la mutacin se mantendr de generacin en generacin (lnea germinal). - Somtica: diferentes a nivel gametas, todas las secuencias tienen una deformacin, todos los ARNm van a estar cambiados, hay mecanismo de reparacin del ADN: correccin de pruebas. No pasan a la siguiente generacin. Mutaciones a nivel gentico y ARNm - sustitucin: se sustituyo un nucletido por otro. Codones sinnimos: mutacin silenciosa Codones no sinnimos: cambia la protena en un aminocido, diferente estructura primaria. Si la estructura tridimensional no varia seguir cumpliendo su funcin. - Insercin de un nucletido: desde el lugar de la insercin en adelante se corri el marco de lectura. Hay una baja probabilidad de codones sinnimos. Si agrego 3 nucletidos consecutivos, agrego un aminocido de ms. No siempre implica agregar un aminocido, puede no haber un autentico corrimiento del marco de lectura. - Delecin: eliminacin de un nucletido, cambia el marco de lectura.
Division celular En procariontes: se reproducen asexualmente por fisin binaria transversal. La divisin del ADN y del citoplasma estn directamente acopladas. La divisin ocurre rpidamente y la clula hija recibe un cromosoma que ya esta comenzando a dividirse. Pueden intercambiar material gentico por los mecanismos de transformacin, transduccin y conjugacin.
EUCARIONTES: Mitosis: a partir de una clula madre se obtienen dos clulas hijas idnticas entre si. El material gentico se duplica en la fase S. La integran la cariocinesis y la citocinesis. Se divide en cuatro etapas: 1) Profase: la cromatina se condensa hasta formar cromosomas bien definidos. estn formados por dos cromatides hermanas, cada una contiene una secuencia de ADN especifica, centrmero. En ellos se desarrollan los cinetocoros (uno por cada cromatide). El centrosoma(crecimiento microtubulos) se divide durante la profase y cada centrosoma hijo comienza a migrar hacia uno de los polos de la clula. Se empiezan a organizar los microtbulos a medida que se alejan que luego formaran el huso cromtico cuando se desorganice la membrana nuclear. El nucleolo desaparece por la condensacin de su cromatina. Comienza con la desorganizacin de la membrana nuclear por fosfoliracin de las cadenas polipeptdicas; los microtbulos del huso se introducen en la regin nuclear y los dos centrosomas hijos constituyen los dos polos del huso. En cada centrmero maduran los cinetocoros. 2) Metafase: Los cromosomas alcanzan su mximo estado de condensacin y se encuentran unidos a las fibras del huso a travs de los cinetocoros de sus centrmeros. Los microtbulos cinetocoricos traccionan a los cromosomas hasta alinearlos en el plano ecuatorial de la clula. 3) Anafase: se separan las cromtides hermanas (separacin cinetocoros), migrando cada una hacia polos opuestos. En este momento se estn repartiendo las dos copias de ADN idnticas que tiene cada cromosoma, una para cada futura clula hija. 4) Telofase: proceso inverso al de la profase. Se reorganiza la membrana nuclear, se descondensa el ADN. Se reorganizan dos envolturas nucleares (una en torno a cada polo). Se desorganiza el huso mittico. 5) Citocinesis: separacin del citoplasma entre las dos clulas. En clulas eucariotas animales ocurre por estrangulamiento del citoplasma por la accin de un anillo contrctil constituido por filamentos de actina y miosina. En clulas vegetales se da por tabicamiento, se divide por formacin de membranas y una pared en el centro de la clula madre separando en dos compartimientos a las clulas hijas.
Meiosis: ocurre en clulas germinales, solo una vez, dando por resultado cuatro clulas hijas haploides. Consiste en dos divisiones nucleares sucesivas (meiosis I y II) precedidas de una nica duplicacin de ADN. Puede ocurrir en distintos momentos de la vida de los organismos: gametica, cigotica o esporica. La reproduccin sexual es una fuente de variabilidad gentica gracias a combinaciones que se llevan a cabo en la meiosis. Estas combinaciones aumentan las probabilidades de supervivencia de una especie en un ambiente con distintas variables. Las fuentes de variabilidades con la segregacin independiente (anafase I o II), que es el azar, y el crossing over (profase I). Obviamente, la fecundacin, al mezclar genes provenientes de dos individuos diferentes, tambin genera variabilidad y por ultimo las mutaciones (este ultimo tambin en asexual).
Sus etapas son: MEIOSIS I: 1) Profase I: Se organiza el huso meitico a partir de los centrolos. Se desorganiza la envoltura nuclear. La cromatina comienza a condensarse de manera que se hacen evidentes los cromosomas. Se produce el apareamiento de los homlogos. Cada cromosoma se une estrechamente a su homlogo por una de sus cromtides. Se forman las tetradas o bivalentes, par de homlogos apareados. Entre las cromtides de los homlogos se podra llegar a producir, como no, el crossing-over o entrecruzamiento, que consiste en el intercambio de zonas homlogas (que involucran los mismos genes) entre cromosomas homlogos. Una de las consecuencias es la variabilidad gentica ya que despus de este hecho las cromtides hermanas ya no son idnticas. Luego, los pares de homlogos se unen a los microtbulos del huso y comienzan a migrar. 2) Metafase I: cromatina compactada al mximo. Los pares de cromosomas homlogos se alinean en el plano ecuatorial de manera que uno de los homlogos est orientado hacia un polo y el otro miembro del par est orientado hacia el polo opuesto.1400nm 3) Anafase I: separan los cromosomas homlogos ya que cada uno migra hacia un polo diferente al azar. 4) Telofase I: se descondensa el ADN. Se reorganizan dos envolturas nucleares (una en torno a cada polo). Se desorganiza el huso meitico. Resultado de la meiosis I: dos clulas hijas diferentes entre s y diferentes a la clula original. Las clulas hijas tienen la mitad de cromosomas que la clula que les dio origen. Por eso decimos que la meiosis es una divisin reduccional(los itenen duplicados. No hay pares de homologos.Dos cromatidas por cromosoma)
MEIOSIS II: se segregan cromatides hermanas, se mantiene el numero de cromosomas (pero ahora son simples) 1) Profase II: se organiza el huso meitico a partir de los centrolos. Se desorganiza la envoltura nuclear. La cromatina comienza a condensarse de manera que se hacen evidentes los cromosomas. Los cromosomas se unen por el centrmero al huso y comienzan a migrar. 2) Metafase II: los cromosomas continan migrando para finalmente disponerse alineados en el plano ecuatorial. Esto significa que cada cromosoma tiene una de sus cromtides orientada hacia un polo y la otra hacia el polo opuesto. 3) Anafase II: se separan las cromtides al azar, migrando cada una hacia polos opuestos. 4) Telofase II: se descondensa el ADN. Se reorganizan dos envolturas nucleares (una en torno a cada polo). Se desorganiza el huso meitico. Gametognesis: proceso de formacin de gametas. OVOGENESIS: ocurre en los ovarios. Las clulas primordiales son las ovogonias (2n), estas duplican su ADN en el tercer mes de desarrollo fetal, originando ovocitos primarios (2n); al quinto mes comienza la meiosis I y al octavo se detiene en la profase I. En la pubertad se continua la meiosis I, y algunos ovocitos I se transforman en ovocitos II; otros en cuerpos polares. Los ovocitos II comienzan la meiosis II (queda frenada en la metafase II ovulacin) producindose el ovulo y un cuerpo polar. Solo se concluye la meiosis II si el ovulo es fecundado. ESPERMATOGENESIS: ocurre en los testculos, comienza en la pubertad. Las clulas primordiales son las espermatogonias (2n). En la pubertad duplican su ADN y se diferencian en espermatocitos I que, gracias a la meiosis I (separa homlogos), forman espermatocitos II (2 clulas haploides) no realizan citocinesis, realizan meiosis II en cada uno de sus ncleos, separa cromatides hermanas. Estos se convierten en espermatidas (4 clulas haploides), luego de la meiosis II. Las espermatidas sufren un proceso de maduracin y diferenciacin, y se transforman en espermatozoides (flagelados, poco citoplasmas = mas hidrodinmicos) 1 celula:4 espermatozoides pero solo 1 ovulo CITO I: hace meiosis I 23 crom duplicados CITO II: hace meiosis II 23 crom simples, haploides ALTERACIONES CROMOSOMICAS: -Inversiones: el cromosoma se rompe en dos sitios y el fragmento del medio vuelve a fijarse pero de manera inversa. El cromosoma no puede aparearse con un homologo normal durante la meiosis. Lo que sucede es que las gametas tendrn una copia adicional o le faltaran dichos genes. Si la gameta es fecundada mostrara un desequilibrio cromosmico. -Translocaciones: un fragmento de cromosoma se fija a otro. Generan grandes cambios. Pueden haber supresiones: perdida de una regin del cromosoma; o duplicaciones: se repite cierto fragmento. - Numricas: no disyuncin pares de homlogos no se separan durante la meiosis I Cromatides hermanas no se separan durante meiosis II Puede no separarse algunas de las tetradas, los homlogos del par sin separar van juntos a la misma celular lo que no impide una meiosis II normal. Las gametas con el nmero cromosmico alterado se denominan ANEUPLOIDE n+1 sobra un cromosoma n-1 falta un cromosoma
Tro de homlogos normal + (n+1) = TRISOMIA normal + (n-1) = MONOSOMIA
Primera Ley: principio de segregacin. Todo individuo tiene un par de alelos para cada rasgo o gen que se segregan durante la meiosis. Cuando los alelos son idnticos, el organismo es homocigota. Si son diferentes es heterocigota para esta caracterstica. El genotipo existe en cada alelo como una unidad discreta que se expresa con letras segn su grado de ploidia. La interaccin de los genes con el ambiente y su expresin es el fenotipo. Si son distintos puede ocurrir: Dominacin completa: uno domina sobre el otro inhibiendo su accin. Dominacin incompleta: los rasgos parecen mezclarse obteniendo un fenotipo intermedio. Codominancia: los dos alelos dominan por igual y se expresan ambos con la misma intensidad. Sucede por ejemplo, con los grupos sanguneos. Cruzamiento prueba: en la dominancia completa no es posible conocer el genotipo del individuo ya que puede ser homocigota o heterocigota. Para averiguarlo se realiza un entrecruzamiento entre el individuo de fenotipo dominante con un homocigota recesivo. Herencia ligada al cromosoma X: sucede porque en el cromosoma X se encuentra mucha informacin gentica. Si bien las mujeres heredan dos, el hombre hereda solo un cromosoma X por que tiene una sola copia de todos esos alelos. Esta caracterstica se llama hemicigota. Si hay un alelo anormal en dicho cromosoma, siempre se expresara en el hombre. En cambio la mujer puede ser simplemente portadora.
Segunda Ley: transmisin independiente. Dos genes tienen que ser independientes, cada uno tiene que tener informacin sobre genotipo diferente. Tienen que estar ubicados en cromosomas homlogos distintos. Si los genes estn ligados voy a obtener dos pares de gametas, excepto que se produzca un crossing over y se podran obtener 4 gametas diferentes.