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UNIVERSIDAD DE LAS FUERZAS ARMADAS ESPE

CARRERA DE ELECTRNICA E INSTRUMENTACIN


INSTRUMENTACIN BIOMDICA


1. DATOS INFORMATIVOS
1.1. Nombre:
Navas Fonseca Alex Dario
1.2. Nivel: Noveno A
1.3. Fecha: 13 de julio de 2014

2. TEMA

Anlisis de la Dinmica No Lineal: Caos, Fractales y Complejidad aplicados al estudio
de ECG en la Universidad de las Fuerzas Armadas-ESPEL
3. OBJETIVOS

3.1. GENERAL
Analizar la Dinmica No Lineal: Caos, Fractales y Complejidad y aplicar estos conceptos
al estudio de ECG en la Universidad de las Fuerzas Armadas-ESPEL

3.2. ESPECFICOS
Investigar fractales en el entorno medico
Analizar diversas seales tomadas de pacientes enfermos, sanos y en estado de
meditacin profunda
Aplicar los algoritmos disponibles en la prctica para el anlisis
Investigar mediante el anlisis fractal si existe alguna variacin el mismo debido a
las edades de los pacientes
Encontrar variaciones en el examen en sujetos sanos, enfermos y estado de
meditacin profunda.


4. RESUMEN
El presente documento proporciona informacin sobre el uso del anlisis fractal y el
mtodo de ley de potencias para analizar similitudes en exmenes ECG en pacientes y
de esta manera dar un diagnstico ms acertado con respecto a enfermedades
cardiacas. Se utiliza el mtodo de la entropa muestral para determinar la complejidad
de las series temporales correspondientes al ECG de seis pacientes a ser analizados


5. MARCO TERICO
Un fractal es, por definicin, un conjunto cuya dimensin de Hausdor f f- Besicovitch
es estrictamente mayor que su dimensin topolgica.
Este concepto no es definitivo, el mismo Mandelbrot reconoce que no incluye algunos
conjuntos que, por otras razones, deben incluirse en la categora de fractales.
Han sido propuestas otras definiciones y, de hecho, estamos ante un concepto
geomtrico para el que an no existe un una definicin precisa, ni una teora nica y
comnmente aceptada.
No obstante, durante este perodo de tiempo, la geometra fractal se ha establecido
como una nueva rama de las Matemticas que tiene muchas aplicaciones en reas tan
dismiles como fisiologa, qumica, psicologa, fsica, finanzas, biologa, astronoma,
geografa, msica y geologa lo que ha llevado a que se le preste cada da ms atencin.

No fractal

Fractal




Tienen autosimilaridad, es decir, que las partes (detalles) se parecen al total



Similaridad determinstica (Tringulo de Sierpinski)



Similaridad Estadstica (Patrones naturales que se bifurcan)




Escalado: La longitud depende de la resolucin, por ejemplo:

La longitud de la costa depende de la escala del instrumento de medida.



Propiedades estadsticas

Los momentos pueden ser cero o infinito.

Funcin Densidad de Probabilidad (Estadstica No Fractal vs Fractal)
o Por ejemplo, la estimacin muestral de la media no se estabiliza en
procesos fractales.
o En procesos fractales no hay media poblacional, ni un nico valor
describiendo el resumen de los datos

No Fractal Fractal








ANALISIS FRACTAL EN EL ECG

Dinmicas del Ritmo Cardiaco
Tasas Promedio: corazn normal vs insuficiencia cardiaca.
Pero hay estadsticas escondidas, o mejor dicho, dinmicas diferentes.
Paradigma clsico de homeostasis: el control neuroautonmico amortiguar el
ruido para volver a un estado de equilibrio constante.
Pero el ciclo cardiaco del corazn sano muestra en reposo una dinmica
compleja, aparentemente poco predecible, frente a las oscilaciones lentas y
cuasi-peridicas (relacionadas con la respiracin).

Detrended Fluctuation Analysis

DFA es un mtodo til para revelar la extensin de correlaciones a largo alcance en
series temporales:
Integramos la serie temporal (N muestras).
Se divide en cajas de igual longitud n, ajuste LS en cada caja a los datos
(tendencia, yn[k]).
Quitamos la tendencia a la serie integrada, y[k] yn[k] en cada caja.
La fluctuacin RMS de la serie resultante es:
() =
1

([]

[])
2

=1

Se repite en varias escalas para caracterizar la relacin entre F(n) y el tamao
de la caja.
LogF(n) vs Logn resulta ser una ley de potencias (escalado), la pendiente es
(parmetro de autosimilaridad), que caracteriza las fluctuaciones.



Variabilidad de la Tasa de Escalado
Periodicidad, 0 < < 0.5.
Ruido incorrelado (aleatorio), = 0.5.
Fractal (Ley de Potencias, correlaciones de largo alcance), 0.5 < 1.
Camino aleatorio, > 1.

Complejidad de la Dinmica del Ritmo Cardiaco
Variabilidad de tipo fractal en el intervalo entre latidos.
No tiene una escala de tiempo caracterstica.
Genera organizacin de largo alcance.
Orden en una seal catica.



ENTROPA DE SHANNON
Shannon y Weaver plantearon el concepto de cantidad de informacin I como el nmero
de smbolos posibles que representan el mensaje expresado en bits y queda enunciado
de la siguiente manera:
=
2
1
()

Donde:
A es el suceso
p(A) es la probabilidad del mensaje o del suceso y es un nmero entre 0 (un evento
improbable) y 1 (un evento posible).
Puede deducirse de la frmula que cuanto ms improbable (prximo a cero) sea un
suceso susceptible de ser transmitido como un mensaje, tanto mayor es la cantidad de
informacin que se podr proporcionar por su ocurrencia.
A la entropa H, Shannon la defini como la cantidad de informacin promedio de estos
mensajes, definida de la siguiente forma:
=
2

Donde N = nmero de mensajes posibles en el conjunto

Entropa Aproximada
Dada una secuencia SN (N muestras, x1, x2,. . . , xN), tenemos ApEn(SN,m, r ).
m es la longitud del patrn, y r el criterio de similitud.
Patrn de longitud m, que comienza en i, se denota por pm(i).
Dos patrones son similares si:
|x(i + k) x(j + k)| < r , 0 k < m

Nmero de patrones en Pm (conjunto de todos los patrones de longitud m) que
son similares a pm(i):



Es un estadstico de regularidad que cuantifica la impredecibilidad de de las
fluctuaciones en una serie temporal. Intuitivamente podemos ver que la
presencia de patrones de fluctuacin en una serie temporal la hace ms
predecible que una serie que no las tenga:



Entropa Muestral

Es el negativo del logaritmo natural de la probabilidad condicional de que secuencias
cercanas para m datos consecutivos estarn tambin cerca si aadimos un punto ms:






6. DESARROLLO
6.1. Caracterizacin de la Complejidad Mediante SampEn
Se provee al alumno con un fichero binario que implementa el algoritmo
de la Entropa Muestral en C (sampen.exe). Dicho ejecutable se usa de
forma exclusiva en linea de comando. El uso de dicho cdigo se puede
consultar mediante la orden sampen -h. El resultado ser:




Un ejemplo de orden para realizar el anlisis SampEn mediante este
ejecutable de la serie temporal correspondiente a un paciente es
C : \sampen m 2 n r 0.2 v < pacienteX.rr > pacienteX.se.
El resultado del anlisis SampEn se almacena en el fichero de texto
pacienteX.se con el formato:
SampEn(0,r,N_ptos)=sampen0 (standard deviation=sd0)
SampEn(1,r,N_ptos)=sampen1 (standard deviation=sd1)
. . .
SampEn(m,r,N_ptos)=sampenm (standard deviation=sdm)


6.2. Realice el anlisis SampEn de las series temporales correspondientes a los
seis pacientes, almacenando los resultados ficheros identificables.
Utilizar el cdigo C : \sampen m 10 n r 0.0002 v < pacienteX.rr >
pacienteX.se. cambian X por el nmero de cada paciente


Observar los resultados de cada fichero








8. CONCLUSIONES
Los fractales son figuras geomtricas que tienen similitud vistos desde
diferentes escalas.
Para el anlisis fractal se necesita un anlisis no lineal, dejando obsoleta
la estadstica tradicional.
La onda R indica el instante en que inicia un nuevo latido del corazn.
Para analizar de mejor manera un ECG es necesario realizar una relacin
lineal, el cual consiste en una recta que aproxima los puntos a su
alrededor y es tomada en ventanas.
La muerte sbita se debe a la actividad elctrica desorganizada del
corazn.
Al realizar el anlisis una curva con mayor pendiente significa procesos
ms complejos (salud) y una de menor pendiente significa procesos
menos complejos (enfermedad, vejes).
A mayor edad y en estado de enfermedad provoca prdida de
complejidad de las seales biolgicas.
Capacidad prognstica y diagnstica mediante el anlisis de la entropa
a diferentes escalas.



9. RECOMENDACIONES
Antes de usar el cdigo conocer los parmetros del mismo, para esto
revisar la ayuda (sampen h).
De ser posible graficar los resultados con la ayuda del software MATLAB
Ingresar correctamente el cdigo, de no ser asi se obtendr errores
Tener paciencia en el clculo ya que se maneja una cantidad
considerable de datos.

10. Bibliografa
Npoles Valdes, J., & Palom Parra, L. (2012). FRACTALES A NUESTRO ALREDEDOR. VIDYA, 16.
Rojo lvarez, J. L. (2014). Dinmica No Lineal: Caos, Fractales y Complejidad. Latacunga.