Cibertorio

Anlisis del polimorfismo Diagnstico

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Guin de la prctica

Diagnstico gentico molecular del polimorfismo de globina beta S mediante RFLP

(Prctica en laboratorio virtual Cibertorio)
Fundamento:
La anemia drepanoctica (anemia de clulas falciformes) se origina por la mutacin de un solo nucletido en el gen de globina beta humana. Esto genera en la poblacin un polimorfismo, definido por la presencia del alelo normal o el mutado, en cada uno de los dos cromosomas 11 homlogos. Pretendemos estudiar el posible diagnstico gentico de esta enfermedad a travs de un polimorfismo !LP, es decir, mediante restriccin " electroforesis. #omo material de partida disponemos de muestras de $%& (virtuales) correspondientes a una parte de ese gen, para las dos variantes (normal, && o '', " drepanoctica, ((). Por lo tanto, vamos a estudiar un locus )ue corresponde a una parte del gen de globina beta " )ue contiene el punto polimrfico.
Ms informacin (no necesaria para la prctica) #oncretamente, las muestras comprenden el e*n 1, el intrn &, el e*n + " parte del intrn ,. ecuerda )ue el polimorfismo se sit-a en el e*n 1. !claracin de la nomenclatura & la hemoglobina normal del adulto, + + , se la llama habitualmente "emoglobina !. de ah el nombre & para el alelo normal de la globina beta a)u estudiado. /ambin se representa como ', de wild type (tipo salva0e o silvestre). La hemoglobina de las clulas falciformes (sickle cells), + (+ , se denomina "emoglobina S.

& lo largo de la pr1ctica tendr1s )ue conservar informacin para pasarla de una ventana a otra del programa. utili2a para ello el 3,loc de %otas4 de 'indo5s. #onviene )ue a6adas tus propios comentarios para identificar la informacin )ue vas guardando. puedes imprimirlo al acabar, para llevarte toda la informacin e incluirla en tu cuaderno de pr1cticas. &"uda para copiar " pegar te*to7 utili2a el men- )ue aparece al pulsar el botn derecho del ratn o, con el teclado, pulsa #trl8# para copiar " #trl89 para pegar.

Bibliografa: :. Lu)ue " &. ;err1e2 (+<<1) Texto Ilustrado de Biologa Molecular e Ingeniera Gentica , p1gs.
=>1?=>=. Ediciones ;arcourt @ Elsevier Espa6a, Aadrid.

Cmo comenzar:
El laboratorio virtual funciona dentro de una p1gina web, por lo )ue debes comen2ar abriendo el navegador de internet (Bnternet E*plorer o !irefo*). Cna ve2 )ue se abra el programa, debes buscar la p1gina de #ibertorio7 Puede estar en los 3Favoritos4 o 3Marcadores4. si no, visita http://biomodel.uah.es/lab/cibertorio/

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Anlisis del polimorfismo Diagnstico

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Ensayo: diagnstico gen tico de dre!anocitosis mediante "F#P

#b$eti%o Empleando una en2ima de restriccin elegida previamente, )ue corta de forma diferente los alelos normal " mutado del gen de globina beta, reali2ar el diagnstico gentico de cuatro pacientes. Materiales %irtuales
Soft&are D Laboratorio virtual de biologa molecular 3#ibertorio4 Reacti%os %irtuales D En2imas de restriccin (deben comprarse en ,ob#o/A, como se e*plica m1s adelante) D Grupo de muestras para diagnstico gentico (tambin comprado en ,ob#o/A), )ue contiene las siguientes muestras de $%&7 D $%& del gen de globina de una persona homocigtica normal (representada como && o ''). D $%& del gen de globina de una persona homocigtica falciforme (representada como ((). D #uatro muestras de $%& de pacientes cu"o genotipo se pretende averiguar (designadas Pt1, Pt+, Pt= " PtE). D Aarcador de masa molecular de $%& (gratuito, de ,ob#o/A) D /ampn universal de restriccin 1<* (gratuito, de ,ob#o/A) D &gua D Puntas de pipeta amarillas, capacidad de 1 a 1<< L D &garosa D /ampn de electroforesis /,E (/ris@,orato@E$/&) D ,romuro de etidio D #olorante de carga de muestras en el gel (contiene a2ul de bromofenol, *ileno?cianol " glicerol) 'nstrumentacin %irtual D Aicropipeta variable hasta 1<< L D Bncubador con regulacin de temperatura ,ob#o /emp?F?Aatic/A D #ubeta de electroforesis hori2ontal en agarosa ,ob#o Gel?F?Aatic/A D !uente de corriente continua ,ob#o 1<<<HI/A (de 1< a 1<<<9) D /ransiluminador ultravioleta (acoplado a la cubeta) D Pantalla " gafas de seguridad protectoras contra C9

Procedimiento $ebes haber reali2ado previamente la pr1ctica 3ensa"o de en2imas de restriccin4. &hora, utili2ando -nicamente la en2ima adecuada para detectar este polimorfismo (seleccionada en la pr1ctica anterior), reali2ar1s el an1lisis de cuatro muestras de pacientes a los )ue ha" )ue diagnosticar si son portadores del alelo causante de la drepanocitosis. 1) (i no lo has hecho "a, sigue las instrucciones de la pr1ctica de ensa"o de en2imas para comprar muestras " en2imas en el impreso de pedido en lnea de ,ob#o, as como para usar el laboratorio virtual. +) Prepara una tabla con los reactivos " cantidad de cada uno )ue necesitar1s para cada tubo7
tubo nJ vol. de agua vol. de tampn tipo de muestra vol. de muestra volumen total (( ++ L >< L && ++ L >< L Pt1 ++ L >< L Pt+ ++ L >< L Pt= ++ L >< L PtE ++ L >< L 1 + = E K L

Prepara los L tubos de ensa"o con el contenido indicado en la tabla. & continuacin, transfiere la mitad del contenido de cada tubo (E< L) al tubo situado deba0o de l (es decir, del tubo 1 al M, del + al >, etc.). &s has creado duplicados de cada tubo, uno )uedar1 como control " al otro a6adiremos en2ima de restriccin. & los tubos M a 1+ a6ade ahora 1 L de la en2ima de restriccin )ue seleccionaste en la pr1ctica 3ensa"o de en2imas de restriccin4. =) Pon en marcha la reaccin de restriccin pulsando en el botn 3 Comenzar4. /ranscurrido el tiempo virtual re)uerido, se ha completado la reaccin. E) En el men- principal de #ibertorio, selecciona el mdulo 3 Laboratorio de electroforesis4. Pulsa el botn 3Autocargar4, )ue har1 )ue las 1+ muestras preparadas en la digestin anterior se transfieran a los 1+ primeros pocillos

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del gel virtual. en el pocillo nJ 1= se carga autom1ticamente una me2cla de patrones de tama6o (3escalera de $%&4). K) &0usta en la fuente el volta0e a +<< voltios " el tiempo a +,K horas virtuales. #onecta la corriente para comen2ar la electroforesis. Aientras progresa, puedes encender la lu2 C9 (aseg-rate de tener puestas tus gafas o careta virtuales de proteccin) " apagar las luces de la habitacin virtual para ver cmo va avan2ando el $%& " separ1ndose las bandas. L) Cna ve2 completada la electroforesis, dibu0a un es)uema de la posicin de las bandas e interpreta los resultados obtenidos7 Ncu1l es el genotipo de los cuatro pacientesO N(er1n portadores o desarrollar1n la enfermedadO