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FLUJO DE TRABAJO AUTOMATIZADO PARA

LA SIMULACIÓN DE CAMBIOS
POTENCIALES EN LA DISTRIBUCIÓN DE
ESPECIES VEGETALES SEGÚN DISTINTOS
ESCENARIOS DE CAMBIO CLIMÁTICO

Blas Benito de Pando

Tutor: Marc Compte

2009-2009

9ª Promoción
PRESENTACIÓN Y CONTEXTUALIZACIÓN
El cambio del clima tiene efectos en la distribución
geográfica de las plantas
Los Modelos de Distribución de Especies (MDEs) pueden
utilizar simulaciones de clima futuro para proyectar la
distribución actual de una especie sobre escenarios de
cambio climático.
Los resultados de estas proyecciones son útiles para el
diseño de planes de conservación de la biodiversidad.
No existe un entorno de modelado amigable que
permita aplicar esta técnica a gran número de especies
¡Pero el software libre y la tecnología de diseño y
ejecución de flujos de trabajo proporcionan las
herramientas para construirlo!
OBJETIVOS
Desarrollar un flujo de trabajo automatizado de
software libre para simular cambios en la distribución
de plantas debidos al Cambio Climático
El sistema debe ofrecer:
Simulaciones de distribución futura de plantas,
obtenidas mediante ensamblado de varios MDEs
Análisis y publicación automática de los resultados
METODOLOGÍA (I): Fundamento metodológico
Proceso de modelado estándar Detalles
Algoritmos predictivos:
Distancia Euclídea
Distancia Chebyshev
Distancia Mahalanobis
Distancia Manhattan
GARP
Proceso de modelado propuesto Support Vector
Machines
Máxima Entropía
Redes Neuronales.
Ensamblado: mediana de
idoneidad del hábitat y
desviación estándar
METODOLOGÍA (II): Arquitectura del sistema
Funciones
Kepler: diseño y ejecución de
los flujos de trabajo
Bash: procesamiento de texto
y control de GRASS
OpenModeller y MaxEnt:
generan MDEs
GRASS GIS: almacenamiento,
ensamblado y análisis de
Dos flujos de trabajo: modelos, control de resolución
Preparación de Registros Octave: preparación de
coordenadas, evaluación de
de Presencia (flujo PRP)
modelos
Modelado (flujo R: gráficos descriptivos y
MODPLAN) análisis estadístico
METODOLOGÍA (III): flujo de trabajo PRP
Función principal

Funciones
Prepara entorno de
trabajo
Prepara coordenadas
de presencia de la
especie
Selecciona especies
según su número de
registros de presencia
METODOLOGÍA (IV): flujo de trabajo MODPLAN
Algunas secciones de MODPLAN

Funciones
Calibrado, ensamblado y
evaluación de MDEs
Proyección de MDEs sobre 4
escenarios de cambio
climático, periodo 2000-2100
intervalos de 20 años
Análisis de los resultados
Generación automática de
informe html con resultados
RESULTADOS (I)
Organizados en un informe html preparado para difusión de los resultados en
Internet. Ejemplo en: http://botanica2.ugr.es/modplan/INICIO.html
SECCIÓN 1: Distribución conocida y requerimientos ecológicos

SECCIÓN 2: Evaluación del modelo de distribución


RESULTADOS (II)
SECCIÓN 3: Proyección sobre distintos escenarios VECTOR DE MIGRACIÓN

ACTUAL
CGCM2-B2

ECHAM4-A2 IDONEIDAD DEL HÁBITAT

ECHAM4-B2

CGCM2-A2
FRAGMENTACION HÁBITAT

MAPA PERSISTENCIA

SECCIÓN 4: Análisis de resultados


CONCLUSIONES

Se ha diseñado y desarrollado, mediante software libre, un


flujo de trabajo que automatiza completamente un proceso
de modelado ecológico complejo
Se han utilizado en total 330 actores de Kepler, y 18 scripts
de Bash, GRASS, Octave y R, con un total de 3100 líneas de
código
A pesar de la aparente complejidad, una vez configurado el
sistema operativo con los paquetes necesarios, la utilización
del flujo de trabajo se reduce a pulsar sobre el botón Run de
Kepler
El proyecto se ha diseñado para llevar adelante una tesis
sobre los efectos potenciales del cambio del clima en la flora
amenazada andaluza. Las pruebas realizadas durante el
desarrollo confirman que la herramienta funciona, y
actualmente se está trabajando en algunas mejoras.