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El Microscopio Electrnico de Barrido permite obtener imgenes de gran resolucin en materiales ptreos, metlicos y orgnicos.

La luz se sustituye por un haz de electrones, las lentes por electroimanes y las muestras se hacen conductoras metalizando su superficie. Los electrones secudarios se asocian a una seal de TV. Son ampliamente utilizados en la biologa celular. Aunque permite una menor capacidad de aumento que el microscopio electrnico de transmisin, este permite apreciar con mayor facilidad texturas y objetos en tres (3) dimensiones que hayan sido pulverizados metlicamente antes de su observacin. Por esta razn solamente pueden ser observados organismos muertos, y no se puede ir ms all de la textura externa que se quiera ver. Los microscopios electrnicos slo pueden ofrecer imgenes en blanco y negro puesto que no utilizan la luz. Este instrumento permite la observacin y caracterizacin superficial de materiales inorgnicos y orgnicos, entregando informacin morfolgica del material analizado. A partir de l se producen distintos tipos de seal que se generan desde la muestra y se utilizan para examinar muchas de sus caractersticas. Con l se pueden realizar estudios de los aspectos morfolgicos de zonas microscpicas de diversos materiales, adems del procesamiento y anlisis de las imgenes obtenida. Los primeros instrumentos desarrollados para este propsito, fueron microscopios pticos, porque con los ojos no se pueden ver las cosas muy pequeas. Estos instrumentos fueron desde una simple lupa, hasta un microscopio compuesto

El microscopio electrnico de transmisin se compone bsicamente de dos o ms lentes de condensador, un can de electrones, un soporte de la muestra y una pantalla de visualizacin. El proceso por el cual este microscopio funciona es relativamente simple. El haz de electrones disparados por el can de electrones se condensa ms de una vez por los condensadores, que son bsicamente los imanes usados para enfocar el haz. A medida que se dispara el haz a travs de la muestra que se est observando, slo unos pocos de los electrones que pasan a travs de dicha muestra (recuerda que los electrones son inimaginablemente pequeos) son registrados por el detector de pantalla debajo de la muestra. Como nota, este espcimen se corta muy fino para permitir que los electrones pasen a travs de l. La imagen se graba en dos dimensiones y slo en escala de grises. Cada imagen es una seccin transversal de una muestra debido a que es muy delgada. Un microscopio electrnico de transmisin slo es capaz de tomar imgenes en dos dimensiones. Sin embargo, compilando muchas imgenes, se puede crear una imagen casi tridimensional.