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De la Cruz de la Cruz Areli Regina Fisiologa microbiana Grupo: 3 Protenas asociadas al nucleoide.

Protena FIS Fue inicialmente identificada por su capacidad de promover as reacciones de inversin del DNA catalizadas por la familia de recombinasas Hin. Esta protena se constituye en un homodmero cuyas subunidades estas codificadas en el gen fis y presenta una estructura tpica hlice-giro-hlice involucrada en la unin al DNA. De carcter bsico, se encuentra altamente conservada en bacterias entricas y es una de la protenas asociadas al nucleoide de E. coli ms abundantes en la fase exponencial del crecimiento, llegando a alcanzar un mximo de 60.000 molculas por clula. Adems, de la misma forma que las protenas IHF, HU y en menor grado H-NS, es capaz de generar curvatura en el DNA. Inicialmente, la protena FIS fue descrita como cofactor de la recombinacin de lugar especfico, pero actualmente se considera que juega un papel importante en la regulacin de la expresin gnica y en la modulacin del superenrollamiento local del DNA. Esta protena reconoce una secuencia de 15 pares de bases muy poco conservada, aunque tambin se une al DNA de forma inespecfica. Estudios bioinformticos ha revelado que el cromosoma de E. coli contiene aproximadamente unos 68.000 posibles lugares de unin de esta protena, o lo que es lo mismo un lugar de unin de cada 230 nucletidos. La protena FIS regula la expresin de un elevado nmero de genes, tanto de forma directa a nivel del inicio de transcripcin como de forma indirecta, y entre los que podemos encontrar genes implicados en la virulencia de bacterias patgenas, como en el caso de Salmonella entrica serovar Tiphimurium, E. coli enteropatognicas y Shigella flexneri. La protena FIS tambien regula genes responsables de la formacin de biofilm en E. coli enteroagregativas. Adems, se ha propuesto un importante papel de las protena FIS como reguladora de la expresin de los genes que codifican RNA ribosmico y como moduladora del superenrollamiento locas del DNA, probablemente por represin de los genes gyrA y gyrB que codifican la DNAgirasa de e. coli y por activacin de uno de los promotores del gen topA, que codifica la topoisomerasa I mediante un mecanismo que es sensible al estrs oxidativo.

Protena HU La protena HU fue identificada inicialmente como protena tipo histona presente en la cepa de E. coli U93. Esta protena se constituye en un homodmero o heterodmero formado por dos subunidades intercambiables, HU- de 9.2 kDa y HU- DE 9.5 kDa, muy similares entre s (aproximadamente un 70% de similitud a nivel de secuencia aminoacidica) en E. coli, S. entrica serovar Typhimurium, Erwinia chrysanthemi y S. flezneri. Los genes que codifican las subunidades de la protena HU, hupA (subunidad ) y hupB (subunidad ), estn reguladas de forma diferente. Parece ser que la presencia de formas heterodimricas de protena HU es una caracterstica comn de las bateras entricas, mientras que otros grupos bacterianos nicamente presentan un homodmero. En E. coli, la protena HU puede presentarse en forma de -homodmero, -homodmero o -heterodmero. Mientras que el -homodmero predomina en la fase exponencial del crecimiento, la supervivencia del cultivo en fase estacionaria requiere de la presencia del heterodmero. De esta forma, la presencia en E. coli de los genes parlogos hupA y hupB permite que la composicin de la protena HU sea dinmica, lo que afecta tanto su capacidad de influir en la estructura del nucleoide como en la modulacin que realiza de la expresin gnica. Su capacidad de unin al DNA viene determinada por la presencia de cargas positivas en la superficie y, aunque presenta una pequea especificidad de secuencia, se une preferencialmente al DNA de forma inespecfica y al DNA que presenta algn tipo de lesin en una de sus cadenas o alguna alteracin estructural. Histricamente se ha considerado a la protena HU como homologa procariota de las histonas eucariotas e incluso se le ha atribuido la capacidad de formar estructuras tipo nucleosomas con el DNA, aunque, actualmente no hay pruebas de la formacin de estas estructuras. No existen muchos detalles sobre el papel de la protena HU en la regulacin de la expresin gnica, aunque si es conocida su implicacin en la regulacin del opern gal y el antagonismo que presenta con H-NS tanto a nivel de estructuracin del nucleoide como a nivel de modulacin de la expresin gnica.