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ESTRUCTURA PRIMARIA DE LAS

PROTEÍNAS
GENERALIDADES

 Se refiere a la secuencia de AA.


 Es la base para los demás niveles de
organización y función biológica de las
proteínas.
 Sanger en 1955 determina por 1ra vez la
secuencia completa de la insulina.
 Desde esa fecha se han secuenciado miles de
proteínas.
EL ENLACE PEPTÍDICO
 Es la unión de un grupo α-carboxilo de un AA con el
grupo α-amino de otro AA. Se requiere energía del ATP.
 Los grupos amino y carboxilo de la cadena lateral NO
forman enlaces peptídicos
Formación del enlace peptídico por dehidración

NH2 1 COOH NH2 2 COOH

Carbodiimida Deshidratación
-H2O

O
NH2 1 C N 2 COOH
H
Características del enlace peptídico:
es rígido y planar = grupo amida planar

C H
C N
O C
El enlace peptídico (C-N) es un enlace Distancias
simple, pero se comporta como un interatómicas y
doble enlace debido a estabilización por
resonancia (aprox. 40%).
ángulos de enlace del
Por tanto, no hay libertad de rotación grupo amida planar
alrededor de este enlace.

Determinados por L.
Pauling y R. Corey
(P.N. 1954)
Configuraciones tipo cis y trans del enlace peptídico

La configuración trans es más estable y


la más frecuentemente encontrada en
las proteínas.

La configuración cis sólo es compatible


con la Pro.
PÉPTIDOS
 Son compuestos formados por 2 o más
AA, unidos por enlaces peptídicos.
 Oligopéptidos.- Si constan de 2 a 10
residuos (di, tri, tetra, pentapéptidos, etc.)
 Polipéptidos.- Si tienen más de 10 residuos.
 Los péptidos siempre se escriben del
extremo N-terminal al extremo C-terminal.
 Cuando un AA forma parte de una cadena
se denomina residuo.
Note que el esqueleto (o columna vertebral) de una cadena
peptídica es: N - Cα – C – N - Cα – C – N - Cα – C – N …..etc.
La lectura de una cadena es del N-terminal al C-terminal.
Ejemplo de un nonapéptido
LA INSULINA
 Fue la primera proteína completamente secuenciada por Sanger
en 1955.
 Se estableció que esta constituida por 51 AA y 2 cadenas (A y
B). Las 2 cadenas se unen por 2 puentes S-S (intercatenario).
La cadena A tiene un puente S-S (intracatenario).
 Es sintetizada por las células ß del páncreas bajo la forma de
proinsulina. Su rol es regular los niveles de azúcar en la sangre
(glicemia).
ANEMIA FALCIFORME
 Es una enfermedad molecular hereditaria
caracterizado por la presencia de GR en forma de
hoz (sickle) causando trombosis. Su fragilidad
(vida más corta) conduce a anemia.
 Causa: sustitución de Val por Glu en la posición 6
de las cadenas ß de la Hb debido a una mutación
puntual en el gen que codifica esta cadena.
 La Hb se denomina HbS que forma agregados
(polímeros) que hacen que el GR cambie de
forma.

Conclusión: La estructura primaria de la


proteína determina los demás niveles de
organización (2ria, 3ria y 4ria.)
Proteínas homólogas
 Son proteínas (en una misma especie o en diferentes
especies) que tienen la misma función biológica pero que
difieren en su estructura primaria. Ej. Isoenzimas,
Inmunoglobulinas, etc.
 Sólo difieren en los residuos variables, pues los invariables
son esenciales para su función.
 Estas proteínas permitieron la construcción de mapas
evolutivos de las especies del planeta (árboles
filogenéticos).

Ejemplo: de los 153 residuos de la mioglobina humana (en rojo) sólo difiere
en un AA de la de chimpancé (en azul).
ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL (3D) DE
LAS PROTEÍNAS.
•Factor
determinante de la actividad biológica de una proteína =
conformación nativa.
•Dependiente de la estructura primaria.
Arbol filogenético para
el citocromo c
ESTRUCTURA SECUNDARIA
 Se refiere a la orientación espacial de un tramo de la cadena
peptídica (del esqueleto).
 El enlace peptídico no tiene libertad de rotación, pero los
enlaces phi y psi tienen gran libertada de rotación.
 La rotación de estos enlaces determinan la orientación de la
cadena (tipo de estructura secundaria).
Ejemplos de rotación de los enlaces phi y psi.
TIPOS DE ESTRUCTURA SECUNDARIA

 Teóricamente, según las


rotaciones de estos ángulos,
habrían una infinidad de tipos
de estructura secundaria. Sin
embargo, por razones estéricas
no son posibles.
 Si los valores phi y psi son
constantes en un tramo de la
cadena, éste adopta una forma
helicoidal regular.
 Los tipos más comunes son las
estructuras:
1. Helicoidales (o estructuras
α)
2. Laminares (o estructuras β)
1. Estructuras helicoidales

 Una hélice se caracteriza


por el número de vueltas
(n) y por su inclinación o
paso (p).
 Las hélices pueden ser
dextrógiras o levógiras.
 La hélice más
frecuentemente
encontrada en las
proteínas es la α-hélice.
 La hélice se mantiene
gracias a puentes de
hidrógeno.
α-hélice
ESTRUCTURAS LAMINARES (o láminas β)

 Es el segundo tipo más común de las proteínas.


 Las distintas cadenas se mantienen unidas por puentes de H.
 Existen láminas antiparalelas y paralelas.
ESTRUCTURAS ALEATORIAS

 Son cualquier estructura que no corresponda a hélices ni


láminas.
 Solo presente en proteínas globulares proporcionando los
cambios direccionales o bucles o giros.
ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS O MOTIVOS

 Son combinaciones de estructuras secundarias.


 Forman parte de los dominios de una proteína globular.
Ejemplos de proteínas con estructura secundaria:
proteinas fibrosas
Queratina
 Proteína fibrosa de alta resistencia presente en todos los vertebrados.
 Existen 2 tipos:
1. α-Queratinas.- Pte en mamíferos (epidermis, cabello, lana, cuernos,
uñas)
2. β-Queratinas.- Pte en peces y reptiles.
 Son ricas en Cisteína los cuales forman puentes S-S intercatenarios lo que
le da resistencia. Las queratinas duras (cuernos, uñas) tienen mayor
cantidad de S-S que las blandas.
Ejemplo de α-Queratina: el cabello humano
 La resistencia del cabello se debe a los
numerosos puentes S-S que unen las
2 α-hélices y a los puentes de H.
 El rizado se debe a la posición de los
puentes S-S el cual está determinado
genéticamente.
 El cabello mojado es más debil debido
a que las moléculas de agua compiten
por los puentes de H.

Organización jerárquica del cabello


Ondulado permanente del cabello.
Colágeno
 Es una familia de proteínas fibrosas que forman fibras insolubles de alta
resistencia.
 Es la proteína más abundante de los vertebrados. Forma parte de la matriz
extracelular(tejido conectivo intersticial).
 Presente en todos los tejidos y órganos dando forma y consistencia.
 Abunda en tejidos conectivos de hueso, cartílagos, piel, tendones,
ligamentos , vasos sanguíneos y córnea.
 La disposición de las fibras de colágeno depende del tejido y la función que
realizan. P.ej. en los tendones están organizados paralelamente, en la piel
forman una red entrecruzada de varias capas que aumenta con la edad (a
eso se debe la dureza de las carnes viejas).
 La composición de AA varía con el tipo y especie animal, pero la mayoría
contiene Gli, Ala, Pro, OH-Pro e OH-Lis. Es bajo en Tir y nulo en Trp (baja
calidad). En algunos tipos la Cis está ausente.
 Son glicoproteínas. El contenido de CH varía según el tipo (0.4 a 12%).
 Contiene alisina (un AA derivado) que forma enlaces covalentes cruzados
entre las superhélices adyacentes.
Estructura del colágeno
 El tropocolágeno es la unidad
estructural básica del
colágeno. Consta de 3 cadenas
levógiras formando una
superhélice (cable de triple
hélice) dextrógira.
 Tiene un PM de 285 kD, un
diámetro de 14 A y una
longitud de 3000 A.
 Las cadenas se denominan α,
β y γ que se mantienen unidas
por puentes de H.
 En el agua los puentes de H del
colágeno compiten con las
moléculas de agua formando
gelatina (se deshace el cable
de triple hélice).
Organización estructural del colágeno
Tipos de colágeno
 Hasta la fecha se han caracterizado hasta 19 tipos de colágeno.
 Los diferentes tipos se encuentran en distintas localizaciones del
cuerpo.
 Los distintos tipos pueden ser agrupados en:
1. Formadores de fibrillas (tipos I, II, III, V y XI)
2. Formadores de redes (tipos IV, VIII y X)
3. Asociados con superficies fibrilares (tipos IX, XII y XIV)
4. Asociados con proteínas transmembrana (tipos XIII y XVII).
5. Formadores de endotastina (tipos XV y XVIII)
6. Formadores de filamentos periódicos (tipo VI)
 El tipo I es el más abundante en mamíferos, principal componente del
tejido conectivo. Contiene 33 % de Gli, 13% Pro, 9% de OH-Pro.
Enfermedades relacionadas con el colágeno
 Latirismo.- Hay una reducción de los enlaces
cruzados produciendo anormalidad de huesos,
articulaciones y vasos sanguíneos.
 Síndrome de Marfan.- Hay osteogénesis
imperfecta (huesos largos y frágiles). Paganini.
 Síndrome de Ehlers-Danlos.- Hay
hiperextensibilidad de articulaciones y piel
(hombre goma).
Elastina
 Principal proteína encontrada en fibras elásticas localizado en la
matriz EC de tejidos conectivos de células musculares lisas,
células endoteliales y microvasculares, condrocitos y fibroblastos.
 Las fibras elásticas permiten expansirse y contraerse a tejidos
(semejante al jebe) como pulmones, arterias y ligamentos
elásticos.
 Poseen una estructura enrrollada no ordenada cuyos AA son muy
móviles.
 Rica en AA: Gli, Ala y Val poca OH-Pro y nada de OH-Lis. Contiene
AA derivados como la desmosina, isodesmosina y
lisinanorleucina.
 También contiene alisina para formar los enlaces cruzados.
 Las fibras elásticas contienen microfibrillas los cuales están
compuestos de glicoproteínas: fibrilina 1 y fibrilina 2.
Fibroína
 Principal proteína de la seda y telarañas. Resistente, elástica
y flexible.
 Formada por estructura β-laminar antiparalela.
 En la seda está ligada a la sericina (proteína gomosa y amorfa
encargada de mantener las fibras de fibroína juntas).
Laminina
 Después del colágeno tipo IV, la
laminina es la proteína más
abundante en las lámina basales.
 Otorga resistencia al colágeno por su
capacidad de unirse a esta y otras
moléculas presentes en la matriz EC.
 Estructuralmente, es una proteína
trimérica formada por 3 cadenas (α, β
y γ).
 Las cadenas se mantienen unidad por
puentes S-S formando una
superhélice.
 Sólo la cadena α tiene una extensión
en el extremo C-terminal que le
permite a otros componentes de la
matriz EC (colágeno, lípidos
sulfatados y proteoglicanos).
Actina y miosina: proteínas musculares
 Las células musculares contienen muchas miofibrillas paralelas
de 1 mm de diámetro.
 El sarcómero es la unidad funcional de la fibra muscular. Se
repite cada 2.3 mm a lo largo del eje fibrilar en el músculo
relajado.
Corte Sección longitudinal de la miofibrilla del músculo esquelético
mostrando un sacómero: (A) M/E y (B) esquema transversal de la M/E.
Una banda A oscura y una banda I clara alternan regularmente. La región central de
la banda A, denominada zona H, es menos densa que el resto de la banda. La banda
I es bisectado por la muy densa y delgada línea Z.
 El corte transversal de una miofibrilla
muscular revela que el sarcómero está
formado por 2 tipos de proteínas
filamentosas interactuantes:
1. Los filamentos gruesos tienen un
diámetro ~ 15 nm y consisten
principalmente de miosina.
2. Los filamentos delgados tienen un
diámetro ~ 9 nm y constande actina y
el complejo tropomiosina y troponina.
 La contracción muscular se logra mediante
el deslizamiento de los filamentos delgados
a lo largo de los filamentos gruesos,
conducido por la hidrólisis de ATP.
 El complejo tropomisina y troponina regula el
deslizamiento en respuesta a los impulsos nerviosos.
 En el músculo en reposo la tropomiosina bloquea la
íntima interacción entre la miosina y la actina.
 Un impulso nervioso lleva a un incremento en la
concentración de Ca++ dentro del miocito. Un
componente del compleo troponina es sensible al
incremento del calcio, en respuesta, releva la inhibición
de las interacciones miosina-actina por tropomiosina.
Movimiento de la miosina a lo largo de la actina.

 Una cabeza de miosina (amarillo) en la forma de ADP se une


al filamento actina.
 El cambio de ADP por ATP da como resultado:
• La liberación de la miosina de la actina (1) y
reorientación de la palanca del brazo de la miosina (2).
• La Hidrólisis del ATP (3) permite que la cabeza de la
miosina se vuelva a unir en un sitio desplazado a lo largo
del filamento de actina (4).
• La liberación de Pi (5) acompañante de esta unión
aumenta la fuerza de interacción entre la miosina y
actina y vuelve la orientación del brazo palanca.
Estructura de la ACTINA
Estructura de la MIOSINA
Movimiento de kinesinas a lo largo de los microtúbulos

Microtubule Structure.

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