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FACULTAD DE CIENCIA E INGENIERIA EN ALIMENTOS

BIOQUMICA II
ASPECTOS GENERALES DEL METABOLISMO DEL NITROGENO
Ismael Acosta Juan Carlos Lpez Edwin Martnez

El nitrgeno se halla tan solo por detrs del carbono el hidrogeno y el oxigeno en su contribucin a la masa de los seres vivos.

Las molculas de Nitrgeno se encuentran principalmente en el aire. En agua y suelos el Nitrgeno puede ser encontrado en forma de nitratos y nitritos.
La mayor parte de este nitrgeno forma parte de aminocidos y nucletidos. Ciertos aminocidos, o parte de aminocidos se incorpora a la estructura de las purinas y pirimidinas y en un caso parte de un anillo de purina se incorpora a la estructura de los aminocidos (histidina).

La histamina es una molcula que se utiliza como prueba funcional respiratoria y de actividad bronquial, se hallan en todos los tejidos y generalmente se almacena en la piel, pulmones, bronquios e intestinos.

ASPECTOS GENERALES DEL METABOLISMO DEL NITRGENO

Las rutas biosintticas que conducen a los aminocidos y a los nucletidos comparten la necesidad de nitrgeno. Por lo general, los compuestos de nitrgeno solubles y utilizables biolgicamente escasean en el entorno natural, por este motivo, la mayor parte de organismos mantienen una estricta economa en el uso del amoniaco, los aminocidos y los nucletidos.

El ciclo del nitrgeno mantiene una reserva de nitrgeno disponible biolgicamente

La forma mas abundante de nitrgeno es en el aire, que en sus cuatro quintas partes es nitrgeno molecular (N2). A pesar de ello, pocas especies pueden convertir el nitrgeno atmosfrico en formas utilizables para los organismos vivos. Los procesos metablicos de distintas especies actan de forma interdependiente para recuperar y reutilizar el nitrgeno disponible biolgicamente en el Ciclo del Nitrgeno

CICLO DEL NITRGENO

El nitrgeno es fijado por enzimas del complejo de la nitrogenasa

El primer producto importante de la fijacin del nitrgeno es el amoniaco, que puede ser utilizado por todos los organismos, ya sea directamente o tras su conversin en otros compuestos solubles, tales como nitritos, nitratos y aminocidos. La reduccin del nitrgeno a amoniaco es una reaccin exergnica:

Sin embargo el triple enlace de N-N es muy estable con una energa de enlace de 930kJ/mol, por lo tanto la fijacin de nitrgeno tiene una energa de activacin extremadamente alta, con lo que el nitrgeno atmosfrico es prcticamente inerte en condiciones normales. El amoniaco se produce industrialmente por el procedimiento de Haber, que requiere temperaturas de entre 400 y 500C y presiones de nitrgeno e hidrogeno de decenas de miles de kilopascales para conseguir la energa de activacin necesaria.

Sin embargo, la fijacin biolgica del nitrgeno tiene lugar a temperaturas biolgicas y a 0,8 atm de nitrgeno, superndose la elevada barrera de activacin por otros medios. Esto se consigue por la unin y la hidrlisis del ATP. La reaccin global puede escribirse as:

La fijacin biolgica de nitrgeno es realizada por un complejo de protenas denominado complejo de la nitrogenasa. Los componentes clave de este complejo son la dinitrogenasa reductasa y la dinitrogenasa. La dinitrogenasa reductasa es un dimero formado por dos subunidades idnticas. Contiene un nico centro redox de tipo 4Fe-4S, unido entre las subunidades, que pueden ser oxidado y reducido por un electrn. Tienen tambin dos sitios de unin de ATP/ADP (un sitio en cada subunidad).

La dinitrogenasa es un tetrmero formado por dos copias de dos subunidades distintas. La dinitrogenasa contiene hierro y molibdeno, aproximadamente la mitad del hierro y del azufre se encuentra en dos centros 4Fe-4S conectados, denominados agregados P; el resto forma parte de un cofactor de hierro-molibdeno de un tipo nuevo. Se ha descubierto una forma de nitrgenasa que contiene vanadio en lugar de molibdeno; algunas especies de bacterias pueden producir ambos tipos de sistemas de nitrogenasa.

La enzima de vanadio puede ser el sistema primario de fijacin de nitrgeno en algunas condiciones ambientales, pero todava no esta tan bien caracterizado como el sistema dependiente del molibdeno. La fijacin del nitrgeno es llevado a cabo por una forma muy reducida de la dinitrogenasa que precisa ocho electrones, seis para la reduccin del N2 y dos para formar una molecula de H2. La dinitrogenasa se reduce por transferencia de electrones de la dinitrogenasa reductasa.

El tetrmero de la dinitrogenasa tiene dos sitios de unin para la reductasa. Los ocho electrones necesarios se transfieren a la dinitrogenasa de uno en uno; una molecula de reductasa reducida se une a la dinitrogenasa y le transfiere un nico electrn y a continuacin la forma oxidada de la reductasa se disocia de la dinitrogenasa en un ciclo repetitivo.

Cada vuelta del ciclo precisa la hidrlisis de dos molculas de ATP por la reductasa dimerica. La fuente inmediata de electrones para reducir la dinitrogenasa reductasa es variable, pudindose usar ferredoxina reducida, flavodoxina reducida y quizs otras fuentes.

Otra caracterstica importante del complejo de la nitrogenasa en su extrema labilidad en presencia de oxigeno.
La reductasa se inactiva en contacto con el aire, con una vida media de 30 segundos; la dinitrogenasa tiene una vida media de 10 minutos en contacto con el aire.

Las bacterias libres que fijan nitrgeno solucionan este problema de diferentes maneras.
Algunas viven solamente en condiciones anaerbicas o reprimen la sntesis de la nitrogenasa en presencia de oxigeno.

La relacin simbitica entre las plantas leguminosas y las bacterias fijadoras de nitrgeno en los ndulos de sus races, resuelve a la vez las necesidades energticas y la labilidad del complejo de la nitrogenasa frente al oxigeno. Las bacterias en los ndulos de las races tienen acceso a una gran reserva de energa en forma de glcidos y de intermediarios del ciclo del cido ctrico suministrados por la planta.
Ello permite a las bacterias de los ndulos de las races fijar centenares de veces mas nitrgeno que sus parientes prximos en las condiciones encontradas frecuentemente en los suelos.

Para solventar el problema de la toxicidad del oxigeno, las bacterias de los ndulos de las races estn impregnadas de una solucin de una hemoprotena fijadora de oxigeno denominada leghemoglobina. Esta protena es producida por la planta (aunque el grupo hemo puede ser proporcinado por la bacteria). La leghemoglobina fija todo el oxigeno a sus alcance, de manera que este no puede interferir en la fijacin del nitrgeno y, a la vez, suministra eficazmente el oxigeno al sistema de transporte de electrones de la bacteria.
El beneficio para la planta, por supuesto, es un suministro rpido de nitrgeno reducido. La eficiencia de las simbiosis entre los vegetales y las bacterias resulta evidentemente por el enriquecimiento en nitrgeno del suelo proporcionado por las plantas leguminosas.

El amoniaco se incorpora a las biomolculas a travs del glutamato y la glutamina

El nitrgeno reducido en forma NH+4 es incorporado primero a los aminocidos y posteriormente a otras biomolculas que contienen nitrgeno.

Dos aminocidos, glutamato y glutamina, constituyen el punto critico de entrada, tambin cumplen un papel importante en el catabolismo del amoniaco y de los grupos amino en la oxidacin de los aminocidos.

El glutamato es la fuente de grupos amino de la mayor parte de los aminocidos restantes, a travs de reacciones de transaminacin. El nitrgeno del grupo amida de la glutamina es una fuente de grupos amino para una amplia gama de procesos biosintticos. En la mayora de tipos celulares, y de fluidos extracelulares en los organismos superiores, uno o ambos aminocidos estn presentes en concentraciones mas elevadas, a veces un orden de magnitud o ms, que los otros aminocidos.

Las rutas biosintticas que conducen al glutamato y a la glutamina son sencillos, la ruta mas importante para la incorporacin de NH4+ al glutamato requiere de dos reacciones: Primero la glutamina sintetasa cataliza la reaccin del glutamato y el NH4+ para dar glutamina. Esta reaccin tiene lugar en dos pasos, con el glutamil fosfato unido al enzima como intermediario

La glutamina sintetasa se encuentra en todos los organismos, adems de su importancia para la asimilacin del NH4+ en las bacterias. Esta reaccin tiene un papel importante en el metabolismo de los aminocidos en los mamferos, al convertir el NH4+ libre, que es muy txico, en glutamina para su transporte en la sangre.

En las bacterias y en las plantas, el glutamato se produce a partir de la glutamina en una reaccin catalizada por la glutamato sintasa. El -cetoglutarato, un intermediario del ciclo del cido ctrico, experimenta una aminacin reductora, utilizando glutamina como dador de nitrgeno:

Los animales carecen de glutamato sintasa; pero el glutamato se mantiene a niveles elevados por procesos como la transaminacion del -cetoglutarato durante el catabolismo de los aminocidos. El glutamato tambien se forma en menor proporcin, por la reaccion del -cetoglutarato y el NH4+ para formar glutamato en un solo paso, catalizada por la Lglutamato deshidrogenasa. El poder reductor lo proporciona el NADPH.

La glutamina sintetasa es un punto de regulacin principal en el metabolismo del nitrgeno

El enzima esta formado por 12 subunidades idnticas y esta regulado alostericamente y por modificacin covalente. La alanina, la glicina y al menos seis productos finales del metabolismo de la glutamina son inhibidores alostricos. Cada inhibidor por si solo produce una inhibicin parcial, si los distintos inhibidores actan conjuntamente causan la inhibicin total del enzima. Este mecanismo de control proporciona un ajuste en los niveles de glutamina en los requerimientos metablicos.

Varios tipos de reaccin tienen un papel especial en la biosntesis de aminocidos y nucletidos.

La clase de enzimas que catalizan estas reacciones se denominan glutamina amidotransferasas. Todas ellas tienen dos dominios estructurales: Uno que fija la glutamina y otro que fija el segundo sustrato, que es el aceptor del grupo amino.

El NH3 que se produce en esta reaccin no se libera sino que se transfiere a travs de un canal de amoniaco a un segundo sitio activo, donde reacciona con el segundo sustrato para formar el producto aminado.
El intermediario covalente se hidroliza para dar enzima libre y glutamato. Si el segundo sustrato debe ser activado generalmente se utiliza ATP para formar un intermediario acil fosfato. La glutamina acta de forma similar, pero usa H2O como segundo sustrato, de manera que produce NH4+ y glutamato.

Bibliografa

NELSON David L, COX Michael M, (2005), Lehninger Principios de Bioqumica, Editorial Omega, Cuarta Edicin, pp: 833-841

VOET Donald, VOET Judith, PRATT Charlotte, (2004), Bioqumica, Editorial Medica Panamericana, Tercera Edicin, Buenos Aires-Argentina, pp: 1088 BERG Jeremy, TYMOCZKO John, STRYER Lubert, (2003), Bioqumica, Editorial Reverte, Quinta Edicin, pp:991

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