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UNIVERSIDAD AUTNOMA CHAPINGO DEPARTAMENTO DE ENSEANZA, INVESTIGACIN Y SERVICIO EN AGROECOLOGA

I. IDENTIFICACIN CURRICULAR 1.1. Datos Generales Nombre de la Materia: Unidad Acadmica: Programa Educativo: Nivel Educativo: Lnea Curricular: Carcter: Tipo: Prerrequisitos: Nombre del Profesor: Ciclo escolar: Ao: Semestre: Horas Clase-Semana: Duracin Total Modalidad Espacio Docente: Ecologa Microbiana DEIS en Agroecologa Ingeniera en Agroecologa Licenciatura Medio Ambiente Obligatoria Terica Prctica Introduccin a la Agroecologa, Edafologa y Fertilidad del Suelo, Ecologa Bsica, Procesos Fisiolgicos MC Langen Corlay Chee 2008-2009 5 Segundo Teora: 4 Prctica: 3 126 h Curso Aula, Laboratorio y Campo

1.2 Resumen Didctico El curso se imparte a alumnos del 5 ao de la carrera de Ingeniera en Agroecologa y tiene como objetivo ofrecer las bases tericas de la Ecologa Microbiana y su aplicacin en el aprovechamiento integral de los recursos sin deteriorarlos. Se relaciona verticalmente con asignaturas cursadas con anterioridad, como Qumica Inorgnica, Qumica Orgnica, Biologa Celular, Bioqumica, Fsica, Introduccin a la Agroecologa, Edafologa y Fertilidad del Suelo, Ecologa Bsica, Procesos Fisiolgicos, Agrometeorologa, Tecnologas Alternativas, etc.; en forma horizontal con Dinmica de Poblaciones, Manejo Agroecolgico de Cultivos y Ecofisiologa. Tambin se relaciona verticalmente con Interacciones Ecolgicas, Sistemas Agrosilvopastoriles, Recursos Genticos, Manejo del Suelo y del Agua, Sistemas de Produccin en Zonas ridas y Sistemas de Produccin de Zonas Tropicales, materias cursadas posteriormente. Adicionalmente se relaciona con las asignaturas optativas Manejo de reas Protegidas, Control Biolgico, Evaluacin de Proyectos Agropecuarios e Impacto Ambiental, Impacto Ecolgico de la Agricultura y del Manejo del Agua, Policultivos, etc. Ecologa Microbiana es una asignatura terico-prctica, cuyas primeras dos terceras partes son de formacin bsica y la ltima, es integradora. Se desarrolla a travs de clases programadas en aula, prcticas en laboratorio, invernadero y campo, acompaadas de trabajos de investigacin, en la medida de lo posible, se utilizan mtodos activos de enseanza. Los materiales que requiere son: libros, artculos cientficos, videos, memorias de eventos cientficos, entre otros. La parte terica se desarrolla en el aula y se imparte en dos sesiones con duracin de 2 h a la semana. Empleando pizarrn, acetatos, diapositivas y videocintas, en forma de conferencia y seminario, se exponen y analizan aspectos relacionados con la Ecologa Microbiana. La parte prctica se imparte en 3 h a la semana en el laboratorio Alfredo Echegaray Alemn, invernadero y campo, donde con la supervisin del profesor- se experimentan diversas tcnicas para la identificacin macro y microscpica, as como el cultivo de los microorganismos presentes en diferentes agroecosistemas; adems se evala su efecto en cultivos agrcolas con los que establecen simbiosis mutualsticas y su aplicacin como indicadores de inocuidad. La temtica de los trabajos de investigacin a desarrollar y exponer por los estudiantes en un seminario, es definida en funcin de los intereses propios de los educandos. El nivel de aprovechamiento de conocimientos y adquisicin de habilidades, se evala mediante tres exmenes parciales, un examen global, reportes de prcticas, as como de la exposicin oral y escrita del trabajo de investigacin. Por su carcter integrador, el curso reviste importancia en la formacin de profesionales que habrn de trabajar en un pas como el nuestro, de gran diversidad ambiental y social, en donde hasta el momento existen polticas

de desarrollo econmico que, en su mayora, no son adecuadas a todos y cada uno de esos ambientes naturales y sociales. II. ESTRUCTURA DEL PROGRAMA DE ESTUDIO Presentacin En el Siglo XX, a principios de los 60s surgi el trmino Ecologa Microbiana para describir las relaciones ecolgicas de los microorganismos, una vez que se reconoci que stos, a pesar de sus dimensiones, son capaces de realizar diversas funciones que modifican su entorno. La degradacin y prdida de suelos debido a los sistemas de cultivo intensivos; salinidad edfica, toxicidad inica para las plantas y dispersin de enfermedades debido a la irrigacin; prdida de la fertilidad natural del suelo y acidificacin debidas a la fertilizacin; aparicin de resistencia en las plagas, persistencia de pesticidas no biodegradables, efectos perjudiciales de los pesticidas sobre organismos benficos, son algunos de los impactos ecolgicos notables de la agricultura moderna, amn de su efecto sobre los cuerpos de agua y la atmsfera. De ah que sea de suma importancia el conocimiento y estudio ecolgico del sustrato agrcola y forestal, el anlisis de las interrelaciones de los organismos y su influencia hacia los cultivos, el efecto de las tcnicas de la agricultura moderna sobre los organismos del suelo y el impacto de stos sobre la produccin vegetal, etc. Con conocimientos de Ecologa Microbiana, el Ingeniero en Agroecologa ser capaz de regular, optimizar y explotar la actividad microbiana, adems podr disear y desarrollar tecnologas alternativas para el aprovechamiento integral de los recursos, en armona con la naturaleza. Objetivos El propsito del curso es describir, inferir, comparar y emplear los principios que rigen las relaciones de los microorganismos y el medio que les rodea, a fin de que posteriormente se puedan disear, adecuar y poner en marcha, sistemas de produccin en forma integral y eficiente de los recursos naturales para obtener una produccin ptima y perdurable. Contenido 1. Introduccin (T = 4 h, P = 6 h) Objetivos: Establecer la importancia de la Ecologa Microbiana. Ubicar el ecosistema suelo con relacin a otros ecosistemas y clasificar los organismos en productores, consumidores y descomponedores. 1.1. Los organismos del suelo en relacin con la estructura del ecosistema. Nmero, biomasa y tipos de microorganismos edficos 1.2. Los organismos del suelo en relacin con su funcin en el ecosistema. El ciclo de los elementos como uno de los dos mayores procesos funcionales de los ecosistemas, el segundo es el flujo de energa 1.3. El suelo como ecosistema. Los componentes abiticos: fraccin mineral, materia orgnica, agua y atmsfera del suelo 1.4. El perfil del suelo. Los horizontes y sus variantes en sistemas forestales, pastizales y agroecosistemas Prctica 1. Caracterizacin morfolgica de microorganismos de diferentes ecosistemas. Colecta, traslado y conservacin de muestras (suelo, planta, efluentes, agua, abonos, etc) con fines microbiolgicos (3 h) 2. La comunidad del suelo (T = 20 h, P = 13 h) Objetivos: Describir y clasificar los organismos de acuerdo con su morfologa, dimensiones, actividad metablica y utilidad para el agroeclogo. Deducir las formas en las que los microorganismos satisfacen sus demandas de energa y nutrimentos. Analizar los fundamentos de las metodologas ms frecuentemente empleadas para el estudio de los organismos del suelo y sus ventajas y desventajas. 2.1. Macrobiota y mesobiota (fauna edfica) 2.1.1. Invertebrados no artrpodos. Platelmintos, Asquelmintos (Nemtodos y Rotferos), Moluscos y Anlidos 2.1.2. Artrpodos. Miripodos, Insectos (Colmbolos, Ispteros, Colepteros, Dpteros, Himenpteros), Arcnidos y caros 2.2. Microbiota 2.2.1. Protistas superiores: Algas, Protozoos y Hongos 2.2.2. Protistas inferiores: Arqueobacterias, Bacterias y Cianobacterias 2.2.3. Virus 2.3. Mtodos para cuantificar microorganismos Prctica 2. Preparacin y esterilizacin de materiales para el cultivo de microorganismos (3 h)
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Prctica 3. Cuantificacin de algas, bacterias heterotrficas aerobias, actinomicetos, hongos y microorganismos con diferente capacidad metablica (celuloltica, proteoltica, amiloltica, solubilizadora de fosfatos, oxidantes de S, nitrificantes, etc) en suelo, agua o efluentes (6 h)

3. Factores que afectan a la comunidad microbiana del suelo (T = 16 h, P = 4 h) Objetivos: Explicar la forma en que los factores: humedad, temperatura, aireacin, pH, disponibilidad de nutrimentos, potencial osmtico, radiaciones, metales pesados, la presencia de otras poblaciones, as como el manejo del suelo determinan la abundancia y actividad de los organismos del suelo. 3.1. Factores fsicos y qumicos 3.2. Rizsfera: Alteracin del medio microbiano por las races de las plantas. Composicin qumica y microbiana de la rizsfera. Efectos de las races sobre los microorganismos. Comprensin de la relacin R/S 3.3. Interacciones microbianas. Interacciones positivas: comensalismo, protocooperacin y mutualismo. Interacciones negativas: competencia, amensalismo, parasitismo y depredacin 3.4. Manejo agrcola del suelo: preparacin del terreno, riego, fertilizacin, encalado, aplicacin de insecticidas, nematicidas, fungicidas, etc. Inocuidad Alimentaria y Buenas Prcticas Agrcolas Prctica 4. Meso y microfauna de suelo y enmiendas orgnicas (4 h) Prctica 5. Coliformes fecales y Salmonella como indicadores de Buenas Prcticas Agrcolas en suelo y sustrato, semilla y plntula, agua de riego, Biofertilizantes (LEDA, SEDA, agua estanque peces, agua residual tratada, estircoles, compostas, vermicompostas, etc) (5 h) 4. Actividades microbianas de importancia agroecolgica (T = 28 h, P = 27 h) Objetivos: Discutir el papel de la actividad microbiana en el reciclado de los nutrimentos para determinar su funcin en la produccin agrcola, con el fin de que posteriormente se puedan disear y desarrollar sistemas de produccin en forma integral y eficiente de los recursos naturales para obtener una produccin ptima y perdurable. 4.1. Ciclo del Carbono 4.1.1. Descomposicin de los materiales orgnicos. Fuentes y composicin qumica de materiales orgnicos. Procesos de descomposicin (mineralizacin y humificacin). Cuantificacin de la mineralizacin del carbono. Factores que afectan su degradacin. Bioqumica de la descomposicin de celulosa, hemicelulosas, lignina, almidn, sustancias pcticas, quitina, protenas, etc. Caractersticas e importancia de las sustancias hmicas. Prctica 6. Enmiendas orgnicas en la actividad microbiana del suelo (6 h) 4.1.2. Fotosntesis 4.1.3. Produccin de metano 4.2. Ciclo del Nitrgeno 4.2.1. Fijacin del nitrgeno 4.2.1.1. Fijacin simbitica: simbiosis leguminosas-Rhizobium, simbiosis actinomicetosno leguminosas, lquenes. 4.2.1.2. Fijacin asimbitica: bacterias, algas verdes y cianobacterias. 4.2.1.3. Fijacin no biolgica Prctica 7. Produccin de inoculantes fijadores de N2 para leguminosas y gramneas (Aislamiento, Purificacin, Propagacin, Impregnacin, Maduracin) Prctica 8. Evaluacin de inoculantes fijadores de N2 en el desarrollo de leguminosas y gramneas (actividades extraclase en campo y laboratorio durante 8 semanas). 4.2.2. Mineralizacin 4.2.2.1. Amonificacin 4.2.2.2. Nitrificacin 4.2.3. Inmovilizacin 4.2.4. Desnitrificacin 4.3. Ciclo del Fsforo 4.3.1. Mineralizacin 4.3.2. Solubilizacin 4.3.3. xido-Reduccin 4.3.4. Inmovilizacin 4.3.5. Simbiosis Micorrzicas 4.3.5.1. Micorrizas ectotrficas. Micorrizas de plantas forestales: estructura y desarrollo, factores que influyen su formacin, fisiologa y ecologa. 4.3.5.2. Micorrizas endotrficas. Diferencia con las ectotrficas: el hongo, iniciacin y
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desarrollo de la infeccin 4.3.5.3. Intercambio de nutrimentos en micorrizas. Efecto de ectomicorrizas sobre el transporte de nutrimentos. Transferencia del carbono del hospedero al hongo en ectomicorrizas. Movimiento de nutrimentos en endomicorrizas 4.3.5.4. Otras funciones reguladoras de las micorrizas. Aspectos sobre la funcin protectora de ectomicorrizas frente a patgenos 4.3.5.5. Produccin y efecto de inoculantes Prctica 9. Inoculantes micorrcicos: Aislamiento, Purificacin, Propagacin y Aplicacin (actividades extraclase en campo y laboratorio durante 8 semanas). Prctica 10. Preparacin y evaluacin de inoculantes con solubilizadores de fsforo (6 h) 4.4. Ciclo del Azufre 4.4.1. Mineralizacin 4.4.2. Inmovilizacin 4.4.3. Oxidacin 4.4.4. Reduccin 4.5. Ciclos de otros elementos

Metodologa La asignatura se impartir a travs de conferencias dictadas por el profesor responsable con apoyo de acetatos, diapositivas y videos; adicionalmente, opcionalmente se contar con la participacin de investigadores invitados, quienes compartirn sus experiencias en la ecologa microbiana. Los conocimientos tericos se reforzarn mediante actividades prcticas a desarrollar en laboratorio, invernadero y campo. Adicionalmente, para acrecentar la apropiacin del conocimiento en la materia, organizados en equipos de tres integrantes, los estudiantes realizarn una investigacin terico-prctica de corta duracin, la cual ser socializada con sus compaeros de grupo a travs de un Seminario. ste se realizar al final del curso. Evaluacin La parte terica representa 60% del curso y se evaluar a travs de 4 exmenes (3 parciales y uno final acumulativo), participacin en clase y actividades de investigacin extra-clase (ensayos y seminario). El 40% restante corresponde a la fase prctica del curso, la cual se evaluar con asistencia, desempeo y reporte individual de prcticas. El reporte se redactar en mximo 15 cuartillas y tendr un formato tipo artculo cientfico, constar de Introduccin, Materiales y Mtodos, Resultados, Discusin o Anlisis de los Resultados, Conclusiones y Referencias Consultadas. No se tendr calificacin de reporte de prctica por inasistencia a alguna de ellas y dado que el costo de las mismas es alto, no habr reposicin de prcticas. El estudiante debe aprobar ambas partes para que puedan promediarse sus respectivas calificaciones, la calificacin mnima aprobatoria es de 66/100. Bibliografa bsica Alexander, M. 1980. Introduccin a la microbiologa del suelo. AGT editores. Mxico, D. F. Mxico. Bartha, R., y Atlas, R. 2001. Ecologa microbiana y Microbiologa ambiental. Prentice-Hall Hispanoamericana. Mxico. Brock, T. D., Smith, D. W., y Madigan, M. T. 1987. Biologa de los microorganismos. 4 Ed. Prentice-Hall Hispanoamericana, S. A. Mxico. Ferrera-Cerrato, R. 1993. Manual de agromicrobiologa. Trillas. Mxico, D. F. Mxico. Killham, K. 1994. Soil Ecology. Cambridge University Press. Cambridge, U.K. Madigan, M.T., Martinko, J.M., and Parker, J. 1998. Brock Biologa de los microorganismos. Prentice Hall. Madrid. Espaa. p 986. Metting, F. B. Jr. (Ed). 1993. Soil Microbial Ecology: applications in agricullture and environmental management. Marcel Dekker, Inc. New York. USA. Bibliografa complementaria Abramson, D., Hulasare, R., White, N. D. G., Jayas, D. S., and Marquardt, R. R. 1999. Mycotoxin formation in hulless barley during granary storage at 15 and 19% moisture content. Journal of Stored Products Research 35: 297-305. Alani, D. I. 1986. Perspectives in biotechnology and applied microbiology. Elsevier Applied Science. London, U. K. Allen, O. N., and Allen, E. K. 1981. The leguminosae. A source book of characteristics, uses and nodulation. The University of Wisconsin Press. Madison. Atlas, R. M. 1997. Principles of Microbiology. WCB/McGraw-Hill. 2nd ed. New York.
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http://www.soil-fertility.com/micorhize/espagnol/index.shtml, http://www.cinvestav.mx/Portals/0/Publicaciones%20y%20Noticias/Revistas/Avance%20y%20perspectiva/sepoct02/ 1%20XOXONOSTLE.pdf) http://www.socbot.org.mx/publicaciones/boletin/contenido80S/MonroyAta%20et%20al%202007%20(BSBMS80%2049-57).pdf