Las fotos contenidas en este tema proceden de pginas web pblicas.

No obstante si el autor de alguna foto desea que se retire, se proceder a hacerlo. Los contenidos de esta presentacin (texto, imgenes y otros materiales) slo son informativos, y no pretenden sustituir al consejo, diagnstico o de tratamiento, profesional mdico o veterinario. Siempre siga el consejo de su mdico o veterinario para cualquier cuestin en lo que respecta a un problema mdico o de salud animals

MICROBIOLOGA: TEMA 13

TAXONOMA BACTERIANA. CONCEPTO. CLASIFICACIN. MTODOS DE CLASIFICACIN: FENOTPICOS, MOLECULARES Y QUIMIOTAXONMICOS. NOMENCLATURA. REGLAS. IDENTIFICACIN Y TIPIFICACIN. MANUALES Y CLAVES DE IDENTIFICACIN Y CLASIFICACIN. COLECCIONES DE CULTIVO TIPO.

Veterinaria-Microbiologa

Las fotos contenidas en este tema proceden de pginas web pblicas. No obstante si el autor de alguna foto desea que se retire, se proceder a hacerlo. Los contenidos de esta presentacin (texto, imgenes y otros materiales) slo son informativos, y no pretenden sustituir al consejo, diagnstico o de tratamiento, profesional mdico o veterinario. Siempre siga el consejo de su mdico o veterinario para cualquier cuestin en lo que respecta a un problema mdico o de salud animal

TAXONOMA BACTERIANA

OBJETIVOS:
Establecer los conceptos de taxonoma, clasificacin, nomenclatura e identificacin bacteriana. Conocer los distintos sistemas y mtodos de clasificacin taxonmica, remarcando la tendencia actual a la clasificacin basada en estudios polifsicos. Conocer las reglas de la nomenclatura bacteriana. Describir las pautas de los sistemas de identificacin bacteriana. Diferencias entre clasificacin e identificacin.

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TAXONOMIA: taxis, ordenacin; nomos, ley. Ciencia de la clasificacin en tanto que agrupa y separa a las bacterias en base a caractersticas fenotpicas y genticas
CLASIFICACION: es la ordenacin o reestructuracin de los organismos en
grupos o taxones (dominio o imperio, clase, orden, familia, genero o especie) en funcin de semejanzas mutuas o de parentesco evolutivo.

NOMENCLATURA: parte de la taxonoma que trata de asignar un nombre

cientfico a los grupos taxonmicos de acuerdo con criterios y normas preestablecidas y admitidas internacionalmente

IDENTIFICACION: parte prctica de la taxonoma en tanto que permite

encuadrar un determinado organismo en un grupo taxonmico previamente establecido. Taxonoma ciencia artificial; avances tecnolgicos, continuo cambio

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Caractersticas
Fenotpicas

Ejemplo de propiedades observadas

Morfolgicas Bioqumicas / Fisiolgicas

Forma y tamao celular, morfologa de colonias, reaccin tintorial, presencia de cilios o flagelos, forma y localizacin de esporos. Condiciones de crecimiento (pH, temperatura, oxgeno), motilidad, fuentes de carbono utilizadas, utilizacin de carbohidratos con produccin o no de

cido, caractersticas enzimticas, tipo metabolismo.

Serolgicas Fagotpia Pruebas de inhibicin Quimiotaxonmicas Antgenos de superficie, respuesta frente a determinados antisueros especficos. Susceptibilidad a bacterifagos Presencia o ausencia de crecimiento en presencia de antibiticos, colorantes, etc.

Membrana citoplasmtica Pared celular Protenas Genticas

Anlisis de cidos grasos, tipo de lpidos polares y menaquinonas, presencia de cidos miclicos. Tipo de peptidoglicano, presencia de cidos teicicos. Comparacin perfil de protenas (totales o de membrana), secuencia de aminocidos.

ADN /ARN

Contenido de G+C, hibridacin ADN-ADN, secuenciacin ARNr

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TIPOS DE CLASIFICACIN

FENOTPICA: semejanzas o similitudes en el fenotipo que

presentan las bacterias en el momento actual, sin referencias a posibles consideraciones evolutivas. Unos pocos caracteres de gran importancia Taxonoma numrica

FILOGENTICA POLIFSICA

Tomada de: www.1hikaru8.blogspot.com

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Imgenes tomadas de Prescott y col. 2003. Mirobiologa. McGraw-Hill

Grupos y semejanzas en taxonoma numrica. A, Matriz de semejanza donde se comparan seis cepas bacterianas. El grado de semejanza vara desde 0.0 (ninguna semejanza), hasta 1.0 (identidad total). B, Las bacterias se han reorganizado y agrupado para establecer grupos de cepas similares. C, Dendrograma que muestra de una manera grfica el grado de semejanza las seis cepas entre s.

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Tomada de: www.1hikaru8.blogspot.com

TIPOS DE CLASIFICACION:
FENOTPICA:

FILOGENTICA:
Filogenia: del griego phylon, tribu o raza, y genesis, generacin u origen

se basa en el establecimiento de relaciones evolutivas ms que en semejanzas generales.

Cronmetros evolutivos/moleculares: la distancia evolutiva de dos m.o. puede establecerse por las diferencias en la secuencias de a.a. o nucletidos de determinadas macromolculas homlogas
N de diferencias en las secuencias es proporcional al n de cambios mutacionales estables fijados en el ADN que codifica esa macromolcula.

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CLASIFICACION FILOGENETICA: Cronmetros evolutivos/moleculares: i) Presentar una distribucin universal, ii) Realizar la misma funcin en todos los seres vivos iii) Sus secuencias deben permitir la identificacin de regiones de homologa y de heterogenicidad iv) Poder alinearse para determinar homologas y variaciones v) Tasa de cambio de la secuencia de la macromolcula debe correlacionarse con la distancia evolutiva

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CLASIFICACION FILOGENETICA: Cronmetros evolutivos/moleculares:

Protenas del shock trmico ATPasa Citocromos Rec A; sodA; rpoB ARN ribosmico (ARNr) 5S, 16

S, 23S

451.545 secuencias de ARNr 16S Ribosomal Database Project

08-11-2007

Tomado de www.revistaaquatic.com

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Tomada de Fernndez-Garayzbal y col. Int. J. Syst. Bacteriol. (1997) 47:1082-1085

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DOMINIOS DE LOS SERES VIVOS

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Tomado de Madigan y col. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 Ed. Pearson Prentice Hall ,2004

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ARBOL FILOGENETICO DE LAS BACTERIAS

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Tomado de Madigan y col. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 Ed. Pearson Prentice Hall ,2004

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TIPOS DE CLASIFICACIN

FENOTPICA:
FILOGENTICA:
CLASIFICACION FENETICA == FILOGENETICA

POLIFSICA: utiliza distintos tipos de

tcnicas, intenta armonizar las clasificaciones fenotpicas y filogenticas mediante el anlisis conjunto e integracin del mayor nmero posible de caractersticas fenotpicas, quimiotaxonmicas, genticas y filogenticas utilizadas en taxonoma bacteriana

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RANGOS TAXONMICOS

DOMINIO PHYLUM CLASE ORDEN FAMILIA GENERO ESPECIE

>70% Hibridacin DNA-DNA
coleccin de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que le permiten diferenciarse de otros grupos de cepas, de tal manera que permite asegurar su reconocimiento como unida taxonmica bsica

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Diferencias > 3-4% en secuencia ARNr 16S. Veterinaria-Microbiologa

Definicin de especie bacteriana

Tomado de Madigan y col. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 Ed. Pearson Prentice Hall ,2004

>70% Hibridacin DNA-DNA

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Diferencias > 3-4% en secuencia ARNr 16S.

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Vandamme y col. Polyphasic taxonomy, a consensus approach to bacterial systematics. Microbiol Rev. 1996 60:407-38

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NOMENCLATURA

Asignar a los microorganismos un nombre cientfico concreto y admitido internacionalmente.

Informal Cientfica o taxonmica

Reglas

Nomenclatura binomial Nombre gnero y especie latinizados Inicial denominacin genrica: mayscula Gnero y especie cursiva o itlica, o en su defecto subrayados (Staphylococcus aureus o Staphylococcus aureus). Denominacin de especie (ej. S. aureus)
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NOMENCLATURA
No es arbitraria (The Internatinal Code of Nomenclature of Bacteria)

Referencia a alguna caracterstica del organismo, tales como su apariencia, procedencia, alguna propiedad caracterstica, el investigador que la descubri
Corynebacterium mastitidis, productor de mastitis Sanguibacter inulinus, aislados a partir de sangre y fermentador de la inulina Sanguibacter suarezii, Guillermo Surez, microbilogo veterinario espaol Uruburuella suis, Federico Uruburu, microbilogo espaol, aislada de cerdo Helcococcus ovis, asilado de ganado ovino Pasteurella, de Louis Pasteur Jonesia, Dorothy Jones, microbiloga inglesa

18Listeria ivanovii subps. londoniensis, de Londres

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IDENTIFICACIN

Parte de la taxonoma que permite encuadrar un determinado organismo en un grupo taxonmico previamente establecido. Seleccin de un nmero, el menor posible, de caracteres fenotpicos que se puedan determinar fcilmente en el laboratorio Sistemas comerciales multisustrato

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Imagen del autor

TIPIFICACIN

Discriminacin a nivel de cepa Mtodos fenotpicos Mtodos moleculares

Importancia desde un punto de vista epidemiolgico y en microbiologa clnica ms que desde un punto de vista estrictamente taxonmico

Imgenes del autor

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MANUALES Y CLAVES DE IDENTIFICACIN Y CLASIFICACIN

R a n g o T a x o n m ic o y S e c c i n
V olu m e n 1 . A r c h a e a , C ian ob a c te r i as , P r o t tr o fo s y G n e r o s m u y r a m ific a d o s Arch a ea R e in o C r e n a r c h eot a S e c c i n I : Th e rm o p ro te i, s u lfo lo b i y b a r filo s R e in o E u r y a r ch a eo t a S e c c i n II : M e ta n g e n o s S e c c i n III : H a lo b a c te ria s S e c c i n IV : Te rm o p la s m a s S e c c i n V : Te rm o c o c o s G n e ro s m u y ra m ific a d o s B a c te r ia s (e u b a c te ria s ) S e c c i n V I : A q u i fe x y a fin e s S e c c i n V II : T h e r m o to g a s y G e o to ga s S e c c i n V III : D e i n os S e c c i n IX : T h e r m i S e c c i n X : C h r y si og e n e s S e c c i n X I : C h lo r o fle x i y H e r p et o si p h on s S e c c i n X II : T h e r m o m i c ro b ia S e c c i n X III : Pr o c h lo r o n y C ia n o b a c te ria s S e c c i n X IV : C h lo r o b i a V olu m e n 2 . P r ote ob a c te r i as B a c t e ria R e in o P r ote ob ac te r ia S e c c i n X V : -P ro te o b a c te ria s S e c c i n X V I : -P ro te o b a c te ria s S e c c i n X V II : -P ro te o b a c te ria s S e c c i n X V III : -P ro te o b a c te ria s S e c c i n X IX : -P ro te o b a c te ria s V olu m e n 3 . G r am p o s itiv os c o n b a jo c o n te n id o en G + C S e c c i n X X : C lo s t ri d ia y a fin e s S e c c i n X X I : M o lli c u t e s S e c c i n X X II : B a c i llu s y L a c t o ba ci llu s

G n e ro s re p re s e nta tiv o s d e in te r s v e te rina rio (c a p tulo d e m a n u a l)

Bergeys Manual of Systematic Bacteriology

Primera edicin clasificacin fundamentalmente fenotpica

(1984-89)

Seccin 4: Cocos y bacilos aerobios Gram negativos Seccin 15: Bacilos Gram positivos, irregulares no formadores de esporos

B r u c e lla (1 9 ), R i c k e tt sia (2 7) N e is s e ria , B o r d et e lla ( 2 0) L e g i on e lla , P s e u d o m o n a s (1 8), E s c h e r i c h ia (21 ), S a lm o n e lla , S h ig e lla ( 2 2 ), K le bs i e lla , P r o t e u s , Y e r s in i a (23 ), V i br i o , A e r o m o n a s (2 4), H a e m o p hi lu s , A c ti n o ba ci llu s , Pa s t e u r e lla (2 5 ) C a m p y lo ba ct e r , H e li c o b a ct e r (1 7)

Segunda edicin clasificacin fundamentalmente filogentica

C lo s t rid iu m (3 3) , E u b a c t e ri u m (35 ), P e p t o st r e pto c o c cu s , V e i llo n e lla M y c o p la s m a , U r e a p la s m a , Sp i ro p la s m a , A c h o le p la s m a (28 ) S t a p h y lo c o c c u s (2 9) , S t r e pto c o c cu s (3 0), E n t e r o co c c u s , L a ct o c o c cu s (3 1 ), B a c i llu s (3 2 ), L a c t o ba ci llu s , L i st e ria (34 )

V olu m e n 4 . G r am p o s itiv os c o n a lt o c o n te n id o en G + C S e c c i n X X III : C la s e A c t in o b a ct e ria

R e n i b a ct e riu m (3 4), C o r y n e b a ct e riu m , P r o p io n i b a ct e riu m (35 ), M y c o b a c t eri u m (3 6), A c t in o m y c e s , N o c a rdia , St r e p to m y c e s (3 7), M i c ro c o c cu s , , A r t hr o b a ct e r

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V olu m e n 5 . P la n c to m ic e t o s , E s p ir o q u e ta s , F ib r o b a c te r , B a c te r o id e s y F u s o b a c te r ias S e c c i n X X IV : P la n c to m ic e to s , C la m id ia s y a fin e s S e c c i n X X V : E s p iro q u e ta s S e c c i n X X V I : Fi b r o b a c t e r S e c c i n X X V II : B a c t e ro i d e s S e c c i n X X V II I: F la v o b a c te r ia s S e c c i n X X IX : E s f in g o b a c te r ia s , F le x ib a c te ria s y C y to p h ag a S e c c i n X X X : F u s o b a c te ria s

C h la m y d i a (27 ) S p i ro c h eta , B o r r e lia , T r e p o n e m a , S e rp u lin a , L e p to sp i ra (16 ) B a c t e ro i d es (2 6) F la v o ba c t e ri u m F le x i b a c t e r , C yt o p h a ga F u s o ba c t e riu m (26 )

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Clasificacin filogentica
2 Ed. Bergeys Manual of Systematic Bacteriology

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Tomado de Madigan y col. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 Ed. Pearson Prentice Hall ,2004

COLECCIONES DE CULTIVO TIPO

Coleccin microorganismos a disposicin comunidad cientfica (recogen, mantienen y suministran microorganismos). Depsito obligatorio de una cepa microbiana en dos colecciones:

Descripcin nueva especie Patente proceso industrial en el que intervienen microorganismos

Coleccin Espaola de Cultivos Tipo, CECT American Type Culture Collection, ATCC Culture Collection, University of Gteborg,
Sweden, CCUG, etc....

Colecciones:

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