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MICROBIOLOGA: TEMA 13
TAXONOMA BACTERIANA. CONCEPTO. CLASIFICACIN. MTODOS DE CLASIFICACIN: FENOTPICOS, MOLECULARES Y QUIMIOTAXONMICOS. NOMENCLATURA. REGLAS. IDENTIFICACIN Y TIPIFICACIN. MANUALES Y CLAVES DE IDENTIFICACIN Y CLASIFICACIN. COLECCIONES DE CULTIVO TIPO.
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TAXONOMA BACTERIANA
OBJETIVOS:
Establecer los conceptos de taxonoma, clasificacin, nomenclatura e identificacin bacteriana. Conocer los distintos sistemas y mtodos de clasificacin taxonmica, remarcando la tendencia actual a la clasificacin basada en estudios polifsicos. Conocer las reglas de la nomenclatura bacteriana. Describir las pautas de los sistemas de identificacin bacteriana. Diferencias entre clasificacin e identificacin.
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TAXONOMIA: taxis, ordenacin; nomos, ley. Ciencia de la clasificacin en tanto que agrupa y separa a las bacterias en base a caractersticas fenotpicas y genticas
CLASIFICACION: es la ordenacin o reestructuracin de los organismos en
grupos o taxones (dominio o imperio, clase, orden, familia, genero o especie) en funcin de semejanzas mutuas o de parentesco evolutivo.
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Caractersticas
Fenotpicas
Forma y tamao celular, morfologa de colonias, reaccin tintorial, presencia de cilios o flagelos, forma y localizacin de esporos. Condiciones de crecimiento (pH, temperatura, oxgeno), motilidad, fuentes de carbono utilizadas, utilizacin de carbohidratos con produccin o no de
Anlisis de cidos grasos, tipo de lpidos polares y menaquinonas, presencia de cidos miclicos. Tipo de peptidoglicano, presencia de cidos teicicos. Comparacin perfil de protenas (totales o de membrana), secuencia de aminocidos.
ADN /ARN
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TIPOS DE CLASIFICACIN
FILOGENTICA POLIFSICA
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Grupos y semejanzas en taxonoma numrica. A, Matriz de semejanza donde se comparan seis cepas bacterianas. El grado de semejanza vara desde 0.0 (ninguna semejanza), hasta 1.0 (identidad total). B, Las bacterias se han reorganizado y agrupado para establecer grupos de cepas similares. C, Dendrograma que muestra de una manera grfica el grado de semejanza las seis cepas entre s.
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TIPOS DE CLASIFICACION:
FENOTPICA:
FILOGENTICA:
Filogenia: del griego phylon, tribu o raza, y genesis, generacin u origen
Cronmetros evolutivos/moleculares: la distancia evolutiva de dos m.o. puede establecerse por las diferencias en la secuencias de a.a. o nucletidos de determinadas macromolculas homlogas
N de diferencias en las secuencias es proporcional al n de cambios mutacionales estables fijados en el ADN que codifica esa macromolcula.
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CLASIFICACION FILOGENETICA: Cronmetros evolutivos/moleculares: i) Presentar una distribucin universal, ii) Realizar la misma funcin en todos los seres vivos iii) Sus secuencias deben permitir la identificacin de regiones de homologa y de heterogenicidad iv) Poder alinearse para determinar homologas y variaciones v) Tasa de cambio de la secuencia de la macromolcula debe correlacionarse con la distancia evolutiva
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Protenas del shock trmico ATPasa Citocromos Rec A; sodA; rpoB ARN ribosmico (ARNr) 5S, 16
S, 23S
Tomado de www.revistaaquatic.com
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Tomado de Madigan y col. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 Ed. Pearson Prentice Hall ,2004
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Tomado de Madigan y col. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 Ed. Pearson Prentice Hall ,2004
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TIPOS DE CLASIFICACIN
FENOTPICA:
FILOGENTICA:
CLASIFICACION FENETICA == FILOGENETICA
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RANGOS TAXONMICOS
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Tomado de Madigan y col. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 Ed. Pearson Prentice Hall ,2004
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Vandamme y col. Polyphasic taxonomy, a consensus approach to bacterial systematics. Microbiol Rev. 1996 60:407-38
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NOMENCLATURA
Reglas
Nomenclatura binomial Nombre gnero y especie latinizados Inicial denominacin genrica: mayscula Gnero y especie cursiva o itlica, o en su defecto subrayados (Staphylococcus aureus o Staphylococcus aureus). Denominacin de especie (ej. S. aureus)
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NOMENCLATURA
No es arbitraria (The Internatinal Code of Nomenclature of Bacteria)
Referencia a alguna caracterstica del organismo, tales como su apariencia, procedencia, alguna propiedad caracterstica, el investigador que la descubri
Corynebacterium mastitidis, productor de mastitis Sanguibacter inulinus, aislados a partir de sangre y fermentador de la inulina Sanguibacter suarezii, Guillermo Surez, microbilogo veterinario espaol Uruburuella suis, Federico Uruburu, microbilogo espaol, aislada de cerdo Helcococcus ovis, asilado de ganado ovino Pasteurella, de Louis Pasteur Jonesia, Dorothy Jones, microbiloga inglesa
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IDENTIFICACIN
Parte de la taxonoma que permite encuadrar un determinado organismo en un grupo taxonmico previamente establecido. Seleccin de un nmero, el menor posible, de caracteres fenotpicos que se puedan determinar fcilmente en el laboratorio Sistemas comerciales multisustrato
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Imagen del autor
TIPIFICACIN
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Seccin 4: Cocos y bacilos aerobios Gram negativos Seccin 15: Bacilos Gram positivos, irregulares no formadores de esporos
B r u c e lla (1 9 ), R i c k e tt sia (2 7) N e is s e ria , B o r d et e lla ( 2 0) L e g i on e lla , P s e u d o m o n a s (1 8), E s c h e r i c h ia (21 ), S a lm o n e lla , S h ig e lla ( 2 2 ), K le bs i e lla , P r o t e u s , Y e r s in i a (23 ), V i br i o , A e r o m o n a s (2 4), H a e m o p hi lu s , A c ti n o ba ci llu s , Pa s t e u r e lla (2 5 ) C a m p y lo ba ct e r , H e li c o b a ct e r (1 7)
C lo s t rid iu m (3 3) , E u b a c t e ri u m (35 ), P e p t o st r e pto c o c cu s , V e i llo n e lla M y c o p la s m a , U r e a p la s m a , Sp i ro p la s m a , A c h o le p la s m a (28 ) S t a p h y lo c o c c u s (2 9) , S t r e pto c o c cu s (3 0), E n t e r o co c c u s , L a ct o c o c cu s (3 1 ), B a c i llu s (3 2 ), L a c t o ba ci llu s , L i st e ria (34 )
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Clasificacin filogentica
2 Ed. Bergeys Manual of Systematic Bacteriology
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Tomado de Madigan y col. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 Ed. Pearson Prentice Hall ,2004
Coleccin microorganismos a disposicin comunidad cientfica (recogen, mantienen y suministran microorganismos). Depsito obligatorio de una cepa microbiana en dos colecciones:
Colecciones:
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