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CambridgeSoft Solutions

10 Minutes 10 Minutes 5 Minutes ChemBioFinder 350Minutes ChemBioDraw and Chem3D 5 Minutes ChemBioOffice Overview Electronic Lab Notebook BioAssay and Inventory

Incremente su productividad Cientfica

ChemBioOffice 2010

ChemBioOffice es el software mas utilizado por cientficos en la industria qumica y farmacutica as como en la academia.

ChemBioOffice

ChemBioOffice pone al alcance de las manos las herramientas de Software requeridas por cientficos

ChemBioOffice se contiene soluciones de uso individual (ChemDraw) o de uso grupal (ELN), esto le provee un sistema completamente integrado de administracin de datos cientificos.

Licencias de Sitio Anuales de ChemBioOffice


-Una gran oportunidad para colaborar.

Uso de todo el software es ilimitado para todos los miembros de su Institucin (por lo tanto el costo por usuario es muy bajo)
Todas los Departamentos y usuarios tienen acceso a usar el software que sea ms apropiado para sus necesidades. Este tipo de licencias de sitio incluyen el soporte tcnico para el administrador del sistema as como las actualizaciones del software. El software se puede usar en todo tipo de ordenadores, ya sea en el laboratorio, en la casa, o en un laptop.) Cada usuario puede descargar el software de nuestro website. Esto reduce la carga de trabajo en administracin de los sistemas. Licencias por mltiples aos son ms convenientes en el largo plazo.

Mdulos en ChemBioOffice
Dibuja estructura en 2D calcula propiedades incluyendo nombres IUPAC, estequiometria, incluyendo rendimiento

Visualiza estructuras qumicas en 3D. Minimice energa y calcula propiedades. Provee una interface para Mopac, Jaguar, Gaussian, Gamess.etc.

ChemBioDraw

Chem3D

ChemFinder

Diseado para reemplazar los cuadernos de laboratorio de papel. Almacena, reacciones, documentos Word, espectro, etc.

ChemBioOffice

Una base de datos con inteligencia qumica, se conecta a Access y Oracle, importa y exporta archivos SD y RD entre otros y contiene BioVIz

eNotebook

Inventory
Administra datos de inventario (qumicos y no-qumicos). Provee una herramienta indispensable para todos los laboratorios de investigacin cientfica.

Almacenamiento y Anlisis de datos biolgicos. BioAssay est diseado para asistir en la optimizacin de experimentos biolgicos y el anlisis de resultados.

BioAssay

Mdulos en ChemBioOffice
Dibuja estructura en 2D, calcula propiedades incluyendo nombres IUPAC, estequiometria, incluyendo rendimiento

Visualiza estructuras qumicas en 3D. Minimice energa y calcula propiedades. Provee una interface para Mopac, Jaguar, Gaussian, Gamess.etc.

ChemBioDraw

Chem3D

Uso Individual

ChemFinder

Diseado para reemplazar los cuadernos de laboratorio de papel. Almacena, reacciones, documentos Word, espectros, imgenes, etc.

Una base de datos con inteligencia qumica, se conecta a Access y Oracle, importa y exporta archivos SD y RD entre otros y contiene BioVIz

eNotebook

Uso Individual o grupal

Inventory
Administra datos de inventario (qumicos y no-qumicos). Provee una herramienta indispensable para todos los laboratorios de investigacin cientfica.

Almacenamiento y anlisis de datos biolgicos. BioAssay est diseado para asistir en la optimizacin de experimentos biolgicos y el anlisis de resultados.

BioAssay

ChemBioDaw

-Haciendo investigacin en forma ms productiva

Acelere su trabajo con ChemBioDraw 12

ChemDraw es fcil de usar


Hot Keys personalizadas, Plantillas (Templates), Apodos (Nicknames)

Nuevas herramientas qumicas


Dibujador de Sequencia Limpieza de estructura y mejoras de la representacin estequiomtrica. Nueva forma de interpretar reacciones, soporte de archivos SD y incorporacin de lgica cuando se dibuja con groups R.

Integracin con otras aplicaciones


LiveLink o conexin directa con Bases de Datos como Chem3D LiveLink

Inteligencia qumica de avanzada


Predicciones de Propiedades fisicoqumicas, nombres, ChemDraw para Excel

Nuevas herramientas BioDraw


Mejoras en la ilustracin de procesos biolgicos Completamente integrado con ChemDraw Nuevas herramientas para mapear Plasmids.

Genera estructuras a partir de un Nombre.


Simplifica el trabajo de laboratorio
Lambda convention Isotopes Porphyrins

Inner salts

Name = Struct maneja multiple tipos de estructuras

- ChemDraw

Acelerando su trabajo con ChemDraw


reduce el tiempo necesario para dibujar estructuras

Hotkeys personalizables
Hotkey
1 2 3 4 c l f a A or 5 b

Resultados
Cambia a enlace simple Cambia a enlace doble Cambia a enlace triple Cambia a enlace cuadruple Centrar un enlace doble Posicionar un enlace doble en la izquierda Traer un enlace al frente A Ac Br Hotkeys ayudan a dibujar estructuras qumicas en la mitad del tiempo No tiene que ir a cambiar herramientas en el menu principal Las hotkeys pueden ser adaptadas a sus requerimientos.

- ChemDraw

Acelerando su trabajo con ChemDraw


reduce el tiempo necesario para dibujar estructuras
Usando estas plantillas estructuras muy complejas pueden ser dibujadas en segundos en vez de minutos

Plantillas personalizadas a sus requerimientos

Ahorre horas de trabajo usando las estructuras predibujadas. Cree sus propias estructuras y reduzca el tiempo cuando dibuja experimentos similares

Simplificando la apariencia de las estructuras


- Ideal para comunicar qumica en forma ms efectiva

Apodos Personalizables (Nicknames)


Simplifique y acelere el dibujo qumico usando Nicknames Dibuje estructuras donde partes de la misma no se muestran en detalle, en cambio son representadas en una etiqueta qumica inteligente que se puede expandir si es necesario. Defina nuevos Nicknames en ChemDraw que sean apropiados a su investigacin

- Dibuja secuencias de Amino Acidos, DNA, RNA.

Herramienta para dibujar Secuencias

Dibuja secuencias de pptidos y nucletidos Modos Diferentes:


- Opcin 1: Amino cidos representado con una letra. - Opcin 2: Amino cidos representados con tres letras. - Opcin 3: dibujador de ADN. - Opcin 4: dibujador de ARN

Nomenclatura Termini son automticamente dibujados de acuerdo con la secuencia dibujada. Se puede expandir y contraer una o mltiple secuencias y etiquetas.

TLC Plate, Tablas, Flechas y lapicera


- Facilita el dibujo

ChemBioDraw calcula estequimoetra


- Evite errores costosos-

Herramienta: Stoichiometry Grid


Menu Structure Analyze Stoichiometry Auto-calcula los valores estequimetricos donde es posible hacerlo Los datos estequimetricos se sincronizan automticamente cuando cambia algo en la reaccin

La ms alta calidad grfica y representacion qumica


- Optimizacin de Structuras y Reacciones.

Con un click la opcin Structure or Reaction Cleanup provee representaciones ms elegantes, ntidas y exactas Se pueden fijar los largos de enlace y ngulos. El algoritmo clean-up ha sido mejorado considerablemente en versin 12.

Eliminando superposicin de enlaces: por ejemplo anillos puente

Selection of base ring in cyclic system

Vertically oriented carbonyls

Positioning of hashed and wedged bonds

Convenciones de representacin qumica


- Mejoras en la representacin estereoqumica

ChemDraw 12 ha sido mejorado para reconocer los estilos comunes de dibujo que representan la estereoqumica tetradrica sin necesidad de enlaces con clsica representacin en estero. Los cambios son consistentes con la ltimas recomendaciones de la IUPAC para representacin estereoqumica. Por ejemplo:

Prediciendo Propiedades Qumicas con ChemBioDraw


Una forma rpida de verificar sus compuestos.

Anlisis estructural (actualizado en tiempo real)


Frmula Masa Exacta Peso Molecular Distribucin Isotpica Anlisis Elemental Punto de ebullicin Punto de Fusin Temp Critica, Pres, Vol Energa de Gibbs LogP MR Ley de Henry Calor de Formacin CLogP CMR

Propiedades Fisicoqumicas

*Topoplogical Polar Surface, tPSA fue adicionado en versin 9.0

ChemBio3D LiveLink -Visualizacin 3D


View 3D Preview es un nuevo tem en el men View Una ventana separada flotante aparece mostrando el modelo en 3D (como la genera Chem3D) Para que funcione, una versin actual de Chem3D debe ser instalada

- Bsqueda de datos en base de datos estructurales en tiempo real.


Bsqueda en tiempo real

Database Gateway Livelink

Busca tan pronto como dibuja. Busca en todas la bases de datos de CS. Busca bases de datos internas

Analizar resultados en detalle


Cliquear un resultado para analizar la fuente y los detalles.

Prediccin de RMN usando ChemDraw


Ayuda a confirmar Estructuras Qumicas
1H NMR incluyendo patrones

de separacin de picos Calcula espectros de 13C NMR

Prediccin de RMN usando ChemDraw


Ayuda a confirmar Estructuras Qumicas

1H NMR incluyendo patrones de

separacin de picos Calcula espectros de 13C NMR

- Se pueden analizar resultados de NMR en segundos


Correccion de Base

MestRe Nova Lite procesa 1D NMR Spectra

MestReNova Lite Importa archivos de


Formato de data VXR/Unity/Inova Gemini/VXR XWINNMR/UXNNMR Aspect 2000/3000 Win-NMR JEOL GX/EX CDFF Nuts JCAMP-DX 5.0 NTNMr SwaN-MR SIEMENS NMR Proveedor Varian Varian Bruker Bruker Bruker JEOL AcomNMR IUPAC Tecmag Menarini Siemens Dimensions 1D ** 1D 1D ** 1D 1D 1D 1D ** 1D 1D 1D 1D

Analisis

Procesado y anlisis de RMN bsico. Ideal para cuando se hacen muchos experimentos de RMN como rutina. Complementa las predicciones bsicas de RMN de ChemDraw.

SIEMENS NMR Nicolet/GE 1D ** La version completa de MestReC tambien lee 2D en este formato

- Diseado para la ilustracin de procesos biolgicos.

BioDraw :Herramienta de Dibujo Biolgico

tRNA Ribosoma Mapa de Plsmidos Cada filamento de la doble hlice de DNA se pude seleccionar modificar individualmente Cada filamento y cilindros de protenas pueden separar y modificar individualmente.

Dibujos qumicos y biolgicos integrados


- Facilita la Comunicacin entre Cientficos Dibuja Mecanismos biolgicos (Biological Pathways)
Enzimas de uno o dos substratos Receptor Ion Channel Protenas helicales membranas lineales Membranas en Arco Complejos de Golgi Nubes G-Proteinas (alpha, beta or gamma subunit) Immunoglobina DNA Micelas Membrana Elptica Retculo Endoplasmico Mitocondria

Dibujos qumicos y biolgicos integrados


- Facilita la Comunicacin entre Cientficos

Las propiedades de BioDraw estn totalmente integrados en ChemBioDraw Ultra Es una excelente herramienta de colaboracin entre cientficos.

ChemBioDaw para Excel

- Store, Search, Organize Chemicals in Excel ChemDraw for Excel Add-In

ChemDraw for Excel

Chemically active structure Substructure search available utilizing ChemDraw toolbar

Adicionando Inteligencia Qumica a Excel


- Clculo de Propiedades qumica de mltiple estructuras ChemDraw/Excel

Adiciona estructuras qumicas y otro tipo de datos de ChemDraw, MDL, archivos SD o a ChemFinder base de datos a una hoja Excel. Convertir Nombres o SMILES en estructuras. Calcular propiedades fisicoqumicas de estructuras qumicas. Qumica combinatoria en Excel
- Generacin automtica de productos as partir de reactivos genricos. CHEMPROP.LOGP CHEMPROP.MR CHEMPROP.HENRY.LAW.CONSTANT CHEMPROP.BOILING CHEMPROP.FREEZING CHEMPROP.CRITICAL.TEMP CHEMPROP.CRITICAL.PRESSURE CHEMPROP.CRITICAL.VOLUME CHEMPROP.HOF CHEMROP.GIBBS CHEMPROP.IDEAL.GAS CHEMPROP.TPSA

LogP Molar Refractivity Henrys Law Constant Boiling Point Freezing Temperature Critical Temperature Critical Pressure Critical Volume Heat of Formation Gibbs Free Energy Ideal Gas Thermal Capacity tPSA

` Propiedades

Funcion

ChemBio3D

- Hacia una comprensin detallada de sistemas qumicos. ChemBio3D Ultra


Grupos de qumicos, bilogos pueden visualizar estructuras qumicas a travs de herramientas que son de alta calidad y fcil de usar. Visualice resultados de qumica computacional- asiste en el diseo de nuevos compuestos. Diagramas de cintas de Protenas y cidos Nucleicos proveen una visin profunda de la estructuras terciarias y cuaternarias de protenas y complejos proteicos. Conexin directa con el PDB

Visualizacin de alta calidad

- La forma eficiente de explorar estructuras complejas-

Model Explorer

- Visualizacin de sitios activos -

Superficies

A Connolly Surface which excludes the ligand

- Puede mostrar en forma selectiva los enlaces de inters-

Muestra los enlaces de puente de Hidrgeno

Superposicin automtica de molculas


- Superposicion rigida es muy simple -

Modelos en vivo en PPT - Facilitando la comunicacion-

C h e m 3D Em b e d

Incorpore modelos de ChemBio3D en PowerPoint Rote y zoom modelos ChemBio3D mientras da una presentacion! Si no tiene ChemBio3D: cree un animated gift

- Integracin con GAMESS, MOPAC, Gaussian y Jaguar


Clculos ab-initio y semiempricos usando: MOPAC GAMESS Gaussian* Jaguar* Que clculos podemos hacer?
Minimizacin de energa Clculos de propiedades electrnicas Prediccin de espectros de NMR, IR y Raman Superficies: Superficie de densidad de carga total, Superficie de Densidad De Spin total, Superficie de potencial Molecular Electrosttico, y superficie de orbitales Moleculares.

Extensiones de ChemBio3D .

ChemBioFinder

- Cree su propia base de datos qumicos y biolgicos.

ChemBioFinder

Construir y visualizar su propia base de datos qumicos y biolgicos. Crear sus propias planillas. Almacenar estructuras qumicas, propiedades fsicas notas y tablas de datos. Almacena datos biolgicos Integrado con ChemBioDraw. Bsqueda de datos usando: Estructuras qumicas(incluyendo sub-structuras) Bsqueda de texto con Wild card Bsqueda numrica.

Obteniendo informacin de datos


- Usando BioViz en ChemBioFinder

Visualizacin y anlisis de data directamente en ChemBioFinder


-Ninguna necesidad de usar otras aplicaciones de software - Los anlisis son almacenados con la plantilla

- Comparando estructuras basado en sus propiedades.

Perfilando compuestos

Perfilando compuestos Compare visualmente y organizar estructuras basados en valores de propiedades especificas y el perfil asociado con cada propiedad.

E-Notebook: Bitcora electrnica de Laboratorio

E-Notebook Ultra: version personal (desktop)


- Elimina horas de trabajo escribiendo y buscando resultados Work Offline Functionality Reaction Section

Batch Explorer

Stoichiometry Grid

Navigation Panel Reaction Conditions

Audit Trail

AutoText

- Interface free-form con una gran flexibilidad en la bsqueda de datos -

E-Notebook: Configuracin para Biologa

Seamless integration with Microsoft Office 2007 Ability to add as many sections as needed

Free-form drawing section

E-notebook Office 2007 Compatibility


- Work seamlessly with Office 2007 -

- Cumple con las reglas de la 21CFR Part 11 -

Seguridad y Audit Trail

Location of audit trail

Inventory y BioAssay

- Maneje su inventario de compuestos en su escritorio-

Inventory Ultra

Seguridad basada en SQL Server Role Modelo que identifica lugares fisicos Audit Trail reistra todos los cambio de Locations, Containers, and Substances

Puede importar datos de Excel Integrado con ChemACX.com

- configuracion intuitiva-

Inventory Ultra

Contents of one location Tabs contain data for each substance

Inventory location hierarchy

Option to rectify contents of location

- Puede accesar miles de compuestos disponibles comercialmente-

Se connecta con ChemACX

Search the ChemACX database or your Inventory database

Results can be added to your shopping cart for manager approval + ordering

Qu es BioAssay?
Importa y almacena datos de ensayos biolgicos Manejo automtico de procedimientos de ensayos biolgicos Grficos y heat maps Manipulacin matemtica y anlisis de los ensayos.

Cmo funciona BioAssay ?


Setup Plate
Define que tipo de plate se esta utilizando (Ex: 96-well, 384-well)

Setup Well
Define que sustancia hay en cada well (Ex: Empty, compound, negative control, positive control)

Setup Protocol
Define que hacer con los datos, una vez que han sido importados

Datos Raw
Pueden ser practicamente de cualquier tipo y pueden esta en fomato de plate o de columna o en un formato que Usted defina.

Que sistema es apropiado para nuestra institucion?

- Este anlisis se aplica para ELN, BioAssay, Inventory ELN, BioAssay, Inventory

Compartiendo informacion?

Desktop

Workgroup

Enterprise

Cloud

Individual use

Data shared among users

Data shared among users

Data shared among users

Individual Database

Read or read/write access to notebooks for each user

Read or read/write access to notebooks for each user

Read or read/write access to notebooks for each user

Forms unique to user

No costly duplication or irretrievable work

No costly duplication or irretrievable work

No costly duplication or irretrievable work

Customizations to meet requirements

Drastically reduced IT and maintenance costs

Beneficios de Compartir data

Busqueda rapida (structure, text, scientist, etc.) Evita duplicar experimentos Estandariza el formato de los datos Proteccion de Propuiedad Intelectual Audit Trail Backups crea reportes en forma rapida y sencilla.

Cloud Computing
- Beneficios -

No requiere inversion en infraestructura Los costos incluye Costo de adquicicion inicial Costo de instalacion Costo de adopcion Costo de soporte Es un ambiente de trabajo coeherente Es escalable

Cloud Computing
- ROI -