Resumen bioqumica:

Fundamentos:

Celulares: todas las clulas poseen una organizacin jerrquica, dada por una membrana plasmatica, un citosol, organelos, coenzimas, etc. Existen los fototrofos que utilizan la luz del sol para trabajar, los quimiotrofos que realizan acciones oxidativas. Clulas bacterianas poseen citosol, nucloide y plasmidos. Clulas eucariontes poseen ncleo, organelos y pueden ser estudiados por separados. Protenas forman el citoesqueleto dando rigidez y forma a la clula, adems otorgan el soporte del movimiento a la clula Los complejos macromoleculares se mantienen estables mediante enlaces no covalentes produciendo estructuras de diversos tamaos.

Qumicos: La versatilidad de enlace, permite al carbono producir una amplia variedad de esqueletos o uniones carbono-carbono con diversidad de grupos funcionales, otorgando as la naturaleza qumica y biolgica de las biomoleculas. Todas las rutas metablicas son iguales Las protenas y cidos nucleicos son parte de una cadena simple de monomeros , donde se encuentra la informacin necesaria para definir la estructura tridimensional y funciones biolgicas La nica forma de cambiar una conformacin molecular es mediante la ruptura de enlaces covalentes Las molculas son altamente especficas.

Fsicos: Las clulas vivas son sistemas abiertos que poseen un intercambio de materia y energa con su entorno, donde esta canaliza su energa para mantenerse en n estado dinmico distante al equilibrio. La tendencia de la reaccin qumica estar dada por la entropia y la entalpia Cuando el delta G es negativo hablamos de reaccin exergonica espontnea (libera

energa) La convercion del ATP a un grupo fosfato + ADP es altamente exergonica La mayora de las clulas reaccionan a velocidades tiles gracias a las enzimas que catalizan. El metabolismo se define como un conjunto de reacciones qumicas, que permiten el consumo de energa necesaria.

Genticos: La info gentica esta codificada en base a cuatro nucleotidos del ADN El ADN posee una estructura doble hlice que permite la replicacion y reparacin de ella misma La secuencia lineal de una protena, codificada en el ADN da paso a la estructura tridimensional de dicha protena (exclusivas)

Estructura y catlisis

El agua Constituye el 70% del peso de los organismos vivos Produce enlaces dbiles denominados "enlaces puentes de hidrgeno" los cuales otorgan al agua las caracteriscas, de poseer un alto punto de fusin, cohesin, adhesin, y de ornamento a temperaturas extremas (hielo) Genera interacciones debido a que disuelve molculas polares que adquieren una

interaccin de agua-soluto. Puentes de hidrgeno,interacciones hidrofobicas, fuerzas de Van de Walls, interacciones electroestticas, en s, son interacciones de carcter dbil, sin embargo, juntas son esenciales para generar las estructuras tridimensionales de las molculas. Los puentes de hidrgeno suelen formar interacciones con los tomos ms electro negativos como oxgeno y nitrgeno. En el caso de molculas no polares formarn unas estructuras denominadas "micelas" como forma de re ordenamiento, ej. Fosfolipidos Para generar interacciones puentes de hidrgeno es necesario tener una conformacin direccional por parte de la molcula a la cual se va a unir, esto esta dado por la unin de las fuerzas

electroestticas de las molculas. Esto puede darse entre un grupo hidrxilo del alcohol y el agua, grupo carbonilo de una cetona y agua, entre grupos peptidicos en polipeptidos y en bases complementarias del ADN (timina y adenina) La concentracin de solutos tiene gran influencia en las propiedades coligativas. Esto podr apreciarse cuando se forma la presin osmtica, y hablemos de solucin hipotonica, hipertonica, e isotonica.

Ionizacin del agua, cidos dbiles y bases dbiles

Las molculas tienen una ligera tendencia a ionizarse reversiblemente para proporcionar un protn, con el fin de propocionarnos enlaces puentes de hidrgeno. El denominado "salto de protones" es una unin entre diversas molculas de agua donde se produce un flujo neto de gran velocidad de un protn movindose a gran

distancia. El salto de protones es mucho ms rapido que la difusin y explica la gran movilidad de los iones H+. Para expresar el grado de ionizacin del agua se requiere de una constante de equilibrio. La cual se expresa como Keq = [productos] \ [ reactantes] en base a esto la concentracin la daremos por handerson-hasselbach ya que los parmetros normales, no se aplican a la bioqumica, es decir. los tampones proporcionan la primera lnea de de defensa por parte del organismo contra los cambios de pH interno. En el caso del tampn bicarbonato est otorga la presin parcial, en base a las concentraciones de CO2 en los pulmones y bicarbonato ( HCO3-) en el palma sanguneo, esto puede provocar problemas crnicos de respiracin. Tiene un pH = 7,4 por tanto su pH ptimo o rango til flucta en este valor adicionando y disminuyendo 1 es decir, el rango til de este tampn flucta entre 6,4 ~ 8,4 Cuando los valores de pH sobrepasan los rangos tiles, las estructuras ms complejas (tridimensionales) son destruidas, sin embargo, la nica forma que no puede destruirse es la estructura primaria. Protenas

Existen 20 aminocidos que se encuentran en forma natural Poseen una composicin de un Carbono central, un grupo carboxilo (arriba), grupo amino (izquierda) hidrgeno (derecha) y una cadena lateral o radical (abajo). Si todos los elementos son distintos hablamos del un carbono quiral. El nico elemento que no posee un carbono quiral es la Glicina que repite el H El enlace entre aminocidos que se ubican a distancia se denomina " enlace disulfuro entre cisteinas" , este es el nico enlace fuerte entre Revisar estos Aminocidos, los van a preguntar! aminocidos. Las protenas pueden actuar como cidos y bases, para esto poseen valores asociados al pH en que se encuentran, esto determinar s sus estructuras

asociadas deben perder protones, estos valores son:

-pK1: se asocia al grupo carboxilo y flucta entre el pH 2~3 aproximadamente -pK2: se asocia al grupo amino y flucta entre el pH 8~9 aproximadamente -pKr: asociado a la cadena lateral. Un amino acta como cido si cede un protn Un amino actua como base si capta un protn Los aminocidos son anfotericos porque pueden actuar de esta forma simultneamente Punto isolectrico: es el punto en el cual el aminocido tiene carga neta 0, puede calcularse de acuerdo a una clasificacin simple:

- aminocidos sin cadena lateral ionizable (no poseen pKr) -------> glicina

PI = pK1+pK2 \ 2 aminocidos con cadena lateral cida ------> aspartato, glutamato

PI= pK1+pKr \ 2 -aminocidos con cadena lateral manteniendo los grupos NH, SH, y OH -----> lis, cys,tir,arg,his

PI= pK2 + pKr\2

Enlace peptidico

Los aminocidos pueden unirse covalentemente mediante enlaces peptidicos para formar ppticos y protenas. Las clulas contienen una gran variabilidad de estas y

con diversas funcionalidad es La protena tiene diversos niveles, el ms importante es la estructura primaria conformada por una cadena larga y unilateral de aminocidos. Los polipeptidos son uniones entre cadenas de aminocidos que poseen una estructura caracterstica. Siempre en la unin de los polipeptidos se conservan los radicales para diferenciar la estructura

Principales caractersticas del enlace: fuerte, rgido, forma un plano, libera una molcula de agua al formarse

Las protenas estn estabilizadas por diversos enlaces dependiendo de su estructura

Protenas Globulares: solubles en agua, posee mltiples funciones (funcin vitamnica no existe) Protenas fibrosas: formadas por insolo tipo de cadena secundaria, insolubles en agua, rgidas y encargadas de otorgar soporte, Ej. Queratina

Enzimas

Catalizan las reacciones qumicas Disminuyen energa de activacin Se clasifican en holoenzimas si estas, estn unidas a una coenzima (orgnico) o an cofactor(ion metlico inorgnico) Apoloemzima : si sen encuentra en estado puro o sola Posee un sitio activo que es donde el sustrato se une y genera un cambio conformacinal en la estructura, mediante enlaces dbiles. Existen tambn las denominadas enzimas alostericas son aquellas enzimas que requieren que algo se una a la protena para que esta empiece a desarrollar sus funciones, ej. Hemoglobina Las enzimas deben ser completaras al estado de transicin V max. Es alcanzada cuando la enzima esta saturada por el sustrato Km: tenemos la mitad de los sitios ocupados por el sustrato, adems indica la

afinidad de la enzima por el sustrato. A mayor km menos afinidad, a menor km ms afinidad por el sustrato. Inhibiciones: competitiva, a competitiva, no competitiva.

Actina y miosina

Protenas esenciales para ejercer la contraccin muscular, se encuentran dispuestas en filamentos que llevan a cabo diversas interacciones transitorias que se deslizan una sobre la otra para generar la contraccin. Ambas conforman el 80% de la masa muscular Miosina: Posee una cabeza denominada "dominio S1" que posee un carcter motor que permitir efectuar la contraccin, esto de produce gracias a la capacidad de este fragmento de cristalizarse y as determinar estructuras. Las unin de miosina permitir formar los llamados filamentos gruesos, estos filamentos son el ncleo de la actividad contractil. Actina: ubicadas en el msculo como actina G ( globular), sin embargo, esta efecta diversas uniones para formar la actina filamentosa (F) la cual esta encargada de formar los filamentos delgados (acompaados tambn por troponina y tropomiosina). Estos filamentos sern los encargados de unirse fuertemente a la cabeza de la miosina para generar traccin, tambn es importante destacar que gracias a la actina se genera la hidrlisis de ATP.