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Memoria de prcticas externas

Andrea Villanueva Carabal LOceanogrfic. Grupo Parques Reunidos. C/ Eduardo Primo Yfera (Cientfic), n 1B. 46013. Valencia. Espaa. 4 Ciencias del Mar

AGRADECIMIENTOS
Antes de nada, me gustara agradecer tanto a la Universidad Catlica de Valencia como a LOceanogrfic, la oportunidad que me han brindado para poder realizar las prcticas en esta entidad. Tambin agradecer el apoyo recibido y los buenos momentos vividos durante este tiempo a todas las personas del departamento de Investigacin y de Educacin del Oceanogrfic de Valencia, a Juan, Susana, Alenar, Susana y David). Y al Coordinador del Departamento de Investigacin del Oceanogrfic de Valencia, Jose Antonio Esteban, por ensearme todas las labores de campo en el mbito de la bioacstica marina. Y como no, agradecer a todos los compaeros que he tenido durante estos meses y con los que he podido compartir conocimientos y aventuras: Dani, Francesca, Salva, Ajka, Nerea y Sara.

ndice
-Objetivo. -Funcionamiento de Adobe Audition 3.0, visualizando los sonidos de las especies de cetceos presentes en el Mar Mediterrneo. -Funcionamiento de XBAT y exportar los datos a una tabla de EXCEL. -Salida en barco para el avistamiento de cetceos. -Mantenimiento de un acuario con especies propias del Mar Mediterrneo. -Enriquecimiento ambiental con morsas y cognicin animal con morsas, leones marinos y belugas. -Dossier de los instrumentos oceanogrficos utilizados. -EAR (Ecologic Acoustic Recorder) -Liberador acstico. -Unidad transceptora. -Hidrfono de mano. -Amplificador. -Capturadora de audio.

Objetivo.
El objetivo de las prcticas ha sido principalmente uno, aprender a utilizar los programas XBAT y Adobe Audition 3.0 para el posterior anlisis de los datos acsticos. Los objetivos secundarios han sido, aprender la mecnica del trabajo en el centro de investigacin de LOceanogrfic, saber el mtodo de trabajo cuando se realizan avistamientos de cetceos y conocer el funcionamiento y mantenimiento necesarios para un acuario mediterrneo.

Funcionamiento de Adobe Audition 3.0.


Adobe Audition 3.0, es un software de reproduccin, edicin y grabacin de audio. Que nos permite visualizar las ondas acsticas en forma de onda o en frecuencia espectral, esta ltima ser con la que trabajar. Este tipo de visualizacin, nos muestra una forma de onda por sus componentes de frecuencia, donde el eje X est representado el tiempo y el eje Y est representada la frecuencia. Se representa mediante una escala de colores predeterminados (de azul oscuro a amarillo claro), los colores ms claros representan componentes de amplitud menores.

Figura 1: Programa Adobe Audition 3.0 con una pista de audio abierta, donde se pueden observar los pulsos de 20Hz de Rorcual comn.

Adobe Audition 3.0 permite acercar o alejar la imagen.

Figura 2: Ampliacin de la primera parte de la Figura 1. Adobe Audition 3.0 permite modificar varias propiedades de las ondas, como pueden ser la frecuencia de muestreo, para poder escuchar frecuencias muy bajas, como ocurre con los pulsos de 20Hz de Rorcual comn (Balaenoptera physalus), esto nicamente se aprecia en el eje X, que multiplica las frecuencias iniciales por el mltiplo que amples la grabacin. La frecuencia de muestreo inicial es de 250Hz, as que si la aumentamos a 500Hz, el eje de la X se multiplicara por dos.

Figura 3: Frecuencia de muestreo inicial a 250Hz (izquierda) y frecuencia de muestreo modificada a 500Hz (derecha).

Se pueden silenciar ruidos, que enmascaren sonidos de frecuencias mas bajas.

Figura 4: Se ha eliminado la zona superior de ruido, para poder escuchar mejor los pulsos de 20Hz. Tambin se puede calcular la distancia entre dos puntos, en este caso, calcular la distancia entre dos pulsos. Se tiene que seleccionar en primer lugar el centro del pulso 1 y luego arrastrar hasta el centro del pulso 2, en la parte inferior derecha se muestra una casilla con la duracin en segundos.

Figura 5: Calculo del intervalo entre dos pulsos. Se pueden reconocer las diferentes especies de cetceos del Mar Mediterrneo visualizando el archivo de audio con Adobe Audition 3.0 en modo de frecuencia espectral. A continuacin se muestran las especie del Mar Mediterrneo, exceptuando la del Zifio de Cuvier (Ziphius cavirostri), ya que su sistema de ecolocalizacin y de emisin de sonidos en muy focalizado y habitan en zonas muy profundas, lo que hace muy difcil la obtencin de sonidos.

Delfn Mular (Tursiops truncatus)

Figura 6: Silbidos de delfn mular, de alta frecuencia y repetitivos. Caldern gris (Grampus griseus)

Figura 7: Sonidos no repetidos en el tiempo.

Rorcual comn (Balaenoptera physalus)

Figura 8: Pulsos de baja frecuencia y repetitivos.

Caldern comn de aleta larga (Globicephala melas)

Figura 9: Silbidos.

Delfn listado (Stenella coeruleoalba)

Figura 10: Silbidos de alta frecuencia y muy agudos, no repetitivos.

Cachalote (Physeter macrocephalus)

Figura 11: Clicks de ecolocalizacin cortos, de gran intensidad y que aumentan en frecuencia cuando se acercan a la presa.

Funcionamiento de XBAT y exportar los datos a una tabla de EXCEL.


1-Abrir MATLAB 2-Para abrir XBAT (Extensible BioAcoustic Tool): -Seleccionar la carpeta: Archivosdeprograma/XBAT -Teclear xbat en la consola y presionar ENTER -Cuando cargue aparecer una nueva ventana a la derecha de la pantalla. 3-En SOUNDS entrar en NEW -FILE: Para abrir solo un archivo o FOLDER: Para abrir una carpeta (Presionar en OK) -Buscar un archivo en las carpetas y darle a ACEPTAR 4-Cuando se abra el sonido aparecer a la derecha, sobre l presionar el botn derecho y a continuacin a ACTIONS DETECT. Saldr una pantalla en la que hay que seleccionar que tipo de sonido queremos que detecte, para Rorcual comn haremos lo siguiente: -Buscar DATA TEMPLATE y luego fin_lejos3_R3 presionar al OK y esperar a que se realice la accin. -Cuando finalice, cerrar la pantalla. 5-Sobre el archivo de sonido realizar las siguientes acciones: -Botn derecho y presionar sobre OPEN, o bien hacer doble clic sobre el sonido. -Ampliar la pantalla que nos sale para poder ver bien. -Entrar en VIEW y deseleccionar la opcin: SELECTION ZOOM -Volver a entrar en VIEW y ir a GRID OPTIONS y luego a TIME LABELS y lo poner en SECONDS -Entrar en WINDOW ir a PALETTE PRESETS y luego darle a BROWSE_1 6-Saldrn unas ventanas: -En PLAY poner 8 o 10 si se quieren escuchar los sonidos, si no se quieren escuchar no es indispensable cambiar este dato. -En COLORMAP deseleccionar AUTO y modificar el brillo y el contraste hasta ver bien la imagen (Normalmente el brillo a: 0,9 y el contraste a: 0,4) -En PAGE cambiar la duracin a 300. -En LOG presionar en OPEN, seleccionar el primer archivo que aparece en la nueva pantalla. .Si no se ha detectado nada, cambiar el brillo y el contraste hasta ver bien la imagen, cerrar la pantalla de la imagen (con ella se cerraran el resto de pantallas) y volver a realizar la deteccin automtica igual que anteriormente (como en el paso 4). .Seguir los pasos de nuevo desde el paso 4 y volver a la pantalla de LOG, darle a OPEN y abrir el segundo archivo, que ser la nueva deteccin automtica. -En EVENT, organizar los datos por TIME. 7-Empezar a buscar desde el principio y a revisar las detecciones automticas. Si hay detecciones que no son pulsos mirar el nmero y en la ventana EVENT localizarla, le damos al botn derecho sobre ella y presionar a DELETE, luego darle a ACEPTAR y continuar buscando.

8-Tambin se pueden encontrar pulsos que no hayan sido detectados por el detector automtico, para seleccionarlos hay que: -Seleccionar el sonido en la pantalla, lo ms preciso posible. -Cuando salga el cuadro rojo, presionar sobre l con el botn derecho, luego presionar sobre LOG SELECTION, presionar sobre DATA TEMPLATE y si aparece mas de un archivo hay que presionar sobre el que tiene un que ser el archivo en el que se este trabajando, esta nueva seleccin se guardara junto al resto y aparecer en la ventana EVENT.

Una vez realizado el anlisis de lo datos mediante el software XBAT, se produce a exportar lo datos a excel, de la siguiente manera: Para exportar los archivos a excel una vez se han seleccionado todos los sonidos, tenemos que: 1-En EVENT ordenar los sonidos por TIME. Seleccionar todos los sonidos y darle al botn derecho a ACTIONS luego presionar sobre EXPORT CSV y a OK 2-Una vez abierto el archivo de excel hay que: -Seleccionar la columna A. -Ir a DATOS TEXTO EN COLUMNAS DELIMITADOS; COMA FINALIZAR -Aadir dos columnas despus de la columna C con los nombres: Segundos y Horas -Seleccionar la columna C, presionar en EDICIN REEMPLAZAR: Primero reemplazar la palabra SEC por nada (dejar la segunda casilla en blanco) y a continuacin reemplazar el . (punto) por una , (coma). -Seleccionar las columnas C, D y E, presionar el botn derecho y a continuacin sobre FORMATO DE CELDAS NMERO ACEPTAR. -En la segunda fila de la columna D introducir: =C2*3 -En la segunda fila de la columna E introducir: =D2/3600 (Hacer doble clic en la esquina inferior derecha para que la frmula se aplique a toda la columna)

Salida en barco para el avistamiento de cetceos.

Se realiz una salida en barco, realizando un transecto alrededor de las Islas Columbretes, para el avistamiento de cetceos.

Figura 12: Transecto realizado, donde estn marcados los puntos en lo que se avistaron los cetceos. En este transecto, se hicieron dos avistamientos de Stenella coeruleoalba: -W.P. S.coerulealba: 8-9 Stenella coeruleoalba. Grupo compacto, poco activas, sin saltar ni interaccionar con la embarcacin (solo al final un poco con nuestra estela). -W.P. Scoeruleaoba2: 39 (posiblemente entre 40 y 50 individuos) Stenella coeruleoalba. Grupo muy numeroso y disperso con grupos de alrededor de 8 a 14 individuos independientes, que en ocasiones se unan en la proa del barco. Se detectan muy lejos dando grandes saltos fuera del agua pero permaneciendo en el mismo sitio. Al acercarse la embarcacin muchos grupos aparecen en la proa de la misma y luego se quedan durante largo tiempo alrededor de las estelas de nuestra embarcacin. Se detectan ejemplares juveniles pero no cras. La salida se realiz desde el puerto de Castelln, hasta las Islas Columbretes, donde se hizo una parada para asegurarnos de que un aparato fondeado segua en su lugar, al comprobarlo mediante seales acsticas enviadas al liberador acstico que forma parte de la lnea de fondeo, empezamos a realizar el transecto para avistar cetceos. Durante el transecto se hicieron turnos de observacin en la parte ms alta del barco, los turnos eran de 3 personas que cubran los 180 de proa, cada 30 minutos se cambiaba a una de las personas para descansar y las otras dos personas rotaban para cambiar la posicin. Al avistar un individuo, el patrn de la embarcacin cambia el rumbo y se dirige hacia l y para poder observarlo de cerca y as identificar la especie y el nmero total de individuos que forman el grupo, a continuacin se vuelve a retomar el transecto marcado.

A la mitad del transecto se realiz otra parada para realizar una grabacin con un hidrfono de mano y as saber si haba algn animal cerca que no podamos ver pero si escuchar. En la grabacin no se detect ningn cetceo por lo que se prosigui con el transecto. Para realizar las grabaciones se utilizaron diferentes equipos, en primer lugar un hidrfono de mano que es el instrumento que esta en contacto con el agua, que se conecta a un amplificador, este a su vez va conectado a una capturadora de audio y esta ltima al ordenador que es el encargado de grabar los sonidos y de mostrarnos el espectrograma.

Mantenimiento de un acuario con especies propias del Mar Mediterrneo.

Acuario de unos 1000L aproximadamente, de agua salada, con tres especies de peces comerciales del Mar Mediterrneo. Tabla 1: Especies que podemos encontrar en el acuario Mediterrneo. Nombre comn Nombre cientfico Individuos Imagen Dorada Sparus aurata 16

Lubina

Dicentrarchus labrax

10

Verrugato

Umbrina cirrosa

Protocolo para el mantenimiento del acuario: -Medir una vez por semana o cada 15 das los parmetros: NH3 y NO2. -Si los nitratos son muy altos no se alimentar y se proceder a hacer un cambio de agua. -Realizar cambios de agua cada 15 das, aproximadamente de un 20%. -Controlar los parmetros del agua tales como: la temperatura, entre 18-19C y la densidad 1024 (32%0). -Alimentar 2 veces por semana, distribuyendo la comida por todo el acuario. -Sifonar los restos de comida despus de alimentar y reponer el agua sifonada. -Limpiar el acrlico. -Limpiar el skimmer de protenas regularmente.

Enriquecimiento ambiental con morsas y cognicin animal con morsas, leones marinos y belugas.
Se ha realizado enriquecimiento ambiental auditivo con el grupo de morsas presentes en el Oceanogrfic, para ello se dispona de una grabacin de los sonidos de ellas mismas as como de otra manada de morsas salvajes. Cada cierto tiempo, no determinado (15 das aproximadamente) se reproduca los sonidos grabados al grupo de morsas y se observaban sus reacciones. Tambin se ha llevado a cabo un trabajo de cognicin animal en el que he colaborado. Mediante este estudio se pretende saber si estos animales son capaces de reconocerse frente a un espejo como los primates. En este programa de cognicin, llevado a cabo esta basado en una serie de tests que se realizaban con los animales. Se empez colocando un objeto a los animales en sus instalaciones, en belugas dentro del agua y en leones marinos y morsas en seco. Se grab las reacciones de los animales y se grab el sonido, despus de este test, se cambi el objeto por un espejo, realizado con dos capas de acrlico, entre las cuales se coloc una lmina de espejo. Durante estas pruebas tambin se realizaron grabaciones de video y audio. Una vez realizados estos dos tests, se procedi a realizar unas marcaciones con diferentes colores a los animales, en primer lugar, nicamente se marcaba a lo animales y se grababa su comportamiento en las instalacin, para evitar que la marca produjera algn tipo de comportamiento anmalo y si esto fuera as tenerlo en cuenta a la hora de analizar los datos. Despus de llevar a cabo este procedimiento durante tres das, se coloc el objeto y se realiz la marca a los animales, este test tambin se realiz para evitar tener en cuenta comportamientos que tuvieran los animales con la marca y el objeto delante del espejo, tambin se realiz durante tres das en todos los animales. Una vez realizado este test, se realiz un tercer test con la marca, tambin durante tres das, en este caso ya con el espejo, aqu es donde se podra observar si el animal es capaz de reconocerse, si se mira la marca o si intenta quitrsela. Y para finalizar el estudio, se procedi a realizar una marcacin a los animales con el espejo, hacindoles ver que se les estaba marcando. No se han podido sacar conclusiones de este estudio ya que an no ha finalizado.

Dossier de los instrumentos oceanogrficos utilizados.

EAR (Ecologic Acoustic Recorder) Desarrollado por: Instituto de Biologa Marina de Hawaii, la Divisin del Ecosistema de Arrecife de Coral de la NOAA y el Instituto Cienftifo Oceanwide (http://oceanwidescience.org/docs/EAR.htm) Peso: 8kg Dimetro: 20cm Longitud: 60cm Profunidad mxima de fondeo: 500m Material: Carcasa de aluminio, con un extremo de metacrilato extrable con doble junta trica, donde se encuentran el interruptor magntico (empezar y finalizar la grabacin) y el hidrfono. Grabaciones: No se pueden realizar grabaciones continuas, estas son grabaciones de 5 minutos cada 10 minutos en stand-by. Tambin dispone de un detector automtico de energa que empieza a grabar en caso de que se produzca un aumento de la energa acstica.

Figura 13: EAR (Ecologic Acoustic Recorder)

Liberador acstico Modelo: ORE Offshore PORT Profundida mxima: 3500m Material: Aluminio Tamao: Compacto y pequeo Caractersticas: Comandos programados para la liberacin, activacin, desactivacin, mensajes informativos sobre la posicin (inclinado o no inclinado) http://www.edgetech.com/ore-offshore/gallery/item/port-mf-push-off-releasetransponder-2

Figura 14: Liberador acstico.

Unidad trasnceptora Modelo: AMD200R Caractersticas: Ordenar y recibir estados de los equipos sumergidos. Resistente al agua. Porttil. http://www.sidmar.es/es/instrumentacion/Productos/COMUNICACIONCONTROL/LIBERADORES/AMD200R.html

Figura 15: Unidad transceptora.

Hidrfono de mano Modelo: Reson TC 4033

Profundidad mxima: 900m Caractersticas: 10 metros de cable. Omnidireccional (capta todos los sonido independientemente de la direccin de la que proceden) Frecuencia: 1Hz a 140 kHz http://www.teledyne-reson.com/wp-content/uploads/2010/12/TC4033.pdf

Figura 16: Hidrfono de mano.

Amplificador Modelo: Brel & Kjaer Nexus 2692

Figura 17: Amplificadora de audio.

Capturadora de audio Modelo: Edirol FA-101 (24 bit & 192 kHz sample rate) Caractersticas: Funciona hasta los 192 kHz

Figura 18: Capturadora de audio.

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