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CLASIFICACIN ESTRUCTURAL DE LAS PROTENAS

La clasificacin se hace en funcin a la estructura secundaria presente. La protena completa o los dominios que la forman se agrupan de la siguiente manera: peridicamente por hembras alfa, hebras betas alternadas o segregadas. Debido a su semejanza en disposicin espacial de los elementos de la estructura secundaria las protenas dentro de una clase se clasifican en familias y subfamilias de plegamiento aunque su secuencia y su relacin no estn relacionadas como es la protena de piruvato cinasa la cual contiene dominios de diferentes familias.

ESTRUCTURA CUATERNARIA Y FORMACIN DE COMPLEJOS MULTIENZMATICOS Un gran nmero de protenas llamadas oligmeros formadas por una asociacin no covalente de dos o ms cadenas polipptidas llamadas sub unidades, los oligmeros ms sencillos son los dmeros, formados por dos subunidades idnticas o diferentes, los trmeros, tetrmeros y completos macromoleculares formados por desenas de sub unidades en ellas predomina la interaccin de los grupos no polares aunque tambin se observan puentes de hidrogeno, interrelacin entre grupos cargados y puentes de di sulfato.

PROPIEDADES DINMICAS Y FLUCTUACIONES TEMPORALES DE LAS PROTENAS

Es posible catalizar protenas puras, la conformacin en los cristales debe ser semejante. Mediante la combinacin de varias tcnicas espectroscpicas, se ha demostrado que las protenas son entes dinmicos que sufren movimientos continuos en escala de tipo variables, mientras las cadena lateral expuestas al solvente muestra un movimiento cercano a los aminocidos libres en solucin en cambio los movimientos de los grupos intermedios es ms lento porque requieren del movimiento concertado de diferentes partes de la molcula. Mediante el uso combinado de resonancia magntica nuclear y experimentos de intercambio en los que las protenas se transfiere a soluciones que contienen h2o en las regiones internas

de la molcula, el hidrogeno de las amidas recambia con el solvente esto depende de dos factores: La formacin de puentes de hidrogeno La accesibilidad del grupo al solvente

EVOLUCIN MOLECULAR Y COMPARACIN DE SECUENCIA

Los seres vivos son semejantes a nivel molecular todos utilizan la misma D-ribosa en los nucleicos y en los L- aminocidos en las protenas este comportamiento se explica de la siguiente manera: Todo organismo proviene de un ancestro comn y con la maquinaria bioqumica necesaria en funcin bsica esencial para el organismo es decir el uso de nucletidos, aminocidos, aparato gentico y sistema para sintetizar protenas el cual debe haberse iniciado hace ms de 3 mil millones de aos . El nmero de protenas se puede formar a partir de la unin de los 20 aminocidos como es el ejemplo de la triosafosfato de ismerasa (TIM) esta protena se ha encontrado en todas las especies que se ha estudiado. El material gentico est expuesto a diferentes mutaciones y los aminocidos son esenciales para la funcin y estructura de la protena. PURIFICACION DE PROTEINAS

la sntesis depende de la especie la E.coli produce aproximadamente 3 000 protenas y el ser humano sintetiza 100.000 debido a las protenas que encontramos en tejidos, clulas o el colgeno en tendones de las protenas .para purificar una protena es necesario purificarla es decir separarla de dems componentes celulares

PRECIPITACIN SELECTIVA La solubilidad de las protenas depende de la concentracin delas sales, pH temperatura y polaridad del solvente. A concentraciones bajas de sal la solubilidad de la protenas aumenta sim embargo a concentraciones mayores la solubilidad disminuye causando la precipitacin de las protenas.

La precipitacin causada por algunas sales como el sulfato de amonio es reversible al eliminar la sal por dilisis u otros mtodos. Cromatografa La cromatografa es el proceso en el que una solucin conocida como fase mvil es percolada a travs de una matriz porosa o resina llamada fase estacionaria que retrasa el proceso de los componentes de la fase mvil, de acuerdo a las caractersticas particulares de cada soluto. Los diferentes tipos de cromatografa pueden clasificarse segn el estado de las fases o la naturaleza de la interaccin entre la matriz y los solutos. Electroforesis Las protenas migran de acuerdo a su campo electrnico, debido a que permite determinar el nmero de protenas diferente en una preparacin peso molecular o el punto isoelctrico

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