ENZIMAS Bioqumica

20 de Mayo del 2013

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OBJETIVO
Dar a conocer

lo que es una enzima sus propiedades, clasificacin, y para qu

es til en nuestro organismo. QUE ES UNA ENZIMA? Los enzimas son biomolculas de origen proteico especializadas en la catlisis de las reacciones qumicas que tienen lugar en la clula. Son muy eficaces como catalizadores ya que son capaces de aumentar la velocidad de las reacciones qumicas y adems son altamente especficos ya que cada uno de ellos induce la transformacin de un slo tipo de sustancia y no de otras que se puedan encontrar en el medio de reaccin. Las enzimas son necesarias para todas las funciones corporales. Las enzimas pueden ser: Simples: formadas solo por aminocidos Complejas: tienen otra parte, llamado cofactor, denominndose apo enzima a la parte proteica; el conjunto se llama holo Enzima. Hay varios cofactores, como las sustancias derivadas de vitaminas, caso en que se llaman coenzimas, como el fosfato de piridoxal. Algunas estn unidas fuertemente a la enzima, otras no. Las enzimas se recuperan y pueden volver a hacer lo mismo. Tampoco las coenzimas se necesitan en grandes cantidades, por lo que no es necesario tomar tantas vitaminas.

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ASPECTOS GENERALES

Los enzimas son catalizadores especficos: cada enzima cataliza un solo tipo de reaccin, y casi siempre acta sobre un nico sustrato o sobre un grupo muy reducido de ellos. En una reaccin catalizada por un enzima: La sustancia sobre la que acta la enzima se llama sustrato.El sustrato se une a una regin concreta del enzima, llamada centro activo. El centro activo comprende (1) un sitio de unin formado por los aminocidos que estn en contacto directo con el sustrato y (2) un sitio cataltico, formado por los aminocidos directamente implicados en el mecanismo de la reaccin Una vez formados los productos el enzima puede comenzar un nuevo ciclo de reaccin.

1.- El enzima y su sustrato

2.- Unin al centro activo

3.- Formacin de productos

Existen distintos grados de especificidad. El enzima sacarosa es muy especfico: rompe el enlace b-glucosdico de la sacarosa o de compuestos muy similares. As, para el enzima sacarasa, la sacarosa es su sustrato natural, mientras que la maltosa y la isomaltosa son sustratos anlogos. El enzima acta con mxima

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eficacia sobre el sustrato natural y con menor eficacia sobre los sustratos anlogos. Entre los enzimas poco especficos estn las proteasas digestivas como la quimotripsina, que rompe los enlaces amida de protenas y pptidos de muy diverso tipo. ESTRUCTURA DE LA ENZIMA Las enzimas como protenas que son, cuentan con una estructura primaria, secundaria, terciaria e incluso si estn formadas por varias subunidades, cuaternaria. Esta estructura resulta importante para su actividad por lo que cambios en la misma pueden llevar a alteraciones en su actividad cataltica. La composicin y forma de una enzima viene definida por las cuatro estructuras, ya mencionadas, stas tienen un carcter jerarquizado, es decir, implican unos niveles o grados de complejidad creciente que dan lugar a los cuatro tipos de organizaciones. La estructura primaria de una enzima es la secuencia lineal de los aminocidos que contiene, o sea, el nmero y el orden en el que se encuentran La estructura secundaria de una enzima se refiere a la ordenacin regular y peridica en el espacio de la cadena polipeptdica a lo largo de una direccin. Se puede decir, que es la disposicin de la estructura primara en el espacio y que es consecuencia directa de la libre capacidad de giro del carbono alfa. Existen dos modelos o tipos de estructuras secundarias: - Hlice a. - Lmina b.

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La estructura terciara de una enzima informa de la disposicin de la estructura secundaria en el espacio y, por tanto, del tipo de conformacin tridimensional que posee. Las conformaciones ms frecuentes que adoptan las protenas son la globular y la filamentosa. Las funciones biolgicas que realizan las protenas dependen de la estructura terciaria que stas poseen. La estructura cuaternaria de una enzima informa que sta est compuesta de ms de una cadena polipeptdica, y hace referencia al modo en que se asocian las cadenas o subunidades para constituir la protena activa.

PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS SITIO ACTIVO Las molculas de enzimas contienen hendiduras o cavidades denominadas sitio activo. El sitio activo est formado por las cadenas laterales de residuos especficos, lo que ocasiona que tenga un arreglo tridimensional particular, diferente al resto de la protena. Este sitio es afn por la estructura tridimensional del sustrato:

E + S D ES D E + P

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EFICIENCIA CATALTICA

La mayora de las reacciones catalizadas por enzimas son muy eficientes y transcurren desde 106 hasta 1014 veces ms rpido que la misma reaccin no catalizada. Tpicamente, cada molcula de enzima es capaz de transformar cada segundo de 100 a 1000 molculas de substrato en producto. El nmero de estas molculas transformadas a producto por molcula de enzima en cada segundo, se conoce como el nmero de recambio. Velocidad en Enzima ausencia de enzima Anhidrasa carbnica Corismato mutasa Triosafosfato isomerasa Carboxipeptidasa A AMP nucleosidasa Nucleasa estafilococal 1.3 X 10 1 2.6 X 10 5 4.3 X 10 6 3.0 X 10 9 1.0 X 10 11 1.7 X 10 -13 Velocidad de reaccin catalizada 1.0 X 106 50 4300 578 60 95 7.7 X 106 1.9 X 106 1.0 X 109 1.9X 1011 6.0 X 1012 5.6 X 1014 Rendimiento

Eficiencia de las reacciones catalizadas por algunas enzimas ESPECIFICIDAD Las enzimas son muy especficas por el substrato de la reaccin que catalizan. Interactan con una o muy pocas molculas y catalizan nicamente un tipo de reaccin, por lo que las molculas con las que interactan deben ser muy parecidas, tanto en composicin, como en estructura tridimensional. Por ejemplo, en la siguiente figura, en el panel A, se muestra la reaccin catalizada por la

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enzima triosafosfatoisomerasa (enzima que cataliza el paso 5 de la gluclisis), en el panel B se muestran inhibidores de la catlisis:

COFACTORES Algunas enzimas se asocian con molculas de carcter no proteico que son necesarias para el funcionamiento de la enzima, estas molculas se

denominan cofactores. Comnmente, los factores encontrados en las enzimas incluyen iones metlicos como el Zn2+ o el Fe2+, tambin pueden ser molculas orgnicas que se denomina coenzimas como el NAD+, FAD, la conezima A y la C, generalmente las coenzimas son derivados de las vitaminas. A la enzima en ausencia de su cofactor (cuando lo tiene), se le denomina apoenzima, en presencia de su cofactor (cuando lo tiene), se le denomina holoenzima. La apoenzima generalmente carece de actividad biolgica. La diferencia entre un cofactor y un grupo prosttico, como el grupo hemo, es que este ltimo est unido

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de manera covalente a la enzima, mientras que el cofactor puede ser removido de la misma con relativa facilidad. REGULACIN La actividad enzimtica puede ser regulada, esto quiere decir que dependiendo de los requerimientos metablicos, las enzimas son activadas o inhibidas, para acelerar o disminuir la velocidad con la que catalizan la reaccin, respondiendo as a las diferentes necesidades de sus productos en la clula. La regulacin ms comn es modificando la concentracin de su(s) substrato(s). LOCALIZACIN EN LA CLULA En los eucariontes, muchas enzimas se localizan en organelos especficos en la clula. Esta compartamentalizacin ayuda a aislar los substratos de la reaccin o productos de la misma, de tal forma que no hay competencia de reacciones, de esta manera se provee un medio favorable para la reaccin, de tal forma que es posible localizar diferentes partes del metabolismo en diferentes organelos, haciendo a la clula una entidad organizada en donde simultneamente funcionan miles de enzimas.

CLASES DE ENZIMAS Actualmente se conocen unas 2000 enzimas, y para su clasificacin se utiliza un sistema que toma en cuenta tanto la especificidad de accin como la especificidad del sustrato. Cada enzima est indicada por un numero EC de varias cifras en el catalogo de enzimas. El primer nmero indica que la enzima corresponde a una de las 6 clases principales de enzimas, los dos nmeros siguientes definen la sub clase ya la sub-sub clase y el ltimo nmero es el nmero progresivo.

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En las seis clases principales se incluyen enzimas que tienen un mecanismo de accin similar.

Clase

Funcin

Tipo de reaccin

Subclases importantes Deshidrogenasas Oxidasas Peroxidasas Reductasas monoxigenasas Desoxigenasas

Catalizan la transferencia de los equivalentes reductores Oxidorreductas entre dos sistemas as redox.

Transferasas

Catalizan la transferencia de otros grupos de una molcula a otra

Transferasas Glucosiltransferasas Aminotransferasas Fosfotransferasas Esterasas Glucosidasas Peptidasas Amidasas Liasas C-C Liasas C-O Liasas C-N Liasas C-S

Hidrolasas

Transfieren grupos y el aceptor siempre es una molcula de agua. Catalizan la ruptura o formacin de uniones qumicas, con la formacin o eliminacin de

Liasas

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enlaces dobles. Desplazan grupos dentro de una molcula sin cambiar la formula general del sustrato. Son reacciones de unin de molculas dependientes de energa y por eso siempre estn acopladas con la hidrlisis de nucleosidos trifosfatos .

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Isomerasas

Epimerasas Isomerasas cistrans Transferasas Intramoleculares Ligasas C-C Ligasas C-O Ligasas C-N Ligasas C-S

Ligasas

ENZIMAS REGULADORAS Son catalizadores biolgicos, que adems de las propiedades que caracterizan a las enzimas, presentan caractersticas que le confieren papeles reguladores del metabolismo. Existen dos tipos:

Las enzimas alostricas

Una enzima alostrica es una enzima cuya actividad est regulada mediante un centro alostrico, que es un sitio, distinto del centro activo de la enzima, al que se une un regulador de manera reversible y no covalente. La unin de este regulador modifica la estructura tridimensional de la enzima y llega a afectar la configuracin del sitio activo, por lo que aumenta o disminuye su actividad, segn el caso.

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Control de las enzimas alostricas.

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Las enzimas alostricas muestran dos tipos de control diferentes: Heterotrpico y homotrpico, segn la naturaleza del modulador.

Enzimas homotrpicas.

El sustrato acta, tambin como modulador. Estas enzimas contienen dos o ms centros de unin para el sustrato. La modulacin depender de cuntos sean los centros del sustrato que estn ocupados.

Enzimas heterotrpicas.

Son estimuladas o inhibidas por un modulador diferente a la del sustrato. Cintica de las enzimas alostricas. Su comportamiento cintico esta alterado por las variaciones de la concentracin del modulador alostrico. Las enzimas homotrpicas muestran una curva sigmoidal en las grficas de velocidad de Michaelis - Menten. La curva sigmoidal implica que la unin de la primera molcula de sustrato con la enzima intensifica la unin de las molculas de S subsiguientes a los otros centros activos. Las enzimas moduladas covalentemente. La actividad cataltica de la enzima es modulada por la unin no covalente de un metablito especfico a un centro de la protena, diferente al centro cataltico. Reaccin determinante. Se asigna a la primera etapa en una secuencia de reacciones multienzimticas, que es irreversible en condiciones intracelulares. Constituye una estrategia de la clula para regular una ruta metablica, desde la etapa inicial y as lograr la mxima economa de metablitos.

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REGULACION DE LA ACTIVIDAD ENZIMATICA Existen 2 mecanismos: Sintetizar ms o menos enzimas de acuerdo a las necesidades.

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Regulacin por va de la actividad. Hay muchos mecanismos reguladores de la actividad enzimtica.

MECANISMOS REGULATORIOS INDUCCIN Y REPRESIN Si una persona tiene tendencia a presin baja, tender a producir ms sustancias que aumenten la presin. Esto est afectado por factores externos, por ejemplo, si una persona come mucha azcar, las enzimas degradadoras de glucosa estarn aumentadas y viceversa. MODIFICACION COVALENTE Agregado a las enzimas una sustancia que se une covalentemente a ellas se puede hacer ms activa o menos activa. La regulacin esta en la enzima que une o separa una sustancia a la enzima. El caso ms frecuente son las reacciones de fosforilacin, donde X es un grupo fosfato. Una enzima puede fosforilarse o defosforilarse. Hay enzimas que al fosforilarse se activan y otras que al desfosforilarse se activan; en cualquier caso se requiere de un sistema que fosforile y otro que defosforile. PROTEOLISIS DE PROENZIMA Hidrlisis: degradacin de enlaces peptdicos. Cuando* a una enzima (proenzima o cimgeno), se le corta un trozo, se activa. Esto lo hace otra enzima, llamada proteoltica. Este mecanismo se da en un solo sentido, no se vuelve atrs, no se le puede volver a unir el pptido a la enzima.

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MECANISMOS ALOSTRICOS

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Enzimas que aparte de su sitio activo tiene un sitio alostrico que cuando se une un efector alostrico puede favorecer o desfavorecer (positivo o negativo) la actividad de la enzima, en cualquier caso, regula. COOPERATIVIDAD POSITIVA
Sustrato solo

La unin de un sustrato hace ms fcil la llegada de un segundo sustrato. Cuando llega un sustrato al primer sitio activo, se favorece la entrada de sustrato a los otros sitios activos. Normalmente se da en enzimas de estructura cuaternaria
[S] V Cooperatividad positiva

REACCIONES ENZIMTICAS: Reaccin Monosustrato:

A+E AE P+E

Reaccin multisustrato:
A+B+E ABE P+Q+E

En este ltimo caso las 2 molculas interactan con la enzima; ambos productos no pueden entrar ni salir al mismo tiempo, por lo que se dan los siguientes casos: 1) Secuencial Ordenada: entra el primer sustrato y luego el segundo; sale el primer producto y luego el otro.
P EPQ EQ Q E

A E EA

B EAB

Catlisis

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2) Secuencial al azar: cualquiera de los 2 sustratos puede entrar primero y cualquiera de los 2 productos puede salir primero.
A EA E EB B A Q EAB EPQ EP P B P EQ E Q

3) Mecanismo ping-pong: la enzima reacciona con el primer sustrato entrega el primer producto, toma el segundo sustrato y entrega el segundo producto.
A EA E EP P E B EB EQ E Q

En trminos de regulacin, la actividad enzimtica va a depender del mecanismo de reaccin que se d con una determinada enzima y si es de un sustrato o de dos sustratos. . MECANISMO DE ACCIN ENZIMTICA Una enzima, por s misma, no puede llevar a cabo una reaccin, su funcin es modificar la velocidad de la reaccin, entendindose como tal la cantidad de producto formado por unidad de tiempo. Tal variacin se debe a la disminucin de la energa de activacin Ea; en una reaccin qumica, la Ea es la energa necesaria para convertir los reactivos en formas moleculares inestables denominadas especies en estado de transicin, que poseen mayor energa libre que los reactivos y los productos.

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Imagen original de la Universidad de Virginia En el diagrama estn representados los niveles de energa, durante el curso de la reaccin, de molculas intervinientes en una reaccin tipo: A + B ---> C. La curva azul muestra el curso de la reaccin en ausencia de una enzima que facilite la reaccin, mientras que la curva roja la muestra en presencia de la enzima especfica de la reaccin. La diferencia en el nivel de energa entre el estado inicial y la necesaria para iniciar la reaccin (picos de las curvas) es la energa de activacin. Tal como se observa la presencia de enzima baja la energa de activacin.

El complejo Enzima- sustrato posee menor energa de activacin que las especies en estado de transicin que la correspondiente reaccin no catalizada.

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Como realiza esta accin una enzima

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Orienta a los sustratos: parte de la energa de activacin se utiliza para que los sustratos roten y se enfrenten con los tomos correctos para formar los enlaces.

Agregan cargas a los sustratos: las cadenas laterales (R) de los aminocidos de las enzimas pueden participar directamente haciendo a los sustratos qumicamente ms reactivos.

Inducen la deformacin en el sustrato: cuando una sustancia se une al sitio activo, la enzima puede causar que los los enlaces se estiren, ponindolo en un estado de transicin inestable.

Cambio de forma de la enzima al unirse al sustrato: el modelo de llavecerradura de Fisher fue actualizado cuando se descubri que las enzimas son flexibles y sus sitios activos pueden cambiar (expandirse) para acomodarse a sus sustratos. Este cambio de forma causado por la unin al sustrato se denomina ajuste inducido.

En la Hexoquinasa puede observarse este ajuste inducido, con el sustrato (glucosa) y sin l. El ajuste inducido alinea las cadenas laterales reactivas del sitio activo de la enzima con los sustratos. Esta enzima cataliza la reaccin: Glucosa + ATP --> glucosa 6-fosfato + ADP Para que una reaccin qumica tenga lugar, las molculas de los reactantes deben chocar con una energa y una orientacin adecuadas. La actuacin del enzima (1) permite que los reactantes (sustratos) se unan a su centro activo con una orientacin ptima para que la reaccin se produzca y (2) modifica las propiedades qumicas del sustrato unido a su centro activo, debilitando los enlaces existentes y facilitando la formacin de otros nuevos.

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INHIBIDORES DE ENZIMAS

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Pueden disminuir la velocidad de la reaccin enzimtica. Esta sustancia al interactuar va a disminuir el efecto de la enzima sobre el sustrato.

En un caso, cuando esta molcula se ubica en el sitio inhibidor, se altera la conformacin del sitio activo, por lo que no se va a producir el complejo enzima sustrato. Este inhibidor no se puede desplazar porque la unin que forma con la enzima es bastante fuerte (covalente).
1/S 1/V Con inhibidor no competitivo Sin inhibidor

Este inhibidor se llama no competitivo y se puede graficar. El valor de la velocidad mxima disminuye, no se recupera aunque se aumente el sustrato y se mantiene para esa velocidad disminuida el valor de Km que se encuentra en ausencia de ese inhibidor.

Otra situacin ocurre cuando el inhibidor tiene la misma forma del sitio activo, ocupa el lugar del sitio activo correspondiente al sustrato, complejo impidiendo enzima la formacin Se del
1/S 1/V

Con inhibidor competitivo Sin inhibidor

sustrato.

puede

desplazar al inhibidor del sitio activo por

simple competencia, aumentando la cantidad de sustrato. Estos inhibidores no alteran la velocidad mxima, sino la Km. Se llaman inhibidores competitivos.

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Existen muchas alteraciones orgnicas donde se puede intervenir conociendo la patologa y las enzimas. Todas las patologas comprometen la accin de una o ms enzimas. Ejemplo: La angiotensina eleva la presin, se sintetiza a partir de un angiotensingeno, que luego forma angiotensina I, II y III. Cuando hay hipertensin se puede evitar la formacin de II y III con inhibidores enzimticos competitivos. Hipercolesterolemia: el organismo sintetiza colesterol, un inhibidor hace que la sntesis del colesterol baje. Un inhibidor muy usado en el mundo (no reversible) es la aspirina. Su destino es interferir una reaccin enzimtica que lleva a la produccin de prostaglandinas (precursor: cido araquidnico); la oxigenasa tiene en su sitio activo un aminocido llamado serina con un radical con un grupo OH; sobre esta enzima acta el cido acetilsalicilico; as la serina y la enzima no funcionan, lo que produce una inhibicin irreversible. Cuando algn signo molesto ocurre en el organismo (fiebre, dolor, coagulaciones intravasculares, etc), la disminucin de la sntesis de prostaglandinas hace que estos signos se abatan.

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CONCLUSIONES

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Las enzimas actan como catalizadores de reacciones qumicas, estas ayudan al funcionamiento de nuestro organismo. Las Funciones de las enzimas, se enlazan y se pliegan una o ms cadenas polipeptdicas, que aportan un pequeo grupo de aminocidos para formar el sitio activo, o lugar donde se adhiere el sustrato, y donde se realiza la reaccin para establecer un equilibrio qumico; por lo tanto las enzimas aceleran la formacin del equilibrio qumico, pero sin afectar las concentraciones finales. La enzima y un sustrato no llegan a adherirse si sus formas no encajan con exactitud. Esto asegura que la enzima no participa en reacciones equivocadas. Myriam Stephania Gonzlez Silva.

Las enzimas son catalizadores biolgicos que incrementan la velocidad de las reacciones qumicas, sin producir cambios importantes en ellas, por lo que son muy esenciales para cualquier ser vivo debido a que dependemos de un gran nmero de reacciones a nivel celular. Hay un gran nmero de enzimas en nuestro organismo, por lo que si no existieran no se podran producir muchas reacciones en nuestro organismo y no podramos vivir. Por lo tanto una enzima que es de origen proteico y se encuentran en cada rgano y clula de nuestro cuerpo ayuda a acelerar determinada reaccin que va a dar un nuevo compuesto que en condiciones de ausencia de la enzima tardara mucho tiempo en suceder, por lo que su importancia para la vida es mucha. Andrea Herrera Nuez

Las enzimas son unas protenas que su funcin es producir un cambio qumico y especifico en todas las partes del cuerpo, ya que tambin son tiles para la descomposicin de alimentos que consumimos en el cuerpo.

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Las enzimas las podemos encontrar en cada rgano y clula de nuestro cuerpo, como mencionar que son catalizadores para reacciones qumicas en los seres vivos, sustancias es decir que sin consumir alguna reaccin aumentan considerablemente su velocidad. En su estructura las enzimas son generalmente protenas globulares que pueden presentar tamaos muy variables, desde 62 aminocidos como en el caso del monmero de la 4-oxalocrotonato tautomerasa, hasta los 2.500 presentes en la sintasa de cidos grasos. Las actividades de las enzimas vienen determinadas por su estructura tridimensional, la cual viene a su vez determinada por la secuencia de aminocidos. Sin embargo, aunque la estructura determina la funcin, predecir una nueva actividad enzimtica basndose nicamente en la estructura de una protena es muy difcil, y un problema an no resuelto. y como esto las enzimas son muy importantes en nuestro organismo ya que cumplen funciones especificas. Vanessa Jurado Prez

Las enzimas son una parte muy importante de nuestro organismo, gracias a ellas podemos llevar a cabo el metabolismo de manera eficiente y nos desarrollamos de manera normal. Cualquier alteracin crea un desequilibrio que pone en riesgo nuestra vida. Cada una se especializa en una reaccin, por lo que es muy importante que estas funcionen bien para que esta reaccin no se vea alterada. Me parece muy interesante la exactitud con la que las enzimas se organizan y realizan su trabajo por lo que me gustara seguir aprendiendo de ellas. Maya Devi Sandoval Herrera

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BIBLIOGRAFIA www.idap.com.mx/apuntes/Bioquimica/Enzimas(2).doc http://genesis.uag.mx/edmedia/material/quimicaII/enzimas.cfm http://medmol.es/glosario/77/ learn.genetics.utah.edu/es/units/activities/extraction/enzyme.html