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Va alternativa Esta va se inicia directamente por componentes de las membranas bacterianas y no necesita la presencia de anticuerpos.

Por ello, representa un mecanismo de defensa importante en los estadios iniciales de la infeccin, cuando an no se ha hecho efectiva la respuesta inmune humoral. El primer factor de esta va, es el C3, que se est activando permanentemente pero a una tasa muy moderada (fase de reposo). La activacin y amplificacin ocurren solamente en presencia de ciertos agentes, principalmente bacterias (fase de ampliacin). En la fase de reposo actan una serie de enzimas naturales que escinden lentamente a C3 en el un fragmento pequeo C3a y otro mayor C3b inactivo Por el contrario en la va de amplificacin, cambia el destino de C3b, pues en vez de entrar en una va de catabolismo forma un enlace covalente con la superficie del germen que amplifica la va alternativa (Figura 5). Este hecho y la intervencin del factor B, D y que ciertos complejos actan de convertasa del C3b hacen que el germen termine siendo opsonizado por molculas de C3b, es decir, "marcado" para ser reconocido y fagocitado por clulas macrfago. En paralelo a la liberacin de C3b se producen fragmentos de C3a de gran importancia funcional Las ficolinas son protenas de defensa que forman oligmeros a partir de tallos homlogos al colgeno y dominios semejantes a fibringeno. Son capaces de sentir seales de peligro tales como patrones moleculares asociados patgenos o a clulas apoptticas. En el hombre, las ficolinas L y H se han caracterizado en el suero, mientras que la ficolina M es secretada por clulas monocticas. Al igual que la lectina de unin a manano (mannan-binding lectin, MBL), pueden asociarse a las serina-proteasas asociadas a MBL e iniciar la va de activacin de complemento de las lectinas, un importante sistema efector de la inmunidad innata humoral. Tambin pueden actuar como opsoninas, incrementando la eliminacin de sus dianas por fagocitosis. Estudios estructurales recientes muestran que la ficolina L es una protena dereconocimiento verstil, capaz de unir molculas acetiladas y carbohidratos neutros por medio de sitios de unin diferentes, mientras que la ficolina H posee un nico sitio de unin con una especificidad ms restringida hacia los carbohidratos neutros. Los estudios filogenticos revelan que las ficolinas han sido conservadas en el proceso evolutivo, apoyando la hiptesis de que el sistema de complemento primitivo era un sistema de opsonizacin basado en lectinas, y ponen de relieve la importancia de las protenas de reconocimiento de carbohidratos en la inmunidad innata.