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Gentica bacteriana

Mecanismos que conducen a la evolucin de los genomas bacterianos: 1. Mutacin y seleccin 2. Transferencia lateral de genes: transformacin, transduccin, conjugacin. 3. Re-arreglos internos del ADN 4. Transposicin de elementos genticos mviles (IS, Tn)

Mutaciones
Mutacin: Cambio heredable en la secuencia de ADN. Pueden causar alteraciones en el fenotipo. Espontneas: originadas por infidelidad en replicacin, inestabilidad qumica de bases. Inducidas: generadas por mutgenos qumicos, radiaciones.

Microlesiones: mutaciones puntuales

Macrolesiones. Generadas por recombinacin homloga

a. M. silenciosas. No cambia el aa b. M. errneas (missense). Cambia el aa

c. M. sin sentido (nonsense) .Cambia a un codn de terminacin de traduccin

Mutaciones polares Afectan genes ro abajo. Ocurren en los operones (bacterias o arqueas).

Mutaciones por insercin (Tn)

Mutaciones condicionales. El producto codificado es activo a la temperatura permisiva e inactivo a la temperatura restrictiva

Los fenotipos mutantes pueden ser restablecidos por reversin o supresin

Reversin de las mutaciones al fenotipo wt

Mutaciones supresoras

Replicacin de templados circulares


Replicn: Unidad de replicacin autnoma. Contiene ori y funciones que actan sobre el ori. Ej. cromosoma, plsmidos, fagos. Modos de replicacin de templado circular: bidireccional () y crculo rodante () Modo bidireccional (): cromosoma, plsmidos Gram- (oriC, oriV, ColE1) Iniciacin tipo oriC

Modo Replicacin en crculo rodante (): fagos (M13), plsmidos Gram +, plsmido F.

Puede generar concatenados que contienen varias unidades del genoma. Son posteriormente procesados (fago lambda)

Plsmidos
Son replicones. Tamao variable (1-200 kbp) Generalmente circulares. Algunos lineales. Una copia/clula o varias copias/clula. Por recombinacin generan dmeros, multmeros o monmeros Modos de replicacin: o Controlan su replicacin y nmero de copia mediante control negativo del inico de la replicacin Poseen: - Mdulo bsico: un orgen de replicacin vegetativo (oriV), genes para la replicacin. - Sistemas de particin (segregacin a las clulas hijas) - Secuencias de insercin (IS) y/o transposones (Tn) - Genes de resistencia a antibiticos u otras funciones bioqumicas (degradacin, virulencia, bacteriocinas, etc) - Funciones de transferencia (plsmidos conjugativos)

Mapa del plsmido de resistencia R100

Mantenimiento de los plsmidos 1. Plsmidos de alto nmero de copia particionan al azar. 2. Plsmidos de bajo nmero de copia (1-2/cel). Deben contener sistemas de particin

Particin de plsmidos de alto nmero de copia

Sistemas de Particin verdaderos: Aseguran que dos plsmidos generados luego de la divisin celular sean segregados a las clulas hijas. Poseen funciones codificadas en cis y trans necesarias para la particin (parA, parB, parS)

Sistemas de adiccin: La bacteria slo sobrevive mientras lleve el plsmido.

Antdoto-veneno producidos por el plsmido. El veneno es estable, el antdolo (bloquea la accin del veneno) es inestable. En plsmido F, antdoto y veneno son protenas. En pR1, el antdoto es un mRNA antisentido que bloquea el mRNA de la toxina

Compatibilidad Dos plsmidos son incompatibles si sus orgenes no pueden ser distinguidos durante algn proceso necesario para su mantenimiento (iniciacin de la replicacin y/o segregacin).

Control del nmero de copia. El ori ColE1 es controlado por un RNA regulador

Mecanismos de intercambio gentico en microorganismos: Transferencia horizontal gnica (THG)

Transformacin Conjugacin Transduccin

Transformacin: Incorporacin de ADN libre del ambiente


Competencia gentica: Capacidad de una bacteria para ser transformada Natural. Ej. B. subtilis, S. pneumoniae

Modelo de transformacin natural en B. subtilis

S. pneumoniae

Artificial. Ej. E. coli, Pseudomonas. Varios mtodos: Cloruro de Calcio, electroporacin, formacin de protoplastos+PEG (arqueas).

Conjugacin
Un plsmido o cromosoma es transferido de una bacteria a otra por contacto entre clulas

Mapa gentico del plsmido F de E.coli. oriV: origen de replicacin vegetativo; Rep; funciones para la replicacin; IS, Tn: elementos mviles oriT: origen de transferencia; genes tra: funciones para la conjugacin.

Modelo de la transferencia de plsmidos durante la conjugacin entre bacterias Gram negativas

Modelo de replicacin en crculo rodante para la transferencia de ADN

Clulas F+: dador Clulas F-: aceptor Clulas Hfr: alta frecuencia de recombinacin de F en cromosoma Episoma: plsmido que se replica autnomamente o se integra al cromosoma Fo R: plsmido derivado de cepa Hfr que lleva genes cromosomales. Plsmidos autotransmisibles: (conjugativos): Poseen funciones completas para la conjugacin (oriT y genes tra) Plsmidos no-autotransmisibles (movilizables): Poseen oriT y funciones incompletas para la conjugacin (genes mob, codifican funciones necesarias para el inicio de su propia transferencia ). Para ser transferidos requieren de un plsmido helper conjugativo que aporte las funciones que le faltan.

Integracin del plsmido F al cromosoma en cepas Hfr