1.- DATOS DE LA ASIGNATURA Nombre de la asignatura: Carrera: Ingeniera Bioqumica Clave de la asignatura: BQJ-1004 (Crditos) SATCA1 4- 2- 6 2.

- PRESENTACIN Caracterizacin de la asignatura. Esta asignatura aporta al perfil profesional del Ingeniero Bioqumico, los conocimientos (composicin celular y los fenmenos metablicos que permiten su desarrollo y utilizacin en los diferentes procesos industriales), necesarios para disear, seleccionar, adaptar, operar, controlar, simular, optimizar y escalar equipos y procesos en los que se aprovechen de manera sustentable los recursos biticos, identificar y aplicar tecnologas emergentes relacionadas con el campo de accin del Ingeniero Bioqumico, formular y evaluar proyectos de Ingeniera Bioqumica con criterios de sustentabilidad, realizar investigacin cientfica y tecnolgica en el campo de la Ingeniera Bioqumica y difundir sus resultados. Se contempla dentro del programa de la asignatura, integrar los contenidos de biomolculas con los procesos bioqumicos del metabolismo celular que permitan desarrollar el quehacer profesional del Ingeniero Bioqumico. Dado que esta materia dar soporte a otras, ms directamente vinculadas con desempeos profesionales; se inserta en la primera mitad de la trayectoria escolar; despus de las Qumicas Orgnicas, Bioqumica I y de Termodinmica, el estudiante debe contar con conocimientos de bioenergtica, actividad enzimtica, estructura y metabolismo de aminocidos y carbohidratos para poder trasladarlos en la comprensin, el anlisis y reflexin de los contenidos de Bioqumica II. Se relaciona con asignaturas posteriores como Microbiologa, ya que el estudiante de Ingeniera Bioqumica debe interpretar y analizar los diferentes ciclos metablicos, para el manejo y control de microorganismos, tambin son necesarias para Cintica Qumica y Biolgica ya que permite comprender la funcin enzimtica como catalizador biolgico y en consecuencia para Ingeniera de Biorreactores. Intencin didctica. Se organiza el temario en seis unidades, agrupando los contenidos conceptuales de la asignatura en las dos primeras unidades referentes al metabolismo integrador de aminocidos y de cidos nucleicos. La tercera unidad integra los mecanismos de control y regulacin del metabolismo celular. La cuarta unidad abarca la concepcin de la gentica, estructura y funcin de los cidos nucleicos. En la ltima unidad se aborda los mecanismos y regulacin de la replicacin, trascripcin y traduccin gentica.
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Bioqumica del Nitrgeno y Regulacin Gentica

Sistema de asignacin y transferencia de crditos acadmicos

En el transcurso de las actividades programadas es muy importante que el estudiante se comprometa con las actividades que se llevan a cabo y entienda que son parte de su hacer futuro profesional. De igual manera, se busca que aprecie la importancia del conocimiento, los hbitos de trabajo y desarrolle adems habilidades y actitudes como la precisin y la curiosidad, la puntualidad, el entusiasmo y el inters, la tenacidad, la flexibilidad y la autonoma. Es necesario que el profesor atienda y cuide estos aspectos en el desarrollo de las actividades de aprendizaje de esta asignatura

3.- COMPETENCIAS A DESARROLLAR Competencias especficas: Competencias genricas:

Comprender, identificar, analizar y relacionar Competencias instrumentales el metabolismo de aminocidos. Capacidad de anlisis y sntesis. Comprender, identificar, analizar y relacionar Capacidad de organizar y planificar. el metabolismo de cidos nucleicos. Conocimientos bsicos de la carrera. Comunicacin oral y escrita Comprender, identificar, analizar y relacionar Habilidades bsicas de manejo de la los mecanismos de control y regulacin del computadora. metabolismo celular, para aplicar en el Habilidad para buscar y analizar aprovechamiento de los procesos y recursos informacin proveniente de fuentes biticos. diversas. Solucin de problemas. Comprender, identificar, analizar y relacionar Toma de decisiones. los conceptos de la gentica, estructura y funcin de los cidos nucleicos. Competencias interpersonales Capacidad crtica y autocrtica Comprender, identificar, analizar y relacionar los mecanismos y regulacin de la Trabajo en equipo replicacin, trascripcin y traduccin Habilidades interpersonales gentica, para aplicar en el aprovechamiento de los procesos y recursos biticos. Competencias sistmicas Capacidad de aplicar los conocimientos en la prctica Habilidades de investigacin Capacidad de aprender Capacidad de generar nuevas ideas (creatividad) Habilidad para trabajar en forma autnoma Bsqueda del logro

4.- HISTORIA DEL PROGRAMA Lugar y fecha de Participantes elaboracin o revisin Observaciones (cambios y justificacin)

Instituto Tecnolgico Villahermosa

de Representantes de los Institutos Tecnolgicos de: Celaya, Culiacn, Durango, Mrida, Morelia, Tehuacan, Tepic, tijuana, Tuxtepec, Veracruz, Villahermosa.

Reunin de Diseo curricular de la carrera de Ingeniera Bioqumica del Sistema Nacional de Educacin Superior Tecnolgica

Instituto Tecnolgico de Representante Tijuana del 14 de Academia de septiembre al 5 de febrero Bioqumica del 2010

de la Anlisis, enriquecimiento y Ingeniera elaboracin del programa de estudio propuesto en la Reunin Nacional de Diseo Curricular de la carrera de Ingeniera Bioqumica.

5.- OBJETIVO GENERAL DEL CURSO Comprender, identificar, analizar y relacionar al metabolismo en su composicin, funcin y control as como los mecanismos de replicacin y regulacin gentica en la clula y aplicarlos en el aprovechamiento de los procesos y recursos biticos. 6.- COMPETENCIAS PREVIAS Fundamentos de Qumica, Anlisis instrumental, Biologa, Matemticas Asociar un comportamiento de variables con una representacin grfica y una representacin analtica; obtener a partir de uno, cualquiera de los tres, los otros dos. Realizar el ajuste de curvas por mnimos cuadrados. Preparar geles para electroforesis para protenas y cidos nucleicos con distinto peso molecular. Preparar amortiguadores de pH y molaridad determinada. Emplear adecuadamente conocimientos sobre estructura y funcin celular. Utilizar conceptos bsicos sobre estructura y propiedades de los compuestos orgnicos. Aplicar conceptos bsicos sobre termodinmica Identificar y aplicar correctamente los mecanismos de reaccin 7.- TEMARIO Unidad 1 Temas Metabolismo del nitrgeno. Subtemas 1.1 Metabolismo del nitrgeno. 1.2 Degradacin de aminocidos 1.3 Excrecin de nitrgeno y el ciclo de la urea. 1.4 El ciclo del nitrgeno. 1.5 Biosntesis de aminocidos. 2.1 Nucletidos. 2.2 Degradacin de cidos nucleicos. 2.3 Biosntesis de nucletidos de purina.

Metabolismo de nucletidos.

2.4 Degradacin de nucletidos de purina. 2.5 Biosntesis de nucletidos de pirimidina. 2.6 Degradacin de nucletidos de pirimidina: enzimas de las vas de salvamento. 2.7 Biosntesis de desoxirribonucletidos. 3 Control y regulacin metablica 3.1. Conceptos de regulacin del metabolismo 3.2. Regulacin a nivel enzimtico 3.2.1. Inhibicin 3.2.2. Activacin 3.3. Regulacin a nivel DNA 3.3.1. Represin 3.3.2. Induccin 4.1. El ADN. 4.2. El ARN. 5.1. Replicacin de la informacin gentica. 5.1.1. Replicacin de ADN. 5.1.2. Naturaleza. semiconservativa. 5.1.3. Topoisomerasa. 5.1.4. Horquillas de replicacin. 5.1.5. Hebra gua y hebra retrasada. 5.1.6. Punto de origen (Ori C). 5.1.7. Primasa. 5.1.8. Funcin del ADN polimerasa III. 5.1.9. El Replisoma. 5.1.10. Sntesis de ADN en procariotes. 5.1.11. Elongacin. 5.1.12. Terminacin. 5.1.13. Reparacin de ADN. 5.1.14. Recombinacin de ADN. 5.2. Transcripcin de la informacin gentica. 5.2.1. Funcin biolgica de el ARN polimerasa. de Eschericia coli. 5.2.2. Mecanismo de la trascripcin:iniciacin interaccin con promotores y regulacin de la iniciacin de la transcripcin. 5.2.3. Elongacin: Incorporacin de ribonucletidos. 5.2.4. ARN polimerasa eucariotas. 5.2.5. Terminacin. 5.2.6. Antibiticos inhibidores de la transcripcin. 5.2.7. Procesamiento postranscripcional del ARN. 5.2.8. Expresin gentica. 5.3. Traduccin de la informacin gentica y biosntesis de protenas. 5.3.1. Componentes necesarios para la sntesis de protenas.

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Estructura de los cidos nuclicos Mecanismos de replicacin y regulacin gentica

5.3.2. 5.3.3. 5.3.4. 5.3.5. 5.3.6. 5.3.7.

Mecanismo de la traduccin. Velocidad de traduccin. Modificacin postraduccionales. Mecanismos de control traduccional. Sntesis de protenas en eucariotas. Modificaciones postraduccionales en eucariotas.

8.- SUGERENCIAS DIDCTICAS Propiciar actividades de bsqueda, seleccin y anlisis de informacin en distintas fuentes, necesarias dentro del proceso de investigacin que la asignatura requiere y que el estudiante lleva a cabo como parte de su aprendizaje y profundizacin de conocimientos. Propiciar el uso de las nuevas tecnologas en el desarrollo de los contenidos de la asignatura, que facilite la induccin al conocimiento de los modelos moleculares y la interaccin metablica para la comprensin del metabolismo intermediario en conjunto. Propiciar el uso de las nuevas tecnologas en el desarrollo de habilidades experimentales, necesarias para el manejo de equipos automatizados. Fomentar actividades grupales que propicien la comunicacin, el intercambio argumentado de ideas, la reflexin, la integracin y la colaboracin de y entre los estudiantes. Propiciar, en el estudiante, el desarrollo de actividades intelectuales de induccindeduccin y anlisis-sntesis, las cuales lo encaminan hacia la investigacin, la aplicacin de conocimientos y la solucin de problemas, lo cual permite lograr la visin en conjunto e integrada del metabolismo intermediario. Llevar a cabo actividades prcticas que promuevan el desarrollo de habilidades para la experimentacin, tales como: observacin, identificacin manejo y control de variables y datos relevantes, planteamiento de hiptesis, de trabajo en equipo. Desarrollar actividades de aprendizaje que propicien la aplicacin de los conceptos, modelos y metodologas que se van aprendiendo en el desarrollo de la asignatura, como: desarrollo de mapas, modelos moleculares y elaboracin de modelos simuladores de estructuras y reacciones bioqumicas. Propiciar el uso adecuado de conceptos, de terminologa cientfico-tecnolgica y nomenclatura bioqumica. Relacionar los contenidos de la asignatura, as como con las prcticas de una ingeniera con enfoque sustentable, con el cuidado del medio ambiente Observar, analizar y dar solucin a fenmenos y problemticas propias del campo profesional. Cuando los temas lo requieran, utilizar medios audiovisuales para una mejor comprensin del estudiante.

9.- SUGERENCIAS DE EVALUACIN La evaluacin debe ser continua y formativa por lo que se debe considerar el desempeo en cada una de las actividades de aprendizaje, haciendo especial nfasis en: o Reportes escritos de las observaciones hechas durante las prcticas de laboratorio, as como de las conclusiones obtenidas de dichas observaciones.

o o o o

Informacin obtenida durante las investigaciones solicitadas plasmada en documentos escritos. Descripcin de otras experiencias concretas que podran realizarse adicionalmente. Exmenes escritos para comprobar el manejo de aspectos tericos y declarativos. Resmenes entregados de visitas y conferencias.

10.- UNIDADES DE APRENDIZAJE Unidad 1: Metabolismo del nitrgeno. Competencia especfica a Actividades de Aprendizaje desarrollar Comprender, identificar, analizar y Analizar y discutir sobre las rutas de relacionar el metabolismo de degradacin de los aminocidos. aminocidos. Analizar y discutir el empleo de los aminocidos como fuente de carbono o bloques estructurales. Analizar y discutir el nitrgeno como limitante en el crecimiento de los organismos vivos. Analizar y comprender el ciclo del N2, y la importancia de la Nitrogenasa. Explicar los pasos y rutas en la degradacin de los aminocidos Explicar las diferentes formas de excrecin de nitrgeno y el ciclo de la urea. Importancia de la ingesta de aminocidos esenciales, ruta de sintesis de esenciales y no esenciales. aplicacin. Unidad 2: Metabolismo de nucletidos Competencia especfica a desarrollar Actividades de Aprendizaje

Comprender, identificar, analizar y relacionar el metabolismo de cidos nucleicos.

Nombrar las diferentes bases, nucleosidos y nucleotidos. Explicar sus funciones aparte de constitutivos de molculas informacionales. Explicar cmo se lleva a cabo la degradacin de cidos nucleicos. Explicar cmo se lleva a cabo la biosntesis de nucletidos de purina. Explicar cmo se lleva a cabo la degradacin de nucletidos de purina. Explicar como se lleva a cabo la biosntesis de nucletidos de pirimidina. Explicar como se lleva a cabo la degradacin de nucletidos de pirimidina. Explicar el papel que juegan las enzimas de las vas de salvamento. Explicar como se lleva a cabo la biosntesis de desoxirribonucletidos.

Unidad 3: Control y regulacin metablica Competencia especfica a Actividades de Aprendizaje desarrollar Comprender, identificar, analizar y Induccin a la investigacin documental relacionar los mecanismos de control y actualizada, de campo o experimental regulacin del metabolismo celular, Bsqueda de material disponible en Internet sobre para aplicar en el aprovechamiento de el contenido del curso y que tenga respaldo los procesos y recursos biticos. cientfico. Exponer y discutir en clase artculos cientficos e informacin de otros tipos fuentes Realizar investigaciones documentadas en equipos. Desarrollar prcticas de laboratorio Asistir a visitas a sectores del campo profesional en grupo. Se sugiere que las actividades aborden los conceptos de regulacin del metabolismo, su regulacin a nivel enzimtico y DNA Unidad 4: cidos nucleicos y sus funciones biolgicas Competencia especfica a Actividades de Aprendizaje desarrollar Comprender, identificar, analizar y Elaborar un diagrama o maqueta del papel relacionar los conceptos de la evolutivo de los cidos nucleicos. gentica, estructura y funcin de los Discutir en panel, los primeros organismos y el cidos nucleicos. papel del ribosoma.

Discutir en panel la estabilidad qumica del ADN

Unidad 5: Mecanismos de replicacin y regulacin gentica Competencia especfica a desarrollar Comprender, identificar, analizar y relacionar los mecanismos y regulacin de la replicacin, trascripcin y traduccin gentica, para aplicar en el aprovechamiento de los procesos y recursos biticos. Actividades de Aprendizaje Elaborar una tabla y un foro de discusin para explicar mutacin qumica y enlistar algunos ejemplos de agentes ambientales mutagnicos. Elaborar una tabla y un foro de discusin para explicar mutacin espontnea. Elaborar una tabla y un foro de discusin para explicar el origen de las especies a partir de las mutaciones espontneas y la presin medioambiental. Elaborar una tabla y un foro de discusin para explicar el la replicacin de ADN, la naturaleza semiconservativa de la replicacin. Elaborar una tabla y un foro de discusin para explicar el papel de la primasa, topoisomerasa y dems enzimas encargadas de la replicacin. Elaborar una cartulina y realizar un foro de discusin para explicar el Horquillas de replicacin. Elaborar una cartulina y realizar un foro de discusin para explicar a la hebra gua y hebra retrasada. Elaborar una cartulina y realizar un foro de discusin para explicar el punto de origen (Ori C). Elaborar una cartulina y realizar un foro de discusin para explicar el papel de la primasa. Elaborar una cartulina y realizar un foro de discusin para explicar la funcin del ADN polimerasa III, as como del replisoma. Elaborar una cartulina y realizar un foro de discusin para explicar las diferencias y las similitudes entre la sntesis de ADN en eucariotes y procariotes para la: Elongacin. Terminacin. Reparacin de ADN. Recombinacin de ADN. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo, la funcin biolgica de el ARN polimerasa. de E.coli. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo, la funcin biolgica del mecanismo de la transcripcin: iniciacin interaccin con promotores y regulacin

de la iniciacin de la transcripcin. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la funcin biolgica de la elongacin, la incorporacin de ribonucletidos. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la funcin biolgica de la ARN polimerasa y explicar la diferencia de este proceso entre procariotas y eucariotas. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la funcin biolgica la terminacin. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo el papel de los antibiticos inhibidores de la transcripcin. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la funcin biolgica del procesamiento postranscripcional del ARN. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la funcin biolgica de la trascripcin para la expresin gentica. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la funcin biolgica traduccin de la informacin gentica y biosntesis de protenas. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo los componentes necesarios para la. sntesis proteica. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo el mecanismo de la traduccin. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la velocidad de la replicacin, la de la trascripcin y la velocidad de traduccin. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la importancia biolgica de las modificaciones postraduccionales. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en panel de todo el grupo los mecanismos de control traduccional. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo la sntesis de protenas en eucariotas. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en foro de todo el grupo las diferencias de

las modificaciones postraduccionales en eucariotas. Elaborar un mapa conceptual por equipo y analizar en panel de todo el grupo discutir en panel la diferencias entre el ribosoma 70S y 80S con respecto a los antibiticos.

11.- FUENTES DE INFORMACIN: 1. Nelson D., Cox M. (2004) Lehninger Principles of Bicohemistry. Worth publishers. New York. 2. Voet & Voet (2001) Fundamentals of Biochemistry. 2nd ed. John Wiley & Sons. New York. 3. Mathews C.K., & K.E. Van Holde (1999) Bicohemistry. 2nd ed. The Benjamin/Cummings Publishing Co. Menlo Park, California. 4. Stryer L (2002) Biochemistry 4th ed. W.H. Freeman. New York. 5. Bohinski, Robert C. Bioqumica. Mxico, DF.5a. ed. Pearson Educacin, 1998. 6. Campbell, Mary F, Farrell, Shawn O. Bioqumica. Mxico, DF. 4a. ed. Internacional Thomson Editors, 2004. 7. Conn, Eric. E. y Stumpf, P.K. Bioqumica Fundamental. Mxico, DF. 3a. ed. Limusa, 1991. 8. Devlin, T.M. Bioqumica. Libro de texto con aplicaciones clnicas. Mxico, DF. 5a ed. Revert S.A. 2004. 9. Epstein, Richard J. Human Molecular Biology: An Introduction to the Molecular basis of health and disease. Cambridge University Press, 2002. 10. Lewin, Benjamn. Genes. Mxico, DF. 3a. ed. Revert S.A. 1991. 11. Pastemak, Jack J. Molecular Biotechnology: Principles and applications of recombine nt DNA. American Society for Microbiology. 3a. ed. 2003. Sitios web The National Library of Biotechnology Information [www.ncbi.nlm.nih.gov] 12.- PRCTICAS PROPUESTAS: 1) Fijacin biolgica del Nitrgeno 2) Separacin cromatografica de aminocidos 3) Extraccin de ADN 4) Aislamiento del ADN 5) Preparacin de ADN plasmdico de Escherichia coli. 6) Secuenciacin de ADN (lectura e interpretacin de autorradiografas) 7) Induccin enzimtica 8) Amplificacin de DNA por PCR y su anlisis por electroforsis